2B7KA

Crystal structure of yeast sco1
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
155
Chain Sequence
GKPSLGGPFHLEDMYGNEFTEKNLLGKFSIIYFGFSNCPDICPDELDKLGLWLNTLSSKYGITLQPLFITCDPARDSPAVLKEYLSDFHPSILGLTGTFDEVKNACKKYRVLVDHSIFFYLMDPEGQFVDALGRNYDEKTGVDKIVEHVKSYVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Metal binding protein
molecule keywords SCO1 protein
publication title Crystal structure of yeast Sco1.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 46
structure length 155
sequence length 169
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b7kA00
1Z6NA 3KP9A 3QR6A 2FWHA 4JR4A 2H6ZA 5JCUA 1RQMA 2VL2C 3ZLPA 5EVOA 4MK3A 1JZRA 4N10A 2B5XA 4XS6A 1A8YA 5A5KA 2OJLA 1YKCA 3C71A 2DBCA 2FA8A 4PQ1A 3FR9A 2DJ2A 1GTUA 4KE3A 2VCVA 3ZFBA 4D73B 1PD21 3SWLA 5G5EA 3HY2A 4K6XA 5CREA 4I8BA 2I3YA 1GNEA 4IP1A 1OKTA 5AIXA 5HFKA 5DALB 3QFBC 2CX3A 1BG5A 5B6MA 2C3TA 1IYIA 4ML1A 3W8JA 5D9VA 1TOFA 3APOA 1OVNA 5KN0A 4OCFA 4PX1A 1OC9A 3CRUA 4O5RA 1WRYA 1NSWA 1FOVA 2H0GA 1PRXA 4NV5A 2E2GA 6GSXA 3KMNA 1X9WB 1GP1A 3LWAA 4ZBAA 2PUKC 1Q98A 4ULXA 1X9MB 4KA0A 1TK5B 5ECOB 4HOJA 5IO0A 1CQHA 3F4SA 1YJ6A 2CA8A 2H71A 3GIXA 3HD5A 4EVMA 1GLPA 1KEBA 4N0ZA 2NTOA 1U88A 3TRPA 1YKAA 2WFCA 3G7IA 4TR1A 1ZCPA 3DEXA 2DC5A 1V58A 1W89A 3DD3A 4K2DA 3KEBA 10GSA 3SBCA 3ZMKA 1O8WA 1GSFA 4ZB6A 2HT9A 4EE0A 2JU5A 3OR5A 5G31A 3KH9A 4Z7XA 3ZTLA 1K0CA 2PGTA 5F05A 3D0ZA 1VF3A 4X0XA 2VLUA 4MPFA 1G6YA 2VL3A 3JCML 4ECBA 4ILFA 2FY6A 3BBYA 3MWHA 2AB6A 3QDNA 1JZDA 4WR5A 1SYRA 3GTUA 4Q5NA 4DSRA 3HZ4A 1BX9A 3UEMA 4AJ6A 4ZBBA 4MPGA 2OE1A 2IIYA 2XHFA 3PH9A 3M8NA 2VIMA 3VK9A 2R6KA 14GSA 2K9FA 3BD2A 4MMMA 1AIUA 2LJRA 1NHYA 5J9BA 2R4VA 3RBTA 3DYRA 1HNBA 4CDOA 1SKRB 4TR4A 4E8HA 2H76A 1NHOA 2PERA 6GSTA 4PUAA 2RM5A 1TRVA 2H6YA 2F3MA 1FB0A 3EYTA 4L0UA 4MJEA 2RIIA 3EE2A 5D8IA 3H79A 4IJ3A 4IQAA 5ECMB 1QUWA 3D4TA 17GSA 1T4ZA 3TUEA 2I9HA 5ECNB 2DMMA 3IHQA 1EGRA 3C8EA 4IELA 3ZL5A 2YZUA 22GSA 1G6WA 2XC2A 4OO4A 1X9SB 5J3RA 3VFIA 2AJQB 1TK0B 4AJ8A 4KDXA 3VPQA 2ZNMA 2IPAA 2V2GA 2VLTA 3QMXA 3DVWA 3FHKA 4JRRA 4RQRA 2HSYA 2H66A 3M3MA 4MZBA 3EU3A 5EY6A 3HCZA 1A0RP 4GF0A 3UL3A 2IMEA 5HR0A 3QAWA 3GYKA 2ZUPA 3LXTA 1EOHA 3TJBA 5DALA 1TW9A 3C1SA 1AW9A 2CAQA 1DSBA 1SK0A 1NM3A 1B4PA 1HQOA 4ISDA 3FZ9A 1M2DA 1MD4A 4L5LA 2ON7A 2JZSA 1IYHA 1WPIA 2WCIA 2I4AA 1R4WA 2H1GA 2LRCA 2FWFA 1X5CA 5DJLA 1UN2A 2AV4A 2K8SA 4TR0A 2L5LA 1OAZA 2MMAA 5JWRB 3J7Yb 3I9V2 3D22A 5H5RA 1GSEA 3L4NA 4XS4B 4OO5A 3R2QA 5J4UA 2FHEA 1J9BA 3L9UA 4IN0A 4J57E 1PKWA 2OE3A 3GL5A 2L4CA 5KN3A 3DVXA 4XHMA 5ECPB 4MCUA 4ZIJA 3KTBA 2VUPA 4DEJA 1MDKA 1MDJA 1TDIA 2LS5A 4F03A 4KB3A 3DIEA 1G7EA 3FR3A 2WB9A 2YNXA 1GLQA 2LKUA 2XPDA 5IPGA 1R7HA 4F0BA 1GSQA 3ZZXA 3FZ4A 1O8XA 1GUMA 4FYCA 3IOSA 2A2RA 1U87A 3ERGA 4RQXA 1XWCA 5F06A 2LRTA 4XIHA 3N9JA 1VF4A 2P0GA 3P90A 4TOPA 1FVKA 2FWGA 1B9XC 2PN8A 3DGQA 1MEKA 1X5DA 5ELAA 4V2LA 5AISA 1H75A 3TJKA 1FHEA 1HNCA 1A2LA 5ECHB 3M0FA 3KD0A 1YEPA 4MP4A 2XBQA 2VL2A 3VWWA 1VF1A 4KH7A 2EIRA 2LJKA 3KP8A 4ECCA 1OE8A 4TR1B 2RM6A 4WKWA 1XOAA 1YZXA 5EPFA 2LSTA 3ZVJA 1SJZA 3A2XA 4ZXGA 2V6KA 1E6BA 4E8EA 4CW9A 1AC1A 3ZFLA 4XCSA 1WOUA 2DSAA 3CSHA 3FEUA 1YF0A 1GTBA 2JZRA 3GX0A 3D5JA 3F4TA 1N8JA 1K3OA 5E4WA 4YQMA 1U6TA 4H86A 2WZ9A 4WXTA 3ED3A 5GSSA 1PMTA 4TN8A 2CVKA 2HSHA 3APSA 2PWJA 1AQWA 1XVWA 5D9XA 1QMVA 4BWQA 4DSQA 4HI7A 2P5QA 1T7PB 1O7UA 4RI7A 1XW6A 1DBYA 1GSSA 5CYYA 2V41A 2WGRA 3I6AA 1W4VA 2H1BA 2VLVA 3D21A 3QOUA 2KOKA 3MNGA 1G7OA 2WJUA 3LSZA 4QQ7A 2L6CA 3FW2A 3V1WA 4RUVA 5IIZA 3KXOA 3EINA 4J2FA 1U3IA 5CO3A 5GZZB 3HVSA 2L6DA 1A2JA 2P31A 1K0OA 2YN1A 3CTGA 3FK8A 2IJYA 2K18A 5ECLB 3M9KA 2X64A 2H72A 3EURA 2LTKA 1VGLA 3KJYA 4XS4A 4LL1B 3GURA 3A2WA 1GTIA 3I43A 3Q19A 1S3DA 4WF5A 4MDCA 2YZHA 5AGYA 2HYXA 5B7CA 1AXDA 5LNKe 4PGTA 3L9VA 2C80A 1OE7A 2DJ1A 5DAKA 4TW5A 2KP2A 5IMVA 1XW5A 5G1LA 2LNSA 3D6IA 2FGXA 3ME7A 3A2VA 2ALBA 1Y6EA 5INYA 2BMXA 2J9HA 4ZBDA 2YWOA 2GZPA 1WMJA 1K0BA 4IS0A 3ME8A 1QFNA 4YQVA 5A4VA 2IL3A 2GSSA 3H1NA 4MJCA 7GSSA 1T1VA 1B8XA 2G0FA 5F8BA 4K8MA 1O85A 1URMA 1YY7A 2JL4A 4EL1A 2CVBA 3GH9A 4HDEA 2L5OA 2C4JA 2VCQA 4I2UA 3P2AA 1TTZA 2OE0A 1EV4A 2TRCP 3O6TA 4PNGA 2IN3A 3ZIVA 2B5YA 4EUYA 2LJAA 1U3AA 1TRUA 3E0UA 2AUVA 1ERTA 3HA9A 5D93A 3GV1A 3A3TA 3ZMLA 1KNGA 3HJMA 2OBIA 1YEXA 1T00A 3F6DA 2E7PA 3BCKA 2VCWA 4ACSA 1ACVA 2L57A 3UIWA 2HLSA 2NDOA 4MF7A 3IAS2 1X0RA 2GSRA 2H30A 3PR8A 2JADA 2DIZA 3I69A 2ZCTA 5KN2A 2H6XA 3TOTA 5ID2A 1TU8A 2EIQA 3HHVA 5DJMA 4V1Ag 1OC3A 2GDRA 3GX8A 1EP7A 1EOGA 3VPTA 4I5QA 4IBPA 5J41A 3QCPA 1E2YA 12GSA 4PQIA 1TK8B 11GSA 1TJDA 4WEYA 4KGIA 4X43A 3G7YA 4Q5RA 4GXZA 1UA5A 1GSYA 5ECSA 2YOIA 3HVVA 1O6JA 4GRFA 1OYJA 3PINA 2BTOT 1TI3A 4PXOA 4ZB8A 3TOUA 4NMUA 5IMCA 3C7MA 2YWMA 1YDKA 5EL8A 3HDCA 1T8EB 2O85A 2FA4A 1K3YA 1PGTA 5G30A 1BJXA 3PGTA 6GSWA 4N11A 4ID0A 5HR2A 2CZ2A 2WRTA 4V1Ap 1SD9A 1VRSD 3IDVA 3GH6A 1XWGA 2DMLA 3UOMA 2O7KA 1M99A 4IW9A 5ABRA 3HZ8A 2H1AA 4MA9A 1TI1A 3FZAA 4YQUA 2K6VA 3TDGA 3TJFA 1XZOA 3TKSC 4LMWA 2B7JA 3EWLA 5G5FA 3DRNA 4TXVA 1GTAA 4EKZA 2KHPA 1PL1A 4KSMA 5IOWA 2C1YA 1SK1A 5CP1A 3UAPA 2B1LA 2I81A 1M2AA 1V2AA 1HNAA 2IMIA 3F4RA 1V57A 2X99A 3KMOA 1TXXA 5D96A 3FRCA 5IMDA 4PNFA 3F3QA 4YH2A 2QGVA 4K7NA 3TKSE 1PX7A 3LXZA 2QC7A 2OBKA 2VM1A 1LJRA 2GS3A 3RDWA 3UVHA 1GUHA 3KIJA 1WJKA 3H8QA 2FWEA 1M9BA 2GTUA 3LG6A 3GNJA 2CVDA 4OFNA 1LU4A 2AHEA 3RPPA 4EDZA 4OCEA 6GSSA 4HUAA 3HKRA 3VWVA 4JZQA 3BOAA 4I97A 2VCZA 4V2MA 5CAXA 3VLNA 4LLRA 4BWSA 4KNDA 6GSUA 2MMOA 3CMIA 1LBKA 5IO2A 1JFUA 5IPHA 3CBUA 2HFDA 3GMFA 4MJAA 2V1MA 3J7Yk 3F6FA 2OKAA 3QAGA 2F51A 2PU9C 4NAXA 2GT6A 1JHBA 2VO4A 2YPMA 3APQA 1DE2A 1FB6A 2O87A 4HJ2A 1VF2A 2HZEB 2MMNA 2RUEA 4F2IA 5C00A 2VM2A 4P3YB 5HFGA 1A8LA 4IQ1A 2HRNA 4XS1A 1ERWA 3FKFA 3U6VA 3F0IA 2AYTA 2LEGA 2YV7A 5ENUA 1JZWA 1UC7A 5DAKB 2R3XA 4GQFA 3CRTA 6GSVA 4OFMA 1M2BA 2OA7A 2H8LA 5J5NA 4K7OA 5JCWA 4I2TA 1BEDA 2B7KA 1FVJA 4KW6A 3ZREA 1XWBA 2H70A 4DVCA 4I6XA 3HVXA 3DMLA 1BAYA 1ABAA 4HU9A 4FO5A 1HD2A 1ON4A 4NPBA 3BJ5A 2H73A 3GKKA 1TRWA 2M46A 3ZRDA 3IK7A 2LUSA 4EXJA 4V2NA 3ERWA 1J0FA 5IMFA 4FYUA 2IMFA 1B48A 1XFLA 4G9HA 1THOA 1Z9HA 3EMXA 5COHA 