5JCGA

Structure of human peroxiredoxin 3 as three stacked rings
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
195
structure length
195
Chain Sequence
TAPAVTQHAPYFKGTAVVNGEFKDLSLDDFKGKYLVLFFYPLDFTFVCPTEIVAFSDKANEFHDVNCEVVAVSVDSHFSHLAWINTPRKNGGLGHMNIALLSDLTKQISRDYGVLLEGSGLALRGLFIIDPNGVIKHLSVNDLPVGRSVEETLRLVKAFQYVETHGEVCPANWTPDSPTIKPSPAASKEYFQKVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin-dependent peroxide reductase, mitochondrial
publication title Structures of Human Peroxiredoxin 3 Suggest Self-Chaperoning Assembly that Maintains Catalytic State.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 59
structure length 195
sequence length 195
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2016-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 5jcgA00
1WIKA 5GSTA 4F82A 3P7XA 5G5FA 1T1VA 2HLSA 5HR0A 1O8XA 3AY8A 1WMJA 2K9FA 2VD0A 4MJCA 3KIJA 2CZ2A 3FZ9A 1TRWA 5FWGA 2JZTA 2PN8A 4TR3A 3KP8A 5F05A 1NHOA 2MMAA 1VF2A 2YWIA 3QR6A 5CREA 2HZFA 3HJMA 2OACA 3IAS2 4NV2A 1ERVA 1W4VA 4LMVA 4GRFA 2ZNMA 2KHPA 2REMA 4GQFA 3WGXA 2NVLA 4JEDA 4ZL7A 3QFAC 1XBSA 3F8UA 2O85A 2F8FA 1ERTA 5JCGA 5B6MA 1EV4A 4YQUA 4OCFA 3KP9A 4TOPA 5IMFA 3MWHA 3FK8A 4TXVA 5CYYA 2H6YA 3NIVA 2LRNA 1HNBA 5DALA 3ZLPA 3RDWA 5HFKA 4Q5QA 3KH9A 3ERGA 3Q6OA 2LV3A 2E2GA 17GSA 2DBCA 3UMAA 2KOKA 4NV5A 2LNSA 3IAM2 4MDCA 4NHWA 2FWGA 2C0GA 2QKEA 2JZRA 2NTOA 3J7Yk 2CV4A 2E7PA 1Z6MA 3RBTA 1Y6EA 1XW6A 2VCZA 2P5QA 1GTBA 1TI1A 2VCTA 4ID0A 2JSYA 2L5OA 4KSOA 1QMVA 3UIWA 2R2JA 1ZCPA 4ZIJA 1Z7RA 2WCIA 3M9JA 13GSA 2HZEA 2HFDA 1YEXA 3TKSC 1SU9A 4I6XA 4KW6A 2VCWA 3DVXA 2VLTA 3ZREA 2HYXA 4POMA 2HE3A 4WR4A 4DEJA 3M9KA 3H1NA 4MJAA 3ZL5A 1NSWA 5A4VA 2H1GA 3A3TA 