2RUEA

Solution structure of the a' domain of thermophilic fungal protein disulfide (oxidized form, 303k)
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
GPLGSEGPVTVVVAKNYNEIVLDDTKDVLIEFYAPWCGHCKALAPKYEELGALYAKSEFKDRVVIAKVDATANDVPDEIQGFPTIKLYPAGAKGQPVTYSGSRTVEDLIKFIAENGKYKAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox-coupled structural changes of the catalytic a' domain of protein disulfide isomerase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
molecule tags Isomerase
source organism Humicola insolens
total genus 25
structure length 121
sequence length 121
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2014-03-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2rueA00
4TN8A 3L0HA 1OYJA 1GTUA 1A24A 4EL1A 2H66A 2O89A 2VO4A 2YP6A 3LQ7A 1XFLA 3C1SA 2LNTA 1ERUA 3GN3A 2DJ3A 5G31A 5J9BA 1A2LA 2N5FA 5KEJA 1FOVA 4MPGA 1K0CA 5ECSA 1F9MA 1MTCA 2YOIA 1S3AA 3Q6OA 4TXVA 2FD3A 2PN8A 5DVBA 2DJ1A 5DQSA 1JHBA 4TRXA 2P5QA 5ECOB 2PGTA 5D8IA 5JWOB 4ECCA 2H72A 3ZIJA 2MZCA 1JLWA 2LJKA 3TKSC 3P7XA 4PUAA 3H1NA 3IHQA 3KH7A 2H75A 4WXTA 3GA4A 3ZITA 5AGYA 1N8JA 3C73A 2GGTA 3KZQA 4KUNA 4IJ3A 4JU5A 5D73A 2GQKA 4OCFA 3ERWA 3Q19A 2OADA 3FZ9A 2YWNA 2H71A 4K8MA 3P8WA 1PX6A 3APSA 4PNGA 2X8CA 1AIUA 5IM9A 3QFAC 2F9SA 3M0FA 2PPTA 1F3BA 2VLTA 2IN3A 5FT3A 3D22A 2MBTA 2VM1A 1G7EA 3F3QA 5GZZB 3VPQA 3C71A 2I4AA 2XBQA 3LFLA 2GQLA 4N10A 4ZB8A 3KCMA 1Z3EA 3M9JA 5FWGA 3ZFLA 3ZMLA 3EWLA 1GTAA 3ERFA 3ZLPA 5J4UA 3DRNA 5FHIA 1GUMA 4CW9A 4LLRA 1VRSD 1O85A 1GRXA 1BJXA 2GVPA 1ON4A 4XRDA 5INYA 1B4QA 6GSVA 2PERA 3QAWA 1DSBA 3VURA 4HDEA 5EVOA 2RUFA 2JSYA 2QSIA 1U3AA 2R5GA 2X8GA 4TR3A 3FRCA 5F06A 2C3TA 2DSAA 4GQCA 4KSMA 1AXDA 3VWXA 4LMWA 22GSA 1SJZA 3F4RA 5IMFA 5ECMB 3FW2A 3IR4A 5ECPB 1Z6MA 1X0RA 1GUKA 4LA1A 5IMDA 3D4TA 2IIYA 11GSA 2FWFA 2CV4A 3TKQA 2MMZA 1SKSB 5ECRB 3TCOA 3US3A 4PURA 2RUEA 4G9HA 5CAXA 1ZCPA 4JBBA 5HR0A 4MF5A 2AAWA 4ECBA 4ZBDA 1WJKA 2E2MA 3MDKA 2QGVA 3DKSA 3EMPA 1J0FA 4PQHA 1Z7RA 4ECJA 2GLRA 3UAPA 5DALA 1XPVA 3F8UA 2CX4A 3TJKA 3MNGA 1UC7A 8GSSA 1XZOA 3BCIA 4TR4A 2C8UA 1QGVA 4FYUA 3F6DA 2B3SA 1K0DA 2B6MA 4QQ7A 2IFQB 1U88A 2KP1A 3UJ1A 1GSFA 1AAZA 5G5FA 3ZMKA 2VL2C 3R2QA 2IFQA 2H8LA 4DVCA 2L59A 3GFKA 2LRTA 3GKKA 4IELA 4L0WA 2GT6A 16GSA 2HXKA 4NV5A 1BAYA 5B6NA 2WB9A 5ELGA 3W6GA 4E8EA 1HNCA 2C80A 3BCKA 4N0VA 1TW9A 4KX4A 3M9KA 1NHYA 4PNFA 2FHEA 5KN2A 4WF4A 4GCIA 4I5QA 4PQIA 3EVIA 2VCZA 2KUCA 4HU9A 5IQYA 2C1YA 4EF0A 2CT6A 4MZWA 4MPFA 2KHPA 3CTGA 2OE1A 3FZ4A 1X5EA 4ACSA 3GRXA 3BOAA 3CSIA 5ECLB 1WWJA 3F6FA 3S9FA 4IP6A 4TR1A 3LGCA 4HJ2A 2FUG2 3ED3A 3ERGA 3F63A 4ECIA 2DJJA 3V1WA 3VK9A 1DBYA 3G7IA 5EL8A 4JRRA 1M99A 3C1RA 1YKAA 2JZRA 4EE0A 3DGQA 4N30A 2H6ZA 3FZ5A 2ON7A 3TJBA 3KXOA 1YKCA 1H4OA 3DIEA 2I3YA 3A2VA 3UIWA 3TDGA 1K3LA 4JEDA 2JU5A 1B9YC 1TI3A 2I1UA 1WOUA 2O87A 1THXA 3UBLA 3H79A 4TW5A 5J9CA 2TRCP 1K0BA 2C3QA 1AQWA 1T00A 2CVKA 1X9WB 2I9HA 2KOKA 4OFMA 2FWHA 3IC4A 2D2ZA 2PVQA 1U6TA 1WPIA 2LV3A 6GSWA 2AB6A 4MF7A 1ABAA 5ECNB 1AQVA 1JZRA 1OE7A 2NTOA 2C0EA 4POMA 2LJAA 1R5AA 3G9BA 3N5OA 1PKWA 2FY6A 2OE0A 5G30A 1CQHA 4N0ZA 1OKDA 1E6BA 4BA7A 2PMTA 2F51A 2CAIA 3WGEA 4GSSA 3HD5A 4MLYA 4TVEA 2V41A 4GTUA 4AF2A 5DJMA 5ELAA 4MJEA 2MYGA 1J9BA 2GSQA 4ULXA 1QXHA 3H8QA 3ZREA 2XHFA 3TGZA 4KDYA 1TRUA 4EDZA 5B7CA 2VCQA 1TXXA 2V32A 4IQ1A 2YANA 3LEFA 1GSQA 5DJLA 3LYPA 3GSSA 4KCAA 3GKXA 7GSSA 1S3DA 2OE3A 2L6DA 1OVNA 1TRVA 1JFUA 2L5LA 1XIYA 3HVSA 2B5XA 3M8NA 1SKWB 2YV9A 4ZIJA 5IMVA 4PXOA 2VM2A 4MMMA 5JCUA 4HJMA 1TU8A 1K0OA 2VD1A 4O5RA 5HR1A 2AJQB 1PN9A 2GZZA 2HLSA 2GTUA 2WS2A 1YY7A 1PX7A 5G1LA 4ML6A 3GURA 3FKFA 4F0BA 1BEDA 4ID0A 2LS5A 1X5DA 1V2AA 1HNBA 5DBQA 5IMZA 2H1AA 2ALBA 4OCEA 1ILOA 4ZL7A 1Z5YE 1USBA 2YWMA 4PUFC 5KN3A 4BVXA 1GULA 4Q5NA 4O32A 1V57A 5CRGA 3WYWA 3IAM2 5D96A 2WCIA 5DCHA 3C7MA 4YAPA 5IOWA 3F9UA 1I5GA 1PQNA 1VGLA 4XS1A 2H1DA 3G7JA 1SL1B 2H73A 5A4UA 5ECQB 4XRAA 1A2JA 1C72A 1PGTA 3GHAA 4J56E 4L5OA 4K7NA 4YH2A 1MDIA 4MA9A 1PMTA 1DE1A 2OBKA 3KMOA 4KDUA 2GSSA 3EC3A 2REMA 1O6JA 1Q98A 2JZSA 1FHEA 1F6MC 3H4KA 3LG6A 2EIQA 3GMFA 5F8BA 3M3MA 4MDCA 3UL3A 5IMAA 2H70A 3IOSA 4LL4B 4AJ7A 2I81A 3EU4A 4K2DA 2V6OA 2VLVA 1LU4A 2LSTA 4MJAA 3TKPA 2WGRA 3GTUB 1H75A 1R5PA 1T1VA 2N5BA 3FR9A 3GV1A 4I6XA 5B6MA 3VPTA 1ACVA 3RPNA 3GTUA 3I43A 1FVJA 1TKDB 5D9TA 2E2GA 5E59A 3I6AA 1GSEA 1K0MA 1FO5A 2PBJA 3IDVA 1I9DA 3F4TA 1JZDA 1J08A 4K1FA 1XW6A 4MF6A 4KW6A 12GSA 1HQOA 3D21A 14GSA 1MDJA 3DVXA 5ID2B 4KDXA 5LD0A 2H0HA 2KLXA 5CYYA 3KTBA 5ID2A 3VFIA 1FW1A 4FYBA 1O81A 3TOUA 3EYTA 1K0AA 2CVDA 2B7JA 2AHEA 3HYPA 3QAVA 3A3TA 3O6TA 3E0UA 1VF2A 2FA8A 3H93A 2K8SA 4MZBA 1SK0A 1EV4A 5H5RA 3HXSA 3CMIA 5ECKB 4ISDA 3TUEA 1N2AA 4PGTA 1ST9A 5IO0A 5CO3A 3D5JA 3UVHA 1TP9A 4KGIA 3I9V2 5DQYA 5C00A 3DEXA 4K6XA 4ML1A 2RIIA 2WDUA 3TKSA 4QL7A 2CQ9A 4NMUA 5EPFA 1SU9A 1PRXA 2C0GA 1BYEA 2DC5A 1EOGA 1UN2A 4XS4B 2CVBA 1SKRB 5G1KA 4NPBA 1ZZYA 5D9WA 2LUSA 3N9JA 4V1Ap 5HFKA 2B5YA 4HZ2A 1Z9HA 4BWQA 1LJRA 4BVYA 2NVLA 5HR2A 3QAGA 2C3NA 3Q74A 1VF3A 4GSTA 1QQ2A 3E9JB 4IKHA 4WBRD 4I2UA 4OFNA 2H6YA 3FEUA 4HS1A 1GSYA 2FGXA 2YJHA 3EINA 3HJOA 1T8EB 4GLTA 5H5QA 2OKAA 1K3OA 2JACA 3FYGA 1HD2A 5IPHA 3D0ZA 1URMA 1OC8A 4JZQA 5JWQB 1SENA 1TK8B 2E0QA 3HKRA 1KBNA 5KN1A 4OFTA 4GXZA 4KB3A 4ZBBA 2NBSA 3CRTA 3FR3A 3ME7A 3RDWA 2HNLA 3F4SA 1ERWA 5GAPD 1EGRA 1TK0B 1M2AA 2DIZA 3F3RA 2VCWA 1OC3A 4OWYA 2K8VA 3RHCA 3BJ5A 10GSA 3CTFA 1WIKA 2CA8A 2C4JA 2J9HA 1GP1A 2GQMA 5LCZA 1Q4JA 3IBHA 2HFDA 3P90A 1RW1A 4GWRA 1BG5A 3IAS2 4IP1A 3TOTA 4ZL9A 3EURA 3DYRA 5ENUA 5D9VA 2RM5A 2VIMA 1FB0A 2XPEA 1GSDA 3ZL5A 1Y25A 1G7OA 3K8NA 3U5RE 2YZUA 1O8XA 4O92A 4F9ZA 1A0FA 2H01A 4PQ1A 1Z7PA 3RPPA 1O73A 3ZRDA 1V40A 4V2MA 3KJYA 2QKEA 2H0IA 3WD6A 2BTOT 3CYNA 19GSA 3KIJA 3ZVJD 2YWIA 1SJ6A 2A2RA 3GKNA 5F05A 1RK4A 1XVWA 1ZOFA 2H6XA 5AISA 4RQRA 3GYKA 1XWAA 4H86A 4F03A 4HEA2 4BL7A 1W89A 5G5EA 1DE2A 4FYCA 2Z9SA 4V1Ag 1B9XC 5A4WA 2RM6A 5J41A 4EUYA 2PU9C 3KP8A 1M2DA 2DIYA 1GWCA 2MBSA 4ZILA 4FIWA 4RQXA 4NAXA 4K0GA 5C04A 1U87A 4TXOB 4OD7A 3TKRA 4HZ4A 4LL1B 2H74A 4X43A 5CRHA 2R3XA 3HZ4A 1B8XA 2MMAA 5IIZA 1M7TA 4I8BA 4TXOA 2BMXA 2MMOA 4K9ZA 5GSSA 2YCDA 2IWTA 4Z7XA 3QPMA 9GSSA 2PWJA 4YQUA 3A2WA 2B1KA 5A4VA 3GX8A 4HI7A 3FR6A 1SJIA 3DWVA 4NV2A 2HI7A 1Z6NA 4F0CA 2JZTA 3QD9A 2LEGA 1B48A 1IYIA 1O8WA 1F3AA 3CSJA 1TRSA 4JR4A 4MK3A 2LTKA 4P3YB 4CDOA 3TB2A 4XHMA 1X9SB 5HFGA 1F37A 5JCWA 1NM3A 4PX1A 2ZUPA 3CSHA 4MABA 1XBSA 1FB6A 1XOAA 3UEMA 3P2AA 2R37A 2VL3A 2AYTA 4EDYA 1NHOA 4L0UA 4EO3A 1EWXA 1XXUA 1EP8A 4IS0A 3NOFA 1BQ7A 1A23A 3Q18A 3UBKA 3QCPA 1G0TA 5IO2A 1JZOA 2WFCA 2L6CA 3SWLA 20GSA 5DAKB 4F2IA 2IL3A 4DEJA 4K7OA 2FCHA 4TKYA 6GSSA 3QMXA 4FO5A 1T4ZA 3KTLA 4RI7A 5DAKA 1OAZA 2M80A 4MCUA 2G2QA 2GZPA 3APQA 2VLUA 4KNDA 3L9SA 3U6VA 1F2EA 3HA9A 1UVZA 1FAAA 2L4CA 17GSA 5JWRB 3UOMA 5HR3A 2H1BA 1M2BA 4I2TA 2VOCA 2HRNA 2NPBA 1KEBA 1AC1A 1XCCA 2FA4A 2X99A 1T7PB 2WRTA 3HCZA 1TRWA 1A8YA 2AUVA 3O3TA 3J7Yk 2O7KA 2ZCTA 3QOUA 4MJCA 3WGDA 3GH6A 5LNKe 3HVXA 5E4WA 2IMIA 1M9AA 1M9BA 3A2XA 3SBCA 1X9MB 3WT2A 4Q5QA 1ERTA 4NHZA 3HY2A 5F07A 1TTZA 2WULA 3C8EA 5J3RA 1YZXA 2HZEB 1GLPA 3GNJA 3KEBA 2FLSA 3TRQA 4KSOA 4WR5A 2HZEA 1NW2A 1WRYA 4WR4A 1SD8A 3D6IA 3NIVA 1GSSA 1THOA 1KTEA 2HE3A 1K3YA 4GRFA 2FNOA 1O7UA 3A5WA 3LSZA 4N11A 4ZBAA 3VWVA 1EOHA 2X8HA 1HNAA 4MP4A 1QMVA 3TKSE 3W8SA 2VCVA 5B8AA 3CXGA 1EP7A 3IE3A 2YN1A 1ZMAA 2ES7A 5IMCA 4O7HA 3HJPA 3KM6A 1ZGNA 1ZL9A 1PA3A 1OE8A 3ZZXA 4XCSA 1XWCA 3KP9A 1V9WA 1MD4A 18GSA 1LBKA 4TOPA 1TJDA 6GSXA 3LORA 2LJRA 4ZXGA 4POBA 4HUAA 2M72A 3LWAA 3ISOA 4EKZA 4X1UA 2FWEA 2VD0A 2DLXA 1AQXA 1A0RP 4IN0A 2GSRA 3GUSA 4KAEA 4HU7A 3L9VA 3GSTA 5DCGA 2HSYA 3G7YA 5CP1A 4YQVA 1OC9B 2YNXA 3IXRA 2JSZA 1NSWA 2CZ3A 3MSZA 2IMEA 1R26A 2GSTA 1JZWA 2B5EA 1OC9A 4FH8A 3UARA 2ZNMA 4WBJA 1EV9A 1GLQA 2DMMA 3OR5A 2G0FA 3BBYA 1XOBA 1PSQA 2VCTA 3JCML 2BJXA 2R6KA 3DMLA 1UA5A 4IHUA 3RAZA 1QK8A 4DSQA 2L4QA 2DJKA 5F0GA 1VF1A 2IMDA 1XW9A 3GX0A 4G19A 1V98A 1HYUA 4V2NA 2JL4A 2P31A 3DD3A 4GQFA 4ZB6A 2DJ0A 3L9UA 1DUGA 3EE2A 3HVVA 3GL3A 1PL2A 4ZB9A 5JCGA 1X5CA 3ZTLA 1YF0A 1A8LA 3QFBC 2N5AA 5AIXA 3ZIVA 3NZNA 3CBUA 2M46A 3HJMA 3IRAA 1GH2A 3APOA 2H30A 2PUKC 4EXJA 4NHWA 3VWWA 4Q5RA 3F0IA 1MD3A 1AW9A 2LKUA 4XS4A 1ML6A 1GSUA 3QDNA 4WKWA 4Q5FA 3FY7A 3AY8A 3L78A 4IBPA 3QR6A 3KMNA 5IPGA 2JADA 3J7Yb 2VL9A 3VI7A 4G2EA 1A2MA 1QFNA 2VUPA 5B8BA 2PVOC 1PKZA 4ILFA 1E2YA 2YV7A 2A2SA 1K0NA 4WEYA 5GSTA 4KCEA 3VWUA 1YEPA 1SD9A 1W4VA 1GTBA 3IK9A 4HOJA 5DALB 2LRNA 2HZFA 4WF5A 4MH2A 3UMAA 1R7HA 3DVWA 4OO4A 4E8HA 4POKA 3KD0A 2DBCA 5ECHB 5CRWA 2YWOA 3ZFBA 3L4NA 4XS6A 5A5KA 4LMVA 3PR8A 1GNWA 3FHKA 4KA0A 5HQPA 2GT5A 5D93A 2GZYA 1T4YA 5AIVA 5KN0A 4AJ8A 1KNGA 4YAVA 2EC4A 4KH7A 2MMNA 1ERVA 2K9FA 1CQGA 4EC0A 1GL8A 3VI5A 2V2GA 1U3IA 4GF0A 1PL1A 2NDOA 3EMXA 4K0NA 4NWYA 6GSUA 3FK8A 1XVQA 1YQ1A 2H0GA 1WMJA 4ZL8A 1V58A 2CX3A 3ZYWA 3IPZA 2FWGA 3KH9A 5IOXA 4POLA 2ON5A 1WE0A 2F8AA 2YZHA 1ZYQB 5J5NA 4TR1B 1M0UA 1G6YA 1MEKA 4CHSA 2A4VA 4X0XA 1SYRA 3TRPA 1RQMA 4KE3A 3D4MA 1SK1A 3TJGA 3TJFA 3HZ8A 5AN1A 4IVFA 3EU3A 1VF4A 5CNWA 2J23A 5H5SA 1GNEA 4DSRA 2HSHA 3ZVJA 1B4PA 1XWBA 2YJ7A 4MZCA 2HT9A 1QUWA 4OMVA 1Y6EA 1YDKA 3HHVA 3RHBA 4MH3A 1SL0B 2KP2A 2L5OA 2F3MA 3BD2A 5DDLA 4HQSA 4GSNA 2VL2A 2B1LA 3PINA 4AJ6A 2TRXA 2V1MA 1FG4A 2OA7A 4IGJA 1FVKA 2VCXA 1EEJA 3DXBA 2QC7A 1OKTA 3IA1A 4TR0A 2XPDA 1SL2B 4JR6A 13GSA 2K6VA 4NXIA 4EVMA 2AV4A 3GH9A 4OO5A 1JLVA 4L8EA 2O8VB 4J2FA 2GDRA 1XW5A 3LXZA 2IMKA 2R2JA 2C0DA 2WZ9A 4RUVA 1S3CA 4RI6A 2H76A 2RLIA 1G6WA 3LYKA 2E7PA 5ABRA 2EIOA 2HYXA 2DJ2A 4IW9A 1PD21 4AGSA 4DSSB 1YF1A 2K18A 4WETA 3IV4A 2OBIA 2IJYA 3I69A 2P0GA 2OACA 3GKMA 3M1GA 4DSSA 3E3EA 2TIRA 3ME8A 1YJ6A 5G2ZA 4D73B 2VAFA 2B7KA 5ECIB 2C0FA 1IYHA 2OJLA 3W8JA 4D73A 1ZYEA 2IMFA 1MDKA 3WGXA 3CRUA 3KGKA 2P5RA 3HDCA 2EIRA 2LQQA 2LQOA 4BWSA 4XTSA 1EZKA 2GS3A 3LXTA 4QL9A 2DMLA 3O76A 1GUHA 4IJIA 6GSTA 4K7IA 2XC2A 2O85A 2WJUA 1TU7A 1YEXA 1GTIA 1EEMA 5COHA 4F82A 2CAQA 1R4WA 5GAND 3UVTA 1XWKA 5CRDA 2LNSA 3TJJA 3PGTA 3FZAA 4HQZA 6GSYA 2HRFA 3GIXA 2L57A 1TOFA 2H19A 2H1GA 2LRCA 1EGOA 4YQMA 4MJBA 3TRXA 1WP0A 2CZ2A 3VLNA 5L71A 1TK5B 3LJRA 1SK2A 3GL5A 2F8FA 2X64A 4IQAA 2IPAA 4L5LA 3PH9A 4JE1A 3MAKA 4G10A 2R4VA 1AUCA 1BX9A 1T3BA 4J57E 4BPYA 2V6KA 3RBTA 2XBIA 2YPMA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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