1KEBA

Crystal structure of double mutant m37l,p40s e.coli thioredoxin
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SDKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKLIASILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGEVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin 1
publication title Structural Consequences of Replacement of an alpha-helical Pro Residue in E.coli Thioredoxin
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Electron transport
total genus 31
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2001-11-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1kebA00
1GUKA 1FG4A 4ID0A 3IK9A 5C00A 3HD5A 1YY7A 2HRNA 5J5NA 4G9HA 1JZDA 5IPHA 3CSIA 1RK4A 5ID2A 2FA4A 1ZGNA 3ERGA 4FYBA 1K0MA 2H6XA 4HUAA 1THXA 5AIXA 4PQIA 2MMZA 2R5GA 3L9SA 2PWJA 4JE1A 2PMTA 11GSA 1KBNA 1YF0A 1OE7A 2VM2A 4L5LA 1DSBA 2H0HA 1A8YA 5CP1A 1G6WA 2OJLA 3TRQA 2X8CA 4WR5A 4V2NA 4OO5A 3TKRA 19GSA 1URMA 4MP4A 3GA4A 4POKA 4HOJA 1XZOA 4PGTA 2BMXA 2V41A 3I43A 1BYEA 3KIJA 3PINA 1PA3A 1XBSA 3O76A 2OE3A 4I8BA 12GSA 5G5EA 1E6BA 5F06A 4PUFC 2RUEA 3TKSA 4EO3A 2JZTA 2FNOA 4TW5A 2IMDA 3C71A 1KNGA 1EWXA 3N5OA 4TXVA 5AIVA 4GTUA 3FYGA 1W89A 1YKAA 2H0GA 2YWNA 3TB2A 5E59A 3EWLA 3VLNA 4PXOA 4I2UA 3RPPA 1KTEA 5J41A 5H5SA 4ZILA 2FGXA 1XCCA 3VI5A 2GGTA 2VD1A 3UOMA 4WEYA 3N9JA 2CVKA 2GQLA 4TR1B 3KD0A 4NXIA 3F3QA 1J08A 3GYKA 1XWAA 1THOA 3RDWA 1PSQA 1SJ6A 4POLA 3TGZA 1A2LA 1Z5YE 3WT1A 3EINA 4TN8A 3LYPA 4PX1A 10GSA 1N8JA 3CMIA 1ZCPA 5G1KA 2YZUA 4OCEA 2OKAA 3EC3A 3HA9A 4I6XA 1K0NA 1XIYA 1A2MA 5LNKe 5ABRA 5ECPB 2CQ9A 4K7IA 1ABAA 4KSMA 2BTOT 5G1LA 2G0FA 4IKHA 5C04A 2X8GA 5J3RA 3DEXA 3O6TA 5CRHA 1XWBA 1TRVA 2H6YA 3AY8A 4RI6A 2LS5A 1O6JA 2VLTA 2DMMA 1SK0A 2R2JA 1FAAA 3WGEA 3HKRA 3IAS2 1PD21 2C3TA 2XBQA 2HT9A 2M46A 4V1Ap 3HYPA 3F0IA 1ON4A 1YDKA 2JU5A 3EMPA 4FO5A 2B5XA 2B3SA 3LXZA 5ECMB 1PL2A 1F3BA 4ECIA 4P3YB 3DVXA 5D9XA 3C1SA 2VO4A 3ZMLA 2PN8A 4EE0A 4JZQA 3ZIJA 13GSA 3P2AA 3VWUA 3UL3A 1IYIA 2RUFA 3GUSA 3LWAA 3ZYWA 2LQOA 1OC8A 4IGJA 2PVOC 3F4SA 3P90A 6GSTA 2XC2A 2YWMA 3TKSC 2AAWA 4IJIA 2N5FA 5A4UA 1USBA 2NPBA 4NHZA 3FHKA 3SBCA 3KTLA 1GSYA 4HJ2A 2L4CA 3D6IA 3Q74A 1OAZA 4WF4A 3GNJA 3FZAA 3DRNA 2H6ZA 4ZIJA 1GSUA 2GDRA 4YH2A 3A5WA 3HY2A 5J4UA 5B6MA 1O73A 2AYTA 2DC5A 2P5RA 3A2XA 4K0NA 2AB6A 1GTIA 3UMAA 4L0WA 3G9BA 3KJYA 2H8LA 6GSSA 2CT6A 1SK2A 3HZ4A 4K9ZA 1LU4A 5B8BA 2DJKA 4K2DA 4XS4B 1GRXA 1OYJA 2N5AA 6GSXA 2DJ1A 3APOA 3LORA 1CQHA 4DEJA 4H86A 3IK7A 2O85A 3PGTA 5DQSA 4O7HA 2CZ2A 2RM5A 3H4KA 2O7KA 2B5EA 3VFIA 5HFKA 3K8NA 2C0GA 3H93A 4XS4A 1QUWA 1OC3A 2VCZA 2X64A 2VIMA 2LV3A 1UA5A 1TP9A 1HD2A 2R6KA 2CZ3A 4NV2A 2C4JA 5ELAA 1GSSA 2HSYA 2P0GA 3LG6A 5GAND 2DLXA 5INYA 1TU7A 5IMAA 2VOCA 3U5RE 3M8NA 4ZB6A 4ECBA 3MAKA 2VCVA 4WF5A 1U88A 4OMVA 2WGRA 4EL1A 4LL4B 2RM6A 3KZQA 3D4TA 3APSA 5ECSA 3TRPA 5H5RA 1XVQA 2J9HA 5JCUA 2H19A 3L9UA 4MH3A 5JWRB 2DSAA 3ZVJA 1ST9A 4HDEA 1TK8B 1QQ2A 2AHEA 2FWEA 1YJ6A 16GSA 1X5EA 1ZYEA 4V2MA 2VL2A 3CTFA 1AW9A 2IIYA 1JLWA 3IOSA 4F03A 2B6MA 4NAXA 4J57E 3HXSA 3EMXA 3KCMA 3U6VA 1QGVA 4IQ1A 3MSZA 5B8AA 4YQUA 4LA1A 4TOPA 1ZOFA 5DJLA 3E0UA 2H0IA 3QPMA 4TVEA 2C8UA 3F4TA 4K1FA 1Q98A 1EZKA 1GNWA 3GHAA 2I9HA 2QSIA 4K6XA 3L9VA 2H01A 3HJMA 2GSRA 2IMIA 4MDCA 4KDUA 1OKDA 4WBRD 1EP8A 2OE0A 1VF1A 2H73A 4EC0A 4OFTA 2TIRA 1GP1A 1GSQA 3BJ5A 1MEKA 1S3AA 3GKXA 6GSYA 4BWSA 4KNDA 1IYHA 4MJAA 2YOIA 4IJ3A 1JZRA 5KN0A 2IL3A 6GSUA 1T00A 3HDCA 1UVZA 3RHBA 4ILFA 4J2FA 2CA8A 2CAQA 1ERUA 4KUNA 2LNSA 1G6YA 5DALB 1YF1A 2IMKA 3CBUA 3LFLA 1ZMAA 2MBSA 2DMLA 1S3CA 4V2LA 5CRGA 4PNFA 3KXOA 4YQMA 5G30A 2GTUA 3O3TA 4GQFA 4HQSA 2A4VA 1Z6MA 2B7JA 2IWTA 3BOAA 4XIHA 1FB6A 2DIZA 1SENA 2A2SA 1MD3A 4GRFA 5DALA 4GXZA 3VI7A 1AUCA 3TJGA 4KDYA 4G19A 1T4YA 4K7OA 4ML6A 2VL3A 1F6MC 2QGVA 2HYXA 2H75A 3QAWA 2FCHA 3GURA 4E8EA 5F0GA 1WOUA 1LBKA 1QXHA 2VL2C 1O85A 3FK8A 2JSYA 1K0CA 2IFQB 3C7MA 2LJRA 1MDKA 4JR6A 3UARA 2ES7A 4KCAA 2YJ7A 1V98A 2C80A 4PURA 1EEJA 1X9MB 4EDZA 2KP2A 1XW5A 2H72A 1TOFA 2WJUA 1AIUA 1A8LA 1RW1A 2F8AA 5LD0A 1N2AA 1O81A 1H4OA 1UC7A 1VF4A 4MLYA 3MDKA 2YANA 3APQA 1GTUA 4AJ8A 4ZL7A 4E8HA 2IFQA 2NDOA 3KMNA 1GUMA 4OFNA 1NHOA 2IJYA 3QMXA 4Q5NA 2MMNA 4QL9A 1BAYA 1AQVA 4X0XA 5CNWA 5HR0A 2V1MA 4TKYA 3NZNA 2H70A 3F6FA 4K7NA 1O8WA 2H76A 1TXXA 3HVVA 1SD8A 4HI7A 3UIWA 5IMDA 3FW2A 2L4QA 3E3EA 1F37A 1SJIA 5D9WA 3CRUA 5F8BA 1GUHA 4FYUA 3DMLA 1BJXA 4ZBAA 2EIRA 1FVKA 5IMZA 3L78A 4IHUA 4QL7A 2VLVA 2OBIA 2A2RA 5DVBA 1FOVA 3HZ8A 4K0GA 4DSSB 4CW9A 2KHPA 3BCKA 1QK8A 2CV4A 1WE0A 1DUGA 4XRAA 3KMOA 3UBLA 5KN3A 2WCIA 4EUYA 1HNBA 2PUKC 1SU9A 4GWRA 2EIOA 2M80A 4TXOB 3L0HA 1RQMA 4L5OA 4DSSA 2YN1A 2QC7A 3FKFA 3UVHA 1T4ZA 5ECOB 1FHEA 4MF7A 3ED3A 2VD0A 4WETA 1AC1A 1K3OA 1GL8A 4PUAA 2YZHA 5ECNB 4HJMA 2AV4A 3M9KA 4TR1A 4GSNA 4IP6A 4N30A 2K6VA 1TK0B 1WMJA 2DIYA 2LRNA 2RLIA 5G2ZA 4EXJA 4TXOA 4MH2A 5DDLA 3LGCA 2H71A 1HNAA 2OACA 1YEPA 1V57A 1NW2A 3FZ4A 2OA7A 2LJKA 2FUG2 5A4WA 2GT6A 3VWWA 3UBKA 3QR6A 3I69A 1SL0B 3GMFA 3M9JA 5EL8A 2KOKA 3EURA 3KM6A 4IQAA 2MMOA 4I97A 4F82A 1XXUA 2DJ0A 4IW9A 1XFLA 1J0FA 2B7KA 2O8VB 2XHFA 3DYRA 4J56E 5HR1A 2DJ3A 1Z9HA 5J9CA 2X99A 1WP0A 4XS6A 3BD2A 1K0AA 4BVYA 1TRWA 1JLVA 2IPAA 3ME8A 2FLSA 3QDNA 3LEFA 2C0DA 5DCHA 2LSTA 5CRWA 2FWGA 2VAFA 4BVXA 1EGRA 4HS1A 1K0OA 4ZL8A 2J23A 1SL1B 2LEGA 1GLPA 2IMEA 4O32A 2NVLA 1M2AA 1O7UA 1M9AA 1XW6A 2JADA 5D93A 1R26A 4MF5A 1TTZA 2AUVA 3UVTA 1ILOA 3GL5A 5JCGA 1JFUA 1NM3A 3H1NA 4POMA 4KX4A 1Q4JA 5IMFA 1JZWA 7GSSA 1XVWA 1OE8A 1K0DA 2WDUA 3UEMA 3JCML 3EE2A 4YQVA 3W6GA 1I9DA 2VCWA 2KUCA 5IIZA 4L0UA 2YV9A 3EU3A 3GKNA 4I2TA 2HXKA 1SYRA 2XBIA 3TKQA 1HYUA 4OCFA 1T3BA 1EV9A 4KCEA 3KP9A 3ME7A 4DSRA 5DAKB 2YJHA 4LMVA 5A5KA 4V1Ag 3GX0A 4L8EA 3PR8A 4AJ7A 4ZB9A 1S3DA 2WFCA 4RUVA 2DJ2A 3TCOA 3LQ7A 1QMVA 3LSZA 4MZWA 3ZITA 2H30A 2DJJA 1A2JA 4JR4A 5COHA 5JCWA 3HJPA 3DGQA 5DAKA 1KEBA 5CRDA 2B1KA 2CX4A 5ECRB 3GL3A 1HNCA 4ISDA 4FYCA 2JACA 3FZ5A 1G0TA 4AF2A 5CO3A 1SKSB 5G5FA 1WRYA 4KW6A 2LJAA 1B4PA 5ENUA 1K0BA 5ELGA 5IOWA 5ECIB 2HZFA 3LYKA 2JSZA 1WWJA 2PERA 5IMVA 1PGTA 22GSA 4HU7A 2GSSA 2C1YA 4GQCA 3RAZA 2VCXA 1UN2A 2OE1A 3FZ9A 3GKKA 1PX7A 4RQXA 4NMUA 5B7CA 3DIEA 1GSFA 3P8WA 3Q6OA 18GSA 3L4NA 4ZBBA 2ZCTA 2H1AA 2O87A 1XOBA 5G31A 2E2GA 4X1UA 3A2WA 3GN3A 2LRTA 3ZTLA 3ZFBA 3LXTA 5AN1A 4RI7A 4F0BA 1PL1A 5A4VA 2I1UA 5IQYA 2H74A 14GSA 2LKUA 3NOFA 3BBYA 1U3IA 5IMCA 3CYNA 1YKCA 3M0FA 2C3NA 2L5LA 2KLXA 3S9FA 4ZB8A 1ERTA 2OBKA 3GH6A 2WZ9A 3GSTA 1TJDA 1V40A 3KGKA 4KA0A 2AJQB 4MA9A 1M7TA 5HQPA 1ML6A 1DE1A 1TK5B 3RBTA 4JBBA 1EEMA 4XS1A 1EV4A 1A24A 2B5YA 1K3LA 4EKZA 4GCIA 1EOHA 2V6OA 1R7HA 2G2QA 4EVMA 4JU5A 1H75A 3QFBC 2JL4A 5ECQB 4JEDA 1Z7PA 3SWLA 1Z7RA 3FY7A 1X9SB 3F9UA 5IPGA 3QCPA 1VF2A 2NBSA 2GQKA 3VWVA 2H1GA 1M0UA 1U3AA 4MZCA 1B8XA 2JZSA 1PN9A 2YWOA 3IAM2 5ECHB 2IMFA 4HZ4A 1T7PB 1AXDA 2V6KA 2ZUPA 2C0EA 4G2EA 2B1LA 2KP1A 4IP1A 2R4VA 3WD6A 2GZYA 2VCTA 5JWQB 3D21A 5D9VA 3FRCA 2M72A 4O92A 3TDGA 2LRCA 2YV7A 3P7XA 1A23A 1FW1A 4BA7A 4Q5QA 4NHWA 2WRTA 2LTKA 5EY6A 2L57A 2E2MA 4TR4A 1OC9B 4F2IA 5EPFA 2YNXA 1J9BA 3KH9A 3HCZA 3WYWA 3ZRDA 1B48A 1F2EA 3F4RA 1PRXA 3ZIVA 5IO0A 2CVDA 3H79A 3GV1A 1Z3EA 4F0CA 2LNTA 4XRDA 1TI1A 1BEDA 3US3A 4MCUA 3CSHA 1FO5A 1XW9A 3J7Yb 2LUSA 1OC9A 3DXBA 4HQZA 3TUEA 3ZLPA 9GSSA 2VLUA 1JHBA 3HVSA 3QFAC 2CVBA 4GLTA 4OO4A 4IBPA 4IS0A 3EU4A 1GTBA 1Y25A 1ZL9A 5DJMA 17GSA 1SD9A 5JWOB 1SKWB 2F3MA 1ERWA 5HR2A 1C72A 2XPEA 3KEBA 2HLSA 1NSWA 1SKRB 4HU9A 2TRXA 4ZBDA 3A3TA 4WXTA 4LL1B 1FVJA 4GSSA 2L6DA 4WKWA 4HEA2 1MDJA 1M99A 5GAPD 5CYYA 5F05A 1GLQA 3TJJA 5KEJA 2K18A 2VM1A 4XHMA 3C8EA 2MMAA 3VWXA 3EVIA 1TW9A 2GZPA 2WULA 5CAXA 1V9WA 1R5PA 3KH7A 3G7IA 3D5JA 3GH9A 3ISOA 3VK9A 1YZXA 5J9BA 1ACVA 4TRXA 2BJXA 5ECKB 5CREA 2MZCA 5HFGA 3DD3A 1TDIA 1ZYQB 1YQ1A 2GVPA 3DKSA 5H5QA 4Q5RA 3WT2A 4KH7A 1XWKA 1F9MA 3J7Yk 4OFMA 4XTSA 3A2VA 3W8JA 1VF3A 1K3YA 4N0ZA 5DCGA 2YWIA 1V2AA 2I3YA 2ON7A 4GF0A 2FD3A 1BG5A 2HRFA 1ERVA 3TKPA 1X5DA 6GSWA 3GX8A 1EOGA 5IO2A 2PPTA 4IVFA 5GSSA 4O5RA 4AJ6A 3TJKA 1DE2A 4MPFA 1V58A 2I81A 3Q18A 4N11A 1Y6EA 2F51A 3QD9A 4GSTA 2K8VA 4K8MA 2VL9A 2WS2A 3ZFLA 3CRTA 5D8IA 5D96A 2EC4A 1R4WA 2IN3A 3FR3A 1X9WB 4IELA 3EYTA 3IR4A 5AISA 2HZEB 3ZVJD 4G10A 1BX9A 2V2GA 1X5CA 2REMA 3WGDA 5DBQA 3IV4A 3GFKA 5KN1A 3TJBA 1PMTA 1B9YC 4D73B 4ECJA 1WIKA 2FWHA 2L5OA 3FEUA 1SL2B 2H1BA 3G7JA 3ZL5A 3IRAA 2HZEA 3DWVA 3F8UA 2RIIA 4I5QA 2K9FA 3CXGA 3FR9A 2C0FA 2GSQA 2YP6A 3VPQA 20GSA 4MJCA 4KE3A 2JZRA 1W4VA 3IBHA 2OADA 4N0VA 4POBA 3G7YA 1GTAA 4D73A 3IA1A 4BWQA 3TOUA 3ZMKA 3OR5A 4LMWA 2L6CA 1G7OA 2CAIA 3ERWA 2O89A 2Z9SA 2ZNMA 1F3AA 4YAVA 8GSSA 3TKSE 5D9TA 3ERFA 4OD7A 1M2DA 1G7EA 3ZREA 1VRSD 1OKTA 3HVXA 6GSVA 2ON5A 3UAPA 1A0RP 1MTCA 2FHEA 3R2QA 1TRUA 2GS3A 4MJEA 5HFIA 3I6AA 1U87A 3LJRA 1E2YA 1JZOA 2HSHA 1GULA 1MD4A 4RQRA 3F63A 4MJBA 4YAPA 1EP7A 4OWYA 4PQ1A 1GSEA 1SK1A 3IHQA 3D22A 1NHYA 5KN2A 5LCZA 1M2BA 1PX6A 2GZZA 5F07A 1Z6NA 1GNEA 2HE3A 4KSOA 2FWFA 4WR4A 3QAGA 2VUPA 1XPVA 5FT3A 1GSDA 4KGIA 5FWGA 4XCSA 3FR6A 1PKZA 2K8SA 4EDYA 3I9V2 4MK3A 4Z7XA 4JRRA 1TRSA 3KTBA 1EGOA 3V1WA 3GKMA 1A0FA 3GSSA 1OVNA 2XPDA 5L71A 1T1VA 2N5BA 3PH9A 2HFDA 4Q5FA 1DBYA 4HZ2A 1TI3A 2E0QA 1GH2A 2H1DA 5IOXA 2LQQA 3RHCA 1WPIA 2PU9C 1ZZYA 3TOTA 1R5AA 4KAEA 5GZZB 3D4MA 3MWHA 1MDIA 1FB0A 4DSQA 3TRXA 2GQMA 1B4QA 2YCDA 2MYGA 3C73A 2VCQA 4NV5A 2P31A 2GLRA 2CX3A 4ZL9A 1U6TA 4MMMA 4BPYA 3HHVA 4NWYA 5EVOA 3UJ1A 2NTOA 2YPMA 3GIXA 3HJOA 4BL7A 4DVCA 3C1RA 4LLRA 2MBTA 1TU8A 2R37A 2L59A 4WBJA 4ECCA 1PQNA 3CTGA 3IPZA 2PVQA 2D2ZA 1T8EB 4TR0A 1PKWA 2PBJA 1VGLA 4N10A 3VPTA 3ZZXA 5E4WA 3M1GA 2HI7A 1XWCA 4ZXGA 2F8FA 1B9XC 3F6DA 1HQOA 3IE3A 5IM9A 3Q19A 1AQXA 3IXRA 2E7PA 3KP8A 1SYXA 2GT5A 2V32A 3DVWA 4MF6A 4KB3A 2ALBA 3GTUB 2HNLA 4TR3A 1LJRA 4EF0A 4KDXA 3CSJA 2TRCP 4AGSA 4CHSA 1CQGA 2EIQA 5GSTA 3W8SA 2QKEA 5FHIA 4CDOA 3QOUA 4FH8A 3IC4A 2F9SA 4MZBA 3VURA 2C3QA 1SJZA 3NIVA 4MABA 4NPBA 3GRXA 3GTUA 3QAVA 1TKDB 1AAZA 5DQYA 1WJKA 3E9JB 3M3MA 4PQHA 3D0ZA 5HR3A 1YEXA 2FY6A 2GSTA 3IDVA 3WGXA 1XWGA 1M9BA 1QFNA 2R3XA 1I5GA 2FA8A 3RPNA 3F3RA 4IN0A 3BCIA 4ACSA 1BQ7A 2H66A 4ULXA 3MNGA 4FIWA 5AGYA 4X43A 2DBCA 2WB9A 4ML1A 3TJFA 4QQ7A 4PNGA 1O8XA 5D73A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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