2B7KA

Crystal structure of yeast sco1
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
155
Chain Sequence
GKPSLGGPFHLEDMYGNEFTEKNLLGKFSIIYFGFSNCPDICPDELDKLGLWLNTLSSKYGITLQPLFITCDPARDSPAVLKEYLSDFHPSILGLTGTFDEVKNACKKYRVLVDHSIFFYLMDPEGQFVDALGRNYDEKTGVDKIVEHVKSYVPA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of yeast Sco1.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule keywords SCO1 protein
total genus 46
structure length 155
sequence length 169
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-10-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2b7kA00
5HFIA 3BJ5A 3JCML 5J4UA 2P5RA 4KCEA 2HZFA 4XRDA 3EYTA 3HA9A 3GX8A 3WGEA 2FD3A 5D9VA 2YJ7A 5G31A 4K7IA 1W4VA 3M9JA 3NOFA 3KD0A 1ABAA 2WULA 5J41A 4MF5A 1K0CA 4NWYA 2RM5A 4ZXGA 3GA4A 4BVYA 3RHCA 3HJPA 3L78A 4OO4A 4PQ1A 5LD0A 3EURA 1F3BA 1Z3EA 1WOUA 3M3MA 5L71A 4X0XA 4G19A 2HNLA 2YOIA 3L4NA 1R5PA 3VPTA 1SD8A 3KCMA 1ERWA 1BG5A 6GSXA 3KM6A 1RK4A 5IQYA 1DBYA 2P31A 2VCWA 1ML6A 3BBYA 2ON5A 4V1Ag 4ML1A 5ECNB 4P3YB 2LRNA 4I8BA 4IBPA 5IMDA 5ECKB 1BQ7A 4GWRA 1ZMAA 3ZFBA 2VM1A 3TB2A 5B7CA 7GSSA 2BTOT 3HVXA 2ZNMA 4D73B 2VLTA 2GQLA 2YANA 4HS1A 1QQ2A 2NVLA 5HR2A 2XBIA 3UBKA 3GIXA 3CYNA 2OADA 5ECHB 20GSA 4OMVA 1SENA 3DGQA 3TKSA 3TGZA 3VI7A 2O85A 1B4QA 5KN1A 1ZGNA 3LJRA 1GP1A 1T8EB 1OC3A 1QXHA 5IMAA 1GL8A 3KEBA 2PVOC 3M8NA 1GULA 4NXIA 3HVSA 2RUEA 3F6DA 4XCSA 5IPGA 5F8BA 5DVBA 2WJUA 1M2BA 2HI7A 2B7JA 4XIHA 5IPHA 2V41A 3HZ8A 4XS4B 1FVKA 1ZYEA 12GSA 1GTAA 5DALA 5CYYA 1XWCA 5G5FA 1U3AA 3CTFA 4WF5A 2R3XA 5KEJA 5CRDA 3FR9A 3DVWA 3H79A 4XHMA 3ZMKA 2C3NA 2H0GA 4DSSB 2DIZA 4ID0A 4BWQA 2CZ2A 1T4YA 5ECRB 4IJIA 5F07A 5ECQB 2R5GA 2H30A 4GCIA 1ON4A 4ZL9A 3UIWA 4JZQA 4EE0A 2GZYA 1GLPA 2I81A 3DEXA 2YWMA 4TOPA 4QL9A 3GYKA 1TK5B 3RHBA 2F51A 2VL2A 2IJYA 5DJMA 5H5SA 4MP4A 5IM9A 1PSQA 2OA7A 1H75A 3QD9A 4HZ4A 2FWHA 3EU3A 3L9SA 2JZRA 2CVBA 4NHWA 2B5EA 1XFLA 3KMOA 1MD4A 1TW9A 6GSVA 4HU9A 2L6DA 4V2MA 1EEMA 2GQMA 1TP9A 3GTUB 1ZYQB 2LUSA 3EVIA 5FT3A 1WPIA 3ZREA 2L59A 5IO2A 5D73A 1NHOA 2F9SA 3ISOA 3DKSA 4EDZA 1MDJA 1YZXA 2LTKA 5G1LA 4FO5A 5B8BA 4OWYA 1WWJA 1MTCA 1O8WA 17GSA 4JEDA 3IC4A 3KXOA 3F4SA 3CRTA 3HZ4A 5IIZA 4RQXA 3KJYA 4L8EA 1PQNA 2GTUA 4ZB9A 3TJKA 2OBKA 3KIJA 4TXVA 4WR5A 2E2GA 2K8VA 1EZKA 3A5WA 4XS6A 1QMVA 2NDOA 1A8YA 4HOJA 1FOVA 5JCGA 4MA9A 3HHVA 2PBJA 4KSOA 3IRAA 4K6XA 2I4AA 1NSWA 5CAXA 4F0BA 2JACA 3O76A 2C0FA 2OBIA 2GT5A 1XWBA 2VO4A 5D9WA 4MZBA 1XW5A 2CX4A 2PUKC 4K0NA 3D4MA 4TRXA 1I5GA 1EV4A 2MBSA 2ON7A 1XOBA 2KLXA 3TRXA 4WBJA 3O3TA 1HNCA 1JZRA 4FYCA 2TRCP 5DDLA 5KN2A 1MD3A 3FYGA 2WS2A 3RPNA 4PUFC 6GSUA 1KBNA 1J08A 4GLTA 4J57E 2H66A 1F2EA 3CTGA 2PPTA 2G2QA 3LORA 4TR0A 1N2AA 1LU4A 3KZQA 3ZIVA 2JZSA 3F4TA 5DCGA 3TUEA 3VLNA 2LQOA 1V9WA 1A2MA 3UL3A 3GSTA 1H4OA 2P0GA 4F82A 4F2IA 2CAQA 1A2JA 3G7YA 2VLVA 5CO3A 2HE3A 4K7OA 3TKSC 3G7IA 1GTBA 4CDOA 5B6MA 1M9AA 3HJMA 1S3CA 3GKMA 4G10A 2C3QA 2X99A 2K8SA 1EP8A 5AIVA 3FZAA 1U87A 1PKWA 2KOKA 2GS3A 3DWVA 4N0ZA 1JZDA 4X1UA 1FHEA 3IAS2 5H5QA 2MBTA 4O92A 5GSTA 4IS0A 1O8XA 1HYUA 1A23A 4WF4A 3ZMLA 2YCDA 4N0VA 2H75A 5CRHA 3FZ4A 1SL1B 1CQHA 3LQ7A 1PD21 2R37A 1HNBA 2ES7A 4TKYA 4GSTA 1R5AA 1DE2A 1U6TA 1VF1A 3DYRA 3A2XA 3C1RA 1E6BA 4ZBAA 3F63A 2I9HA 2GZPA 2VL2C 1OC9B 4HEA2 5ECOB 2VAFA 4JBBA 5HR3A 5F06A 4EKZA 4PGTA 1Y6EA 4GSNA 5LNKe 1XZOA 1XXUA 2CV4A 5DAKB 4I2UA 3GHAA 3VFIA 1RW1A 3L9VA 3TOUA 2LRCA 1VF3A 1O7UA 1SJZA 1GSEA 4XS1A 5ELAA 5GAPD 3ME8A 2JADA 2VCQA 2AUVA 2KP1A 1IYIA 1SKRB 4K8MA 2CVKA 4V2NA 2X8CA 4N11A 3CSJA 2JU5A 3ERWA 5B8AA 5GAND 4MPGA 4YQUA 4O32A 4PQHA 1S3AA 1T1VA 4AF2A 1U3IA 4EF0A 3D6IA 2IFQA 4ZL8A 4NPBA 1BAYA 4CHSA 2AYTA 1PMTA 3SBCA 4EC0A 4ZBBA 2J9HA 4L5OA 4EDYA 4POKA 4OD7A 1B9YC 1THOA 3D0ZA 4J56E 5J3RA 2GZZA 4Q5QA 2MZCA 2IWTA 3VPQA 4CW9A 2LNTA 3TDGA 5IMZA 4ZB8A 3ERGA 4RQRA 2VUPA 2IMIA 2E0QA 2OACA 5DJLA 3UVHA 2GLRA 2H1BA 3A2WA 4DSRA 3GFKA 1TRVA 3QFBC 4FIWA 2AJQB 2DJJA 1PN9A 5FWGA 2TRXA 5EY6A 3K8NA 1K3OA 1BX9A 2H6XA 4TVEA 1OKDA 1OAZA 1EEJA 4TR4A 2FNOA 1EWXA 4PUAA 5ID2A 4PNGA 4L0WA 1YDKA 4J2FA 2H0IA 1XW6A 3ZLPA 2RM6A 1SK0A 1O85A 3GURA 4ULXA 5D8IA 1A0RP 2P5QA 4LL1B 14GSA 4V1Ap 4WXTA 1ST9A 4JR6A 4JR4A 3E0UA 1WJKA 3C71A 2C0GA 2XBQA 2QGVA 2I1UA 3KH9A 4H86A 1N8JA 1GSUA 4IP6A 2DJ1A 4ZB6A 1EGOA 1BEDA 2N5FA 3VI5A 3G7JA 2PERA 5JWOB 4QQ7A 2Z9SA 2B1LA 6GSTA 3ZIJA 1SL0B 3LXTA 4GRFA 2MYGA 4ML6A 18GSA 4WKWA 3KGKA 1SYRA 1V2AA 3ZRDA 5KN0A 4IKHA 2R6KA 3HVVA 5IOXA 3DIEA 5JCUA 1T7PB 1AQXA 1GTIA 3E9JB 1KTEA 1X5EA 4X43A 5B6NA 3C8EA 3IAM2 3EU4A 4NAXA 3KP8A 10GSA 1ERUA 2L6CA 2H6YA 2DJ2A 2A4VA 1EOHA 3WGXA 3I6AA 1SJ6A 4ECBA 4IQAA 5A4WA 2WB9A 5ECPB 1JLWA 3HKRA 2MMNA 4ACSA 2VCTA 4TN8A 3N5OA 3LYKA 1GSQA 1GRXA 2X64A 3TJBA 5D93A 2QC7A 1PL1A 1FW1A 2H1AA 3IK9A 1B9XC 1X5CA 1PGTA 3Q18A 4EUYA 1M0UA 2HSHA 5IOWA 3M0FA 4GTUA 3RBTA 2ZCTA 3HDCA 5J5NA 1TRSA 2HZEB 1K0MA 2O8VB 2EC4A 3E3EA 2QKEA 1HQOA 4TR1A 2NPBA 2B3SA 1DUGA 1ZL9A 3P8WA 2L5OA 2FCHA 3GUSA 2B1KA 5GZZB 3IHQA 3PGTA 4MABA 3ZTLA 1NHYA 1A24A 3J7Yb 4XTSA 2DJ3A 2MMAA 4HQZA 1ACVA 1WMJA 2B6MA 1F6MC 2PMTA 1F37A 1XWKA 3LGCA 1JLVA 4MZCA 4GF0A 4KX4A 3KMNA 1CQGA 1PA3A 4ECJA 1TOFA 2N5BA 4TXOB 2VL9A 9GSSA 1XW9A 4K9ZA 5GSSA 4KW6A 3UJ1A 2DIYA 3TKPA 3HCZA 3QCPA 1Z7PA 5JCWA 2L4QA 4ZIJA 3NIVA 4KDYA 3EMPA 2BMXA 2CAIA 2GSQA 4Z7XA 5JWRB 1AXDA 3FZ9A 4E8EA 4EXJA 3GMFA 3TCOA 1TJDA 3CXGA 4PNFA 4IVFA 4I5QA 4HZ2A 2H70A 3MNGA 2WDUA 4HDEA 2EIQA 3M9KA 2ZUPA 4BWSA 2CT6A 3D22A 1XVQA 3EMXA 2H1DA 4OFNA 1I9DA 1VF2A 4OFMA 3H93A 3HXSA 1ZCPA 1M2DA 2HRNA 2REMA 3Q19A 3EC3A 3QMXA 4PURA 2BJXA 4D73A 1YQ1A 3F6FA 2V2GA 3GL3A 3VWWA 3IK7A 1C72A 2ALBA 2V32A 1TKDB 4LMVA 5HFGA 5EL8A 1THXA 2DBCA 3GSSA 4KB3A 1Z7RA 5H5RA 4NV2A 3ZZXA 3IV4A 2CX3A 4K0GA 4IP1A 1OVNA 1B48A 2VCZA 2WRTA 2YWOA 2B5XA 4MJAA 3H8QA 1FAAA 3CBUA 1XVWA 1G6YA 4KA0A 5F0GA 1VGLA 16GSA 1O73A 3APSA 3L9UA 2LEGA 3MAKA 2GSTA 3MWHA 1MDKA 2GVPA 1R4WA 3ZFLA 1XCCA 4WETA 2YWNA 3AY8A 1J9BA 5ENUA 2DMMA 2EIOA 4HJMA 6GSSA 3C73A 4IQ1A 2HRFA 1DSBA 1JZWA 4DSSA 3RDWA 5CRWA 3WYWA 3HYPA 4HI7A 2L5LA 2C3TA 2IIYA 2YPMA 1XBSA 5CNWA 1UVZA 2HT9A 2C4JA 2H19A 1AAZA 2LQQA 3HY2A 3FR3A 3BD2A 4O7HA 1SD9A 3C1SA 