2H8LA

Crystal structure of the bb' fragment of erp57
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
PASVPLRTEEEFKKFISDKDASIVGFFDDSFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDLLIAYYDVDYEKNAKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAGHKLNFAVASRKTFSHELSDFGLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3
publication title Crystal Structure of the bb' Domains of the Protein Disulfide Isomerase ERp57.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase
total genus 64
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h8lA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h8lA02
3H93A 4O32A 2OJLA 2LS5A 3C8EA 2LJAA 1HNBA 1EEMA 3TUEA 3I69A 6GSSA 4TR0A 5IMAA 1SYXA 3GSTA 1GSUA 1A8LA 4QL9A 4YQUA 1S3CA 3IDVA 2BTOT 3FR3A 2JZRA 2OE1A 1JZDA 4ACSA 1GL8A 5HR0A 3HZ4A 5B8AA 4ZXGA 3CYNA 4HEA2 4HI7A 3C7MA 1GUMA 1NHYA 1YY7A 3LQ7A 4I2UA 1SD8A 2H6YA 4BA7A 1ILOA 2RLIA 4OFNA 2AUVA 1B9YC 2EC4A 1Y25A 1OC9A 3HKRA 3IXRA 4IJ3A 3D6IA 1AAZA 2LKUA 5E59A 2HZEB 4FYBA 1TI3A 1IYHA 3LXTA 1R5AA 4TR3A 5IIZA 1BQ7A 1U3IA 4V2LA 2NBSA 1PRXA 1XZOA 3KM6A 1BG5A 4ZB8A 1PMTA 2JL4A 1Z7RA 4H86A 4MJCA 2O87A 3ZREA 2CX4A 17GSA 2B7KA 1O73A 1KBNA 3TKQA 4HUAA 3F4SA 1ST9A 4LL4B 2FD3A 3FKFA 4KH7A 2JSYA 5JCUA 3ZL5A 5ELAA 1A0FA 4JBBA 2I9HA 2YP6A 3VI7A 2IMFA 2DJ2A 2H66A 3TKSA 3S9FA 3QFAC 3KMOA 4FIWA 5DVBA 2MZCA 1O7UA 1SKSB 3EU4A 3P2AA 6GSUA 2CQ9A 3Q19A 3IPZA 2HYXA 4RUVA 1B4QA 3RAZA 3L9VA 2JACA 2PWJA 1UVZA 2DJJA 1QUWA 2KLXA 3U6VA 4KDUA 3DVWA 1GTUA 4TR4A 3GYKA 3UIWA 5ID2B 1HYUA 2LTKA 2FNOA 4G9HA 3EMXA 2I81A 2GLRA 5HR3A 2Z9SA 4ZBDA 4OO5A 2WDUA 1H75A 3KEBA 3UMAA 3VI5A 5CYYA 2C0FA 3MAKA 2QC7A 9GSSA 1XXUA 2OA7A 2F9SA 5AISA 2N5FA 1V58A 4OWYA 1SENA 2KUCA 5HR1A 2IPAA 2H72A 3D0ZA 4X1UA 2IMEA 4DSSB 2VAFA 2H74A 4IW9A 1ZZYA 1ACVA 3TJBA 3D5JA 8GSSA 3N5OA 1MDJA 6GSXA 5G2ZA 1JZOA 1YEXA 1AW9A 1W89A 2CT6A 5GSTA 10GSA 3EC3A 1Z7PA 2NVLA 2RM5A 4BPYA 1THXA 3MDKA 5DDLA 4O7HA 5LNKe 4TKYA 4L0WA 1MDKA 2LRCA 2B5EA 3TDGA 2HSHA 4FH8A 2V32A 1WJKA 5ECOB 4TXVA 2WFCA 1GP1A 3ERGA 6GSTA 4MA9A 2I3YA 1HD2A 4RQRA 2CA8A 5J5NA 3QPMA 2LUSA 3BCKA 1K0MA 5DQYA 1KNGA 3P8WA 3TCOA 1V2AA 4F82A 4IP6A 1SKWB 5CNWA 1X5DA 1FOVA 2O89A 3TJFA 3KJYA 2VLVA 4JEDA 4AJ7A 4DEJA 1GULA 1A2MA 2GSRA 3DMLA 3GUSA 3IK7A 1EP7A 4IQ1A 1M2BA 3IA1A 5F0GA 4MMMA 1FG4A 1PKWA 2LQQA 3RPNA 1XWGA 3KGKA 2C4JA 4K7OA 4LA1A 1F37A 3D4MA 1KEBA 4I97A 3VWXA 3VK9A 3HXSA 2YJHA 1K3YA 1TRWA 1GSEA 5DAKA 2CAQA 3KD0A 4MJBA 4G19A 5ECKB 4I8BA 5CAXA 1SJIA 4HQSA 3WGDA 3ZVJD 1QMVA 1X5EA 1EEJA 1CQGA 2LRNA 2VLTA 4CHSA 1B8XA 4Q5FA 1G6YA 4GRFA 4HQZA 3O6TA 2H71A 1K0CA 2VOCA 1DSBA 4NXIA 2H19A 2LEGA 3LSZA 4XIHA 1TP9A 3TOTA 4TXOB 3EWLA 2IIYA 4L5LA 4J56E 1B4PA 3NZNA 1K3LA 2RUFA 1MD3A 5LCZA 2JZTA 5D9VA 1WWJA 5ECIB 2FHEA 2LQOA 1XWBA 1X9MB 3M1GA 2RUEA 3UBKA 3GA4A 5F8BA 2MMZA 2MMOA 4I2TA 2HZEA 1U3AA 3QR6A 1NSWA 4TW5A 4PNFA 1R26A 7GSSA 4PUFC 3DEXA 1X9SB 1YF0A 4ECCA 1TJDA 2VCVA 1IYIA 3VURA 18GSA 5DQSA 1N8JA 1A24A 2EIQA 2YWMA 4XS4A 3EINA 3TJJA 1K0BA 1ERUA 2PERA 5DALB 2F8AA 4LMWA 4POBA 4O5RA 2PUKC 4YH2A 1VGLA 3QAGA 2TRCP 2OACA 5J9CA 3NIVA 1ZGNA 5F07A 1JZWA 5IOWA 2X64A 4NV5A 3FK8A 4MK3A 3HD5A 2JU5A 3WYWA 3GL5A 4O92A 3HHVA 1QXHA 3DGQA 5AIXA 4WR4A 3P7XA 3EURA 3F3QA 5A5KA 1K3OA 1W4VA 3UEMA 4K1FA 5G5FA 4K6XA 1O81A 3H1NA 2A2SA 2LSTA 3KP9A 2R6KA 3GHAA 1THOA 4N0VA 1DE1A 4KB3A 1GUKA 3L78A 4MPFA 4GWRA 4PUAA 2FA4A 3UBLA 2K8VA 1F3AA 3EYTA 3A2VA 3KMNA 4HZ2A 2IN3A 2P31A 2X8HA 1XPVA 1QGVA 1YEPA 3UVTA 2RM6A 3Q6OA 4IBPA 5HQPA 4IKHA 2GQKA 1KTEA 4ZBAA 2GSQA 2IL3A 5KN1A 2H1GA 4MJEA 3RBTA 1X9WB 2ES7A 2H1AA 4AGSA 1PKZA 5EVOA 3MNGA 1OVNA 2YV7A 4ZB6A 2XBQA 4MZCA 2C3TA 1YDKA 1SL2B 4EXJA 1GLQA 3F8UA 3GMFA 3G9BA 3GTUB 1SD9A 2B1LA 3FZAA 3APSA 1ABAA 4V1Ap 5ECQB 2CVKA 2YANA 2QKEA 2L4QA 2PVQA 3UOMA 5JWRB 3HVXA 2MMAA 2D2ZA 1BAYA 5D93A 3TKRA 5KN3A 4DSQA 3TKPA 2XBIA 1M2AA 4HU7A 1FB0A 5IPGA 1A8YA 1TK5B 2GTUA 3DVXA 1JZRA 2JSZA 3F3RA 1XOAA 3HVVA 1HQOA 4JZQA 3M9JA 2HE3A 1EOGA 1PSQA 2C8UA 2VL3A 1T00A 4PNGA 4RQXA 2XPDA 3QAVA 2P5QA 3ME7A 2R5GA 1GNEA 5KN0A 5INYA 2LJKA 3GFKA 3PGTA 3O76A 1GSYA 4G2EA 2IMDA 3IV4A 2WJUA 5IMCA 3QCPA 22GSA 3F4TA 4L0UA 2WS2A 1SYRA 2K8SA 3ZYWA 1R5PA 20GSA 2YJ7A 5J41A 3FR9A 3LG6A 2P0GA 1FW1A 19GSA 2DJ3A 1JHBA 1Z5YE 3W8JA 3VFIA 4OMVA 3WGEA 1TU8A 1TKDB 4KAEA 4MF5A 2QGVA 4J57E 4P3YB 5DCHA 1M2DA 1WPIA 2N5BA 4V2NA 1MEKA 5G5EA 2H0HA 2M46A 2R3XA 2VM2A 4ECJA 1NM3A 5CRGA 1FO5A 4NWYA 11GSA 2CAIA 5B6NA 4ZBBA 3A3TA 4KA0A 5A4UA 3PINA 1G0TA 2YPMA 1TRUA 1XW6A 1S3AA 2HLSA 1O6JA 1FVKA 2VCTA 2WRTA 3GX0A 2DIYA 3EU3A 3FY7A 4WF4A 1URMA 1EGOA 1DE2A 3VPTA 3UJ1A 4CW9A 3GURA 3IK9A 3QOUA 2LNTA 3QFBC 3A5WA 3EE2A 4WR5A 1RQMA 4ILFA 4FYCA 2IMKA 1DBYA 5KN2A 3KTBA 3LGCA 4EC0A 1G7OA 4DVCA 1WOUA 5D96A 3GH6A 2NTOA 4AJ8A 2MBTA 3FR6A 1M7TA 2VD1A 2YCDA 4WETA 2VCZA 1ML6A 1TDIA 4GSNA 1YQ1A 1PGTA 1B9XC 4BWQA 3AY8A 4K8MA 2GT6A 3I43A 2ON7A 3ZLPA 4X43A 5HR2A 2HXKA 4MABA 2A2RA 2WZ9A 2GS3A 1AIUA 4YQVA 3LORA 1GTAA 3GNJA 1M9AA 1F2EA 4F03A 2BJXA 2OBKA 3QD9A 2MMNA 4KE3A 2BMXA 1Q4JA 4GCIA 1AC1A 2HNLA 2J9HA 4F9ZA 3HYPA 4GF0A 3VPQA 3RHBA 1FAAA 5D9XA 2I4AA 4E8EA 4KDXA 4IVFA 3SWLA 2RIIA 1X0RA 1XW5A 4TR1A 5ECHB 2CZ2A 4BVYA 1V40A 1SK1A 1OC3A 3LXZA 2X99A 2R4VA 3HJMA 4POKA 3EMPA 3LYPA 4KGIA 5KEJA 1A2JA 2CVBA 1RW1A 1F6MC 3IR4A 3BJ5A 1GSDA 2E2GA 5ECNB 1J0FA 1A0RP 4OD7A 5D8IA 3CRUA 1AQWA 1SK0A 4IELA 2K6VA 3G7YA 1O8XA 1T4ZA 3NOFA 2CVDA 5CO3A 3BD2A 5CP1A 1EGRA 1BJXA 3CRTA 1FVJA 4HOJA 4WXTA 1OC9B 4XCSA 2ZCTA 2AHEA 3WT2A 3MSZA 2H6XA 4GQFA 4MH2A 2GQLA 4EUYA 4BL7A 1XFLA 1OE7A 4POLA 1ZOFA 2NDOA 2XC2A 4PQHA 3HCZA 2GZYA 5C00A 4L8EA 3MWHA 1BYEA 3E9JB 4ZL7A 3TRXA 1V98A 3K8NA 4IS0A 2L6CA 2H0GA 3QAWA 1OKDA 1O8WA 4ZIJA 5J9BA 4KCEA 2VD0A 1BX9A 2GT5A 5DBQA 2G2QA 5CRWA 1XWCA 2H75A 3C73A 3UARA 4IGJA 2FWFA 2C3NA 1MD4A 2GZZA 4AF2A 3APOA 3KP8A 4YQMA 3UL3A 2YNXA 4MLYA 3GTUA 2LRTA 3KH7A 1XWKA 2DC5A 4GLTA 2KHPA 1ZYEA 2M72A 5ECMB 1F9MA 3J7Yb 4N30A 1K0NA 3LJRA 1U6TA 2E2MA 1ON4A 5FHIA 5IM9A 3I6AA 2H8LA 1XIYA 1K0AA 3C71A 4K2DA 3VLNA 2F51A 1XCCA 2DJKA 2X8GA 3L9UA 5B6MA 1OE8A 1Q98A 2H6ZA 2VCWA 2JADA 4K9ZA 2ZUPA 4KSOA 2L6DA 1AXDA 4RI6A 3APQA 5ECRB 3FYGA 4LLRA 4K0NA 3GH9A 3FZ4A 5COHA 4EL1A 1AUCA 2YWNA 1G7EA 5F05A 2AAWA 5CREA 2AV4A 1Z9HA 1GWCA 3IHQA 4KNDA 2VLUA 4NPBA 4F2IA 2H01A 1OKTA 3DIEA 2GVPA 1K0OA 3G7IA 4ZL9A 3GRXA 3LWAA 2EIRA 3TRQA 4NHZA 5GZZB 4ZB9A 1ZL9A 3IRAA 5H5SA 1SL1B 1MTCA 4GTUA 5EPFA 1AQXA 3L9SA 4G10A 3QMXA 4YAVA 2AB6A 4WF5A 1GTBA 1T1VA 1QFNA 1SL0B 3GKNA 3RPPA 1T3BA 4XTSA 1EV4A 2VCXA 4IHUA 5H5RA 3TGZA 3H4KA 5JWQB 2O8VB 1M9BA 1NW2A 2AYTA 2NPBA 5AGYA 2K18A 3WD6A 3CBUA 3ZZXA 2F8FA 1UA5A 3W8SA 1MDIA 2HSYA 2FWEA 1WMJA 2L5LA 2OE0A 3BOAA 3TKSE 1HNAA 1NHOA 2KOKA 4N11A 3CTFA 1VF2A 1TI1A 4XHMA 3A2XA 1JLVA 5IPHA 4YAPA 2IWTA 3M8NA 3F4RA 1T7PB 5IOXA 4WEYA 5ID2A 4ULXA 2ALBA 1GLPA 3CSJA 1Y6EA 3ZIJA 4GSSA 2WULA 1EOHA 1WE0A 2C0GA 5ELGA 4OCFA 3BBYA 3E3EA 4ML6A 1TW9A 1TOFA 1VF4A 2HT9A 2AJQB 1LBKA 2PU9C 3IAM2 4N10A 4HDEA 4MZBA 1YZXA 4DSRA 2PN8A 4PQ1A 2YZUA 3OR5A 3TOUA 2B3SA 4N0ZA 4JU5A 4MF6A 4KW6A 5F06A 3CXGA 5G1KA 3RHCA 1R4WA 1XBSA 1VF1A 3FRCA 3KXOA 4DSSA 5D9TA 3HY2A 1V9WA 2VL2C 1GSSA 1R7HA 2VIMA 2WB9A 13GSA 1XVWA 2FWGA 3BCIA 4ID0A 2H73A 2HFDA 2YN1A 3C1SA 4MJAA 4X0XA 5A4WA 3VWVA 1XWAA 3VWWA 3FHKA 2CX3A 2R2JA 1TRSA 3F6FA 2F3MA 5HFIA 1FHEA 2DIZA 1H4OA 3H8QA 4ISDA 4ECBA 5HFGA 3FW2A 1TTZA 2OADA 1EWXA 3DRNA 5CRHA 4KSMA 2IJYA 3HJOA 5J4UA 2TIRA 1BEDA 1C72A 3PH9A 2FGXA 5DCGA 1Z6MA 4PGTA 4D73B 1GSFA 5G30A 2DMMA 4MZWA 1A2LA 2PGTA 4PURA 1GRXA 5GSSA 2X8CA 2PPTA 1U87A 3LEFA 4KCAA 5H5QA 5FT3A 4POMA 2YZHA 3F9UA 2KP2A 5IMZA 1XOBA 4V2MA 1YKCA 5DJLA 1M0UA 4HJ2A 2H30A 3D21A 2WGRA 3DD3A 3W6GA 2GZPA 4WKWA 4XS4B 1PA3A 4JRRA 2OKAA 4I5QA 2HRFA 1GNWA 2IFQB 2OBIA 4FO5A 5IMVA 5JCGA 4MCUA 2O85A 3G7JA 5GAPD 2H70A 4HJMA 1QK8A 2I1UA 6GSYA 2C80A 2G0FA 4PQIA 2O7KA 4KDYA 5D73A 4EF0A 3F63A 2M80A 3DYRA 4IJIA 5FWGA 3DXBA 4TXOA 1XVQA 1OC8A 1I9DA 3GX8A 3CTGA 3U5RE 1FB6A 3H79A 2FUG2 4K0GA 1GSQA 2K9FA 2FA8A 2H1DA 3IAS2 1WP0A 1ZCPA 1AQVA 2CV4A 3M0FA 2LNSA 3E0UA 4EKZA 1SJZA 3HA9A 2ON5A 3HVSA 2B7JA 1YKAA 1V57A 3D4TA 1ERVA 1EZKA 1X5CA 2FLSA 4HS1A 4PX1A 4OCEA 1S3DA 2V1MA 5A4VA 2VUPA 2C0EA 3ZIVA 4FYUA 1GUHA 1SK2A 3HJPA 16GSA 3QDNA 3FEUA 1ERWA 3TKSC 2GQMA 6GSVA 5DALA 3ZTLA 3CSIA 1ZYQB 3GL3A 5EY6A 3PR8A 2DBCA 2GSTA 2QSIA 4TRXA 4CDOA 3LYKA 3R2QA 3US3A 4BWSA 2VCQA 3ZFBA 4QL7A 3KZQA 2N5AA 5E4WA 5IQYA 1TK8B 4QQ7A 3SBCA 5IMFA 3FZ9A 4XS1A 1SKRB 5ENUA 3EVIA 4JR4A 2H76A 4XRDA 3KIJA 4MH3A 3VWUA 2LJRA 3ZFLA 3ZMKA 1F3BA 1PN9A 1TRVA 1VRSD 4XRAA 5IO0A 2PBJA 4TVEA 3A2WA 3ISOA 2V6OA 1OYJA 2H0IA 3L4NA 3GIXA 1UC7A 3WT1A 1ZMAA 2REMA 4BVXA 4NHWA 3GKXA 2VM1A 4Q5QA 1J9BA 4TOPA 1I5GA 1EP8A 3ME8A 1QQ2A 4MP4A 1G6WA 1T4YA 4I6XA 1J08A 1B48A 1T8EB 1SU9A 4EO3A 1YJ6A 4ZL8A 4LL1B 5IMDA 4Q5RA 12GSA 4ML1A 4IN0A 2HRNA 3KH9A 1E2YA 3IC4A 2GGTA 4MPGA 1PX6A 2B5YA 3J7Yk 3GSSA 1E6BA 3GN3A 1M99A 5B8BA 1VF3A 1WRYA 2FWHA 2L59A 2C3QA 2TRXA 3P90A 5G31A 1PL2A 2KP1A 1Z3EA 4IP1A 2DSAA 2P5RA 5AIVA 3F0IA 1PD21 2FY6A 1U88A 3LFLA 3WGXA 1K0DA 3D22A 1O85A 2L4CA 4ECIA 2B1KA 4F0CA 4AJ6A 4F0BA 2V2GA 2YWIA 1TK0B 1LJRA 2L5OA 2A4VA 2YV9A 1TXXA 3Q74A 2HZFA 2DLXA 3ZITA 1HNCA 2VL9A 4EVMA 2B5XA 4RI7A 3ZMLA 1USBA 3C1RA 4LMVA 5JWOB 1GH2A 1XW9A 2J23A 1ERTA 2XHFA 4D73A 3GKKA 1OAZA 4OO4A 3Q18A 3M3MA 2VO4A 1JFUA 3I9V2 5C04A 4JR6A 4KUNA 1EV9A 4OFTA 2WCIA 3O3TA 4K7IA 4WBJA 3TJGA 4GSTA 3KTLA 4JE1A 2DJ0A 4OFMA 2C1YA 3GKMA 14GSA 4ZILA 6GSWA 2HI7A 3TB2A 4GQCA 2C0DA 3FZ5A 4WBRD 1Z6NA 1TU7A 3HZ8A 5B7CA 5GAND 1LU4A 1N2AA 3ERWA 3F6DA 2E0QA 4MF7A 2IFQA 2V41A 4NMUA 5DJMA 4XS6A 2XPEA 4NV2A 2YOIA 3UVHA 5CRDA 4Q5NA 1PL1A 3DWVA 1UN2A 3JCML 1SJ6A 4KX4A 5G1LA 5ECSA 2DJ1A 2E7PA 4E8HA 5HFKA 5JCWA 1JLWA 4TR1B 2VL2A 4NAXA 5ECLB 5ABRA 3TJKA 1WIKA 1GTIA 2OE3A 2ZNMA 5LD0A 3ED3A 4K7NA 4EDYA 3UAPA 4V1Ag 3N9JA 5AN1A 2H1BA 5J3RA 3RDWA 1YF1A 4L5OA 2YWOA 1A23A 1DUGA 2L57A 3M9KA 5IO2A 4J2FA 3HDCA 5L71A 2V6KA 2LV3A 1PX7A 1RK4A 3ERFA 3ZRDA 2CZ3A 2MBSA 5ECPB 2DMLA 3DKSA 4EDZA 4HU9A 3V1WA 1PQNA 2R37A 3L0HA 5DAKB 3TRPA 5EL8A 3IE3A 2GDRA 2FCHA 2PVOC 4MDCA 4IQAA 2PMTA 4HZ4A 3IOSA 4TN8A 5D9WA 2B6MA 2MYGA 3CSHA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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