3F4RA

Crystal structure of wolbachia pipientis alpha-dsba1
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
TSNELLLPLPNDKLLGDPKAPILMIEYASLTCYHCSLFHRNVFPKIKEKYIDTGKMLYIFRHFPLDYRGLKAAMLSHCYEKQEDYFNFNKAVFNSIDSWNYYNLSDLTLLQRIAALSNLKQDAFNQCINDKKIMDKIVNDKSLAINKLGITATPIFFIKLNDDKSYIEHNKVKHGGYKELKYFTNVIDKLYGKAIVKLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Characterization of the Oxidoreductase alpha-DsbA1 from Wolbachia pipientis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative uncharacterized protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Wolbachia pipientis
total genus 76
structure length 199
sequence length 199
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13462 Thioredoxin_4 Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.40.80 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 Ribonucleotide Reductase Protein R1; domain 1 3f4rA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f4rA01
4IGJA 2XC2A 2H01A 2IFQB 2LSTA 3WT1A 1BJXA 3QFAC 4IKHA 4IN0A 3NZNA 1V40A 3WYWA 3F4TA 2R6KA 4NV5A 2YV7A 4RQXA 1GSQA 1FVKA 4MF5A 2QSIA 3HJMA 2HI7A 2IMKA 3F4SA 3TKQA 1MEKA 2HZEA 2PUKC 1WJKA 3F6FA 3CSJA 3HHVA 4DSQA 5C00A 4FO5A 5B8AA 2MBTA 4PUFC 2ZNMA 4ZILA 1LJRA 2HZFA 1BAYA 4JBBA 4XS4A 3GUSA 2LS5A 2YWNA 1F3BA 3F3QA 2DJKA 3ERFA 2GQLA 6GSUA 1YF0A 1GUHA 2WZ9A 3LFLA 1PX7A 1X5DA 2ZCTA 3UARA 1J0FA 2K8VA 1A23A 2R5GA 4F0CA 3HY2A 1S3AA 3APQA 3HYPA 2M46A 1K0OA 4KCEA 5J5NA 4HZ2A 10GSA 3VI5A 5J41A 2YJ7A 1K0CA 1XIYA 3KXOA 4PURA 3GKNA 4HJ2A 2JACA 1F2EA 3L9UA 5LD0A 2KP1A 2C3QA 1CQGA 4NV2A 4EE0A 5IOXA 1TDIA 1JZWA 4FH8A 2DLXA 5A4VA 3EU4A 1OC8A 4YQMA 3ZTLA 3D5JA 2GDRA 5G1LA 1URMA 4IVFA 3TOUA 4KX4A 1Y6EA 4GQFA 3GIXA 2B5XA 4TRXA 3CTFA 3F8UA 3WT2A 3M0FA 3LYKA 3FW2A 3IK9A 2VOCA 5IPGA 2OBKA 1T3BA 4DSSB 3HA9A 2QGVA 2GSQA 2IPAA 2DJ0A 3GURA 4K2DA 2O7KA 9GSSA 3ZVJA 2IFQA 1R7HA 1GL8A 3KEBA 5FHIA 1FVJA 4K0NA 6GSWA 2I4AA 4WF4A 4EF0A 2MZCA 3HCZA 3ED3A 2VL2A 3N5OA 5KEJA 4I2UA 3APSA 2ZUPA 4O32A 3VPQA 1EWXA 2B1KA 1GTAA 5B8BA 5IPHA 3CBUA 1ZGNA 5JCWA 4ECJA 5ELGA 4HUAA 2PGTA 2A4VA 3ZLPA 4Q5NA 4JZQA 4TW5A 3TJJA 3LQ7A 4K7IA 2VL2C 3FZ5A 5ID2B 2KUCA 1BG5A 4LL1B 1Q4JA 4Z7XA 1BX9A 1H75A 4K0GA 3H93A 3VWUA 5CREA 5ENUA 1F37A 3FY7A 5CAXA 3GH9A 8GSSA 4N0VA 5DALB 2MMZA 3H4KA 2VLUA 4JEDA 5ECNB 1JLVA 3WD6A 3UBKA 3FZ9A 1O8XA 3FK8A 3GTUB 2CX4A 2I1UA 2GSRA 3VK9A 2IMIA 4I2TA 2TRXA 2K8SA 3IXRA 2LRTA 4MJBA 2H66A 2C0GA 1V57A 3GNJA 3L78A 1XCCA 1GTIA 2ON7A 5ECLB 1O8WA 1WWJA 4ISDA 4GTUA 3Q6OA 7GSSA 2YCDA 3C7MA 3F9UA 1RW1A 4TN8A 2LRNA 5F8BA 3HJPA 3QMXA 2E2GA 1ST9A 3I69A 4V1Ap 2DJJA 4F9ZA 2VD0A 2R37A 2YNXA 3N9JA 4GCIA 1DBYA 5AIVA 1YKAA 4DSSA 12GSA 1XOAA 2L4QA 5AIXA 4DEJA 5D8IA 2F9SA 5DAKB 3EC3A 1R5AA 2QKEA 3CSIA 3V1WA 3VURA 3TB2A 1M2DA 4YQVA 2HSHA 1TRVA 2YV9A 3DWVA 5EVOA 5KN1A 4EC0A 3TJGA 3BJ5A 3BCIA 1O81A 2J9HA 1EP8A 3A3TA 3F4RA 1EP7A 2GQMA 1B9XC 1PQNA 2B7JA 2QC7A 1JZRA 3UBLA 3F6DA 2VLVA 3NOFA 2H0GA 4X0XA 1K3LA 4PQ1A 1PN9A 2EIQA 2PERA 1EV4A 2H0HA 4I6XA 2C0FA 3P8WA 1BYEA 3LSZA 4ZB6A 3U6VA 18GSA 2HNLA 1XBSA 4TR0A 5F07A 5ID2A 1K0AA 1O85A 1QGVA 3FR9A 1A2MA 4JE1A 4KAEA 1B48A 1TU8A 3E9JB 5GSTA 3CRTA 1MDKA 5DALA 3UIWA 1MD3A 1X0RA 3QAVA 2KHPA 2RIIA 2H75A 3GTUA 1YEPA 1PA3A 1UA5A 3BOAA 1OE8A 3D0ZA 3IK7A 3UOMA 4GSNA 2PVOC 1JZDA 2YZHA 4CDOA 3CXGA 1USBA 2DMMA 4WKWA 3HVVA 1T00A 3EVIA 5IMDA 5IO2A 2FGXA 3UJ1A 1U3AA 5ELAA 1THXA 1NHOA 2LTKA 4MPGA 2DIZA 1FB0A 1TK5B 3TRXA 4ZBDA 4ML6A 2FLSA 4NMUA 2RUEA 2B6MA 4XS6A 1XOBA 4ULXA 5DAKA 3ISOA 4L0UA 3RDWA 1THOA 3GKMA 3DIEA 5DBQA 1OVNA 1TI1A 2LJKA 3A5WA 1GSUA 1J9BA 3TRPA 2NVLA 3TKRA 5CO3A 4XTSA 5HQPA 4PNGA 1ZZYA 1XPVA 2C3NA 2O89A 1U88A 1GRXA 4G2EA 1XVWA 1TP9A 1SK1A 4DVCA 2GZPA 2WGRA 2LJAA 2PMTA 2YN1A 2CX3A 1XW6A 2DC5A 1FW1A 3LYPA 1XFLA 4KDUA 5G31A 3LXTA 3ZIJA 3GA4A 5H5QA 2RLIA 4YAVA 2H76A 5HFKA 1R4WA 4N11A 5G30A 1BEDA 2IN3A 4K1FA 1G6YA 4YQUA 1T8EB 3GX0A 5J4UA 2KOKA 2VO4A 5D9WA 3IHQA 4IQ1A 3HZ8A 3DXBA 4MPFA 3HKRA 1Y25A 4OMVA 1ZYQB 5DJLA 1GLPA 2E7PA 3VWWA 2EIOA 3GSSA 2PBJA 5B7CA 2TRCP 2FD3A 4V2NA 1SYRA 2GSTA 4XRDA 4MCUA 1GUKA 3ZVJD 5G5FA 3P7XA 3DVWA 3C73A 4ECIA 2F51A 4WF5A 2GGTA 1EOGA 1KNGA 2WB9A 3LWAA 2WDUA 4BA7A 3DVXA 4TXOB 5E4WA 3ZMKA 3WGEA 5KN2A 1N8JA 3VPTA 4OCFA 4ECBA 4NAXA 1VF1A 4KNDA 4IP1A 3ZMLA 4IW9A 2VM2A 3KMOA 4MZBA 1SU9A 2EC4A 3IR4A 2ON5A 2LNTA 3GYKA 2C0DA 3M8NA 2DJ2A 4XS1A 4CW9A 1JFUA 3OR5A 4TOPA 3KP9A 2AHEA 2R3XA 4GXZA 3IC4A 4WR5A 4V2MA 3QOUA 1H4OA 2O85A 4WEYA 5CRHA 2OKAA 5IM9A 4ZB9A 4QQ7A 3QFBC 20GSA 2C80A 4IJ3A 2NPBA 3KTBA 4KW6A 4NPBA 2MMAA 4HEA2 5HR1A 5DQYA 1TI3A 6GSVA 1U6TA 2YZUA 1NHYA 5AISA 1GH2A 2XBQA 4RI7A 1GTBA 4JRRA 3DKSA 2FA8A 2OE0A 2FNOA 1ERUA 4EXJA 4NWYA 5A4WA 2VM1A 1SJZA 3KGKA 5G1KA 1WRYA 3GN3A 1PD21 3TUEA 2H73A 4TVEA 1AQVA 1RQMA 2VCWA 4O92A 2F3MA 2GVPA 4OWYA 3EWLA 4LLRA 1M2BA 3HJOA 4TR1B 4MF7A 2X64A 5GAPD 5B6NA 1EEMA 2ALBA 4TXOA 4O7HA 1U87A 3HDCA 5COHA 5KN3A 1S3CA 1E2YA 3L0HA 3KD0A 2AJQB 5ECRB 1AC1A 4MA9A 4JU5A 2VCQA 3L9VA 2D2ZA 4TR4A 5JCGA 3LJRA 3CYNA 3IPZA 2F8FA 2IMDA 2P31A 1GSYA 2F8AA 2JADA 2R2JA 2L6DA 1AAZA 1WMJA 4HZ4A 3LG6A 3D21A 3TOTA 2DJ1A 1T7PB 4F03A 3A2WA 4IJIA 3ZZXA 4BWSA 3KH9A 3FR6A 4BWQA 3JCML 3G7IA 2GT6A 2MMOA 1W89A 3QAGA 2PU9C 5DVBA 2L5OA 3MNGA 1EOHA 1FAAA 3GKXA 2A2SA 3CTGA 1G7OA 4OFNA 3NIVA 2HT9A 4PQHA 5JCUA 4AJ6A 2H1DA 2X8GA 1VF2A 1ML6A 2WFCA 3TKSA 1NW2A 5AGYA 1TTZA 2C1YA 4HQZA 3D4MA 1NM3A 3ZITA 3TKSE 4KSMA 3QD9A 5F05A 2FA4A 1ACVA 3DEXA 6GSYA 2MYGA 3L4NA 4MF6A 3H1NA 4LMWA 1JLWA 2PPTA 4E8EA 3H8QA 1GULA 4PXOA 2WS2A 4MJEA 4V2LA 1X9MB 4KDYA 2BMXA 3TKSC 4WBJA 1XWGA 4GSTA 1EGOA 1K3OA 3KIJA 1OE7A 2LNSA 2LQQA 2YANA 3C71A 2JZSA 1FOVA 4MLYA 5A5KA 4WETA 1SL1B 1VF3A 5ECOB 1TRSA 2GS3A 4TR1A 1FB6A 1HYUA 4WR4A 3UEMA 2Z9SA 1K0BA 1KBNA 2IMFA 5DCHA 3I43A 2YJHA 3LEFA 1XWCA 3FZ4A 5D9TA 4EL1A 3QPMA 2GZYA 2JU5A 1OKDA 4BPYA 5HFIA 2B3SA 6GSSA 1GLQA 4MDCA 3BD2A 1A24A 4GWRA 4K7NA 2XPDA 4N0ZA 4GF0A 1GWCA 2YWMA 1XVQA 2X8CA 2DJ3A 1Z6MA 2H74A 5CP1A 5IOWA 1X9WB 4WBRD 1SKWB 3MSZA 2JSZA 1FO5A 1ON4A 5H5SA 1Z5YE 3GX8A 2OE1A 4Q5RA 2DSAA 4TXVA 2X99A 2CZ3A 2DBCA 3PR8A 1XXUA 2L5LA 2C0EA 3ZFBA 1A2JA 1OC9B 3VFIA 2M80A 1QQ2A 1LU4A 2VIMA 3BCKA 4XCSA 1F6MC 1SKRB 4FYCA 2V1MA 1SD9A 3UVTA 1GP1A 2I9HA 2L59A 1B8XA 5ABRA 2E2MA 3F3RA 5ECIB 1R5PA 2AV4A 1LBKA 4ID0A 2JL4A 4ZL8A 1XWAA 1MD4A 3IAM2 3MDKA 3MWHA 4HU9A 1A0FA 4OCEA 4NHZA 1AQXA 2H71A 2HYXA 1QMVA 2H8LA 4KA0A 3VI7A 17GSA 1SKSB 2L57A 1XW9A 4ACSA 4MABA 3QCPA 4X43A 3CRUA 3G7JA 4K8MA 5AN1A 5FWGA 5INYA 3C1SA 1B4PA 3RPNA 4GQCA 1M9BA 4IS0A 1G6WA 2K18A 3IE3A 3QR6A 1UVZA 3RHCA 4EDYA 4BVXA 4RQRA 1ZYEA 6GSXA 1A8YA 1M7TA 1Z7PA 2P5RA 4POBA 2FWEA 3P2AA 2JZTA 3LORA 3ZRDA 5D9VA 2VL9A 3C8EA 3H79A 5IMVA 1SK2A 4ZL9A 3IAS2 5EPFA 3EU3A 11GSA 1XWKA 1TW9A 2FCHA 1SJIA 4AGSA 2VCXA 4CHSA 3MAKA 1A2LA 4KE3A 4ILFA 4IP6A 3TJFA 1K0NA 1PX6A 2CVBA 4ZB8A 5IO0A 2A2RA 2V2GA 5G2ZA 1IYIA 4K9ZA 2LRCA 2NTOA 4ZIJA 1G0TA 2AYTA 2XPEA 4PX1A 1X5EA 1OYJA 2CT6A 1V98A 3GRXA 1Q98A 4NHWA 4LA1A 1OC9A 2V41A 2V6KA 3K8NA 2HLSA 4ML1A 3TGZA 3CMIA 1MDIA 4AJ8A 1CQHA 1SL0B 1EZKA 3CSHA 3Q74A 2CVKA 4OFMA 3FRCA 4HOJA 4EVMA 5CRDA 5ECQB 2N5BA 2L4CA 1Z7RA 4KH7A 2FUG2 3EMPA 4KCAA 1QXHA 4Q5FA 2O8VB 2PN8A 6GSTA 5EY6A 1GUMA 3ZREA 2AUVA 4G19A 3GL5A 2C8UA 1XW5A 4LMVA 4PGTA 2C3TA 4KSOA 2IJYA 1F3AA 1SJ6A 2B5YA 1ERWA 1R26A 1QK8A 3UL3A 3EINA 3KCMA 2WRTA 2VLTA 5IIZA 1DUGA 1Z3EA 5F0GA 3ERGA 1O6JA 1AXDA 22GSA 1XWBA 1EV9A 1PKWA 2N5FA 3ME7A 1X5CA 2HE3A 2AAWA 1B4QA 5H5RA 3M9JA 2JSYA 1SENA 4V1Ag 2HSYA 3D22A 2CV4A 1EEJA 5HR0A 3O6TA 2GT5A 3Q18A 3I6AA 2RM6A 4ZL7A 4K6XA 1I9DA 2VCZA 3EYTA 3PH9A 2CVDA 4GSSA 4PUAA 1WE0A 5IMAA 1HNCA 2IL3A 4N30A 3EMXA 1JZOA 1IYHA 4QL9A 13GSA 1DE1A 1BQ7A 3TJBA 4OO5A 1OC3A 2HFDA 4J2FA 5DCGA 5GAND 1UC7A 1DSBA 1Z9HA 4GLTA 5JWOB 2FWHA 1XZOA 2VL3A 3FHKA 3GH6A 2YWIA 4O5RA 3O3TA 4YH2A 5ECKB 2E0QA 2KP2A 1K0DA 3M1GA 5DDLA 2H1AA 2LJRA 5JWRB 1DE2A 2AB6A 3RHBA 3HXSA 2K9FA 2BTOT 4P3YB 3QAWA 3UMAA 3U5RE 3UVHA 1W4VA 3WGDA 4GRFA 3IRAA 4XIHA 4F0BA 4TR3A 2GQKA 3FKFA 2YWOA 2O87A 4D73A 1OKTA 1ABAA 1M0UA 3IBHA 3KH7A 2V32A 5D93A 3I9V2 2MBSA 1T1VA 4HJMA 3IA1A 1SYXA 1Z6NA 1AW9A 1MTCA 1SK0A 1ERVA 2H30A 4ZBBA 3IDVA 4OO4A 1VRSD 2DIYA 4L8EA 1YY7A 4I97A 5LCZA 3W8JA 3TDGA 3A2VA 1TXXA 4H86A 3S9FA 1M2AA 4EKZA 4G9HA 4QL7A 2CAQA 1YF1A 3ME8A 5D96A 5GSSA 1PL1A 3GKKA 3FR3A 3F0IA 2TIRA 2GZZA 1TK8B 4X1UA 4BVYA 2H6YA 1GSFA 3ZFLA 3J7Yb 5C04A 4POLA 4OD7A 2B1LA 2V6OA 3HVSA 1ILOA 1PRXA 4FIWA 1FG4A 1HD2A 1PKZA 2DMLA 1HQOA 3M3MA 2YP6A 5D9XA 3KP8A 1OAZA 1TRUA 4MH3A 3HVXA 4HDEA 5IMZA 2HRFA 3GFKA 1GSEA 4OFTA 3D6IA 1QFNA 3DRNA 2GTUA 1KEBA 4MJCA 3ERWA 2H0IA 2WJUA 5KN0A 4YAPA 3VLNA 3WGXA 2IMEA 4NXIA 4POKA 5GZZB 1SL2B 3LXZA 5G5EA 3DYRA 3HD5A 1YDKA 2HXKA 5E59A 5ECHB 4KUNA 4MP4A 4XRAA 1MDJA 5L71A 1VGLA 4BL7A 3D4TA 3TRQA 1V9WA 1EGRA 1A8LA 3SBCA 3ZIVA 3LGCA 2P0GA 2B7KA 2LEGA 2R4VA 3KZQA 1ERTA 5HR2A 2H70A 1V2AA 1YEXA 1ZL9A 5CNWA 4ECCA 5IMCA 2H19A 2OJLA 3GHAA 1O73A 2YOIA 2OADA 2X8HA 1WOUA 4N10A 3VWXA 5DQSA 4L0WA 1ZOFA 2OACA 3TCOA 1JHBA 2LUSA 1T4YA 3TJKA 1YKCA 2OBIA 4HI7A 2CAIA 4ZXGA 3J7Yk 1PSQA 4WXTA 4J56E 2VAFA 1NSWA 5A4UA 2XHFA 1X9SB 2N5AA 4HS1A 4E8HA 5D73A 1T4ZA 4RI6A 3DD3A 3GL3A 2GSSA 16GSA 4MMMA 4MZCA 3W8SA 2PVQA 2EIRA 4DSRA 2M72A 1PMTA 2VD1A 1K0MA 4EO3A 4XHMA 1SD8A 1AQWA 4POMA 2KLXA 3QDNA 2I3YA 3HZ4A 5IMFA 2BJXA 2K6VA 14GSA 4IELA 4I5QA 5J3RA 1TOFA 1AIUA 2CQ9A 1KTEA 1TRWA 1E6BA 1J08A 2H1BA 1F9MA 5CYYA 2NBSA 3APOA 4IBPA 1V58A 2CA8A 3ZL5A 3L9SA 4RUVA 1S3DA 4FYUA 3KMNA 5J9CA 2REMA 2C4JA 4FYBA 4EDZA 2CZ2A 3R2QA 5CRWA 3Q19A 1PL2A 2FWFA 3VWVA 2MMNA 1O7UA 3ZYWA 4TKYA 3TKPA 2B5EA 2NDOA 4JR4A 3DGQA 4L5LA 1YJ6A 4KDXA 2JZRA 2J23A 3IOSA 5IQYA 2FWGA 2H6XA 2ES7A 5ECSA 1WPIA 1YZXA 1GNWA 1GSSA 2IIYA 3RAZA 3IV4A 2GLRA 2PWJA 5J9BA 2G0FA 2RUFA 4MJAA 3EURA 4Q5QA 4HQSA 4PNFA 4MH2A 3RBTA 5HR3A 1WIKA 4HU7A 3M9KA 4F82A 2XBIA 3P90A 4G10A 2IWTA 3UAPA 3KTLA 1TU7A 5FT3A 4ZBAA 3RPPA 1A0RP 3EE2A 3PINA 3G9BA 3E0UA 3W6GA 2VCTA 1GTUA 5DJMA 4AF2A 3PGTA 1GSDA 2HZEB 4K7OA 4KB3A 3US3A 3GSTA 4J57E 1PGTA 3O76A 2LQOA 4EUYA 19GSA 1I5GA 1HNAA 5ECMB 4XS4B 3DMLA 5F06A 2L6CA 2OA7A 2H1GA 5EL8A 1RK4A 2LKUA 3GV1A 1N2AA 4AJ7A 1U3IA 2FY6A 3G7YA 2YPMA 1ZCPA 4F2IA 1WP0A 4LL4B 3KM6A 5HFGA 1M99A 2WULA 3SWLA 4D73B 1VF4A 4JR6A 2H72A 1B9YC 3KJYA 1YQ1A 4IQAA 4PQIA 4MZWA 3FEUA 3BBYA 2VUPA 1K3YA 5ECPB 5JWQB 5B6MA 3AY8A 2LV3A 2G2QA 3A2XA 3FYGA 4MK3A 2VCVA 4I8BA 2OE3A 4L5OA 3FZAA 4KGIA 4IHUA 1AUCA 3GMFA 1G7EA 2RM5A 1TKDB 1GNEA 5CRGA 2HRNA 3C1RA 1TJDA 3E3EA 1QUWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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