2B7KA

Crystal structure of yeast sco1
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
155
Chain Sequence
GKPSLGGPFHLEDMYGNEFTEKNLLGKFSIIYFGFSNCPDICPDELDKLGLWLNTLSSKYGITLQPLFITCDPARDSPAVLKEYLSDFHPSILGLTGTFDEVKNACKKYRVLVDHSIFFYLMDPEGQFVDALGRNYDEKTGVDKIVEHVKSYVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of yeast Sco1.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SCO1 protein
molecule tags Metal binding protein
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 46
structure length 155
sequence length 169
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b7kA00
3GMFA 1TOFA 1PX7A 2TRCP 2PMTA 3VPQA 3HHVA 4O7HA 3O3TA 2GZZA 1ILOA 1V98A 3TCOA 3W6GA 3RDWA 5DDLA 5E4WA 1PGTA 2DSAA 4PNGA 3MAKA 2C0FA 3CBUA 4MPGA 1YF1A 4MF5A 2VLTA 5F0GA 2AHEA 3F8UA 1J0FA 3GIXA 5INYA 5LD0A 3KMNA 2LRCA 2RLIA 4WXTA 3D4TA 4LL4B 1Z9HA 3ME7A 2F8FA 4IJIA 2ZUPA 4HEA2 2MMNA 3ZIVA 5CAXA 1R5AA 3TJBA 2QC7A 1USBA 3LJRA 4FIWA 1I9DA 1LU4A 3LGCA 4BL7A 2H1GA 4L5OA 5JWOB 1XVQA 4GQCA 3IE3A 3A5WA 2MBSA 4NWYA 1O8WA 1Z5YE 2WULA 3IRAA 1JLVA 5DALA 3UEMA 4ML6A 2FWEA 3FKFA 1PKZA 4AGSA 4F9ZA 1H4OA 1GLPA 5CRGA 3HA9A 2EIOA 2AUVA 5DQSA 2GSSA 1XWCA 2LKUA 5J9CA 2ES7A 5EVOA 4WKWA 5ECMB 1TI3A 2KLXA 4HQZA 4KSOA 3QMXA 4MJCA 1KBNA 5J4UA 2QSIA 1WPIA 3CSHA 4CW9A 6GSTA 4JU5A 2CZ3A 1XWAA 4TW5A 4PGTA 2IMIA 2DMMA 3GA4A 1OC3A 2DMLA 2YOIA 4GSNA 4F82A 5L71A 2QGVA 1TKDB 3ZFLA 3APSA 5FWGA 5D96A 4N0VA 2FUG2 2JACA 5F8BA 4IHUA 6GSUA 3CSIA 3D21A 4Q5QA 2GQKA 4V1Ap 2H75A 1HD2A 3UARA 4V2MA 1F2EA 1MEKA 4N30A 1CQHA 2I9HA 2HI7A 3PH9A 5IMZA 4IS0A 2JSYA 3CYNA 4PQHA 1TRUA 5EPFA 3TKPA 2B5YA 4ML1A 1XWBA 2CQ9A 4TKYA 2ON5A 4P3YB 3CRTA 2AJQB 1A0RP 2B5EA 3FR6A 1BG5A 1SJZA 4IQAA 1A2MA 4GSSA 1EV4A 1EEJA 1V57A 3P2AA 3LWAA 5ECLB 1SK1A 2CV4A 3HCZA 2RUEA 3SWLA 2MMAA 5G5EA 1GSDA 3G9BA 3TOUA 3UJ1A 1VRSD 2VCXA 1G0TA 1VF1A 1ZZYA 1JFUA 1XIYA 5H5SA 1BQ7A 2H0HA 5DCGA 2HZFA 4YQMA 5DALB 3GUSA 3ZZXA 2GS3A 1YY7A 4L0UA 4ZL8A 1DBYA 4LMWA 1J08A 2TIRA 3IK7A 5CP1A 1V58A 2IWTA 1GSYA 2EIRA 