3WT1A

Crystal structure of the b'-a' domain of thermophilic fungal protein disulfide isomerase (reduced form)
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
GSPLIGEIGPETYSDYMSAGIPLAYIFAETAEERKELSDKLKPIAEAQRGVINFGTIDAKAFGAHAGNLNLKTDKFPAFAIQEVAKNQKFPFDQEKEITFEAIKAFVDDFVAGKIEPSIKSEPIPEKQEGPVTVVVAKNYNEIVLDDTKDVLIEFYAPWCGHCKALAPKYEELGALYAKSEFKDRVVIAKVDATANDVPDEIQGFPTIKLYPAGAKGQPVTYSGSRTVEDLIKFIAENGKYKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Protein disulfide-isomerase
publication title Redox-dependent conformational transition of catalytic domain of protein disulfide isomerase indicated by crystal structure-based molecular dynamics simulation
doi rcsb
source organism Humicola insolens
molecule tags Isomerase
total genus 65
structure length 244
sequence length 244
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2014-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wt1A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3wt1A01
3ZIJA 2FWHA 4ZXGA 3HJMA 5DAKB 2VCWA 1EOHA 5J5NA 1SL2B 1GL8A 1SKSB 1QXHA 3KD0A 2GT5A 1Z6MA 3GKMA 4GSNA 4RI7A 3L0HA 3GYKA 1B4PA 2LQOA 1IYIA 1U3AA 2H71A 4OFNA 4GSSA 5IMZA 2O7KA 1TXXA 4MABA 2R4VA 5G1KA 1PKWA 2C4JA 2IMFA 4LA1A 3GSTA 4I5QA 3IV4A 2V41A 4EDZA 2DJ3A 3QR6A 2K18A 1QQ2A 1R4WA 5CYYA 3PGTA 2HRFA 4V2LA 2ON5A 3M9KA 2VCTA 2NDOA 2JACA 2KP2A 1SL0B 2LRCA 2VIMA 2IIYA 1PX6A 4G9HA 4PNGA 3TKSE 1V2AA 5ELAA 2MZCA 1G7EA 5ECOB 1B9YC 1EP7A 1KNGA 5DQSA 1MDIA 3CXGA 2YANA 1O81A 5LNKe 2C1YA 14GSA 2RM6A 1FVJA 7GSSA 1GLPA 1MDJA 2M72A 5EPFA 5IMCA 3VWVA 4CDOA 4JRRA 5H5QA 3ZMKA 3TGZA 2KP1A 1ILOA 3EINA 1N2AA 1VF4A 3H79A 3IBHA 1ZYEA 2C8UA 3GH6A 4XIHA 1VF2A 2HZFA 3LWAA 1O7UA 1HYUA 1U6TA 2PU9C 1BG5A 5IOWA 1NHYA 2H1BA 2PVQA 5JCUA 5J4UA 1SU9A 2V6OA 3RBTA 1UN2A 3CMIA 5DJMA 1GTAA 1MTCA 5ECHB 1FG4A 2IMKA 3EURA 4K7NA 1AC1A 3FZAA 3IAS2 3Q19A 2AHEA 5IMVA 1SD8A 4L8EA 2CAQA 1XFLA 3IRAA 4MMMA 1EWXA 5KN1A 1F9MA 1GUMA 3D22A 4J2FA 4EXJA 1EZKA 3APQA 1T7PB 2IMEA 1SD9A 4XS6A 3D4TA 4IVFA 1I5GA 2PWJA 17GSA 2GLRA 1R5PA 4MF5A 6GSUA 1GUKA 4LLRA 3CYNA 5HFGA 16GSA 2L6DA 2I3YA 4NMUA 3TJFA 4TR1B 2F9SA 3L9SA 4NHZA 3A2VA 1TK5B 1EGRA 1K3OA 1ZOFA 2L59A 4KA0A 5B8AA 1AQXA 4TKYA 3FRCA 4O7HA 4KDYA 2H6YA 1TK0B 3G7JA 4Z7XA 4NAXA 2IFQA 2CT6A 2ZCTA 5CRHA 3VURA 5EVOA 2B3SA 1ERWA 5JCGA 1O8XA 4MJEA 2HSHA 1TKDB 3FR6A 5A4WA 2H1GA 1WIKA 2O89A 3P7XA 3TKRA 1A0RP 3DIEA 5IQYA 3DD3A 3D5JA 5D73A 3FHKA 1Q4JA 1OE8A 4FYCA 1R5AA 3I9V2 3LYPA 2YJHA 5D9XA 4HQZA 3KIJA 1T00A 3IK9A 4J57E 1THXA 3A2XA 3FR3A 5D9VA 3HHVA 2H72A 1O73A 4ZBAA 5IMFA 2H75A 3IC4A 4MH3A 3DRNA 4YH2A 1M2DA 2WRTA 1MD3A 5J3RA 2AYTA 2WZ9A 2FUG2 1RQMA 2FD3A 4ML1A 2QC7A 3IOSA 2C0DA 2GZPA 5CNWA 2EIOA 5IPGA 4HUAA 4NV5A 3KZQA 3ZFLA 1DE2A 1PD21 2A2RA 4IS0A 5KEJA 4FH8A 4LL1B 2YWNA 3ZVJD 2ALBA 2JL4A 2E0QA 3PH9A 3F63A 1QK8A 1TOFA 5HR2A 2YN1A 2L5OA 1V58A 3L78A 2JZTA 3TDGA 1Z6NA 5JWRB 1YF0A 3KP9A 3UOMA 2EIQA 2H0HA 1WRYA 1E6BA 5FT3A 4BPYA 4HJMA 3H8QA 2O87A 4JR6A 1WJKA 2PBJA 2IPAA 2OJLA 4Q5FA 5GZZB 1MEKA 1EV9A 1OKTA 5DBQA 3F0IA 3ED3A 3EU4A 1U87A 5C00A 3FKFA 3E0UA 5CP1A 4PXOA 1GTUA 1GNEA 2FY6A 2LSTA 2V2GA 5DQYA 1URMA 1TI3A 4WR5A 2OA7A 2EIRA 1BEDA 2J9HA 2VL2A 5LCZA 1A24A 4P3YB 1FAAA 5INYA 4JZQA 3APOA 3DXBA 2X8GA 5CRWA 4OD7A 5JCWA 3FZ9A 1BX9A 3O6TA 4HEA2 3FW2A 2I1UA 2G2QA 2IMDA 1VGLA 4YAPA 3ERGA 3KXOA 4K7OA 2ES7A 3LEFA 3GA4A 1YJ6A 2HZEA 1KBNA 2VL3A 3W8SA 2VO4A 1X9MB 4G10A 4H86A 1TDIA 4QL9A 3EMPA 3GKXA 5DCHA 4TR0A 3D4MA 3TOTA 4BVXA 1SK0A 1TJDA 2QSIA 2YPMA 2C3NA 1GSQA 4RI6A 