5DBQA 13GSA 2MZCA 6GSYA 5J9CA 1OKDA 4GSNA 5HR1A 2VCTA 3DKSA 1F6MC 1UVZA 3MAKA 1MDIA 4OWYA 4MH2A 3RPNA 3TKRA 1K0NA 1F3AA 5DQSA 4HU7A 1SD8A 5DCGA 3G7JA 5ID2B 1XOBA 3KZQA 3IAM2 2NPBA 5F07A 2B5EA 2H0IA 4FYBA 1PKZA 2LV3A 4KAEA 2B1KA 2I1UA 1GWCA 1PX6A 2MBTA 1V40A 2C0FA 5HQPA 4POKA 2C0GA 2M72A 2CAIA 1SU9A 2O89A 2YANA 4MLYA 4IHUA 1SL2B 3LJRA 4KCAA 1ZGNA 3KTLA 4LA1A 5D9WA 2KP1A 5GAND 1PA3A 4O92A 3L0HA 3ZVJD 5D9TA 2B6MA 3DXBA 4F0CA 3FYGA 1XIYA 1I5GA 3TJJA 1JLVA 2CZ3A 4J56E 3HYPA 4NHZA 5B8AA 1QGVA 2B3SA 3QPMA 1GRXA 1EEJA 1AQXA 2KLXA 2V32A 1M9AA 2PVOC 3NIVA 5JCGA 4BVYA 5C04A 4O32A 2F8AA 4POMA 1DUGA 4ZL7A 3LEFA 3GRXA 2WDUA 2HI7A 1JZOA 3WGDA 4G19A 3IRAA 4MABA 4GWRA 1ZYEA 2C0EA 4KDUA 19GSA 2VAFA 2LRNA 5AN1A 2HXKA 1SKWB 1WE0A 2HZEA 2L59A 3LGCA 2IMKA 2R37A 5ECKB 4GLTA 3M9JA 1GSDA 3IA1A 1F3BA 2H0HA 3HJOA 4GSSA 5JWQB 2WULA 3QD9A 3KM6A 4TVEA 4HZ2A 4EO3A 3VWUA 3CSIA 3MDKA 2CV4A 2CX4A 3UMAA 4FIWA 1R5AA 1WIKA 1SL0B 3H93A 1THXA 1EEMA 4G2EA 3WYWA 4TXOA 2A2SA 1ML6A 2GQLA 2VD1A 3F3RA 4JE1A 4KDYA 4KX4A 3ERFA 4K0GA 3ZIJA 2Z9SA 2HE3A 5GSTA 3NZNA 5CRHA 1N2AA 1A23A 1YQ1A 3LORA 5FT3A 3QAVA 4QL7A 1SJIA 3FY7A 4BL7A 5DCHA 1T4YA 1Z6MA 3TKPA 3H4KA 1K3LA 3TKSA 3LFLA 1XXUA 3GA4A 1I9DA 3IE3A 4GCIA 3Q6OA 1ST9A 3MSZA 1PN9A 1ZL9A 3IBHA 2CT6A 1JLWA 2V6OA 4XTSA 4Q5FA 1GH2A 3FZ5A 2REMA 4DSSA 2N5AA 1FO5A 3A5WA 3HJPA 5ECQB 1J08A 4WETA 2YJHA 1XW9A 3NOFA 4QL9A 3LYPA 3IK9A 2DIYA 4K0NA 4TRXA 1R5PA 2YWNA 2C8UA 1ERUA 8GSSA 3TRQA 3LQ7A 2J23A 1AUCA 3ZITA 2D2ZA 2YV9A 4OFTA 3GSTA 4MJBA 1XCCA 1YF1A 3RAZA 3QFAC 2GGTA 4GQCA 1F37A 2C0DA 2VOCA 1TU7A 3G9BA 4IGJA 1SYXA 2X8GA 4F82A 5CNWA 2FD3A 2CQ9A 1SJ6A 2HRFA 3UARA 20GSA 1G0TA 1Z7PA 2IFQB 4XRDA 5G2ZA 3VI5A 1A24A 1XBSA 5D73A 2XBIA 1Y25A 4BA7A 1ZOFA 2DJKA 2EIOA 3E3EA 3WGEA 1EV9A 4L5OA 2YJ7A 4HS1A 2NBSA 2X8CA 4ZL8A 3UVTA 3IC4A 1R26A 2IMDA 3S9FA 3CSJA 2ES7A 2C3NA 2GQMA 1V98A 1NW2A 4YAPA 3IR4A 2E2MA 2PVQA 2DJJA 3CYNA 4EF0A 4ECIA 4K1FA 4XRAA 4N0VA 3GHAA 2MMZA 1F9MA 4MF6A 2FUG2 5CRDA 4JBBA 5G1KA 4MZWA 1WWJA 4HEA2 2H01A 2VCXA 3KH7A 4IKHA 4AGSA 1AAZA 5KEJA 4NV2A 5HR3A 5A4UA 4WBRD 4IVFA 1PSQA 4PURA 4YAVA 1ZZYA 4TR3A 2GZYA 2PPTA 2OADA 4AF2A 3UJ1A 1TP9A 3VWXA 5B6NA 2QSIA 2N5FA 2JZTA 3RHCA 5B8BA 4L0WA 4NHWA 1QXHA 3L78A 5GAPD 4HJMA 4JU5A 2HNLA 4EC0A 1FG4A 2C3QA 3E9JB 3IXRA 4CHSA 3TJGA 4GSTA 2GVPA 3RHBA 3ZYWA 1Q4JA 1TKDB 1OC8A 3EU4A 3KCMA 3EMPA 2TIRA 3WGXA 3CTFA 2LQQA 1Z5YE 3C1RA 2LQOA 4L8EA 2EC4A 3TRXA 4D73A 2GSTA 3LYKA 2G2QA 3IV4A 1QQ2A 3M1GA 3GUSA 1KTEA 1V9WA 4AJ7A 2GZZA 5IOXA 1B4QA 5ECRB 2RLIA 3TKQA 3Q74A 4KUNA 2R5GA 3K8NA 5ECIB 4N30A 1K0AA 1B9YC 3W6GA 2DJ3A 4RI6A 5IM9A 1K0MA 1H4OA 2MYGA 1Z3EA 5IQYA 4G10A 2JACA 1HYUA 4LMVA 3EVIA 1KBNA 2ON5A 2YP6A 4OMVA 3TGZA 3O3TA 5H5QA 2F8FA 2FNOA 2DLXA 5JWOB 3ISOA 1GULA 1XVQA 1ERVA 3GN3A 3VURA 4WBJA 2PMTA 1WP0A 3F8UA 2TRXA 2F9SA 1MTCA 2N5BA 3C73A 4BVXA 1GL8A 2M80A 3UBLA 1ZYQB 5DVBA 4MF5A 1F2EA 5AIVA 5HFIA 1S3AA 2PBJA 4F9ZA 1X5EA 1EP8A 3AY8A 2BJXA 1XWKA 2GT5A 4HQSA 4NWYA 4TXOB 2QKEA 2HZFA 1SKSB 3Q18A 1A0FA 1SENA 4BPYA 4WF4A 2H19A 4POLA 3GFKA 1O81A 2FCHA 5A4WA 2IFQA 3UBKA 1RK4A 4OD7A 1EZKA 2H1DA 2VL9A 3GSSA 1XWAA 2K8VA 2VD0A 4JEDA 1EWXA 3KGKA 1MD3A 2E0QA 3WT2A 3DWVA 2JSZA 3O76A 1OC9B 3WT1A 3TCOA 5KN1A 4KSOA 4HQZA 3P8WA 1DE1A 2YWIA 4WR4A 1S3CA 2H74A 4DSSB 16GSA 3U5RE 2L4QA 3TB2A 4PUFC 4IP6A 5DDLA 4ML6A 4Q5QA 2X8HA 5H5SA 1QK8A 4TKYA 2WS2A 4NXIA 3EC3A 1A2MA 1PQNA 3GKXA 5CRGA 1SL1B 3F9UA 5IMZA 1BYEA 3IPZA 1T3BA 3W8SA 2JSYA 3L9SA 4ZILA 2NVLA 3FR6A 4POBA 1ZMAA 5DQYA 5ELGA 2GLRA 2LNTA 4EDYA 4K9ZA 5FWGA 4O7HA 3N5OA 1USBA 1SK2A 2RUFA 1C72A 2XPEA 9GSSA 2OACA 2FLSA 1FW1A 4JR6A 4KCEA 3P7XA 5E59A 1M0UA 3CXGA 2R2JA 2H75A 4GTUA 4X1UA 3BCIA 3GTUB 4K7IA 18GSA 3HXSA 1GUKA 4FH8A 3VI7A 1PL2A 5IMAA 4IJIA 2MBSA 1GNWA 3GKMA 2GSQA 4ZB9A 3D4MA 1ILOA 4MZCA 4PQHA 1FAAA 1O73A 1XPVA 3GL3A 1Z7RA 3F63A 2AAWA 1K0DA 2IWTA 1BQ7A 2GQKA 4MH3A 2P5RA 5FHIA 2O8VB 3GKNA 5LD0A 1AQVA 1RW1A 3US3A 5CRWA 2A4VA 2KUCA 3WD6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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