2H8LA

Crystal structure of the bb' fragment of erp57
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
232
structure length
232
Chain Sequence
PASVPLRTEEEFKKFISDKDASIVGFFDDSFSEAHSEFLKAASNLRDNYRFAHTNVESLVNEYDDNGEGIILFRPSHLTNKFEDKTVAYTEQKMTSGKIKKFIQENIFGICPHMTEDNKDLIQGKDLLIAYYDVDYEKNAKGSNYWRNRVMMVAKKFLDAGHKLNFAVASRKTFSHELSDFGLESTAGEIPVVAIRTAKGEKFVMQEEFSRDGKALERFLQDYFDGNLKRYL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Protein disulfide-isomerase A3
publication title Crystal Structure of the bb' Domains of the Protein Disulfide Isomerase ERp57.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 64
structure length 232
sequence length 232
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2006-06-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h8lA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h8lA02
1WIKA 1GLQA 3UAPA 2HI7A 4ZL8A 3KP8A 4ZBBA 4XCSA 4BA7A 2RM5A 2LV3A 3L4NA 2DJKA 4XS6A 2FGXA 1YZXA 2VIMA 3FR6A 2LNSA 3APOA 1OC3A 1GSYA 2GLRA 3GH9A 2GGTA 3IC4A 4LMVA 2R37A 2P31A 2G0FA 4BVYA 2C0DA 1IYIA 4JR4A 4Z7XA 4JEDA 3TKSC 4PUFC 3FHKA 3KEBA 4EDYA 1EV9A 2ES7A 18GSA 3VWXA 2GDRA 2H66A 1ZGNA 4IJIA 1NW2A 1ZOFA 1QQ2A 1S3AA 1AC1A 2L5LA 1ZMAA 3EC3A 4I97A 4ECIA 1WE0A 1BAYA 3GA4A 5LD0A 5IO2A 1A0FA 1PL1A 4H86A 5LCZA 1H75A 2GSSA 3QDNA 4AGSA 4PUAA 1MDIA 2DMLA 2CT6A 1JFUA 2VLTA 2LSTA 4LMWA 2GSTA 3TOTA 4MK3A 1X5DA 2MMAA 2H0IA 1U6TA 1M2AA 2PBJA 3D0ZA 4WETA 5HQPA 3VI7A 4HS1A 5J9BA 4J57E 4HU9A 3EU4A 3NIVA 4IQAA 4TW5A 2HSYA 2YN1A 3FKFA 1F3BA 1AXDA 3GYKA 5IOWA 3ERGA 13GSA 2HZEB 4K0NA 1OKDA 4OO4A 1PSQA 2YZUA 5J9CA 2YV7A 1AUCA 1A24A 1TK5B 2YJ7A 1R5PA 4DSQA 2R3XA 2C8UA 4K6XA 1XBSA 4WF5A 4ZBDA 3LEFA 4QQ7A 2I3YA 1T00A 1VF2A 3ZTLA 