4TKYA

The complex structure of e. coli dsba bound to a peptide at the dsba/dsbb interface
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHAYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein DsbA
publication title Peptide Inhibitors of the Escherichia coli DsbA Oxidative Machinery Essential for Bacterial Virulence.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase/peptide inhibitor
total genus 69
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4tkyA00
2ON7A 4OFTA 1QK8A 2A2SA 4GSTA 3O6TA 3GMFA 3DVXA 2OBKA 4BA7A 1T4ZA 1XBSA 2VM2A 3EU3A 5ECQB 1B4QA 1H4OA 3C1SA 3VI7A 2DBCA 4KSMA 3RHBA 4BVYA 3M0FA 4JE1A 3A2VA 1R5AA 1RK4A 3H1NA 3GKMA 5ABRA 1AUCA 2YNXA 2DJ2A 2JZSA 5HFKA 4L0UA 4IBPA 2DSAA 4GQFA 2K8VA 6GSYA 4MDCA 4EC0A 2GQMA 2YOIA 4HZ2A 2C0GA 3GL5A 5HR0A 5AIXA 3BOAA 4TOPA 3K8NA 2VO4A 4I2UA 2A4VA 3QAGA 1OYJA 1A2LA 3GX8A 1A8YA 2CT6A 2BMXA 4J56E 1VF3A 4AF2A 4GQCA 1V58A 1X5EA 4GTUA 3ZRDA 3IE3A 4EF0A 2HZEA 3GNJA 2NBSA 2FWEA 2V32A 3OR5A 3HD5A 4HQSA 3CYNA 5HR3A 1GNWA 2MMZA 4V2NA 4NXIA 2E2MA 4OD7A 1SD8A 1G6WA 2HE3A 3IBHA 2GSQA 3QD9A 3UVTA 2MMAA 1K0CA 2H1AA 3MAKA 5JWRB 1PL2A 1TI1A 2DJ0A 1SU9A 1OE7A 5GSTA 4IP6A 4OFNA 3GH9A 3TOTA 3KTLA 1SYXA 2CZ2A 4NV2A 1JLWA 2H19A 3G9BA 2VOCA 3IA1A 1SK2A 1PKZA 3KTBA 5F8BA 2B3SA 1M0UA 1TK5B 2DIYA 3BJ5A 1Z7RA 4V2MA 3ZREA 5CRHA 4AJ8A 2LRCA 2KUCA 1TI3A 1MDKA 2VCVA 5INYA 3F8UA 3KZQA 1ERUA 2GZZA 5IIZA 3GUSA 3GKKA 1E6BA 4D73A 3DXBA 3Q18A 4AGSA 4IQAA 1GRXA 3QDNA 2P5QA 2PVQA 3UL3A 2CX3A 3FR6A 1GULA 1G7OA 2O89A 2ZUPA 4CW9A 3F9UA 4KE3A 1GLPA 4YAPA 3MSZA 3UIWA 4HEA2 2CA8A 2BJXA 1I9DA 3VFIA 3TKSC 1DE2A 4WR4A 4IP1A 2C1YA 2FCHA 5D9TA 3M9KA 4MZCA 3GURA 1YDKA 4AJ7A 4EE0A 3KH9A 2WRTA 3GH6A 1JLVA 1WE0A 1K0NA 4LA1A 3CSJA 2YPMA 1ZGNA 1JFUA 4RI6A 1GSFA 1TJDA 2C3NA 1GTAA 2PUKC 4MF7A 5ECNB 1K0OA 4OFMA 2GZPA 3F4RA 3DKSA 5CAXA 1ML6A 17GSA 1X9MB 2EC4A 5D93A 2F8FA 3GX0A 2JU5A 3WT1A 1Z7PA 1FOVA 1GSYA 2LS5A 2JL4A 1M99A 2J9HA 2C4JA 2OACA 3IOSA 4K7IA 1F9MA 5LNKe 2LRNA 1O8WA 2R3XA 4PQIA 2R4VA 2H66A 3FZ5A 1IYIA 1LU4A 1GP1A 2MMNA 3C8EA 3TOUA 4ZBDA 4ACSA 1PGTA 4TN8A 3FR3A 3IK9A 1QQ2A 4WEYA 1O8XA 3HZ8A 5J9BA 5DJMA 5JWOB 1V2AA 1KNGA 3US3A 1SKRB 4TXVA 1IYHA 3P7XA 1M7TA 2N5BA 2OE1A 4IS0A 1Z3EA 1U3IA 3RAZA 2VCTA 3HYPA 4XS4A 1F3AA 2PU9C 3QR6A 4RUVA 3GA4A 1F6MC 2VCWA 2D2ZA 1XWKA 1Z6NA 1TRWA 4PQHA 2GSSA 4NPBA 4Z7XA 2VM1A 2WFCA 1T4YA 2H01A 2B7KA 1T00A 2LJKA 2H1BA 2C80A 3APSA 4EO3A 2E2GA 1GNEA 1ZYEA 3DD3A 1GSQA 1T3BA 5DAKA 1CQGA 1VF4A 3ZTLA 1WP0A 3GL3A 2YV9A 4MMMA 3BD2A 3IDVA 4KAEA 5C00A 2H75A 3CRUA 2FGXA 3CTGA 1CQHA 4ZL8A 1B8XA 4ZIJA 4TXOB 2H8LA 2WULA 4E8EA 2DMLA 3JCML 4NWYA 4WBJA 2I1UA 1W89A 1I5GA 1J0FA 1C72A 2IPAA 3IPZA 3WGXA 1FAAA 2GSRA 4ZB6A 1TP9A 4KNDA 4RQXA 1ZYQB 2I4AA 3GKNA 1QFNA 1Z5YE 4GWRA 2NDOA 5IO0A 5IPHA 2VUPA 5GZZB 3FZAA 5CRDA 2F9SA 4OMVA 1F2EA 6GSUA 1XOAA 3U5RE 4K7NA 5CREA 1XWBA 1GSDA 2YWIA 1XFLA 4L5OA 3APQA 4EUYA 4ILFA 2LEGA 2WDUA 3NIVA 6GSVA 4I97A 1VRSD 1OC9B 4EL1A 3BBYA 3VK9A 5H5SA 1YF1A 2TRXA 3MNGA 3LQ7A 5JWQB 1R7HA 1A24A 4WF4A 1O73A 2YZUA 3ERFA 3W8JA 1HNCA 3UBKA 1GTBA 2VLVA 3C73A 3GYKA 3TB2A 2IMEA 1PD21 5DALB 2HZFA 3FEUA 1EP7A 4MF6A 22GSA 3N5OA 5IMDA 2FWFA 1MTCA 4N10A 1GUMA 4HS1A 3ZLPA 1ERWA 1QUWA 3GTUA 5IM9A 1XVQA 1EOHA 2HNLA 5B7CA 3HDCA 2YV7A 1S3AA 1AIUA 4OO4A 2H71A 1AXDA 3KJYA 3FZ9A 4F0BA 5A5KA 5DVBA 3FW2A 3DYRA 3FK8A 4GCIA 1PQNA 3HY2A 2NPBA 1BJXA 1TRVA 1XVWA 3KP9A 1HNAA 1UN2A 3Q6OA 3CXGA 1THOA 1OVNA 3TDGA 1TDIA 5D96A 1SK0A 4PNGA 2VCQA 3IXRA 4MH3A 4OO5A 2QSIA 4G9HA 1EV9A 1GSEA 1NW2A 4X0XA 3G7JA 4QQ7A 4FO5A 3SBCA 2EIQA 4TKYA 2Z9SA 4P3YB 4DSRA 5D8IA 1M9BA 4NMUA 1TKDB 5J41A 3HKRA 2E0QA 5HFIA 1WOUA 3UMAA 5ENUA 8GSSA 2G2QA 2MBSA 3TJFA 1MDJA 5A4VA 2OJLA 3ERWA 4J57E 2KHPA 2L4CA 4F0CA 2C0FA 2X99A 5EL8A 1YY7A 4V1Ap 4Q5FA 2FY6A 3I6AA 5IMFA 4PURA 3IV4A 2JZRA 2H73A 5FWGA 1Y6EA 1O81A 3L0HA 5IPGA 3EVIA 1FB6A 5IOWA 4BL7A 1A0RP 4TR1A 3KH7A 4MCUA 4ZL9A 2IIYA 4HUAA 4MK3A 3E9JB 4GSNA 4H86A 1XCCA 1BYEA 4IQ1A 1ZL9A 3QFAC 2A2RA 2QC7A 2HSYA 3GSTA 3LWAA 1A2MA 6GSTA 5AIVA 2DJ1A 2DIZA 5G2ZA 4HJ2A 3RPPA 3C1RA 2V2GA 5AN1A 3ZIVA 4TR3A 5A4UA 4F9ZA 5G5FA 1LJRA 4ZL7A 5CYYA 3Q74A 2GQLA 3FZ4A 1T8EB 5HFGA 1X5CA 4G19A 5ECHB 2GQKA 4ULXA 3IR4A 1SYRA 3ZFBA 1GUKA 5CRGA 4JU5A 1DSBA 1FB0A 2IMIA 3GSSA 4FYCA 5D73A 4K6XA 2JACA 2WB9A 2LTKA 2VIMA 1RW1A 2FA8A 5KN1A 5B6NA 2J23A 2IFQA 5F07A 2H72A 3WGEA 1U87A 4NHZA 4WBRD 4KH7A 4KUNA 4ZBAA 3D4MA 2B5XA 4Q5RA 5G31A 4XHMA 2O7KA 2JSYA 2OE0A 3RBTA 4GF0A 2X8GA 3D6IA 5IMVA 2IN3A 1B9YC 4EXJA 4MJCA 1A23A 3VPQA 5ECRB 4PUFC 3V1WA 4HU7A 5ECMB 2HYXA 5ECSA 4NHWA 2EIRA 4OCFA 5IO2A 4MPFA 5HR1A 5C04A 3FR9A 5J5NA 3HCZA 1U6TA 10GSA 3M8NA 2YN1A 3FY7A 4HDEA 4GRFA 3KXOA 5IOXA 3HJMA 4POBA 6GSXA 4KGIA 3KIJA 5CP1A 2XBIA 2YWNA 5E4WA 1K0BA 5ELAA 1KTEA 4IGJA 3ZVJD 3O76A 5HR2A 2CVDA 1X9SB 2TIRA 5AISA 2H6XA 5KN0A 2HI7A 4KDXA 3D21A 1RQMA 2K9FA 1PKWA 1XW9A 2QGVA 1FO5A 4I5QA 1K0AA 5G30A 2H1DA 4K2DA 3D0ZA 19GSA 3KGKA 1PSQA 2JSZA 2N5AA 1MD4A 2OADA 3A2WA 2HRNA 3HJPA 3CSIA 3TKQA 1X5DA 3CRTA 2B1LA 1YJ6A 2MYGA 3I43A 1OKTA 2GGTA 1V57A 1ZCPA 2LUSA 3F6DA 4POLA 1QGVA 3TRPA 2PGTA 2O8VB 2DLXA 3TJBA 3UEMA 4WF5A 4KDYA 2PVOC 2RM5A 5L71A 1SD9A 2VAFA 1VF2A 3ME8A 4ZB8A 5LD0A 3VI5A 5F0GA 5IMZA 2YCDA 1DBYA 4N11A 2GT6A 2AUVA 5G1KA 3RDWA 3ED3A 4Q5NA 4JRRA 1V40A 4BWQA 3GKXA 4WKWA 3FHKA 2KP1A 4EKZA 1ZMAA 2RLIA 5GAPD 3WD6A 3GIXA 3LXTA 3CMIA 2GT5A 2F3MA 1O6JA 4G2EA 1Z6MA 1BX9A 2V1MA 1BAYA 1FVJA 1SL2B 3QOUA 1XW6A 2H70A 3HVVA 6GSWA 2VL2C 2C8UA 2WS2A 4KCAA 2X8HA 1FW1A 4OWYA 3TKPA 3VWWA 4O32A 2M80A 4IJIA 2WCIA 4Q5QA 2HT9A 2CVBA 1Y25A 1NSWA 1SL1B 1TK0B 2TRCP 1FVKA 1WWJA 2IMKA 4ZBBA 1Z9HA 4CDOA 1XWCA 2AV4A 1J9BA 3EC3A 5ID2B 3EE2A 2JADA 3M3MA 1AC1A 3FKFA 1N8JA 3ZMLA 3W6GA 3D5JA 2HLSA 3ZFLA 1G0TA 3CBUA 1URMA 1EEJA 5IMAA 1GLQA 9GSSA 3ERGA 1YF0A 2NTOA 5EPFA 1OC8A 3GHAA 1BQ7A 4YAVA 1JZWA 3A2XA 5AGYA 5CNWA 2VLUA 2FWHA 1AW9A 5CO3A 5DDLA 4WXTA 3F6FA 2V6KA 2WZ9A 4FYUA 3DGQA 3H93A 3M1GA 5J3RA 1PX7A 4LL4B 5KEJA 3LYPA 1XZOA 1TXXA 4GXZA 2GS3A 2FA4A 3Q19A 2N5FA 3DEXA 3QCPA 3WT2A 4TR4A 3N9JA 2F51A 4TW5A 4IN0A 2FHEA 1NM3A 4X43A 3KM6A 4PUAA 4TR0A 2HZEB 1TK8B 5ELGA 4IVFA 1T7PB 4F82A 4J2FA 4GSSA 3KEBA 2VLTA 2OA7A 3F0IA 4KB3A 3J7Yb 4DSSB 2DC5A 4L8EA 5J4UA 4YQUA 2FUG2 3VLNA 4MJAA 2REMA 5HQPA 4JBBA 1JZDA 5DQSA 5KN3A 4ML1A 2GLRA 4DSQA 4O5RA 3LFLA 2L57A 3VPTA 2LJAA 3QMXA 1SJ6A 1K3YA 1M2AA 1EOGA 2AAWA 2VD0A 4WR5A 2H0GA 4ECBA 3EMXA 1WPIA 2C0EA 2L6DA 5E59A 3GRXA 3EYTA 3RHCA 3A5WA 2RUFA 1KBNA 4NV5A 4MLYA 14GSA 6GSSA 4POMA 3C7MA 1GH2A 1GUHA 2C3QA 2LQQA 2H6ZA 3ZVJA 2P31A 4HOJA 1B48A 1SKSB 4MJEA 3TUEA 2P0GA 5B8AA 2I81A 4JR4A 4L5LA 2XC2A 1YZXA 2PN8A 2L5OA 3LORA 2PPTA 4XTSA 3TKRA 5D9XA 5GSSA 1HQOA 1NHOA 1VGLA 3ZMKA 3EU4A 1E2YA 3F4TA 2B5EA 3P90A 2DJJA 5F05A 2DJ3A 2E7PA 1PN9A 4HQZA 2RIIA 2HXKA 2R5GA 2OE3A 1O85A 4XS1A 2IL3A 2RUEA 3HVSA 4KW6A 3L9SA 4K1FA 2H6YA 1XXUA 2I3YA 5ECIB 1XOBA 3H79A 2B5YA 2CV4A 1K0MA 5ECPB 1BG5A 2IMDA 5DBQA 3KCMA 1GSUA 4TXOA 3D22A 2V41A 4XRAA 3LYKA 3PR8A 4E8HA 1WIKA 4MH2A 2DMMA 3EURA 2LSTA 5A4WA 2XPDA 1DE1A 4K0GA 2R6KA 3IAS2 3PGTA 2OKAA 1MDIA 2VCXA 2K8SA 1B4PA 1THXA 1OAZA 3HHVA 4MABA 3L78A 2H74A 2MMOA 3GV1A 4LMVA 1ACVA 4MP4A 5CRWA 2LKUA 3TJKA 3F3RA 4KSOA 1PRXA 1PMTA 1U3AA 3R2QA 2ALBA 4JEDA 2L6CA 3TJGA 3PINA 4O7HA 5KN2A 2IWTA 2M46A 1TRSA 1OC9A 4PGTA 2MBTA 3GN3A 1JZOA 1W4VA 1PL1A 3SWLA 4XIHA 2H0HA 4YQMA 1F37A 4XS4B 3J7Yk 4ID0A 3VWXA 2PMTA 3EWLA 3MDKA 4F03A 2KLXA 4DSSA 3VURA 5DALA 1EGOA 2L59A 3UARA 4HI7A 2L4QA 2F8AA 4LMWA 2EIOA 4K0NA 2GTUA 3H4KA 2LJRA 2H1GA 1ZOFA 4DVCA 1GTUA 3F3QA 1TOFA 2HRFA 4BPYA 4MZWA 5DAKB 5JCWA 1F3BA 5D9WA 1S3CA 16GSA 2GZYA 4IHUA 2YJHA 3HZ4A 1WJKA 3TRQA 1G7EA 1TU8A 1WMJA 4JZQA 2LNTA 2K6VA 2WGRA 3KMOA 4XCSA 4WETA 3QAWA 2KP2A 2VCZA 3KP8A 5GAND 2XHFA 2VD1A 12GSA 2FD3A 2HSHA 3DVWA 4BWSA 3IRAA 4F2IA 2CZ3A 3NOFA 4ECJA 4EDYA 1KEBA 3RPNA 3FRCA 1ST9A 1DUGA 3UOMA 5EY6A 1FG4A 1K0DA 2ON5A 3IHQA 3PH9A 3G7YA 1YEXA 3DIEA 1TW9A 2LRTA 2VL9A 1HYUA 2VL3A 3BCIA 3HXSA 3P2AA 1UC7A 3HJOA 3TKSA 1MEKA 3IAM2 3NZNA 2O85A 18GSA 3DMLA 2RM6A 3TJJA 5IQYA 4YH2A 1ILOA 4IKHA 3UAPA 4ECCA 4AJ6A 4K7OA 3KD0A 4NAXA 3L9UA 1ERVA 4I8BA 4QL9A 4POKA 1OE8A 2NVLA 2O87A 2B7JA 2R2JA 1K3LA 3CTFA 3LG6A 5DCHA 3GTUB 2XPEA 4RI7A 3QPMA 3O3TA 4FIWA 2QKEA 1SJZA 1MD3A 1G6YA 3LXZA 2I9HA 1M2DA 2YP6A 1GSSA 4HZ4A 3GFKA 1LBKA 4BVXA 3M9JA 3ZL5A 1X9WB 1SKWB 3L4NA 1YQ1A 3FYGA 3UJ1A 3EMPA 2ZNMA 1NHYA 4ZXGA 2YWOA 1JZRA 4PXOA 7GSSA 1ERTA 3LSZA 1FHEA 3KMNA 4I2TA 5F06A 1N2AA 4PNFA 5J9CA 3I69A 4MF5A 5FHIA 2VL2A 4TVEA 3VWUA 1TU7A 4FH8A 4CHSA 1QMVA 3MWHA 4LLRA 1AQVA 1ABAA 4IELA 4DEJA 3EINA 2LNSA 4PQ1A 4XRDA 1XW5A 3U6VA 1V9WA 5G1LA 4GLTA 1EEMA 2B6MA 4K9ZA 1UVZA 1EGRA 2H30A 4KA0A 2AYTA 3G7IA 5LCZA 2C0DA 4EVMA 2PBJA 1OKDA 3P8WA 13GSA 5D9VA 1HNBA 3UVHA 2CAQA 4ZILA 1A8LA 1TRUA 3ISOA 5ECLB 2C3TA 1J08A 2GSTA 3IK7A 4N30A 2CVKA 3WGDA 1EWXA 1O7UA 4K8MA 1JHBA 1M9AA 4TR1B 1VF1A 3C71A 4TRXA 1BEDA 4L0WA 2X64A 1HD2A 1YEPA 2KOKA 2YJ7A 1H75A 1UA5A 3S9FA 1GTIA 1S3DA 1XWGA 2P5RA 2WJUA 1K3OA 3LGCA 1AQXA 2H76A 5JCGA 4HU9A 2JZTA 2CQ9A 5DCGA 2HFDA 1AAZA 3AY8A 2YANA 5H5QA 3H8QA 3HVXA 4MPGA 4ECIA 2YZHA 3W8SA 3BCKA 4QL7A 1R26A 4KCEA 4IJ3A 4KX4A 1R5PA 4G10A 3IC4A 2XBQA 1SENA 3ZZXA 3DRNA 1GL8A 3DWVA 1OC3A 2M72A 3ZIJA 3QAVA 2AJQB 1PA3A 2ES7A 1ZZYA 1QXHA 2LQOA 1V98A 3TGZA 1SJIA 4KDUA 5FT3A 1T1VA 2BTOT 2FLSA 2AB6A 1EP8A 1SK1A 2G0FA 3ZYWA 2OBIA 2GDRA 2PERA 2IFQB 3E3EA 2PWJA 1A0FA 1X0RA 3A3TA 4ISDA 3VWVA 3ME7A 3I9V2 2L5LA 2DJKA 4MA9A 1XIYA 3TRXA 3UBLA 5COHA 5H5RA 1Q4JA 1WRYA 4MJBA 4XS6A 3L9VA 3D4TA 5IMCA 1B9XC 20GSA 3LEFA 4IW9A 1ON4A 3LJRA 5B6MA 4X1UA 3HA9A 1EV4A 2MZCA 2YWMA 2FWGA 2X8CA 4ZB9A 4HJMA 1PX6A 1R4WA 4MZBA 3TKSE 4YQVA 4ML6A 1USBA 2LV3A 1M2BA 3CSHA 1AQWA 2K18A 3WYWA 3F4SA 2H0IA 2CAIA 4D73B 5DQYA 1A2JA 5DJLA 11GSA 5JCUA 2B1KA 2IMFA 1SL0B 4FYBA 2V6OA 2IJYA 1TTZA 2ZCTA 4N0ZA 1XPVA 4V2LA 5G5EA 4EDZA 2FNOA 1Q98A 3E0UA 4PX1A 1YKAA 2GVPA 4LL1B 4O92A 4RQRA 1GWCA 5ECKB 5EVOA 3TCOA 2CX4A 4OCEA 3F63A 5B8BA 1YKCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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