The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
36
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sequence length |
108
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structure length |
108
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Chain Sequence |
b'MAREELRRHLVGLIERSRVVIFSKSYCPHSTRVKELFSSLGVECNVLELDQVDDGARVQEVLSEITNQKTVPNIFVNKVHVGGCDQTFQAYQSGLLQKLLQEDLAYDA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structure of glutaredoxin domain of human thioredoxin reductase 3
rcsb |
| molecule keywords |
Thioredoxin reductase 3
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule tags |
Oxidoreductase
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| total genus |
36
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| structure length |
108
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| sequence length |
108
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature |
ec
1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase. |
| pdb deposition date | 2009-04-29 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00462 | Glutaredoxin | Glutaredoxin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 3-Layer(aba) Sandwich | Glutaredoxin | Glutaredoxin |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2OE1 A; 1HNC A; 3L78 A; 1V9W A; 5G31 A; 1XVQ A; 3VPT A; 2LRC A; 2H75 A; 3UJ1 A; 3HD5 A; 4JED A; 2PVQ A; 3VWV A; 5G1K A; 2IN3 A; 3QCP A; 5ECN B; 2VM2 A; 1AQW A; 5FWG A; 1PRX A; 2KP2 A; 6GSS A; 5HFG A; 3FR3 A; 4RI6 A; 3QAV A; 2K8S A; 1THO A; 2GGT A; 4TRX A; 5DCH A; 3MWH A; 1AUC A; 3G7Y A; 3DGQ A; 2MYG A; 1AW9 A; 1TRW A; 1QMV A; 2GQM A; 1HD2 A; 1PKZ A; 6GSV A; 1B48 A; 2GZP A; 2N5B A; 1H75 A; 1QXH A; 1B9X C; 4JU5 A; 4KGI A; 2DC5 A; 3ZFB A; 1XW9 A; 4KAE A; 2C0D A; 1TP9 A; 1SYR A; 3AY8 A; 3ZTL A; 1U87 A; 2TRX A; 3DXB A; 2R37 A; 2X99 A; 4CDO A; 1EV4 A; 3TOT A; 1XW6 A; 4V1A g; 4AJ7 A; 4KND A; 2PER A; 4K7O A; 3WT2 A; 1AIU A; 4QL7 A; 3Q6O A; 5CYY A; 4MJC A; 1A0R P; 4BA7 A; 4GQF A; 2HRN A; 1YY7 A; 1A0F A; 4GSN A; 4KH7 A; 1XZO A; 3GX0 A; 3TGZ A; 1R5A A; 1V40 A; 2JSY A; 2NPB A; 4L5L A; 5CRE A; 1GP1 A; 5GSS A; 2KLX A; 3I6A A; 5A4U A; 1SD9 A; 5ELG A; 5AN1 A; 1S3C A; 3I43 A; 4OD7 A; 3EYT A; 2MMZ A; 3PIN A; 4WR5 A; 4EO3 A; 1TJD A; 2E7P A; 1FW1 A; 2DIY A; 3VFI A; 1TOF A; 3ED3 A; 3GHA A; 3M1G A; 4MK3 A; 1FOV A; 5IMC A; 2V1M A; 3C7M A; 1ZCP A; 4MF5 A; 2H76 A; 