3FZAA

Crystal structure of poplar glutaredoxin s12 in complex with glutathione and beta-mercaptoethanol
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
106
structure length
106
Chain Sequence
GSRLEDAVKKTVAENPVVVYSKTWCSYSSEVKSLFKRLNVDPLVVELDELGAQGPQIQKVLERLTGQHTVPNVFIGGKHIGGCTDTVKLYRKGELEPLLSEANAKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure-function relationship of the chloroplastic glutaredoxin S12 with an atypical WCSYS active site.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Populus tremula x populus tremuloides
total genus 37
structure length 106
sequence length 106
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-01-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3fzaA00
4L0UA 1OE8A 3F4RA 2F51A 5D9XA 1AC1A 3IK9A 3TRQA 1TRSA 5DCGA 5DJMA 1GSYA 4TVEA 3DGQA 1TP9A 1XVWA 4JU5A 2AV4A 2H0GA 5KN0A 2H1AA 4JR4A 3P90A 5JCGA 2RUFA 1W89A 1V9WA 1F3BA 2LSTA 1FAAA 4PUFC 17GSA 2E2MA 2R3XA 4OMVA 4EDZA 2MMZA 2RUEA 1GTAA 1OE7A 4OWYA 1JHBA 4GRFA 4I5QA 2HXKA 3QAGA 1PA3A 4HDEA 4D73A 4CDOA 3P8WA 1MEKA 2V32A 4EDYA 5CRHA 3LWAA 4PX1A 11GSA 3EWLA 4TXOA 5ECQB 3ZVJA 4ZB6A 3SWLA 5DAKA 2EIQA 1K0BA 3RDWA 5J4UA 5H5QA 1QGVA 2WS2A 3IC4A 5D73A 4HJ2A 1T3BA 5IPGA 5IOWA 3I43A 3APOA 4MP4A 1EOGA 1JZRA 3CSHA 2WDUA 3FZAA 4BVYA 4OFMA 4AJ8A 2KP1A 2OE3A 2ON7A 4DVCA 6GSVA 2GQKA 4NXIA 2H74A 2DMLA 4ECBA 3ISOA 2VOCA 1K0AA 2HZFA 1JLWA 2DJ2A 3TJKA 2XBQA 4O7HA 2IWTA 2WRTA 4K2DA 5F05A 2M46A 1AQXA 2KLXA 5ELGA 1JZWA 2YN1A 5IMCA 3GH6A 2DSAA 4XTSA 3BJ5A 4F82A 2LRTA 4DEJA 2OE1A 1VF4A 2MMNA 3F8UA 3HCZA 2IMKA 5COHA 5ELAA 2VCVA 3BCIA 4YH2A 1O8XA 3DVXA 4N10A 5J5NA 1OAZA 3VPTA 2E7PA 1M2BA 2FA8A 2R6KA 4WF4A 5E4WA 2GZZA 3ZIVA 3APQA 3TB2A 1B4PA 1X5DA 1VF2A 2HSYA 4XS1A 3F4TA 4BPYA 3LORA 5J9CA 2HFDA 1GTBA 3FR9A 3HYPA 1K0NA 1SD8A 1X9WB 2FLSA 4LA1A 4L5OA 2L6CA 5ECKB 4ZB8A 1OC8A 3IE3A 1SKRB 4XHMA 1GNWA 3G7IA 5IMDA 1YF1A 2I3YA 3V1WA 2BMXA 5CRWA 4HI7A 2KUCA 2JU5A 3ZMLA 3M9JA 1SYXA 1B9YC 3F6DA 3FZ5A 4FYBA 4HUAA 2ZUPA 1V58A 5ECSA 2DLXA 16GSA 1M9BA 4OFTA 1YJ6A 5CNWA 4ZL8A 5HR1A 3O6TA 3E0UA 4BWQA 1E2YA 2IJYA 1SKWB 4CW9A 2IPAA 3P2AA 1BQ7A 2CT6A 5DALB 3KH7A 2MMOA 2WFCA 3OR5A 3W8JA 2OBKA 3DRNA 2AB6A 2H19A 4MDCA 1F3AA 2GLRA 4HJMA 2KOKA 3VWVA 1H4OA 1R5AA 2O85A 1T8EB 3FHKA 1R26A 3DD3A 4KAEA 3KP8A 3HY2A 3LYPA 4KGIA 5ABRA 4I2UA 4AJ6A 2H6ZA 5ENUA 2OKAA 4QL7A 2DIZA 3H4KA 2HT9A 2XPDA 2A2RA 4XRDA 4WF5A 2AUVA 2OJLA 1A0RP 2LNSA 5F8BA 4V2MA 4ZBAA 1GLQA 1GSSA 5DQYA 2L57A 2GGTA 3U6VA 2XBIA 3IR4A 4K7IA 3FY7A 3D22A 4TRXA 4N0ZA 2P31A 1TXXA 2KP2A 3H93A 1SJIA 1XZOA 3LEFA 3CRTA 1A2MA 3UAPA 2GVPA 1BEDA 1GSDA 2H72A 1AQWA 3IXRA 5G5EA 4BL7A 2B3SA 2ALBA 3E3EA 5CO3A 2VL2C 1WWJA 1OYJA 4KCAA 2WB9A 1M9AA 1SK1A 5D9TA 3US3A 2GS3A 1V40A 3NZNA 3A5WA 1F6MC 5FHIA 5D9WA 1YZXA 6GSYA 1XWCA 2RM5A 1M0UA 1TTZA 5F06A 2HZEB 1U3AA 2XC2A 4EVMA 3I6AA 5G5FA 2IMDA 1O73A 3GIXA 1U88A 5H5SA 3WGDA 5AGYA 1YF0A 2DJKA 3M9KA 6GSTA 4I97A 1DSBA 2CVBA 1OVNA 2K9FA 2VCTA 3Q19A 1K0OA 3GRXA 5AISA 2PGTA 1A0FA 1AXDA 1XBSA 5CYYA 2GSTA 1ERWA 4GSNA 1UA5A 4RI6A 1NM3A 5B6NA 3FYGA 3I9V2 2PU9C 3L0HA 2FCHA 3IK7A 3DYRA 2A2SA 2NPBA 4BWSA 2B5EA 1PGTA 5IMFA 1OC9A 2N5FA 2F8FA 2R5GA 4ML1A 2JACA 1USBA 1HNAA 3QFBC 5AIXA 3ZYWA 1SD9A 1QMVA 2PVQA 2ZCTA 1GL8A 1SU9A 4MPFA 3DKSA 5EPFA 1M7TA 2EC4A 1ON4A 3H8QA 1RQMA 1G6WA 2JL4A 3KGKA 2H71A 4I2TA 3GL3A 4MZBA 1X5EA 1PL2A 1TRUA 2MBTA 2YCDA 4MH2A 1VF3A 3WD6A 5GAND 1TRWA 3GKXA 5D8IA 3CTFA 5IOXA 1B4QA 5J41A 4XCSA 1TDIA 3KIJA 1EGRA 5L71A 3QR6A 1XW5A 5AIVA 2F9SA 3L78A 5ECPB 3GKNA 2CAQA 1AQVA 2FUG2 2LEGA 4X1UA 2AAWA 1ST9A 3GSTA 2I4AA 1K3OA 4KB3A 3J7Yb 3AY8A 2IFQB 4MJAA 1B8XA 3N5OA 3O3TA 2C4JA 3IPZA 2QC7A 3TKSA 4DSQA 5LNKe 1TRVA 2LNTA 4ZB9A 4MZCA 2XHFA 3F9UA 4FH8A 3KMNA 2X8HA 3D5JA 3C71A 3ZL5A 2PVOC 1ERTA 3E9JB 4GQCA 4LMVA 2B6MA 5JWRB 4MZWA 4HEA2 1WJKA 3UL3A 4K0NA 3FRCA 1HD2A 2VD0A 1GNEA 4IP1A 3FZ9A 3MDKA 3UEMA 4KX4A 4O92A 2M80A 1V57A 2CQ9A 4KA0A 3D21A 1EV4A 4KNDA 4ECJA 3C7MA 1KTEA 3GSSA 2L6DA 2C0GA 1V98A 5E59A 2C80A 2Z9SA 3GTUB 3L9SA 4IGJA 4OO5A 4NPBA 2B5XA 1HNBA 3VWWA 1QXHA 2CZ3A 1O8WA 5IQYA 3VI5A 1NHOA 3VI7A 3LSZA 2YWIA 3UIWA 4O32A 2L4QA 3KM6A 5CP1A 5ECOB 1XIYA 4EF0A 1F37A 5F07A 2J23A 1J08A 3IOSA 3G9BA 3VFIA 4ACSA 3HVXA 4FO5A 3MAKA 4JE1A 4KCEA 3A3TA 5JCWA 2G2QA 4PQ1A 3ZRDA 4MJBA 2X8GA 3HJOA 1A24A 3C1SA 2YOIA 4XIHA 2ON5A 1JZDA 3TOTA 2YJ7A 4E8EA 2OA7A 1M2DA 3CTGA 3GMFA 2C0DA 4LLRA 1GWCA 3WGEA 1YY7A 5AN1A 1URMA 3LG6A 1QK8A 5DALA 4DSRA 1Y6EA 1HNCA 2H75A 19GSA 2H6XA 2M72A 4LL4B 5DBQA 4RQXA 4V2LA 2I9HA 3EMPA 3HJPA 4TW5A 2H70A 4AGSA 3GHAA 3VK9A 3FKFA 5ECLB 4FYCA 2C3QA 3VWXA 7GSSA 2HI7A 4N30A 3NOFA 4HU9A 4WR5A 2L5LA 3DXBA 4XS4B 3GYKA 2GSQA 5C04A 2CX4A 2K8VA 3GX0A 1TK5B 5KN1A 1M99A 4ZL7A 3IAS2 3EURA 4G10A 2N5AA 3HVSA 1XOBA 4WKWA 4ZL9A 5F0GA 1ZL9A 2MZCA 1BG5A 1AUCA 3TUEA 4ID0A 2I1UA 5DQSA 4POLA 4F0BA 2FGXA 2H0IA 4ML6A 1MTCA 2A4VA 1VGLA 1MD4A 4GQFA 2YWOA 4KDUA 5H5RA 6GSWA 2D2ZA 1S3CA 5DDLA 2AJQB 1M2AA 4IN0A 2LTKA 2K6VA 2V6KA 4GF0A 4TR4A 4ZIJA 4ZILA 5DAKB 4KW6A 4ZBBA 1A8YA 1GP1A 2GQLA 3IBHA 1GTIA 2OE0A 4K9ZA 4TR0A 1TI3A 3P7XA 3HDCA 4MF6A 1I9DA 3EU4A 1VRSD 2HZEA 2WCIA 3W6GA 5EL8A 2BTOT 3PINA 5IM9A 4PXOA 4OO4A 1ZYEA 1XW9A 2H6YA 3PH9A 3G7YA 5JWQB 3HZ8A 4WR4A 1SL2B 2QKEA 3RHBA 4K1FA 1PQNA 1U87A 3UJ1A 5LD0A 4MH3A 5HR0A 1AAZA 3LFLA 5GSTA 12GSA 1WRYA 5A4UA 4LMWA 2K18A 1WE0A 1UC7A 1A23A 4J2FA 2LJKA 1K0MA 5EY6A 2V6OA 3MWHA 4MPGA 2HNLA 2GQMA 4PQIA 1O81A 4OCFA 1YQ1A 1K3LA 2VUPA 3KD0A 2O8VB 3K8NA 3HVVA 2LKUA 3CSIA 1O7UA 2I81A 4ILFA 4XRAA 3W8SA 2DC5A 4JR6A 2P5RA 2GT6A 3KMOA 2DIYA 3HXSA 4WBRD 2H8LA 2VCWA 1NSWA 4PNGA 2KHPA 2R4VA 2FNOA 1A2LA 1RK4A 2IMIA 3TKSC 1SL0B 2LJRA 1TI1A 1QUWA 2EIRA 1ACVA 2C3NA 4K6XA 4MK3A 6GSUA 3EU3A 1KEBA 1ML6A 4EC0A 1K3YA 5ECHB 4MJEA 1LU4A 5HQPA 4N11A 4MA9A 1YDKA 1NHYA 1V2AA 4G2EA 1TJDA 5ECNB 4MJCA 4JEDA 1G7EA 1SK2A 3JCML 1GLPA 6GSSA 3EC3A 1ZOFA 4PUAA 3QCPA 3KJYA 5A4WA 1AIUA 2HRNA 1PX6A 3ZITA 2C3TA 3HZ4A 1Q98A 5B8AA 2H1BA 3QOUA 1XWGA 2L59A 2YNXA 1MD3A 2VCXA 4KSOA 4X0XA 5ECRB 18GSA 1N8JA 2H73A 4YAPA 4E8HA 3CSJA 2IFQA 3UBKA 2AHEA 2LS5A 4KUNA 1FVJA 3C73A 2K8SA 3UBLA 1FO5A 2IMFA 4PQHA 5HFKA 1XWAA 2IL3A 1W4VA 3GL5A 4XS6A 4TR3A 4MCUA 5IIZA 2NVLA 3FR3A 13GSA 4NV2A 2VCQA 1F9MA 2HE3A 2JADA 4L8EA 1WMJA 2B1KA 2JZSA 1PRXA 1QFNA 1SYRA 5HR3A 3WT1A 1ZCPA 1Z6MA 2YP6A 2LQOA 1GUKA 4AF2A 2RIIA 3GV1A 2N5BA 5D96A 2B5YA 1CQHA 4HOJA 3A2VA 3LJRA 2H0HA 4RQRA 3ED3A 3VPQA 3GN3A 2YJHA 3ZFLA 3BCKA 4GXZA 2CAIA 2CVKA 3GTUA 4FIWA 3UVHA 1B48A 3I69A 2X64A 1G7OA 2CA8A 3A2WA 3O76A 3M1GA 1R4WA 5IMAA 3J7Yk 4WETA 2VL9A 1BAYA 1SENA 2FWHA 2X99A 4KE3A 4V2NA 3TRXA 4NHZA 2RM6A 1PL1A 1GSEA 1T00A 5GAPD 4HZ2A 3CMIA 3WT2A 1GSUA 1GRXA 4I6XA 2PWJA 2X8CA 3GKKA 5G1KA 3WGXA 2CVDA 5HFIA 1T4YA 3CBUA 1DUGA 4YAVA 2DJ0A 3RAZA 3IDVA 4QL9A 1EV9A 4ZXGA 5IPHA 2VO4A 1X0RA 3D6IA 3TDGA 1YEPA 1OKDA 1WPIA 3LYKA 3KTLA 4K0GA 2MBSA 3LQ7A 2H1DA 3MNGA 2DJ3A 4FYUA 1O85A 1X5CA 1Q4JA 1FB0A 4TR1B 4MMMA 1FG4A 1Z6NA 3M0FA 1JLVA 3WYWA 3EE2A 5J9BA 5INYA 2E0QA 1A2JA 3BD2A 2O7KA 1SJ6A 1K0DA 2GDRA 3UARA 4TKYA 1IYIA 3GA4A 1PD21 3C8EA 3KP9A 5CREA 1WOUA 1EEMA 1R5PA 1ILOA 2VCZA 4XS4A 5IO0A 1VF1A 3M3MA 1BYEA 1YEXA 4NWYA 5G2ZA 1EZKA 3Q74A 2LV3A 3ERWA 4HQSA 2YV7A 5EVOA 3F3QA 4K7OA 1XWKA 2IIYA 5DCHA 1Z7RA 1AW9A 1GULA 5ID2B 4HQZA 2WGRA 4WEYA 2QSIA 4I8BA 2YANA 2XPEA 3QAWA 3U5RE 2C0FA 4LL1B 2DJ1A 2P5QA 3L4NA 3D4MA 1TK8B 1EP7A 4IQ1A 5B8BA 3KCMA 2PUKC 4NAXA 2HSHA 1XW6A 4L0WA 3APSA 1BJXA 3DEXA 2GZYA 1H75A 2WZ9A 2ZNMA 3RHCA 1HQOA 2F8AA 4ECIA 4EE0A 3ERFA 3BBYA 4IQAA 4IVFA 1WP0A 1THXA 1WIKA 3QPMA 3TJFA 3BOAA 2HLSA 2V1MA 2FHEA 4POKA 3F0IA 1X9MB 3TJJA 4WXTA 2L4CA 3QAVA 3M8NA 1XOAA 4QQ7A 5B6MA 3FR6A 1EEJA 3ZIJA 4GCIA 2QGVA 2O87A 4DSSB 2VAFA 4HU7A 3ZMKA 3KEBA 4Q5RA 1A8LA 4J56E 1FB6A 1KBNA 2C8UA 3HKRA 3S9FA 2P0GA 4YQMA 1Z9HA 1ABAA 3KXOA 5D93A 1XPVA 2H76A 1Z7PA 3GFKA 3KH9A 2C1YA 4KH7A 3ZLPA 5CAXA 1X9SB 2NDOA 9GSSA 4OFNA 3ZFBA 4KDXA 3EINA 4TXVA 1YKAA 1HYUA 1K0CA 1PN9A 3F3RA 3TKSE 4TN8A 20GSA 2DJJA 2CV4A 3TCOA 8GSSA 1XFLA 1OKTA 1RW1A 1TU7A 4F2IA 1T1VA 2FWEA 3F63A 1F2EA 3DIEA 5KN2A 5FT3A 2C0EA 3LXTA 3GKMA 1SL1B 4RI7A 3QMXA 1JFUA 3R2QA 4H86A 4D73B 2DBCA 3TGZA 2GT5A 4TXOB 1FOVA 3UOMA 2PBJA 2JSYA 4KDYA 3H1NA 4Q5QA 1PSQA 3HA9A 2R2JA 2MYGA 4ULXA 4IW9A 2JSZA 2TIRA 2WJUA 5CRDA 4F03A 3CXGA 4GTUA 5A5KA 1S3DA 1DE2A 2VD1A 4Q5FA 4IJIA 2IMEA 1MDIA 1ZYQB 3HD5A 2REMA 1MDJA 22GSA 4RUVA 1R7HA 5KEJA 2TRCP 1TK0B 5CRGA 1ZGNA 3GUSA 2FD3A 5C00A 2NTOA 2CX3A 1PKZA 4POMA 2H30A 1B9XC 1Z3EA 3EMXA 1J9BA 2LRNA 2FA4A 1PX7A 3QFAC 2GTUA 1ERUA 1UN2A 1ZZYA 3DMLA 2HRFA 5IMZA 2PPTA 4MF5A 3N9JA 1UVZA 1J0FA 4F9ZA 2VLUA 1T7PB 2GSSA 2BJXA 1C72A 4BVXA 4MF7A 1GSFA 5ECMB 4EUYA 5A4VA 1KNGA 5HFGA 2IN3A 1BX9A 1GH2A 2R37A 3TKRA 5D9VA 1GUHA 2LUSA 4G9HA 4JBBA 1DBYA 4PURA 2VLTA 4JZQA 1TW9A 2PN8A 3IAM2 3GNJA 3TOUA 3KTBA 3TJGA 5ECIB 5IO2A 3DWVA 3VURA 2H1GA 4IHUA 3CRUA 5LCZA 4IS0A 3ME7A 3TRPA 4POBA 3SBCA 4K7NA 1TKDB 3RBTA 4HZ4A 4YQUA 4IJ3A 4V1Ap 4YQVA 2G0FA 2NBSA 2YZHA 1Y25A 2H01A 4EXJA 3VLNA 4HS1A 2YPMA 4IBPA 1ZMAA 2VIMA 4P3YB 1XCCA 2MMAA 1NW2A 2GSRA 3LXZA 5JWOB 2YWNA 4GSSA 2AYTA 1PMTA 3FEUA 3G7JA 3NIVA 2ES7A 14GSA 3PGTA 1E6BA 2DMMA 2V2GA 1SK0A 3ERGA 1FW1A 2FY6A 4JRRA 3F4SA 4OCEA 2H66A 5G31A 3HJMA 3MSZA 3ZTLA 5KN3A 2F3MA 2V41A 2O89A 3VWUA 3FK8A 3DVWA 4TR1A 1I5GA 3RPPA 1GUMA 4TOPA 1N2AA 2VLVA 3FZ4A 3IV4A 3TKPA 4MABA 2PMTA 2LQQA 4CHSA 4J57E 1FHEA 4O5RA 4BA7A 3IA1A 2B1LA 2CZ2A 3D0ZA 4IELA 5GSSA 3EYTA 1G6YA 2LJAA 4GSTA 3UMAA 1EP8A 3Q6OA 1MDKA 3QD9A 4OD7A 4ZBDA 1XXUA 1Z5YE 1GTUA 3TKQA 1YKCA 1DE1A 2VM2A 2RLIA 3TJBA 5B7CA 1TU8A 1LBKA 3F6FA 5IMVA 4Z7XA 2TRXA 10GSA 1G0TA 3UVTA 3LGCA 4ISDA 4PGTA 2E2GA 5DVBA 4PNFA 2YZUA 4X43A 4Q5NA 5ID2A 5HR2A 3C1RA 2JZRA 4G19A 1OC3A 2OBIA 3Q18A 3EVIA 2J9HA 2VL3A 3A2XA 2FWGA 1FVKA 3HHVA 3L9VA 3IHQA 2PERA 3GH9A 1IYHA 4WBJA 3H79A 1THOA 1GSQA 2FWFA 3RPNA 1O6JA 2OACA 1EOHA 3GURA 1XVQA 1XWBA 2EIOA 3D4TA 5DJLA 5J3RA 1JZOA 2OADA 2LRCA 3GX8A 2WULA 4KSMA 4NMUA 2GZPA 1QQ2A 2VM1A 1SJZA 2B7JA 3CYNA 4IP6A 3ME8A 1T4ZA 1TOFA 1CQGA 4GLTA 1S3AA 4L5LA 4GWRA 2JZTA 2B7KA 2HYXA 4ECCA 4N0VA 1PKWA 3KZQA 3PR8A 4IKHA 3ZREA 5G1LA 4EO3A 3QDNA 3L9UA 4V1Ag 4EL1A 4DSSA 5JCUA 4K8MA 3FW2A 3ZVJD 4MLYA 2VL2A 1U6TA 2YV9A 4AJ7A 2YWMA 1EGOA 4EKZA 5FWGA 1SKSB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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