1YZXA

Crystal structure of human kappa class glutathione transferase
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
sequence length
218
structure length
218
Chain Sequence
LPRTVELFYDVLSPYSWLGFEILCRYQNIWNINLQLRPSLITGIMKDSGNKPPGLLPRKGLYMANDLKLLRHHLQIPIHFPKDFLSVMLEKGSLSAMRFLTAVNLEHPEMLEKASRELWMRVWSRNEDITEPQSILAAAEKAGMSAEQAQGLLEKIATPKVKNQLKETTEAACRYGAFGLPITVAHVDGQTHMLFGSDRMELLAHLLGEKWMGPIPPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
publication title Thioredoxin-like domain of human kappa class glutathione transferase reveals sequence homology and structure similarity to the theta class enzyme
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione S-transferase kappa 1
total genus 74
structure length 218
sequence length 218
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2005-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1yzxA01
1T4ZA 1B4PA 4MMMA 5HQPA 4KSMA 2XHFA 3LGCA 2WFCA 1XXUA 2B5XA 5D96A 4BWQA 2HI7A 2E7PA 3D22A 1TRWA 2OE1A 5HFKA 3TKSA 2OE3A 3TDGA 2H6YA 3C8EA 2DMLA 3CSIA 2PVOC 4HDEA 2IFQB 4OMVA 2IL3A 3ERGA 5JCGA 2MBSA 5IIZA 2LQQA 3QOUA 1TKDB 5GSTA 17GSA 4GCIA 2F8FA 2MBTA 4KA0A 6GSUA 3CSJA 2CV4A 2F3MA 2VCVA 4XS4A 5IO2A 3G7IA 4O32A 2AHEA 3L9UA 4WR4A 2GQMA 1AC1A 3FKFA 5IMZA 2DC5A 2WDUA 1SKWB 4NHWA 5D9VA 2FGXA 2JSZA 4Q5QA 4ECIA 2F8AA 3NZNA 1FVKA 3DKSA 3MAKA 1VF3A 3HVXA 2WS2A 1FOVA 2GS3A 2V32A 2JU5A 4EVMA 2V2GA 3LYPA 3GV1A 4XHMA 2NBSA 3GTUB 2A2SA 1YF0A 1ZYEA 1WMJA 4AGSA 1AQXA 3W8SA 3FYGA 1O6JA 1LU4A 1DE1A 2CVKA 2DIYA 3MSZA 3TKSC 3IE3A 3ZL5A 3MDKA 5CRGA 3BCKA 1U88A 1NSWA 4ZB8A 3TGZA 2I9HA 4TR4A 4G10A 2GZYA 3FZ5A 4XTSA 2CX4A 4LMVA 3O76A 5FT3A 4TR0A 2WB9A 1SL0B 3UBLA 3M3MA 2VLTA 2VL3A 2NDOA 5DBQA 1YEPA 1WOUA 3F8UA 1SD9A 5D9WA 2B1LA 4MZCA 1UA5A 3L9SA 1ZOFA 3H8QA 1AXDA 4IN0A 5G30A 3GSTA 1OYJA 2AYTA 3KH9A 4J2FA 2HSHA 2PN8A 4PUFC 3KH7A 2LRTA 5G31A 2YWIA 2WCIA 5G5FA 2CAIA 4IJ3A 4CHSA 2QKEA 5ELGA 2I3YA 5D9XA 4KCEA 4JU5A 1DSBA 1V57A 2H0HA 2PVQA 2LKUA 4CW9A 1PQNA 2C3NA 1M99A 3ME8A 4IGJA 4ILFA 1EOGA 1O8XA 1XZOA 2VM1A 2FA8A 5ECHB 3LXTA 3QAWA 1ZL9A 4EUYA 1MTCA 2FWHA 4ZB6A 2VM2A 2ES7A 3UVHA 1MD4A 3F4TA 4MF6A 4H86A 1R7HA 1Z9HA 3ZIJA 1GWCA 2H1DA 3CTFA 2HRNA 5E59A 2V6OA 5ID2B 3GHAA 3ERFA 5DALA 1WRYA 3LORA 2C3QA 2GQLA 4MZWA 1Z3EA 4JRRA 1AQVA 1ZZYA 5HR0A 4HEA2 2C8UA 1BQ7A 4IW9A 1O8WA 3P2AA 1E2YA 4MDCA 3CBUA 1GRXA 4PQIA 3FEUA 1K0OA 4MA9A 1M9AA 4NV5A 4ECJA 5GAND 3IDVA 1YJ6A 5ECOB 1GTIA 4MCUA 1MDJA 3GKXA 1Z7PA 1XFLA 1A23A 2IMDA 3R2QA 2DJJA 3SWLA 1PL2A 3HVSA 4YH2A 5EPFA 2EIRA 5B8BA 3ZLPA 2VD0A 3A5WA 6GSWA 1WIKA 1JZWA 1MEKA 1TU7A 3RBTA 4XIHA 1A8LA 2ZNMA 5J41A 3WD6A 3VWXA 2FHEA 1M7TA 1A2JA 3ZMKA 1XWBA 1GLPA 1FAAA 4BA7A 4ECBA 5ECLB 1SKSB 1ERUA 2P0GA 4PX1A 1SJIA 3I69A 5D73A 5AGYA 4KX4A 3LSZA 2QGVA 2JACA 4ZXGA 3UVTA 1QMVA 4I8BA 2QSIA 3LJRA 4EXJA 9GSSA 4XCSA 2PERA 4LA1A 4IJIA 1JLVA 2EC4A 4DSQA 5B8AA 5LNKe 1LJRA 1MD3A 3G7YA 3H4KA 3IAM2 1EEMA 4ECCA 4NAXA 3TJJA 2XC2A 3DD3A 3ZRDA 1E6BA 4TR1B 4OWYA 2YWNA 4K7OA 3IXRA 2WZ9A 3VPQA 4PUAA 5JWQB 1XIYA 3A3TA 3KEBA 2LS5A 4HUAA 2CZ2A 2IMIA 2ZUPA 4OCEA 1EV9A 4L0WA 2H1BA 1K3YA 5DAKB 2KLXA 6GSXA 4MK3A 1O7UA 2LQOA 5COHA 1TDIA 3DRNA 2HLSA 2C0GA 2N5BA 3EMPA 1G0TA 3ZFLA 2PPTA 4F82A 4OFNA 4I2UA 3WYWA 1TK8B 1G7OA 1JZRA 2RM5A 1VF1A 3KMOA 4JZQA 4POBA 1HNAA 5ECNB 3J7Yk 4KDXA 4E8EA 2R2JA 4TN8A 10GSA 1OVNA 2KUCA 3KM6A 1TI3A 4D73B 3P90A 3JCML 4WKWA 1X0RA 3APSA 1S3AA 2J23A 1U87A 3IV4A 2I81A 2HT9A 2QC7A 11GSA 2HXKA 2H19A 1PX6A 4F9ZA 1JHBA 2FCHA 4RQRA 3TKQA 2VCXA 1DUGA 2H0IA 5ECPB 1TOFA 3QR6A 2C0DA 4ZBAA 4GXZA 2R5GA 1QUWA 3APQA 5A4WA 3GH9A 4K7IA 2HYXA 2O87A 4NV2A 1V40A 4G2EA 1F37A 1EEJA 3RPPA 3CTGA 4ZL7A 3Q74A 3DGQA 3ISOA 2B3SA 3F3QA 2X8HA 3DIEA 1N2AA 1XBSA 5C00A 2BMXA 3GA4A 1M2BA 4Q5FA 18GSA 5AIXA 1ILOA 3US3A 3HD5A 1CQHA 3TOTA 3V1WA 2M72A 1QXHA 2L59A 3IAS2 5DJMA 4WXTA 3IK7A 1BX9A 4KGIA 2VL2A 4IKHA 4YQUA 2LRNA 5IMVA 5J3RA 5DCHA 3VPTA 1FB6A 1F6MC 1KTEA 4XS4B 1G6YA 3BD2A 1OKDA 3VWWA 3KP8A 1XCCA 4HZ2A 3H1NA 3HZ8A 3RHCA 3ZVJD 2I1UA 2PMTA 4J56E 4ZBBA 2YWOA 4ZBDA 1YEXA 5H5QA 2E2MA 2H73A 5IM9A 1PSQA 2HE3A 2OACA 1O85A 4MF5A 4L5LA 2KP1A 22GSA 12GSA 1X5CA 2DJ2A 1ACVA 2RLIA 4IS0A 1V58A 4NHZA 2CX3A 1SK1A 3QAGA 4RI6A 2MYGA 1QGVA 3QD9A 1DE2A 2E0QA 1ZMAA 1C72A 2EIOA 4EDYA 2C80A 14GSA 2MMNA 1TRVA 2NVLA 4IQAA 5ECSA 1URMA 1LBKA 3A2XA 1M2DA 4OFMA 4XRAA 1X9WB 3I43A 1V9WA 2HSYA 2VLVA 1R26A 2GSQA 5IOXA 3WGEA 1T3BA 1HD2A 2CT6A 4JBBA 4BL7A 4IVFA 1O73A 2LTKA 5KEJA 4KNDA 2FY6A 1Y6EA 2V6KA 1ON4A 3TJBA 4YQVA 3HJOA 1VRSD 3TCOA 1O81A 3FK8A 2IMKA 2FWGA 4I6XA 2C0EA 5AN1A 3TRPA 4FIWA 2H8LA 2YJHA 1VGLA 4BVYA 5DJLA 3IHQA 3N9JA 4MJAA 2CVDA 4GRFA 4IP1A 3GRXA 2LNSA 3GX8A 1HNCA 3U6VA 1K0MA 2VCTA 2WJUA 1XOBA 1RK4A 4IBPA 1A0RP 5JCUA 4N11A 4DSRA 2K6VA 5DVBA 1H75A 2IN3A 3TKPA 4OO4A 5EL8A 3I9V2 2L5OA 5EVOA 3RAZA 4KDUA 5GAPD 3Q6OA 4MPFA 1I5GA 3FY7A 2MMAA 1I9DA 3HCZA 1FHEA 2B6MA 2JZSA 2E2GA 3F4SA 5CAXA 1Q4JA 3BCIA 1OKTA 3HXSA 1AQWA 4RQXA 5G5EA 2L4CA 2IMFA 3GX0A 1U3IA 1X9MB 2O89A 5J9BA 2AAWA 3QFAC 4XS1A 3ZREA 1PRXA 4NMUA 3D4MA 5HR3A 1SJZA 2NPBA 4BPYA 1TK5B 1FW1A 3FHKA 4K1FA 4MJEA 2HZFA 1SENA 5DALB 5J4UA 2L5LA 3ZITA 4NXIA 3M9JA 4F0BA 1OC8A 2VUPA 3QPMA 3J7Yb 4X0XA 2X99A 4CDOA 3AY8A 5IO0A 5F05A 1QFNA 4RUVA 5LCZA 4IHUA 1F2EA 2RUFA 3GMFA 5IPGA 4FH8A 1OC3A 1NW2A 1TRUA 2L57A 2YV7A 5ECRB 1RQMA 3QFBC 1TW9A 3LXZA 1GUKA 3VLNA 4QQ7A 4P3YB 4MJBA 2VL9A 1EP7A 3G7JA 3HVVA 4ID0A 4KDYA 2H6XA 1GSDA 2F9SA 3U5RE 4KW6A 3D21A 2KP2A 3F63A 1UVZA 4K6XA 3RPNA 1SU9A 1YY7A 4V1Ap 5GSSA 1WJKA 5CREA 4EKZA 1K0AA 3GFKA 4MZBA 4PQ1A 3KP9A 3ZVJA 4K0GA 5B6NA 1ML6A 1TP9A 3PGTA 4MH2A 2DJ1A 2YNXA 3ZYWA 3M0FA 1XPVA 2B1KA 3HA9A 4HU7A 1ABAA 1ZYQB 2JSYA 1OE7A 1YKCA 4GSSA 4TVEA 1J08A 1QK8A 1GH2A 6GSVA 3CRTA 2YN1A 4LLRA 2K8VA 2R37A 1K3LA 3BOAA 4IP6A 3LWAA 2YWMA 5LD0A 4G9HA 4PQHA 4XS6A 5AISA 4AF2A 2M80A 5INYA 4EO3A 2YZHA 3GYKA 2K18A 1QQ2A 2H74A 4F0CA 2OADA 2CA8A 1PL1A 3RHBA 1X9SB 2OBIA 3F3RA 4K9ZA 3VWUA 3EVIA 3KD0A 4MPGA 5HR1A 1N8JA 1GL8A 2OKAA 4HZ4A 4KUNA 3E3EA 4PXOA 4NWYA 3TRXA 4N30A 4WBRD 3TKSE 1S3DA 3C73A 1IYHA 3M9KA 1FG4A 1GTUA 1XWKA 5J9CA 1A2MA 1K3OA 2ALBA 3F9UA 3EE2A 3N5OA 1USBA 1YF1A 1XOAA 3NOFA 1OC9B 4HJ2A 3ME7A 4HU9A 2IMEA 1HYUA 4GF0A 4MLYA 1FO5A 1F3BA 4JR6A 1G7EA 4FYBA 1GSSA 1GSYA 2TRCP 3KIJA 2O85A 2PBJA 4JEDA 5ECIB 4DEJA 1A8YA 4N10A 4OO5A 1WP0A 3QMXA 2LSTA 1EGOA 4WEYA 4KE3A 2YPMA 4OD7A 4ML6A 3HZ4A 5FWGA 2N5FA 1EOHA 3C7MA 1BEDA 1AAZA 2Z9SA 4L0UA 3W6GA 1HNBA 2DMMA 1WWJA 2H1GA 4NPBA 2ON7A 3UJ1A 3BJ5A 3CYNA 3TJFA 2P5RA 4PURA 1YKAA 3IR4A 3DMLA 5JWOB 1UN2A 3EYTA 2GDRA 1S3CA 2M46A 5JCWA 2H1AA 4TXOA 3LQ7A 4ULXA 2EIQA 4WR5A 1T1VA 4GQCA 6GSTA 3ZZXA 2DJ0A 4TXVA 1U6TA 3GIXA 3A2WA 5F07A 5H5RA 3FZAA 1GSFA 1SL1B 3FW2A 2N5AA 3D0ZA 3FRCA 3UARA 4N0ZA 3WGDA 1IYIA 1Z6MA 13GSA 5A4VA 5ENUA 6GSSA 3CRUA 5F0GA 2BJXA 5B6MA 5IMDA 1VF4A 4TR1A 1X5EA 3QCPA 2WRTA 5DDLA 3K8NA 2AV4A 1TU8A 2RIIA 3GL3A 1X5DA 1AIUA 1PKZA 4LL4B 3EMXA 4EC0A 2H01A 4HS1A 1GSEA 1SYRA 4ZL9A 2REMA 5CO3A 1GTAA 1TRSA 3EU3A 3F6DA 3IRAA 1JLWA 3D5JA 5IPHA 3RDWA 5B7CA 5ECQB 2TRXA 3NIVA 2LRCA 4AJ6A 4AJ8A 2WGRA 1Y25A 4BVXA 3W8JA 1B8XA 2LJAA 2FNOA 3IC4A 3ZTLA 3HKRA 3BBYA 4MF7A 4WF4A 3TKRA 4MJCA 2L6CA 2YANA 4KH7A 4AJ7A 1PX7A 3MWHA 5CRWA 2GLRA 1YZXA 2HZEA 4O5RA 5G1KA 3UIWA 5HFIA 5KN1A 2CQ9A 1FB0A 2DJKA 3ZIVA 4ML1A 4ZIJA 3E0UA 3DVWA 3LFLA 5D93A 1MDKA 2BTOT 2HFDA 2GQKA 2A4VA 3UAPA 1CQGA 4YAVA 2O7KA 2LEGA 2IIYA 3FZ9A 3ZFBA 2X8GA 3ED3A 5E4WA 3IK9A 3HJMA 2R4VA 1EP8A 3LEFA 4X43A 2VOCA 4HOJA 5KN0A 5H5SA 4O92A 3MNGA 2GZZA 4GTUA 4KAEA 1ZGNA 2H0GA 3ERWA 1B9XC 1XW5A 4PNFA 2FUG2 2P31A 2IWTA 2XBIA 1XWGA 7GSSA 4N0VA 4OFTA 3UBKA 2DSAA 1JZDA 4Z7XA 5IOWA 1ERTA 1NHYA 3TRQA 2IPAA 4WBJA 1GULA 4DVCA 2YCDA 4GSNA 2PU9C 4ZB9A 4HI7A 4JR4A 3FR9A 5GZZB 3CMIA 5CP1A 2VL2C 1T00A 8GSSA 2GT6A 2I4AA 2K9FA 1ERVA 2YV9A 1KBNA 3S9FA 2MZCA 1FVJA 2VAFA 1YQ1A 3QAVA 2GZPA 4KSOA 2H70A 3GKMA 3I6AA 3KCMA 4DSSA 1AUCA 4IQ1A 5CRHA 4KCAA 4EDZA 1XVQA 2O8VB 4I97A 2CAQA 1BYEA 4JE1A 1HQOA 5IQYA 1XW9A 2FWEA 3HY2A 2C1YA 4F03A 2R3XA 4GSTA 5DQYA 3WGXA 3A2VA 2FWFA 4WETA 1XW6A 4BWSA 2ZCTA 3F4RA 3KGKA 5CNWA 1H4OA 5L71A 1MDIA 3TUEA 1R5PA 1RW1A 2VCZA 2IFQA 5ABRA 3PH9A 3KJYA 3DEXA 1M0UA 4ZILA 3IBHA 2PUKC 5IMAA 3HYPA 3EWLA 4ISDA 1W4VA 5JWRB 4X1UA 4MP4A 2LJKA 2YJ7A 2AB6A 4GWRA 2GGTA 1Z5YE 3VI7A 2L4QA 2X64A 2DLXA 2NTOA 1SK2A 3E9JB 3HHVA 1SJ6A 2G2QA 4V1Ag 3GL5A 2H71A 4J57E 2WULA 5D8IA 1AW9A 2DBCA 5G1LA 1GSUA 3GNJA 4G19A 5G2ZA 2AUVA 3H93A 4Q5NA 2PWJA 1WPIA 5F8BA 3WT2A 4POKA 2RM6A 3GTUA 2CVBA 4ZL8A 2CZ3A 2HNLA 1PN9A 4V2NA 4TRXA 4F2IA 3LYKA 2YOIA 3LG6A 2VLUA 3L9VA 2KHPA 4O7HA 2P5QA 5EY6A 4ACSA 1TJDA 4RI7A 4LMWA 2C4JA 4XRDA 2YP6A 3P7XA 1JZOA 2OE0A 3TB2A 5A4UA 3VK9A 4HQSA 3OR5A 3APOA 5DCGA 1EZKA 2C3TA 3C71A 1OE8A 3O6TA 5ECMB 4POLA 1V2AA 19GSA 1BJXA 1SYXA 1TTZA 2GT5A 1M9BA 3TOUA 3TJKA 3EINA 4HQZA 5CYYA 4IELA 2XPEA 3D6IA 2G0FA 1TK0B 4Q5RA 3IPZA 4K7NA 1GP1A 2F51A 3ZMLA 1A24A 5HR2A 4MH3A 4TW5A 1K0BA 1B4QA 3O3TA 3EU4A 3H79A 4TR3A 2VIMA 1K0DA 1NM3A 4L8EA 2TIRA 5IMFA 4WF5A 1GUMA 3IA1A 2L6DA 2V41A 3DXBA 1PKWA 3Q19A 2PGTA 4V2LA 1VF2A 3M1GA 5D9TA 1A2LA 1ZCPA 3UEMA 5CRDA 4TXOB 1PD21 3GURA 5FHIA 1YDKA 1PGTA 1SL2B 2H66A 1J0FA 1XWAA 1GNEA 1THOA 1XVWA 1G6WA 2VCQA 3GUSA 1UC7A 5A5KA 1KNGA 4QL7A 2IJYA 2VCWA 4EE0A 3Q18A 3DWVA 2LUSA 5ID2A 3L78A 1SD8A 1EWXA 4TKYA 4K0NA 1GTBA 2OA7A 3TJGA 3P8WA 4YAPA 4POMA 1U3AA 3EURA 2B7JA 1BAYA 2X8CA 4TOPA 1T7PB 4FYUA 4EF0A 5HFGA 3GSSA 2OBKA 1ST9A 1R5AA 3G9BA 2B7KA 3VFIA 1M2AA 1V98A 3GKNA 1PMTA 1T4YA 4HJMA 3VWVA 2LJRA 1B48A 4I2TA 5KN3A 3C1SA 1J9BA 3VURA 4E8HA 2A2RA 3HDCA 4KB3A 3F0IA 2AJQB 1W89A 3VI5A 2VO4A 2H76A 3EC3A 3KXOA 2XBQA 4YQMA 1F9MA 16GSA 3PINA 3CSHA 3QDNA 2JZTA 2DIZA 1EV4A 2LNTA 5AIVA 4PNGA 1T8EB 3L0HA 2GTUA 3GN3A 3KMNA 2C0FA 2D2ZA 2B5YA 4FYCA 1K0NA 2JL4A 4K2DA 4L5OA 5J5NA 2HZEB 2JADA 4FO5A 3PR8A 3C1RA 1GLQA 1OC9A 5ELAA 2B5EA 2FA4A 5ECKB 1Q98A 4OCFA 2H72A 2FD3A 2K8SA 1WE0A 3L4NA 3DVXA 3UL3A 6GSYA 1TXXA 2RUEA 1OAZA 3GH6A 1Z6NA 2FLSA 2ON5A 4GQFA 2VD1A 5DQSA 3CXGA 2HRFA 3GKKA 3KTBA 3SBCA 1A0FA 3FZ4A 3M8NA 3HJPA 4I5QA 4MABA 3F6FA 2R6KA 2GSTA 2GSRA 3WT1A 4V2MA 1Z7RA 2H75A 2JZRA 2KOKA 1F3AA 2MMOA 1K0CA 1THXA 2MMZA 5KN2A 5DAKA 4GLTA 1BG5A 1GSQA 3UOMA 5IMCA 2OJLA 1NHOA 3D4TA 2DJ3A 2V1MA 1SK0A 4QL9A 1PA3A 2LV3A 4K8MA 1SKRB 2GVPA 1ERWA 1B9YC 3FR3A 2XPDA 1DBYA 1GUHA 5F06A 1JFUA 1KEBA 2H6ZA 4D73A 1GNWA 3DYRA 4LL1B 2YZUA 2GSSA 1XWCA 1TI1A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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