1S3CA 2X8CA 3TJKA 2X8GA 4TXOB 1EEMA 2DMMA 3IK7A 1PX6A 3F4RA 1NSWA 3WT2A 4G10A 1MD4A 2PMTA 2TIRA 3CSHA 2DC5A 4NXIA 3QAGA 3QOUA 1XWKA 4HI7A 3KTLA 3LWAA 5IMAA 5C04A 4F0BA 4OFNA 4N11A 1UA5A 1AAZA 4F2IA 4RQRA 2RUEA 3I9V2 3DEXA 1N2AA 2P5QA 1X9SB 1YKAA 4TKYA 4GLTA 2B7KA 2GTUA 5D8IA 2LJAA 3KJYA 2H0HA 4KB3A 2V2GA 2VCVA 4X0XA 3ERFA 3P8WA 2VD0A 1X5CA 3E0UA 4L8EA 2N5BA 3GN3A 1OAZA 5DAKA 3M9KA 3UBKA 1VF1A 3GL3A 1M0UA 3LG6A 2MMOA 2CAIA 4HOJA 1V98A 2LJKA 1TI3A 3WGXA 2MMNA 1W4VA 5D9XA 2MBSA 1XW6A 2VD1A 3RPNA 1UVZA 1THXA 2LJRA 3RPPA 3C73A 16GSA 2H1BA 3IHQA 2VLVA 4I5QA 1YEXA 2WS2A 4MZWA 4HQSA 2L4CA 3ZMKA 2QGVA 2VM1A 3UARA 3IPZA 4AF2A 2XBQA 4HU7A 4AJ8A 2LQOA 2A2RA 4ILFA 1LU4A 3BBYA 3EURA 4E8EA 3APSA 3FR3A 1Z3EA 3O76A 3W8JA 2ZUPA 4BWSA 5KEJA 3KXOA 3JCML 1GUKA 3IAM2 2L59A 3HZ8A 3GSSA 3RDWA 5B8BA 1ZL9A 3E9JB 3KCMA 1M99A 2VM2A 1AQVA 4MF6A 4ZB6A 1V57A 2KUCA 2J23A 3GIXA 3O3TA 3D5JA 2I9HA 4N0ZA 4EO3A 2DJ2A 4P3YB 1OC9B 4N10A 2WGRA 3DRNA 1THOA 5JWRB 3H79A 4EKZA 4ZL9A 4EUYA 2C0GA 2YOIA 1F6MC 3HJOA 2AAWA 2E7PA 1I9DA 2AV4A 4X43A 4KAEA 4YAVA 3ISOA 4EF0A 4FYBA 2IMFA 1XWCA 3IDVA 1FO5A 2NVLA 5D9TA 2MYGA 3C1RA 4L0WA 3GV1A 2LS5A 3GKMA 3HXSA 5G2ZA 3E3EA 1GNEA 3FRCA 5G5EA 1GSDA 3GNJA 1JZWA 1EP8A 5G5FA 2P0GA 4XHMA 2H6XA 3C8EA 1K0MA 1SK0A 2IFQA 4MF5A 4PXOA 5J5NA 4ZB8A 4KE3A 3AY8A 3A2WA 4EE0A 1I5GA 5DCHA 4D73A 4I2UA 4PQHA 11GSA 2H1AA 5DALA 1XOBA 2LRCA 3HD5A 3MWHA 3G7JA 3MNGA 1YF1A 3ZRDA 2YWMA 5ELAA 4KDUA 4WBJA 3VURA 1GSSA 1TRUA 3ZZXA 2OE1A 2A4VA 5IPGA 1PRXA 5E4WA 3C7MA 3H4KA 3LSZA 2FWGA 2DLXA 2MBTA 3F8UA 2H74A 1V2AA 1JZOA 3QMXA 1Z6NA 2QKEA 4G19A 1PD21 5EL8A 2PGTA 3VK9A 2YWNA 1B8XA 3TCOA 1USBA 4IQ1A 5DJLA 3V1WA 5DQSA 3TB2A 1K3OA 2DJ1A 3J7Yk 3DD3A 4IBPA 2JADA 5EY6A 