5JCGA

Structure of human peroxiredoxin 3 as three stacked rings
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
TAPAVTQHAPYFKGTAVVNGEFKDLSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGSGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQYVETHGEVCPANWTPDSPTIKPSPAASKEYFQKVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial
publication title Structures of Human Peroxiredoxin 3 Suggest Self-Chaperoning Assembly that Maintains Catalytic State.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Oxidoreductase
total genus 59
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jcgA00
5HFIA 3C8EA 1YDKA 2BTOT 3DVXA 1HD2A 3PH9A 2R37A 3C7MA 4XS1A 3C71A 5FT3A 5HR3A 2F8FA 3LFLA 2VL2A 1LJRA 4HI7A 3C73A 1SL2B 3HDCA 3HVSA 1R4WA 1T4ZA 1XXUA 2MMNA 4KSOA 1SYXA 3DYRA 1OYJA 2FA8A 4NHZA 1N8JA 3GV1A 1ZYEA 1OAZA 1A2MA 5DJLA 1YKAA 2JZSA 4F9ZA 3TJKA 2H1AA 5F05A 5ELGA 3ZTLA 4HDEA 5DALA 3GURA 1XZOA 2I4AA 5HFKA 2VD1A 1VF1A 1X9WB 4LMWA 2M72A 3CXGA 2H6YA 3FR3A 3GSTA 3BCKA 3QOUA 3I9V2 4XS6A 1OKTA 3D4TA 2GQLA 3BD2A 2VL2C 4YH2A 2H30A 3W8SA 5ECOB 2R6KA 1M0UA 2V1MA 1OKDA 5FWGA 2WFCA 1SJZA 2NTOA 4KCEA 4K6XA 3TKSE 4L5OA 5IM9A 1TRSA 1PA3A 2HZEA 2WRTA 3QFBC 4BVXA 2H1BA 3UOMA 2H0HA 1PGTA 4MPGA 3GSSA 3H4KA 3LYPA 3LWAA 3ZMLA 3ED3A 2NVLA 5ECRB 4MZBA 5JWQB 3LYKA 2P5QA 1XWKA 4BWQA 1BEDA 3RPPA 2L59A 5ECSA 3CSIA 4RI6A 4OMVA 1UVZA 1WE0A 4X1UA 4TXOA 1TU7A 4F82A 4KAEA 5A4UA 3LORA 2R5GA 1ZL9A 2PUKC 1YJ6A 2O85A 2JZTA 3EINA 3FZ4A 3TRQA 2H01A 1XWAA 4HZ4A 5IOWA 3R2QA 2I3YA 4LL1B 4POBA 1TXXA 3U5RE 4WBRD 3TRXA 3EMPA 3RHBA 3ZZXA 2H76A 5DQSA 2LJKA 4Q5QA 1GSSA 3EMXA 4ZL9A 4XS4A 1VRSD 3IK7A 1GSYA 1WPIA 3CBUA 1GSDA 1ZOFA 4MJAA 4POLA 3N9JA 2AV4A 3DWVA 4WXTA 3F63A 3J7Yk 2KOKA 2IMIA 3TDGA 2L57A 3ZFBA 4GQFA 3ZMKA 4TR3A 3KM6A 4J56E 2H0GA 2I9HA 1K3YA 4IKHA 3DIEA 2P0GA 1FOVA 3HJOA 1EP8A 2CZ2A 3KJYA 4JZQA 4MMMA 5D8IA 2IWTA 1H4OA 3UBLA 2NDOA 4ECJA 3EU3A 3FY7A 4I2TA 3G7JA 3EYTA 1YF0A 2C4JA 1KNGA 2BJXA 3APOA 1X9SB 1JZDA 1X5DA 3APSA 1TI1A 4HS1A 