4GWRA 4JU5A 1PQNA 2P5QA 2IL3A 2VD1A 5DDLA 1XW6A 3ZFBA 4GLTA 1PN9A 1U3IA 1YEPA 4NXIA 4MJBA 4OWYA 1SYXA 3QFBC 3ZYWA 5HFIA 1JZDA 1XIYA 4ILFA 3KP8A 2YOIA 4V1Ap 4ULXA 5G5EA 3IAM2 1XCCA 3MWHA 1TRUA 3FYGA 1A0FA 1ZCPA 2H73A 4OFMA 1FB6A 3CSJA 1EEJA 4YQVA 2JSZA 4CHSA 1C72A 5DALA 1ST9A 1X9WB 3DGQA 1Q98A 4WR4A 2GZZA 2FA8A 1GNWA 5ID2B 5KN0A 4MPGA 1VF1A 3EYTA 4EDYA 3MNGA 2YWOA 1AW9A 3O76A 3F6FA 1JFUA 2OKAA 2MMAA 4NPBA 3VPQA 1OC9B 2LKUA 3LXTA 2CVDA 3SWLA 19GSA 1SENA 5HQPA 4TW5A 4EL1A 1TRWA 2H0GA 4YQUA 6GSSA 4F03A 1NSWA 3VPTA 4DSSA 4KAEA 4EE0A 4BWSA 4MZBA 1XOAA 3QAGA 1G6WA 2CVKA 2CV4A 2WB9A 1YKCA 2AUVA 1GSSA 1K3YA 4WBRD 3RPPA 4MCUA 1EEMA 3KH9A 3QDNA 6GSXA 4OCEA 2GGTA 3F8UA 3P8WA 3TB2A 2DIZA 1GTBA 3QOUA 3GURA 2OE0A 2AB6A 2L4QA 1QGVA 3ZREA 3HJOA 1VRSD 4FO5A 4YQMA 4ECCA 1WP0A 2CZ2A 2OBKA 3N9JA 5G2ZA 2O8VB 5AN1A 3HVSA 2CX4A 2VL9A 3NOFA 4NV2A 4NWYA 1HD2A 4IQAA 9GSSA 1RK4A 1SYRA 3C8EA 4X1UA 5LD0A 11GSA 1GWCA 3IHQA 2VAFA 1WMJA 1PKZA 3Q6OA 1U88A 2F8FA 4NHWA 4HU9A 1M9BA 3WYWA 3HZ4A 1SL1B 4ISDA 4K8MA 5D8IA 3TUEA 2GSRA 2MBSA 3I69A 3GNJA 3WGXA 3DVXA 1F3BA 1TU7A 5GSSA 3LYKA 4HJ2A 5HR1A 2GZYA 1X5DA 1GTIA 5ECMB 4EVMA 3TRQA 3CBUA 4PX1A 3KTBA 4Q5NA 2N5AA 2GVPA 3EWLA 2VCVA 4O32A 2HLSA 5IO2A 3TJKA 4D73A 1GUHA 2GTUA 3FY7A 1SJ6A 3I6AA 3G9BA 2NTOA 4WF5A 3RDWA 5CREA 1GH2A 5KN2A 2LRNA 3CSHA 3DKSA 2IMIA 1GSDA 2OADA 4LMWA 3Q18A 1F3AA 4KCAA 1DUGA 3UMAA 3UL3A 4IBPA 4L5LA 4FYUA 3KMOA 4AJ8A 5F8BA 1T8EB 1AQVA 4IW9A 5KN3A 1AQWA 4KDUA 4KCEA 2GSQA 2DBCA 3HDCA 2YCDA 3GFKA 5B8BA 2GSSA 1K3LA 4PUAA 3O3TA 1J9BA 2MBTA 4OMVA 1DBYA 1PMTA 4N30A 3H93A 1B9XC 2M80A 3VI7A 4MK3A 2A4VA 2P31A 5DAKA 3TKSA 2H74A 2I81A 1JLVA 2XC2A 2WFCA 2DJKA 4POLA 1SK1A 2KUCA 2VCQA 3P90A 3U6VA 1BYEA 2F8AA 2PN8A 1GLQA 4HDEA 4EC0A 4MP4A 2EC4A 1M0UA 3HXSA 10GSA 2B5EA 3VFIA 2FHEA 2QGVA 5A4UA 4IP1A 3ME7A 5ECLB 2KOKA 4TR4A 1XW9A 1B48A 2TIRA 2B5YA 2BMXA 3C71A 1TP9A 2B1KA 5DCGA 4ECBA 3BBYA 3ZZXA 3F3RA 4MA9A 4XRDA 3BOAA 2K8SA 1X9SB 1ABAA 3L9VA 2FNOA 4I97A 1G6YA 4MJAA 2C3QA 3KM6A 2VCXA 4N0VA 3TRXA 2B6MA 1XWCA 1UVZA 2H8LA 3EE2A 2C0FA 1WE0A 1TTZA 3GHAA 4DEJA 3GH9A 2VL2C 5GSTA 4JE1A 4PUFC 3WD6A 4K2DA 4TOPA 1ML6A 3UAPA 4MF7A 4KW6A 4KE3A 5IMDA 1K0DA 1M7TA 1S3CA 1ERUA 3DEXA 2GT6A 3WGEA 3CSIA 2I9HA 2IN3A 1GSFA 5CAXA 2P0GA 4BWQA 2C80A 2YP6A 2LRTA 1K0OA 2CVBA 1N8JA 13GSA 3J7Yk 4AJ7A 1A2MA 1ERVA 4TN8A 20GSA 2O85A 5J9BA 1V57A 2HYXA 4WBJA 4OO5A 2E7PA 2DMLA 2XHFA 1GULA 2RM5A 2VLTA 2P5RA 4POMA 1OC3A 1Z7PA 4ZB6A 1FHEA 2MMZA 1YZXA 4IELA 4MDCA 1MD4A 2H76A 4HQSA 4EUYA 2LJRA 4YAVA 4TR1A 2X64A 3C1SA 4K0NA 3HVVA 5CRDA 4DSRA 2YNXA 3HYPA 4F82A 4ID0A 4KX4A 2VLVA 3GL3A 1XVQA 2PPTA 3GKNA 5ECPB 2DJ2A 4ML6A 3HA9A 2R2JA 1PA3A 3KH7A 4PQ1A 2DLXA 4TXOB 4IN0A 1HQOA 3D0ZA 4N10A 3PINA 4MH2A 2PGTA 3EC3A 1H4OA 5F07A 2WS2A 4V1Ag 4PNFA 4XS1A 5ABRA 2LJAA 3IDVA 1OYJA 2FCHA 3QCPA 3F4TA 4JEDA 1GP1A 3GV1A 4XS4B 4BA7A 2WULA 2V32A 2L4CA 2AJQB 4FYBA 3GTUB 3EMXA 2OE3A 4F9ZA 1IYHA 5ENUA 4LMVA 1XZOA 3U5RE 2HE3A 2ZNMA 4OO4A 1XPVA 2B1LA 2JSYA 1GSUA 3M0FA 3HD5A 3WT1A 2HXKA 1Z3EA 3HCZA 5C04A 5ECKB 3WGDA 3ISOA 5IPHA 3P2AA 3KTLA 3S9FA 2X99A 2IJYA 1TU8A 2DC5A 4IJ3A 1EP8A 5F0GA 2LTKA 4DVCA 1FOVA 2YZHA 5D93A 3M3MA 4HS1A 3HVXA 4TXVA 1YQ1A 4PURA 3HY2A 1X5CA 4I6XA 3C73A 3UVTA 4MJCA 1QMVA 1B8XA 3KJYA 5L71A 5H5SA 5GAPD 2GS3A 1WOUA 2E2GA 2C3TA 1VF3A 5CO3A 1EGOA 4J56E 2KHPA 1OE7A 2RUEA 3UBLA 3W8JA 1Z7RA 5IMAA 1QUWA 1T3BA 3OR5A 4RUVA 1PSQA 5IO0A 3TRPA 1F6MC 4X0XA 1XW5A 4O92A 2DJ0A 5FWGA 2HI7A 4O5RA 4GQCA 1O8WA 4HI7A 5D9TA 1EOGA 1TRVA 3R2QA 