2YP6A 4OCEA 3HXSA 2DC5A 2HE3A 2L5OA 2VLVA 3GX0A 1M2AA 1E6BA 1N2AA 3FY7A 4I97A 2GTUA 4RUVA 5IO2A 5IM9A 3IK9A 1OAZA 2NPBA 4IP1A 4Q5NA 3KJYA 4G10A 3ME8A 3EINA 3TJKA 2I3YA 3M8NA 3F4TA 3G7JA 16GSA 1XCCA 1F9MA 2VL3A 1JZRA 2REMA 4KDXA 5ECRB 4QQ7A 4ILFA 3F4SA 3ZVJD 4KB3A 1W4VA 4OO5A 2PVQA 4I2TA 1X5DA 1GUKA 5J3RA 1ZMAA 1R5PA 4K0GA 4PQIA 1WOUA 2MZCA 1QGVA 2XBIA 1PRXA 1HNCA 3ZITA 1X0RA 2C8UA 3TRQA 4HDEA 3P7XA 1XZOA 3MNGA 1BYEA 4IP6A 4PX1A 5FT3A 1F3AA 2YJ7A 3LG6A 4OD7A 3QCPA 3HY2A 2C3NA 2LNSA 5COHA 1M9BA 4EDYA 1TRVA 3IAM2 2O89A 2LTKA 2R37A 4DSRA 3DKSA 3FYGA 2RM5A 3LEFA 3GL5A 1T1VA 1R26A 1XOAA 2VUPA 5E59A 2K8SA 2DIZA 3BJ5A 3SBCA 3IAS2 5IQYA 4OWYA 1O7UA 5ELGA 5ABRA 2FGXA 1K3OA 4AJ7A 2HLSA 4MDCA 2O85A 4EE0A 3CRUA 2C4JA 1GP1A 1TK5B 1TK0B 3HDCA 1ZYEA 6GSVA 1LBKA 3H8QA 4MPFA 2C0DA 2GQLA 2LQQA 2M72A 2C80A 3D4MA 1QUWA 2PWJA 4HJ2A 3VWXA 1GULA 4XS4A 4F0CA 3PINA 3A2XA 1FAAA 3J7Yb 2HXKA 4L8EA 3EE2A 3GN3A 3QD9A 4EF0A 2H71A 1A23A 5AN1A 2DJ2A 3L9UA 4KNDA 2L57A 2VL2C 2ALBA 2YWIA 2R2JA 3IV4A 2PBJA 3H4KA 2I1UA 1TU7A 2P5RA 4ZL9A 2XC2A 4MF6A 4IN0A 2PERA 2K9FA 3BCIA 3DRNA 3IOSA 3L9VA 3QFAC 1TP9A 3VI5A 4X1UA 1EWXA 3G7IA 4IQ1A 3TDGA 2GZYA 5ECIB 4XCSA 4V2LA 3RHCA 4HU7A 1X5EA 2GLRA 3UOMA 4YH2A 4J57E 1H75A 2YNXA 1QXHA 4KCAA 1JZDA 2H0GA 5GAND 3HD5A 1SENA 3Q18A 2H72A 4OFNA 3TRXA 2H1DA 3C8EA 2EIQA 2OBKA 4DEJA 1S3AA 1U3IA 3M1GA 2AAWA 1M2BA 5D8IA 3F3RA 1SL0B 4ZIJA 2FWGA 3H93A 3UBLA 4BWSA 1MDJA 1V40A 4ISDA 3ZL5A 1ZGNA 1C72A 2J9HA 1U88A 3GTUA 4POBA 1RQMA 4XS4B 1EGRA 4BWQA 4HU9A 4ZILA 4PXOA 2E7PA 2H8LA 2H19A 4OO4A 2K6VA 5EY6A 3E9JB 4GSTA 4KX4A 2EC4A 1GTBA 3EYTA 1MTCA 2VM1A 4K7NA 2C3TA 5ENUA 1ML6A 2K8VA 4OCFA 3C1RA 2M80A 1T4ZA 3DIEA 4TR3A 3BBYA 1VF3A 2LRTA 5IOWA 1PMTA 2PPTA 3TJJA 1AIUA 3M3MA 3A2VA 2YPMA 3CTFA 4TXVA 3KXOA 1DSBA 5CNWA 2MMZA 2VCQA 2LJAA 4ACSA 5LNKe 3IPZA 2WZ9A 4WEYA 2CX4A 5F05A 2C0EA 2WJUA 4ULXA 1IYIA 5D9WA 3APQA 1QFNA 2AB6A 3LYKA 1XXUA 4O92A 4OFMA 1QQ2A 4KW6A 1TRSA 5B6MA 3A3TA 2R3XA 4HZ2A 4K0NA 1GNEA 1PL2A 2CVBA 5ECSA 3GL3A 4AF2A 2V6KA 1GUMA 5GAPD 2OE0A 2IN3A 4EL1A 1TU8A 2B1LA 1XVWA 1RW1A 4MZWA 4TR0A 5G30A 1O73A 4F2IA 2HRFA 3VWUA 3M0FA 2GGTA 3GV1A 1K0MA 3GSSA 3FZ9A 1ZCPA 1ST9A 4N10A 3DD3A 4MZBA 3IA1A 3OR5A 1GTAA 1XPVA 5ID2A 1U3AA 3CMIA 2N5FA 1ABAA 3F3QA 4HI7A 2MBTA 3GTUB 4JE1A 2VL2A 3GKNA 1DE1A 2H6ZA 1M99A 1AW9A 1HNAA 3FR9A 2ZCTA 2L4QA 4BVYA 3CTGA 3GYKA 1XW5A 2OACA 2HSYA 4J56E 1G7OA 1B4QA 3ZIJA 2LSTA 2HYXA 2I81A 3IXRA 3CSJA 1PA3A 5KN3A 5AISA 4IKHA 3UL3A 3H1NA 6GSYA 4WF4A 1ERTA 4K7OA 5HFIA 3CXGA 4WETA 5HFKA 1OKDA 5JWRB 1JLWA 2H01A 3DVWA 2JZRA 3ZREA 4EUYA 4XIHA 2OBIA 1O81A 1K0AA 4CDOA 3D5JA 4GRFA 1WWJA 2DJKA 3HJMA 3APOA 2XBQA 2IPAA 4XHMA 1GSQA 4XS6A 2LRNA 3IHQA 4MJAA 3C1SA 4RI6A 1EV9A 5C00A 2KUCA 2WGRA 4LL1B 1F37A 2OADA 2IL3A 3WGEA 4F0BA 2VO4A 5G31A 3D0ZA 4K7IA 2PUKC 4KCEA 14GSA 4HS1A 2JZTA 1M9AA 3TKRA 1M2DA 2WCIA 1NM3A 4POMA 5GSTA 4I8BA 2H1BA 2ON7A 2OKAA 1SYXA 1I5GA 1TXXA 3HZ4A 2O8VB 1JHBA 3HYPA 3W8SA 3G7YA 4DSQA 5ID2B 1AQXA 1F3BA 5AIVA 3LFLA 3N5OA 3TB2A 2GVPA 2CA8A 5GSSA 4I2UA 4NPBA 3Q6OA 5DQYA 1LJRA 1Y6EA 1Z6MA 2H0IA 5IPHA 4G19A 3DWVA 1FVJA 3KCMA 1YKAA 3FK8A 1K3LA 2DJJA 2WFCA 1V9WA 1JZOA 4FO5A 3F4RA 3KP8A 4I6XA 1OE8A 4KGIA 4K8MA 2B6MA 3HVXA 2XPEA 5B6NA 2XPDA 4NAXA 3L9SA 2LV3A 1ERVA 4HZ4A 3L0HA 1GLQA 5JCUA 3VWVA 2LUSA 3TKSA 4TOPA 3DXBA 4IJ3A 4LMVA 3M9KA 5CRDA 3GRXA 3K8NA 3RAZA 3GURA 1YDKA 2OJLA 3A2WA 2VCZA 4YAPA 4GLTA 1AQVA 5DJMA 5IMAA 3LXZA 4NMUA 6GSXA 1PSQA 3DEXA 2BTOT 4RQXA 1QK8A 4FYBA 1O8XA 3FW2A 2IMDA 1CQGA 5ECKB 1F6MC 5IMDA 3E3EA 1MDIA 2N5BA 4AJ6A 5B8AA 4X43A 5FHIA 3NOFA 2R5GA 3ZTLA 2A2RA 4G9HA 3ISOA 1WIKA 4O32A 1WRYA 5HR3A 5A4UA 4Q5RA 2DIYA 3QDNA 2JU5A 5DCHA 2CT6A 3TGZA 3VWWA 2BJXA 1NW2A 3ERGA 3J7Yk 3M9JA 3C71A 5AGYA 1OC8A 2H74A 2E0QA 3VPTA 1EOHA 2I4AA 1THOA 4FYUA 1HNBA 1PKWA 5DVBA 3AY8A 3EU4A 4DVCA 1SJIA 2DLXA 2WRTA 1K0OA 3TJGA 1X9MB 1NHOA 2YJHA 3ERFA 3LXTA 4IELA 2VCVA 4MABA 3FZ5A 1U6TA 3UBKA 4OFTA 2R6KA 2C3QA 2R4VA 3FEUA 2C1YA 1ON4A 1ZOFA 3ED3A 5D9VA 1EOGA 4XRDA 1XWGA 1ACVA 5ELAA 2K18A 2GDRA 1SKRB 1SK0A 2VCWA 1XW9A 