3QFAC

Crystal structure of the human thioredoxin reductase-thioredoxin complex
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPSKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKSMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of the human thioredoxin reductase-thioredoxin complex
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic
total genus 29
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-01-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3qfaC00
5C04A 4MPGA 1TW9A 5G5FA 3WT2A 1OE8A 4IJ3A 2VLTA 4MA9A 4MDCA 2NVLA 3DGQA 3FW2A 3ZMLA 1GTIA 1TU7A 4ECBA 2GSRA 1SK1A 2P5QA 3GH9A 4O32A 1EV9A 2VIMA 5IMDA 4NXIA 4PQ1A 1GSSA 3TOTA 1GL8A 3GSSA 3HCZA 4MCUA 1Z6MA 3FR3A 3CYNA 2FNOA 2L5LA 2KP2A 2VO4A 4EDYA 5IOXA 1ACVA 5HQPA 2IJYA 4ZL8A 1W89A 5HFGA 4IJIA 2N5BA 2DMMA 3ZMKA 4NAXA 1A2LA 3WGXA 1TRSA 1AW9A 3DVXA 3F6DA 4EXJA 3QCPA 1TOFA 4K0GA 4ZL7A 5DVBA 2X8GA 1F37A 3D5JA 3ZFLA 1XWAA 3ZRDA 3QMXA 1PA3A 5ECOB 3SWLA 4MABA 2H19A 5ECNB 2FGXA 1HD2A 5DBQA 4RI6A 7GSSA 5D9TA 1GSQA 2ES7A 3FKFA 1I5GA 1GULA 3G9BA 4O92A 1AQWA 2KOKA 3QAWA 3ZL5A 1OKDA 1ZZYA 1U88A 5AIVA 1PKWA 2HI7A 2ON5A 2OJLA 2YWMA 4FH8A 3M0FA 4ZB6A 6GSTA 3VLNA 2P0GA 1GTBA 3GHAA 2H6XA 4L5OA 4K8MA 1MDKA 2PPTA 4K1FA 3PR8A 1WP0A 3CRUA 4PNFA 1BJXA 3KGKA 3RHBA 1Z7RA 3FR6A 4MF6A 4AJ7A 1WJKA 2LS5A 4HZ2A 4MLYA 3U6VA 3RDWA 1WOUA 3CXGA 5FHIA 4XS6A 5AIXA 2NPBA 5IMFA 1TRVA 4I97A 3BBYA 1S3AA 1SKWB 5ECPB 3GKMA 1IYIA 4E8HA 1JZWA 4NV2A 5G30A 3FZAA 1SL2B 4KW6A 4XS4B 3TJFA 4POMA 2AV4A 3E0UA 4YH2A 4LLRA 2HSHA 1JLVA 2FHEA 2R3XA 4BA7A 4HJ2A 1XVWA 4GF0A 5D8IA 4KH7A 2OKAA 4NPBA 3O6TA 1ST9A 1EZKA 3KZQA 3DMLA 1ERTA 1XWCA 1AQXA 1RK4A 1QXHA 4MJEA 4PX1A 2GT6A 2HLSA 5A4UA 5G2ZA 3KD0A 1SK0A 3IA1A 1YEXA 5KN0A 4LMVA 1GSEA 2L57A 5DALA 2KUCA 2EIRA 5DCHA 2VCZA 2VD0A 4RUVA 2H01A 2G2QA 2YWNA 5B8AA 3C71A 1XWBA 3MSZA 1HNBA 1K0CA 3VI5A 2LUSA 1SJ6A 4G19A 4I5QA 3GX8A 1ZYEA 2CX4A 1K3YA 1EGOA 2O87A 2H75A 4Q5RA 2HNLA 3MNGA 4IN0A 4TR0A 6GSWA 5COHA 1WPIA 4J56E 1K0MA 2V32A 5KN3A 1O6JA 2E2MA 4QQ7A 1SJIA 3NZNA 2LV3A 5ECLB 3D4TA 2WULA 1EEMA 3HY2A 1ERVA 3ZIVA 2RM6A 2HZFA 13GSA 3L0HA 2FA8A 3UAPA 3DIEA 5CRHA 4LL1B 3FY7A 4O5RA 1TXXA 1DBYA 4NHWA 4IQ1A 8GSSA 1UVZA 1K3OA 2JZTA 2PBJA 2F51A 2NBSA 1B8XA 1PQNA 3L4NA 5HR1A 3MWHA 4HU7A 4HDEA 1JLWA 2VM1A 2VL9A 4XS1A 1HQOA 1WWJA 4HJMA 1Y6EA 2C3TA 2XPDA 4N0ZA 4TVEA 2MYGA 3MDKA 4K7IA 4DSQA 1V58A 4MMMA 1S3DA 1PGTA 4POBA 1K0BA 3F3RA 2X8CA 4OD7A 3KJYA 2BTOT 4GWRA 4JEDA 1GH2A 2M72A 4IS0A 2H1GA 3CTGA 2H72A 4KX4A 2MMNA 3A2VA 4FYCA 3UARA 1EP8A 4IHUA 1KBNA 1EP7A 2WFCA 1GTAA 1JZOA 3CTFA 3P2AA 2OBIA 3US3A 3GSTA 2LSTA 1M0UA 3LEFA 4BVXA 4GTUA 2B1LA 4GLTA 4AJ8A 2B5YA 3ZTLA 11GSA 3GIXA 4FYBA 4JR4A 4WR4A 2C80A 1F3AA 2FLSA 1I9DA 4EDZA 2Z9SA 4G9HA 4ZILA 3G7JA 3IE3A 1DSBA 3L9UA 2KP1A 2YZHA 4K7NA 2DJ2A 1SKRB 3TJJA 3EWLA 3O76A 2H74A 2REMA 4AGSA 5JCGA 4X0XA 4L0UA 2HFDA 1BG5A 3IBHA 4J2FA 1PX6A 3CRTA 4KCAA 5D9XA 2B6MA 5DAKA 3RBTA 4RQRA 1GTUA 4XS4A 2N5FA 1AUCA 1HYUA 2RUFA 4P3YB 2VLVA 2R37A 1FB0A 2O89A 5G31A 2PU9C 1VF3A 1A0RP 1GWCA 1V2AA 1ZGNA 3F4RA 1F2EA 4HQSA 1FAAA 2JADA 3QR6A 5B8BA 1S3CA 5F05A 2H8LA 1LBKA 4ZL9A 1YY7A 5ECRB 5GSSA 1A8LA 2QSIA 1TDIA 2YP6A 2LJAA 3KH9A 2PVQA 4EO3A 5J9CA 1G6YA 1SL1B 2F3MA 4AF2A 1TKDB 1V98A 3LQ7A 4YQVA 1LU4A 2LNTA 1URMA 4OWYA 2O85A 2K6VA 6GSYA 4V2NA 4Q5FA 2L59A 3A2WA 3HJMA 5E4WA 4XCSA 5ECQB 4G10A 1TTZA 4MF5A 3ZYWA 4PUAA 1TP9A 2DJJA 3IAM2 5D73A 3D0ZA 4Z7XA 5F0GA 1X5CA 2JZRA 6GSSA 5D96A 4MF7A 3GTUA 2GLRA 1Q98A 1O7UA 3R2QA 4GSSA 4EF0A 2C3QA 3HXSA 3KXOA 1R26A 3F0IA 2H66A 1FHEA 3HKRA 2GSTA 2HYXA 6GSUA 3KMNA 2HZEB 4MP4A 1U3IA 1YZXA 3GNJA 1TI1A 5JCUA 1G7EA 2M80A 3C73A 1A8YA 3E3EA 4ZB8A 1N8JA 4IQAA 4BVYA 4K7OA 2YJ7A 4WF4A 2HRNA 1FG4A 2X99A 1YKCA 2QGVA 3LGCA 2PERA 2OADA 2I4AA 1JZRA 3L78A 3TKSE 5G1LA 3IPZA 3HJOA 3DVWA 4TR1B 1K0NA 1MD3A 4V2MA 1OKTA 4K9ZA 2K8VA 3F9UA 4I6XA 1F6MC 1CQGA 1EV4A 2FWHA 3GH6A 4QL9A 2H1DA 1G6WA 3CSHA 3EE2A 2GS3A 5INYA 2IMDA 1WRYA 2DBCA 2NTOA 1PSQA 4L8EA 4ACSA 5J4UA 3IDVA 1GUMA 5J9BA 2DJ0A 3DKSA 4ZIJA 1K0AA 1DE2A 1KEBA 3BCKA 1X5EA 3ED3A 4GSNA 1JHBA 2DIYA 3LJRA 4XRDA 2OE3A 1OC9A 1ML6A 3GRXA 3ISOA 1QGVA 1GP1A 2FCHA 3A2XA 1USBA 1X9SB 4MJBA 3QFBC 5D9WA 4MH2A 1ERWA 3HD5A 4KDYA 5H5SA 5GAND 1R5AA 1V9WA 2E2GA 2CVDA 4I2TA 1PL2A 1M7TA 5J3RA 4K0NA 3EC3A 3OR5A 1PMTA 3UBLA 2H0IA 2VOCA 3BD2A 1K0DA 1RW1A 1O8WA 2A2SA 1EEJA 1YJ6A 2D2ZA 3GFKA 4H86A 4JRRA 4TXOA 2RIIA 4F0BA 3FZ9A 4GCIA 5DJLA 3LFLA 1TU8A 2L4CA 3D6IA 2TIRA 1NHOA 2YOIA 3G7IA 4DSSB 3I6AA 2FA4A 2V1MA 4F0CA 4K2DA 1UA5A 2O8VB 2H76A 2HRFA 2C8UA 2F8AA 5GAPD 4PQHA 17GSA 2IIYA 2IFQB 5IIZA 4IW9A 2BMXA 3VWVA 1B48A 2V6KA 2VCVA 2B5EA 3TJGA 2CAIA 3WYWA 4TOPA 1O73A 3I9V2 2GVPA 4HS1A 2J23A 3F4SA 4PXOA 3W8JA 4TRXA 3N5OA 1BYEA 2VCTA 3GUSA 2R2JA 1XW6A 5E59A 3P8WA 4JZQA 1NW2A 4XRAA 3J7Yk 5ABRA 1E2YA 4KNDA 2I81A 2AAWA 4ILFA 4ECIA 4DVCA 5DCGA 3UVTA 3HVXA 4ECJA 4JBBA 3J7Yb 1J9BA 1SD8A 1FOVA 1SYXA 4ECCA 5GZZB 3VWWA 1C72A 3IR4A 4TXVA 5FWGA 3KH7A 4BL7A 5ECKB 1GNEA 2PGTA 3ERFA 2VCXA 3HZ4A 3EU4A 3GYKA 1HNAA 3TOUA 3IV4A 4KE3A 1VGLA 2M46A 2EIOA 3FZ5A 5ECMB 3KIJA 3FYGA 2JACA 3FZ4A 2QC7A 1M9BA 2YWIA 3M9JA 3K8NA 3TUEA 1YEPA 3A5WA 1ZL9A 4MZWA 1BEDA 2IMKA 4IBPA 2DMLA 1QK8A 1YF0A 4HQZA 2H73A 4IKHA 2GDRA 2YV7A 2TRCP 4KDUA 5CRGA 4JU5A 4OFNA 2WB9A 4IVFA 2GTUA 3GURA 2LRTA 4CHSA 3GX0A 2HZEA 3N9JA 2MMAA 4HEA2 1JFUA 1PX7A 3UIWA 4I8BA 3TKSA 3KM6A 1PD21 3GA4A 2EC4A 3UJ1A 1J0FA 2FD3A 5LD0A 1XW9A 3LSZA 2B1KA 5L71A 3C8EA 2CVKA 2LRNA 5ECIB 5IMVA 5G1KA 1WMJA 1BQ7A 5H5RA 5HR3A 4RQXA 1O81A 5B6MA 1O85A 1VF1A 2K9FA 1EOHA 1SL0B 4ISDA 3AY8A 3O3TA 4N0VA 1AQVA 5KN1A 2HXKA 1U6TA 5ECSA 1FW1A 2WGRA 4PNGA 4G2EA 4PUFC 1XZOA 3I69A 2BJXA 4TR1A 1QUWA 2WZ9A 2KLXA 2A2RA 4LMWA 4BWSA 5EL8A 4FYUA 2KHPA 4XTSA 4IP1A 4I2UA 5A4VA 3DXBA 1OC3A 4POLA 5B7CA 1DUGA 2VCWA 3SBCA 1GRXA 2JL4A 3HVSA 4MJAA 3P7XA 2B5XA 20GSA 3PINA 1G7OA 3CSIA 3H8QA 4X1UA 3LYKA 1F3BA 4TKYA 5DJMA 3WD6A 5CP1A 4IP6A 1B9XC 1MD4A 4XHMA 4YAPA 2GGTA 3TKPA 1J08A 2LQOA 4YAVA 5ELAA 1EGRA 1XWGA 2YN1A 2YZUA 3VWUA 2DIZA 2RM5A 3M8NA 1ABAA 1F9MA 5KN2A 4EE0A 1GSUA 3D22A 4HU9A 2PVOC 4OCEA 2LEGA 1R4WA 3Q6OA 2OE0A 3TJBA 3TJKA 2H30A 4ML6A 3PH9A 4O7HA 4NWYA 2MMOA 2JZSA 2IMFA 3CSJA 3G7YA 4BPYA 2J9HA 1KNGA 1U3AA 3IK9A 2O7KA 4MZBA 4HOJA 3ME8A 2CAQA 1LJRA 5ID2B 4F9ZA 3HJPA 2IMIA 2CZ2A 4TN8A 3KEBA 1THXA 3H1NA 4HI7A 4V2LA 2VL2A 3ERWA 5DALB 16GSA 4RI7A 1M9AA 3TKSC 2C0DA 4GXZA 4MH3A 2LQQA 4FIWA 3QPMA 4DSSA 5HFKA 4OFMA 5AISA 1XPVA 4NV5A 3RHCA 3IC4A 4WXTA 2LTKA 4MK3A 4ULXA 3EMXA 5IPGA 3ZREA 4YQMA 1QQ2A 2IFQA 1XBSA 1SENA 1W4VA 1FB6A 4TW5A 2DLXA 4GRFA 3RPNA 3KMOA 2RUEA 1Z7PA 2R4VA 4KSOA 3APQA 1M2DA 2WRTA 1Y25A 2FWFA 1GSYA 4EVMA 5IQYA 2NDOA 2C0EA 2VAFA 5DDLA 2DC5A 5CYYA 5J41A 5CREA 3F6FA 2XBQA 1FO5A 2H1AA 4CW9A 1UC7A 1VF2A 2MMZA 3WGEA 1TRWA 2GQKA 1A2JA 1BAYA 3ZZXA 5JWQB 2F8FA 5IMZA 2WDUA 1OVNA 1XVQA 1YDKA 2H6ZA 3TB2A 2WCIA 2GQMA 2CV4A 2DJ1A 4KB3A 4ML1A 3DEXA 2AYTA 1OE7A 1K3LA 3D21A 4ZXGA 1AC1A 3EVIA 1A24A 1K0OA 3UMAA 1ERUA 1TRUA 2TRXA 2VUPA 3UEMA 1B9YC 1N2AA 1ZOFA 3GL3A 4K6XA 3TRPA 4WBJA 2V2GA 4HUAA 2P31A 3ZVJA 3LXZA 2PUKC 2XPEA 4Q5NA 2A4VA 2YPMA 2ZUPA 1E6BA 1Z9HA 2ALBA 2GZZA 3LWAA 2MBSA 4N10A 2PN8A 4KAEA 3GKKA 5CRWA 5IMAA 3ERGA 2CVBA 3UL3A 3WGDA 3TRQA 2AJQB 3UVHA 4OO4A 4AJ6A 1HNCA 2VL2C 1B4QA 10GSA 3QDNA 5F8BA 1A23A 1CQHA 5ELGA 3Q18A 4POKA 5HFIA 1YQ1A 3TKQA 5IM9A 4DEJA 3FHKA 4WETA 4PGTA 3FEUA 4DSRA 3TGZA 2IL3A 3M1GA 2OA7A 4OFTA 4GQCA 1SK2A 2R6KA 2GSQA 4V1Ap 4TR3A 2K8SA 4GSTA 3UBKA 2IWTA 3C1RA 1M99A 5EVOA 2X64A 4KUNA 2XC2A 1PRXA 1T4YA 2C0GA 3VURA 2OACA 1T1VA 6GSXA 3KP9A 1Z6NA 1V57A 2VM2A 2JSZA 4GQFA 2YWOA 4MZCA 5DQYA 2CQ9A 2I3YA 1XCCA 3CMIA 4KCEA 1AIUA 1ZMAA 1BX9A 2X8HA 3HVVA 3MAKA 3EMPA 1O8XA 4WEYA 1MTCA 4EUYA 2LJRA 2GZYA 4F82A 2AHEA 2CA8A 5JWOB 5DQSA 1NSWA 5G5EA 2LRCA 1U87A 4MJCA 5DAKB 2R5GA 3NOFA 1IYHA 3ZVJD 3F63A 4L0WA 4D73B 3M3MA 1ILOA 3C1SA 2V6OA 4NHZA 2HT9A 5IO2A 3H79A 2I1UA 4XIHA 2JSYA 3BOAA 2OE1A 2HSYA 2H1BA 1A0FA 4J57E 3CBUA 4ZB9A 1R7HA 3BJ5A 4F2IA 4JE1A 3GKXA 5ID2A 3VPQA 5A5KA 1GLPA 2LJKA 1M2BA 3QFAC 1GLQA 4F03A 1SU9A 