1XOBA 2DIYA 3KH9A 4KX4A 3LEFA 3VWWA 5AIVA 1XFLA 5J5NA 4P3YB 1F9MA 2OBKA 3TB2A 1OC9A 2NPBA 5ABRA 2YV9A 4FYBA 3A2XA 18GSA 3CTFA 3GL3A 1SU9A 3RAZA 4ZB8A 3G7IA 4XRDA 4MLYA 1A23A 2VCQA 3HXSA 3G9BA 2DJKA 1BQ7A 5CAXA 2FY6A 3N5OA 3CRTA 1SYRA 1O8WA 3WGEA 1KEBA 4KB3A 1U3IA 2GT6A 2YCDA 1URMA 1ERWA 1THOA 2GZZA 4GF0A 1Y25A 3TUEA 4FIWA 4KE3A 3WGXA 3FKFA 2IMFA 3H79A 1HQOA 2R2JA 3WD6A 1ABAA 1WIKA 4HQZA 5HR1A 1SK2A 3O6TA 2DSAA 5G5EA 3IHQA 3QMXA 3GN3A 2OE0A 5CYYA 2MZCA 2D2ZA 1YF1A 1YEXA 2KUCA 5GSTA 4EO3A 2YANA 4XRAA 4G10A 3OR5A 6GSSA 1XBSA 4WF4A 4ACSA 3FRCA 3MSZA 3VWUA 4GSTA 2QSIA 4L0WA 4XS4B 1OE7A 2LNSA 5IMCA 3CTGA 4NXIA 5E59A 3FYGA 4CW9A 3H1NA 2OJLA 4BVYA 1XWGA 2CA8A 1C72A 2WJUA 14GSA 5EVOA 3ERFA 2VCWA 3EU4A 1Y6EA 5HR0A 4TR0A 3CSHA 2WZ9A 2FGXA 3G7YA 3QD9A 4PUAA 3EWLA 4MABA 4V2NA 3WT2A 2H6XA 4PNGA 1T4YA 4D73A 1ACVA 4ULXA 4JE1A 1TK0B 3QR6A 3UBKA 3DKSA 2OE3A 3TKPA 3VPTA 1M2DA 2IPAA 1KBNA 1AQVA 2VLVA 5DVBA 4ZIJA 1FVKA 4CDOA 3QCPA 1X5CA 4KA0A 4F0CA 2H6ZA 4IGJA 1ERUA 5ENUA 3FZAA 3UAPA 2LKUA 2GS3A 1JZOA 1FB6A 4ML1A 1PL1A 1JHBA 5KN2A 3QDNA 3FW2A 4PURA 1MEKA 1OC9B 1XWCA 1MDKA 2IJYA 1B4PA 2LV3A 3ZIJA 1FB0A 4L8EA 2K8SA 4N10A 3A2WA 4N0ZA 2C0DA 5ID2B 1DE2A 1PQNA 2RUFA 4OO4A 2H73A 2JU5A 3US3A 1K0OA 1RQMA 2EIQA 3DGQA 5CNWA 4X0XA 4NV2A 2LRNA 4K1FA 2KHPA 4OCEA 4X43A 4K8MA 3VI7A 3C1SA 5J9CA 13GSA 2YJHA 1JLVA 1IYIA 1DUGA 1GRXA 5GSSA 2ZUPA 4K9ZA 2IMKA 5FHIA 3KIJA 3NIVA 3LGCA 3ME7A 1PMTA 5ECLB 4Q5FA 1MD3A 1Q4JA 2IN3A 3FR9A 5HFGA 3HJMA 1V57A 2M46A 3QAWA 2L5LA 1WP0A 3PINA 3IK9A 3QAGA 6GSVA 1SENA 3ZVJD 3KGKA 2YJ7A 1XW6A 1M9AA 1EZKA 4NHWA 1WJKA 5IO0A 3F6FA 2EC4A 3ISOA 1GTBA 2CVKA 4V1Ag 4IJ3A 4WKWA 3VFIA 2JADA 3FZ9A 3QAVA 2VM2A 1GSQA 2GSTA 2WULA 1T7PB 4ZBAA 1F6MC 2AAWA 1B9YC 2K18A 1BYEA 5B6MA 3MNGA 1XPVA 2K6VA 3TKQA 2VCVA 4IP6A 4XHMA 3Q6OA 1NHOA 4MJEA 6GSTA 4KCAA 4GRFA 2A2RA 5GAND 3SBCA 3TJGA 4NMUA 1I5GA 3F9UA 2H8LA 2DJ0A 5F0GA 3LQ7A 2LQOA 3UARA 1AQWA 2B3SA 1QUWA 3L9UA 1DSBA 1XVWA 3TKSA 2V6KA 3IOSA 4IS0A 4AJ7A 5JWOB 1SL0B 1PKZA 