2OJLA

Crystal structure of q7waf1_borpa from bordetella parapertussis. northeast structural genomics target bpr68.
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
79
structure length
79
Chain Sequence
HPPRIAIQYCTQCQWLLRAAWMAQELLSTFGADLGEVALVPGTGGVFRIHYNGAPLWDREVDGGFPEAKVLKQRVRDHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords Hypothetical protein
publication title Crystal structure of Q7WAF1_BORPA from Bordetella parapertussis
rcsb
source organism Bordetella parapertussis
total genus 22
structure length 79
sequence length 79
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ojlA00
5DQYA 1WOUA 2JSYA 3BBYA 3KEBA 2B5EA 3CXGA 1J0FA 3GL3A 2LRCA 3R2QA 5G1KA 2DBCA 2VCTA 3MAKA 3GV1A 5A5KA 4IQ1A 3ME8A 1EP8A 2R6KA 3W6GA 1V2AA 4NV5A 3W8SA 2QSIA 1ST9A 1GTBA 1Z6NA 4MP4A 2DLXA 2I81A 2FCHA 1WPIA 4GCIA 4XIHA 2L5LA 19GSA 4ILFA 4MDCA 1PN9A 1WP0A 3KD0A 5HFKA 5IQYA 3ZRDA 4ZB9A 3O6TA 2RM6A 2NVLA 2VAFA 2CT6A 2GT6A 4NAXA 3TGZA 2GDRA 5D73A 2CVDA 2ZNMA 2F51A 2A4VA 3M9JA 1PD21 1TU8A 5E59A 1O7UA 2JSZA 2H73A 1URMA 3RDWA 3FZ9A 4GWRA 1TK8B 1GUMA 4JRRA 1T8EB 5CRWA 4J57E 14GSA 1YQ1A 3I9V2 3HKRA 2V32A 2H1AA 2O85A 4WF4A 3FR3A 4AJ8A 3KGKA 2IPAA 3DEXA 1FG4A 5ECKB 5ELAA 3I43A 3BCIA 5IPHA 4PNGA 2MBTA 2O8VB 3UEMA 5IO2A 2DJ1A 2TRCP 4AF2A 1X5CA 2H0GA 2P0GA 5JWOB 1BJXA 5B6MA 3G9BA 1BYEA 2PMTA 2PN8A 5DCHA 2FWEA 1U6TA 1VF1A 1AAZA 4L5LA 2DJ0A 5CNWA 4KX4A 3LSZA 4N0VA 3GL5A 4OD7A 2IMIA 4NV2A 3ZMLA 3ZVJA 4IJIA 3P2AA 1SKWB 2VOCA 1PL2A 3ERGA 1M2AA 2GGTA 4XRAA 1YKCA 3MDKA 4MJCA 3HVXA 2OBKA 4HOJA 4MJBA 1PSQA 2B7JA 5DAKA 3EU3A 4ECJA 1THXA 4POMA 4PUFC 2LQQA 1FB0A 2VLUA 1TU7A 2FA4A 2H0HA 3D6IA 1AW9A 4O92A 2AYTA 3WYWA 2FUG2 1A2LA 2OE1A 1Q98A 2XPEA 2MZCA 1XPVA 4KGIA 5D9XA 4XS4A 4MH2A 3GFKA 3P90A 1Y25A 3KTLA 2K6VA 2EC4A 2KOKA 3GNJA 1RK4A 3LFLA 2H6XA 2BMXA 4F0CA 2OADA 2HYXA 1G6YA 2A2SA 1TXXA 2MYGA 5G5FA 1K0AA 1ON4A 5INYA 2JZRA 5G2ZA 4ZL8A 2CZ2A 5FT3A 1C72A 1ERVA 1M7TA 3V1WA 1HYUA 2IJYA 3TKSA 5ECQB 2BTOT 4G2EA 1X5EA 3VWXA 4XS6A 5D9TA 3O3TA 3OR5A 3IC4A 3KMNA 5DAKB 5JCWA 4P3YB 1ZOFA 1YEXA 3GA4A 4L8EA 3EURA 2JZSA 2C1YA 4K0NA 4POKA 3DWVA 4MA9A 5IMDA 2WJUA 3SBCA 4HU9A 4PGTA 5LD0A 2L5OA 2HRNA 5JCUA 3RPPA 4TXVA 4FYUA 3GH6A 1YF0A 2IMFA 1OAZA 4V1Ag 4CHSA 2FA8A 5JWRB 2F9SA 3VI5A 4BL7A 4MPFA 4XS4B 3GSTA 1TK5B 2CX4A 3DXBA 2YWNA 2V1MA 3IOSA 4MZBA 2YP6A 3Q18A 2PBJA 2M46A 3QFAC 4FO5A 2HRFA 2C3NA 4F03A 4L0WA 1SL1B 4TN8A 3GKKA 4PURA 1H4OA 4I5QA 2LSTA 1GSQA 3A3TA 4MH3A 1JZRA 4EC0A 2DJ3A 1OE7A 3IBHA 3IDVA 5EPFA 1NSWA 5HR2A 4TRXA 3GKXA 3F4TA 1TI1A 3U5RE 1XCCA 1ACVA 2O7KA 5IOWA 3ZFLA 5ID2A 1K0CA 2HXKA 1GP1A 2LRNA 2H19A 4EDYA 5IMVA 1CQGA 1ZZYA 3D22A 1ZCPA 5CO3A 1U3AA 3GH9A 4ECIA 3KP8A 3DMLA 3IHQA 3M0FA 3M9KA 3VI7A 1F9MA 3TOUA 3LXZA 5B8AA 1DSBA 4OMVA 17GSA 2YJ7A 1NHYA 1G7OA 1GLPA 2GSRA 5KEJA 4V2NA 2QGVA 3VWWA 4EF0A 2P5QA 3F4SA 3LYKA 3GUSA 3MWHA 1X9WB 4IKHA 2VM2A 5J5NA 2DIZA 3S9FA 1Z7PA 5IO0A 2HZEA 1V57A 1KTEA 2RUEA 1GLQA 3LQ7A 1IYHA 3KH7A 5D8IA 4JR4A 5DJMA 4ID0A 1GULA 5CAXA 4QQ7A 1V40A 2I4AA 1F3AA 2DC5A 1O8XA 2CAQA 2HLSA 3KJYA 2GT5A 4G19A 3WT2A 4CDOA 2WDUA 3C71A 2YV9A 1W89A 2DJKA 3DVWA 4GSSA 5J41A 5ID2B 4JE1A 4KH7A 3H93A 1FVKA 3UARA 2L4CA 4YQMA 3VK9A 3A5WA 1XVQA 4JBBA 2HI7A 2V6OA 3TKQA 5GSTA 5B7CA 4ACSA 4V2MA 2G0FA 3LXTA 1GSDA 5IMFA 1ILOA 1T00A 1TI3A 2LUSA 2DSAA 3I69A 1BEDA 3WT1A 4K7NA 2K18A 4WKWA 3GSSA 1XIYA 3J7Yk 5LNKe 4KDUA 2YNXA 2MMNA 3FR6A 1TRUA 3C8EA 1MDJA 3GKNA 2DMLA 1FOVA 1XOBA 5H5QA 1O81A 3DD3A 1UN2A 1YKAA 2CVBA 2IN3A 2B1KA 1A0FA 4F9ZA 3DGQA 3CTFA 2WB9A 1B9XC 4PXOA 5CP1A 4I8BA 2F8FA 3N5OA 5ECRB 2YWIA 2YPMA 3GKMA 4J56E 3ZITA 2GLRA 4N10A 3GMFA 3TJJA 4O7HA 4J2FA 1QUWA 4EDZA 4OO4A 3CMIA 1FB6A 2YJHA 3FEUA 3CSIA 1R7HA 4KCEA 2R3XA 5C04A 3HDCA 3D0ZA 3L4NA 2F8AA 3RHBA 1K0NA 1TRSA 3HZ8A 2YOIA 2V2GA 1TJDA 1EGOA 5IOXA 1TDIA 4F2IA 2OBIA 1ABAA 1QMVA 4MK3A 2FWFA 2X8CA 4ML6A 2H74A 3VFIA 2GQLA 5CYYA 1ML6A 4AJ6A 3MSZA 4PX1A 4O32A 1W4VA 3F3RA 3FY7A 2VLTA 1O73A 3K8NA 3SWLA 4OFMA 1YZXA 2JADA 2PERA 4HDEA 1A8YA 1PX6A 1SJIA 2XC2A 6GSXA 3KTBA 1ERTA 1OC8A 1MEKA 3LG6A 2I3YA 2K9FA 4KB3A 2IMEA 3IK9A 4FIWA 5H5SA 3ISOA 1NHOA 4JEDA 3E3EA 1GRXA 3F0IA 2YWOA 2E0QA 4YAVA 4FYCA 3TKSE 4ZL9A 2HFDA 3PR8A 1TW9A 2EIQA 4Q5RA 2GVPA 5GAND 4XS1A 3Q74A 1VF2A 4NXIA 4MZWA 4GF0A 2CZ3A 4OCEA 4QL7A 2E2GA 1GUHA 2LJKA 4PNFA 4MCUA 4PQHA 1YEPA 3BCKA 3QOUA 2PPTA 4ULXA 3ZLPA 2QC7A 3CRTA 4GQCA 4K0GA 4G10A 1ZMAA 1QQ2A 1JFUA 2WFCA 2ES7A 2C3QA 1LBKA 2AV4A 3CSHA 4KSOA 3G7IA 1THOA 1XWKA 4KW6A 3VPQA 4DSQA 1AIUA 5EVOA 1SL0B 2FGXA 2L4QA 3H79A 4KUNA 1TK0B 1WWJA 4HEA2 1DUGA 5CRDA 2LS5A 3ZFBA 4H86A 2E7PA 4WF5A 6GSYA 1SU9A 4ZBDA 2H76A 2OACA 2P5RA 3P7XA 4V1Ap 4ZILA 1MDIA 1U88A 2XHFA 2VL3A 4EXJA 3D5JA 1JLWA 4X1UA 3C73A 3TRXA 1GSYA 2N5AA 4I6XA 2F3MA 1G7EA 4YQUA 2AHEA 2VO4A 1GTAA 3GHAA 2WZ9A 3EWLA 2GQKA 5ENUA 2L6CA 3MNGA 5ECMB 2HSHA 3CRUA 3FYGA 5J4UA 2WCIA 2VCXA 2H01A 1R26A 5AIXA 4ECCA 2CVKA 3VURA 1AQXA 3VLNA 1HNCA 5KN3A 5CRHA 1N8JA 4LA1A 4XHMA 2K8VA 1V58A 3UJ1A 4MF7A 2H75A 2AAWA 4HI7A 1XW9A 2OA7A 1K0MA 4IHUA 2I1UA 3UIWA 1SKSB 3RBTA 3W8JA 3ZTLA 1M9BA 1VF4A 4POLA 1A23A 3HZ4A 2YV7A 1MD4A 2X99A 1GSSA 3DKSA 3GN3A 1PQNA 2GQMA 3PGTA 4TVEA 3Q19A 1BAYA 4IGJA 3G7YA 2AB6A 4RI6A 2B3SA 4IQAA 5D9VA 4LMWA 5JWQB 3F6DA 3Q6OA 2HE3A 3BOAA 3EC3A 1K3LA 5L71A 3EMXA 1ZGNA 6GSWA 1A2MA 3TUEA 3FKFA 1IYIA 3ZYWA 4JR6A 4HQSA 3F9UA 4ZL7A 4L5OA 2I9HA 1U3IA 1EV4A 2H72A 2O89A 1XWGA 4FH8A 9GSSA 1VGLA 2V41A 5IMZA 1T4ZA 3KM6A 2VM1A 2WGRA 5DCGA 3HCZA 4TXOA 1QFNA 3QAGA 3L9UA 4BWQA 3VWUA 4DSSA 3IXRA 5ECLB 3QCPA 4GSNA 4KA0A 1XW6A 2C0EA 4Q5NA 1SK0A 4EKZA 1J9BA 1KEBA 2CA8A 3LYPA 20GSA 3A2WA 2EIRA 2MMOA 2KUCA 4RUVA 1SL2B 2PVQA 1JZWA 1F3BA 2TIRA 2NBSA 1PA3A 1XWBA 1GTUA 1X9MB 1GSEA 4MZCA 4MJAA 4RI7A 1KNGA 1FVJA 3C1RA 4NMUA 5ECPB 4HUAA 3C1SA 3FHKA 1SJ6A 2NTOA 3HHVA 4GXZA 1YDKA 2R2JA 1EGRA 1WE0A 1SYXA 4WBRD 1G6WA 4TR4A 5J9BA 1TKDB 5EY6A 2REMA 3CSJA 4AJ7A 2VCZA 1OC9A 3ZVJD 2B6MA 2VL2C 1SJZA 4IBPA 3GIXA 1A24A 4YQVA 1SKRB 2D2ZA 2LJAA 1XW5A 3FZ5A 3FZ4A 3AY8A 4TXOB 3TJKA 2ALBA 4MLYA 1FAAA 1QGVA 1TP9A 2YWMA 2OE3A 4DSSB 2XBQA 4JU5A 4EE0A 5ECSA 1OVNA 4IP6A 1WMJA 3IR4A 1YY7A 4KDXA 4NPBA 2CV4A 3NOFA 4HZ2A 1FHEA 2KP1A 3QD9A 1MDKA 1PX7A 4EL1A 2HT9A 1WJKA 3EVIA 11GSA 2CX3A 4WR4A 2X8GA 1MTCA 1H75A 4IJ3A 3GURA 3APSA 3QAWA 1MD3A 1WRYA 3KXOA 3EMPA 3KIJA 4KSMA 4XRDA 2GSSA 1FO5A 1VRSD 4NHWA 3WD6A 5DJLA 1U87A 3ZIJA 4N11A 1EP7A 2FWHA 6GSUA 2VCVA 4MABA 1SD8A 4NHZA 1GWCA 1OC9B 3HVSA 3RAZA 3A2XA 3UBLA 3KCMA 2VD1A 4GTUA 3WGXA 1PKWA 4TW5A 3GRXA 1SENA 8GSSA 3F8UA 1AQVA 5KN1A 1F2EA 1LJRA 1AXDA 2H6ZA 4OWYA 3GTUA 1N2AA 1KBNA 2LQOA 4YH2A 3CBUA 3HJMA 2L59A 3IAM2 2HZEB 2PU9C 3TJFA 4BVYA 5G30A 3FR9A 1Z3EA 1TRVA 3EE2A 4GQFA 4TR0A 2LV3A 3ERFA 1T4YA 4I2TA 4TOPA 3RHCA 1JHBA 2M72A 4BWSA 1WIKA 2H8LA 3RPNA 3TCOA 1PRXA 1A2JA 1B9YC 3EYTA 3M1GA 2AJQB 3TRQA 1XXUA 2IWTA 5F06A 1M9AA 1SYRA 2C80A 3E9JB 1HNAA 3KH9A 2DIYA 1GSUA 3ZL5A 2V6KA 3UBKA 3IA1A 3GX8A 5ABRA 1V9WA 5A4VA 1EV9A 5G31A 5ECHB 2PVOC 2Z9SA 1EOGA 3F6FA 1AC1A 2NPBA 5A4WA 4XCSA 1O85A 1GNWA 6GSVA 2P31A 2E2MA 1X9SB 2IMKA 4DEJA 1GL8A 7GSSA 3GTUB 1S3AA 3GX0A 2C3TA 1XZOA 4LMVA 3FK8A 2LTKA 5DQSA 3HD5A 3DRNA 5ECNB 3UMAA 4IELA 2XBIA 1XBSA 3VWVA 1SD9A 4JZQA 2FWGA 4IS0A 3HXSA 2AUVA 2LNSA 2ON7A 1E2YA 4TKYA 4F82A 5JCGA 2GZZA 5HFGA 4K2DA 4KNDA 5GAPD 1BQ7A 1XFLA 3TRPA 1RW1A 2C0DA 3TOTA 1M2DA 2CQ9A 3A2VA 4RQXA 4KAEA 2FY6A 1PGTA 2H71A 3TDGA 3PH9A 2VIMA 2VD0A 2GSTA 2VCQA 2RM5A 4MMMA 1LU4A 3C7MA 3JCML 2RIIA 3DVXA 2J23A 3LJRA 4KDYA 4BPYA 2GTUA 1QXHA 3G7JA 1USBA 5D9WA 4HQZA 2WS2A 3H8QA 3IE3A 3QDNA 4X0XA 1DBYA 4EVMA 2M80A 2HSYA 2X64A 1A8LA 16GSA 5HQPA 3IRAA 2H30A 3KZQA 1BX9A 5GSSA 2GZYA 4ZB6A 3O76A 2H66A 5KN2A 18GSA 1M0UA 4DSRA 1EWXA 4Q5FA 3QMXA 3TJGA 10GSA 4O5RA 2B5YA 1CQHA 3UL3A 4OFTA 4HZ4A 5IMCA 1SK1A 1X5DA 5D93A 1K3OA 1Z9HA 2BJXA 3IPZA 5IM9A 3FRCA 1K0OA 3HY2A 1R5PA 4DVCA 2R37A 3KMOA 3L0HA 5HR0A 2CAIA 5CREA 2IFQA 2GSQA 1TTZA 5AIVA 2FD3A 3EU4A 1I5GA 5G1LA 4LLRA 6GSTA 2ON5A 4Z7XA 3U6VA 1K0BA 3L9SA 4K6XA 1B48A 1EOHA 2FHEA 4LL4B 5A4UA 2H6YA 1ERUA 3L9VA 2PGTA 2YN1A 3TJBA 5F0GA 1ZYEA 3H4KA 1PKZA 2KP2A 3M3MA 1NM3A 4E8EA 1PL1A 4MF6A 3ED3A 5EL8A 2FNOA 4YAPA 5ECIB 5C00A 5CRGA 1K0DA 4WBJA 2R5GA 6GSSA 3IAS2 3HA9A 2LKUA 5HR1A 1ZL9A 1V98A 1K3YA 1XOAA 1J08A 2VL9A 2JACA 3ZREA 5F8BA 3ZZXA 3LORA 1O6JA 1TRWA 4TR1A 5AN1A 3WGEA 1T3BA 5DDLA 3QFBC 1OKDA 2IMDA 1X0RA 4ZXGA 2H1GA 2G2QA 2H0IA 1BG5A 4WEYA 3IV4A 5B6NA 1B4QA 1DE2A 3ME7A 4HJMA 3H1NA 2GZPA 3GYKA 2LEGA 4GRFA 12GSA 4LL1B 1B8XA 2JL4A 2IFQB 2N5BA 4MPGA 2OJLA 1RQMA 2MMZA 3TKSC 4K7OA 4F0BA 1GH2A 5J3RA 1OKTA 4PQIA 3E0UA 1M2BA 4K1FA 1NW2A 5ELGA 3LEFA 4ISDA 4I2UA 1HD2A 5LCZA 2MMAA 3APQA 2H1DA 5HR3A 4XTSA 2OE0A 5E4WA 2VUPA 4IN0A 3D21A 2EIOA 2L6DA 2RUFA 1F37A 3PINA 4ECBA 1GUKA 3FZAA 3TKRA 3I6AA 3US3A 4D73A 4CW9A 1B4PA 1OC3A 1XWCA 4V2LA 3F4RA 3ZIVA 1G0TA 1AUCA 4ML1A 1Z5YE 2B5XA 1XVWA 4POBA 4K8MA 4K9ZA 4TR1B 4G9HA 3KP9A 4KCAA 1S3CA 2ZCTA 1GNEA 13GSA 2DMMA 2H70A 4ZBAA 2X8HA 22GSA 5G5EA 3LWAA 3J7Yb 2H1BA 3BJ5A 2HZFA 4WETA 2OKAA 3P8WA 4NWYA 1VF3A 4MF5A 2IIYA 4OFNA 1TOFA 2VL2A 3HJPA 5FWGA 5B8BA 2J9HA 4X43A 2FLSA 4TR3A 2N5FA 3N9JA 1YF1A 1YJ6A 4RQRA 1XWAA 3QAVA 3VPTA 2DJJA 1EZKA 2QKEA 2GS3A 3UAPA 2XPDA 3UVTA 4OO5A 4WXTA 5DALA 4HU7A 3DIEA 3F63A 3FW2A 1R4WA 5ECOB 1Z6MA 4D73B 5D96A 1JLVA 3HJOA 4ZBBA 1O8WA 2YZHA 4HJ2A 3DYRA 2O87A 5J9CA 4IVFA 1A0RP 1S3DA 3WGDA 2K8SA 5AGYA 1E6BA 1UC7A 2NDOA 1JZOA 4PUAA 4PQ1A 5HFIA 1Y6EA 1HQOA 5IMAA 3IK7A 4QL9A 4WR5A 4AGSA 1HNBA 1GTIA 4BA7A 2YZUA 3M8NA 1ZYQB 5DVBA 1SK2A 3L78A 2WRTA 5IIZA 1R5AA 4EO3A 1Q4JA 1T1VA 5DBQA 4MJEA 3QR6A 1UA5A 4ZIJA 1T7PB 1UVZA 4E8HA 1DE1A 2B1LA 2PUKC 3UVHA 2RLIA 5COHA 3D4MA 3D4TA 2TRXA 5GZZB 2DJ2A 3TKPA 5DALB 4ZB8A 3HVVA 2R4VA 1PMTA 3NIVA 2PWJA 3ERWA 1FW1A 4OCFA 3F3QA 3EINA 1OE8A 1AQWA 3BD2A 4N0ZA 3CTGA 4GSTA 2JZTA 5AISA 2C4JA 2B7KA 2LJRA 4IW9A 5F05A 2MBSA 2LRTA 4Q5QA 1JZDA 2KHPA 4N30A 3UOMA 3HYPA 1F6MC 1EEMA 1Z7RA 4K7IA 1OYJA 3NZNA 4EUYA 2IL3A 3CYNA 1EEJA 3QPMA 4KE3A 3TB2A 2JU5A 2C8UA 2YANA 4L0UA 2VLVA 5F07A 2ZUPA 2LNTA 4IP1A 3APOA 1I9DA 2WULA 2HNLA 2VCWA 5H5RA 4GLTA 4BVXA 2C0GA 4I97A 2L57A 5KN0A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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