2FY6A

Structure of the n-terminal domain of neisseria meningitidis pilb
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
VPHTLSTLKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQTEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGDFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQSLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRDPNADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The X-ray Structure of the N-terminal Domain of PILB from Neisseria meningitidis Reveals a Thioredoxin-fold
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB
molecule tags Oxidoreductase
source organism Neisseria meningitidis
total genus 44
structure length 143
sequence length 143
ec nomenclature ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date 2006-02-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fy6A00
1SK1A 1Z5YE 2CZ3A 3KTBA 2JU5A 5D9VA 1THOA 5ECOB 3GKMA 1UVZA 4GSTA 2BMXA 3DVWA 6GSSA 1NW2A 2B7JA 4EDYA 5ELAA 4GTUA 5ECNB 4EDZA 1OC9B 4MH2A 3MSZA 3HXSA 4FH8A 3KZQA 4QQ7A 5ELGA 2WRTA 2YNXA 1Z6MA 4POKA 3WT2A 3A2WA 1O8XA 2B5YA 2DC5A 4ZXGA 2KOKA 4HUAA 3IRAA 3QAVA 3FR3A 5DCGA 2JSZA 4NMUA 2PBJA 2OKAA 4ZILA 3RHBA 2X99A 4N10A 9GSSA 3D4MA 2OE0A 3QOUA 5DQYA 5DQSA 3EC3A 3F4SA 5KN2A 2FY6A 2LRTA 4KSOA 1AQWA 3S9FA 4L0WA 4RI7A 3SBCA 2YCDA 5D9TA 4KNDA 1FOVA 2F51A 5DCHA 5J3RA 2FCHA 3M0FA 3Q19A 3HKRA 2YWNA 1DUGA 3N5OA 3LXZA 1B4QA 5J41A 2GGTA 2FWHA 1TU8A 1PQNA 1YKAA 2QKEA 1ST9A 2CAIA 2N5BA 2K9FA 4FYUA 4LMWA 4HJMA 2X8CA 3HVVA 3CSHA 1V40A 2CX3A 3TRXA 1U88A 2H6ZA 3GKXA 3GL3A 5L71A 1HQOA 3TUEA 5HR2A 1U3AA 1PN9A 2AAWA 2QSIA 4NAXA 1EGOA 1OE8A 5IMFA 2LUSA 5CRGA 2X64A 4IJIA 1YEPA 4MPFA 2L5OA 3F4TA 3IXRA 1RK4A 4D73A 4KDYA 4LA1A 4KCEA 3GFKA 3GX0A 1PD21 1MDJA 4MMMA 3HHVA 4L0UA 2AV4A 1ZYQB 4TR0A 1R5PA 4WR5A 5IMDA 2NBSA 3CMIA 5DALA 2CAQA 2A2RA 2WULA 2PGTA 3LORA 3H79A 3ZMLA 1K0NA 3ZMKA 1JHBA 2I81A 5KN3A 2WZ9A 1O8WA 5KN0A 2HSHA 2VOCA 1M2AA 1ZYEA 1HNCA 1WPIA 5LD0A 2H30A 2PVOC 5G2ZA 1EOGA 2FHEA 2K8SA 2PVQA 1OKDA 4N30A 4I97A 1MD3A 2FUG2 2VAFA 1JLWA 1BEDA 4FO5A 4WBRD 6GSXA 3M8NA 5HFGA 2WCIA 4HQZA 3VLNA 3TJBA 1J0FA 1O7UA 4XS4A 3FZ4A 2XHFA 5KEJA 2C0GA 4POMA 4JBBA 2IN3A 4N11A 2GVPA 1H75A 3RHCA 3GV1A 2C8UA 4Q5RA 2F3MA 2F8FA 2GSRA 2CZ2A 2B1KA 5AGYA 5GAPD 1TK8B 2HFDA 2LTKA 2KP2A 5DALB 2MYGA 2TRXA 5IMCA 3QCPA 4N0VA 5HFKA 4MCUA 1GP1A 2C3NA 3TRPA 3EYTA 1UN2A 2DJ3A 3TCOA 4TN8A 2H1AA 4TOPA 2VL2A 2YPMA 2H8LA 5FWGA 4PUAA 4ILFA 1M2DA 1FVKA 2FNOA 3EU3A 1TOFA 4XIHA 5INYA 2IL3A 2BJXA 3ERGA 3P2AA 2Z9SA 1CQGA 3VK9A 2HSYA 4TXOA 3ZVJA 1Q4JA 4I2UA 3GURA 3DKSA 5JCGA 5D8IA 3ZRDA 3VWVA 1K0DA 3TRQA 4EUYA 1PMTA 4QL7A 2AUVA 1SYXA 2L6CA 1V98A 4DEJA 4HOJA 3WT1A 2JZTA 1Q98A 5F06A 3C1RA 2IMIA 1FHEA 3UEMA 4AF2A 1ERVA 2MMAA 1M7TA 1HNBA 4PGTA 4G19A 1NM3A 4MABA 3LXTA 1T00A 1WOUA 4PX1A 3LFLA 3KTLA 3F0IA 3HJOA 1O6JA 1XIYA 3DWVA 2WB9A 4NV2A 2H70A 4NXIA 4BPYA 4TR1A 1SL0B 5D73A 5IIZA 1HD2A 1T4YA 3MDKA 4XHMA 5ECMB 3A5WA 2E0QA 4O7HA 2B3SA 2XBQA 4ZBBA 4MH3A 5GSSA 1OAZA 3ZFLA 3NOFA 1WMJA 2FLSA 3HD5A 2HNLA 2V6OA 3E3EA 4F9ZA 3F63A 3FR9A 1E6BA 1XW5A 4MDCA 2VLUA 4HI7A 4AJ6A 4TR3A 3W8SA 5ECLB 1XWBA 1XFLA 4IJ3A 1T4ZA 2N5AA 5JWQB 1F6MC 1X5EA 1Z7PA 1USBA 1ERUA 2PWJA 2LJRA 5G1LA 4JEDA 5IPGA 5GZZB 1A8YA 2CV4A 3ME7A 5IOXA 1PL1A 1SYRA 2YWIA 2VL3A 1TK0B 1K0MA 19GSA 1GRXA 4CW9A 3ED3A 1R7HA 3DIEA 3O76A 4Q5QA 1ERWA 2LQOA 2NDOA 2YZHA 2F8AA 5JCWA 1LU4A 3GTUB 3Q6OA 1BAYA 2GQKA 1THXA 1TRUA 1OC9A 4IP1A 4HEA2 4G10A 1TI3A 3HCZA 3APOA 1R26A 2R5GA 3GA4A 4POLA 2VUPA 2TRCP 1WJKA 3APSA 1JZRA 4XCSA 2CVDA 1GULA 1M0UA 5CRDA 3ZZXA 1VF2A 1B9XC 3TKQA 2PMTA 4ACSA 3HJPA 3L4NA 3DD3A 3HA9A 4XS1A 5LCZA 4ULXA 4TKYA 3O3TA 1QQ2A 1B48A 4YQUA 2H19A 5IPHA 3HZ4A 4V1Ap 3R2QA 3DXBA 1G6WA 1XVWA 2V1MA 5E59A 3UBLA 4P3YB 5CREA 3TOUA 1XOAA 2I4AA 3Q74A 3P8WA 5FHIA 2V6KA 2VIMA 2YWMA 3H8QA 3TJKA 2IFQA 2L59A 3D4TA 1GH2A 2P5RA 3UARA 4KAEA 3UOMA 5B8AA 1WWJA 3C8EA 1HYUA 5D96A 3RPNA 1A2JA 3ZLPA 3D22A 4MF6A 5CNWA 2IMDA 1GUKA 4YQMA 4EKZA 5D9WA 4NV5A 2G0FA 3D0ZA 4K2DA 4TRXA 1EV9A 1JZOA 3IK9A 2H1DA 4J57E 1BQ7A 2VLVA 5ID2A 1F2EA 1FB6A 2GT5A 3DGQA 2GLRA 1A0RP 2CX4A 1LJRA 4BVXA 2H72A 3KD0A 4KB3A 1GLPA 1O81A 2B6MA 3ZREA 1PSQA 3IOSA 4HZ2A 1SKWB 2AHEA 2OE1A 3QDNA 3CTFA 3L9UA 2XBIA 4PNGA 2VL2C 4ZL8A 5LNKe 4YQVA 5AISA 5DBQA 4KE3A 3W6GA 1GUHA 5J4UA 2LEGA 3FZAA 2IFQB 4KSMA 5EVOA 4GXZA 2H1BA 1IYHA 2PUKC 4MA9A 6GSTA 3EURA 4OCFA 2VM1A 2X8GA 2GZYA 3HYPA 4WETA 4KH7A 2FD3A 1MD4A 1VF1A 5HR1A 5B6MA 3ZIVA 3HY2A 3LJRA 2KHPA 4WXTA 1MDIA 4HU9A 1FB0A 2L4QA 1I9DA 4V2NA 2P31A 1XWAA 4TW5A 2X8HA 3GH9A 5ID2B 4K7OA 3ISOA 1XVQA 5KN1A 2M46A 3IAM2 5D9XA 3CRUA 2DMLA 2B1LA 2PN8A 1PX6A 2MZCA 4BA7A 4WEYA 22GSA 11GSA 2VO4A 5J5NA 2DJKA 1SENA 5COHA 3KM6A 1SJIA 4IVFA 5DAKB 2VLTA 2H75A 4TR4A 1ABAA 2V2GA 2DSAA 1ZGNA 4JZQA 1SL1B 1GL8A 1PL2A 4XTSA 4OFMA 4G9HA 4MK3A 2AYTA 1OC8A 4QL9A 4PXOA 2CA8A 1FAAA 1U3IA 3WYWA 1EEJA 3J7Yk 1F3BA 1SKRB 3LWAA 3M9JA 2FWGA 2JZRA 1GSDA 1T3BA 5B6NA 3UVTA 3PINA 5GAND 14GSA 5IM9A 1G7OA 4WKWA 2HXKA 3H1NA 1QFNA 2PERA 1K3OA 2DIYA 2RUEA 3G7JA 2ZNMA 2B5XA 2YZUA 4OO5A 2IWTA 2V41A 1X0RA 2E2GA 1TKDB 1E2YA 3I43A 1Z9HA 4ECBA 2WFCA 4K8MA 1TDIA 1K3LA 3EU4A 1BX9A 1Z3EA 3ZL5A 4EVMA 4YH2A 3UL3A 2GS3A 3IBHA 5ECHB 5F05A 3PH9A 18GSA 1XW9A 1SJZA 2AB6A 2DJ1A 2K18A 3EWLA 4JR4A 3DYRA 1URMA 3ZIJA 1BG5A 3EMPA 2R4VA 2C0EA 1UC7A 4EXJA 3IV4A 4RUVA 2C0FA 2G2QA 5FT3A 3G7YA 4ECCA 3C71A 1TRVA 2RM6A 4TXVA 3TKRA 5IO2A 2I3YA 3LYPA 1U6TA 5ECKB 4ML1A 3TKSA 5E4WA 2HRFA 5IO0A 2KP1A 2CQ9A 1TRSA 10GSA 2C1YA 3APQA 2LNSA 1XWCA 1OC3A 1V58A 4BVYA 3TDGA 1J08A 2YV9A 3IDVA 4DSRA 4KX4A 5J9CA 1MTCA 1AQXA 1G6YA 2H66A 4IS0A 4ECIA 3Q18A 1GTBA 2HLSA 3GKNA 4I8BA 1UA5A 2GZZA 20GSA 1JZWA 2DJ0A 2OA7A 5AIVA 4IN0A 1VGLA 1XZOA 1SKSB 3LEFA 4H86A 3M1GA 4RQRA 5CYYA 2YJHA 5CRWA 1F3AA 1GTIA 2KLXA 1N8JA 2B5EA 4GSSA 4KUNA 4MP4A 3WGEA 1SD8A 1IYIA 3FHKA 3U6VA 3GHAA 1BYEA 4GQFA 1G0TA 1ZMAA 4IGJA 3MAKA 4AJ7A 1YY7A 2WGRA 3DMLA 1EZKA 2IMKA 4KGIA 3VURA 3CRTA 4PUFC 2HZEA 4K6XA 3F8UA 2KUCA 3VI5A 2ON7A 3OR5A 2XC2A 1R4WA 3IA1A 3I6AA 2VCTA 4K7NA 4CHSA 4K0NA 2C80A 2DJJA 4HDEA 5ECQB 4G2EA 5J9BA 3RBTA 4F03A 4MJBA 3GTUA 2LSTA 1QMVA 2HI7A 2DJ2A 1G7EA 4XRDA 2YANA 4OFNA 2R2JA 3VWXA 4V1Ag 2HT9A 2ALBA 2EC4A 4AGSA 4ZB8A 3RAZA 5ECSA 3HVXA 1X9SB 2ON5A 4CDOA 4POBA 4PQ1A 3U5RE 3H93A 3C1SA 2GT6A 1TJDA 1VF4A 6GSUA 2VL9A 2AJQB 2OBKA 4MPGA 3CXGA 3IAS2 3FK8A 3PR8A 1SK2A 4J2FA 1GSQA 3TOTA 6GSWA 1VRSD 1AIUA 2DBCA 3I69A 1QUWA 2OBIA 3GUSA 4ZBDA 2O7KA 2YV7A 1DSBA 3ME8A 2GSQA 3P90A 4KCAA 2C0DA 3A3TA 3GRXA 2PU9C 3MWHA 5A4VA 2PPTA 4NWYA 3AY8A 2VCQA 4IHUA 3BOAA 2FGXA 3FEUA 4GF0A 2GQLA 2HZEB 4HQSA 1DE1A 1GLQA 1AQVA 1PX7A 2ZUPA 3L0HA 3GNJA 4WBJA 3FKFA 2J23A 1M9BA 2IPAA 3LSZA 4N0ZA 4MZWA 3EVIA 2OADA 3GMFA 3PGTA 3LQ7A 1ZCPA 4E8HA 4IELA 4YAPA 3C7MA 4NHZA 3E9JB 1AXDA 2IMEA 1Y6EA 1W89A 3UIWA 4XRAA 1OYJA 4XS6A 1KTEA 3EINA 3CSJA 2ES7A 2GSTA 2QC7A 3KIJA 2JADA 3VFIA 3VI7A 4K9ZA 4X1UA 1M2BA 5GSTA 4ZL7A 3DRNA 3CYNA 1A2LA 2H76A 4E8EA 1EP8A 3FYGA 2FWFA 2L57A 3LGCA 2P0GA 4I6XA 4DSQA 4JRRA 1OE7A 3TJJA 2RUFA 2MMZA 2VCXA 1ILOA 2JSYA 1SU9A 3JCML 2YWOA 4AJ8A 1Z6NA 5H5RA 1XWGA 1W4VA 1TK5B 1LBKA 1GTAA 4FIWA 1S3CA 1GNEA 3D6IA 2JL4A 3F3QA 1V9WA 2IJYA 2YJ7A 4K0GA 2JZSA 16GSA 2LJKA 4HS1A 4RQXA 2H6YA 1A24A 1XOBA 1ZOFA 2F9SA 2N5FA 2FWEA 1K0CA 1B4PA 1ACVA 3W8JA 4LLRA 1V2AA 4I2TA 2I1UA 2H1GA 4BWQA 3HZ8A 3FR6A 2O85A 2LJAA 2CVKA 3KGKA 5H5SA 2L4CA 5C00A 3GL5A 4O5RA 4OFTA 3TJFA 2LQQA 4KDUA 4RI6A 1PRXA 2K8VA 3TJGA 4F0CA 3TKSC 1DE2A 2CT6A 5DAKA 3IE3A 4IKHA 3L78A 5ABRA 2LRNA 5DJLA 3C73A 4K1FA 3GSTA 3BD2A 1FO5A 2OACA 4O92A 4OD7A 3ZTLA 3FZ5A 2H71A 2EIQA 1EGRA 3I9V2 13GSA 3QFBC 2GTUA 5B7CA 4ID0A 6GSYA 2J9HA 2E7PA 1WE0A 4ZL9A 5F8BA 1M99A 3O6TA 3NZNA 1GWCA 3GX8A 1WP0A 4GQCA 3US3A 3EE2A 4BWSA 2R3XA 1AAZA 3QAGA 3UJ1A 3CSIA 3LYKA 1AC1A 2VD1A 1XWKA 4X43A 1A0FA 1B9YC 3VWUA 5B8BA 1YJ6A 3IC4A 2YP6A 4NPBA 1YEXA 1XPVA 4J56E 2R37A 4L5OA 4IP6A 2E2MA 3VPQA 3KMOA 1PA3A 1OKTA 2HZFA 3QFAC 2LV3A 1AW9A 3DVXA 3KEBA 2OJLA 4X0XA 1H4OA 5JWRB 3LG6A 3BCIA 4MZBA 3ZITA 1MEKA 3A2VA 2H6XA 4Z7XA 4PNFA 3QPMA 2M80A 5D93A 4GLTA 1ZZYA 3ZYWA 3F3RA 1KBNA 3TGZA 2H01A 1EOHA 5AIXA 4WF5A 1XBSA 2DIZA 1O73A 1K0OA 5CRHA 4IBPA 4F0BA 3BBYA 5H5QA 3KH9A 3K8NA 4IQ1A 2LRCA 3IK7A 3KJYA 4EL1A 1WRYA 5A5KA 4NHWA 3SWLA 5HQPA 4JU5A 3CBUA 2L5LA 2VCWA 2IMFA 3GN3A 5CAXA 4PQIA 5HFIA 4DVCA 5G5EA 2VCVA 2LNTA 4HZ4A 2GDRA 2H0HA 1U87A 4OCEA 1QK8A 3KXOA 1O85A 1M9AA 5G30A 5EPFA 3N9JA 5JWOB 1PKZA 1KEBA 3F9UA 2C3QA 1EWXA 1A8LA 2JACA 1DBYA 5CP1A 4L8EA 5IMAA 4F82A 3D21A 3TKPA 3ZFBA 1YDKA 3F6DA 2D2ZA 4D73B 1QXHA 2V32A 3GYKA 3IHQA 3M9KA 1PGTA 1X5DA 2H73A 2EIOA 1RW1A 1GSSA 1OVNA 1NHOA 5ECRB 2FA8A 2H0IA 1FG4A 5F07A 2WDUA 4L5LA 3L9VA 3UAPA 3UVHA 5ENUA 2WS2A 3WD6A 2XPDA 6GSVA 1S3DA 1FVJA 3QR6A 4O32A 3G7IA 4GWRA 3GSSA 4OMVA 1NHYA 1HNAA 4MJAA 3FW2A 1MDKA 2RM5A 17GSA 4V2MA 5ECIB 4HU7A 7GSSA 3F6FA 5ECPB 4IW9A 3KH7A 1Z7RA 3KCMA 4HJ2A 3F4RA 3A2XA 3H4KA 5CO3A 1JFUA 3NIVA 4ZB6A 4DSSA 1F37A 1SK0A 2VM2A 2XPEA 5G1KA 1N2AA 4XS4B 1TRWA 4FYBA 1ON4A 5HR3A 4MLYA 2GZPA 1GSFA 1YKCA 4YAVA 2FA4A 2I9HA 2HYXA 4ECJA 1FW1A 4PURA 2ZCTA 1I5GA 4V2LA 5AN1A 5IQYA 2RLIA 2VD0A 3VWWA 1ML6A 5A4UA 1RQMA 1Y25A 4JE1A 3P7XA 2O89A 2H74A 4GRFA 3GH6A 3IPZA 1ERTA 1XCCA 1SL2B 2YOIA 1EV4A 1TU7A 5F0GA 3FZ9A 4EO3A 4Q5FA 12GSA 1F9MA 4PQHA 1JLVA 4ZBAA 1T7PB 2A2SA 4I5QA 4GCIA 1BJXA 1GSYA 4KW6A 4GSNA 4BL7A 3RDWA 4LMVA 1YF0A 1PKWA 1JZDA 3L9SA 4EF0A 1TXXA 2WJUA 5G5FA 3KP9A 3QD9A 3BJ5A 4K7IA 3J7Yb 1B8XA 3HDCA 1CQHA 1T1VA 1YQ1A 3ERFA 4TXOB 1V57A 1EEMA 3E0UA 4DSSB 2GQMA 4ZB9A 1KNGA 5IMVA 4IQAA 1C72A 3TKSE 3QAWA 1S3AA 3G9BA 2LKUA 1ZL9A 1SJ6A 2MBSA 3WGXA 1TP9A 4WF4A 1AUCA 4F2IA 2EIRA 2L6DA 2O8VB 3CTGA 2BTOT 1GTUA 2A4VA 3VPTA 2P5QA 5IMZA 2R6KA 1J9BA 2C4JA 4FYCA 4MJEA 3TB2A 1GUMA 4OO4A 4MF7A 1SD9A 3FY7A 1A2MA 4EE0A 2OE3A 2IIYA 3D5JA 5EY6A 4MJCA 5HR0A 1GNWA 1QGVA 3ERWA 5DVBA 3MNGA 4ML6A 1A23A 1K0AA 5A4WA 3HVSA 1TW9A 4WR4A 3WGDA 2O87A 1YZXA 3KP8A 4TR1B 3GKKA 1EP7A 5G31A 2MBTA 1XW6A 1WIKA 4JR6A 4LL4B 1YF1A 2NVLA 2YN1A 4MZCA 2CVBA 2MMOA 1R5AA 3HJMA 1NSWA 3FRCA 1X5CA 4KA0A 3RPPA 2QGVA 2REMA 5DDLA 2RIIA 3ZVJD 3UBKA 2MMNA 5JCUA 2HE3A 1GSUA 5EL8A 4MF5A 4OWYA 4KDXA 4ISDA 2C3TA 4EC0A 1GSEA 1X9MB 1K3YA 5C04A 2H0GA 2B7KA 1K0BA 1XXUA 2DMMA 3M3MA 2VCZA 5IOWA 3GIXA 3UMAA 3DEXA 5DJMA 2LS5A 2M72A 3BCKA 1TTZA 3V1WA 4ZIJA 2DLXA 4TVEA 3KMNA 1X9WB 3QMXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite