3C1SA

Crystal structure of grx1 in glutathionylated form
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
b'VSQETIKHVKDLIAENEIFVASKTYCPYCHAALNTLFEKLKVPRSKVLVLQLNDMKEGADIQAALYEINGQRTVPNIYINGKHIGGNDDLQELRETGELEELLEPIL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Glutathionylation-triggered conformational changes of glutaredoxin Grx1 from the yeast Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-1
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 39
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2008-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3c1sA00
5INYA 1M2AA 2PVQA 4XS1A 2AHEA 2C0GA 5DVBA 4EC0A 3M1GA 4WXTA 3BCIA 2XPEA 4HI7A 1XPVA 1ZZYA 2BTOT 4D73A 3IBHA 1DE2A 1M9BA 5B8BA 3TJGA 2PU9C 2HXKA 2H1DA 2ZUPA 2NVLA 5HFIA 2M46A 2B7KA 1NHOA 4KA0A 1I9DA 3F63A 3PH9A 4PGTA 5ECRB 4ID0A 4KX4A 2FWGA 3IE3A 4PNGA 1OVNA 1UVZA 5D9VA 5FT3A 2H0HA 2VM2A 3PINA 4BVXA 2LNSA 3QOUA 4MZCA 2PBJA 4DVCA 3U6VA 1OC8A 5J3RA 2XBIA 1IYHA 1ML6A 5G5FA 3F0IA 17GSA 2OBIA 2N5AA 3QPMA 4ILFA 1FVJA 2P31A 1QUWA 2HRFA 4LLRA 1JZWA 3HJMA 5ECKB 4TKYA 1VF2A 4L8EA 3BCKA 3IDVA 3TOTA 1DUGA 3JCML 3UAPA 11GSA 4J57E 5JCGA 4I6XA 4NPBA 1AQWA 1EEJA 5ECPB 3VK9A 3KMOA 1HNAA 2GZZA 4ZILA 2VCWA 3ZREA 5DJLA 3GV1A 5A4UA 3W8SA 1HNCA 3ME8A 2E2GA 4DSRA 1PQNA 3F3QA 2GVPA 4WF5A 1EV9A 1T8EB 2R2JA 3O6TA 13GSA 2AJQB 5COHA 2AV4A 1K0CA 1B8XA 1ERUA 1Z5YE 2HYXA 1Q98A 4ZL7A 2DLXA 4LL1B 4FIWA 1OYJA 3TKQA 4MF6A 1PGTA 4V2MA 2V6KA 2EIOA 7GSSA 3VWXA 1EWXA 1OAZA 3WGEA 1T00A 1GRXA 1XW5A 3ZMKA 1UA5A 1B48A 3FR3A 1ZYEA 2XHFA 5ECNB 1TOFA 3M9KA 2R4VA 4KCAA 4MH3A 1SYRA 4V1Ap 2R3XA 1AIUA 4GTUA 5F05A 3D4MA 5ELAA 4HEA2 1TRSA 4TW5A 5IPHA 4POBA 1R5PA 3GMFA 5G1LA 1WOUA 2OE3A 2F8AA 4MJEA 2CVDA 2K9FA 4IQAA 4XS6A 4L5LA 5CO3A 5ECQB 2PVOC 3TRPA 4HOJA 4ECCA 4XTSA 4YQUA 3E9JB 4KB3A 4POMA 5F0GA 3TJBA 1V57A 3A2XA 1XOAA 2IMDA 2GGTA 3BD2A 4I8BA 3ZVJD 1JFUA 4PQIA 2LRNA 2VD1A 1YQ1A 3HXSA 2P0GA 3VPTA 3E3EA 1XWCA 3KD0A 1USBA 1QMVA 5ELGA 4MK3A 5FHIA 3C1SA 1XW9A 2H1AA 1T3BA 4V2LA 4XRDA 2JZSA 3UVTA 2V41A 3PR8A 4ECJA 5CRWA 4MJAA 1T4YA 4RI6A 2JACA 2H75A 1A23A 5B7CA 5C04A 2FA8A 5JWRB 4MPGA 2GQMA 1J0FA 4DEJA 2H6ZA 3DVXA 4Q5RA 1M0UA 4GCIA 3EYTA 3FKFA 3F4SA 3IXRA 4N30A 2TRXA 2FLSA 4ZIJA 1MD3A 4OMVA 4ZB8A 1E6BA 2VL2A 5E4WA 1RK4A 2O87A 1Z6NA 4JR4A 2VLVA 3I9V2 4F03A 3EU4A 3WT1A 3CSHA 5H5RA 2H66A 5H5QA 4E8HA 2LQOA 4IBPA 3EVIA 4XS4B 3G7YA 1TTZA 3ZRDA 5D8IA 3P7XA 2K8VA 1NW2A 20GSA 4KH7A 12GSA 4PURA 1GSQA 1PN9A 2WJUA 3MWHA 3UVHA 2AYTA 2M72A 3EMPA 5F06A 3FK8A 1K3YA 1CQHA 1AW9A 5E59A 5DBQA 1XIYA 2F8FA 1FOVA 3GX0A 4MH2A 2YV7A 3GURA 4DSSA 1GUMA 2HT9A 2JZRA 2FGXA 1G6YA 2GT5A 3LYPA 3GYKA 3FZ5A 5KN2A 1JZOA 1R26A 2O85A 5HFKA 1EP8A 1TW9A 3RHBA 4N0VA 2CQ9A 2CZ3A 3GFKA 1PSQA 5LD0A 2L57A 5IM9A 3VURA 1GTBA 2HZEB 4K7IA 2H72A 2C4JA 4F0BA 4Z7XA 3U5RE 4RQXA 3G7JA 3ME7A 3BBYA 4Q5NA 1X9WB 1ST9A 4NXIA 4ZBAA 1XCCA 1U88A 2QSIA 19GSA 2VLTA 5HFGA 3KJYA 3TDGA 3HCZA 4CDOA 2A4VA 3VFIA 2V32A 2DJ0A 3A3TA 3UBKA 4JZQA 2CAQA 4N0ZA 2B3SA 2VIMA 2VAFA 3IC4A 1TI3A 3FW2A 3ERGA 4MZBA 1V40A 2KUCA 5D73A 2L6DA 3H79A 5JCWA 5F07A 4O5RA 4P3YB 3GSSA 3F6FA 4KCEA 4YH2A 5KEJA 2L4CA 5DAKA 5ID2A 4BWSA 3UJ1A 5B6MA 3FRCA 4HS1A 2OBKA 2I81A 1G6WA 1GTIA 4BA7A 2HSYA 5J9CA 1FHEA 4YQVA 2HRNA 1OE8A 3VLNA 2MMAA 3RPPA 1TJDA 4K7OA 2GZYA 1ZL9A 2CAIA 1TRVA 3LG6A 1E2YA 4K0NA 2K8SA 1MTCA 2C3TA 4IP6A 4MJBA 5B8AA 2CA8A 4WKWA 3KXOA 1C72A 4KW6A 2VOCA 1SK2A 3UEMA 2DJJA 2C3QA 3I43A 5EPFA 1EGRA 2H0IA 2VL2C 3RPNA 5GAPD 4OO4A 5IO2A 2WULA 1VF3A 1TRWA 4ISDA 5B6NA 1TU8A 4FYCA 4MA9A 4CW9A 2B6MA 4RI7A 1GL8A 1FG4A 1WP0A 5L71A 2I3YA 4EO3A 5GZZB 3LSZA 3GKXA 5KN1A 1KEBA 1YJ6A 1WWJA 3WGXA 1SKRB 2H6XA 1A2LA 5KN0A 3F9UA 3S9FA 2LNTA 1A24A 1M2DA 2IMKA 1OC9A 2FNOA 4NV5A 3DMLA 3TB2A 1JZDA 1F3AA 1F9MA 2HE3A 3LFLA 2L4QA 1EGOA 3US3A 1SENA 1VF1A 5CP1A 3QFBC 4XCSA 5AISA 18GSA 1CQGA 3Q74A 2FWHA 1QFNA 4IP1A 2H1GA 5ABRA 4MZWA 2FCHA 2OE0A 1SD9A 4YAVA 4KDYA 2OACA 4JBBA 4KE3A 2IPAA 4N10A 1YKCA 2DJKA 2IFQA 2YPMA 4ML1A 1M99A 1B4QA 1F3BA 4G9HA 1MDJA 1OE7A 4NWYA 4H86A 1DE1A 1T4ZA 2WS2A 