5J9BA

Crystal structure of peroxiredoxin asp f3
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
163
Chain Sequence
GSGLKAGDSFPSDVVFSYIPWSEACGIPINYNASKEWADKKVILFALPGAFTPVCSARHVPEYIEKLPEIRAKGVDVVAVLAYNDAYVMSAWGKANQVTGDDILFLSDPDARFSKSIGWADEEGRTKRYALVIDHGKITYAALEPAKNHLEFSSAETVLKHLH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of Peroxiredoxin Asp f3 Provides Mechanistic Insight into Oxidative Stress Resistance and Virulence of Aspergillus fumigatus.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Neosartorya fumigata (strain atcc mya-4609 / af293 / cbs 101355 / fgsc a1100)
molecule keywords peroxiredoxin Asp f3
total genus 46
structure length 163
sequence length 169
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5j9bA00
1RW1A 6GSSA 3D22A 4X1UA 4EC0A 2DJ3A 1JHBA 1Z3EA 1M0UA 2F8AA 2ES7A 3GKMA 5KN1A 3MAKA 4NHWA 3APSA 1TU7A 2KP1A 4N0ZA 1KBNA 2ZCTA 1GL8A 4N0VA 4V2LA 5LCZA 4XHMA 4OO5A 5ECLB 5CREA 5ECRB 4MA9A 4DVCA 3H1NA 3GNJA 2AUVA 5F0GA 3I9V2 1SJ6A 4OO4A 4PURA 5ID2A 3W8JA 5GSTA 1SL2B 1FAAA 3QAWA 5INYA 3GL5A 4I8BA 2I4AA 2YJ7A 1OYJA 2X64A 2BMXA 1EV9A 5J9BA 3UBKA 1I9DA 3KD0A 5ECOB 2FHEA 2JZRA 1F37A 1OAZA 4G10A 3IPZA 3G7YA 13GSA 1SJIA 1U6TA 3HZ8A 1XWKA 4ZBAA 1BAYA 3GSTA 1O6JA 3LXZA 3H4KA 4HU7A 1K0OA 4QL7A 4F2IA 3QAVA 2N5AA 3BBYA 3ZRDA 5HFIA 3LG6A 5J4UA 3E0UA 4GRFA 2CX4A 1FHEA 3RBTA 1A23A 1TRSA 4AF2A 4XS1A 2NTOA 4GSSA 2GSQA 4MZCA 5B6MA 1EP7A 4PGTA 2LJKA 4E8EA 1CQGA 3EYTA 2IMFA 1A2MA 1EP8A 2KOKA 4WR4A 2CA8A 4L8EA 3GA4A 4K1FA 2K8SA 4X43A 2REMA 1XW6A 2ALBA 1X9SB 2GZPA 4N10A 1S3CA 5AIXA 4I2UA 1QFNA 3TKSC 4KSOA 3UMAA 5B8BA 3PH9A 2MZCA 4IS0A 3FRCA 4I2TA 3GUSA 2CZ3A 2C3TA 5HQPA 4JE1A 1JZWA 1HNCA 1YY7A 2LSTA 2DIZA 2B7KA 1O85A 1ZGNA 2FWEA 1AQXA 4RI7A 1K0DA 2TRXA 4JU5A 1DSBA 1W4VA 1U87A 3PINA 3LGCA 4K9ZA 4CW9A 1ERUA 1YF0A 3HHVA 2PPTA 1PKZA 4EO3A 3F4TA 4PX1A 3H93A 2DJJA 3A2XA 1SD8A 2RUFA 3QFAC 1EGOA 5EPFA 1OVNA 1V98A 4YAVA 3BJ5A 1X5EA 1AIUA 3QMXA 3CBUA 5JWQB 1T4YA 3TJBA 3KXOA 5IOWA 4TR4A 2GQKA 1M9AA 4TN8A 3FKFA 5CYYA 1SL1B 4JRRA 3ERGA 3VWVA 3ZREA 3KGKA 5AISA 1QGVA 3VPQA 4HQSA 5FHIA 5IPHA 4ZBDA 4H86A 4KCEA 2VO4A 1G0TA 3EVIA 4NV5A 2GVPA 2OE1A 2XHFA 1WP0A 4F0CA 1NHYA 2YP6A 2IWTA 1J08A 4BPYA 1TW9A 1B4QA 2VM1A 3LQ7A 1H75A 3HCZA 4POBA 1XOBA 4MMMA 2DLXA 2IL3A 5HR1A 2YV9A 1U88A 3RAZA 2YN1A 2IIYA 1MD3A 4I97A 1X0RA 2E7PA 4EUYA 2VL2C 6GSYA 1HYUA 1GSSA 3EWLA 5G30A 3UARA 1YF1A 3GRXA 3LWAA 1N8JA 2H75A 1VF4A 3HJPA 2GLRA 4NV2A 3KP8A 5IOXA 1SK2A 2KHPA 3IA1A 5DALA 2OBIA 3L9VA 5ENUA 4PNFA 4G2EA 5A4WA 1XVQA 4WF4A 2YWOA 3HZ4A 3HXSA 2P0GA 5IMCA 2MMAA 1FB0A 1F2EA 4HS1A 3ZFBA 3VI5A 3DKSA 3O3TA 5F07A 1MTCA 4EF0A 1OKDA 5A4UA 3RPPA 3M1GA 4FYCA 4J57E 1Z7PA 2VLVA 4BVXA 2HT9A 3HVSA 4DSSA 3G9BA 3TKSE 3IDVA 5GSSA 3FZ9A 2LQQA 4NAXA 1Z9HA 1SU9A 4TOPA 3ZLPA 1KEBA 3GH6A 2AHEA 2O8VB 2XBQA 3FHKA 4KW6A 4MCUA 2I81A 2HFDA 3HY2A 5CRWA 1GULA 1MDJA 2YWMA 3SBCA 1WWJA 4KDXA 3S9FA 1HQOA 2GSSA 3ZIVA 3EU3A 3N9JA 4DSQA 3TJJA 1YEPA 4AJ8A 2L5LA 3IOSA 4RI6A 1IYHA 3IAM2 2AAWA 3ME7A 2NVLA 3GKXA 1M9BA 3U5RE 4KA0A 3OR5A 5FWGA 3TUEA 1XWGA 2YANA 2WS2A 4L0WA 5JWOB 4XCSA 3VURA 1TTZA 2AJQB 3PGTA 3KM6A 1BQ7A 2LQOA 5G2ZA 4TVEA 3IBHA 5JWRB 1PA3A 1R4WA 5EL8A 5DDLA 1SKWB 2HSYA 4MDCA 3FW2A 1K0CA 2GZZA 4KDUA 1Z5YE 5HFKA 5GAPD 4ZIJA 1O7UA 1U3IA 2JZSA 4KCAA 1A0RP 3CTGA 2EIQA 4TR3A 2V1MA 4KAEA 2K9FA 3FR6A 4MLYA 1EEMA 2OJLA 4ZL7A 3ME8A 2HLSA 4WBJA 2RIIA 5HR3A 3TRPA 2LJRA 