2L4CA 5A4VA 2FA8A 2HZEA 2IMFA 5ECNB 5G2ZA 3GKMA 2GSQA 2P31A 6GSSA 1GTUA 1SKSB 4E8HA 1OKTA 4V1Ag 3BOAA 3R2QA 1FOVA 1B9XC 1HYUA 5H5RA 3V1WA 3KZQA 3FRCA 1Z7RA 5JCWA 2PN8A 4PURA 3EU3A 3F9UA 3I69A 3LSZA 5CO3A 5DBQA 2KP2A 1SL1B 2DJ3A 4EO3A 3D22A 4IGJA 1B8XA 5J41A 4MCUA 1VF2A 4J2FA 5IMVA 3F63A 5JCGA 4FH8A 2X8HA 3DGQA 3UVHA 1T8EB 19GSA 5KN0A 1A24A 1AUCA 5F07A 1EZKA 1MD3A 2L5LA 4EKZA 4KA0A 5HR1A 1UC7A 2L6CA 1TI1A 2HT9A 4PUAA 1U87A 1V2AA 3BD2A 1PN9A 4BPYA 1XWKA 3VLNA 2JL4A 1OVNA 3LYPA 3EMPA 3PGTA 2TRXA 5IIZA 4EC0A 2E2MA 4MLYA 3Q74A 1W89A 1FW1A 2V1MA 4HQSA 3QAVA 5GZZB 2B1KA 5IPGA 1B4PA 2FCHA 13GSA 2HNLA 4GCIA 1FVKA 1O85A 3JCML 1Z7PA 5JWQB 2B7KA 1G6YA 2HZEB 3UMAA 2FA4A 1SKWB 4ZB6A 1WE0A 4MH3A 4YQUA 3O76A 2PGTA 3O6TA 3KEBA 3GX8A 4NHZA 1GSEA 1EEMA 1A2JA 18GSA 4KDUA 1PX6A 2WB9A 5HR0A 1BJXA 2KHPA 4Q5FA 4JZQA 1GSFA 4KDYA 4YAVA 2RUFA 1B9YC 1K0CA 4LLRA 2F9SA 4KUNA 4HOJA 2GSTA 1X9WB 4JRRA 2YN1A 4G2EA 2HFDA 5KEJA 5DJLA 4E8EA 1ZYQB 4OMVA 3PR8A 4PUFC 2CAQA 4PQ1A 3KIJA 3TKSC 1GUHA 2IMKA 4MMMA 4L5LA 5B7CA 6GSWA 1GRXA 5LCZA 5A5KA 3HJOA 4GTUA 1SK2A 3WGXA 1AQWA 2IFQA 1BEDA 2HSHA 1YEPA 1XW6A 3RPPA 4TXOA 3FHKA 5H5QA 4N0ZA 1T00A 4AJ8A 3ZFBA 1B48A 1UN2A 3UVTA 2VD1A 5F06A 2IMEA 4KE3A 4LA1A 3QPMA 3FZ4A 4NV5A 1KEBA 1TW9A 2VD0A 1EP8A 2ZNMA 1A8LA 2A4VA 2VM2A 5CREA 3L4NA 1Q98A 2A2SA 2FWHA 2FD3A 1ERUA 1UA5A 12GSA 2YWMA 1Q4JA 1NHYA 3VK9A 1GL8A 3U6VA 1FHEA 1DE2A 2X8GA 1X9SB 2V6OA 4RI7A 4MJBA 4K9ZA 4ECIA 1EP7A 22GSA 5HQPA 2LJRA 2FLSA 1FB0A 1AAZA 1OYJA 2GT6A 5AIXA 3FZAA 3C7MA 3W8JA 4MJEA 5KN2A 2GSRA 4GXZA 4N11A 2LS5A 4POKA 5KN1A 2RIIA 3FR3A 1BAYA 2YZUA 3WYWA 2NBSA 4IBPA 2VIMA 1UVZA 1K3YA 3N9JA 3MWHA 4ZB8A 4Z7XA 5ECPB 4IVFA 5J9BA 3TKQA 1K0NA 2QKEA 2G2QA 2NTOA 3VFIA 3EMXA 1E2YA 2IFQB 2F3MA 5ECQB 2OE1A 4ECJA 1ERWA 1URMA 4PNFA 2H66A 4H86A 2N5AA 3ZMLA 1TRWA 4TXOB 1GNWA 3IDVA 1EGOA 2DBCA 3QFBC 2LNTA 4F03A 5D73A 3MDKA 3VI7A 3D6IA 1A0FA 3EWLA 3F6FA 2BMXA 4WBJA 4QL7A 3L78A 1VF4A 1Y25A 1RK4A 1OC9A 2OE3A 5ECOB 2B3SA 3QOUA 2G0FA 3E0UA 4ID0A 3TRPA 4NXIA 