2FY6A

Structure of the n-terminal domain of neisseria meningitidis pilb
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
143
structure length
143
Chain Sequence
VPHTLSTLKTADNRPASVYLKKDKPTLIKFWASWCPLCLSELGQTEKWAQDAKFSSANLITVASPGFLHEKKDGDFQKWYAGLNYPKLPVVTDNGGTIAQSLNISVYPSWALIGKDGDVQRIVKGSINEAQALALIRDPNADL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB
publication title The X-ray Structure of the N-terminal Domain of PILB from Neisseria meningitidis Reveals a Thioredoxin-fold
pubmed doi rcsb
source organism Neisseria meningitidis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 44
structure length 143
sequence length 143
ec nomenclature ec 1.8.4.11: Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase.
pdb deposition date 2006-02-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2fy6A00
4N0ZA 3FR6A 5ECSA 1GTIA 3UOMA 1BJXA 2VLVA 1O81A 4ZL8A 2A2RA 4F9ZA 2Z9SA 3H8QA 3HA9A 1XWKA 1TI3A 4MJBA 4N11A 2QC7A 2H01A 3ME8A 4JRRA 3GA4A 3L9VA 2YJ7A 2M46A 3RHBA 1OKDA 2EIRA 1Z3EA 3ME7A 2WRTA 3F9UA 1W4VA 6GSVA 3CBUA 1YDKA 4Q5NA 3GH9A 5HFIA 2FWGA 3L0HA 2TRCP 4LL4B 3HDCA 19GSA 4KNDA 1WMJA 1ERWA 2LRTA 3W8SA 4TW5A 1XWCA 4IHUA 4KSMA 5ECLB 1GTUA 2IFQA 3IAS2 3L4NA 1W89A 2FY6A 1WP0A 3KM6A 1XOAA 1ZMAA 4KA0A 2FNOA 1PGTA 2VCVA 4IN0A 2L59A 3GX8A 2B5YA 4V2NA 3L9SA 1SD8A 5ID2B 2OE0A 1T7PB 5GSTA 2PBJA 4HS1A 2LJAA 2VD1A 2YV9A 1BG5A 4NHZA 3EINA 1ZL9A 1EZKA 1C72A 2GSSA 5ECRB 4MDCA 2RUFA 2H0IA 1SJZA 17GSA 4ML6A 5IMZA 1EGRA 3IAM2 1RQMA 1XW6A 1B4PA 1M7TA 1UA5A 1F3AA 1TU8A 1DBYA 1AC1A 4E8EA 2B7KA 3TDGA 2LJRA 1V9WA 2OJLA 4MJEA 3ZREA 3VI7A 2EC4A 5DQSA 4I6XA 4YQVA 2QGVA 3VLNA 1T00A 2GZPA 2H1GA 3HD5A 5JWOB 4WETA 4L5OA 3UAPA 5DQYA 5ECHB 4O92A 5HQPA 3MSZA 1WJKA 1TI1A 2RUEA 2HSHA 5J9CA 2I9HA 1A2JA 3DD3A 2IIYA 5G30A 2KHPA 2C0EA 1TRUA 1XPVA 2XPEA 3VWXA 1ZCPA 1V57A 5D8IA 3TUEA 5A5KA 3KXOA 1Z6NA 3TGZA 1OYJA 3HVVA 2HLSA 4PGTA 2C80A 3FZAA 2L4CA 4DEJA 3MAKA 3HY2A 1WWJA 1ERTA 3CTGA 2ZNMA 3DWVA 1ACVA 3NOFA 5B6MA 3HZ8A 3GKMA 1PX6A 4POLA 4OO5A 4ZB6A 3S9FA 4BWSA 3NIVA 4XS6A 3LWAA 3I69A 4WBRD 1X5DA 4ZBBA 1BEDA 2DIYA 2DJ2A 4X43A 1V2AA 3LQ7A 3US3A 1EGOA 5JWQB 1BX9A 1GNEA 2B1KA 4K9ZA 2DMLA 2H6ZA 2VIMA 2V32A 13GSA 1TK8B 1R5PA 1FAAA 3WYWA 1E2YA 3RPPA 3M9KA 4FH8A 3UARA 3M1GA 2HNLA 4OCFA 1TRVA 3C1RA 2V1MA 3RDWA 5IPHA 2AYTA 4LL1B 2JSYA 1A8YA 1SK2A 2E0QA 1GLPA 2HFDA 4GWRA 1VGLA 1XCCA 3FHKA 4FIWA 1EWXA 2WS2A 14GSA 2GSQA 1JHBA 3EE2A 2IMIA 1U88A 1NHYA 1FG4A 4I5QA 5IQYA 1URMA 1XVWA 3Q6OA 3UMAA 4JR4A 2L4QA 1O6JA 4IELA 3C7MA 1M2DA 3APOA 2VCXA 3IR4A 4I2TA 4Q5RA 4ZXGA 5DVBA 2KLXA 2K18A 3W6GA 1GSDA 2D2ZA 3MDKA 4XRAA 1XZOA 1A0FA 4AJ6A 3VI5A 3FRCA 4JZQA 1SJIA 4LMVA 1BQ7A 2L57A 3DYRA 6GSYA 3F3RA 5ECOB 1ON4A 2YWMA 4N0VA 12GSA 4MMMA 2WFCA 3LGCA 5AISA 3GKNA 5ECKB 2IWTA 1PKZA 3RAZA 1ERUA 2YOIA 1RK4A 5LNKe 1GWCA 2VL9A 2JZSA 5D96A 3PH9A 3QAGA 2MMNA 1PSQA 1G7EA 3IDVA 4POKA 2PN8A 2HRNA 4L0WA 4G9HA 4BVXA 5B7CA 2MBTA 4PNFA 1EP8A 3UVTA 4MCUA 2OACA 2O85A 4XS4A 5DALA 4WBJA 4KDUA 2NPBA 2HZEB 18GSA 5C04A 1YY7A 3GRXA 3EURA 2YN1A 2O89A 4KX4A 3G7IA 4ILFA 4BA7A 4AGSA 4EUYA 2L6DA 2HZEA 1TRSA 2VL3A 3RPNA 4QL7A 2YPMA 3O3TA 3ZLPA 4HZ4A 4HJMA 2LNSA 2OE1A 3TOTA 4EXJA 3PR8A 2GQMA 2VO4A 2V2GA 2AJQB 4IKHA 1T3BA 1X9MB 4TOPA 3FR9A 2CX3A 4BVYA 1ZZYA 2PU9C 4HJ2A 3EVIA 4O5RA 2H6XA 3KTLA 4J2FA 2VL2C 4HQZA 1MDIA 1OKTA 2HYXA 1YKCA 4DSSB 1TK5B 2X8HA 2L5OA 5E59A 1T4ZA 2K8VA 4TR1B 4NV5A 4DSSA 3FR3A 2EIOA 2XBQA 4FO5A 2CVDA 4TR3A 1EOGA 2N5FA 2LNTA 5F06A 1A2MA 2FUG2 4MJCA 1XWBA 4RI7A 5H5QA 3O76A 3BD2A 4PX1A 1PQNA 2LKUA 3L9UA 3LJRA 5DJLA 2B3SA 2C3NA 5DCHA 3TRPA 3ZFLA 3GH6A 5G31A 4KUNA 1AXDA 1QUWA 5ECMB 3KZQA 3LSZA 2HZFA 4V2LA 3FW2A 4PUAA 3ERFA 4WR5A 1K0OA 1GTAA 1V58A 2LQOA 1EP7A 5EVOA 1T4YA 4MPFA 5GZZB 6GSWA 1M99A 4AJ8A 4IP1A 1LJRA 10GSA 3UVHA 3HVXA 4WXTA 3K8NA 1FOVA 4L8EA 4Z7XA 2TRXA 3QCPA 4L0UA 1OE8A 1B4QA 4K2DA 4MK3A 4WF5A 4O32A 5CP1A 5IMAA 4HU9A 3TKPA 2WJUA 4J56E 2YANA 1Y6EA 3CYNA 1YKAA 2ZUPA 2R4VA 2VUPA 2V6OA 3GTUA 3LG6A 2E2GA 3QR6A 4IGJA 1THXA 3EU3A 3N9JA 1X9SB 5DAKB 2K8SA 3QFBC 11GSA 2LQQA 1Y25A 4GQCA 5DAKA 3PINA 2DIZA 3KTBA 3GFKA 3TRQA 3M8NA 2ZCTA 4KB3A 3ZRDA 2AV4A 1KEBA 3CRTA 4LLRA 3GSSA 2YP6A 4MH2A 5F05A 1J08A 1K3YA 2RM5A 4I2UA 3ZFBA 4TR4A 4YQUA 4GRFA 1OC3A 4I8BA 4POMA 4WEYA 4MF7A 1HNAA 1K0NA 3J7Yk 4YAPA 3GKXA 1F9MA 1TKDB 4ML1A 5C00A 1WRYA 4IBPA 4WR4A 1G7OA 3H4KA 2I81A 2PVOC 2XC2A 3VWVA 3VWUA 4PURA 2IMEA 2YWNA 5KN1A 1GH2A 1FVKA 4HUAA 2FA8A 2JU5A 1YQ1A 1OAZA 3LXTA 2QSIA 3BCKA 2FLSA 1PA3A 1T8EB 2I4AA 2NBSA 2I3YA 2FD3A 2V41A 1A8LA 2IMKA 5D9WA 2PVQA 5ID2A 5A4VA 4ECJA 1TU7A 3P7XA 2MYGA 4OFTA 3LEFA 3WD6A 3KCMA 1M2AA 3F4RA 4FYBA 1X5EA 4EL1A 5EY6A 2GSRA 1XWAA 3P2AA 1FO5A 4ECIA 5J3RA 3HJPA 4GF0A 2CV4A 2MMZA 3H93A 3IC4A 2HE3A 1V40A 5CO3A 2DSAA 1MDJA 3QAVA 2H75A 2GTUA 2OE3A 1PRXA 3KIJA 1JLWA 2CA8A 2F3MA 3WGEA 5ABRA 5KN3A 1PL2A 1A2LA 4BPYA 2G2QA 4XHMA 3ED3A 1M9BA 3W8JA 1OC8A 1Z9HA 3KMOA 4KCAA 3D4MA 3WT2A 5HR2A 1OC9B 4GSSA 4KGIA 4KSOA 3TKSA 1XW5A 2C0FA 4F0CA 1MEKA 1ERVA 1XW9A 1FB0A 1OVNA 2H0HA 1JZRA 4MJAA 1YEXA 1V98A 3GX0A 4MP4A 3EMXA 1TRWA 5F07A 2MMOA 1QMVA 1R4WA 2E7PA 5KEJA 1ZGNA 2H1DA 1F3BA 2GZYA 2PPTA 2VCZA 3KMNA 4ZILA 1K0AA 2CVKA 4E8HA 3G7JA 2H30A 3ZIJA 3IPZA 1GNWA 2P31A 2XHFA 2L6CA 1NW2A 2AUVA 5CYYA 1WOUA 2X99A 2VCQA 2FA4A 4GLTA 2WDUA 2GDRA 1M9AA 2P5QA 2BJXA 2LJKA 3GHAA 2VCTA 1EOHA 1AUCA 3CSIA 3EC3A 1TTZA 3GV1A 5J41A 4XS1A 5D73A 5IO2A 4LA1A 2NDOA 3F4SA 1JZWA 2X64A 5CRDA 3UJ1A 2C4JA 5CREA 1B9YC 2YCDA 2MMAA 3TCOA 2VM1A 4F82A 3QOUA 2VM2A 3DMLA 4PQIA 2YJHA 1AQVA 2C3TA 1VF3A 3QMXA 1SKWB 3LYKA 1OE7A 1K3OA 1SL0B 3CSHA 1RW1A 2GT6A 2L5LA 4Q5FA 1VF1A 5IOXA 1O73A 2CAQA 2ALBA 2DMMA 2B6MA 2AB6A 4XRDA 2WZ9A 5IIZA 5L71A 1PKWA 1MTCA 4YH2A 4MF5A 1GLQA 4K7OA 1PL1A 3A5WA 5DJMA 4IJIA 2O8VB 2HRFA 3HVSA 1JZOA 2GGTA 4KAEA 3GIXA 3FKFA 5A4UA 1J0FA 5KN0A 2VAFA 7GSSA 2LUSA 1H75A 1U3IA 3APQA 4I97A 1AAZA 1N8JA 2AHEA 3FZ9A 5JCWA 1SL1B 2R3XA 3C73A 3C1SA 5GAPD 1LU4A 2LV3A 2KP1A 4PXOA 2VOCA 4IQAA 4ACSA 3Q19A 1PMTA 2EIQA 1SENA 3RBTA 2GVPA 5G5EA 3SBCA 3HJOA 2DJ3A 5JCUA 1QQ2A 3ERGA 3NZNA 5F8BA 2H70A 2IMFA 3M0FA 4H86A 4BL7A 5ENUA 2OA7A 2P0GA 4J57E 3IK7A 4DSRA 2OADA 2JL4A 1X0RA 1FW1A 2O7KA 3IE3A 1GRXA 5EL8A 3U6VA 2GSTA 1XXUA 4ZIJA 2FWEA 4N10A 1S3CA 2F8AA 3ZL5A 3P90A 4X1UA 2GS3A 2C0GA 5B8AA 2M72A 4HEA2 3M9JA 5ECPB 2H76A 5G1LA 3GL3A 3HKRA 3VPTA 2WB9A 2DJJA 2ON7A 5D9VA 1R7HA 4JR6A 4TR1A 3TJKA 2G0FA 3R2QA 1BYEA 2LSTA 5A4WA 4ECBA 4D73B 2KUCA 4G19A 1GSUA 1O85A 1YEPA 4G10A 3HXSA 5B8BA 3GYKA 4OFMA 3UBKA 2H0GA 3WGDA 5IMDA 2JACA 2CT6A 1CQHA 2O87A 3GURA 4MZWA 5GAND 3ZMKA 3A2XA 4HI7A 2DC5A 5HR3A 3TKQA 3FY7A 6GSUA 5COHA 4ZB9A 2HSYA 5ECIB 1XIYA 2C1YA 3EWLA 5IM9A 4CHSA 3KH9A 5ECQB 4JU5A 3JCML 2B5XA 4N30A 5F0GA 1TP9A 1SU9A 5D93A 2ES7A 2IN3A 2YZUA 4RQXA 2H73A 1SKSB 2ON5A 4IS0A 3ZYWA 4YQMA 4GXZA 3U5RE 4HU7A 3Q74A 3C8EA 3KEBA 3VURA 3TJJA 2YZHA 3D4TA 16GSA 1PN9A 2GZZA 3FK8A 3TKSE 1SK1A 2R2JA 1HYUA 3A2WA 2JADA 3F3QA 5IMFA 1F2EA 3UIWA 5IPGA 1E6BA 3KD0A 4JE1A 4PUFC 3ZZXA 5EPFA 4MLYA 4GSNA 3Q18A 3UL3A 4JBBA 3BCIA 4L5LA 5D9XA 1NHOA 3DIEA 2JZRA 3UBLA 1KTEA 1XWGA 4FYUA 5FWGA 1G6WA 4MF6A 1X5CA 3N5OA 3L78A 4EDYA 1AQXA 2VLTA 3DGQA 5HFGA 1Z6MA 3EU4A 4BWQA 3LXZA 4EDZA 1TXXA 1TJDA 4GQFA 2FWHA 2HI7A 2F9SA 2H1AA 3WGXA 4V2MA 3F8UA 4POBA 1U3AA 5G1KA 5CAXA 1O7UA 3H79A 1GSYA 5ELGA 3IXRA 4NHWA 5CRWA 5ECNB 4YAVA 3RHCA 1Q4JA 3MNGA 2PUKC 1VF4A 3OR5A 5LCZA 1DE1A 2FHEA 5ELAA 3CTFA 4MPGA 1ML6A 2IFQB 2C0DA 3GSTA 3BJ5A 2IL3A 4ZBAA 3D6IA 3MWHA 4NAXA 1JFUA 2PGTA 2M80A 1TK0B 1FHEA 1ZYEA 1NSWA 4ECCA 2C3QA 1K0MA 3D22A 4EO3A 1O8XA 5CRHA 2YV7A 3I43A 2PMTA 3KH7A 4F0BA 3EYTA 5AIVA 1FVJA 2H8LA 2JZTA 1PD21 1YZXA 1B9XC 1HQOA 2E2MA 1A0RP 4IQ1A 4F2IA 2DJ1A 2K9FA 4KW6A 2DJKA 5LD0A 1EEJA 2P5RA 4V1Ap 1QFNA 1K0BA 4TN8A 8GSSA 4XCSA 2OBIA 5H5SA 3TKRA 1GP1A 1S3DA 1XVQA 3J7Yb 1GUKA 1OC9A 4AJ7A 4TKYA 4P3YB 1O8WA 2CQ9A 1QGVA 2H72A 3BBYA 3ERWA 2NTOA 2J23A 3M3MA 3TJGA 3LFLA 1THOA 1NM3A 1DSBA 1N2AA 3E0UA 4KH7A 1Z5YE 2XBIA 4HDEA 1A24A 1DUGA 4WKWA 1B8XA 3GN3A 4NV2A 4HZ2A 1FB6A 5DDLA 3PGTA 2PERA 2QKEA 2V6KA 4O7HA 3VFIA 4Q5QA 2LRNA 2IPAA 4EC0A 3UEMA 4K0NA 2F8FA 2MBSA 3A2VA 3GL5A 4TR0A 4EE0A 2H19A 3QPMA 1HNBA 2LTKA 2VL2A 3LORA 2H6YA 2RLIA 2HXKA 3ZMLA 2DJ0A 3VK9A 3APSA 1AW9A 4QQ7A 5HR1A 1ILOA 2X8GA 2IMDA 1WPIA 3DKSA 1KBNA 1F6MC 4ZBDA 4OMVA 5CNWA 3IRAA 3IK9A 1QK8A 1GUHA 4LMWA 3TB2A 1R26A 4RI6A 1XBSA 3IV4A 2DLXA 2F51A 1Z7RA 3CXGA 3ZVJA 3CSJA 5FT3A 2OKAA 5IO0A 3IBHA 5JWRB 2YWOA 4NPBA 1B48A 1AQWA 1SJ6A 2KP2A 4ZL9A 1GL8A 5G5FA 2VCWA 4K6XA 2CX4A 1K0CA 4DVCA 1A23A 2VD0A 4OWYA 4PNGA 3TOUA 1I5GA 3G7YA 3FZ4A 5INYA 3H1NA 2AAWA 3IA1A 4GTUA 3P8WA 1YF1A 5DBQA 4HOJA 4IP6A 5KN2A 4KDXA 1R5AA 1DE2A 1MDKA 4V1Ag 1Z7PA 3QD9A 3LYPA 2B5EA 2DBCA 1T1VA 3DEXA 2XPDA 4HQSA 1J9BA 3VPQA 2RM6A 1GSEA 4MZBA 3FEUA 3G9BA 5IMVA 4NMUA 3HJMA 1EV9A 1GUMA 2GLRA 3D21A 2K6VA 4GSTA 3DVXA 3DRNA 1EV4A 1YJ6A 3O6TA 1YF0A 5H5RA 6GSSA 2I1UA 2WCIA 4K1FA 2H74A 4QL9A 1TDIA 3F63A 1GTBA 1MD3A 5DCGA 1ABAA 4JEDA 1GSSA 1GSFA 3F4TA 4GCIA 1SD9A 2C8UA 3F6FA 4OO4A 1Q98A 3KJYA 1SL2B 2LEGA 2LS5A 1K3LA 1LBKA 1TOFA 4KE3A 2GQKA 1UVZA 4G2EA 3I9V2 1UN2A 4CW9A 3ISOA 1BAYA 2H71A 4XS4B 5DALB 3GNJA 3SWLA 1SYXA 4K8MA 2YWIA 2OBKA 3TKSC 3KP9A 20GSA 1G6YA 1GSQA 2VLUA 2RIIA 22GSA 4TXOB 1X9WB 2B1LA 2N5AA 6GSTA 1HNCA 5HFKA 5IOWA 2LRCA 1WIKA 4PQ1A 4TXOA 1UC7A 3F6DA 1F37A 3ZIVA 2A4VA 4MZCA 3CRUA 1SK0A 2H1BA 5AN1A 2NVLA 3D0ZA 1AIUA 3CMIA 4OFNA 4X0XA 1M0UA 3ZVJD 4RUVA 3EMPA 3DVWA 4KDYA 1PX7A 3GUSA 3QDNA 4ID0A 2HT9A 3IOSA 3ZTLA 4F03A 9GSSA 3KGKA 1SKRB 4ISDA 1KNGA 2FWFA 4IW9A 2N5BA 1ZYQB 3TRXA 4AF2A 1M2BA 2MZCA 2J9HA 4XTSA 2KOKA 5FHIA 5HR0A 1I9DA 3D5JA 2GQLA 1U6TA 4K7NA 4KCEA 3A3TA 5AIXA 3F0IA 2R5GA 5J5NA 2R37A 3V1WA 5AGYA 3I6AA 2REMA 4D73A 2CZ3A 3QAWA 6GSXA 4TRXA 2X8CA 1SYRA 4RQRA 4ULXA 4EF0A 3GMFA 3KP8A 1XOBA 1VRSD 5J9BA 4K7IA 2CAIA 1QXHA 3IHQA 4MH3A 3E3EA 4PQHA 4OD7A 5GSSA 4CDOA 1IYIA 1K0DA 1ZOFA 3C71A 2GT5A 4EKZA 3VWWA 4EVMA 3WT1A 3HHVA 2CVBA 3TJBA 5B6NA 2YNXA 1JZDA 2CZ2A 4XIHA 1CQGA 1EEMA 1TW9A 1S3AA 3HCZA 1WE0A 5D9TA 1U87A 4WF4A 2A2SA 2FGXA 1JLVA 5JCGA 3TJFA 4ZL7A 1G0TA 1MD4A 3BOAA 2FCHA 2PWJA 2H66A 1USBA 4TXVA 4DSQA 1H4OA 2WULA 4IJ3A 1GULA 5J4UA 4NXIA 2WGRA 1HD2A 3GTUB 4IVFA 2BTOT 4K0GA 3GKKA 2TIRA 2R6KA 1VF2A 2B7JA 5G2ZA 1ST9A 4TVEA 3DXBA 2IJYA 2JSZA 3ZITA 3AY8A 3HZ4A 4MA9A 4FYCA 3FZ5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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