3G7YA

Crystal structure of oxidized ost6l
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
153
structure length
153
Chain Sequence
DILQLKDDTGVITVTADNYPLLSRGVPGYFNILYITMRGTNSNGMSCQLCHDFEKTYHAVADVIRSQAPQSLNLFFTVDVNEVPQLVKDLKLQNVPHLVVYPPAESNKQSQFEWKTSPFYQYSLVPENAENTLQFGDFLAKILNISITVPQAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Dolichyl-diphosphooligosaccharide-protein glycosyltransferas
publication title Oxidoreductase activity of oligosaccharyltransferase subunits Ost3p and Ost6p defines site-specific glycosylation efficiency.
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Transferase
total genus 39
structure length 153
sequence length 153
ec nomenclature ec 2.4.1.119: Transferred entry: 2.4.99.18.
pdb deposition date 2009-02-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3g7yA00
4F9ZA 4F03A 5H5RA 3GURA 4RQXA 2VLVA 1YF1A 2RUFA 2FWHA 3ZITA 4TXOB 3F4RA 2CVDA 2V32A 1B9XC 3MDKA 5JCGA 1VF2A 5HFKA 2YN1A 1FG4A 2YV7A 2WDUA 3L78A 5IMDA 3KTLA 3US3A 2PPTA 1PRXA 4NHZA 2LJKA 1SL1B 2RLIA 3NIVA 3ME8A 5H5QA 4OFTA 3UBKA 4EO3A 1J0FA 3GSTA 2MMNA 2NBSA 1SL2B 1SKWB 4EF0A 3EVIA 3I69A 1QK8A 4MJEA 5HR0A 1B9YC 4FO5A 4I8BA 2DIYA 2HLSA 2H75A 5F8BA 2MBSA 3L4NA 2HT9A 4LLRA 5DALA 4I5QA 4L5OA 2LS5A 4XCSA 2HXKA 1B4QA 4ECIA 3RAZA 4MH2A 5AIXA 2R37A 4HJ2A 17GSA 3HVSA 1PSQA 6GSUA 5JWRB 1AW9A 3GTUB 2GZYA 3HJMA 1YQ1A 2ON7A 4MK3A 3FR3A 4L5LA 4ACSA 3OR5A 2A2RA 2N5BA 1ZGNA 3GH6A 2H19A 4BWQA 2MMAA 3ZVJA 2YWMA 4HQZA 4HDEA 5IQYA 3QAGA 2YZHA 2ZCTA 5E59A 2L57A 2OBIA 4KCEA 3UBLA 1GSDA 1XW9A 4JBBA 4MJCA 1V2AA 2AAWA 1QFNA 1V40A 19GSA 3IA1A 4HI7A 4MPFA 2B5XA 2EIOA 1SK2A 3S9FA 4ZL9A 2IN3A 2M72A 2HSHA 1R5PA 2C0EA 5ECRB 2QSIA 3F0IA 1EOGA 2O7KA 4LL4B 1YKCA 1A0FA 1S3CA 3UOMA 4YQMA 2PVQA 5ECLB 3CSIA 3GKXA 1THOA 1XWKA 3GKKA 2QGVA 2WFCA 3GKNA 3CRUA 5JWQB 2M80A 4Q5RA 1SL0B 4K2DA 3VK9A 2HYXA 3TKSC 4POKA 3LYPA 3GYKA 2H6YA 2H76A 3O3TA 3FR6A 1SENA 5LCZA 3IDVA 2WULA 6GSYA 5GAND 1SKSB 1X5EA 2OACA 2OADA 4MA9A 3UARA 2OKAA 1PL2A 1TRVA 1G7EA 4RI6A 3Q18A 1X9MB 4GF0A 2AUVA 3IK9A 3O6TA 22GSA 2V1MA 2YJ7A 5DDLA 5ECHB 4BL7A 3GA4A 3LORA 4NMUA 4PGTA 1JHBA 3HA9A 5B6MA 1SU9A 3NOFA 4WEYA 3TDGA 2JZRA 2YANA 1ACVA 1XW5A 5B8AA 2VO4A 1VF1A 2MMZA 2LRCA 2JL4A 3M9KA 1G7OA 3HDCA 4DEJA 13GSA 2YP6A 5IO2A 1GSFA 3IXRA 1MDJA 3QR6A 4GSTA 2K8SA 4TXOA 1PKZA 4MF7A 5D73A 1X5DA 1K3YA 2TIRA 2L6DA 5JCWA 4EL1A 3TKRA 1R7HA 5IO0A 1XWAA 3JCML 1DBYA 3FY7A 2LTKA 3CTGA 1EEJA 1V9WA 2F8FA 3UMAA 5CRWA 3H79A 2H1DA 2C1YA 1WPIA 4QL7A 3KCMA 1LBKA 2H73A 1U3AA 1EGRA 3HCZA 2FGXA 2E2GA 5ECMB 3VWUA 4KSMA 4F0CA 4PUAA 1DUGA 3D4TA 3C1RA 1YDKA 4DSSB 3HKRA 2FUG2 3EYTA 4MCUA 2OE1A 5IPHA 1FO5A 3GTUA 2XBQA 1ZZYA 4KDUA 3F63A 1NHYA 3D6IA 3IAM2 1E2YA 2I1UA 1U87A 2K6VA 2NTOA 5ID2B 3VPTA 4O7HA 2HNLA 2HZEB 3CBUA 4ML6A 2GLRA 1U3IA 3EC3A 2PWJA 2NPBA 3FRCA 3C7MA 4XHMA 1H4OA 1ON4A 2H71A 2GQMA 2R3XA 1WJKA 4ZILA 3FR9A 1TW9A 1X5CA 4OCFA 1I5GA 2IMDA 4XS4B 3VWWA 4PQHA 3RPPA 3BD2A 2I9HA 2GT6A 2VCQA 3WYWA 4PNFA 16GSA 2JZSA 3P7XA 4YAPA 1FB6A 2N5AA 2PERA 3KH7A 1TP9A 2DJ0A 1XVWA 3O76A 2F51A 2GSSA 6GSVA 5F06A 2A4VA 4MF6A 4OFMA 1GL8A 1PD21 4ECCA 4YQVA 2KHPA 4JE1A 4WF4A 1VRSD 5CAXA 3KTBA 3W8JA 1TRUA 3C1SA 1GRXA 2O89A 1KNGA 6GSTA 3M9JA 3LG6A 2O85A 1XWBA 2B1LA 5CRHA 2NVLA 1SYXA 2A2SA 4K0GA 2DIZA 4GXZA 4IELA 3EMXA 1X9SB 4KH7A 1GSEA 2IIYA 1ML6A 2B1KA 3EU4A 1PX6A 2DC5A 3DYRA 2FLSA 5ENUA 1GTUA 5A4UA 2R6KA 2BMXA 3TKSE 4EXJA 1PL1A 1TDIA 2GVPA 3KD0A 4GLTA 2FHEA 3F3RA 4O92A 1I9DA 3L0HA 2KLXA 1XVQA 2E0QA 2AV4A 2Z9SA 2B6MA 4K7OA 2VL2C 4ZL8A 3HD5A 4Z7XA 3HVVA 4MJAA 3ZMLA 3IBHA 2B5EA 3DWVA 3UEMA 3A2VA 2LEGA 2ZUPA 2KOKA 2F3MA 5H5SA 1TRSA 3GX8A 1PN9A 4PQIA 4H86A 1A8LA 2V6KA 3KMNA 2WB9A 5DJMA 2C0GA 5AISA 5AGYA 1A8YA 2TRXA 3IV4A 4P3YB 4LMWA 2H1GA 6GSWA 4ZB6A 1U88A 2QC7A 4EC0A 1K3LA 1O85A 4E8EA 1J9BA 2P5QA 4E8HA 4OFNA 4GRFA 1ERUA 3QMXA 5DVBA 3TJKA 4DSSA 2F9SA 3KP8A 2CVKA 12GSA 1ERTA 2FWEA 2EC4A 4X0XA 2N5FA 4ZBAA 3EE2A 3C73A 3UL3A 3U5RE 4K8MA 2VLTA 4KGIA 5HR1A 5ID2A 1GLPA 1T3BA 4POBA 4PX1A 2HZEA 1OC9B 3WGEA 1RW1A 2B3SA 3LYKA 1HNAA 5DQYA 2AJQB 4IVFA 1A0RP 3RHBA 4N0VA 1GSUA 2G0FA 4XS4A 4I97A 1BQ7A 7GSSA 1XPVA 1W89A 4ZL7A 1X9WB 3A2WA 3LWAA 5IMAA 5KN0A 3F6DA 3QDNA 1FOVA 1AQXA 2C0FA 2H70A 1KBNA 5D9XA 3ZZXA 1O6JA 3EU3A 2VCXA 3PH9A 2H30A 2FNOA 5F05A 2XBIA 3QAWA 2C3TA 5CRDA 4TRXA 1QQ2A 3GN3A 4WKWA 1T1VA 2LUSA 3DRNA 5CREA 4N10A 4FIWA 3D22A 2LQOA 4YQUA 3U6VA 3UVHA 4ZB9A 3G7JA 4CDOA 1ERVA 1OC8A 20GSA 5DBQA 1TJDA 1TOFA 4IJIA 11GSA 1ZYEA 2KP2A 1T4YA 5DQSA 2BTOT 5COHA 3W8SA 4JRRA 2OE0A 2V2GA 2GZZA 3BCIA 1FW1A 5D8IA 5IMCA 5J4UA 2H0GA 1SYRA 5INYA 2H1AA 1VF4A 4Q5NA 5CNWA 3KM6A 2I4AA 2WRTA 1TTZA 2E7PA 3LQ7A 4JU5A 2E2MA 5D9WA 1JZOA 4I6XA 5EY6A 4MMMA 1KTEA 5C04A 1JLVA 3J7Yb 2LJAA 2CAQA 4L0UA 1M9AA 3CXGA 4JR4A 2PU9C 1MDKA 4G10A 3GHAA 3M3MA 5GSSA 3Q6OA 4BVYA 2K9FA 5IPGA 1BG5A 3I6AA 3F4TA 2C80A 3FEUA 4HZ2A 3FK8A 4BVXA 2VUPA 5D9TA 1BJXA 2DMLA 4GCIA 1URMA 1A2MA 2C3QA 5ECSA 4MZCA 5GSTA 1Z3EA 3F8UA 2JACA 3N9JA 1FHEA 2KP1A 5A4VA 4HEA2 3D4MA 1PQNA 3GSSA 3P2AA 4AJ8A 4IW9A 2ZNMA 4TR0A 5JWOB 1GULA 5ECKB 4DSQA 4XRAA 4ID0A 4IBPA 4OCEA 1SJZA 2IL3A 1QXHA 1ZCPA 1M2BA 2MBTA 1N8JA 2LV3A 4NXIA 3ZLPA 3PR8A 3K8NA 3L9VA 1V57A 3KGKA 3P8WA 3L9UA 5C00A 4RUVA 4X43A 2X64A 4MF5A 3MAKA 2DBCA 1DE2A 1TK5B 3ZREA 3ZFBA 3ZVJD 3FKFA 3FZ9A 4EDYA 3KJYA 4F0BA 4MZWA 9GSSA 4LL1B 4IKHA 4OO4A 4IN0A 3IHQA 3WT2A 1N2AA 3WT1A 5LNKe 3VURA 2RM6A 2LNSA 3GMFA 2L5OA 1K0AA 3TJBA 3N5OA 5KN2A 1OKDA 4GQFA 1AIUA 3G7YA 3TKSA 3TOUA 3M8NA 4L0WA 1GSQA 4N11A 2OA7A 1B48A 3VWXA 5D9VA 2WGRA 1OC9A 1B4PA 2YPMA 2XHFA 5LD0A 1F37A 4YH2A 3APOA 1AUCA 1O7UA 2H8LA 4WF5A 5IMFA 3ZYWA 1T00A 2YWNA 4JEDA 2AHEA 1S3AA 3DD3A 3APSA 3GL3A 4V1Ag 1V58A 3TRPA 4L8EA 1AAZA 2KUCA 2H72A 2CAIA 1AQWA 3VI5A 4TVEA 1XOAA 3FZ4A 4TR3A 1E6BA 3DGQA 5G5FA 4F82A 3LXTA 3A2XA 1B8XA 1O73A 3HHVA 3QAVA 2MYGA 3RBTA 2EIQA 2DJJA 4FYBA 4HZ4A 2VCWA 1NSWA 4NV2A 2WCIA 1WP0A 2VAFA 5EL8A 3APQA 5B8BA 5CP1A 3AY8A 2FY6A 2I81A 2DMMA 1HYUA 2LKUA 2K18A 3MNGA 1XOBA 3GRXA 5CO3A 2AYTA 2L5LA 4N0ZA 2L6CA 5DCGA 1XWGA 2GGTA 1K0CA 3CSJA 2H0HA 1Z9HA 2L59A 3UVTA 3P90A 2K8VA 3UIWA 4LMVA 3IOSA 4XIHA 4KDXA 2O8VB 1SK0A 1M2AA 3L9SA 3EURA 1ERWA 4TN8A 5D93A 1Z6MA 5B6NA 4KAEA 5J3RA 2P31A 3ZL5A 1FVJA 3HVXA 1TKDB 2GS3A 5DCHA 2R5GA 3F3QA 3TKQA 3GIXA 4BA7A 1GNEA 3ED3A 3RPNA 4G2EA 3RHCA 2PGTA 3KP9A 4DSRA 3HYPA 4ILFA 3D0ZA 2P5RA 4J56E 4DVCA 1SK1A 3DIEA 4I2TA 2DJ3A 4TXVA 2JZTA 2V6OA 4KSOA 3DVWA 4ZBDA 2HRFA 4BPYA 1M99A 4G19A 3W6GA 4XTSA 1FB0A 1TI1A 1SD8A 4IP6A 3Q19A 2C4JA 1OVNA 3MWHA 5ECOB 4IQ1A 1UN2A 5IM9A 5G1LA 2NDOA 1EZKA 1OYJA 4KUNA 4OWYA 5A4WA 4LA1A 1M0UA 3VFIA 1EP8A 1R26A 18GSA 3A5WA 3VWVA 1EGOA 2B5YA 3BOAA 1AQVA 5KN3A 4TR1B 5G1KA 2YNXA 4IGJA 4PQ1A 4KW6A 3GV1A 1PA3A 1GSSA 1F3BA 2I3YA 5IMVA 2WS2A 3FZ5A 2EIRA 2H1BA 1NW2A 4AJ6A 6GSSA 1K0NA 2LRNA 1O8XA 1J08A 3IR4A 3J7Yk 1M9BA 5J5NA 1MD4A 1UC7A 2CX4A 4WR4A 3E0UA 4AJ7A 5J41A 1XFLA 2MZCA 5E4WA 2O87A 1QUWA 3FW2A 2IFQB 2LNTA 3C71A 4MDCA 4IQAA 3HXSA 3DEXA 1BX9A 2BJXA 4NPBA 3G7IA 1BYEA 2VIMA 2HE3A 3I43A 4POLA 1RQMA 2G2QA 3DXBA 3KIJA 5IOXA 3BCKA 1K0OA 1A23A 3CRTA 3M1GA 1XW6A 1GTIA 2YWOA 1Q98A 2H66A 3QPMA 2CV4A 4RQRA 2C3NA 1GLQA 2HRNA 4QL9A 4MP4A 5B7CA 1GUMA 4KNDA 4ZXGA 1G0TA 3QOUA 1JZDA 4KX4A 1SD9A 2ON5A 4PURA 1XXUA 2H6ZA 3KXOA 3I9V2 2X8HA 1EOHA 4WXTA 2PN8A 3EWLA 4GSNA 2D2ZA 4ECJA 2VL2A 3H4KA 5KN1A 1OE7A 5CYYA 2HI7A 3TB2A 2XC2A 3F4SA 1F3AA 3HZ4A 4KCAA 2H6XA 2GSRA 2RUEA 2VLUA 2OE3A 3D21A 1ZOFA 3Q74A 5GAPD 4HOJA 5DJLA 2PVOC 1WE0A 3TJJA 2DJKA 2JU5A 1IYIA 5G2ZA 5HFIA 1YJ6A 5J9CA 3D5JA 1UA5A 2GDRA 5ECQB 3KMOA 1YEPA 5J9BA 4ML1A 2LRTA 1Z7PA 5DAKB 2IMFA 4KE3A 1K0MA 1OKTA 1LJRA 2DLXA 1GSYA 3VLNA 3PINA 2IJYA 4MJBA 4TKYA 3FZAA 4MPGA 1FVKA 1TRWA 3M0FA 4ZIJA 2TRCP 2DJ2A 1BEDA 3HY2A 1YKAA 1A2JA 1WMJA 3TJFA 1TK8B 2PMTA 3GX0A 2IMEA 1G6WA 4D73B 3SBCA 4K9ZA 5ECPB 5IOWA 3ERWA 4O32A 4Q5FA 1EWXA 1LU4A 3LJRA 2VD1A 2GZPA 2X8CA 1HNCA 2R4VA 5EPFA 3ME7A 1WRYA 3ZFLA 4V2LA 4KB3A 2VCVA 1EEMA 3GH9A 3H93A 4FYUA 5ELGA 4HUAA 1K0DA 2FWGA 2PBJA 4GTUA 2J9HA 3ZIJA 4IP1A 4TR1A 3CSHA 1VGLA 3EINA 4BWSA 4HU7A 2IMKA 1AXDA 2GSTA 5ELAA 3ZMKA 3IPZA 1F2EA 5KEJA 2CT6A 1JZRA 2GT5A 1X0RA 4KDYA 4MH3A 2OBKA 4EE0A 2CA8A 2YZUA 5FHIA 5ABRA 3ZRDA 4JR6A 1TU8A 3GKMA 5HR3A 3ERGA 3LFLA 3TUEA 6GSXA 4K1FA 4N30A 2IFQA 4YAVA 4WR5A 4HS1A 1KEBA 4PNGA 1U6TA 2AB6A 1MTCA 2QKEA 2C8UA 3KH9A 1M2DA 3LSZA 4J2FA 8GSSA 2JSYA 1SKRB 1ZL9A 4WBRD 1A24A 2PUKC 3TRXA 3ZIVA 3TCOA 2IPAA 1K0BA 2B7KA 5EVOA 3VI7A 1S3DA 2VCZA 1MEKA 3E3EA 2M46A 2FCHA 3H1NA 2HZFA 2LQQA 2JADA 3QD9A 1PKWA 1TK0B 2C0DA 4FH8A 2VL3A 4JZQA 4TOPA 4WETA 4ISDA 1PGTA 2JSZA 2VM2A 2FWFA 3LGCA 3GL5A 1IYHA 1XIYA 1MD3A 3G9BA 1GUHA 3WGDA 4XS1A 5GZZB 1ZYQB 4WBJA 2CZ3A 3GFKA 2XPDA 2H74A 3H8QA 4OMVA 1XCCA 2L4QA 1WWJA 2V41A 1QGVA 2OJLA 2DSAA 2FA8A 2YWIA 1TU7A 2YJHA 5CRGA 1YF0A 3DKSA 1EV9A 4ZB8A 1A2LA 5HQPA 1BAYA 3CYNA 2ALBA 4PXOA 3IE3A 4NAXA 3UJ1A 3NZNA 10GSA 2VM1A 2CZ2A 4MLYA 4V2NA 4Q5QA 3IAS2 2GQLA 4AF2A 4POMA 4XRDA 3FHKA 4NHWA 2YV9A 3WGXA 1F6MC 1HD2A 3ZTLA 3A3TA 1SJ6A 1Q4JA 1C72A 2YOIA 2FA4A 2HFDA 1ILOA 1OAZA 5DAKA 3QFBC 2RIIA 3QCPA 1TI3A 1Z6NA 3GUSA 1Z5YE 3WD6A 2CQ9A 1DSBA 3CMIA 2VOCA 2B7JA 4XS6A 4GQCA 1RK4A 3BJ5A 1SJIA 1Y6EA 14GSA 4PUFC 2H0IA 4V2MA 4QQ7A 4AGSA 2IWTA 3BBYA 3KZQA 1USBA 4TR4A 1GWCA 2R2JA 2LSTA 3TJGA 3ERFA 1CQGA 1ABAA 4D73A 2WZ9A 1OC3A 4K0NA 5FT3A 1XWCA 1VF3A 1EP7A 2DJ1A 4IJ3A 1XBSA 1HNBA 1T7PB 1O81A 5DALB 3TKPA 1NM3A 1R5AA 5ECNB 4V1Ap 1YY7A 4ZBBA 4HJMA 3F9UA 3MSZA 2XPEA 2VCTA 3LXZA 2FD3A 1K3OA 5A5KA 3RDWA 1H75A 2ES7A 1TXXA 2HSYA 4FYCA 4I2UA 1ZMAA 4KA0A 2RM5A 3CTFA 2X99A 2CVBA 5AN1A 1GH2A 2F8AA 1DE1A 1WIKA 3DMLA 3TGZA 3HJPA 3E9JB 2REMA 1EV4A 3IC4A 4X1UA 4GSSA 4HU9A 1NHOA 3TRQA 1M7TA 2WJUA 1GP1A 1OE8A 4MZBA 4IS0A 4NV5A 1AC1A 4IHUA 1CQHA 4K6XA 5IIZA 4HQSA 4CHSA 4RI7A 5D96A 1XZOA 3VPQA 5F07A 2GTUA 3ISOA 4G9HA 3R2QA 3IK7A 2VD0A 1V98A 1THXA 4K7NA 2IMIA 3GNJA 3HJOA 1JZWA 4ECBA 3LEFA 1UVZA 4NWYA 5HR2A 1ST9A 3PGTA 3EMPA 5G31A 4OD7A 1O8WA 4OO5A 1Y25A 1JFUA 2X8GA 2GSQA 1WOUA 2LJRA 1W4VA 4EVMA 3IRAA 3TOTA 1MDIA 5HFGA 2P0GA 5G30A 4CW9A 1G6YA 1FAAA 3V1WA 3HZ8A 1GTBA 5ECIB 5G5EA 1JLWA 2MMOA 4K7IA 3UAPA 1Z7RA 2GQKA 2VL9A 5AIVA 3KEBA 1T4ZA 1F9MA 1GTAA 1PMTA 3F6FA 4EKZA 5FWGA 1PX7A 1YEXA 3FYGA 4GWRA 2J23A 5L71A 1GNWA 3DVXA 5JCUA 3C8EA 2L4CA 1HQOA 4EDZA 3QFAC 5IMZA 1QMVA 4TW5A 4ULXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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