2YZUA 4ECCA 2VM2A 1YF1A 4ZBDA 2M46A 1UN2A 4MZWA 5HQPA 2HXKA 2V6OA 19GSA 2XC2A 2VD0A 2VCXA 4BPYA 3LFLA 1TRUA 4PXOA 1UC7A 1NW2A 2M72A 3FKFA 4QL7A 2PGTA 4JRRA 2F8FA 1XPVA 1K0OA 4G9HA 4N10A 2PU9C 1SU9A 4GQCA 1PX6A 2I3YA 1U88A 5IMCA 3KTBA 2C0DA 2FWGA 1M7TA 1T3BA 4POMA 3VWVA 4HJ2A 1WP0A 3GTUA 4OCFA 4I6XA 3WT1A 3V1WA 1IYHA 1K0BA 2WZ9A 1G7EA 2F3MA 2H72A 4KCAA 4MLYA 2IL3A 2M80A 2VL3A 4E8HA 4K2DA 1E2YA 4YH2A 4ILFA 2HYXA 1TXXA 2YZHA 1GTUA 5DALB 3GKNA 4ZILA 4ISDA 2AHEA 2XHFA 1ZZYA 2VLUA 4N30A 2N5AA 3TRPA 4K1FA 1DE1A 3IE3A 1GUKA 1A8LA 1PL2A 1GNWA 1M9BA 5HR1A 5EPFA 4AJ8A 3SWLA 4EO3A 8GSSA 1JFUA 3FZ5A 3GKKA 2YN1A 4YAVA 2B5YA 1Q98A 5E59A 3RAZA 3WD6A 2AV4A 2FA8A 1FVJA 1OE8A 4IJ3A 3ED3A 5A4VA 3QDNA 1TI1A 1TU8A 1ILOA 2YP6A 4MMMA 4TR1B 2H6ZA 2K9FA 4WEYA 3R2QA 2OE3A 2VOCA 3TJGA 2VIMA 5G5EA 3WT2A 3G9BA 4RI6A 1ERVA 3F3RA 1Q4JA 2F8AA 2A2SA 3ZVJD 2QSIA 3N9JA 2YWIA 3M1GA 3P90A 2H74A 3KTLA 2JSYA 2GSRA 3ZITA 2GQKA 4FH8A 2WFCA 3US3A 3IOSA 4TW5A 1AQWA 3VWXA 3EE2A 1YEXA 4NHZA 1F9MA 3GH9A 3FK8A 3ZYWA 2O87A 4KSMA 1AUCA 2E7PA 3IR4A 3ZL5A 1V40A 1FG4A 2HFDA 2JL4A 4V2LA 1M2AA 1WIKA 3FRCA 1YKAA 5LCZA 4F0CA 5DQYA 11GSA 1FB6A 4IW9A 2FWEA 1MDIA 4MF6A 3H4KA 2FLSA 1BYEA 4L5LA 5DBQA 2LRTA 3MSZA 3TOTA 4Q5FA 2LS5A 5C00A 2OKAA 3I69A 2YV7A 4ZL7A 4AGSA 3VWUA 3W8JA 2XPEA 2H73A 1TK0B 2HSYA 2C1YA 1V58A 1AQVA 4IGJA 2K6VA 3UOMA 2A2RA 5DQSA 2RIIA 3FW2A 3EINA 2X8GA 1X0RA 4KNDA 2VCVA 5IMVA 1G7OA 3RPPA 1XWGA 1GSDA 4TR3A 1YY7A 1TK8B 2H01A 3Q74A 4Q5RA 3U5RE 2TIRA 5DCHA 4MPFA 13GSA 3NZNA 1TI3A 5ABRA 5G2ZA 1V57A 1VF4A 4POBA 1WRYA 5G1KA 1X9SB 1YF0A 2D2ZA 3BOAA 3F0IA 3C7MA 2H0HA 4BA7A 3GH6A 4AJ6A 1YEPA 3DVXA 4MJBA 4XRAA 1JHBA 2YV9A 2LKUA 2C80A 3QAWA 1X9WB 2K18A 4RI7A 4KDUA 1JZOA 2GT6A 3F4RA 3FEUA 1TDIA 3P7XA 1OC9A 3UAPA 1EOGA 3FHKA 1Y25A 1XIYA 5DAKA 5J9BA 3DXBA 4LMWA 3F9UA 4NV5A 3A3TA 1ERTA 1EV9A 3FY7A 1GUMA 2IMEA 3Q6OA 5ECMB 1YJ6A 1SK2A 4EVMA 2FWFA 3IBHA 3PINA 1HD2A 5A5KA 1GUHA 4KAEA 4MH2A 5C04A 3UEMA 4ECIA 1KEBA 2EIRA 1QFNA 5HR0A 2YNXA 1PKZA 4HUAA 2MMOA 1SL2B 2PVQA 3CRUA 3GL5A 2WCIA 3UMAA 4KUNA 2LJRA 2B7KA 5AISA 3IXRA 2FUG2 5F05A 4NMUA 3BCKA 4KGIA 4YQMA 3MDKA 5ECLB 2AB6A 2KP2A 4GQFA 1OE7A 4MF7A 5A4UA 3J7Yk 1TTZA 3LG6A 2J23A 2O89A 2OJLA 3CSHA 2CA8A 1K0NA 2WGRA 2KUCA 1PX7A 2H76A 1B4PA 1QGVA 1X9MB 4KH7A 4MDCA 1J0FA 1OC8A 3GV1A 3TKRA 1ZOFA 3IDVA 4I97A 5D96A 2GGTA 1URMA 2RLIA 4YAPA 1GSYA 4IN0A 4HQSA 3W6GA 2IPAA 2DC5A 1UA5A 2DLXA 3L0HA 4OO5A 1S3DA 3GN3A 3TKSE 3GX0A 2V1MA 4F03A 5E4WA 4IELA 2H71A 3ERFA 4EL1A 3PH9A 2YJHA 5IMFA 2OE0A 2DJ0A 4LA1A 3UVTA 3HJOA 2JZTA 4BL7A 1Z9HA 4OCEA 3WGDA 2LJAA 3F3QA 5IO0A 2MMZA 4L0UA 3BCIA 5EVOA 2FGXA 3TKQA 3CSIA 1MEKA 2LV3A 4BVXA 1QK8A 5D9XA 1RQMA 3APQA 3CMIA 3VK9A 1K3YA 2GDRA 3APOA 5AGYA 3PR8A 3QAGA 4RUVA 3OR5A 1AW9A 1W89A 2PWJA 1SKSB 4YQVA 2CQ9A 2VD1A 2R2JA 2R4VA 2O7KA 4F9ZA 2PN8A 2IFQB 1BJXA 1GNEA 1GWCA 1EGRA 4FYBA 3GNJA 6GSYA 1R26A 4WBRD 4MH3A 1V98A 2IMFA 4LL4B 3D5JA 5HFKA 2LJKA 3FR6A 5ECSA 3ZVJA 5ECIB 5JWQB 5KN3A 3D4TA 4JE1A 3TJJA 3ME7A 4MK3A 4DSQA 1K3LA 4JU5A 1R7HA 2IMDA 1M99A 1GSSA 5FHIA 1LBKA 1HNAA 6GSWA 2CZ3A 4XS4A 3DRNA 2L57A 3P2AA 1GLQA 2CVDA 5ID2B 3QPMA 4HU7A 2L4CA 2XPDA 3I43A 2OE1A 3S9FA 1G6WA 3UARA 4PX1A 3QR6A 5CRGA 4KDXA 1TRWA 4WR4A 1KNGA 3D21A 3IPZA 3F8UA 3GKXA 2HLSA 1QUWA 2HZEA 5ELGA 1Z6MA 3A2VA 3GRXA 4PQIA 1USBA 1Z5YE 3LXZA 1SKWB 1Z6NA 3U6VA 3UBLA 3DD3A 1FO5A 1O6JA 3LSZA 5COHA 4MJEA 2C8UA 1F3AA 1XOAA 3LWAA 2AAWA 1WE0A 1OKTA 3KH7A 4AJ7A 1OYJA 2DMLA 4POLA 1T4ZA 1TU7A 2IMKA 1AIUA 4FYUA 2GSSA 2RUFA 5INYA 1YKCA 3I9V2 4G2EA 1VRSD 2NBSA 4TXOA 4LLRA 1EP7A 3TRQA 5D9TA 2FHEA 4GXZA 1K0DA 1X5DA 3LEFA 1K0AA 3W8SA 5CREA 4IHUA 4MJCA 3KP9A 4K7NA 1FB0A 2NTOA 2FA4A 4Q5NA 1G0TA 1PRXA 3DMLA 3QOUA 3LYPA 2JSZA 3IA1A 4I2TA 4OFTA 2DSAA 2DJKA 1GH2A 22GSA 1SYXA 4KE3A 2G0FA 1AC1A 3VURA 4DVCA 2FY6A 2KHPA 4DEJA 2LSTA 5AIXA 2V6KA 3H1NA 1T00A 5AN1A 4O5RA 1LJRA 5G30A 5CP1A 3QFAC 2IN3A 1O81A 3TJFA 2E2MA 1SJIA 2X8HA 2H1GA 3EWLA 2C0EA 5J9CA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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