1AIUA 2PUKC 1KBNA 8GSSA 2PU9C 3TUEA 1GSFA 2M80A 2YWMA 3DGQA 4Z7XA 1PN9A 4EDYA 3TKRA 2VLVA 2GS3A 3IC4A 2V6KA 5IOWA 1RW1A 3WYWA 3FZ5A 5CRHA 5ECRB 4K7OA 4V1Ag 2YWNA 3BD2A 2C80A 2CAIA 2IJYA 3UL3A 5DCGA 4WEYA 1AW9A 3C1SA 1GSSA 1TJDA 2PPTA 1G0TA 1TDIA 4BPYA 4KE3A 1SJIA 5ECKB 12GSA 4P3YB 3HZ8A 3KM6A 2VAFA 4HJMA 4ILFA 2PGTA 4GF0A 5ELGA 1H75A 4Q5FA 4NPBA 2FY6A 2KLXA 1GULA 4N10A 3GHAA 2IIYA 2AAWA 4E8EA 3IHQA 1XVQA 4KA0A 4KAEA 2WJUA 1MD4A 4KCAA 1EGOA 1O73A 3MDKA 2YPMA 4K7IA 2C3NA 1SJ6A 1BYEA 1FB6A 2YZUA 1WRYA 3LSZA 2XC2A 5DDLA 4RI6A 1U6TA 1K0MA 4DSRA 5A5KA 2AB6A 2BMXA 5DJLA 2WS2A 2J9HA 3UOMA 5ID2B 2PWJA 5J3RA 2H0IA 2TIRA 4D73A 2GQKA 2L5LA 2OKAA 3HYPA 2VD1A 1QQ2A 2VM1A 3F4TA 5B8BA 3WD6A 1YEPA 1UC7A 2LQOA 4V2MA 2HRNA 3ZFLA 3I43A 1BQ7A 1C72A 1N8JA 20GSA 2GZZA 1K0DA 1WWJA 2VL2A 2CAQA 4HS1A 3TJFA 2BJXA 2RM6A 3IDVA 1FO5A 3ERFA 1GP1A 5ECNB 1G6YA 4ZBAA 2FCHA 1GSQA 1EP7A 1VF1A 4NHZA 5ECPB 4F2IA 4EXJA 3CXGA 3P90A 1BJXA 1SD9A 4WXTA 1OKTA 1Q98A 2Z9SA 2VL9A 2JADA 1MD3A 2IFQA 2GSSA 1XIYA 1T3BA 2PVQA 4YAVA 3TJGA 1B4PA 5GAPD 4TRXA 1A2JA 5IMZA 5IOXA 1YKAA 1FW1A 1MDKA 5IMDA 4F0BA 3DEXA 3CSJA 1EOHA 4TXOB 5H5SA 5E4WA 4ISDA 2C4JA 3D5JA 3LG6A 4DSSB 4K1FA 3M3MA 4XIHA 2ES7A 3Q19A 5ELAA 5ECMB 3TOUA 5L71A 4N0ZA 2ZCTA 3FW2A 4OFNA 3GTUB 3LQ7A 3J7Yb 3D4MA 4GSNA 2KP1A 5G5EA 4F9ZA 4XTSA 3RPNA 2YCDA 2GT6A 4K9ZA 5GSSA 2WB9A 1RQMA 2H8LA 5DVBA 1HNCA 3TCOA 1TI3A 1GTAA 1BG5A 5D93A 2VUPA 1XWCA 1VRSD 2DSAA 5DQYA 4MF6A 2LJKA 5ECQB 5ECSA 5EL8A 2CA8A 1H4OA 5D9TA 4PQIA 1SK1A 3IA1A 1GSYA 1X5DA 1YF1A 3IK9A 3VPQA 5INYA 2F9SA 4CDOA 4WBRD 5C00A 3CSIA 2A2SA 1GNEA 2XBIA 1WP0A 3W8JA 1THXA 4WBJA 5J9CA 2DJ1A 3F6FA 2FA4A 3C71A 4GQCA 5ECHB 2HT9A 1SKSB 3APQA 1JZWA 3QOUA 4FYCA 4X1UA 2WDUA 3OR5A 1X0RA 4PNGA 3EU3A 1V2AA 3N9JA 1DUGA 3O3TA 1Z5YE 3FRCA 2QSIA 4TW5A 2YANA 4PQHA 3GX8A 1K0NA 4AGSA 1XWAA 2C0FA 2FWFA 3DRNA 3EVIA 1ILOA 3ZFBA 22GSA 1XW9A 3L4NA 2FGXA 1FB0A 1XOAA 5KN3A 3DXBA 4MJEA 4TN8A 3US3A 2G2QA 3HJOA 5IIZA 3TJBA 4FH8A 5D9VA 4YQVA 2P31A 1R5AA 5JWRB 3ED3A 1ST9A 4BA7A 4GXZA 4K6XA 4ACSA 2B3SA 1GLPA 1GSEA 3GL5A 1E2YA 2R4VA 6GSSA 2F8AA 1TOFA 1QXHA 4I2TA 1CQHA 1XWBA 1X5EA 1RK4A 1THOA 3GSSA 2VL3A 3APOA 1EWXA 3G9BA 2GTUA 1N2AA 5FHIA 3SBCA 3HVSA 1Y25A 1AQVA 1AQXA 3M0FA 1X5CA 1V40A 1GRXA 3S9FA 2DJ0A 2E2MA 1A8YA 3APSA 1BX9A 3L9UA 3KTBA 5DCHA 4WKWA 4OCEA 4KDUA 4MK3A 2N5AA 2H01A 4ECCA 1NHYA 4IGJA 3FY7A 1UN2A 3ZVJD 2OE3A 2HRFA 5CP1A 4ZBDA 3LYPA 1EEMA 3WT1A 4OO4A 1EV9A 1TK8B 4DVCA 1M9AA 4K0GA 4WF5A 3FEUA 1XCCA 3TDGA 3TKQA 4ECIA 3CBUA 1OC8A 5G31A 1T8EB 1GNWA 3KTLA 4JRRA 3M1GA 6GSWA 18GSA 1AAZA 2V41A 3D0ZA 1GLQA 2H30A 4HJ2A 2CQ9A 2M46A 3KXOA 5HQPA 3PGTA 2DJ3A 3LWAA 4PUFC 2MZCA 2RM5A 1B9YC 3ZYWA 1R26A 2L59A 3R2QA 1F3BA 2X8GA 4MA9A 3LFLA 5CNWA 3L78A 1ERWA 4EKZA 4Q5RA 3CRUA 2DJKA 3NZNA 4ULXA 1O6JA 4L5OA 4POBA 1Z3EA 1G7OA 4O92A 2AUVA 1YQ1A 1MDJA 1WOUA 4TVEA 4HOJA 5DJMA 4IW9A 3E0UA 1A24A 1B48A 4MZWA 1YJ6A 2X8CA 5J4UA 1U3AA 2YP6A 2YOIA 4IJIA 5ECIB 5F8BA 4V1Ap 3GN3A 3ERWA 2YWOA 5AISA 1K0BA 2LRTA 1ON4A 16GSA 2J23A 4MLYA 1OC3A 2N5BA 4BWSA 2EIRA 1F9MA 2IMIA 4FYBA 2LKUA 2H71A 4I8BA 5EY6A 1FOVA 2XPDA 6GSTA 1SENA 4FIWA 5ENUA 3DMLA 4LLRA 1TK5B 2B7JA 2YJHA 3HDCA 4KB3A 1XZOA 1OE7A 3WT2A 5F06A 11GSA 3ZVJA 2GQMA 3MNGA 2H66A 3KH7A 4J57E 5ID2A 1XWKA 4K7NA 2A4VA 2DMLA 4IVFA 3C1RA 3G7IA 3TRQA 1SD8A 2GSRA 3UEMA 1IYIA 2K8SA 2FA8A 3FZ4A 1USBA 2R37A 3GV1A 3VWVA 4LA1A 2I4AA 3DD3A 2DJJA 4L0WA 2X99A 3UJ1A 1MEKA 1HD2A 3C73A 4E8HA 1SYXA 