3F3RA 4GQCA 3GTUB 2VOCA 3K8NA 3GKXA 1K0AA 1JLWA 4N30A 3A5WA 1A2MA 1H4OA 1XW9A 1YF0A 1Z7RA 2M80A 1GH2A 4NAXA 3UEMA 1NM3A 2C4JA 3G7IA 4KW6A 1X9WB 3ME7A 5IMZA 1XZOA 4IVFA 2DSAA 3CMIA 5CYYA 2IJYA 2H1DA 3DVWA 3LXTA 1B4PA 3PGTA 1ABAA 3WGEA 2VUPA 3HVVA 1TK0B 2XBIA 2I81A 1DSBA 1SKSB 1AQXA 3FZ5A 2CZ3A 1V9WA 2AJQB 3HJPA 3KIJA 5CRWA 3F0IA 4JZQA 4RI7A 4ZILA 5COHA 1PMTA 4FH8A 2VAFA 3DMLA 3BCIA 4ID0A 2DIZA 2QC7A 1FAAA 1TKDB 4JU5A 3TJGA 2CX4A 3HYPA 1Z5YE 2NDOA 4DEJA 2VLUA 2YV9A 4FIWA 2HZEA 4IGJA 3KTBA 2HT9A 4ISDA 2GS3A 1MDKA 4L5OA 4V2MA 1O73A 4V2NA 2VL2C 1FOVA 1GL8A 2L57A 1MDJA 1VF3A 2OACA 2WULA 2XC2A 2YPMA 2FWEA 1MTCA 5ECQB 4MPGA 1SKWB 4MH2A 4IP1A 1U3IA 3TJBA 3DWVA 4YQVA 2CZ2A 3P90A 14GSA 4TXOA 3TJFA 2IMKA 2N5FA 1TJDA 4NMUA 1FVJA 2KP1A 1MD3A 1GRXA 1RW1A 3PR8A 2H70A 1TOFA 5G1KA 2RLIA 5DVBA 4JBBA 1SENA 2R6KA 3F4TA 4RI6A 3I69A 5FHIA 1K0CA 1SKRB 3P7XA 1PQNA 2HZFA 4IW9A 2H1GA 1WJKA 1WPIA 4CW9A 2GQKA 1F37A 4GSNA 1PKWA 4TR1B 3L9VA 3U5RE 3ERWA 5HR2A 3TKQA 2YWIA 1R4WA 1MEKA 4ML6A 1VF4A 2G2QA 1YY7A 4DVCA 1GP1A 3HVXA 4IJ3A 2JSZA 2JL4A 1CQHA 1JZRA 4JRRA 1TP9A 5CAXA 4ACSA 1XCCA 2J9HA 1KTEA 5ECIB 2VL3A 4IS0A 2L5OA 2K8VA 5HR0A 5IQYA 1G7OA 2HLSA 2FLSA 2LKUA 1HNCA 3D4TA 5F05A 4WXTA 5ECNB 1GTIA 1YEPA 4KCEA 1SYRA 1SJZA 1JLVA 4K0GA 2LEGA 3PINA 4K7OA 1GTUA 4IP6A 2F51A 4HZ4A 2EC4A 4FYCA 5IM9A 2F9SA 3CBUA 4WR5A 2X99A 1T8EB 1A0RP 1YKCA 5CRGA 3G7YA 1HD2A 7GSSA 5ECLB 3LYPA 1TW9A 1KBNA 1B48A 1EWXA 5B7CA 4OFTA 4NV2A 1GWCA 3FZ9A 5G31A 1B9YC 2YCDA 2JZRA 6GSWA 1W89A 2MZCA 1A8YA 2HRFA 1T3BA 5CREA 3QPMA 3LFLA 5ECOB 5H5RA 3CSIA 2IWTA 4WR4A 3EVIA 1GTBA 1M2DA 1GSQA 4V1Ag 4EL1A 4MP4A 1Z9HA 1B4QA 1VGLA 4YH2A 5ECRB 2FHEA 2IIYA 5B6MA 1JHBA 4G2EA 2H0GA 1T4ZA 3TKPA 5ECKB 2M72A 1OC8A 6GSTA 3W6GA 2TRCP 1QXHA 3RHCA 1R7HA 1OC9A 1FW1A 2H30A 2MMZA 1R26A 4MH3A 2H19A 4KNDA 2H6ZA 3RBTA 2XPDA 3UIWA 5D9WA 3WD6A 2P5RA 1E6BA 4ZL7A 1GSFA 2F8AA 4RUVA 4QL7A 4WF4A 2FA4A 3DKSA 4J56E 3R2QA 1O81A 2O87A 2CQ9A 1TK8B 5D93A 3GMFA 4LA1A 4TR3A 3KMNA 4LL4B 4Q5NA 4KA0A 2OE0A 3VWVA 5L71A 1TI1A 1ON4A 3EU3A 3GL5A 4ZB9A 3VFIA 4BPYA 5ECHB 3CTFA 3P2AA 1SYXA 3HJMA 2L6CA 3IXRA 5ECPB 1GUMA 2LRTA 2NBSA 6GSXA 3IAS2 1WRYA 3OR5A 3F9UA 2WRTA 2FCHA 4PNFA 2DBCA 5DCGA 1FB0A 9GSSA 4TR0A 4MJAA 2B7JA 3IE3A 2C80A 1O6JA 3ZIJA 5HFIA 1G0TA 2VCWA 2K18A 2V41A 2VL9A 1ZYQB 2GQLA 3EMXA 1ST9A 2H76A 5KN0A 3F6DA 5AISA 2JSYA 1TRWA 4PQIA 1OE8A 4V2LA 4XS4B 4KDXA 3VPTA 3VWUA 2B1KA 2OJLA 1LJRA 4PNGA 3MAKA 2YWOA 5F07A 1TU7A 4I8BA 3DGQA 1J9BA 3J7Yb 1ZYEA 1T4YA 3GHAA 4O92A 2HXKA 5JCUA 5A4UA 2E2GA 5ID2B 1DUGA 3FZAA 2E2MA 3TJJA 2CVKA 3VPQA 2VL2A 1PGTA 1N8JA 5GZZB 3TKSE 5KN2A 3GTUA 1PKZA 4O32A 2AUVA 5J3RA 1AW9A 3TKSA 1XWGA 3TGZA 3TRPA 2X64A 5IMVA 5F8BA 3HCZA 5A4WA 4TN8A 4Q5RA 1BX9A 1NHOA 3GSTA 4I2TA 2HSHA 3LQ7A 3FEUA 5AN1A 4OFMA 3F3QA 4GXZA 4BVXA 1FB6A 3ZVJD 5FT3A 3A2VA 4MZBA 2H01A 5CO3A 3WGDA 3WYWA 2GT6A 4EC0A 3M3MA 4JE1A 1SJ6A 3QR6A 5HR3A 2A2SA 3HHVA 4F03A 1BG5A 1JZDA 3O6TA 4HJMA 2NPBA 5D73A 12GSA 4K7NA 3Q74A 5ENUA 5A4VA 2RIIA 2JACA 2PVQA 1K0NA 2IN3A 3IK9A 1XVQA 3QFBC 1URMA 4WBRD 3WT1A 5CRHA 5AGYA 1O7UA 3M8NA 3L0HA 1DE1A 2HFDA 2OKAA 1IYHA 2EIRA 3RAZA 1ERUA 3D22A 2PU9C 5J4UA 3L78A 3ZITA 2R2JA 4GRFA 2REMA 1EV4A 5IMCA 3SBCA 3LJRA 3GX8A 2YNXA 3QFAC 3GH6A 3FW2A 1GSEA 5G1LA 4CDOA 2QSIA 5DJMA 1X5EA 4J2FA 5CP1A 2CVBA 3HZ4A 2Z9SA 5F0GA 4XRDA 1QUWA 1ILOA 1ZZYA 2JU5A 3UBLA 4X1UA 4ECBA 2IPAA 3BOAA 1XIYA 4L0UA 17GSA 2XHFA 3N9JA 3QAWA 3CRUA 5AIVA 1RQMA 1A2LA 2PWJA 5GSTA 4K2DA 1Z6MA 4XS1A 3EE2A 4MPFA 1GULA 1HNAA 2ALBA 3TDGA 2LRNA 5JCGA 3TUEA 4TR1A 5IO0A 1K0BA 1TU8A 1O8XA 1G6YA 3QD9A 2LTKA 3UL3A 2B5YA 3PH9A 1XXUA 3IA1A 5F06A 5ECMB 2AYTA 4POKA 2B5XA 4TRXA 5GSSA 4HDEA 5KN3A 3GX0A 4HQZA 5FWGA 3H1NA 2LNTA 2RUFA 1EGOA 4ULXA 4E8HA 3F4SA 4HZ2A 1XVWA 3I43A 1M9AA 4OWYA 2CX3A 2C3NA 4GWRA 4KDYA 3ZFLA 2RM6A 5JWQB 1X0RA 3FYGA 4N0VA 2R4VA 2PERA 2PVOC 4MDCA 5EVOA 4O7HA 1Y25A 3KH7A 5IIZA 2OE3A 3CSJA 3EWLA 2ON7A 4F9ZA 4IELA 2B3SA 2YANA 19GSA 1UN2A 1T7PB 4MJCA 4EDZA 4DSRA 2V1MA 1PL2A 2I4AA 3IBHA 3IOSA 8GSSA 2VCQA 4DSSB 3Q6OA 1YQ1A 3GUSA 4MJEA 3EINA 1SK1A 1EEJA 1PX7A 3FZ4A 1EP7A 3UJ1A 3HKRA 1XFLA 2H71A 1ERWA 3KM6A 5CRDA 2FD3A 5IMDA 2LQQA 1O85A 3M9JA 3APQA 1EOGA 2H72A 22GSA 2GZPA 4KX4A 1WWJA 1BJXA 3IV4A 10GSA 2VCXA 6GSUA 3A2XA 5GAPD 3ZVJA 1DE2A 2I1UA 2V6OA 2BMXA 3RHBA 3CTGA 2PUKC 1Z7PA 4WKWA 6GSVA 2C1YA 2NTOA 3CYNA 1R5AA 4Q5FA 4ECCA 4YQMA 4LL1B 2KOKA 3F6FA 2B5EA 1FVKA 1GNWA 1XOAA 2LUSA 3FY7A 3L9UA 1K0OA 3UVHA 1K0DA 4KGIA 5B6NA 2ZCTA 2JZSA 3Q19A 5B8AA 4POBA 4CHSA 4BL7A 2TRXA 1A8LA 2F8FA 3GKNA 4ZIJA 2O7KA 3H93A 3D6IA 4NHZA 1U88A 1OVNA 3HY2A 1ERTA 4RQXA 2R5GA 5DQYA 4MA9A 1F9MA 3H8QA 3ZFBA 2GQMA 2ZNMA 3QCPA 4POLA 3LYKA 2YP6A 5INYA 2V6KA 3EMPA 2V32A 2VCTA 2GVPA 3QAVA 2IMDA 1M9BA 3NZNA 4PX1A 2IMIA 5ELGA 3TRQA 6GSSA 4AJ6A 2GT5A 2M46A 3FR9A 2DIYA 4ZXGA 4MZCA 5AIXA 2WJUA 1ACVA 20GSA 4V1Ap 1SU9A 1O8WA 3W8SA 1SL2B 1X9MB 1F3AA 1XPVA 4HEA2 3IRAA 1XW5A 4G9HA 4OCEA 4MLYA 3ME8A 2X8HA 4ML1A 4KH7A 1QFNA 1J08A 1GUHA 3HA9A 2AHEA 4TOPA 4MABA 1M2BA 1DBYA 4PURA 2O8VB 3TKRA 4TVEA 2CA8A 3ZLPA 2JZTA 4XS4A 2H8LA 1SJIA 1HQOA 4ECJA 2FA8A 2WZ9A 5DBQA 4F82A 3BD2A 1AQWA 2OADA 4NV5A 3MDKA 4O5RA 1BQ7A 3CXGA 5DDLA 1SL0B 2OBIA 1U3AA 5ID2A 5J41A 2IMEA 3ZMLA 1NHYA 4KUNA 4TXVA 4NPBA 5IMFA 2H75A 4WEYA 1Q98A 2C3QA 2KP2A 3DVXA 2B6MA 4XTSA 2IL3A 5EPFA 1OYJA 5A5KA 4I6XA 3FK8A 1SD8A 1WP0A 3I6AA 2YJHA 1QGVA 3TOUA 4PQ1A 1F2EA 1U87A 5GAND 3HVSA 2GSRA 4BWQA 4F0CA 5HFKA 2OBKA 4OCFA 1ERVA 1GSUA 4GSSA 3ZIVA 3GURA 2N5AA 2VCZA 5JWOB 1GTAA 3ZYWA 2DJ3A 1KNGA 4XRAA 3VLNA 3VWWA 2L6DA 3ZL5A 2PPTA 4PGTA 2HNLA 5H5SA 1OE7A 3LXZA 2YZHA 2CAQA 3Q18A 3LGCA 5DAKB 3KH9A 3F63A 3DXBA 1GLPA 1B9XC 4OD7A 5HR1A 4EVMA 4MJBA 1QMVA 2D2ZA 3NOFA 5JCWA 1K3LA 4MCUA 3L9SA 1YDKA 4YQUA 4K7IA 4OO5A 4ZBAA 3TRXA 1J0FA 4K8MA 3DYRA 1PA3A 1Q4JA 2XPEA 4JR6A 4IKHA 3M0FA 4MMMA 4KSOA 1UC7A 2FY6A 2B1LA 1ZCPA 4TR4A 3KP9A 1ML6A 1BYEA 1EZKA 4GCIA 1Y6EA 2L4QA 1SL1B 3LORA 3D21A 5D96A 1TRSA 3IR4A 4GSTA 3SWLA 2KLXA 3C1SA 4GQFA 1YJ6A 1E2YA 5E59A 1V58A 3KMOA 2BJXA 4K9ZA 2FWFA 2VO4A 2WCIA 3ZREA 2GZZA 3C71A 2C0EA 1TRVA 2C3TA 1FHEA 3KZQA 1SD9A 3US3A 3EYTA 1PN9A 4POMA 2DJ0A 1HNBA 1TXXA 5G30A 5CNWA 3KGKA 5LNKe 1BEDA 1WOUA 1AIUA 3N5OA 4QL9A 2WB9A 3DIEA 4IHUA 1TTZA 2H73A 2PN8A 3KD0A 5C00A 3GRXA 3CRTA 2DJJA 2HRNA 4KCAA 3ED3A 3HDCA 1HYUA 4NWYA 1V40A 2EIQA 3UMAA 1C72A 3BCKA 1XWAA 1A2JA 4OMVA 1EGRA 4KSMA 5KN1A 2OA7A 4FYUA 1A23A 4XIHA 6GSYA 3A3TA 3U6VA 3G9BA 2CV4A 3VI5A 2F3MA 2HE3A 4K1FA 1OKTA 5HFGA 4MF7A 5ABRA 4AJ7A 5H5QA 1VRSD 2GSQA 2AB6A 1T1VA 3BJ5A 2H6YA 2HYXA 3GFKA 1XWBA 4HJ2A 4IN0A 1S3DA 4NHWA 2O89A 4HUAA 2FWHA 2FUG2 2WFCA 4YAPA 2GZYA 3D4MA 2K9FA 2IFQB 1K3YA 2C0FA 1EOHA 3UOMA 5IOXA 3S9FA 3M1GA 1G6WA 5D9VA 4D73B 2ON5A 2FNOA 4GF0A 5ECSA 1G7EA 5DALB 2CVDA 1QK8A 3MSZA 1WMJA 1M7TA 1KEBA 2EIOA 4DSSA 1LBKA 4EXJA 2BTOT 1TDIA 2K6VA 1SK2A 2E0QA 4FO5A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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