2RIIA 1KEBA 3HKRA 3IE3A 4XRAA 3ZITA 4Q5QA 1M2BA 4GRFA 1V9WA 4KSMA 4WKWA 3MDKA 2XPDA 4AJ6A 1BAYA 1PL1A 2LNSA 3PR8A 4IHUA 3LFLA 1F2EA 4KGIA 2H6ZA 4KB3A 2CA8A 3CTFA 3RHCA 5DVBA 3BCIA 1SKWB 18GSA 3TKSC 2CZ3A 1OKDA 2TRCP 5G30A 1ON4A 3A2WA 2H70A 4ZL9A 2R6KA 4GXZA 1LU4A 3MSZA 5HR0A 4GSTA 4F0CA 4F0BA 2R3XA 2H01A 1O6JA 2JZRA 3FZ5A 4ZBBA 4ACSA 4GCIA 3QMXA 4WF4A 1OC8A 1GSEA 2E2MA 5HFKA 1A23A 5ELGA 3VWXA 3F6DA 2DJJA 1S3AA 2WGRA 2DJ1A 3K8NA 1F37A 5B6NA 1JLWA 3FZ4A 5E59A 1JZOA 2IFQB 1XOBA 6GSVA 3GX8A 1PRXA 2VM2A 5D96A 1THOA 1V40A 3TJGA 3C7MA 5ID2A 2CX3A 2V6KA 3L4NA 4AGSA 2L5LA 5IOXA 1K0BA 2YV9A 1SKRB 2GQMA 4MZCA 3KEBA 1TK8B 4ZIJA 6GSWA 4WXTA 3QAWA 2H1AA 3TKQA 5B7CA 1OC9A 1XWKA 4HZ4A 4K0GA 1Y25A 2YWIA 5A5KA 1NM3A 3DWVA 4RQRA 2LEGA 4WEYA 2A2SA 3SBCA 1GSYA 3GKKA 3C1RA 3MAKA 4LL4B 3LSZA 8GSSA 2WCIA 4MF6A 3WT2A 5AIVA 3QAVA 3VWUA 1ZL9A 1R7HA 2IWTA 3J7Yb 4G19A 1XWGA 3CTGA 1A2JA 1W4VA 3H4KA 3QD9A 1YDKA 1B4QA 1A2LA 2ON7A 1K0CA 1G0TA 3GSSA 4OFTA 1USBA 1PX7A 2KLXA 1YKAA 1FB0A 22GSA 1V98A 4K6XA 2HRNA 3LGCA 2D2ZA 4K7IA 2NPBA 1AIUA 2K9FA 1ERTA 1QFNA 2X8HA 3F4SA 1O85A 1ZMAA 1TRSA 2X8CA 2LQQA 2PERA 3FEUA 2DSAA 4XTSA 3D21A 3IR4A 1JZRA 1XXUA 2H0IA 3CRTA 1DSBA 3ERFA 2VD0A 4PGTA 1UC7A 3GUSA 5HR3A 3ZMLA 1FW1A 3A5WA 2LV3A 1UA5A 2M46A 1XWAA 4ZBDA 3GL5A 3IA1A 4ZL7A 3GMFA 4ECJA 1K0AA 3VLNA 1SJIA 3KCMA 2H1DA 5B6MA 2LNTA 4IP6A 3TCOA 2C0GA 2GQKA 1JZWA 4L0UA 3RHBA 1AXDA 2VUPA 1E2YA 2N5BA 2HSYA 3G7YA 2HNLA 3TJJA 2YJ7A 1TI1A 2XPEA 3LG6A 4ECIA 5AISA 2YWMA 6GSTA 3UVHA 1A8LA 4HZ2A 3UARA 5GAND 3JCML 3L9UA 4KNDA 3US3A 5EL8A 2HFDA 3DYRA 3UBKA 4POBA 4QQ7A 1LBKA 3ZL5A 3M1GA 3VK9A 2R5GA 2FLSA 5H5RA 5G1LA 2OBIA 3DVWA 4L5OA 5G5FA 2YV7A 3ZVJA 3CRUA 2TRXA 3VI5A 4F2IA 3KGKA 4V2MA 5D9WA 1XWBA 1X0RA 5G31A 2HZEB 1BQ7A 5CRGA 1ZGNA 2REMA 4K9ZA 4K1FA 2DMMA 1YEXA 4WETA 2YZUA 5F05A 2OACA 3N5OA 1AUCA 3H1NA 1YF1A 4GF0A 4E8EA 2FA4A 5ECIB 1T4YA 4POKA 3GIXA 3UJ1A 3QFAC 3HJPA 4KH7A 2H30A 4XCSA 4ZILA 2VLUA 1Z9HA 5ECRB 3E9JB 1Z5YE 3HZ8A 1CQGA 2VCZA 3NIVA 1J0FA 3G7IA 3BJ5A 2WJUA 3DMLA 2H19A 3UIWA 2Z9SA 1J08A 1FO5A 1T4ZA 4QL7A 4PQIA 4G2EA 4I2UA 1Y6EA 2MMNA 4KUNA 5A4VA 5J9CA 4IKHA 1HNAA 3ME8A 3F9UA 3ZRDA 3QPMA 3D6IA 2FGXA 3GX0A 3V1WA 5DALB 4L0WA 5DJLA 2B7KA 1R26A 1XBSA 2NVLA 2PUKC 1HNCA 3E3EA 1AAZA 4BVYA 1YY7A 5ECNB 2MYGA 3IXRA 1HNBA 1K0MA 2B5XA 1G7OA 2RUFA 1RW1A 2JZSA 4XHMA 4IGJA 2VOCA 2BTOT 3W6GA 3Q74A 1EV4A 4GTUA 2L6CA 3F4RA 4X43A 1A8YA 1OVNA 2K6VA 4CW9A 2F3MA 3ERWA 2B7JA 1ACVA 3RPNA 4DSSB 5COHA 4ZL8A 4TRXA 4FIWA 2ZUPA 1I9DA 3M8NA 3LXZA 1ZYQB 3VWWA 3EU3A 1W89A 4JR4A 1M99A 12GSA 4Q5RA 4E8HA 1H75A 2CAIA 4I2TA 1SJZA 3APSA 2PMTA 3ZIVA 2BJXA 3FK8A 3M9JA 5IIZA 5J41A 2GDRA 4I8BA 1GRXA 3TKPA 1WPIA 3ZTLA 2JU5A 2C0EA 5IM9A 2QKEA 1NW2A 2HT9A 3LJRA 3IK7A 4EKZA 2OE1A 3A3TA 1PGTA 4OCFA 3ZLPA 2V1MA 1PL2A 4HOJA 4TR3A 5JWQB 3EVIA 4KSOA 1JHBA 2AV4A 4TVEA 4KDXA 3LQ7A 5AIXA 6GSYA 4BL7A 2VM1A 1K0NA 3IPZA 1T1VA 1MDKA 3BD2A 2GSTA 3BCKA 4ZB9A 1XVWA 4JBBA 4MLYA 3I43A 2DIYA 4PQHA 1M9AA 5F06A 2FWFA 4HU7A 2XBIA 3GRXA 2NBSA 1FVKA 2I4AA 5AGYA 4MPFA 3NZNA 3GN3A 4GQFA 5EY6A 1CQHA 3KMNA 2GQLA 5JWOB 1S3DA 2F51A 4D73B 4MZWA 4V2NA 1DE1A 2H66A 4ZB8A 2MMOA 4TXOA 4RQXA 2RLIA 5E4WA 4DSQA 2XBQA 1BJXA 2PVOC 2J23A 2AAWA 4EO3A 2FWGA 2JADA 1LJRA 2LJKA 4EF0A 1SK2A 4IQ1A 3AY8A 3TOUA 1OAZA 2CQ9A 2FWEA 2LS5A 2LUSA 1M2AA 3LORA 1KTEA 5FHIA 3UEMA 3F3QA 4XS4A 2L57A 2N5FA 3FR9A 1WWJA 4N0ZA 5ECQB 1ZZYA 4AF2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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