1DE1A 2ZCTA 1TRUA 4WR4A 1UA5A 3L9VA 5LNKe 2B7JA 5AISA 4F03A 5DJMA 1TW9A 3F4RA 4AJ6A 3VWXA 2IMEA 1K0DA 1EWXA 3GL5A 4J2FA 3A5WA 3F6DA 3EURA 4BA7A 2K8VA 4BWSA 1GUMA 4GQCA 1Z6NA 3H8QA 1QFNA 3M8NA 5JCWA 3BOAA 2IMDA 5G1LA 3ZL5A 3Q18A 5AIXA 4DVCA 5IO2A 2EIOA 3UMAA 3HCZA 3ZVJA 3TRPA 3QFAC 1GLPA 1ST9A 3UL3A 1ERTA 1H75A 1A0FA 2VUPA 5L71A 2FWEA 3HYPA 3VK9A 1EOHA 1SK1A 5CRDA 2FWHA 4XIHA 4IELA 1EEMA 1R5AA 3GMFA 4MJBA 4G19A 2LEGA 1LBKA 2BMXA 5IQYA 1FO5A 2F51A 2GDRA 5A5KA 1FVJA 3IXRA 4RQXA 1O8XA 3KEBA 1CQHA 2JACA 3IA1A 4HQSA 2LTKA 1UN2A 2JSYA 2CVDA 4NV5A 4Q5RA 3I43A 2PWJA 1O81A 2P5RA 3ZFLA 5DAKB 1VF4A 1NSWA 2MYGA 2DLXA 3A3TA 2FD3A 4G2EA 2GZPA 1NM3A 1U3AA 4QL7A 1N2AA 3HD5A 2VLTA 1QGVA 4K0GA 4GLTA 3UVTA 4IHUA 3D0ZA 3ERGA 2AB6A 2RUEA 1ZCPA 5GZZB 5ECIB 2GQKA 4YQMA 4ZBDA 2B7KA 1ERVA 3I6AA 4ECBA 2LRCA 1A2JA 3Q74A 2X8CA 2VL9A 4FYCA 1JZWA 3K8NA 4MJCA 3LSZA 2B6MA 2DMMA 4JBBA 3KTBA 4AF2A 1CQGA 4HZ2A 2LQQA 3HY2A 2QGVA 1GSUA 5DALB 1TKDB 2RLIA 3ZITA 1K3OA 4WBJA 1XCCA 4KH7A 1U87A 2H70A 3KP8A 2F3MA 2WB9A 2C0EA 1E2YA 1F3AA 3CSJA 7GSSA 2H66A 3KD0A 2PVQA 2YP6A 3KH7A 3GFKA 1EGOA 2O87A 4YAVA 4GCIA 3FK8A 1VF2A 2H1GA 2GSQA 1WRYA 2XPEA 2H75A 2J9HA 3DEXA 2OA7A 4TN8A 1FHEA 3UEMA 1F3BA 1T1VA 2HZEB 2OBIA 2IFQA 5IMFA 3BCIA 4PX1A 3W8JA 1OE8A 4DSRA 1X9MB 3RBTA 3F0IA 1SKRB 3IC4A 5D9VA 1SJIA 4JR4A 2V41A 5J9BA 4PUFC 2P31A 1EOGA 3KP9A 1O85A 4GSSA 2E7PA 5DCGA 3E3EA 5H5SA 2VL3A 4TXOB 3RPNA 4IQAA 1KTEA 5G31A 3CYNA 2C3QA 2FWGA 3AY8A 4NAXA 1ON4A 5IPHA 1GTAA 4RI7A 3M9JA 1Z5YE 1J9BA 4OFMA 1DBYA 20GSA 2TRXA 4IW9A 5D9TA 4HJMA 1U88A 2VAFA 1U6TA 2DBCA 1WMJA 1JFUA 5D9WA 2WCIA 2O7KA 4DSSA 1TP9A 5COHA 1GL8A 3LJRA 1E6BA 4ZXGA 3GYKA 1M99A 1GUHA 3BBYA 1YQ1A 5ECNB 1M2AA 1SD8A 3GTUA 2VCTA 3TKRA 2RM6A 1TU8A 4LL4B 5IOXA 2C3NA 1SL1B 1O6JA 2GVPA 6GSUA 5LD0A 1USBA 2CV4A 2DMLA 5H5QA 1F2EA 3TJJA 4EF0A 6GSXA 2O8VB 3KTLA 5B7CA 1SD9A 2GGTA 2OADA 1G6YA 1XVQA 3F4TA 4K7IA 1V58A 1WOUA 4MF6A 1QQ2A 3LG6A 2HLSA 4HJ2A 3F3RA 3W6GA 5G1KA 2ALBA 4ID0A 3HZ4A 3LXTA 4IP1A 2LJRA 4DEJA 