2DSA A; 3UL3 A; 1O7U A; 4DSS B; 2LEG A; 4OO4 A; 3HVV A; 4ZBD A; 2FWE A; 2OAD A; 4MPG A; 4V2N A; 2PVO C; 5LNK e; 2AAW A; 2CVB A; 4ZBB A; 4PUR A; 2ON5 A; 1R26 A; 3EIN A; 1NHO A; 5B6N A; 4PNG A; 3C1R A; 2ZUP A; 1TXX A; 3QD9 A; 4JZQ A; 3TJB A; 2JZR A; 4XS1 A; 3M0F A; 2QGV A; 2YWM A; 2FWF A; 1U88 A; 5EVO A; 3US3 A; 2H66 A; 11GS A; 1EGO A; 1OC9 A; 4H86 A; 1JZO A; 3ZZX A; 5GST A; 2FA8 A; 2H0G A; 1J08 A; 2DJ2 A; 3LEF A; 2RUF A; 2QSI A; 5JCU A; 2PPT A; 3EUR A; 16GS A; 1PL1 A; 4TR0 A; 4Q5R A; 4IP6 A; 3GSS A; 1AAZ A; 1FO5 A; 2WB9 A; 3ERW A; 4TR4 A; 2J23 A; 3VWU A; 3DRN A; 3LFL A; 1GNE A; 4GF0 A; 2YZH A; 4N10 A; 5IMV A; 2XBQ A; 2YNX A; 2B7J A; 3EMX A; 2REM A; 4J2F A; 2HNL A; 3IK9 A; 3H4K A; 1A2M A; 1HQO A; 3KCM A; 5J9C A; 1T00 A; 3GKN A; 2CVD A; 1A2J A; 1Q4J A; 2B1L A; 1TK8 B; 1JZD A; 4N0V A; 1MDK A; 2WFC A; 5JWR B; 2P5R A; 3TJJ A; 3HZ8 A; 2GT5 A; 5ECO B; 3KZQ A; 4EKZ A; 4TVE A; 2V32 A; 3RPN A; 1VGL A; 4XRA A; 1GL8 A; 1XOA A; 1TU7 A; 3MNG A; 3C8E A; 3CSI A; 3CTG A; 1BX9 A; 2LJR A; 1Q98 A; 3IC4 A; 3M8N A; 1OC3 A; 2IL3 A; 3FR9 A; 1XWK A; 4G10 A; 5GAN D; 4OFT A; 2HXK A; 3N5O A; 3CBU A; 3M3M A; 3TKS C; 3HHV A; 3Q18 A; 1Z7R A; 4XHM A; 3TKP A; 2PN8 A; 2RM5 A; 3KTL A; 1FB6 A; 4BL7 A; 4HQS A; 4WF5 A; 3VWX A; 5H5S A; 3P2A A; 4XRD A; 4N30 A; 3ISO A; 2YWI A; 6GSX A; 3KM6 A; 4TXV A; 2DLX A; 1LBK A; 2PWJ A; 4OO5 A; 1OKD A; 4K1F A; 1A23 A; 2L57 A; 4HZ2 A; 1ZYQ B; 1X9W B; 3F4R A; 1AQX A; 1VRS D; 2RLI A; 4MP4 A; 2R3X A; 3UBK A; 3QOU A; 3QR6 A; 1WRY A; 1GSQ A; 4IBP A; 3L9U A; 1F2E A; 3IHQ A; 3K8N A; 2B3S A; 2O8V B; 4OFM A; 3G7I A; 3WGD A; 3LG6 A; 1QGV A; 2BTO T; 1FAA A; 4EE0 A; 1Z5Y E; 2O85 A; 5IO0 A; 2AHE A; 5CRG A; 4PX1 A; 4TN8 A; 4IGJ A; 3FEU A; 4KCA A; 1GUL A; 1GH2 A; 3TOU A; 2WGR A; 5CRD A; 5G5F A; 2FY6 A; 4XIH A; 2D2Z A; 2KHP A; 2HT9 A; 2JZS A; 3F3R A; 1M2D A; 3IAS 2; 4OCF A; 4KX4 A; 2L5L A; 3TKS A; 2YJ7 A; 2LUS A; 1SEN A; 1VF4 A; 3KGK A; 1ILO A; 3WGX A; 4TXO B; 4X0X A; 1XW5 A; 3HDC A; 4G9H A; 3LXZ A; 1TU8 A; 4N11 A; 5DQS A; 2E2M A; 3ZMK A; 1PL2 A; 2L4Q A; 3DVX A; 3TJF A; 3ME7 A; 2K6V A; 4QL9 A; 3TJK A; 2PGT A; 4WF4 A; 1ZMA A; 3V1W A; 1URM A; 2VCZ A; 2R5G A; 5E4W A; 2EC4 A; 5DAL A; 5B8A A; 3UAR A; 5IO2 A; 1XXU A; 3MAK A; 5DAK A; 2A2R A; 1X9S B; 3A2W A; 1K0D A; 4XS6 A; 3OR5 A; 3C73 A; 5INY A; 1KBN A; 4MZC A; 2EIO A; 3D21 A; 1LJR A; 3EWL A; 2C8U A; 3LWA A; 3IXR A; 4WEY A; 3CMI A; 3J7Y k; 2VL3 A; 2HE3 A; 1XCC A; 3EMP A; 3MDK A; 2IFQ B; 5D8I A; 3TUE A; 3FK8 A; 3LXT A; 1XWA A; 5IOX A; 5D96 A; 1R4W A; 5AIS A; 4AF2 A; 3RPP A; 2OJL A; 4NHZ A; 2ALB A; 13GS A; 4ZIL A; 4EUY A; 1GTU A; 5ECL B; 1K0O A; 1M9B A; 3GH9 A; 3KH7 A; 2IMI A; 4ZL8 A; 2VCX A; 2C3T A; 4F2I A; 17GS A; 6GST A; 3N9J A; 2XBI A; 4MJA A; 3FKF A; 2FCH A; 2LTK A; 3DVW A; 4L0W A; 1O6J A; 3LGC A; 4Q5Q A; 3U6V A; 1EEM A; 3GKM A; 2N5F A; 2VO4 A; 4IHU A; 2V6K A; 3UVT A; 4ZBA A; 2X64 A; 2H6X A; 4YH2 A; 1WOU A; 1JLV A; 3SWL A; 1PN9 A; 2H19 A; 2VOC A; 3SBC A; 5DJM A; 2GZY A; 4PQH A; 1OC9 B; 3FY7 A; 2X8H A; 2H6Y A; 4HI7 A; 1EOH A; 3QFA C; 1B9Y C; 4K6X A; 3FZ4 A; 3IK7 A; 2HFD A; 4NAX A; 2G0F A; 2VCV A; 1Z6M A; 4F82 A; 2AUV A; 1O73 A; 5AIX A; 2LNS A; 1GTI A; 3DYR A; 3CSJ A; 3HXS A; 2VL2 A; 3ZVJ A; 2OE0 A; 2DML A; 4HU7 A; 5HR1 A; 4EL1 A; 1JHB A; 5FT3 A; 3UEM A; 4FYC A; 1O81 A; 5HFK A; 1U3A A; 1A8Y A; 2VL9 A; 3GRX A; 1QK8 A; 4PXO A; 5IIZ A; 1SJZ A; 2JSZ A; 4J56 E; 1TKD B; 1TI3 A; 4ZL7 A; 4Q5F A; 3ZVJ D; 4POM A; 4YQM A; 3GKX A; 3FZ9 A; 5JCW A; 4NWY A; 5HR3 A; 5IPG A; 2ES7 A; 2F51 A; 4NPB A; 1PD2 1; 4KUN A; 2I9H A; 5ECI B; 2C0G A; 1ML6 A; 4YAV A; 4POK A; 4BWS A; 2RII A; 4F03 A; 2GVP A; 2FUG 2; 2XPD A; 7GSS A; 5G30 A; 5DDL A; 2HSY A; 4GSS A; 1GUH A; 4MF6 A; 2CV4 A; 2H1G A; 4WET A; 4RQX A; 1USB A; 3Q74 A; 4EDY A; 2H30 A; 2GLR A; 2BMX A; 4LLR A; 4HQZ A; 4HEA 2; 1MD3 A; 3HVS A; 4XS4 A; 1K0B A; 2FHE A; 4L8E A; 1GNW A; 3ZL5 A; 4F0B A; 2JZT A; 3EVI A; 3VWW A; 1N8J A; 3TRP A; 5D9V A; 2DIZ A; 4WKW A; 5B8B A; 2N5A A; 4HS1 A; 1BG5 A; 5AGY A; 1TRV A; 4PGT A; 1EEJ A; 1B4Q A; 1J0F A; 1AXD A; 3BCI A; 5IM9 A; 4KCE A; 1C72 A; 4QQ7 A; 3RHB A; 3GH6 A; 3NZN A; 5IMD A; 3L9S A; 2GSQ A; 2YJH A; 2HRF A; 4LMV A; 6GSU A; 2ZCT A; 5COH A; 3VPQ A; 4LL1 B; 2VIM A; 5B6M A; 1ERU A; 2PBJ A; 3QMX A; 4DSR A; 1GUK A; 1SL1 B; 4P3Y B; 2XC2 A; 3IAM 2; 3LYK A; 1RW1 A; 1SKS B; 2E2G A; 1YKA A; 4CHS A; 5A4W A; 3H1N A; 1T3B A; 3F6D A; 4HZ4 A; 2M72 A; 3IV4 A; 4HU9 A; 2KUC A; 2AJQ B; 1YEP A; 3BCK A; 3ZML A; 3A2X A; 4I5Q A; 1JLW A; 1Y6E A; 3KTB A; 4K9Z A; 3ZFL A; 1A2L A; 2FWG A; 4FYU A; 5F8B A; 4X1U A; 1X5C A; 4K0N A; 1G6Y A; 1EP8 A; 2DJ1 A; 3J7Y b; 4FYB A; 1EGR A; 4YQU A; 5D9X A; 3APQ A; 2CAQ A; 3F0I A; 4MZW A; 1NM3 A; 1GTA A; 3GYK A; 2YAN A; 3E3E A; 4I8B A; 4PUA A; 4TR3 A; 2VCW A; 3HCZ A; 1DSB A; 5D9W A; 5F07 A; 4ZB9 A; 1SK2 A; 1FVJ A; 3LOR A; 2I81 A; 2H1B A; 3PH9 A; 1ST9 A; 3GUR A; 1F9M A; 4PUF C; 3D6I A; 4J57 E; 2GSR A; 4MLY A; 4V2M A; 1F6M C; 2VLT A; 2L4C A; 1T8E B; 4LL4 B; 2HSH A; 3M9J A; 5C00 A; 1GLP A; 2DJJ A; 3H93 A; 4GQC A; 1TTZ A; 4MAB A; 4V2L A; 3HJO A; 2CZ3 A; 1I9D A; 2AYT A; 3ZYW A; 5KEJ A; 4EDZ A; 2JU5 A; 5EL8 A; 5J41 A; 5DQY A; 4EVM A; 3LYP A; 5ECM B; 3G7J A; 1KTE A; 3P8W A; 4JE1 A; 4WXT A; 1PGT A; 1UA5 A; 2PU9 C; 3VI7 A; 3LJR A; 4MJB A; 3HJP A; 2GS3 A; 3QAW A; 1WE0 A; 2K18 A; 4V1A p; 1R5P A; 2J9H A; 1QUW A; 4MJE A; 4YQV A; 1K0M A; 4RI7 A; 2IPA A; 1UVZ A; 1WJK A; 3O3T A; 1JFU A; 3TDG A; 3KEB A; 8GSS A; 1NHY A; 5IMZ A; 3A2V A; 3KP8 A; 1UN2 A; 2H70 A; 2HI7 A; 2WDU A; 4ML1 A; 4TOP A; 4TW5 A; 2WJU A; 3ZLP A; 2AB6 A; 1PKW A; 1Z3E A; 3CRU A; 2C4J A; 2VCT A; 1V2A A; 2A4V A; 2H01 A; 1F37 A; 3RDW A; 1GLQ A; 4HUA A; 5C04 A; 2MMN A; 2VAF A; 4X43 A; 2K8V A; 1GSU A; 1TI1 A; 4I2U A; 4L5O A; 3FR6 A; 1ERW A; 4FH8 A; 4IQ1 A; 2YWO A; 3TKQ A; 2B7K A; 1AQV A; 2XHF A; 3GX8 A; 5LCZ A; 5IQY A; 1A8L A; 1GTB A; 3DML A; 2NVL A; 1TRS A; 5J9B A; 3GFK A; 4I97 A; 1DE2 A; 4TR1 A; 3ZIV A; 1PX6 A; 3FZ5 A; 2YWN A; 1M0U A; 2GTU A; 10GS A; 4ML6 A; 2GDR A; 1GRX A; 3F8U A; 1R7H A; 3EU4 A; 2H73 A; 4MDC A; 1BQ7 A; 2I1U A; 2DJ3 A; 2B6M A; 1RK4 A; 3UIW A; 2CAI A; 4O7H A; 4Z7X A; 3D0Z A; 3WD6 A; 4BVY A; 3KD0 A; 22GS A; 1NW2 A; 4FO5 A; 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6GSW A; 4NHW A; 1GSF A; 1OAZ A; 3R2Q A; 2MZC A; 1WPI A; 6GSY A; 2CX4 A; 1ZGN A; 4Q5N A; 1PSQ A; 2CT6 A; 3QPM A; 5ELA A; 1X0R A; 4N0Z A; 2HZE A; 3KXO A; 3HKR A; 3L4N A; 4ZB6 A; 4PQ1 A; 5F0G A; 1ABA A; 2B1K A; 1U6T A; 2LQO A; 1PA3 A; 4JBB A; 4AJ8 A; 2LS5 A; 5KN2 A; 1WIK A; 3WT1 A; 3GL5 A; 4MF7 A; 5KN1 A; 4IP1 A; 5KN0 A; 2IWT A; 4TXO A; 3ZIT A; 4MH3 A; 1BYE A; 3D5J A; 1RQM A; 2XPE A; 4KDU A; 4GST A; 3NOF A; 1QFN A; 5ENU A; 5GZZ B; 2GQK A; 2H74 A; 2GSS A; 4KSM A; 2GQL A; 5L71 A; 3DEX A; 2C3Q A; 5ID2 A; 3PR8 A; 3GNJ A; 2BJX A; 1S3D A; 3VK9 A; 1GSS A; 4OMV A; 1MTC A; 1G7E A; 1YF0 A; 2V2G A; 4ZB8 A; 4ZL9 A; 3APO A; 3BOA A; 1HNB A; 4O5R A; 1ZZY A; 1MDI A; 3W8S A; 3WYW A; 1K3Y A; 4ZIJ A; 4E8H A; 2YN1 A; 3TCO A; 2WS2 A; 2WCI A; 2H6Z A; 3O76 A; 4ID0 A; 5LD0 A; 4F9Z A; 4KE3 A; 3U5R E; 1JZR A; 5DCG A; 1ERV A; 3HA9 A; 4MCU A; 3GA4 A; 3GTU A; 3TRQ A; 4PQI A; 3IRA A; 3L9V A; 5DBQ A; 2B5E A; 5ABR A; 3CTF A; 1OVN A; 4NMU A; 2IFQ A; 4GRF A; 9GSS A; 1GSE A; 1O8W A; 4IVF A; 1QQ2 A; 1FG4 A; 1XVW A; 1EV9 A; 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