1GUHA 6GSSA 3DRNA 1GWCA 1GP1A 4I97A 2G0FA 2B1KA 5IMCA 2DJ1A 2DJ2A 3FZ9A 3FY7A 3HZ4A 1O73A 1Q4JA 3HZ8A 4HZ4A 2YZUA 2ON7A 2XPDA 1WE0A 1GSSA 5EVOA 3V1WA 1A8YA 4IJ3A 2O8VB 4POKA 4TOPA 4ULXA 3TKPA 2NBSA 3F4TA 4IS0A 2QGVA 5IOXA 2V1MA 3GKKA 4KGIA 1SK1A 1O85A 3DYRA 5CRGA 1K0MA 1OC3A 1X5CA 3H4KA 1SK0A 2JADA 3HVXA 2M80A 2I4AA 1GH2A 5G2ZA 3TUEA 2O89A 2VO4A 1XZOA 3D5JA 4EXJA 2DMMA 3C8EA 4MCUA 3FR6A 4L5OA 1V2AA 2GDRA 4PQHA 3IOSA 1TU7A 3MDKA 4MDCA 2N5BA 2MMZA 4EDZA 2WDUA 3ZFBA 1G7OA 2P5QA 1X9SB 2ES7A 2L59A 4AF2A 2TIRA 5GSTA 2GT6A 4AJ6A 4OO5A 2K6VA 1FB6A 4KSMA 4IHUA 3PGTA 2DMLA 1H75A 1PL1A 2CX3A 2X8HA 5HR3A 5ECLB 3P90A 3APOA 2VUPA 2YJ7A 3RDWA 1K0DA 1JLVA 1Z3EA 3KGKA 3CRTA 2XC2A 1MDIA 4IGJA 5AN1A 4KUNA 4POLA 4KSOA 4G2EA 4GSNA 1PL2A 5JWQB 1YY7A 2H19A 5DCHA 4HQSA 4WBJA 4EE0A 3CXGA 3VPQA 2C8UA 1J9BA 3M8NA 4XHMA 4BVYA 4IKHA 1GSDA 3F4RA 4AJ7A 1GSUA 2QKEA 4GSSA 4TXOB 3TRQA 3I69A 1KBNA 1ILOA 2O7KA 3ZYWA 3FEUA 1W89A 4F9ZA 1ERVA 2B1LA 2GSRA 2IJYA 4K0GA 4Q5QA 4JR6A 2H30A 3FR9A 4TVEA 1NSWA 2Z9SA 4ZBBA 3ISOA 2X8GA 2J9HA 1I5GA 5F8BA 1FW1A 5KN3A 3GHAA 1AAZA 4EVMA 5IO0A 2R37A 2LJRA 1QGVA 4MMMA 2VCTA 1M7TA 2JU5A 3GTUB 5J5NA 1U3IA 3UL3A 2FHEA 3ZVJA 2R5GA 2EC4A 5G31A 4HUAA 4NHWA 1M9AA 3O3TA 2P5RA 4EDYA 5J9BA 2WFCA 6GSYA 3FZAA 3L9VA 1SL1B 1SL0B 4O7HA 2J23A 2ZNMA 2GTUA 4TR0A 5ECOB 2HNLA 2IN3A 14GSA 3WT2A 3RHCA 3HY2A 4GQFA 4PX1A 4KAEA 4OFMA 4WR4A 1ZGNA 1VF4A 3P8WA 1W4VA 1U3AA 4K7NA 3GL5A 1XFLA 2GSSA 2F3MA 3UOMA 5AGYA 4IQ1A 3QDNA 2PPTA 2YCDA 5D9XA 4TXVA 1V58A 4OWYA 4PNFA 3WGDA 3KP9A 3DIEA 1GNEA 1SD8A 3N5OA 1AUCA 1XOBA 4V2NA 2LSTA 2IIYA 2JL4A 4MABA 2EIQA 5DALB 2IL3A 1ZCPA 3VWVA 4GSTA 3L9SA 16GSA 2HFDA 4ZXGA 2HLSA 2H1BA 3APSA 3K8NA 3M9JA 2XBQA 3Q6OA 1PKWA 3TKSE 3RBTA 2LRTA 2PWJA 3KEBA 3UMAA 2FUG2 1DBYA 2HZFA 3HJPA 10GSA 5G30A 1VRSD 1PMTA 2VL9A 1GUKA 1OKDA 1YEPA 1K3OA 2JZTA 2PUKC 3KMNA 3D6IA 2EIRA 2LRCA 3C7MA 4FYUA 3EU3A 4F2IA 5HQPA 3GL3A 1HYUA 4PQ1A 2CZ2A 2G2QA 1O8XA 3NIVA 2E7PA 1V98A 2YV9A 4TR4A 2FD3A 1KTEA 2CVBA 4WETA 5CRDA 1SKSB 1XWBA 1TK5B 2N5FA 9GSSA 2C80A 6GSXA 1GLQA 3LYKA 4MLYA 2C0DA 3IA1A 3MSZA 3M0FA 3TKRA 3IR4A 2VL3A 2RLIA 2ZCTA 3CMIA 3HVSA 3D0ZA 1BX9A 1EP7A 3HDCA 2QC7A 3NZNA 4TR1B 2X64A 3FHKA 4G10A 4D73B 3SWLA 1WRYA 4X1UA 1ABAA 3HA9A 2WRTA 1MD4A 5CNWA 2VM1A 3L4NA 2OADA 4XS4A 5CAXA 4AJ8A 1PX7A 1MDKA 2IWTA 3W6GA 3LQ7A 1A2JA 2GS3A 3KTLA 3QAWA 5A4WA 1Y25A 5DJMA 2OKAA 2L5OA 4DSQA 3DVWA 4I2UA 3EE2A 3CTGA 5IIZA 1QXHA 6GSVA 5IMZA 2CVKA 2NDOA 3H93A 2AB6A 2YP6A 2DC5A 4GXZA 2IMIA 3SBCA 2H76A 3ZTLA 1X5EA 1ERTA 3CBUA 4WR5A 4OCFA 4JRRA 2DIZA 1URMA 3CTFA 1Y6EA 4OD7A 4MJCA 4YAPA 2VCVA 4ECBA 8GSSA 1K0NA 3P2AA 3CYNA 1JLWA 3HYPA 4KNDA 1F37A 4QL7A 1K0OA 3ERWA 3KH7A 1HQOA 5AIVA 3IV4A 1GSFA 1FAAA 3ERFA 2CT6A 2FA4A 1IYIA 3GRXA 4MF5A 1WJKA 5CRHA 1AQVA 3DXBA 2HZEA 2PN8A 4EL1A 2H74A 5ECMB 2F9SA 1TK8B 4WEYA 1UN2A 5D96A 4WF4A 2WZ9A 5DDLA 3CRUA 3J7Yb 1WIKA 2TRCP 4HJMA 4X43A 3UARA 1ZOFA 4HU9A 1H4OA 2JSYA 5LCZA 1XW6A 3CSJA 3Q18A 2YNXA 1Z6MA 3LEFA 3HKRA 1TDIA 1ACVA 2VCXA 2RUEA 3TCOA 4TR1A 4QL9A 2H0GA 2KLXA 2H73A 3DWVA 2CX4A 1A8LA 2GQLA 3FYGA 1HNBA 1Z9HA 4EUYA 4OFNA 1BQ7A 3ZMLA 3GA4A 2B5XA 2LS5A 2RUFA 4ZL8A 3QMXA 3EMXA 2A2RA 5HR2A 2MMOA 5A4VA 4MP4A 3W8JA 3IHQA 4HU7A 1YKAA 2H8LA 4YQMA 1NHYA 1PD21 3A2WA 5EY6A 5ENUA 1PA3A 1U87A 2PERA 3LXZA 4ZB9A 1YZXA 2WB9A 3F8UA 5CREA 4I5QA 1JZRA 2YZHA 3QAVA 2MMNA 2E0QA 4IN0A 2RM6A 4NAXA 2YWNA 4TRXA 3D21A 2LV3A 1RW1A 4GWRA 3QAGA 3WYWA 4BL7A 3ZITA 1LBKA 1V9WA 2WCIA 5HR0A 2C0FA 4V1Ag 1TRUA 1LU4A 3TJFA 3HD5A 2YWIA 1M2BA 2VCZA 3AY8A 2NPBA 1EOHA 1NM3A 2GZPA 1SJIA 4BWQA 1PRXA 1S3AA 4EKZA 3HJOA 3CSIA 1EEMA 1LJRA 5G5EA 4HZ2A 3KP8A 4IJIA 1QQ2A 1XBSA 2OJLA 3TRXA 3DKSA 4PUFC 4FO5A 2MBSA 4K9ZA 1VGLA 5D9WA 2OA7A 1SYXA 4XRAA 2FY6A 4KDXA 1B4PA 5IMVA 2ON5A 2DSAA 1QK8A 2LKUA 3ZIJA 1WPIA 5A5KA 1HD2A 4WBRD 3GSTA 4FH8A 3FZ4A 5D9TA 1AC1A 2FWFA 4L0UA 3LORA 3C73A 4HDEA 4JEDA 3Q19A 3ZIVA 5C00A 2MYGA 5IMFA 1SU9A 22GSA 4LL4B 1SJZA 3LWAA 4OFTA 1G0TA 2LQQA 2C3NA 1EOGA 4ZL9A 1K0BA 1DSBA 3A2VA 2RIIA 3TOUA 3R2QA 3H8QA 2VLUA 1ON4A 5J41A 5AIXA 2GSTA 2DIYA 3ZLPA 1N8JA 1AXDA 4DSSB 1XXUA 1K0AA 2CV4A 1RQMA 4IELA 1YDKA 4ZBDA 5IMDA 1B9YC 1N2AA 2C0EA 4HQZA 3EURA 3UBLA 2R6KA 5DCGA 3GNJA 3HHVA 5IMAA 4NHZA 4N11A 6GSTA 3KZQA 4FYBA 1YEXA 2X99A 2I1UA 1OKTA 2IMEA 1R7HA 2YJHA 1TKDB 2V6OA 4Q5FA 1TXXA 3TKSA 1X0RA 4OCEA 1SJ6A 1BEDA 2L6CA 1T7PB 3IPZA 3HVVA 3LGCA 1GLPA 3GKMA 3C1RA 4K1FA 3TJJA 4F82A 4JE1A 4O32A 3TJKA 1MEKA 1S3DA 2LEGA 3F6DA 4PUAA 3IAS2 5EL8A 3LJRA 4J56E 3LXTA 2VD0A 1B9XC 4GRFA 4ACSA 5ECIB 1EZKA 2MZCA 1O6JA 2KOKA 3KM6A 1KNGA 1ZYQB 3M3MA 3QFAC 4E8EA 5ECHB 1GNWA 2PGTA 1AQXA 5D93A 1F2EA 1Z7RA 5DAKB 3BJ5A 5ID2B 2L5LA 3OR5A 3KIJA 1GSEA 2VCQA 3GH9A 3KTBA 3G9BA 2K18A 4I2TA 3MNGA 4J2FA 2F51A 3L0HA 1X9MB 2H71A 2JSZA 2FWEA 1WMJA 2PMTA 4TXOA 1S3CA 4K8MA 1A0FA 1J08A 2WGRA 4TR3A 3A5WA 3DGQA 1XWGA 1K3LA 2V2GA 2ALBA 2AAWA 1BAYA 3GIXA 3KCMA 4BPYA 4AGSA 4NMUA 1GTUA 1PX6A 3BOAA 5FWGA 2KP2A 3NOFA 1G7EA 2IMFA 2YANA 1BYEA 4TN8A 3GTUA 3VI7A 5IQYA 5J4UA 3IRAA 2AUVA 3ZL5A 1X5DA 4EF0A 1R4WA 5G1KA 4X0XA 1TI1A 1YF1A 2GSQA 2LJKA 1THXA 2GQKA 2LTKA 4PXOA 2YOIA 5GAND 2A2SA 1XVQA 3IK9A 1OC9B 2HSHA 3L78A 4JU5A 4GLTA 3GN3A 1SKWB 3ED3A 2GLRA 4K6XA 3D22A 5JCUA 2I9HA 2D2ZA 2C1YA 3UIWA 1GSYA 4LA1A 6GSUA 5IOWA 1A2MA 1XWKA 2HI7A 2DBCA 1THOA 5LNKe 2REMA 2OE1A 1O8WA 3IK7A 5CYYA 1FO5A 3VWUA 4QQ7A 3GKNA 2H70A 4K2DA 3L9UA 1BJXA 3DEXA 3GUSA 2H01A 2B5YA 1TP9A 4HJ2A 1XVWA 2KHPA 4MPFA 4F0CA 2IFQB 2X8CA 3VWWA 3TGZA 3MAKA 2YWOA 3E0UA 4MF7A 3GH6A 2LUSA 5DALA 4KDUA 1ZMAA 5JWOB 3I6AA 1GTAA 3GX8A 1YF0A 4O92A 3QD9A 3QR6A 1JHBA 3F3RA 3EINA 1EV4A 3N9JA 1UC7A 1XWAA 1T1VA 1SL2B 2DJ3A 3RAZA 3QCPA 3TKSC 4LMVA 2BMXA 3ZFLA 1U6TA 3DD3A 3EC3A 1A0RP 3KH9A 2BJXA 4IVFA 2MBTA 2YN1A 1FB0A 2LJAA 4LMWA 4ML6A 5DQYA 1O81A 4GQCA 3H1NA 3J7Yk 5DQSA 2B5EA 1R5AA 1F6MC 4ECIA 4XIHA 1TK0B 2YWMA 3WD6A 4L0WA 4RUVA 4IW9A 3EWLA 1BG5A 1ERWA 1GULA 3APQA 3C71A 4CHSA 2RM5A 1FVKA 5GSSA 1Z7PA 3G7IA 3ZZXA 2E2MA 3D4TA 3VI5A 1O7UA 5IPGA 1PKZA 2B7JA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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