3C1SA

Crystal structure of grx1 in glutathionylated form
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
VSQETIKHVKDLIAENEIFVASKTYCPYCHAALNTLFEKLKVPRSKVLVLQLNDMKEGADIQAALYEINGQRTVPNIYINGKHIGGNDDLQELRETGELEELLEPIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Glutathionylation-triggered conformational changes of glutaredoxin Grx1 from the yeast Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-1
total genus 39
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2008-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3c1sA00
2OE3A 4G9HA 1VF4A 4LMVA 1EEJA 4OMVA 2PPTA 3VPTA 2OKAA 3BD2A 3FRCA 1YY7A 2WRTA 1GSUA 2H8LA 4WBJA 2GDRA 1O81A 5CO3A 1RK4A 2FWHA 1O7UA 2GT5A 4ECCA 4XRAA 4ZXGA 3MSZA 4WXTA 3GTUA 4MH3A 4I5QA 4Q5NA 2TRXA 1GNEA 5ECNB 2O85A 4K2DA 2YNXA 2WULA 2PWJA 4FYUA 5ID2A 4RUVA 3UBKA 3HXSA 4XS4B 3GMFA 3CSJA 1TP9A 1SJZA 4G19A 3RPPA 9GSSA 4YQVA 3IK9A 1PKWA 4EE0A 2GT6A 1GTUA 4JBBA 5CNWA 3SBCA 1ABAA 4I2TA 2L6DA 3P90A 2F3MA 3R2QA 1CQHA 1X9SB 3QMXA 4FYBA 1JFUA 2KOKA 4MJBA 3TRPA 4HU9A 2FUG2 3M9KA 4N11A 2IIYA 5J5NA 1TU7A 3VLNA 2FWFA 2R2JA 2H19A 4IVFA 3IOSA 4KX4A 4N0VA 3AY8A 4IW9A 3MWHA 2LSTA 5IPHA 1F3AA 2IN3A 1I5GA 3GIXA 5AIVA 4NHWA 5E4WA 2V2GA 4TOPA 2YWIA 1TXXA 2GQLA 2DMLA 4OCFA 3IK7A 1EGOA 4HZ4A 3EMXA 1BYEA 3ZIVA 3UJ1A 3ZL5A 4XIHA 3IDVA 3QCPA 3ZIJA 2IMFA 2B5YA 1KNGA 2AV4A 4MLYA 4KCAA 1WMJA 5A4UA 2HFDA 2AUVA 2HSYA 3P7XA 4N0ZA 3D22A 2L59A 1C72A 3WD6A 3UBLA 1U3AA 12GSA 5EL8A 2J23A 2REMA 3H1NA 3EYTA 3Q18A 2V41A 1SENA 1JZOA 2C3QA 4LL1B 2N5AA 5DDLA 1PKZA 3I43A 4EXJA 3GA4A 1TK0B 3UIWA 1ZOFA 1GWCA 3WYWA 1PN9A 2CAQA 3GH6A 4PURA 4ECBA 1OKTA 2XPDA 1LU4A 2GLRA 1T4ZA 5D8IA 4KH7A 1V58A 2ALBA 3TUEA 1Y25A 2J9HA 1W4VA 4V2MA 3PGTA 2JL4A 2H1DA 3HD5A 2BMXA 2ZCTA 5KN1A 3CYNA 6GSVA 3DKSA 3GSSA 3F4RA 5DCHA 3F3QA 2ON7A 4KDXA 1F2EA 3TGZA 4L0UA 3UAPA 4FH8A 2L4QA 5IO2A 2FGXA 5JCUA 3IC4A 5DBQA 3BJ5A 1YF0A 3DVWA 2OBIA 4V1Ap 3DXBA 2GSQA 3CXGA 4O5RA 1T00A 3ZVJA 1QMVA 1PX7A 4JR4A 1ZCPA 2A2SA 1LJRA 4MCUA 1U87A 3FZ4A 5F0GA 2YWOA 5IOWA 4KSOA 4IKHA 4XS4A 3LYPA 3ZMLA 3Q6OA 1K3YA 1A0RP 4LA1A 1GSDA 3C73A 4PGTA 3GH9A 2MMAA 3O6TA 4POLA 4MA9A 1HYUA 5AISA 2IPAA 3KTBA 4ZB8A 1JZDA 2CVDA 1KEBA 3ME7A 3W6GA 3GL3A 2X8HA 4IQ1A 4KUNA 2FY6A 4NHZA 1S3AA 2PBJA 3EC3A 3PR8A 2V32A 5FHIA 3APSA 1Z6MA 4ZB6A 3VWWA 3HVVA 4K7IA 5ELAA 3EWLA 3HDCA 4KDYA 5IO0A 4OCEA 1AAZA 2K6VA 2DIYA 1XPVA 4WKWA 1ZGNA 2ZNMA 3LWAA 2HZEB 4OFNA 4LMWA 2FD3A 3QAGA 3QOUA 1BAYA 4OO4A 2L6CA 2VCXA 1XXUA 4MZCA 3C1SA 4TKYA 3TCOA 4K1FA 4I97A 1X9WB 1K0CA 3ME8A 3GUSA 1G7OA 1M7TA 3CTFA 4IBPA 4X1UA 1SYXA 2R4VA 3EU4A 1XWCA 4H86A 1T3BA 5JWOB 4DSRA 5FWGA 4BWQA 2YWNA 1R26A 2HT9A 1YKAA 2KLXA 3UOMA 1K3OA 3RHCA 1R5AA 1OE7A 3P2AA 2H0IA 6GSXA 1Z7PA 2XBIA 2BJXA 2H70A 1WOUA 1XFLA 1YJ6A 1BG5A 5CREA 1GULA 4DVCA 1HNBA 2O89A 2TIRA 4KW6A 4Q5RA 1X5DA 1M9BA 1M2DA 4HJMA 4ML6A 1X0RA 1OC3A 4I8BA 3TOUA 2E0QA 1SJIA 20GSA 4TXVA 3DMLA 5D9XA 2DMMA 3A2XA 5KN0A 2L5LA 1BX9A 1NM3A 4PUFC 2HRNA 3D5JA 1UN2A 4MF6A 3WGDA 5JWRB 1V57A 1V98A 2P5QA 3WT2A 2DC5A 1FVKA 4XRDA 4JE1A 2X8GA 3ZLPA 4PNGA 1B4QA 2B5EA 1A24A 1ML6A 5IPGA 1GSQA 4MPGA 1EOHA 3MAKA 2PERA 2VCVA 3FZ9A 3HY2A 1GNWA 1SK0A 3K8NA 1SL1B 5J3RA 4MF5A 3A2WA 1R7HA 2VD1A 1BQ7A 5IMDA 3GFKA 5ECMB 14GSA 3GV1A 2C80A 4PQ1A 2X64A 3QDNA 4MJEA 3KJYA 1BJXA 3GSTA 3E9JB 2C0FA 3VI5A 4N30A 2WB9A 1HD2A 2VCZA 3HCZA 3CSIA 2LQQA 4KDUA 5G31A 4QL9A 2CQ9A 3LEFA 2V1MA 4PXOA 5HR3A 6GSYA 4ZILA 1J0FA 2GVPA 2OACA 1M2BA 3H4KA 3ERGA 4OWYA 3VWXA 2DJ1A 4PX1A 1M2AA 3NOFA 4YH2A 3D4TA 3BBYA 10GSA 2JACA 1Z7RA 5CRHA 3ZZXA 3UMAA 3D4MA 1K0OA 3OR5A 1SYRA 3I9V2 2H0HA 4GLTA 1XWBA 1ERWA 2B1KA 2EIRA 2DIZA 4V2LA 1OKDA 5F8BA 5G1KA 3CRUA 2H1AA 3HA9A 5HR0A 1OC9A 2WDUA 2XHFA 3RHBA 4IQAA 4EUYA 4MF7A 2HZEA 5DCGA 1WP0A 3QAVA 1HQOA 2F9SA 5KEJA 3G9BA 4NXIA 1HNCA 4P3YB 2AB6A 5H5SA 2MBSA 3GKNA 2PGTA 1XIYA 2E2MA 2FLSA 4DSSB 5B8BA 2B7KA 3C1RA 3UL3A 2H74A 2GZPA 4QQ7A 1SD9A 1PX6A 4PQHA 4HI7A 3LYKA 4NWYA 2RM6A 3LGCA 5INYA 5IMCA 5IMAA 5D73A 2I81A 3F3RA 1Z6NA 2I3YA 1K3LA 3FEUA 2C8UA 5GAPD 4GWRA 4RI7A 2GGTA 5CP1A 1CQGA 2H6XA 1UA5A 2CT6A 4TXOB 3KM6A 5G5EA 19GSA 4ECJA 2Z9SA 1B48A 2LKUA 3IV4A 2DBCA 5DALA 1G0TA 1GSYA 2FA8A 3IA1A 1E2YA 1MDKA 5GZZB 2CA8A 3FK8A 1GTBA 2IWTA 3VWVA 4HDEA 2CX4A 1OC8A 2MZCA 4BVYA 5EVOA 3RDWA 2WS2A 2ZUPA 1IYIA 2YV7A 1TDIA 4ULXA 5DAKB 2GZZA 1GSEA 1O85A 5DVBA 5G1LA 2H72A 4XCSA 5D9TA 4TW5A 3ZTLA 1PMTA 1YQ1A 4TRXA 2HI7A 1EGRA 4TR3A 5ELGA 4X43A 3GX8A 4XTSA 3M9JA 4IGJA 4BVXA 4NPBA 3J7Yb 2H0GA 4EO3A 1N8JA 1EWXA 3HZ4A 3F8UA 3O76A 2R5GA 1A2JA 4ZBBA 5LD0A 2DJ3A 5HR2A 6GSWA 1MEKA 2CZ3A 2X8CA 3A2VA 4EL1A 1KBNA 2ON5A 1SKRB 3KCMA 1TRSA 4MMMA 1RW1A 1U6TA 4HQSA 2QC7A 1GUMA 2JZSA 2TRCP 1FO5A 1OAZA 5ECHB 5ECKB 1WE0A 2QSIA 1XVWA 2WZ9A 7GSSA 1JZWA 4TN8A 4WETA 3UVHA 4K0GA 4LL4B 4G10A 5A5KA 2WGRA 1B8XA 1TK8B 3D21A 4AJ6A 2AHEA 3P8WA 4YQMA 1ST9A 3EMPA 3ZREA 3HJPA 4AJ7A 2LNTA 1QFNA 5ABRA 3LG6A 1URMA 2IL3A 2YZUA 1WWJA 3M3MA 4OFTA 1QXHA 1Z9HA 1F6MC 4ZBDA 4J56E 4DSSA 3HVXA 4TR4A 3TRXA 2K18A 4BL7A 4X0XA 3LJRA 2EC4A 3TKQA 4POKA 3KD0A 1AQWA 3M1GA 2DJ2A 3KIJA 1OYJA 1MD4A 2YPMA 2VM2A 2ES7A 2JSZA 2AYTA 4YQUA 3KP8A 3APQA 2VM1A 5AIXA 5ECSA 3DYRA 4GSNA 4L5LA 2H1BA 1EOGA 2RM5A 1USBA 1S3DA 4TXOA 4WBRD 2M46A 4V2NA 2QKEA 3IPZA 3QAWA 2LRCA 1OVNA 3ZYWA 5ECIB 1SU9A 4NV2A 4O92A 4POMA 4WR4A 1Q98A 2L5OA 4IJ3A 4XS1A 3L9SA 1TU8A 1HNAA 2P0GA 5D93A 4XS6A 3QPMA 2LS5A 2KP2A 1DUGA 1TW9A 4Q5QA 3G7IA 1NHOA 5ENUA 3IAS2 5JCGA 3ERWA 4FIWA 3TDGA 4WF4A 3W8SA 2A2RA 4WEYA 1EZKA 1B9XC 3F63A 3C7MA 4O7HA 5JWQB 4GTUA 1R4WA 1ZMAA 3LORA 2GSSA 4IN0A 3W8JA 1G7EA 1A23A 3DD3A 1R5PA 2MYGA 2VCWA 3CSHA 1AUCA 4F2IA 4GRFA 3C71A 1YZXA 5IOXA 2VUPA 5HQPA 2K9FA 3VWUA 4K9ZA 3H79A 1TI3A 2YJHA 1EP7A 2FHEA 4HUAA 3NZNA 3TB2A 3IR4A 4ZL8A 1EP8A 3Q19A 1XWAA 1XWGA 3VK9A 5G30A 1ZYEA 2CVKA 5G5FA 4EKZA 3WGEA 4FYCA 3MNGA 3FKFA 5B6MA 1EV4A 2VAFA 1XOAA 3BCIA 5A4WA 3IRAA 4K7NA 1FB6A 3ERFA 3FYGA 13GSA 4HU7A 1V40A 1ERVA 1AQXA 2DJ0A 1FW1A 3EU3A 3FR3A 3J7Yk 4MP4A 4Z7XA 1F3BA 2CAIA 1TRVA 2H66A 4MJAA 1B9YC 2OJLA 1G6YA 4ISDA 2C0EA 2F8FA 2VO4A 1TOFA 2YP6A 4EDZA 4F0CA 4IP6A 1ZL9A 3GTUB 3US3A 1K0MA 5B7CA 3HJMA 1X9MB 3KEBA 2OADA 4GSTA 5CAXA 2G2QA 3ISOA 2I9HA 2IFQB 3ED3A 3QD9A 5F07A 2IMIA 3WGXA 2VL2A 1J08A 3DGQA 3GRXA 1FOVA 1PSQA 2FNOA 2P31A 2LTKA 1T1VA 3PH9A 1MDIA 2PN8A 3LQ7A 4BA7A 3JCML 5C04A 2DJKA 3DWVA 2YWMA 4GQFA 22GSA 3KTLA 3GNJA 1XW9A 1A2MA 2NVLA 5KN2A 5IM9A 5GAND 2XC2A 2B3SA 2HLSA 2EIOA 3TJJA 3UARA 3F0IA 2WJUA 1SD8A 2IJYA 3FY7A 4ZIJA 2PVOC 2FCHA 1SL2B 1ERTA 2HZFA 4N10A 2L4CA 2GSTA 1TRUA 4ZBAA 2OE0A 1MD3A 3TJKA 4LLRA 1PGTA 5ECOB 1K0DA 3MDKA 1YEXA 5J9BA 5GSSA 2R6KA 3L78A 5KN3A 3D6IA 4GSSA 4MDCA 1EEMA 2C4JA 3GKXA 3M0FA 1H4OA 1SJ6A 2VLUA 4GXZA 3CBUA 3FR6A 1VF3A 1F9MA 16GSA 2JSYA 1UVZA 1GTIA 2H76A 1O8XA 2I1UA 1A8LA 1UC7A 1M9AA 2YOIA 4PQIA 1K0BA 2DSAA 2LJRA 2H6ZA 4TR0A 2XBQA 1TK5B 1Z3EA 2YZHA 3LSZA 1PRXA 4WF5A 3FHKA 5J9CA 1VRSD 2B5XA 2H71A 3FZ5A 2HYXA 1GUHA 5FT3A 2X99A 2GSRA 1ACVA 1GSSA 3CMIA 3VFIA 2FWGA 5B8AA 4AF2A 2GTUA 4TR1B 4D73B 5A4VA 4NAXA 1DSBA 1F37A 4CW9A 4OFMA 4KB3A 1ILOA 4V1Ag 1V2AA 1T7PB 3LXZA 3M8NA 1XZOA 3NIVA 3IAM2 1DE1A 3RBTA 1PL2A 1GP1A 1AC1A 2HSHA 3LFLA 4HJ2A 1K0AA 3HVSA 2H75A 2JZTA 1LBKA 1T8EB 4ILFA 4E8EA 2JU5A 2QGVA 2IFQA 4IHUA 4L5OA 1NSWA 1OE8A 3E3EA 3FR9A 5IQYA 2GQKA 1GTAA 3HHVA 3TKRA 2CV4A 2VL2C 3I69A 1V9WA 4F82A 1YF1A 2KP1A 5DQYA 4L8EA 4K0NA 4YAPA 4MK3A 2VLVA 4K8MA 3IE3A 5EY6A 1N2AA 4KCEA 1G6WA 1MDJA 4HS1A 2HRFA 3KZQA 3GKKA 1MTCA 3F4TA 5DQSA 4MABA 2GZYA 1QK8A 2YN1A 5EPFA 3VI7A 3TKPA 2GS3A 3TOTA 2DLXA 4EF0A 1VGLA 2IMEA 2LJKA 1O73A 2HXKA 2N5BA 2G0FA 5H5RA 2VIMA 4OD7A 3GN3A 3O3TA 2E2GA 2H73A 4RQRA 2NTOA 1KTEA 3U5RE 2MMNA 2YV9A 1XOBA 4PNFA 3LXTA 3UVTA 3G7JA 1WJKA 1VF1A 5J4UA 1PQNA 3APOA 1GSFA 2JZRA 4EVMA 2WCIA 5ECPB 2YANA 3DEXA 2LV3A 4JZQA 3IBHA 5LCZA 2FA4A 2B7JA 8GSSA 2F51A 2OA7A 2YCDA 2VD0A 3KXOA 2H1GA 1SK1A 2VLTA 1B4PA 1PL1A 5HR1A 2C3TA 1AQVA 2K8SA 1JZRA 4TVEA 2NPBA 4J57E 5IIZA 3TKSC 1X5CA 3EURA 6GSUA 2C0DA 4POBA 4K6XA 1IYHA 4J2FA 4ECIA 2LRTA 3ZMKA 2C1YA 1THXA 1WPIA 3G7YA 5G2ZA 3E0UA 1U88A 3Q74A 4MJCA 4AGSA 2KUCA 4KA0A 2H30A 2O8VB 5C00A 1T4YA 4F03A 2RUFA 3HYPA 1E6BA 5CRDA 4TR1A 4D73A 4KNDA 1NW2A 2YJ7A 4E8HA 1Q4JA 1TKDB 4ZL7A 3UEMA 3A3TA 4IJIA 2RIIA 1YEPA 3DIEA 4XHMA 6GSSA 1A0FA 11GSA 2R3XA 3QR6A 2LEGA 3EE2A 2O7KA 1FB0A 1GL8A 2PVQA 5DJLA 4KE3A 4OO5A 4HOJA 1VF2A 4JU5A 3RPNA 5L71A 1JHBA 3GURA 5DAKA 3N9JA 4IELA 1FVJA 2LRNA 3HZ8A 2LQOA 3U6VA 2L57A 4F9ZA 3KP9A 3KMNA 2B6MA 3L9VA 3IXRA 2VL3A 1SKWB 5HFGA 5D96A 2GQMA 3A5WA 1U3IA 4QL7A 5HFKA 3GKMA 4BPYA 3RAZA 5IMZA 2E7PA 1FAAA 3V1WA 3N5OA 3HKRA 3D0ZA 3F6DA 3IHQA 1OC9B 2RUEA 4DEJA 3ZVJD 3EINA 2PMTA 4PUAA 4ID0A 3TKSE 2OBKA 1TJDA 4RQXA 4GF0A 2LUSA 2I4AA 2D2ZA 5J41A 5CYYA 4CHSA 3WT1A 3KH9A 2RLIA 2VCTA 1GRXA 1Y6EA 3VPQA 1Z5YE 3FW2A 3GL5A 3KH7A 1YKCA 1TI1A 2C3NA 4MPFA 1A8YA 1DBYA 1FHEA 5IMVA 4GCIA 4ZB9A 4ACSA 2WFCA 18GSA 5B6NA 2AJQB 3L4NA 2AAWA 4I2UA 1A2LA 1H75A 1ON4A 2V6OA 1XW6A 4K7OA 1THOA 4KAEA 5CRGA 5DJMA 1M0UA 1WIKA 3BCKA 3C8EA 2H6YA 4MZWA 3H8QA 3CRTA 3F9UA 2NDOA 1XWKA 5DALB 1X5EA 4JEDA 1SK2A 1ZZYA 5ID2B 3H93A 1XW5A 1JLWA 4RI6A 4NMUA 3KMOA 3TJBA 5GSTA 3L0HA 4DSQA 5COHA 1GLPA 5E59A 5IMFA 3GX0A 3ZRDA 2MMOA 5F06A 4NV5A 4AJ8A 2BTOT 4IP1A 1GLQA 3TJFA 2H01A 3EVIA 4YAVA 3GYKA 4HQZA 1O6JA 1ERUA 1J9BA 3DRNA 1BEDA 1GUKA 2LJAA 3BOAA 1PD21 17GSA 2MMZA 3ZITA 5ECQB 4MZBA 2PU9C 3S9FA 2VL9A 3CTGA 2CVBA 3ZFBA 2KHPA 3TRQA 4CDOA 4F0BA 1AIUA 2VCQA 2P5RA 3L9UA 5HFIA 3FZAA 4GQCA 5F05A 1DE2A 2NBSA 4JRRA 5CRWA 1QGVA 1XCCA 2K8VA 4O32A 3VURA 1TTZA 2IMDA 2IMKA 2XPEA 2M80A 2M72A 1I9DA 1NHYA 5AGYA 2O87A 1O8WA 3ZFLA 4KGIA 2OE1A 4BWSA 1JLVA 2LNSA 2EIQA 2CZ2A 1EV9A 5D9WA 3TJGA 2C0GA 1M99A 2CX3A 4ZL9A 2R37A 1TRWA 3F4SA 2MBTA 2A4VA 2V6KA 3QFBC 2HE3A 1AXDA 5D9VA 6GSTA 4HEA2 4IS0A 2N5FA 3QFAC 4EDYA 5ECLB 4ML1A 1SKSB 3SWLA 5ECRB 3F6FA 2F8AA 5JCWA 1YDKA 2HNLA 5LNKe 1XBSA 1XVQA 4Q5FA 1PA3A 3TKSA 3HJOA 5H5QA 1WRYA 1AW9A 4JR6A 1RQMA 4EC0A 1ZYQB 3KGKA 1SL0B 1W89A 4HZ2A 2B1LA 2PUKC 4MH2A 4I6XA 2JADA 3DVXA 2FWEA 1GH2A 4G2EA 3PINA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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