2FD3A 1T4ZA 3WGXA 4JR4A 3WGEA 1DUGA 5ABRA 1X9MB 3ZIJA 2EIRA 2J9HA 3CTFA 4ECCA 5KN3A 4POMA 3DWVA 4TRXA 2HI7A 1T7PB 3GURA 1R5PA 4MF7A 2O89A 2X8CA 3O76A 4F0BA 1SD9A 3ISOA 2IN3A 3FZAA 1B4PA 2QC7A 2CAQA 1NSWA 2R5GA 5DALB 5CP1A 1K3OA 2QKEA 3EC3A 1G7EA 1QUWA 4GF0A 2H72A 1ERWA 3I6AA 3UAPA 3UOMA 2XBIA 1K3LA 1GSFA 4V1Ag 1GTIA 5CO3A 1Y25A 3LSZA 4EKZA 4HDEA 1A0FA 2MBTA 4F9ZA 1MD4A 2R3XA 4IELA 2FA4A 4Q5FA 1GUHA 3DEXA 2GSRA 2H8LA 3L9SA 5ECHB 2V6KA 1XFLA 4Q5NA 1GSEA 4HQZA 1A2JA 1EZKA 5LD0A 1Q98A 3TDGA 3WYWA 1Q4JA 3KTLA 5ECQB 5ECSA 2VCTA 5J41A 2WCIA 2L59A 4O7HA 1FW1A 22GSA 1AXDA 1YKCA 2L57A 1ZCPA 5G1LA 3RDWA 2F8FA 4D73A 4KE3A 4IP1A 4IP6A 1ZOFA 1EV4A 1VF1A 3E9JB 4NWYA 2WDUA 1GP1A 2MBSA 1WMJA 4EXJA 3TKQA 2MYGA 3C7MA 3HD5A 3A2WA 3F63A 4ECBA 4TXVA 1XXUA 1ILOA 3LYPA 3R2QA 4KNDA 1O8XA 2PVOC 2VD0A 2IJYA 4ZB8A 2VL3A 4IN0A 1PN9A 3UVHA 2GSTA 2HRFA 2IFQA 2ZNMA 2RLIA 3KJYA 3IXRA 7GSSA 3V1WA 4K7IA 2H66A 4MF6A 1A2LA 3I43A 3N5OA 1YKAA 4XTSA 1WRYA 5KEJA 4WF5A 3US3A 1OC9B 1O81A 2J23A 3TGZA 1XW9A 4MF5A 4L5OA 1WOUA 2H0GA 2VCWA 4HOJA 3LJRA 2CVKA 3GV1A 3GX8A 4IVFA 5G1KA 3WGDA 4GSNA 2DJ1A 4CDOA 2VOCA 1Z7RA 4Z7XA 3MNGA 2B5XA 2B7JA 3F9UA 3C73A 1TKDB 2H30A 4V2NA 2CV4A 5GZZB 4YAPA 2GZYA 2K6VA 2HZEB 5D8IA 3GTUB 3W8SA 2X8GA 4G9HA 1VRSD 3FEUA 4GQFA 3KEBA 1C72A 3M3MA 3IRAA 4KB3A 3G7JA 2RM5A 1IYIA 2MMZA 4MJAA 4EL1A 1TI1A 3FZ5A 3FZ4A 1JLVA 5D9VA 4OCEA 2H1GA 4OFMA 3P90A 1J0FA 1NM3A 3KP9A 4JEDA 1A8LA 3KH7A 2YV7A 1HNBA 3NOFA 2DJ2A 1X9WB 5IMVA 1WIKA 4PUAA 2C1YA 2DBCA 4K6XA 3ZYWA 4OWYA 5DCGA 1B9YC 2TRCP 2N5FA 3HYPA 1YQ1A 1OC3A 2E2MA 2VLTA 1GLQA 1XWBA 1G6YA 1XZOA 1UA5A 4FYBA 5IMDA 4OMVA 3VLNA 1F6MC 2H73A 1GNEA 3P8WA 1PL1A 2OE3A 5KN0A 2XPEA 3JCML 3TJGA 1V57A 1ERTA 3KMOA 1W89A 2F3MA 4MZWA 5H5SA 4D73B 1OC8A 2CAIA 4F03A 4HJMA 3A2VA 4ISDA 3ZZXA 1GUKA 2F51A 5D73A 3F8UA 2LRCA 3ZMKA 4MP4A 2NDOA 4F82A 5ECMB 2JSZA 4OD7A 3DD3A 3WT2A 3EE2A 3ZMLA 2KUCA 4K7OA 1EEJA 1XWCA 1PD21 2P5QA 4MZBA 3ERWA 2TIRA 3D0ZA 3CMIA 5JCWA 1Z6MA 1OE7A 3H8QA 5IMAA 2MMNA 2GS3A 4AJ7A 1FVKA 2PU9C 4MK3A 1DBYA 3DYRA 2C0DA 2FWFA 2IFQB 2FLSA 4N30A 4QQ7A 1K0BA 1SK0A 5E59A 1A24A 3BCIA 1M2AA 1SK1A 3HVXA 3UJ1A 2E2GA 4BWSA 4ECJA 3P7XA 1GH2A 4K7NA 1SKSB 1B9XC 1AAZA 1T3BA 3ED3A 3ERFA 3Q6OA 4XIHA 5J9CA 2A2RA 1GTAA 4J56E 2ZUPA 4WR5A 2B6MA 2B5EA 2H1AA 3Q19A 2OBKA 9GSSA 5D93A 1XPVA 1AQWA 1V58A 4GQCA 4Q5QA 2WB9A 2RUEA 5EY6A 2LRTA 2C3QA 2FWGA 2V2GA 1XW5A 1J9BA 3UL3A 3LORA 4WXTA 2AV4A 2LS5A 2XPDA 4L5LA 1SENA 2I3YA 1PKWA 3KZQA 3QDNA 3EMPA 1TRWA 2HZFA 3FR3A 1B8XA 3F6FA 5ECIB 1GUMA 1UN2A 5AGYA 3QFBC 2H0HA 1SKRB 3QCPA 2YWNA 3GKKA 1XVWA 2K18A 3LEFA 2H0IA 2LRNA 3D6IA 2GT6A 1KTEA 1XOAA 5IO2A 2VUPA 5E4WA 2HRNA 2M46A 2B1LA 1E6BA 3K8NA 2GTUA 4KDYA 3CRTA 3QD9A 1O73A 3DVXA 1THOA 3G7IA 4BVYA 1HNAA 14GSA 2HXKA 1FO5A 2HE3A 4GSTA 2OADA 2GGTA 3HDCA 3BCKA 3CYNA 1O8WA 2YZUA 3IE3A 1T1VA 3GKNA 4ILFA 5KN2A 3TKPA 2VCXA 6GSWA 3LYKA 5G31A 1MDIA 3QAGA 2H70A 4WETA 1FOVA 1TDIA 4IGJA 1AQVA 4ECIA 4L0UA 5H5RA 1GSQA 4ZB9A 4K8MA 1ABAA 3TRQA 2NBSA 2PN8A 2PUKC 5IMFA 1V9WA 1OKTA 1F3BA 5F05A 3E3EA 2AB6A 2F9SA 1GSUA 4TR0A 1OC9A 2GT5A 4ZILA 4PNGA 5DQSA 3APOA 4ZL8A 4OCFA 2LEGA 4BWQA 3CXGA 4NHZA 1RQMA 4AJ6A 4IKHA 2H01A 2G0FA 3TOTA 5CRHA 3F6DA 5HFGA 1TRVA 2LNSA 4GTUA 3GFKA 3WD6A 1T00A 2FWHA 3FY7A 1R26A 1SL0B 3I69A 2AYTA 5JCGA 5D9WA 4RQXA 4IJIA 2M80A 5HR2A 1TRUA 1SYXA 2R2JA 2N5BA 4EDYA 1YEXA 2YCDA 1ST9A 1XBSA 2HZEA 3KH9A 3QOUA 1NHOA 5GAND 3GTUA 1YDKA 4V1Ap 3KCMA 2MMOA 2C80A 1GRXA 4LL1B 2R4VA 2Z9SA 3DVWA 3HJMA 3VWUA 3F0IA 5IO0A 2PBJA 2FA8A 3DMLA 3IK7A 2R37A 4YQUA 2CVBA 1ON4A 3LXTA 1B48A 3M0FA 4HUAA 3TCOA 12GSA 1GWCA 3A5WA 3EU4A 2JL4A 3KMNA 2DC5A 4DEJA 2IMIA 3ZL5A 1MDKA 1VF2A 3L4NA 5C04A 2C0FA 3UIWA 3DIEA 5J5NA 2CZ2A 2IMDA 2YPMA 2NPBA 1F3AA 3EURA 1GTUA 5DAKB 2GQMA 3DXBA 1BYEA 2FY6A 1GLPA 6GSTA 3QR6A 4EDZA 3GIXA 3VWXA 4FH8A 2B1KA 1PL2A 3PR8A 5F8BA 1Z6NA 2CQ9A 2YOIA 3UBLA 2CT6A 1M2BA 5ECKB 3RHBA 3W6GA 3UVTA 1X5DA 1ZL9A 2PVQA 4ZXGA 4PQIA 1JZRA 3ZITA 1TJDA 4MPGA 2LNTA 2O85A 1TP9A 1M7TA 1SJZA 5JCUA 3C8EA 5J3RA 2I1UA 2QGVA 5A5KA 1V2AA 1PRXA 2EIOA 1JZDA 5F06A 2YNXA 4HI7A 5D9TA 3CSJA 1G7OA 2V41A 4ZB6A 3ZFLA 1GSYA 3BD2A 4PXOA 1TU8A 2FNOA 3J7Yb 3Q74A 4ULXA 1WE0A 2H74A 2IMEA 1ZMAA 5DVBA 1A8YA 2JACA 3D5JA 2HYXA 5AIVA 3MWHA 1I5GA 1ZZYA 1H4OA 3MSZA 3U6VA 1ERVA 16GSA 2LKUA 1YJ6A 3FYGA 3GL3A 4AGSA 4TXOA 4YH2A 3QPMA 5B6NA 3RPNA 3D21A 4ZL9A 1XIYA 3C71A 4HJ2A 1FB6A 5DCHA 5IQYA 2ON7A 4WEYA 8GSSA 4WKWA 5A4VA 2H6YA 3LFLA 2A4VA 4XRDA 3GX0A 1M99A 1JZOA 2FCHA 3HVVA 3Q18A 4K2DA 4JBBA 3DGQA 1CQHA 2YJHA 5COHA 1N2AA 2YWIA 2GQLA 4Q5RA 2OE0A 1K0NA 20GSA 1PSQA 1F9MA 1QK8A 3J7Yk 3L9UA 1YZXA 1ACVA 1MEKA 2B5YA 1V40A 4MJCA 4RQRA 5IM9A 2P5RA 4MJBA 1K3YA 2OA7A 4FYUA 5D96A 2PGTA 3KIJA 2ON5A 5ELGA 6GSVA 1XWAA 4PQ1A 1G6WA 5CRDA 3HKRA 5L71A 2X8HA 1AC1A 4BA7A 2EC4A 4TR1A 2VAFA 5FT3A 2K8VA 1PGTA 2H19A 4EE0A 1OE8A 2YZHA 4KX4A 1E2YA 4BL7A 3GMFA 4CHSA 5CNWA 4JZQA 2C8UA 2O7KA 4FO5A 2P31A 1FG4A 2X99A 1TI3A 1QXHA 4HEA2 4GCIA 1ML6A 4K0GA 3ZVJA 1JFUA 4LMWA 4PQHA 1R5AA 5C00A 3TKSA 6GSXA 2KLXA 2JADA 5G5FA 2H1BA 5ID2B 4N11A 3D4TA 3FR9A 4IQ1A 3DRNA 1TK8B 2WRTA 3IV4A 1LBKA 10GSA 3GSSA 4E8HA 2BTOT 1ZYQB 1UVZA 2DJKA 1NW2A 2V32A 4XS4A 1RK4A 4I5QA 3F3RA 3IC4A 3VI7A 2OKAA 2JU5A 2DMLA 1BJXA 2H1DA 3GHAA 1AUCA 3F4SA 1EOGA 3VFIA 3M8NA 4O32A 17GSA 3P2AA 4IHUA 4XS6A 1PX7A 4NMUA 4LLRA 2OACA 2V6OA 1EOHA 4G19A 11GSA 2VLUA 2WJUA 4KH7A 1TXXA 4HZ2A 5DBQA 4RUVA 4GWRA 3WT1A 1R7HA 2L6DA 4MH2A 4YQVA 2M72A 4TXOB 1X5CA 2A2SA 1EGRA 2VL9A 2DMMA 4TKYA 4MJEA 3L78A 3C1RA 2VD1A 1Y6EA 2JSYA 5D9XA 4WBRD 3AY8A 3C1SA 2PWJA 4J2FA 3H79A 3A3TA 2HNLA 4KSMA 4KGIA 3F4RA 2JZTA 3CSHA 4O92A 5IMZA 1PMTA 2H76A 1SYRA 2R6KA 1UC7A 1BX9A 2GDRA 5H5QA 2L4QA 1QQ2A 4PUFC 5ELAA 4OFNA 3TJFA 1U3AA 2FUG2 5DJLA 2VL2A 3TRXA 5DAKA 2LTKA 4OFTA 2O87A 1VF3A 4ACSA 4ID0A 1TOFA 5B7CA 4EVMA 4ML1A 2E0QA 4P3YB 2CVDA 2RM6A 2C0EA 1WJKA 2H71A 4V2MA 4X0XA 2H6ZA 2VM2A 4TR1B 4IW9A 3CRUA 2DJ0A 3IK9A 4JR6A 1K0AA 5HR0A 4LMVA 1PX6A 2I9HA 3GH9A 4KUNA 1T8EB 4LL4B 2XC2A 2C4JA 6GSUA 3TOUA 4POKA 1FVJA 4GLTA 2C3NA 3HA9A 4MPFA 1THXA 1BEDA 2HSHA 4ZBBA 2IMKA 4IBPA 4HU9A 2D2ZA 2VCZA 3IHQA 3IAS2 5B8AA 3M9KA 1GTBA 2WZ9A 1AW9A 2LV3A 1S3AA 1XCCA 2LJAA 3ZVJD 2WULA 2LUSA 1DE2A 5ECPB 4O5RA 2VIMA 3VWWA 4XS4B 3BOAA 2BJXA 2IPAA 4TW5A 2B3SA 2G2QA 2FGXA 1GSDA 3F3QA 3EINA 4QL9A 3VK9A 4YQMA 3RHCA 5DQYA 4DSRA 4NPBA 5ECNB 1EWXA 1ZYEA 3MDKA 4XRAA 3GYKA 3HJOA 1TK5B 3SWLA 2DIYA 1LJRA 2KP2A 4K0NA 2CX3A 3NZNA 2L4CA 3UEMA 2C0GA 1LU4A 4GXZA 1WPIA 4MH3A 5IPGA 3KTBA 1DE1A 2DSAA 2VCQA 3IR4A 3TJKA 1GNWA 1URMA 2VCVA 4FIWA 5CAXA 1PQNA 5DJMA 1TK0B 4POLA 2QSIA 5CRGA 2WGRA 2H6XA 2L6CA 2PMTA 1QMVA 4I6XA 2L5OA 1M2DA 4ML6A 3TKRA 18GSA 3NIVA 4HZ4A 3L0HA 3FK8A 1JLWA 2PERA 2WFCA 5EVOA 4IQAA 1VGLA 5G5EA 3VPTA 3CSIA 19GSA 4MABA 3M9JA 5AN1A 1KNGA 1S3DA 4IJ3A 3GN3A 4NXIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite