2OJLA

Crystal structure of q7waf1_borpa from bordetella parapertussis. northeast structural genomics target bpr68.
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
79
structure length
79
Chain Sequence
HPPRIAIQYCTQCQWLLRAAWMAQELLSTFGADLGEVALVPGTGGVFRIHYNGAPLWDREVDGGFPEAKVLKQRVRDHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bordetella parapertussis
publication title Crystal structure of Q7WAF1_BORPA from Bordetella parapertussis
rcsb
molecule keywords Hypothetical protein
total genus 22
structure length 79
sequence length 79
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ojlA00
1A8LA 1EP7A 3UBLA 1XZOA 1MDIA 2H01A 5F07A 2QKEA 4F0CA 3F3QA 6GSXA 5FHIA 3RAZA 3ISOA 1AQXA 1A2MA 2RLIA 4IJIA 2KUCA 4ISDA 2VLUA 1AAZA 5AGYA 1PN9A 1GP1A 3D4TA 4PNGA 3L9VA 5CRWA 3ZMLA 4JR4A 2E2MA 3KTLA 6GSUA 1GSEA 2REMA 2CVBA 2PN8A 5IO2A 2MMAA 2XBIA 2M46A 1SL1B 3ZITA 3I9V2 4MPGA 2JL4A 1N8JA 3TRPA 3GH6A 4DEJA 1SJIA 1W4VA 2R5GA 4K1FA 2IMFA 1JZWA 2LJRA 2ZNMA 2TRCP 4HQSA 1XW5A 2YN1A 2H0GA 2GQMA 4N30A 3HJMA 4BL7A 1FHEA 1QMVA 2JSZA 4KGIA 3ZFBA 1QXHA 3PR8A 5CRHA 5KN0A 3GYKA 4MJBA 7GSSA 3BCKA 1V98A 1FAAA 3I6AA 2H72A 5JWOB 1ZZYA 2TIRA 1BJXA 2L59A 5GSTA 2HT9A 1SU9A 2ALBA 1LBKA 1TDIA 1GNEA 2WS2A 2FGXA 3F4TA 2B7KA 1V9WA 4O7HA 4WBRD 6GSVA 3G7IA 5IIZA 2VCZA 19GSA 4K8MA 1RW1A 4HOJA 2GT5A 4EF0A 4HS1A 1U87A 5FT3A 5B7CA 1JHBA 5ECLB 4EO3A 2O87A 4O92A 2H1GA 2MBSA 2IMKA 2FWHA 1YEPA 2J23A 4GWRA 4BWQA 3H4KA 3H93A 1WRYA 5GAPD 4BA7A 2IWTA 1YZXA 3DMLA 3IAS2 2IL3A 1M9AA 4MP4A 5ABRA 3LWAA 3J7Yb 1GLPA 3TUEA 5D8IA 2HZEB 1Z7PA 4XHMA 2H1BA 4LLRA 1F2EA 1EOHA 4XS4B 3K8NA 2FUG2 4ZB8A 2H71A 1T4ZA 1QUWA 5IOWA 3LQ7A 1HQOA 3UAPA 5ELAA 5AISA 2JZTA 2H1AA 1VF4A 2YWIA 4HU9A 5LD0A 2QGVA 2RM6A 1M2BA 4TR1A 1HD2A 4I2TA 3O3TA 4MJEA 1H75A 5G1KA 2H6ZA 1EOGA 1J08A 1FB6A 4RQXA 1Y25A 4FYCA 3ED3A 2I1UA 5DVBA 5G1LA 1E2YA 2O7KA 2C0EA 16GSA 2LS5A 1MDKA 1TJDA 4IBPA 1USBA 1R7HA 2GTUA 1M99A 2VL3A 2N5FA 2GDRA 4TR3A 3UVHA 4LL4B 4IW9A 4KNDA 5KN1A 4PQ1A 4ZBAA 3UEMA 2MZCA 6GSWA 3Q74A 2FWGA 18GSA 4K6XA 1FO5A 1B4QA 5IQYA 3ME8A 3GIXA 1V57A 1Q4JA 3ZIVA 1AIUA 2LTKA 5CYYA 2KHPA 4NPBA 2DMLA 1TU8A 2LEGA 3DGQA 3N9JA 3BJ5A 2V41A 1B9XC 2G0FA 5F05A 5J3RA 5ECPB 4AGSA 2RIIA 2HSYA 2P5RA 4DVCA 4WKWA 2CQ9A 3P2AA 4WXTA 5ECNB 2CZ3A 5HFKA 1IYIA 1TRWA 4IQ1A 1K0AA 4NAXA 1G7EA 9GSSA 3NZNA 3LYKA 2H70A 3MWHA 3VPTA 4L0UA 4MZCA 1EZKA 3US3A 3JCML 1G6YA 4EDZA 4N10A 4MPFA 3VLNA 3W8SA 1K0DA 1OC9B 1YJ6A 3L9SA 2H1DA 1CQGA 1PD21 1SD9A 4JBBA 2CAQA 3ZLPA 1TRSA 1KTEA 4IGJA 5KN3A 5HFGA 5C00A 2VCWA 1R5PA 3CYNA 4G9HA 4ML1A 5H5QA 5F0GA 2XPEA 3UMAA 1U3AA 5DJMA 1UVZA 1E6BA 3GKMA 1GSSA 3F0IA 4XRDA 3RPPA 2CVKA 4POKA 1ZMAA 3QMXA 5D93A 3TRXA 5GSSA 4MA9A 2WJUA 3HDCA 2A2SA 2P5QA 4EXJA 1FW1A 5IMFA 4GSTA 4PNFA 2MMZA 4KA0A 2C1YA 4GF0A 4NV2A 2EIQA 1VF2A 2VUPA 2DJ1A 3TKSC 1GRXA 1VF3A 5IM9A 3O6TA 1OKDA 2I3YA 3IAM2 3IK9A 1MD3A 1SL0B 1PRXA 2OADA 3H79A 3TKPA 2LKUA 5G5FA 4WR4A 3C71A 4L8EA 3C1SA 1EEMA 4K7OA 1GULA 2PERA 2LNSA 4LA1A 2YNXA 1C72A 5ELGA 3NOFA 4EE0A 2XPDA 3MDKA 1AUCA 3DVWA 3SWLA 2MBTA 1X9WB 1ILOA 4OCFA 4YAVA 2YJHA 1A24A 2MMOA 2M72A 3F4SA 4ACSA 2VO4A 2C8UA 1GUHA 3C8EA 4PURA 1AC1A 4TXOA 4TR0A 1PQNA 2HZEA 2L57A 1O7UA 2H75A 5DQYA 4F82A 4I5QA 1FOVA 4KCAA 3QR6A 4IP6A 1ON4A 1T00A 3FEUA 2GGTA 4XS4A 5B6NA 1YY7A 3DD3A 4ID0A 5H5SA 2FNOA 3VWXA 1AQWA 5JWQB 4ILFA 5A4UA 1GWCA 4E8EA 8GSSA 1THXA 1WMJA 4J57E 4ECIA 3EINA 1DSBA 4L5LA 3L9UA 4TVEA 4ECJA 2FD3A 2L5LA 3WGXA 1JZRA 5IMCA 2C3TA 3GFKA 2YWMA 2FA8A 2GS3A 1K0BA 3SBCA 2F3MA 3APQA 1X9SB 1JZDA 1BQ7A 1AW9A 4N11A 2WCIA 5IMDA 4OCEA 1SK2A 3WT1A 3U5RE 1TK8B 1O8WA 3UL3A 1G0TA 2NVLA 3A5WA 1OYJA 1X0RA 2HLSA 4EUYA 3TJGA 3UOMA 3HYPA 2VCXA 3GTUA 2K8VA 2DJ2A 3M9KA 3IPZA 2L4QA 3CSJA 3GL3A 2C3QA 4NHZA 4F0BA 3FR3A 2GSRA 1ERVA 2E0QA 3D0ZA 1UC7A 1WWJA 5B8AA 1J0FA 2NBSA 1GTAA 3CSHA 2VL2C 1OAZA 1T8EB 2KP2A 4IHUA 2L4CA 1TK5B 1TTZA 4TR4A 2GSQA 1T4YA 1MD4A 5J4UA 5ID2A 3C7MA 4EVMA 3LXTA 4TRXA 1ABAA 1SJ6A 2LSTA 1OC8A 5FWGA 4IVFA 1B8XA 2JZSA 3TCOA 4K2DA 2YCDA 4NWYA 3RBTA 3GSSA 4ULXA 5INYA 3L0HA 1FG4A 2H73A 2VLTA 4MZBA 2DJ0A 1V40A 2I81A 3L78A 1OC9A 4RI7A 3DYRA 1G6WA 1WE0A 2FY6A 4ZILA 4GRFA 2YPMA 3S9FA 2FA4A 1A2LA 1XPVA 4PGTA 2WFCA 4TW5A 2DBCA 3ME7A 3QCPA 3FW2A 4G19A 2GQLA 1PL2A 2YJ7A 2O85A 5ENUA 1T3BA 3UVTA 3I69A 2PMTA 3GL5A 1KEBA 2VD0A 2E7PA 3ZVJA 3H1NA 3IBHA 2F9SA 20GSA 1EV4A 1PSQA 1WOUA 2B1KA 3TJFA 2E2GA 4EDYA 2YV7A 5JCWA 6GSYA 1XIYA 1KNGA 4J2FA 1EEJA 1HNAA 3LFLA 2HRFA 4BWSA 3TJKA 1PKWA 3MAKA 3U6VA 1DBYA 4GQCA 4IKHA 3QPMA 1EGOA 3FRCA 1O6JA 5HR0A 3OR5A 2RUEA 4N0VA 3TOTA 3VURA 1S3DA 5ECRB 4MABA 2H19A 5HR3A 3QAWA 4HZ4A 3Q6OA 2CT6A 4WEYA 2X8CA 2B7JA 4ZBBA 3MSZA 4HJMA 2KOKA 3DEXA 1PA3A 3RDWA 2HNLA 4IQAA 4OO4A 5J9CA 2M80A 1ZOFA 1O73A 1Z6NA 2GVPA 2N5AA 4MCUA 2OE3A 1TOFA 1TU7A 1XBSA 1XVQA 5IMZA 3KP9A 2C0DA 4L5OA 5L71A 3FZAA 4GQFA 2Z9SA 4D73A 3A2VA 4FO5A 3I43A 1ZYQB 2DLXA 2EC4A 2VD1A 3IK7A 4JU5A 5DALB 3FZ5A 5G5EA 1SKSB 5EPFA 1HNCA 3GNJA 5J9BA 4JRRA 4V2MA 4HDEA 3HHVA 5D9TA 4MK3A 1I9DA 1YF1A 4HI7A 3ZZXA 3KMNA 3AY8A 4CHSA 4ZL7A 3G7JA 3FY7A 1V2AA 1FVJA 1DUGA 1GTIA 1DE2A 1G7OA 4KX4A 2IPAA 5HQPA 1B9YC 3VK9A 1QFNA 1WP0A 2FLSA 4DSSB 2DSAA 2K6VA 1Z3EA 2YWOA 1M9BA 4LL1B 3QDNA 1U88A 3IA1A 1F3BA 4OO5A 4F2IA 2V32A 1GSFA 1R4WA 5A4VA 3DWVA 3ZRDA 3ZIJA 1OC3A 2NTOA 2GZPA 2AV4A 3ZMKA 3PGTA 2D2ZA 2K18A 1M7TA 2AUVA 5G30A 1BYEA 1GLQA 1JZOA 5F06A 3E9JB 3M0FA 1EWXA 4PUAA 2AJQB 2CX4A 2GSSA 4JE1A 4ZIJA 2JU5A 6GSTA 2B6MA 4WBJA 1GSDA 3TKSE 3GRXA 2H66A 4LMWA 2HZFA 4ZBDA 4JEDA 3A2WA 2IMIA 1SYRA 1S3CA 4K7NA 4PXOA 1HNBA 3QD9A 3IC4A 1N2AA 1TKDB 3HZ8A 1GL8A 1XWBA 2ZCTA 3ERFA 3KXOA 3HVXA 2R4VA 4Q5FA 2IN3A 4I6XA 4G2EA 2TRXA 2FWEA 4OFNA 2H0IA 4PUFC 4L0WA 2WDUA 2C0FA 3HKRA 3VPQA 5E4WA 1Z9HA 1GSUA 4I2UA 2QSIA 3TKQA 1F37A 1H4OA 3EU4A 3KD0A 1J9BA 1NSWA 1I5GA 1PKZA 4IP1A 4MH2A 2ES7A 4KH7A 2H30A 4MH3A 1TK0B 2V6OA 5JCGA 1O8XA 1GTUA 4MF6A 3A2XA 3VFIA 4V1Ap 1WIKA 2J9HA 2NDOA 4HU7A 1YKCA 2YANA 3DIEA 3WGDA 4KSMA 4OD7A 3Q18A 3LXZA 2HRNA 4X1UA 1ZCPA 3KJYA 2VLVA 5D9WA 2FHEA 2CAIA 2BJXA 2HSHA 2N5BA 4YH2A 3HCZA 4F03A 3UBKA 4AF2A 2F8FA 2HYXA 2YP6A 2DJKA 4IJ3A 1WJKA 2LNTA 3F63A 3IE3A 1S3AA 1Q98A 4MZWA 4N0ZA 2HE3A 2V2GA 4OMVA 3IHQA 3GA4A 3TKSA 4JZQA 4YQUA 2L6CA 1TRUA 1TW9A 4WF5A 3UARA 3QFBC 2PPTA 1GUKA 4QL7A 1NHOA 3P7XA 2HXKA 4ZL8A 1PMTA 1NW2A 2XC2A 3KH9A 3IV4A 1PX6A 4X0XA 1Z5YE 4X43A 1K0MA 1BEDA 1ERTA 1JLVA 3WD6A 1O81A 5IPGA 4AJ7A 4TR1B 3DRNA 5GZZB 2V6KA 2FCHA 4Q5RA 1XCCA 3BBYA 1EGRA 4ZXGA 2AAWA 4NV5A 2LUSA 4OFMA 1W89A 3CXGA 5DCGA 4I8BA 1BAYA 3FZ4A 2RUFA 5H5RA 3TKRA 4MJCA 5E59A 2WB9A 5IMVA 3F6DA 5DDLA 4V2LA 1XOAA 3N5OA 1XWCA 4KSOA 3GHAA 2HFDA 4ML6A 3HY2A 1F6MC 4GLTA 22GSA 2R3XA 3TOUA 2ON5A 2LJAA 4GSSA 1T1VA 2WRTA 4IN0A 5CRGA 1YEXA 3KEBA 2OE1A 2VCVA 3J7Yk 4DSQA 2R2JA 1K3YA 4GTUA 5CAXA 1M2DA 2LQOA 1X5CA 3GX8A 2IFQB 1R26A 3GKKA 4TN8A 5J5NA 2EIOA 1GNWA 1SKWB 4RI6A 3D21A 3A3TA 5B6MA 10GSA 4TXVA 2VAFA 1GSQA 3F8UA 2F8AA 4POBA 4NHWA 3VWVA 5ECKB 2DJJA 3LG6A 1VGLA 2JSYA 1AQVA 4CDOA 4I97A 5J41A 2GLRA 4J56E 4ZB6A 1GSYA 1ZL9A 2GZYA 4K9ZA 1GUMA 2VL9A 2VL2A 3LSZA 4EKZA 1SYXA 5C04A 3F3RA 4KUNA 5D96A 4GSNA 2MMNA 1SD8A 2AHEA 4Z7XA 3GSTA 2YOIA 4PQHA 1UA5A 3GH9A 5HR1A 2BMXA 3NIVA 4MMMA 3IXRA 4WR5A 2YWNA 3HXSA 2YZUA 1A0RP 5GAND 4H86A 5G2ZA 1DE1A 2QC7A 2XBQA 3MNGA 6GSSA 3ZFLA 2AYTA 5LCZA 4XS1A 1SENA 3RHBA 3GURA 1XW9A 5CO3A 4KW6A 3EC3A 2OACA 3WT2A 3WGEA 5LNKe 4WF4A 4QL9A 2V1MA 4IS0A 1M0UA 3VWWA 1GTBA 3LORA 1SKRB 1RK4A 1WPIA 1ZGNA 2JACA 2B3SA 2H8LA 4XCSA 2AB6A 5DAKB 3CSIA 1ST9A 1TRVA 3EVIA 3HVSA 2IMDA 1T7PB 4OWYA 4MF7A 4HEA2 5ECHB 1XWGA 4BVYA 3QFAC 4HUAA 4F9ZA 4XIHA 2FWFA 4XRAA 1AXDA 2I9HA 1K0NA 3EMPA 5JCUA 5A4WA 1ML6A 2LRCA 3FZ9A 5HR2A 1OE8A 2OA7A 2VM1A 3C1RA 4KDXA 3CRTA 3GMFA 1PX7A 5ECMB 3TB2A 2I4AA 2OBIA 5JWRB 2PU9C 4TXOB 4HJ2A 4GCIA 3KMOA 3KIJA 3L4NA 2RM5A 3QAGA 1OE7A 3ZYWA 1K0CA 3C73A 1O85A 3BCIA 3ZVJD 2IIYA 1A0FA 5F8BA 3GUSA 3FYGA 1EP8A 4MF5A 1SK1A 3D4MA 1XFLA 2VIMA 1LJRA 4HQZA 2IMEA 2C4JA 3KTBA 2HI7A 1XOBA 1TI3A 3W6GA 3KP8A 3KZQA 3BD2A 2ZUPA 1QK8A 4OFTA 4K0NA 5CP1A 1PL1A 2A4VA 2LRTA 1X5DA 2X99A 4KB3A 3APSA 2DJ3A 3CTGA 3TDGA 2B5XA 5ECQB 2JADA 2OKAA 5DBQA 1A2JA 3E3EA 2H6YA 1V58A 3ERGA 3M8NA 1YF0A 5HFIA 2XHFA 1JFUA 3LYPA 1B4PA 2DIZA 5CREA 1THOA 3KGKA 3GTUB 5EL8A 3HZ4A 4EC0A 1Y6EA 1XWKA 4RQRA 3HD5A 4YQMA 3GV1A 1X5EA 1M2AA 2LQQA 3G7YA 2WZ9A 4K7IA 1MDJA 1F3AA 2G2QA 2GT6A 1NM3A 4V1Ag 2PBJA 3HA9A 4BVXA 4WETA 3UIWA 3HJPA 2B1LA 2PWJA 2B5YA 1EV9A 3FK8A 3FR6A 1A23A 4POLA 4NMUA 1BX9A 5DQSA 2PVOC 4YQVA 5AN1A 1URMA 5A5KA 3BOAA 2IFQA 2LJKA 4EL1A 4ECCA 4ZL9A 1XXUA 3Q19A 3M1GA 5ID2B 4G10A 1YDKA 1PGTA 3EYTA 1K3LA 2PUKC 5IOXA 2KP1A 2P0GA 3UJ1A 4PQIA 2OE0A 1QQ2A 4NXIA 5DCHA 1QGVA 2WGRA 2MYGA 4MJAA 4O5RA 4ECBA 5EVOA 5DJLA 4P3YB 3RHCA 1VF1A 1JLWA 3QAVA 2H76A 1FVKA 3GKXA 2F51A 4IELA 3GN3A 3HVVA 3O76A 1A8YA 5CRDA 1X9MB 2K9FA 2X8HA 4XTSA 4KDYA 3DXBA 1VRSD 4RUVA 1U3IA 3RPNA 3EURA 3VWUA 1HYUA 3D22A 4PX1A 12GSA 3PINA 3LGCA 14GSA 4KE3A 5KN2A 4Q5NA 4KAEA 2CA8A 1MEKA 2L6DA 2JZRA 4DSRA 3CMIA 2VM2A 3KM6A 3ZL5A 2O8VB 3ZREA 3CTFA 3GX0A 2PVQA 3DKSA 1XW6A 3APOA 1F9MA 1OVNA 3LEFA 1K3OA 2C80A 4K0GA 5D9VA 3P90A 5ECOB 1KBNA 1GH2A 4V2NA 1BG5A 5IMAA 11GSA 5D9XA 5ECSA 1XWAA 1U6TA 2CVDA 2BTOT 4KCEA 1ACVA 3GKNA 2YV9A 4QQ7A 1IYHA 3HJOA 1NHYA 4FIWA 5DAKA 4FH8A 4TKYA 4BPYA 1SK0A 2EIRA 2P31A 1MTCA 3CBUA 2VCQA 4O32A 1B48A 3WYWA 3PH9A 4AJ6A 13GSA 2DMMA 2GQKA 2CX3A 2O89A 2A2RA 1SL2B 2X8GA 2H0HA 3F6FA 4ZB9A 3EU3A 1ERWA 1ZYEA 5ECIB 2C0GA 3FHKA 2OBKA 3F9UA 1CQHA 2R6KA 3IDVA 5EY6A 2K8SA 3G9BA 3KCMA 3QOUA 2LRNA 5IO0A 4Q5QA 5G31A 2H6XA 3EMXA 1Z6MA 1LU4A 2KLXA 3V1WA 3H8QA 3W8JA 4XS6A 4POMA 3TJBA 5IPHA 1Z7RA 5D73A 2VCTA 4E8HA 4D73B 3EWLA 2CV4A 1TP9A 3R2QA 3LJRA 3CRUA 3VI5A 1RQMA 3D5JA 5AIXA 4AJ8A 2X64A 3M9JA 4FYBA 5COHA 4MLYA 5DALA 2R37A 1XVWA 2WULA 4YAPA 3M3MA 3D6IA 1FB0A 2DC5A 3F4RA 17GSA 3IOSA 3FR9A 5KEJA 3ZTLA 2YZHA 4HZ2A 4LMVA 2OJLA 1OKTA 4KDUA 1R5AA 1YKAA 2B5EA 4MDCA 3VI7A 2LV3A 4JR6A 1SJZA 2VOCA 3KH7A 1YQ1A 3TJJA 1TXXA 2GZZA 5B8BA 4TOPA 4CW9A 2NPBA 2C3NA 3E0UA 1ERUA 5AIVA 1UN2A 3TRQA 2PGTA 2GSTA 3P8WA 2CZ2A 3IRAA 5CNWA 3ERWA 4GXZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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