1TP9A 3F4RA 4POKA 4RQRA 1YF0A 3CTFA 3PR8A 5D9WA 5DBQA 2MMOA 1B9XC 2K8VA 5CAXA 3UAPA 1FVJA 2NPBA 3F63A 1V9WA 2VL2C 4G9HA 1XOBA 5EPFA 3O6TA 1PRXA 3DYRA 3L9VA 1TKDB 1AQWA 3DIEA 4KCEA 2GQLA 1QK8A 3M8NA 3FR3A 1U87A 2JZSA 3QMXA 5J41A 2HXKA 4AJ7A 3RHCA 3I6AA 1XW5A 3H4KA 1ML6A 1W89A 3C8EA 1SK0A 2YZHA 4G2EA 3ZZXA 4Q5NA 2WFCA 2DIYA 3ZMLA 3VPTA 4DSQA 5AIVA 1PX7A 1J0FA 1V57A 2CVDA 3BJ5A 2O89A 2EC4A 1GL8A 3V1WA 1O8WA 3KD0A 3VK9A 3H93A 1K0CA 3EU4A 1V58A 4J2FA 4TXOA 3QFBC 3CMIA 5IMAA 4JR4A 5IM9A 4DSSA 2FD3A 4AF2A 2OE1A 4ECJA 3RHBA 4MJBA 2B6MA 3GTUA 1M9BA 4N11A 1TK0B 1EOGA 1SK2A 4PNFA 1E6BA 3PINA 1ZYQB 3EMPA 1M2AA 1TRVA 4YAPA 4XCSA 2OE0A 1EEJA 4ZL9A 4RI7A 4IBPA 4EO3A 4RQXA 3WGDA 4WF4A 4IN0A 1K3LA 2E0QA 3LXTA 3HXSA 3D21A 3GIXA 14GSA 1R4WA 3KMNA 1SJZA 2VCVA 2VM2A 2GSTA 4O5RA 3F3RA 5B8AA 5LD0A 6GSUA 4MH3A 4IP1A 3EINA 3HY2A 3QAWA 2LS5A 1GUMA 4BWQA 4AJ8A 1JZRA 3GFKA 2DC5A 1QUWA 3KCMA 3ME7A 3LGCA 1M7TA 5CO3A 6GSXA 1OKDA 1I5GA 4PQ1A 2C0DA 3HVVA 3MSZA 3JCML 1XWGA 3IE3A 3BOAA 4FYUA 3ZIVA 4XHMA 4ZXGA 2NDOA 1YDKA 3CRTA 2KP2A 4PGTA 1XFLA 3VLNA 9GSSA 1A8LA 3LJRA 5G1LA 3VWUA 4O7HA 4X43A 1T4ZA 3IV4A 2WZ9A 4L8EA 2PBJA 1PA3A 3VWXA 2CX3A 2LRCA 4PUAA 4O32A 2FLSA 3F9UA 4KUNA 5GAND 2GDRA 4MMMA 3IXRA 3DVWA 1QGVA 4KDXA 4NWYA 2OBIA 5IMCA 3HCZA 1VF4A 2HNLA 5F0GA 1X9WB 3I69A 3F6DA 2VCXA 5FT3A 1ABAA 1FG4A 2FWEA 4HDEA 1K3YA 5LNKe 1JLVA 1IYHA 2YV9A 5KN1A 2C3TA 4QQ7A 4LL4B 4HZ2A 1CQGA 2TRCP 5G2ZA 1LU4A 3F0IA 1UVZA 3UBKA 1PKZA 1A0RP 3TRXA 5G1KA 1PMTA 4EL1A 1ZMAA 2CX4A 2R3XA 4KDYA 4LL1B 4RUVA 1TU7A 2LTKA 1T00A 3KEBA 1VF3A 3GL3A 3EWLA 3DKSA 2I81A 3CTGA 4XRAA 3U6VA 2LUSA 4ML6A 3RAZA 4HU9A 1B8XA 1TTZA 2IMKA 3D4TA 1O85A 4BVXA 4CHSA 2H74A 3TJKA 4KH7A 2IWTA 2CVBA 5GZZB 3GRXA 3VFIA 5D73A 3EC3A 3P8WA 5HR2A 2H6XA 4OD7A 1PQNA 2OBKA 1FHEA 2B5EA 4OMVA 3Q18A 2C0EA 1HYUA 4PX1A 4QL7A 4MABA 1JLWA 5HFIA 2GVPA 4EVMA 2V2GA 1T7PB 2X8HA 5B7CA 2K18A 3GA4A 1Z9HA 1S3CA 3Q74A 3TKSE 2P5RA 5JWQB 2RUEA 2A2RA 3VWWA 4JR6A 4AJ6A 4LMWA 2EIOA 2OADA 3U5RE 3WGEA 4IQAA 1M2BA 1OC9A 1TRUA 2IL3A 1KNGA 19GSA 1NM3A 4HU7A 2DJ2A 1A0FA 2JSZA 3ZMKA 1TRSA 2V1MA 5DAKB 3GKXA 2H1DA 2EIQA 5JCUA 5IO0A 1PSQA 3D6IA 2C1YA 5LCZA 3K8NA 3UBLA 4OFMA 4EF0A 3EYTA 2VCQA 7GSSA 3E3EA 1JZOA 3VI7A 1M0UA 4TR1B 3TGZA 4KX4A 2IMFA 2LEGA 2XHFA 1A2LA 3H79A 3ZITA 3RPPA 2G0FA 2QC7A 3HKRA 4GSTA 1F6MC 2H19A 3GURA 3QD9A 1AC1A 2XBQA 4J56E 5IMVA 2JU5A 2V32A 2GT5A 4V2NA 1UA5A 3W6GA 2OA7A 1OYJA 5ECOB 1OC9B 1SKRB 4TKYA 2AV4A 1J08A 1WE0A 2B1KA 3HVXA 2O8VB 5KN2A 4I97A 3FYGA 4YH2A 4K2DA 1SL1B 3IPZA 3UARA 3A5WA 3GMFA 3QAGA 3KJYA 4OWYA 5C04A 3QAVA 1T4YA 2HSHA 1KTEA 2L6DA 4IP6A 1TW9A 4TR4A 3L9SA 2IN3A 5EVOA 5IPHA 5CRGA 2IMDA 3UVTA 1BAYA 1GTUA 4QL9A 5KN0A 3NOFA 4NXIA 1PKWA 2MMZA 2I9HA 3GKKA 4EC0A 2TRXA 1JZDA 1V98A 4IS0A 3DWVA 5DALB 5HR1A 1TU8A 2L4CA 1GUKA 1JFUA 1YY7A 3D22A 1AUCA 5AGYA 4MZBA 3L0HA 2B5YA 4XRDA 2XPEA 3IRAA 5J5NA 1XPVA 1DSBA 2VOCA 3GKMA 4HQSA 4L5LA 2NBSA 1Z6NA 2C3QA 4EUYA 2GLRA 2H1BA 2CVKA 2H70A 1B4QA 4ZB8A 2D2ZA 2I3YA 4PURA 3A2WA 6GSVA 5H5QA 1Z7PA 3TJJA 4GLTA 2WGRA 3TKSA 3O76A 3ZRDA 1G7EA 3FKFA 1YZXA 1R7HA 4IELA 3FR9A 2B7KA 3G7JA 3GSTA 1ZYEA 2VLUA 2CZ3A 5CRWA 4ZBBA 4BVYA 5D96A 2O87A 3KMOA 2HZEB 4V2LA 3KGKA 2MBSA 2GGTA 1ERUA 5ECLB 4F03A 2HI7A 2WULA 1QFNA 3KZQA 1GSDA 1M99A 3IK7A 5HFGA 3HZ4A 4IHUA 4WETA 3FHKA 2L57A 3H8QA 2I1UA 3C7MA 2H1AA 3UVHA 1U88A 1BEDA 2GZPA 2DIZA 3GX0A 1DE1A 4EDZA 1LBKA 3E9JB 4IJ3A 3FR6A 1MTCA 3N5OA 1GH2A 3IOSA 2CT6A 1TXXA 6GSYA 4OFTA 3IR4A 3EURA 1OE8A 2JACA 4ML1A 1KEBA 3EE2A 1YKCA 2FUG2 3ISOA 4KSMA 1EGRA 4GTUA 3CYNA 2ALBA 4IKHA 4YQMA 5IQYA 4NMUA 3PH9A 2LJAA 2AHEA 1ACVA 4MPFA 1OAZA 4H86A 4JBBA 4MPGA 3GH9A 5CRDA 3SWLA 2R6KA 5A4UA 5J9BA 2LQQA 1XXUA 4L0UA 2K6VA 4KGIA 1DE2A 3GH6A 3HHVA 4ZL8A 2R5GA 5KEJA 2VO4A 4HQZA 1U3IA 2F3MA 1EZKA 2M72A 1X9SB 1LJRA 2MMNA 3A2XA 5DQSA 3LXZA 5G30A 4ZB9A 3F4SA 5JCWA 2X64A 2H0GA 1EP8A 2BTOT 1Q4JA 3LEFA 4HEA2 1JHBA 4KNDA 2H72A 3MAKA 3QPMA 2YV7A 3TRPA 5JWOB 1S3AA 1VGLA 4MP4A 2YJ7A 4K8MA 2C8UA 5IO2A 2ON7A 5E59A 2B1LA 3GKNA 1GTIA 4GCIA 2DMMA 1R5PA 2FHEA 10GSA 2RUFA 1AXDA 1GWCA 1ZOFA 2LNTA 4IQ1A 1URMA 5H5RA 2H73A 1GSUA 4I2UA 2LJRA 3GUSA 2QGVA 4D73B 4MF5A 4JZQA 3QDNA 1PGTA 2HSYA 4MH2A 3P2AA 2H76A 2KUCA 5A4WA 4FO5A 4F0CA 3W8SA 3FZAA 1FVKA 3BBYA 5AN1A 2H6ZA 3TOTA 2H0HA 4CW9A 4MCUA 2JL4A 1SKWB 2N5FA 4ECBA 4ZB6A 4HI7A 4GSSA 2MBTA 5B6NA 2WRTA 4N30A 1WPIA 2VIMA 3TB2A 4ZILA 2L6CA 1DBYA 3BCKA 1WJKA 1PL2A 2P0GA 1J9BA 1M2DA 4I5QA 4XS4A 2PMTA 3GYKA 1O81A 3ME8A 1ZGNA 1K3OA 1SYRA 4X0XA 4HUAA 1HQOA 2GSQA 3HA9A 4MZCA 5AIXA 5D8IA 5HR3A 2F51A 4OO5A 1ZZYA 2LSTA 2DLXA 3F3QA 5F07A 4K0NA 5COHA 3VI5A 2IFQB 2O7KA 3HD5A 2V6OA 2ZUPA 2RLIA 3A2VA 1ZL9A 1K0AA 2YN1A 4XS6A 1A2MA 4XS1A 2FWHA 2PVOC 3ZTLA 4N0VA 5DAKA 3VURA 1NW2A 2L4QA 1K0OA 1I9DA 1G6WA 2B5XA 4MF7A 2OJLA 4G19A 4POLA 2ON5A 5IPGA 1F37A 5D9XA 3LORA 3G7YA 1PD21 3ZIJA 2IPAA 4HZ4A 1MDIA 3LYKA 3CSHA 1SL2B 2AJQB 3I9V2 1S3DA 2GZYA 1FAAA 1X9MB 4JE1A 2AYTA 1OVNA 4JU5A 4TR1A 2PERA 3IBHA 1HNAA 1O7UA 2YNXA 4XS4B 1PX6A 3QCPA 4EE0A 1GUHA 1XVWA 3GNJA 2MYGA 1PL1A 1A23A 1F3AA 4G10A 4NAXA 4WR5A 4PXOA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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