1Z5YE 2IMEA 5CO3A 1SYRA 3LXTA 1NM3A 4MPFA 1X5DA 3L9VA 18GSA 3VPTA 2B7JA 2L6CA 2H70A 3W8SA 4QL7A 1GUKA 1T3BA 1PN9A 2YV9A 1YF1A 1XIYA 2H0GA 1XFLA 1OAZA 5IMCA 3HHVA 3QAGA 3RAZA 2YNXA 1X9MB 2IN3A 3GL5A 12GSA 1SJZA 1T00A 2FY6A 5AN1A 3H4KA 3HDCA 3EU3A 2DJKA 4NMUA 1R5PA 1MDIA 2H71A 3KTBA 3GTUB 2GQLA 4WR5A 1XOAA 2G0FA 1THOA 2VLUA 2L6DA 4ZBAA 1PL1A 3S9FA 2C4JA 2FWEA 1ZYQB 3LORA 1AXDA 4V1Ag 3KCMA 1T4ZA 4EKZA 3RPPA 4OCFA 3VWXA 1SD9A 3EURA 4EC0A 14GSA 5HR0A 3ZITA 2MBTA 2JU5A 1OYJA 2PWJA 4KA0A 2C0FA 1NHYA 4OO5A 2ZNMA 1B4PA 2H6YA 2YANA 2GZPA 5IOWA 2H0HA 22GSA 1EWXA 1TI3A 3C7MA 2V41A 3I43A 1TK0B 2CZ3A 3ZFBA 4JR6A 4L5LA 5A4WA 2MZCA 2E7PA 3DRNA 3GN3A 4PURA 5D93A 1XOBA 2WJUA 1XXUA 4N30A 4IGJA 2F9SA 5F06A 3UOMA 2ON7A 4ZBDA 4LA1A 3TKRA 5D9VA 5F07A 3WT1A 3APSA 1OC8A 1G0TA 1XWKA 5ECHB 3FRCA 2DJ3A 2ZCTA 4Q5QA 3P90A 6GSVA 3IOSA 4WF5A 1AAZA 2YJHA 3PGTA 3ZLPA 3V1WA 2FWGA 4KGIA 3FK8A 3KP8A 2N5AA 1VRSD 1EOGA 1X9WB 2CT6A 3DD3A 4E8EA 2XBIA 2AB6A 3VFIA 5CRDA 3DWVA 5EY6A 2YCDA 3TDGA 3E9JB 3F8UA 1A2MA 5IPHA 4IELA 1OC9B 2IPAA 3EYTA 3A3TA 5LNKe 4CDOA 3M9KA 2LNSA 4KSMA 3IHQA 5IO0A 4WKWA 2B3SA 3IAS2 2DSAA 3Q74A 3VI7A 2OBKA 1Z3EA 5J5NA 1SKSB 2VD1A 1GNWA 2I9HA 3W6GA 3F4TA 3TRXA 3JCML 5AGYA 4ID0A 1GSDA 3HYPA 2EIQA 2CX3A 3GMFA 3ME7A 5H5QA 5KEJA 5C00A 4LL4B 1ON4A 5LCZA 3GKNA 1GUHA 2XHFA 2VL3A 4TXOB 4KDXA 3LYPA 3NIVA 3DYRA 2HE3A 2P5RA 5EPFA 3KTLA 1VF4A 3BCIA 1MDJA 2AUVA 3HA9A 5JWRB 3D4MA 1DE1A 1X0RA 2GT5A 1H75A 2B7KA 4X43A 1FVKA 1FVJA 1KTEA 4N11A 3GV1A 3IXRA 1TK8B 3H93A 1PKZA 2L5OA 3Q19A 19GSA 1V40A 3IRAA 5HR2A 4OMVA 4D73A 2GSSA 4HZ4A 3QD9A 2RLIA 3EINA 5GSTA 1UN2A 1YKAA 1MEKA 2K18A 5JCWA 1QFNA 3L9SA 2VCQA 3TCOA 2PMTA 4FO5A 1XW5A 2L4QA 3VK9A 4BWQA 1ZCPA 3QOUA 2WS2A 1TK5B 4ZBBA 3IK7A 1JZDA 4YQUA 4WBRD 1T7PB 1H4OA 1TJDA 5CNWA 2C1YA 3FR9A 3APOA 1RQMA 3LG6A 4TR4A 5FT3A 5CAXA 2C3NA 5ENUA 4PQIA 3U5RE 2QKEA 4EL1A 1WE0A 1M2AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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