2H8LA

Crystal structure of the bb' fragment of erp57
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
PASVPLRTEEEFKKFISDKDASIVGFFDDSFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDLLIAYYDVDYEKNAKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAGHKLNFAVASRKTFSHELSDFGLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the bb' Domains of the Protein Disulfide Isomerase ERp57.
pubmed doi rcsb
molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3
total genus 64
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h8lA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h8lA02
2HZEB 2QC7A 4JU5A 2H1GA 3C7MA 3GKXA 3K8NA 2HE3A 3KP8A 4K0GA 2VCZA 2JZSA 2C0EA 4IP1A 2DJKA 5AIXA 4XHMA 3UOMA 3CMIA 4Q5RA 4V2LA 2V41A 3IE3A 2BJXA 4J56E 1VF3A 5C04A 3TRQA 4KE3A 3P90A 3C73A 1MD3A 4X1UA 1RQMA 2L57A 1SK0A 5F05A 3U6VA 1AC1A 5A4UA 2C8UA 3HXSA 2O87A 2H19A 2B1LA 3P7XA 4HU9A 4WKWA 3FY7A 3MSZA 1Q4JA 3D21A 1GP1A 1R4WA 3DD3A 5ENUA 4MJEA 5EL8A 1NM3A 5CREA 2OE0A 2GQMA 2LNSA 5ECIB 2EC4A 1THOA 2CAQA 3IK7A 4WBJA 4HU7A 3Q74A 1XPVA 5G1LA 2VM1A 1ACVA 4MH2A 1PA3A 3ISOA 4V2NA 4YQVA 7GSSA 1YF0A 1TJDA 2N5FA 4IQAA 1JFUA 1B8XA 2PERA 1M2AA 3TJKA 1BEDA 2FA8A 1GTBA 2DMLA 1K0OA 3HVXA 4GXZA 2H0HA 2GGTA 1WRYA 2YPMA 1M7TA 2L4CA 5AGYA 3W6GA 3F63A 3EURA 2DBCA 1EP8A 1DE2A 4MJBA 3WYWA 4JR4A 2YWIA 3GHAA 1XWGA 1ZYQB 1JLVA 2H76A 3P8WA 2DJJA 5ELAA 3VWWA 1PD21 3RHBA 4YQUA 2C3NA 1O8XA 1VRSD 1F2EA 1C72A 4GRFA 4H86A 2LKUA 5GSSA 2DSAA 1MD4A 2TRCP 4HUAA 1TK0B 2VOCA 3DKSA 3GNJA 5ECOB 5DQSA 2L59A 3GX8A 3LSZA 1AIUA 1XWCA 4MZCA 4IVFA 3S9FA 1QGVA 4KDYA 1SK2A 2F8AA 2AJQB 2BMXA 2HSYA 3VWVA 3CXGA 1HQOA 2WULA 2YZUA 3HD5A 4OWYA 5G1KA 3GSSA 1TXXA 2E2GA 5INYA 2R37A 2HT9A 3LORA 4YH2A 1AQXA 4N10A 4HOJA 2HRFA 2RIIA 2L6DA 5F07A 3HCZA 3PINA 4LA1A 2E0QA 4D73A 2CZ3A 1RK4A 1GSQA 1SYXA 2DJ2A 4WF5A 3GH6A 3WT2A 1AW9A 5HFGA 5J5NA 1YJ6A 4KCEA 4IS0A 2YWMA 3KJYA 4BVYA 1PL1A 3IV4A 4DSSA 3HDCA 5A4WA 2DMMA 4EF0A 5IPGA 2DJ0A 4EXJA 4DEJA 2GT6A 2HRNA 3UBKA 2B6MA 5GAND 4KSMA 1URMA 1O8WA 2CVKA 6GSUA 4BVXA 1J0FA 1ABAA 3KTLA 4OD7A 4XIHA 2FA4A 4MMMA 2GSSA 1EGOA 3I43A 3QR6A 2KHPA 3Q19A 2VCWA 2HSHA 2EIRA 3KMNA 3P2AA 3C1SA 1GLPA 5GAPD 1WJKA 4L5LA 5ABRA 4K2DA 3G9BA 1I5GA 4XRDA 2YCDA 2XC2A 1K0MA 1GULA 2GZYA 4F2IA 2X99A 2AAWA 1BJXA 2HI7A 3GIXA 1SJZA 3U5RE 4N30A 2VAFA 1MTCA 4FYUA 1NSWA 4HS1A 3HHVA 5E4WA 1K0NA 2I3YA 3UBLA 2WGRA 1PGTA 1ZCPA 3Q18A 4HJMA 4WR5A 5ECKB 1PL2A 4QL9A 3TKQA 2WS2A 4G9HA 4ISDA 1H75A 1H4OA 5G30A 5JWQB 2XPDA 2BTOT 2F51A 2H0GA 2VD1A 3FHKA 4ML1A 3CRTA 2LS5A 1Z7RA 3DGQA 1K0CA 1UA5A 2IIYA 3ME8A 1A23A 1TRSA 2N5BA 6GSVA 2KUCA 1YZXA 2REMA 3CTGA 4ID0A 1V57A 2M80A 5H5QA 2JACA 1FOVA 1WWJA 4ZB8A 3KCMA 4ML6A 1M9AA 4O5RA 4ZXGA 2GSRA 3A2XA 4YAPA 1V58A 4BL7A 2O7KA 4MPGA 4OO4A 5B6MA 4MF7A 2B5XA 4L8EA 1M2BA 2MMNA 2V6OA 3GTUA 5DQYA 2E7PA 2IMFA 5HR0A 4O32A 3GUSA 3QD9A 1X5CA 4ZL9A 5ECPB 4BWSA 2G2QA 3FZ9A 1Z3EA 2YANA 1T4YA 3CSJA 4MABA 5D73A 1PN9A 2J9HA 3IDVA 1RW1A 2YJ7A 4WETA 4KAEA 3HYPA 2LSTA 2GDRA 1VF4A 1UC7A 4K8MA 4EKZA 3BOAA 2P0GA 1XW9A 2ZNMA 3SBCA 5HFIA 4XS6A 4LL4B 4GSSA 4KNDA 3TCOA 1ZGNA 3RDWA 1XOAA 4IBPA 6GSTA 4MZBA 5H5SA 2M72A 5CRHA 2OE3A 2AV4A 5IMZA 3IHQA 4IELA 2MBTA 3RPNA 5JWOB 1GSEA 4WEYA 3QDNA 3QCPA 3M9JA 1F3BA 1GSSA 1SENA 1SL2B 1XIYA 4IN0A 5AN1A 5GSTA 4TN8A 1THXA 3L9SA 1E2YA 5ECHB 1PKZA 1GUHA 4DSRA 3GN3A 3TKRA 5EY6A 5J41A 13GSA 3TGZA 3GL3A 3KXOA 4PQ1A 1PSQA 1B9YC 3SWLA 4HEA2 1XW5A 1FB6A 3M0FA 5B6NA 2OBKA 2NDOA 5DALA 1SJIA 5DCHA 4L0UA 5DAKB 1TU8A 1UN2A 3EU4A 1DUGA 4ZBBA 2A4VA 1A2JA 1IYHA 3BCIA 4PGTA 1GUKA 2YV7A 3ZIJA 2PMTA 4MZWA 2K9FA 2AB6A 2B1KA 3ZREA 1HYUA 1ZZYA 4PUFC 3ZIVA 2IWTA 4KB3A 3HKRA 2OACA 3F9UA 1BQ7A 2KLXA 2NVLA 1EGRA 2JZTA 1EOHA 4XRAA 1TI1A 1WP0A 1HNAA 2VCVA 1OYJA 1Z6NA 4MLYA 1WOUA 4PURA 2EIOA 1VF2A 1VF1A 3N5OA 5ECLB 2LV3A 5D93A 1ERWA 5JCWA 2H01A 1TU7A 4MF5A 5ID2B 1F9MA 3FYGA 2FLSA 2DJ1A 3GSTA 1PMTA 2HNLA 3VK9A 4MJCA 3WGEA 4TRXA 2FUG2 1ERVA 3BJ5A 5CYYA 3KP9A 4ZL8A 3G7YA 1BG5A 3UIWA 2YOIA 1HNCA 2IFQB 2DLXA 3IBHA 2IMKA 5G5EA 4GTUA 4EE0A 4GSNA 1T8EB 5KN3A 3VPQA 4EVMA 2GQKA 3G7IA 5IOXA 3I69A 3QAWA 5D9XA 2CX4A 1OE7A 5B8BA 1FW1A 5FHIA 4PQIA 3A3TA 1PRXA 4EUYA 4L0WA 1TOFA 1SYRA 4ULXA 3UVTA 3M9KA 3C1RA 1JZWA 1V98A 4DSQA 3VFIA 2HFDA 3QPMA 3GFKA 2VLVA 2F8FA 2ES7A 5D9VA 3LJRA 2JSYA 1SU9A 4AJ8A 5L71A 3TKSC 2VD0A 3OR5A 1OC9A 3HJPA 4V1Ag 4HI7A 4IP6A 1FG4A 2H72A 2GT5A 3D4TA 1R7HA 5IMAA 3UJ1A 4F82A 2NPBA 2C3QA 3KZQA 5FWGA 6GSSA 2GZZA 3GURA 3MWHA 1TP9A 1TI3A 2D2ZA 1R5PA 3UEMA 5IPHA 4ZL7A 4MA9A 1G7EA 5JCGA 1YKCA 1SD8A 4TXOA 5F0GA 2FWFA 1MEKA 3UAPA 1PQNA 2B5YA 4GF0A 2Z9SA 1N2AA 2CA8A 1T00A 2C4JA 2B3SA 2YP6A 3ME7A 4ECIA 2IN3A 1B9XC 2GS3A 1B48A 5G31A 3ZL5A 1VGLA 4KW6A 1OC8A 3M8NA 1ST9A 4MDCA 4ZILA 3DRNA 2H71A 2OKAA 3O3TA 3ZMLA 1TK5B 2LRNA 4AGSA 1ERUA 3E3EA 1YY7A 5KN1A 3KH9A 2YV9A 2I81A 2C0GA 2IMEA 5ECRB 2JSZA 2ON5A 5A5KA 4JR6A 2O85A 2EIQA 4KSOA 2LTKA 2DIYA 3FRCA 1XFLA 2H6XA 5HQPA 2R5GA 3HVVA 1F3AA 2FHEA 2K8SA 3F0IA 1OVNA 4IKHA 3FK8A 3CSHA 1EV9A 4TR1B 4FIWA 3DIEA 4XS4B 1G6WA 2K18A 5ECSA 3L9VA 1I9DA 2WCIA 1LU4A 3MNGA 2DJ3A 2VCXA 4JZQA 2C3TA 5ECQB 3EYTA 4I8BA 3VWUA 4L5OA 3FZAA 2KP2A 2FWEA 4IGJA 1A0FA 3F4SA 2OADA 3D0ZA 2HZEA 1O85A 3APSA 3FEUA 2GTUA 1O81A 4MP4A 1TRWA 1MDIA 4PNFA 1U88A 2YJHA 2GQLA 5DVBA 1Z9HA 4ACSA 1A0RP 1FVJA 1TRUA 4Z7XA 4F03A 1ERTA 2V1MA 1QQ2A 1G6YA 2GSQA 1O73A 1XWAA 1T3BA 2F3MA 1R5AA 2LJKA 2K8VA 3DVXA 2FY6A 3TJFA 4NV5A 2P5QA 4WF4A 3Q6OA 3F4TA 1DBYA 3DXBA 3UL3A 1YQ1A 2WFCA 1W4VA 2VCQA 3L9UA 4K6XA 3LGCA 4POBA 3C71A 3H93A 2HZFA 4N0ZA 3H79A 1A8LA 5J3RA 3BD2A 2IMDA 2C1YA 5CRDA 1GTUA 5DBQA 3LEFA 2NTOA 3EINA 1ZL9A 5IMFA 1FAAA 1X9SB 17GSA 1WPIA 1U3AA 4KGIA 2LJAA 4NHWA 2VL2C 4KUNA 3GH9A 2X64A 4O7HA 4AF2A 1EEJA 4MF6A 2PPTA 1EV4A 2VLTA 1SL0B 3NZNA 4MPFA 1GSFA 3IXRA 2PN8A 1YEXA 2WZ9A 3IRAA 2B7JA 3KD0A 1FB0A 2L5LA 1GTIA 3ZYWA 1XOBA 1K3YA 1QUWA 4FH8A 2PU9C 16GSA 3G7JA 4XS1A 3LWAA 1XXUA 2MYGA 2PVQA 3TJBA 3APOA 5IQYA 4LMWA 1EWXA 1TW9A 3TJGA 5IM9A 4ZB9A 2H0IA 1OC3A 4X0XA 3FW2A 4X43A 2JL4A 2ALBA 4WBRD 1AQWA 3TOTA 1AAZA 4TR0A 5IIZA 4POKA 4V2MA 1S3AA 1U3IA 4G10A 4Q5NA 3VI7A 3TOUA 1Z5YE 2VUPA 1GSUA 2CV4A 1JHBA 2XPEA 3GKMA 2WDUA 4HZ4A 1WE0A 4BWQA 5F06A 11GSA 3KIJA 3ZVJD 4QQ7A 2OA7A 1HNBA 2RUEA 4RQXA 2C0FA 5IMVA 1G0TA 1K3LA 2LQOA 3GKKA 3KH7A 4K9ZA 2MMZA 1XZOA 2RM5A 4HDEA 3EE2A 4K7OA 3F6FA 4ECBA 1KTEA 1QXHA 3H1NA 2N5AA 2QSIA 2VL9A 2IMIA 3IK9A 4ZBAA 5JCUA 1Y25A 3J7Yk 3ZZXA 3RAZA 2V2GA 1TTZA 2RM6A 1ZOFA 1A2LA 2G0FA 1OKTA 1EOGA 3ERFA 1K0BA 1YKAA 1BAYA 3L0HA 3GYKA 2CAIA 2HXKA 3GV1A 2TRXA 4ZB6A 1T1VA 4EC0A 1FHEA 3TKPA 1TRVA 2F9SA 1B4QA 1DSBA 4CHSA 2I4AA 3IPZA 3F4RA 3RBTA 4MK3A 1XVWA 4LLRA 2I9HA 2QGVA 2GVPA 3HA9A 3DEXA 4F0BA 2P5RA 22GSA 2R2JA 3JCML 12GSA 3EMXA 3D6IA 1NHOA 3HVSA 5AIVA 1XWKA 2C80A 3IAM2 3DYRA 5DDLA 2HLSA 3GMFA 3RHCA 2C0DA 1JZOA 3KEBA 4OFTA 4KDXA 1AQVA 1EZKA 1N8JA 3ZMKA 2R4VA 2KP1A 1R26A 2FWGA 4Q5QA 4E8EA 1OKDA 5H5RA 4NV2A 4D73B 4MCUA 4GQFA 1JZDA 3ZRDA 3J7Yb 3CBUA 1KEBA 4RQRA 4BPYA 2CVBA 2I1UA 5LNKe 2H1AA 2H30A 1PX7A 2YZHA 2CX3A 3DWVA 3VURA 4DSSB 3I6AA 3DVWA 1Y6EA 2B5EA 4IJIA 2V32A 2GSTA 5HR3A 2MBSA 3O76A 1GWCA 4LMVA 3KM6A 2L5OA 3LXTA 3MDKA 3QAGA 3NOFA 5IO2A 2X8GA 4N0VA 3HZ4A 2H70A 4AJ7A 2FNOA 4KDUA 1GUMA 1OAZA 4CW9A 2X8HA 3CSIA 4N11A 3HJOA 9GSSA 5J9CA 5D8IA 4FYBA 5CO3A 3IOSA 1M9BA 3H8QA 4RI6A 2X8CA 2LRTA 2LUSA 2L4QA 4IHUA 2XHFA 2ON7A 5D9WA 3LYPA 1OE8A 3W8JA 3ERWA 4NMUA 4ILFA 5DJLA 5IMCA 4TKYA 1K3OA 3I9V2 2YWOA 4JEDA 1PX6A 2H1DA 4XCSA 2P31A 3GA4A 3IA1A 5KN0A 1GH2A 3V1WA 3A2WA 1FVKA 1XVQA 1WMJA 4K1FA 2GZPA 3TRXA 1J08A 2JZRA 3CYNA 2AHEA 2O8VB 4BA7A 1U87A 3EC3A 3TB2A 3D4MA 2FGXA 2K6VA 5EPFA 4KH7A 2B7KA 2CZ2A 6GSYA 3EMPA 3L78A 4NHZA 1SKSB 3WT1A 3TKSA 1ZYEA 2A2RA 4IW9A 4E8HA 3E0UA 4TVEA 2VLUA 3ZVJA 4LL1B 5J9BA 4WXTA 5ELGA 3D5JA 3GTUB 1TDIA 3LXZA 3LG6A 5ECNB 5D96A 4PXOA 1SD9A 2PUKC 5DAKA 1U6TA 2H8LA 4POLA 4MH3A 4OFMA 3QOUA 2ZUPA 4HZ2A 4NWYA 4ZBDA 4GLTA 3QAVA 4CDOA 5DJMA 1QFNA 2VIMA 1TK8B 3TKSE 3LQ7A 5CRGA 3TRPA 5J4UA 4JE1A 3FR9A 2DIZA 4F0CA 2YN1A 3ZITA 2JADA 1TKDB 2JU5A 1GLQA 1BX9A 1SK1A 4F9ZA 4Q5FA 4GCIA 3VWXA 2AYTA 4J2FA 4GWRA 2AUVA 1QK8A 1A2MA 2IJYA 1NW2A 2RLIA 4PUAA 4AJ6A 2VL3A 5B8AA 3TDGA 2IPAA 3VI5A 5G2ZA 2H6ZA 2CVDA 2PBJA 3TJJA 2OE1A 3UARA 2LEGA 1EEMA 1HD2A 4FO5A 4OCFA 2H66A 2XBIA 2MMOA 3ZFLA 2LQQA 4RUVA 1XCCA 5ID2A 4PX1A 1J9BA 1ILOA 1X5DA 2XBQA 5D9TA 1B4PA 1V40A 4EDZA 4OO5A 1SJ6A 4NPBA 3WD6A 3WGDA 3KTBA 2PWJA 3QFAC 3N9JA 2KOKA 3F3RA 3IAS2 3KGKA 4EDYA 1GNEA 4G19A 2IFQA 3M1GA 1WIKA 3GKNA 2ZCTA 1AXDA 5DALB 3O6TA 6GSXA 18GSA 4YAVA 1Q98A 1M2DA 2A2SA 2R3XA 2PGTA 4QL7A 1GL8A 5EVOA 2H75A 1A8YA 3GL5A 4I2TA 3BCKA 1M99A 4TOPA 5C00A 3D22A 5JWRB 8GSSA 4ECJA 1S3DA 1O6JA 1USBA 2WB9A 2DC5A 1T7PB 4TW5A 2MZCA 1E6BA 4OCEA 14GSA 2H73A 3A5WA 3F3QA 3GRXA 5B7CA 5CNWA 4POMA 5G5FA 5FT3A 1NHYA 4KX4A 3L4NA 5F8BA 4G2EA 3LYKA 1S3CA 3A2VA 4TR3A 1IYIA 1SKRB 1F6MC 1CQGA 3HJMA 1K0DA 3EVIA 5CP1A 1X9MB 4IQ1A 1M0UA 4GQCA 5ECMB 4GSTA 4HQSA 1AUCA 3BBYA 1GSYA 3DMLA 1QMVA 4K7IA 3CRUA 2YNXA 2QKEA 2O89A 3FR3A 2VL2A 3FKFA 3PR8A 1O7UA 2NBSA 1ZMAA 1G7OA 4O92A 3IR4A 1MDKA 3FR6A 1JZRA 1DE1A 3E9JB 1YEPA 4ZIJA 4I5QA 1LBKA 1KBNA 5GZZB 4I97A 4DVCA 4TR4A 3IC4A 1K0AA 3KMOA 2RUFA 1KNGA 3APQA 4PNGA 1Z6MA 2LNTA 4IJ3A 1Z7PA 3F6DA 4OFNA 1GTAA 2LJRA 3PGTA 1OC9B 5LCZA 3FZ5A 2L6CA 2FWHA 2PVOC 3LFLA 4TR1A 4XS4A 5HFKA 4RI7A 5E59A 1V2AA 3VPTA 1FO5A 2HYXA 3ZFBA 5A4VA 3QFBC 3R2QA 3EU3A 4TXOB 1SL1B 3EWLA 4NXIA 2YWNA 6GSWA 1X0RA 5IO0A 1LJRA 2VCTA 4I6XA 1X5EA 2FD3A 5KEJA 1BYEA 1ML6A 5IMDA 1V9WA 5AISA 4V1Ap 3UVHA 3VLNA 3HZ8A 2J23A 4P3YB 3W8SA 5CRWA 10GSA 2WJUA 4MJAA 1EP7A 5HR2A 4I2UA 1GRXA 3GX0A 3MAKA 4TXVA 4OMVA 4NAXA 1XW6A 3ERGA 2V6KA 3RPPA 3M3MA 1A24A 2GLRA 4FYCA 1F37A 1YF1A 2OJLA 1SKWB 3WGXA 3QMXA 5IOWA 4EO3A 4K7NA 2TIRA 4WR4A 4JRRA 2CT6A 4KA0A 2R6KA 1YDKA 5CAXA 1W89A 20GSA 1XBSA 3UMAA 1ON4A 3C8EA 3H4KA 4YQMA 3ZLPA 1X9WB 1XWBA 5KN2A 2CQ9A 2MMAA 4HQZA 3NIVA 2LRCA 2E2MA 2OBIA 2VO4A 2H6YA 1GNWA 1MDJA 4ECCA 1PKWA 5DCGA 4J57E 1GSDA 1T4ZA 4XTSA 3AY8A 1UVZA 2WRTA 3CTFA 4PQHA 3HY2A 3FZ4A 2FCHA 4KCAA 2H74A 2IL3A 3TUEA 3ED3A 4JBBA 3PH9A 5LD0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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