4EIQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	528
structure length	514
Chain Sequence	NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDAMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule keywords	Putative FAD-monooxygenase
publication title	An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes. pubmed doi rcsb
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
total genus	155
structure length	514
sequence length	528
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	4eiqA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4eiqA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4eiqA01

3FIMB 5L46A 5HYMA 4YSZA 1IUSA 4J56A 2JBVA 1PJ5A 3PO7A 2QAEA 4JY2A 1O94A 4MJWA 2BK5A 4K5RA 4GDEA 3QSMA 3NYEA 5CQFA 3CNJA 3CNSA 4BK2A 3GRTA 1Z6LA 4BURA 4U8MA 4U8NA 1GESA 1NENA 2VRMA 2OALA 3ABVA 3GRSA 4X4JA 3UTFA 1CJ3A 3C4AA 4NTCA 3PS9A 2YLWA 3Q9TA 4I58A 3BI5A 1CJ2A 2O9ZA 3UOZA 2A87A 4UDQA 3IWAA 1H6VA 4Z2UA 5TR3A 1DODA 2BACA 4Z2TA 3D1CA 2C65A 2GB0A 1F8SA 2PYXA 4OPDA 3ZYXA 2CVJA 2XVIA 1W4XA 2RABA 5BVAA 5J60A 2V5ZA 3II4A 4FX9A 1XDIA 2V61A 4JNAA 2YR6A 2C73A 4B67A 2BCPA 3ALLA 2X8CA 3UOXA 3ALJA 4A79A 1DXLA 4UDPA 1B37A 3NG7X 3P4SA 1PHHA 4U2TA 4A5LA 1PJ6A 3C96A 5M10A 3UTEA 3GMCA 2C70A 3NK1X 3K7MX 1DJQA 4Z2RA 3E1TA 2BABA 2GMHA 3SFEA 3CIRA 1Q1WA 5FS8A 2R45A 5KWFA 2GR2A 1K0JA 4PAAA 4B63A 1N4WA 4YSXA 3QSSA 1EL9A 2VVLA 2WU5A 1Q1RA 3DJJA 2JB1A 3QJ4A 4J31A 2VOUA 2WPCA 4CRTA 1NG4A 4OPGA 1DOBA 2C76A 1F6MA 3LADA 2WP5A 3UKHA 1S2YA 4BJYA 4DSGA 4UDRA 4XXGA 5JCLA 5LV9A 1PBEA 1O5WA 3UKPA 3ICTA 1KNRA 1N4VA 3KVEA 2XCGA 3NK0X 1CJ4A 3COXA 1M6IA 3H8LA 1JNZA 3NNEA 2BXSA 2C7GA 4RSLA 2R4EA 4K22A 1VQWA 3ATRA 1K4QA 3F8DA 3ITJA 4EMJA 2XVJA 2GAGB 3LB8A 4GR1A 1B5QA 2C72A 2VVMA 3LZWA 2GH5A 1JOAA 1NHRA 1MXTA 4YTMA 4NTDA 4XWRA 2EQ8A 2WDQA 3GWDA 4O5QA 1RYIA 4H7UA 1NHQA 3ADAB 4OCGA 1VG9A 5C3JA 1XANA 5JCIA 2XLUA 2OA1A 2E5VA 1LJ1A 1BWCA 2EQ7A 4H4XA 1ZMDA 2F5ZA 2OLNA 3CPHG 4H4ZA 3C4NA 4EQXA 5FMHA 4CNKA 4YKGA 3RNMA 1BGJA 3B6DA 4J57A 1H86A 1F3PA 4TM1A 2FBWA 1IUWA 2B9WA 2JAEA 4JNQA 1JEHA 4DGKA 2NVKX 3RP8A 2V6OA 1Y56A 2YLRA 1D4CA 1JU2A 1YY5A 3AEEA 1LPFA 2X99A 3GMBA 3GSIA 1H84A 1GNDA 3ALMA 1F8WA 3DJDA 4GDPA 2WPFA 2YAUA 4J2WA 4BK3A 1MOKA 2XVFA 1JRYA 4U2LA 1GV4A 2GAHB 2GVCA 1PXCA 3VRBA 4WX1A 1ZP0A 3IHMA 2JB3A 2WOIA 3AE7A 2FJBA 3AXBA 1K0LA 3AEFA 2GEWA 2B76A 2QA2A 1ELIA 1K0IA 3IF9A 4IA5A 1PJ7A 2J3NA 3L1RA 1OJAA 3FG2P 2XFQA 5KVIA 4K2XA 4Y4NA 1NHSA 3FPZA 1GTHA 3P4QA 2GR1A 3DGHA 4Z25A 1PBCA 2Q0KA 5U25A 5KXJA 3ICRA 1GEUA 2PHHA 4HB9A 4GRTA 4KX6A 2ACZA 4ZCCA 2GRTA 3UKQA 2YLXA 2WOVA 4CY6A 2BC1A 3AD7B 3CGEA 5FS7A 2VQ7A 1GALA 2BYBA 5ER0A 1NAAA 2B7SA 4RG4A 3UOVA 2BC0A 2FJAA 2XLPA 5HXIA 2Q0LA 2XFNA 4A99A 4J34A 3VR9A 2Z5XA 3GYJA 1OJDA 1NG3A 5GSNA 4H2QA 5HY5A 3FMWA 2X3NA 4A6NA 4B66A 4C3YA 2QA1A 3T37A 4AP1A 2B9XA 3JSKA 4H50A 3VR8A 2H89A 1BF3A 2YG7A 2XVEA 1Q9IA 5IQ4A 2X50A 3EANA 4CBQA 1DOEA 2JB2A 4K7ZA 3CPJG 1GT8A 3AYJA 1Y56B 5EOWA 4A9WA 1YQZA 2XYOA 4CCQA 4EM4A 1PS9A 1DJNA 1L9CA 1EBDA 4ECHA 5HHFA 3AEDA 2CFYA 2YG4A 1FEAA 3L8KA 4YSHA 3CGCA 4NEVA 1CJCA 4Z26A 3V3OA 1V59A 4ICYA 1KNPA 1XHCA 2V60A 3AEGA 3I6DA 5EB4A 4DNAA 3AD9B 1OJCA 1TYTA 1D4EA 3GDNA 2E4GA 2C75A 2WPEA 4JY3A 1GXFA 1GRFA 3NYFA 4H4UA 2A8XA 4TM4A 3IC9A 1LQTA 3UTGA 2IVDA 2YWLA 2E1MA 2B7RA 2X8HA 3GDPA 2XLSA 2YG6A 2V3BA 4H4RA 2WEUA 4U8LA 4IVOB 2WU2A 4WCTA 3REDA 2RGHA 2R4JA 1JRZA 2B9YA 2OAMA 1KF6A 1H7XA 1SEZA 3CNTA 4H2NA 4U8IA 4YTNA 2QCUA 4D04A 3DA1A 2IIDA 3KD9A 4IA6A 2TMDA 2JK6A 5BULA 2YLTA 4NZHA 3R9UA 1H82A 3EF6A 4CCRA 1L0VA 1IUXA 1ONFA 1XPQA 4APNA 1VRQB 2C3CA 3ZDNA 3BHKA 1IUTA 3DJGX 3NYCA 2BK4A 2C64A 3DK8A 3GYIA 3NK2X 4H4WA 1Y0PA 3SQPA 3NIXA 4B68A 1NDAA 1FECA 3H4KA 2R0PA 3KPFA 3NHOX 3NT6A 4BJZA 4H2RA 3CNDA 1GERA 3B3RA 1KDGA 3P4RA 1EL7A 4OPLA 4D03A 2BS3A 3NN6X 2VVLG 1GOSA 2YLZA 4JDRA 4LA1A 3CNPA 1GSNA 3DGZA 4U8KA 1CHUA 2XFPA 3DH9A 2YM1A 5CKUA 1DOCA 2BS2A 3GWFA 1VG0A 3P4PA 3P9UA 4OPIA 3DMEA 3UKKA 3M0OA 2FJEA 4H4PA 2WESA 5DBJA 3RP7A 3AE1A 3SM8A 2DKHA 2H88A 2OLOA 2AAQA 3URHA 1B4VA 4TM3A 1NHPA 2R46A 3UKFA 3KKJA 2GV8A 4E0VA 1GRAA 2CULA 2YM2A 3F8RA 5EB5A 2WQYA 1S3BA 3NTAA 3OZ2A 5FS9A 4K8DA 3M13A 4TLZA 3EPTA 5J7XA 4H4SA 1CL0A 5FS6A 2ZZ0A 3ISHA 1TYPA 1GETA 3LOVA 4U2SA 4B65A 2XVHA 3P1WA 3S5WA 3VRDB 2UZZA 3NLCA 2VQBA 3AE2A 1ZK7A 2W0HA 3G5QA 3NN0X 1IJHA 4EM3A 1PXAA 1GRGA 4A65A 2EQ6A 4H4TA 4CNJA 1E6EA 2BA9A 3NH3X 5IPYA 5BRTA 1E1NA 1TDKA 2BK3A 3G5RA 4NEWA 1TDFA 1TDNA 2WHDA 2YG3A 3BNMA 1REOA 3AEBA 4EIPA 4UP3A 2R0GA 1S3EA 1LV0A 2YR5A 3I3LA 3DK4A 4AOSA 4AT2A 2Y6RA 4GUVA 4USRA 2V3AA 1B8SA 2WP9A 3K7TA 3V3NA 1YKJA 2WS3A 1CC4A 3LXDA 3UKAA 2ARDA 5KRQA 2BCGG 3OC4A 2R9ZA 3BI4A 4OPUA 1ZKQA 4C77A 3NRNA 1L9EA 3ICSA 5KOXA 4LIIA 1H83A 1M64A 2JKCA 4YKFA 2GMJA 3D8XA 5KVHA 1IUVA 1PBDA 1L9DA 3IHGA 1PBFA 2XLTA 1QO8A 4J33A 4USQA 4H4QA 2ZZCA 4XWZA 4EQWA 4CY8A 3QVRA 4BV6A 4EQRA 3GD3A 1GRBA 4YT0A 4GCMA 2R0CA 4C5OA 3QVPA 3AECA 1ZOVA 1F8RA 1ZOYA 2VRLA 1RP0A 1QJDA 1E1KA 1P2HA 1D7LA 4Z43A 4AT0A 1E1MA 3AB1A 1EL5A 2DKIA 2Q7VA 1CF3A 2Y6QA 1P2EA 4DSHA 1H81A 2YLSA 2IVEA 3HZLA 1GRHA 1GTEA 3VRAA 2A89A 3Q6JA 3QFAA 3O0HA 2RGJA 3WE0A 1ZX9A 3V76A 4YSYA 3GD4A 2CDUA 1PBBA 4Z24A 3UP5A 4PABA 4EQSA 1OJ9A 2TPRA 3AE5A 2GR3A 4KPRA 2FJDA 2XLRA 2YVFA 3QSEA 3AE9A 1NPXA 2AR8A 4EMWA 1TRBA 2WDRA 3AE4A 2YQUA 1CBOA 4JN9A 4A7AA 2AQJA 4IVMB 4IV9A 3DJEA 4OVIA 2XDOA 1D4DA 1E39A 1KFYA 1JRXA 4K5SA 2YVJA 4P9SA 2WP6A 5C2TA 1BZLA 3AE8A 3AYLA 3KA7A 3FBSA 3AD8B 4FDCB 2Z5YA 2WBAA 2BS4A 1ZY8A 5EBKA 4YTPA 5JCMA 2WOWA 5IQ1A 1CC6A 4B69A 3LZXA 5KOWA 2C3DA 3BI2A 1BKWA 4A6NB 3ATQA 1E1LA 3M12A 4X9MA 4FK1C 3UP4A 3UOYA 3KLJA 2WDVA 3NTDA 1O95A 3NKSA 3AWIA 4TM0A 3UKLA 3QFBA 1H7WA 2NPXA 1N4UA 3UCLA 1GRTA 1IUUA 1EL8A 4M52A 1S2QA 2YR4A 3G5SA 3K30A 1N1PA 3CPIG 2GQWA 4ADWA 1X31B 1AOGA 4ZN0A 4H4YA 3K7QX 4JQ9A 4NTEA 1PDHA 3BNUA 4OPCA 4U8OA 3S61A 4EMIA 3CTYA 1D7YA 1FOHA 1KSUA 1LQUA 1LTXR 2YVGA 1LVLA 3VQRA 3LJPA 4ZCDA 1DNCA 1UKVG 1TDOA 1E7PA 1FEBA 1FL2A 4C3XA 4N9XA 4U8JA 4LU6A 3AEAA 3AE6A 4AP3A 1GREA 4OPTA 3EAOA 3F8PA 1BGNA 4I59A 5GRTA 1HYUA 4AOXA 1VDCA 4X9NA 3SFDA 4TLXA 2ZZBA 4GF7A 4REKA 4HA6A 3PVCA 4B64A 5JCNA 3KU9A 1KSSA 1RSGA 3CGDA 2GR0A 4YWOA 4Z44A 4Y4LA 5JCKA 1D5TA 4H4VA 2HQMA 2APGA 1NEKA 1QLBA 2GQFA 5U63A 2ZBWA 3UTHA 1ZDLA 2XFOA 4O5UA 4J36A 2C66A 1GPEA 2YG5A 3RHAA 4B1BA 4BK1A 2XFUA 3DK9A 1PN0A 1ZMCA 4RG3A 1MO9A 2EQ9A 3AE3A 3RP6A 4U8PA 4C74A 3CN8A 1CC2A 2X8GA 2VZ2A 5M0ZA 3NGCX 1TDEA 3CGBA 2GF3A 5BUKA 1JNRA 3BHFA 4FK1A 3H8IA 5U1OA 4EIQA 1YQ3A 1PXBA 2Q6UA 3AYIA 3SGLA 1FCDA 4YXDA 4H2PA 2WETA 4Y4MA 2BXRA 1OJTA 2I0ZA 2RGOA 1COYA 1YQ4A 2C67A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

5HYMA 4YSZA 1F9MA 1Z7PA 4J56A 1PJ5A 4K8MA 2BK5A 3ZIVA 3NYEA 4E8HA 5H5RA 3GRTA 1Z6LA 1FVJA 4U8MA 4U8NA 4GWRA 1GESA 5AISA 2CA8A 3GRSA 4X4JA 3GMFA 5JCGA 4BPYA 4UDQA 2HLSA 4G19A 1DODA 2BACA 2GB0A 2HRAA 3GX0A 2FA4A 3LWAA 1W4XA 5BVAA 1XDIA 2V61A 4JNAA 4YQVA 2DBCA 1ON4A 2IL3A 3ALJA 1K0BA 1DXLA 2V6KA 1B37A 3NG7X 1PHHA 4U2TA 2GTUA 2NVLA 3IC4A 3C96A 2V32A 4N10A 22GSA 1EWXA 1FOVA 2XBIA 2C70A 3NK1X 3ED3A 3E1TA 3SFEA 1SYXA 1Q1WA 5FS8A 2R45A 5IOXA 4B63A 4OO5A 2VVLA 3FR9A 3DJJA 4J31A 2WPCA 3M8NA 4YJHB 3F6DA 5HQPA 3UKHA 3EU4A 4DSGA 2H1DA 4GSSA 2RLIA 2C0FA 2DIZA 2F8FA 3OR5A 3COXA 1M6IA 4NMUA 4MA9A 2IMIA 2R3XA 3FY7A 3TKSC 5G30A 3F8DA 4TR4A 2XVJA 2NBSA 2H74A 2GH5A 4NTDA 3S9FA 3GWDA 2XC2A 4F0BA 4G0KA 2OBKA 5KMRA 1BWCA 2HI7A 1WJKA 1PKZA 2C3TA 3C4NA 2MMZA 4BVXA 5FMHA 4YKGA 3B6DA 4TM1A 4CW9A 4JNQA 3RP8A 2NVKX 2VLVA 2PVOC 1AN9A 5CP1A 2B5YA 2MBSA 4F03A 3ALMA 1GNDA 2H19A 1F8WA 2J23A 4GCIA 3DJDA 4GDPA 2WPFA 4KNDA 4KDUA 1MOKA 3KP9A 1JRYA 1GV4A 1HNBA 1PXCA 3IHMA 4OCEA 4OFTA 2GEWA 2NDOA 5G2ZA 2DJ3A 2QA2A 4IA5A 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1X5EA 4YJGA 4EDZA 4N0VA 3T2KA 3HYXA 4IN0A 4KAEA 2GS3A 3P7XA 3ZZXA 3ISOA 1QQ2A 4ILFA 2GDRA 1QMVA 4QFCA 2H88A 2OLOA 4EXJA 3URHA 18GSA 1B4VA 2H73A 2R46A 3UKFA 2H76A 1MDJA 1V40A 4N30A 5EB5A 4V2MA 2WQYA 1TRWA 3BOAA 2DJ1A 3NTAA 3SXIA 1GH2A 2CZ2A 3QAVA 3GH6A 4GSNA 1GETA 4B65A 1GTBA 4EL1A 4OFMA 2C4JA 2UZZA 1CQHA 1GSDA 3LW9A 4AJ6A 1A0RP 4XS4A 3VFIA 4NHZA 2CVKA 5B8BA 3VURA 5BRTA 1C0LA 1TDFA 3LG6A 3AEBA 5FS6A 4UP3A 1LV0A 4AT2A 3DK4A 2Y6RA 4GUVA 3KXOA 4USSA 3K7TA 1FB6A 3E0UA 5ID2B 1BJXA 1ZKQA 4WETA 2HT9A 3NRNA 2CT6A 4XS6A 2F8AA 1H83A 3F3RA 2JKCA 1GUHA 3DVXA 2CQ9A 1BAYA 3IHGA 4USQA 3BBYA 1Z5YE 1GRBA 4YT0A 3W4KA 2GSTA 2H0HA 3QFBC 1ZOVA 4KDYA 1V9WA 3QR6A 2VRLA 1RP0A 2IMFA 1E1KA 1QUWA 3R2QA 2HRKA 1E1MA 3AB1A 1GLQA 2Q7VA 3VWXA 1CF3A 3TOTA 1WPIA 2Y6QA 2A89A 2IN3A 3F4SA 3GNJA 2RGJA 3WE0A 1ZX9A 2WB9A 3I69A 2P5QA 4Z24A 2HXKA 1OJ9A 3LSZA 3ZLPA 1TKDB 3ZFBA 4WBJA 4LL1B 2DU8A 4ECBA 2VIMA 4IHUA 5CYYA 3AE4A 2YQUA 1CBOA 2AQJA 3DJEA 1AW9A 2B3SA 1SJ6A 1EEMA 3PH9A 4JRRA 5ENUA 2LEGA 4K5SA 4P9SA 2YVJA 1BZLA 1J08A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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 1NPX A;  1TK8 B;  3HJO A;  4EMW A;  2FGX A;  5ECS A;  2WDR A;  3UAP A;  4GRF A;  4IVM B;  4IV9 A;  4OVI A;  4NNJ A;  2XDO A;  1SL0 B;  1B9Y C;  1KFY A;  2K8V A;

4EIQA

Total Genus

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