3TCOA 1O7UA 4PXOA 2FWFA 1YKCA 4EVMA 2A4VA 4YQUA 3L9SA 4NWYA 5KN3A 3GH9A 2VD0A 1TK8B 1HYUA 3ZIVA 2KP1A 5C04A 5LCZA 2JSZA 1M2BA 1PX6A 2PPTA 3HA9A 3D6IA 3FHKA 3H93A 5J3RA 3ERWA 10GSA 1BG5A 4ZB6A 2IFQB 4TVEA 3GIXA 1THXA 4V1Ap 3HVVA 1ML6A 3S9FA 3M1GA 2CAQA 3DD3A 2QKEA 2YOIA 4ZL8A 1JLWA 5DQYA 2GLRA 4K7OA 2I1UA 4PGTA 3J7Yb 1X0RA 2H72A 4NPBA 2HXKA 2FUG2 3F3QA 1V98A 2AHEA 3TOUA 2G0FA 1MDJA 1K0MA 3P90A 5HR2A 2CT6A 4AGSA 1TRVA 2HYXA 2GZYA 4JEDA 1PSQA 2GSRA 3GRXA 4BL7A 1K0CA 1XIYA 4OFNA 2E0QA 4TXVA 5IMZA 2AUVA 2B1LA 1YY7A 1XW5A 4OO5A 2DJJA 1J08A 1ZMAA 4HU7A 3D21A 3WGDA 4OFTA 5CREA 5CRWA 5CRHA 1MTCA 2VCZA 1GWCA 4XCSA 5CRGA 2XBIA 5F07A 2NBSA 4MDCA 3WYWA 1W4VA 1K0AA 2HSYA 1GH2A 3ZREA 2HNLA 4Z7XA 2B5EA 2C3TA 4N11A 4WF5A 4POMA 2GQMA 1ZYQB 2YWIA 4EUYA 1S3DA 1GULA 5EL8A 2TIRA 3SWLA 3MDKA 4I8BA 2IL3A 1ILOA 2YWNA 3GTUB 4MP4A 1GP1A 3MWHA 2JL4A 2CAIA 1AAZA 1TI3A 4K7NA 1EGRA 2YNXA 3FR6A 1J0FA 4EXJA 4LMVA 4E8HA 2X8HA 2ZNMA 4D73B 2C8UA 1NHYA 4RUVA 1M7TA 4GWRA 1PL2A 1PRXA 17GSA 4KDYA 4TW5A 1PKWA 1EEJA 1AIUA 1SK0A 2R3XA 4MF5A 1FAAA 2JZRA 2YWOA 5DCHA 4QQ7A 4J57E 2DJ2A 4MZCA 4ECIA 3GKKA 1EV4A 2ON7A 2REMA 4MH2A 1PN9A 1AQXA 2L6DA 1O73A 3GX0A 3HHVA 3I69A 2C0GA 2L4QA 1R7HA 5KN1A 4POKA 1IYHA 2WGRA 1Z6MA 2X8GA 4ZILA 5D96A 2XHFA 1EV9A 1TK5B 4WETA 1Z7RA 2MBTA 3LXZA 4I97A 1ZGNA 2MBSA 4G9HA 3Q19A 5D73A 1B8XA 2HSHA 1PX7A 5H5RA 4HU9A 4RQRA 3C1RA 1GUKA 3BJ5A 4PNFA 3HVXA 4EKZA 2VCXA 2VIMA 5G30A 1A8YA 2TRCP 1GNEA 2Z9SA 4O7HA 2I81A 4N30A 5F06A 1YEPA 3TKSC 1QMVA 2OKAA 3GHAA 5ECKB 1TOFA 3KMOA 4ZL7A 3FEUA 4L5LA 2H0IA 2OACA 2H71A 2WS2A 1TTZA 2E2MA 4IBPA 4EL1A 4MZWA 2G2QA 3F8UA 2F8AA 3V1WA 1R5PA 3P2AA 4LA1A 4O32A 4MF7A 2H1DA 5KEJA 3DMLA 1Z3EA 2YPMA 5B6NA 3VLNA 4PQIA 22GSA 2CX4A 4ISDA 2V6OA 2MMOA 4Q5NA 5C00A 2LJAA 2RM5A 3VURA 1GNWA 2FLSA 2FA4A 2PBJA 5ECPB 2CX3A 2XC2A 1W89A 16GSA 4HOJA 5CP1A 5DDLA 2H74A 4JR6A 4L0UA 3RHCA 5KN0A 1T3BA 1R26A 3GUSA 2V2GA 3WT1A 5ECMB 2KP2A 1HNCA 3UIWA 2B1KA 4F0BA 1G7OA 4ILFA 3HZ8A 2FHEA 2CVBA 2YZHA 4TKYA 5IPGA 4KUNA 1K0NA 5AN1A 2L4CA 2R4VA 3APQA 4K2DA 1AW9A 2PGTA 1SKWB 1LU4A 3E9JB 5AGYA 2HT9A 2LS5A 2B5XA 2HZFA 5J4UA 3E0UA 4EC0A 3ZYWA 2DJ1A 2DC5A 3ZRDA 2C0FA 5JCUA 4QL9A 4EDYA 3O3TA 3FZ5A 11GSA 4ZBBA 2ON5A 2VOCA 2WDUA 4V2LA 2N5BA 1TJDA 5GAPD 4I5QA 5J41A 3KXOA 3DRNA 4E8EA 3TGZA 1B48A 4V2MA 2N5FA 2HE3A 4EE0A 1XWBA 1SKSB 2XPDA 5F8BA 4KDUA 3UJ1A 5ECQB 2OE1A 4LLRA 5DBQA 4GTUA 2RIIA 3GA4A 2YWMA 4GXZA 3DXBA 4CHSA 1HNBA 3TJFA 1RW1A 2EIRA 6GSYA 1V2AA 2N5AA 3PR8A 3GKMA 4XTSA 3EVIA 1V9WA 1TRWA 1T8EB 1A24A 1VF3A 2C80A 2MMAA 1Z9HA 1YZXA 2GT5A 3IR4A 4TR1A 1G6WA 4IVFA 1GTUA 3D22A 4GSNA 3IPZA 4MCUA 5ID2A 3VPQA 2LRTA 3HKRA 5IMVA 3IRAA 2VLUA 1B9XC 4KDXA 2AYTA 5JCGA 3GX8A 2M80A 2CZ3A 2FNOA 5ECHB 4BPYA 4YQVA 3IAM2 5B8AA 2KLXA 4O5RA 1A2LA 2PU9C 3D5JA 3MAKA 1RK4A 2LNTA 3RDWA 4KGIA 1JZRA 5JWRB 1EP7A 1K0BA 2HRFA 2HFDA 5D9XA 2LSTA 4HEA2 4EDZA 4DSQA 1A0RP 1F37A 2PVOC 2DIZA 1AC1A 4N0VA 4JRRA 4WR5A 2A2SA 2E2GA 3P8WA 4IN0A 19GSA 1MDIA 2PERA 2MMZA 3D4MA 2DJ3A 3U6VA 3GKXA 1GLQA 2FCHA 3P7XA 2LUSA 2C1YA 3IAS2 5G2ZA 2VO4A 3L78A 3L0HA 1UC7A 2ES7A 2O89A 4YAPA 5IMAA 2GTUA 3ME8A 5EY6A 4I2UA 1ZZYA 4O92A 3IV4A 1I9DA 4K0NA 9GSSA 4MPFA 4MK3A 4ZB9A 2F9SA 3QPMA 5A4WA 3CRUA 3TOTA 1XOAA 1B4QA 4MA9A 3EC3A 1FG4A 3NOFA 3KZQA 1WWJA 4IJIA 2X99A 1GSEA 1S3AA 2L6CA 4I6XA 4F2IA 3ZLPA 3VWVA 3GH6A 4FH8A 2QC7A 4OD7A 3GKNA 2V32A 4OWYA 2CQ9A 4TOPA 2H19A 5A4VA 4OCFA 1A8LA 2J23A 3F4SA 4PQ1A 1QXHA 2B5YA 2IIYA 4AJ8A 3M0FA 4KSMA 2YN1A 4TRXA 3PGTA 5CO3A 3KCMA 3NZNA 4JU5A 2GSSA 1T00A 3CMIA 6GSWA 5G5FA 4TR1B 4WEYA 1MD4A 1G7EA 2PMTA 5D93A 1SJ6A 5B8BA 2XBQA 1X5EA 3M9KA 4KNDA 1K3LA 5ELAA 3IBHA 2AJQB 2YZUA 1QK8A 2K9FA 3GNJA 2YV7A 1TDIA 1BAYA 5IMDA 3KMNA 5HQPA 8GSSA 1G0TA 1HNAA 1Z7PA 4IQ1A 4ML6A 4H86A 4MH3A 1FW1A 1Q98A 1OC3A 1OVNA 4FO5A 3JCML 2VM1A 2X64A 3M3MA 1VGLA 3O76A 3A2VA 4DSSB 4KW6A 1XW9A 3VI5A 1AXDA 5E4WA 3L4NA 1GSFA 1BX9A 2PN8A 1AUCA 2L5OA 4TR4A 4FYUA 1PD21 12GSA 4PQHA 1S3CA 4HUAA 5EPFA 3TJBA 1V40A 2HRNA 3IE3A 3IDVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite