1YKAA

Solution structure of grx4, a monothiol glutaredoxin from e. coli.
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
MSTTIEKIQRQIAENPILLYMKGSPKLPSCGFSAQAVQALAACGERFAYVDILQNPDIRAELPKYANWPTFPQLWVDGELVGGCDIVIEMYQRGELQQLIKETAAKYKSEEPDAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
publication title Molecular mapping of functionalities in the solution structure of reduced Grx4, a monothiol glutaredoxin from Escherichia coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords monothiol glutaredoxin ydhD
total genus 27
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-01-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ykaA01
3D0ZA 4ECBA 1BAYA 2DIYA 3US3A 1GNEA 3UBKA 3Q18A 1XWAA 4N0ZA 3HDCA 4PNGA 4TR1A 2IFQA 3KGKA 3PGTA 1K0NA 4PX1A 4HQZA 2AHEA 2FY6A 2O8VB 1ZZYA 4V2MA 1S3AA 4P3YB 4F03A 4FIWA 4GXZA 3GKKA 2H1DA 4MF5A 3IXRA 1HYUA 1XW6A 4DSRA 3ERGA 4J56E 2GQMA 2H75A 2VCZA 4MA9A 5FWGA 1PKZA 4MJEA 1MD4A 1NHYA 4HDEA 3GRXA 4NHZA 5G5FA 3EYTA 1SK0A 1SKSB 1MDKA 1XZOA 1QMVA 3NIVA 4IP1A 2VLVA 2L6DA 1SENA 3HJOA 4K7IA 1IYIA 2IMKA 3KCMA 2AJQB 5E4WA 4GCIA 3HXSA 2FLSA 3D4TA 2Z9SA 2GGTA 3D6IA 2RUEA 3I43A 2X8GA 4GRFA 1O8XA 4HEA2 3TRQA 2B5XA 5B8AA 5D9VA 1JZWA 1R4WA 2B1KA 5DALB 5A4VA 5DQYA 9GSSA 1PA3A 1DBYA 2HNLA 1JZOA 4WETA 4EO3A 1TK0B 1GH2A 5G31A 2JL4A 5DAKA 2KP2A 3CXGA 1JZRA 1TU7A 1OE8A 3V1WA 4YAPA 3TJGA 3LWAA 1ERWA 3UAPA 3I6AA 3DMLA 3EINA 4MPGA 2VCQA 3FZ5A 1YEXA 2YOIA 1B4PA 1XWKA 3TOUA 4ILFA 5IMVA 5A4WA 3RHBA 4KDYA 2H74A 1R7HA 3MDKA 3QCPA 4HZ4A 3PH9A 3ZRDA 5F05A 4ECCA 2HZEB 4BL7A 2L4QA 1HQOA 5ELAA 5KN2A 3VWUA 1O73A 2YJHA 1GLPA 4K1FA 2EIRA 4G10A 4FO5A 5DJMA 2EIQA 2HRFA 1WE0A 6GSXA 1Z7PA 2TIRA 1PKWA 2ES7A 5IMAA 2WDUA 4KW6A 1QUWA 1ZOFA 2KOKA 2AB6A 4IQAA 3ZIJA 3F0IA 3ERWA 4XRDA 1QFNA 4V2LA 11GSA 2WB9A 3N5OA 1PGTA 3GH6A 4NXIA 3TKSC 1SL1B 2VO4A 2WS2A 4KCAA 4ZBBA 3QPMA 2DJJA 1XWCA 4BVXA 1B9YC 2PGTA 4CDOA 2PVOC 5D96A 2F9SA 1WOUA 4IHUA 2H6XA 2YPMA 4QL7A 5CP1A 5DQSA 1G7EA 4GF0A 1OE7A 1VF3A 4LMVA 1OAZA 4HJ2A 3IAM2 4IJIA 2C0FA 2R5GA 2A2RA 1U3AA 2E0QA 4TXOA 5IM9A 4YQMA 2VOCA 1JHBA 2WJUA 1YKCA 3QAGA 4O32A 3I9V2 2K8SA 5JCGA 3GKXA 4KDXA 3MNGA 1V9WA 5ABRA 1THOA 2YZHA 2H01A 3GTUB 1V40A 3FHKA 3ZFLA 4MF6A 1U88A 2LKUA 3MAKA 2BJXA 1DSBA 3RAZA 5KN3A 4EE0A 1B48A 3WT2A 1X9WB 2YWNA 4HQSA 1FO5A 4X1UA 1JLWA 2DBCA 4LL4B 5HR1A 3TB2A 3GYKA 2WGRA 4F0CA 2LJKA 1A23A 3FR6A 4OO4A 2XPEA 3KD0A 4BA7A 7GSSA 4DEJA 1F3BA 5KN0A 4MJAA 3G7YA 3U5RE 1OC3A 4OMVA 5ECIB 3L4NA 3KP9A 4OWYA 3LSZA 4RI7A 2GZYA 1MD3A 3DVXA 4EVMA 2YV9A 1C72A 5IIZA 3VURA 2ZNMA 3TRPA 3A2WA 4ECJA 1GULA 4POLA 2GLRA 3GN3A 5L71A 1NHOA 1PL1A 3IDVA 1I9DA 1Z6NA 4EXJA 1H4OA 4N11A 1R26A 2K8VA 1AXDA 4MPFA 1HD2A 4K6XA 4IELA 1GSYA 3C1SA 3DXBA 1YEPA 2GDRA 2LEGA 2OKAA 5ECKB 3UIWA 2L57A 4MLYA 1SYRA 5IMCA 1SYXA 4RI6A 1OC9A 4OFNA 3C73A 5ID2B 1U87A 3H1NA 3R2QA 4PUFC 4QL9A 2LJAA 6GSTA 1K0OA 5HQPA 1THXA 1OVNA 2V32A 4IP6A 4POBA 2LUSA 2V2GA 1XOBA 3RHCA 3CTFA 1B4QA 2CAQA 3IK9A 1R5AA 4TW5A 4NPBA 2WCIA 5ECLB 2IN3A 3DRNA 4V1Ap 1GTIA 2LQOA 3ZMKA 5C00A 3HHVA 2I81A 3HZ4A 4NMUA 3F6DA 4KSMA 1ZCPA 4ZILA 4LMWA 1G0TA 4JEDA 5KEJA 1A0RP 1QQ2A 4Q5RA 4AF2A 4L8EA 5INYA 4MZBA 3UBLA 1KTEA 2M46A 3WGDA 3UOMA 4DVCA 1TK5B 2X64A 4TRXA 2H1BA 1AC1A 4L5OA 5CRHA 3D4MA 4HJMA 1GLQA 2X8HA 1BJXA 2YWMA 4KGIA 1SL2B 4N10A 1NSWA 3W8JA 2BTOT 2H1GA 2A4VA 4PNFA 3SBCA 4I2UA 3LYPA 5C04A 1SK2A 1GNWA 1PSQA 2LRNA 3P90A 3QFBC 1GTBA 5IOXA 2RIIA 1ON4A 1CQGA 1A0FA 3SWLA 6GSVA 3JCML 2NTOA 5FT3A 4JBBA 1M2DA 1WPIA 1Z6MA 2H76A 1G6YA 4I8BA 2B3SA 1YJ6A 3O76A 2FA4A 3A2VA 2E7PA 3EU3A 2PPTA 1Q4JA 3K8NA 2JZSA 1E6BA 1U6TA 1U3IA 2H1AA 3HVXA 3DIEA 5IMFA 3ZVJA 2H73A 1WRYA 1XW5A 4K9ZA 1X5EA 5CRDA 3GH9A 2GT6A 2CAIA 3ZFBA 10GSA 4IKHA 2HXKA 4X0XA 3BCKA 1A2JA 2YNXA 5DALA 4MK3A 3ZZXA 3EWLA 1VGLA 5ECOB 3L0HA 2XHFA 5D9XA 3GSTA 4ZB9A 3TOTA 3TJJA 5D93A 1OYJA 2FHEA 3TJBA 3FZ9A 3VI7A 1TP9A 1SJ6A 2G0FA 3ZYWA 2YANA 4G2EA 4BWQA 4PQIA 4BPYA 1WMJA 4MH3A 3A5WA 5D9TA 2B7KA 1KNGA 4BWSA 5H5RA 2CVDA 2DC5A 4KH7A 3EMPA 1LU4A 2R6KA 4WF4A 2RM6A 2MMNA 2IL3A 1EGRA 3LEFA 3ZVJD 5H5QA 1BEDA 1TI1A 1K3OA 3VFIA 1PN9A 4RUVA 3WYWA 3HZ8A 5F8BA 4ZIJA 2PUKC 2H0HA 1VRSD 2J9HA 3E0UA 4GSTA 3MSZA 2VM1A 2OACA 2CVBA 2FWEA 4N0VA 3H4KA 5DCGA 2YN1A 5HR2A 4ZL7A 2I9HA 3EE2A 2JSYA 4J57E 5AN1A 2O7KA 1M99A 2P5QA 3P7XA 3TKQA 3LGCA 3DYRA 19GSA 3UVTA 1K0DA 3GURA 1JZDA 1XFLA 1WJKA 3GSSA 3L9UA 5IMDA 1PQNA 5HR3A 2YWIA 2DJKA 3KIJA 4GQFA 2NDOA 5E59A 2O89A 2FWHA 1Q98A 1XWBA 3DKSA 4TN8A 2H6ZA 4DSSB 1DE2A 3D21A 4LL1B 2TRCP 5G1KA 3CTGA 1VF4A 4NAXA 1DUGA 4DSQA 4HU7A 1JFUA 2C8UA 2VL3A 2ZCTA 2GSRA 3HY2A 4POKA 2K6VA 1A24A 3KMNA 1AW9A 3F3QA 1GSQA 3UJ1A 2RLIA 3LORA 1TK8B 4ZBAA 1I5GA 3PINA 5J5NA 3GTUA 3FEUA 1SD9A 1UA5A 4G9HA 5CRWA 1GUKA 4JZQA 1TRSA 4L0WA 4MH2A 2PBJA 1XOAA 4OO5A 2HYXA 4L0UA 5F0GA 2MMOA 1O85A 3FR3A 3CSIA 1M0UA 3IPZA 4K8MA 2DSAA 3CMIA 2VL2A 1GP1A 3Q6OA 2FUG2 3CSHA 4EC0A 3LXZA 3VLNA 3E9JB 4CHSA 4GQCA 2LTKA 1A8YA 1HNBA 1GSUA 1TXXA 2C3NA 2GT5A 2RM5A 2OE1A 2WULA 4L5LA 4ECIA 2GTUA 3KTBA 1EEJA 2B6MA 3J7Yb 2DJ1A 3UEMA 1XVWA 3IK7A 1F6MC 4F82A 2C3TA 2H72A 2YP6A 3PR8A 2GSQA 3LQ7A 1GSEA 3HA9A 2L59A 3GMFA 3P2AA 2AV4A 2JZTA 2MZCA 4KB3A 2M80A 1FB0A 1WP0A 2I3YA 1EV9A 2H70A 2R2JA 2YWOA 3Q19A 5ID2A 3TGZA 6GSWA 4GSNA 4HZ2A 1GUMA 4F9ZA 1O7UA 2MBTA 3HJPA 3HKRA 2K18A 4ACSA 3H8QA 2OE3A 2FWFA 3IC4A 3H79A 5DDLA 5JWOB 5D73A 2VCVA 5EPFA 3KH7A 2GQKA 4YH2A 1QGVA 3DEXA 5B6MA 4QQ7A 3MWHA 1QK8A 2QC7A 5HFGA 1GTUA 4ZXGA 1O81A 4I5QA 5ECRB 2OA7A 1ZMAA 1F2EA 5ECNB 4J2FA 4H86A 3D22A 4K2DA 3BBYA 5J3RA 3F4TA 1GSSA 5J41A 4ZL8A 4TXVA 6GSSA 1TJDA 5AIXA 4PQ1A 5GAPD 2F8FA 1N8JA 3EURA 2IWTA 1MDJA 3C8EA 2DJ2A 4WBRD 1MEKA 4HI7A 4BVYA 5A5KA 4FH8A 4OFMA 2GZZA 5IO0A 3KH9A 3ZL5A 5IOWA 5GSSA 2DJ0A 3IHQA 2CA8A 4XS4B 2P31A 2PN8A 3TKSE 2VD0A 3KJYA 2IMEA 5IPGA 4TR0A 1TKDB 3QMXA 3F6FA 1RW1A 3KM6A 1EGOA 4XRAA 3HVVA 3TJFA 2QKEA 3UMAA 1R5PA 4XCSA 5HFKA 2PMTA 3CSJA 2H0IA 4EDZA 3HCZA 3ISOA 5IQYA 1EWXA 5JWQB 5JCUA 2V1MA 3IE3A 3NOFA 1J0FA 4KDUA 1K3LA 1BYEA 4G19A 4IS0A 1EV4A 5AIVA 1H75A 4IGJA 2HRNA 3L9VA 3QFAC 5G1LA 4ZB8A 2BMXA 4Q5NA 1K0AA 4F2IA 4HOJA 5GAND 2NBSA 1XBSA 4IVFA 4WEYA 3TRXA 1FVKA 1ST9A 3GX0A 3ZITA 4ULXA 2LSTA 1CQHA 4O7HA 3FW2A 3I69A 4D73B 2MBSA 20GSA 1XCCA 3C1RA 4PURA 3EU4A 2NVLA 3GA4A 4XIHA 5JWRB 4JR6A 4V2NA 1DE1A 4CW9A 2CZ2A 1TDIA 3GHAA 5J9BA 1TW9A 1E2YA 3VPQA 3CBUA 1GTAA 3G7IA 1OKDA 14GSA 1VF1A 5AGYA 5A4UA 3M0FA 1V2AA 2B5YA 4GLTA 1T8EB 1JLVA 2WZ9A 3S9FA 3FYGA 3UL3A 3A3TA 2L5OA 5ELGA 3KMOA 3BCIA 1ZGNA 3GIXA 2NPBA 3G9BA 1G7OA 4JR4A 1OC8A 1Z3EA 2D2ZA 4PXOA 2GZPA 2XBIA 4RQRA 2VLTA 1Y6EA 12GSA 1SL0B 4KSOA 3E3EA 3APOA 4XHMA 1TRUA 3IBHA 3TCOA 3IOSA 2F3MA 5ECHB 4XS6A 1XWGA 1T4ZA 2H19A 3ME7A 4KUNA 2JSZA 1N2AA 2C80A 2PVQA 5CREA 2ON7A 4RQXA 5LNKe 1ERTA 3KP8A 4DSSA 5D8IA 5ECSA 2LRCA 3LXTA 1XIYA 3F8UA 4ZB6A 1NW2A 3M9KA 4ID0A 4MABA 2VUPA 1SJIA 2LS5A 2HT9A 1AIUA 1SD8A 5CYYA 1PRXA 1KEBA 2MYGA 2H71A 4NV5A 1K0CA 2XC2A 3GUSA 1PX7A 1URMA 2N5FA 2KUCA 1GWCA 3UVHA 4MZCA 1O8WA 2F8AA 5DVBA 4IQ1A 4E8HA 1V98A 1AUCA 5J4UA 1FHEA 3HVSA 1ACVA 1AQXA 4JE1A 2J23A 2AUVA 4TR4A 5CO3A 5DJLA 2FA8A 5FHIA 1PMTA 4OFTA 4NWYA 4KCEA 1SKWB 1PL2A 4HU9A 5ECMB 2HLSA 1KBNA 1O6JA 5D9WA 3FR9A 3WGXA 4K7NA 3GNJA 4ISDA 2HZEA 3FKFA 3FRCA 3L9SA 5KN1A 2ZUPA 4LA1A 3P8WA 1M9AA 4FYBA 4ML1A 1GSFA 3VWVA 3KXOA 1VF2A 1OKTA 2C1YA 5EVOA 1ZL9A 4WF5A 4EDYA 2FCHA 4PUAA 2CV4A 2OJLA 3TKPA 1EZKA 2IPAA 2EC4A 3O6TA 3ZTLA 2DJ3A 2QGVA 13GSA 1GUHA 1J08A 4ZBDA 2OBKA 2VIMA 2QSIA 3ED3A 3HD5A 1GSDA 2VAFA 1A8LA 5LD0A 1Z5YE 1EP7A 4TVEA 3DWVA 2VD1A 1LBKA 1YDKA 2VM2A 3KEBA 3Q74A 2ALBA 2C4JA 6GSUA 1XW9A 3TKSA 3D5JA 2CX3A 5ECQB 1UN2A 3FZAA 5H5SA 4YQVA 3F4SA 4OCFA 2JADA 3KTLA 2PWJA 1F37A 2LRTA 2CT6A 3IR4A 3AY8A 5IPHA 4AGSA 4WBJA 1S3DA 4MJBA 5JCWA 1TI3A 3QAVA 2A2SA 2DIZA 2K9FA 3WD6A 1GRXA 2IMDA 2IMIA 2F51A 4PGTA 1EOHA 4GWRA 4KA0A 2V6KA 4POMA 3ZIVA 1PD21 2LQQA 3KZQA 3QOUA 2XBQA 1SU9A 3APQA 4MMMA 1SJZA 2KLXA 5CNWA 4IJ3A 2R4VA 1WWJA 3VWWA 5HFIA 1G6WA 2FD3A 2KP1A 2WFCA 1B8XA 4OD7A 3GV1A 2E2GA 3IAS2 5G30A 3RPPA 4JU5A 2HSYA 3CYNA 1XVQA 1F3AA 5G5EA 4F0BA 1SKRB 3LFLA 2KHPA 1YY7A 3F3RA 3M3MA 3J7Yk 2FNOA 4EUYA 4O5RA 4TR1B 2IFQB 1UVZA 3RDWA 4K0GA 4XS4A 2H6YA 3VK9A 5LCZA 3LJRA 1X5DA 1FB6A 1XPVA 1FAAA 2REMA 5EY6A 4FYUA 2VCTA 2MMAA 3DGQA 3W8SA 2L4CA 1AAZA 2HE3A 4MZWA 2LNTA 1FOVA 5AISA 2N5AA 3A2XA 3RPNA 2V41A 4MCUA 3APSA 3WT1A 4WR4A 2OBIA 4EF0A 2I4AA 3GL3A 4LLRA 1IYHA 1X9MB 1MTCA 22GSA 1TRVA 2C3QA 2EIOA 3DVWA 2AYTA 4MJCA 2H0GA 3FK8A 3QAWA 4AJ6A 3IV4A 1M2BA 2LJRA 1YZXA 1HNCA 2ON5A 2VCWA 2CX4A 3HYPA 1W4VA 4D73A 4MF7A 1M7TA 2B5EA 6GSYA 1T3BA 2R37A 1K0MA 1T4YA 1WIKA 1FG4A 3F63A 1TRWA 3G7JA 2H66A 3N9JA 3TUEA 3TDGA 5DAKB 4V1Ag 4HS1A 2GSTA 2YV7A 4AJ8A 1GL8A 2I1UA 1NM3A 1ILOA 2FWGA 4MP4A 1TTZA 3CRTA 2HZFA 2C0EA 1LJRA 2E2MA 1ABAA 5B8BA 1EEMA 2O85A 2VL2C 5IO2A 1SK1A 5EL8A 3ERFA 1T1VA 1K0BA 2DLXA 3F9UA 2DMMA 2G2QA 1QXHA 1V58A 4NV2A 1YF0A 1YKAA 1TU8A 1T00A 5COHA 4EKZA 1Z9HA 1ERVA 1FVJA 3GL5A 4K0NA 1ZYQB 1TOFA 3ZREA 3U6VA 1BQ7A 4WKWA 1YQ1A 4N30A 2L6CA 4KE3A 4PQHA 3M1GA 2C0DA 4TR3A 1T7PB 1W89A 3WGEA 4MDCA 2LNSA 1A2LA 2P0GA 1Y25A 4XTSA 4YQUA 3W6GA 3VI5A 2JACA 2M72A 1AQVA 3CRUA 4WXTA 5G2ZA 2O87A 5CRGA 16GSA 3DD3A 5J9CA 4GTUA 2L5LA 1USBA 5F06A 4GSSA 3O3TA 4K7OA 1Z7RA 4NHWA 2R3XA 4KAEA 3EC3A 17GSA 2VL9A 3VWXA 2JZRA 4Z7XA 1BX9A 1PX6A 1MDIA 1RQMA 3GFKA 1B9XC 2H30A 2HSHA 3EMXA 3GX8A 2YCDA 1J9BA 4AJ7A 4TXOB 5B6NA 2HFDA 2DMLA 5DBQA 1UC7A 1F9MA 3NZNA 4ML6A 1XXUA 5GZZB 4E8EA 1X9SB 2P5RA 5GSTA 3LG6A 1M9BA 3BJ5A 2IMFA 2V6OA 2RUFA 5DCHA 2C0GA 2CQ9A 2WRTA 2YJ7A 1ZYEA 2CZ3A 2PU9C 4I6XA 3QDNA 1A2MA 2GS3A 3GKMA 8GSSA 2TRXA 2CVKA 3VPTA 2X99A 1X5CA 2X8CA 4KX4A 3QR6A 2B1LA 3QD9A 4Q5FA 5B7CA 2PERA 4XS1A 2AAWA 2FGXA 3EVIA 1X0RA 1FW1A 2H8LA 3LYKA 1BG5A 3M9JA 3TKRA 2VLUA 5F07A 4ZL9A 4I97A 1M2AA 4JRRA 1AQWA 3FY7A 4Q5QA 2GSSA 3IRAA 5ENUA 3F4RA 3FZ4A 3HJMA 3TJKA 2N5BA 4IW9A 2JU5A 2VCXA 2IJYA 5HR0A 1S3CA 2XPDA 4O92A 4WR5A 2HI7A 3RBTA 4KNDA 3ME8A 3H93A 18GSA 1V57A 3GKNA 4IBPA 3C71A 4OCEA 1YF1A 1EOGA 2LV3A 2YZUA 2MMZA 2GQLA 4I2TA 3ZMLA 4YAVA 2OE0A 4EL1A 2IIYA 4IN0A 1OC9B 3BD2A 3IA1A 3ZLPA 3UARA 4FYCA 1RK4A 3M8NA 1HNAA 5IMZA 1K3YA 2OADA 1EP8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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