20GSA 3UAPA 4D73A 2P0GA 2H70A 2VLUA 3QAGA 1NSWA 2CX3A 4K2DA 2FWFA 1SJ6A 2L59A 3P8WA 2IJYA 1YZXA 4MK3A 4ZBDA 1GSUA 3ZRDA 3KH9A 2F8AA 1TDIA 3WT2A 2PVOC 1WP0A 5IO0A 2AYTA 2E2GA 1FG4A 1K0BA 3KM6A 3TOTA 3VURA 1QMVA 2B5XA 3GKKA 1KTEA 1WMJA 3WT1A 3QR6A 2V32A 2WDUA 4K1FA 4CHSA 4ECBA 2LJKA 2VAFA 2HRNA 4TR4A 2D2ZA 2MYGA 3KD0A 2FNOA 2H6YA 3RBTA 2JSZA 4TVEA 4EVMA 3DMLA 1N8JA 4ECCA 2MMOA 1SD9A 2F51A 11GSA 2O87A 1YF0A 4GQFA 1TJDA 4GF0A 4XRAA 3ZYWA 1SU9A 1XFLA 5DAKA 1AC1A 2VL9A 1KNGA 2KOKA 3QAWA 2L6DA 3GNJA 3IC4A 4TR1A 1GWCA 4HJMA 1IYHA 4WR4A 2YV9A 4KH7A 2O7KA 2CVDA 4WF5A 3EVIA 2GQMA 2IIYA 5IMCA 5D9XA 1OC9B 2X99A 3U5RE 2B7JA 1BX9A 3HZ8A 4MA9A 10GSA 1O6JA 2CAIA 2NVLA 4JEDA 1YEXA 3WD6A 1VGLA 3C73A 4ZBBA 4D73B 4MF7A 4EXJA 2LQOA 4FYCA 3NZNA 1AXDA 2GZPA 4QL9A 3HVSA 4RQRA 3GH6A 3EURA 2RM6A 1SYRA 1YKCA 1X5CA 3IBHA 2DJ1A 4NV2A 3BCKA 5CRWA 4TN8A 3WGDA 9GSSA 2OA7A 3H79A 2H6XA 1T4YA 4JR4A 4BVXA 2H30A 1HQOA 1S3CA 1MD4A 2P5QA 3GFKA 1S3DA 3IR4A 2JZSA 1Z6NA 5HR2A 1PD21 3F0IA 4IW9A 4WR5A 2YANA 2YWNA 3DYRA 3US3A 1TTZA 1SL2B 4GWRA 4KSMA 1A2LA 2JADA 1FO5A 5IMFA 3KTBA 2WS2A 3LQ7A 4MZCA 4EDZA 3P90A 2CVKA 2DJ0A 1JZWA 4HUAA 5A4WA 4BA7A 4ZBAA 3GHAA 3ZMKA 1GH2A 4O5RA 2V41A 1G6WA 1MDKA 4DSSA 1XOBA 3RHBA 5G5FA 1PQNA 7GSSA 4I5QA 5DAKB 1WJKA 2H73A 2YV7A 4XS1A 2AV4A 1T3BA 3I43A 2J23A 4TR1B 2H76A 4YQVA 17GSA 1DUGA 3KP9A 1M7TA 2H1AA 3GKXA 3KGKA 1K0DA 4XTSA 2YZHA 3RPNA 3TKSE 5CRHA 1YJ6A 2V2GA 1OE7A 5ECHB 3ZLPA 5G1LA 3HKRA 4KAEA 2KP1A 3S9FA 3HVVA 2FHEA 4POLA 1THXA 2PU9C 2YCDA 3GH9A 1TK8B 1M0UA 4WBRD 2Z9SA 1R7HA 4JBBA 2M46A 1XBSA 3I6AA 3KMOA 4NHWA 4ZB9A 1FB6A 2LEGA 1Z3EA 5D9TA 1PL1A 3HJPA 2XHFA 2C0GA 2X64A 5HFGA 4MP4A 5CYYA 1GTIA 2VOCA 3I9V2 4V2NA 4ZL7A 1SD8A 5C04A 3Q19A 3UIWA 1A8YA 8GSSA 2GT5A 2YWOA 3MSZA 3TUEA 3EC3A 4TRXA 2FY6A 3ZVJA 1T7PB 5J5NA 4L0WA 3TJFA 1ZL9A 5G1KA 2NDOA 5EL8A 2VCTA 3F6DA 1G7EA 4ZXGA 3KH7A 1J9BA 3NIVA 5IOXA 3LORA 2CZ2A 4K6XA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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