4EIQ | Genus

Total Genus 155

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	155
sequence length	528
structure length	514
Chain Sequence	NAPIETDVLILGGGPVGMALALDLAHRQVGHLVVDAGDITHPKVSTIGPRSMELFRRWGVAKQIRTAGWPGDHPLDAAWVTRVGGHEVYRIPLGTADTRATPEHTPEPDAICPAHWLAPLLAEAVGERLRTRSRLDSFEQRDDHVRATITDLRTGATRAVHARYLVACDGASSPTRKALGIDAPPRHRTQVFRNILFRAPELRSLLGERAALVFFLMLSSSLRFPLRSLDGRGLYNLVVGVDDAMDSFELVRRAVAFDTEIEVLSDSEWHLTHRVADSFSAGRVFLTGDAAHTLSPSGGFGMNTGIGSAADLGWKLAATLRGWAGPGLLATYEEERRPVAITSLEEANVNLRRTMDRELPPGLHDDGPRGERIRAAVAEKLERSGARREFDAPGIHFGHTYRSSIVCGEPWRPSARPGARAPHAWLTPTTSTLDLFGRGFVLLSFGTTDGVEAVTRAFADRHVPLETVTCHAPEIHALYERAHVLVRPDGHVAWRGDHLPAELGGLVDKVRGAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	An Unusual Role for a Mobile Flavin in StaC-like Indolocarbazole Biosynthetic Enzymes. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Putative FAD-monooxygenase
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Lechevalieria aerocolonigenes
total genus	155
structure length	514
sequence length	528
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01494	FAD_binding_3	FAD binding domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.30.9.50	Alpha Beta	2-Layer Sandwich	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2	4eiqA02
3.40.30.120	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	4eiqA03
3.50.50.60	Alpha Beta	3-Layer(bba) Sandwich	FAD/NAD(P)-binding domain	FAD/NAD(P)-binding domain	4eiqA01

1L9DA 2A87A 1DXLA 1KSUA 4AOXA 1GRTA 3GYJA 1F8SA 2YLZA 4U8IA 3G5RA 2XVJA 2WPCA 2YG4A 3K7MX 3I6DA 3UKFA 2BCGG 4A6NA 3FG2P 4YKGA 4K8DA 4USRA 1E1NA 3KKJA 4H4VA 3GRTA 3KVEA 1KSSA 1ZMDA 2JKCA 1NEKA 4CY6A 2GV8A 2X8HA 3AE7A 4YXDA 1TDFA 1H7XA 1DJNA 3NYFA 1VG0A 1LJ1A 2C75A 2QA2A 1B8SA 2B9WA 2C3CA 1BF3A 1M64A 4OPIA 1NAAA 3PVCA 3QFAA 5BVAA 3AEEA 1CHUA 3L8KA 1RYIA 2YLXA 3P4RA 3S5WA 1FCDA 1Y56A 5JCKA 4YSZA 1BWCA 3SQPA 2B76A 4UDQA 3SFEA 1TRBA 4U2TA 1PXBA 2YG5A 5KOXA 2CDUA 3NRNA 4Z43A 2ARDA 1DNCA 1RP0A 3G5QA 1CBOA 2WOVA 3JSKA 1PDHA 4YT0A 1DOEA 1TYTA 1E6EA 3ALMA 3CGCA 2JB1A 3K7QX 4XXGA 2IIDA 4UP3A 3DJEA 3UKPA 3LZXA 1IUUA 4UDPA 5IQ4A 4USQA 5FS7A 5TR3A 5KRQA 4YKFA 2RABA 3DH9A 4D03A 4B65A 1L9CA 2BCPA 4BK3A 1DOBA 2GEWA 3AE5A 4TM0A 1B37A 1O5WA 1CC4A 2QAEA 3AE6A 1CF3A 4DSGA 3BHKA 1JRYA 3NGCX 4ZCCA 4EM4A 2JK6A 3L1RA 3P4SA 4HB9A 4A9WA 1NG4A 4JQ9A 1JEHA 4NTDA 2XVIA 3K30A 3IC9A 2GR1A 4Y4MA 4B67A 2WPEA 1GRGA 1CJ4A 1K4QA 2BABA 4Z25A 1E1MA 2B7RA 2AR8A 2WS3A 1LQUA 4RG4A 3AE2A 3VRAA 1GV4A 3DK9A 3P4QA 3UOYA 1NDAA 1EBDA 5IQ1A 4U8PA 3SM8A 1Q9IA 1AOGA 1IUVA 1H83A 2BACA 2VQ7A 2WP9A 2E4GA 3B6DA 3FMWA 4AT2A 4BJZA 1S2QA 4TM1A 4GRTA 2C66A 2V61A 3AEBA 4MJWA 4Z24A 4U8OA 3KD9A 2XLPA 2YLRA 1L9EA 3IHGA 2BK4A 3G5SA 2ZZCA 3ZYXA 4C3YA 3Q6JA 3RHAA 4AT0A 4C3XA 2B7SA 3ICRA 4A65A 3KA7A 1N1PA 3BI2A 1TDEA 5KXJA 1D7LA 3AEGA 4ECHA 3BHFA 3K7TA 5CQFA 2YAUA 2C65A 5GRTA 3NTDA 2FJBA 4J2WA 4EMJA 2OA1A 2UZZA 2WESA 3V3OA 4P9SA 1GRBA 5HHFA 3EF6A 1GXFA 1V59A 3UOZA 3H8IA 1H86A 4K7ZA 3EAOA 2GH5A 3BNMA 1B4VA 1GT8A 5C3JA 1F3PA 3P9UA 1JRZA 1KF6A 2VVMA 3GSIA 1O95A 1F8RA 4IVOB 3AECA 2Q0LA 1BZLA 1XANA 5BRTA 3NYEA 4IA6A 2FBWA 4O5UA 4WCTA 2VOUA 4Z44A 3OZ2A 4H2RA 3NKSA 3VRBA 2CULA 2WU5A 4EMWA 1M6IA 4J57A 1DJQA 4H4UA 2XLSA 3AEAA 1EL5A 2WP6A 4UDRA 1ZOYA 2C3DA 1YQZA 1YQ4A 4H7UA 3UKKA 2XFOA 3D1CA 3AXBA 4NTEA 3ATRA 1CC6A 2BA9A 3URHA 4GUVA 1XHCA 2PHHA 4BV6A 3VR8A 2Q7VA 3KLJA 2Z5XA 1NENA 2BYBA 3COXA 3LXDA 3M12A 4ZCDA 3CGBA 3ICSA 2WQYA 2WBAA 4K5RA 4CY8A 2GMJA 1ZDLA 3DK4A 1PHHA 5KWFA 2E5VA 3CIRA 3QVRA 5CKUA 4A6NB 4H4YA 2V60A 4Y4NA 2YG6A 2YQUA 4APNA 2JB3A 3OC4A 1MOKA 4H4TA 1JNRA 5FMHA 3UKAA 4AP3A 4FK1C 4X4JA 3NYCA 2VRLA 4OPCA 2WDVA 5HYMA 4K2XA 3UKQA 2GR0A 3GD3A 3ALJA 1NHPA 2C73A 3UTGA 3V3NA 1PN0A 2GR2A 1GOSA 4EIPA 3NG7X 1PXAA 2XFUA 3NN6X 3BI5A 1NG3A 4BJYA 4B1BA 4EQRA 2C76A 4H4PA 1GTHA 1GNDA 1TDKA 3IHMA 3KU9A 3UP5A 4B69A 4YSYA 5J7XA 4C5OA 1GRFA 4GR1A 3GRSA 3VR9A 2Q6UA 1JRXA 3GMBA 4I59A 3DK8A 3H4KA 4D04A 1PBEA 3CNPA 1CJ2A 3FBSA 1OJAA 1D7YA 2V5ZA 2R0GA 1S2YA 2R0CA 2FJEA 1P2EA 2RGHA 2BXSA 1JU2A 4H4RA 1N4WA 4RG3A 2XFQA 1N4UA 3GWFA 2H88A 1CC2A 3O0HA 4OPLA 4PAAA 4KPRA 4H2QA 4XWRA 1OJTA 2EQ6A 1LQTA 1MXTA 3LADA 5FS8A 4WX1A 4B68A 2NVKX 4Y4LA 3F8DA 1OJ9A 2ZBWA 3F8RA 5DBJA 4CNKA 4H4SA 3DMEA 4NEWA 3GDPA 1ZK7A 3H8LA 3UCLA 1IUTA 1F8WA 1Q1WA 2ZZ0A 1ELIA 1PXCA 3FIMB 3ITJA 4JNQA 4JN9A 4A5LA 4J34A 3UTEA 1O94A 1FEBA 2YM1A 1E1KA 5FS6A 1YQ3A 4GDEA 4JY2A 2XVFA 4FX9A 1ZX9A 2J3NA 2O9ZA 4YSHA 3ALLA 1XPQA 3CPHG 4YTNA 5IPYA 4EQSA 3EPTA 1NHQA 3NNEA 4JNAA 1D4DA 1ZP0A 2R0PA 4H4WA 1PBBA 2XVEA 1PBFA 3DGHA 3I3LA 2GQFA 2WOWA 4LIIA 2VZ2A 4OPUA 4JDRA 1EL7A 3RP7A 3II4A 1DODA 3NIXA 2XDOA 1E7PA 3AD9B 3GD4A 3NHOX 1B5QA 1MO9A 1H6VA 2X8GA 3NH3X 4EMIA 3GWDA 1PS9A 1SEZA 3UTFA 2ACZA 3V76A 2EQ7A 2JBVA 2GF3A 1NPXA 3SGLA 3AYJA 4EQWA 4H4QA 2BK5A 4CRTA 2QCUA 3GMCA 2BS3A 5JCIA 1N4VA 4J56A 3UOVA 2X3NA 3AYLA 2GQWA 1GTEA 3P4PA 3RNMA 2W0HA 2YLWA 1S3EA 5U1OA 3CPIG 3NT6A 1UKVG 4CNJA 1EL8A 2WDRA 3BI4A 2X99A 3DGZA 3KPFA 4H4XA 2RGOA 1KFYA 3CPJG 2XLTA 1LVLA 1PBCA 1ZKQA 3M13A 4E0VA 2V3BA 2RGJA 3C4AA 3CNDA 1FOHA 2WU2A 4FK1A 3ADAB 2FJAA 3CGEA 1PJ6A 1JOAA 3IF9A 1VQWA 4J33A 2C70A 3AEDA 1BKWA 1GRAA 4Z26A 4CBQA 2X50A 2APGA 2A89A 2GR3A 4LU6A 1GEUA 2WETA 4CCRA 2OAMA 2QA1A 4B64A 5EB4A 2YLSA 4B63A 3BNUA 2YVGA 3SFDA 4IV9A 1JNZA 2C67A 3CTYA 2F5ZA 3AE9A 4J36A 3Q9TA 3NLCA 3UTHA 4ZN0A 4NZHA 4EIQA 3VRDB 1GREA 2BC0A 1GRHA 2R4JA 2Q0KA 2YLTA 3F8PA 4U8JA 1RSGA 3GDNA 1ZOVA 3EANA 5BUKA 1YY5A 5HXIA 1ZY8A 2XLUA 2WDQA 3LOVA 4AP1A 1P2HA 1QJDA 3ATQA 4GDPA 4PABA 5GSNA 1ZMCA 3DA1A 4H2PA 2GMHA 2NPXA 3AB1A 4K22A 3PS9A 5EOWA 3NK1X 1X31B 4YTPA 3UKLA 3DJJA 4TLZA 4EQXA 1LTXR 4NTCA 1FECA 3NN0X 1Y56B 2V3AA 3ICTA 2GB0A 1GETA 4OPDA 1CJ3A 3AD7B 2IVEA 1Z6LA 3GYIA 4FDCB 2A8XA 4N9XA 4TM3A 4LA1A 3B3RA 4OPGA 5C2TA 5J60A 5JCLA 2FJDA 3C4NA 2YWLA 1D5TA 1GSNA 2B9XA 4J31A 4U8NA 3DJGX 2XFPA 3REDA 2CVJA 4GCMA 4AOSA 4JY3A 3T37A 1BGNA 5BULA 4Z2TA 2XVHA 3CNTA 4X9NA 1GERA 3NK0X 2JAEA 4BK2A 2VRMA 1PJ5A 5JCMA 4TM4A 2YR5A 5FS9A 4REKA 1REOA 1YKJA 4RSLA 1COYA 2VQBA 3AYIA 1GESA 2GRTA 4NEVA 1CJCA 1Q1RA 2YR4A 2AQJA 4O5QA 2YG3A 3UP4A 3QSEA 4YSXA 1CL0A 4BK1A 3QSMA 4I58A 3QVPA 2XYOA 4C74A 1XDIA 1E1LA 2PYXA 3ABVA 1TYPA 1FL2A 4XWZA 2DKIA 4YWOA 2HQMA 5EB5A 5KVHA 1OJDA 1S3BA 3DJDA 1D4CA 1QLBA 4U8KA 2R46A 1EL9A 1IUSA 1NHRA 3NK2X 1F6MA 3P1WA 5EBKA 3S61A 4Z2UA 3AEFA 1PBDA 1VDCA 2X8CA 3CNJA 2BS4A 2OLNA 3CGDA 4M52A 3AE3A 2B9YA 1IUXA 1KDGA 2CFYA 1K0LA 2XCGA 1IJHA 2C72A 1TDOA 2OALA 2EQ9A 1LPFA 3D8XA 4X9MA 3VQRA 2AAQA 4HA6A 3R9UA 1W4XA 2I0ZA 2TPRA 4DSHA 1GALA 1K0JA 3AWIA 4H4ZA 2E1MA 2IVDA 4Z2RA 3QJ4A 3LB8A 5LV9A 1KNRA 1HYUA 4ICYA 3AE4A 3WE0A 4ADWA 4IVMB 3UKHA 3CNSA 1Y0PA 3C96A 3PO7A 5M0ZA 4B66A 1IUWA 4GF7A 5KVIA 2WOIA 2TMDA 4A79A 4U2LA 1GPEA 2C7GA 3ISHA 5HY5A 2XLRA 4IA5A 1H82A 3FPZA 2Y6QA 3AE1A 3IWAA 3RP6A 2YR6A 5ER0A 5U25A 2Z5YA 2BC1A 2BS2A 4KX6A 1OJCA 1H84A 2JB2A 3M0OA 4A99A 4EM3A 3CN8A 4TLXA 4OCGA 5KOWA 2YM2A 4YTMA 4OPTA 3ZDNA 1E39A 3QFBA 1LV0A 1ONFA 2DKHA 2WPFA 4DGKA 2WHDA 2YG7A 1H7WA 2OLOA 3E1TA 2GAHB 4H2NA 1L0VA 3UOXA 1DOCA 5M10A 1VG9A 4OVIA 4CCQA 2XFNA 1FEAA 2R45A 4U8MA 4U2SA 2H89A 4BURA 2BK3A 3LJPA 4H50A 3QSSA 4C77A 4DNAA 2GAGB 4U8LA 2ZZBA 2V6OA 2WEUA 3HZLA 2WP5A 1D4EA 3LZWA 2R9ZA 3AE8A 1QO8A 3NTAA 2GVCA 3RP8A 3AD8B 1K0IA 2VVLG 2EQ8A 2YVFA 1TDNA 2BXRA 2VVLA 4A7AA 5L46A 1NHSA 1H81A 2YVJA 1BGJA 5U63A 5JCNA 1VRQB 2C64A 1KNPA 2R4EA 4K5SA 2Y6RA 1PJ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

1L9DA 2A87A 1GSQA 1DXLA 4AOXA 3L9VA 5IMZA 1F8SA 3A2WA 2P31A 1FO5A 2GTUA 3ZIJA 5DALB 3UKFA 4A6NA 3FG2P 3KMNA 2CAIA 1WE0A 3V1WA 4H4VA 3KVEA 3DMLA 1KSSA 2HLSA 1NEKA 2H73A 4YXDA 4TRXA 1M9BA 2H19A 1TDFA 4K7IA 4K2DA 1ERWA 2B9WA 2L59A 2DMMA 2C3CA 2O7KA 1CHUA 3ZNNA 3QD9A 1H75A 4Z43A 2CDUA 1GSSA 1TP9A 4MH3A 1QGVA 1RP0A 3G5QA 3APQA 3D22A 1X0RA 3IK7A 4E8EA 5C04A 4YT0A 1TYTA 2JB1A 4KF9A 4UP3A 2HRFA 3UKPA 3LZXA 4MCUA 2DLXA 18GSA 5IQ4A 1V57A 1L9CA 4BK3A 5ECMB 2C3QA 2VL2A 3APSA 1B37A 1CC4A 2PGTA 4XS4A 1Z7PA 2E7PA 2FA8A 4LL1B 3GYKA 1B4QA 4HB9A 2OJLA 2MZCA 3ZL5A 4JQ9A 4RQXA 4D73B 2XVIA 2GR1A 11GSA 4B67A 3GN3A 1BQ7A 1JHBA 1GP1A 1CJ4A 4Z25A 1JZRA 3W4KA 3VRAA 3AE2A 2L4QA 1OC9B 3TOUA 3P4QA 3UOYA 3F3QA 2GZZA 5L71A 4U8PA 3SM8A 3LFLA 1AOGA 2PPTA 4YQMA 1H83A 2E2MA 3UMAA 2WP9A 2XHFA 2E4GA 3FMWA 2DIZA 4AT2A 1S2QA 4TM1A 4GRTA 2C66A 3GRXA 3AEBA 3APOA 4IS0A 3KD9A 1DBYA 4J56E 4OCEA 2JU5A 5G1KA 1XWCA 3IHGA 2BK4A 1QQ2A 4C3XA 3ICRA 3BI2A 1KIFA 5KN1A 1TDEA 3AEGA 4I2TA 2YAUA 5GRTA 2FJBA 2H76A 2OA1A 3N5OA 2WESA 1XIYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4EIQA

Total Genus

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