4L0WA

Plasmodium yoelii prx1a modified at the n-terminus forms an artifactual octamer
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
173
structure length
173
Chain Sequence
YFQGQAPSFKAEAVFGDNTFGEVSLSDFIGKKYVLLYFYPLDFTFVCPSEIIALDKALDSFKERNVELLGCSVDSKFTHLAWKKTPLSQGGIGNIKHTLISDISKSIARSYDVLFNESVALRAFVLIDKQGVVQHLLVNNLALGRSVDEILRLIDALQHHEKYGDVCPANWQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium yoelii yoelii
publication title Observed octameric assembly of a Plasmodium yoelii peroxiredoxin can be explained by the replacement of native "ball-and-socket" interacting residues by an affinity tag.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin peroxidase 1
total genus 53
structure length 173
sequence length 173
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4l0wA00
1R5AA 4KGIA 2JSZA 5GSSA 2R3XA 1H4OA 1PQNA 1NHYA 1GSFA 4ZB8A 5JCUA 3FR6A 4NPBA 3HDCA 18GSA 3WT2A 3GKMA 1AUCA 8GSSA 4WXTA 3UVHA 1SJZA 2KOKA 3OR5A 5DJLA 2EIRA 4MZWA 1U3IA 4IS0A 2L4CA 2O8VB 4HU9A 3TRPA 1U6TA 1OE7A 2CQ9A 5F0GA 5G31A 1TP9A 1TRVA 1XWKA 2H6XA 4JU5A 4MDCA 3NZNA 2AJQB 3VLNA 3HHVA 3RPPA 1WPIA 2FUG2 4IQ1A 5DVBA 4IKHA 4J57E 3HXSA 2E7PA 2PVQA 3L78A 2EIQA 2PERA 1SYXA 1GNWA 1XIYA 1GUMA 4OMVA 2LTKA 3WD6A 3FZ9A 1PX6A 3D0ZA 3BCIA 4X0XA 3EWLA 2NBSA 3LYKA 3EE2A 2A4VA 4KCAA 1ST9A 4OO4A 1FG4A 5AN1A 2O89A 4ILFA 2EIOA 3HZ4A 5IIZA 2C80A 3IOSA 2WS2A 3CRTA 2VM2A 1XZOA 1BYEA 2IMFA 4YQUA 2B5XA 1F6MC 3FY7A 4I2UA 3TJJA 1LU4A 3VWXA 3UVTA 1GSYA 2L57A 1S3AA 2PPTA 3UEMA 3VPTA 1DE2A 1YJ6A 1YKCA 1HD2A 3M1GA 1H75A 5HR0A 3ZIVA 1KTEA 2NVLA 3DIEA 3FZ4A 4I97A 1UVZA 3TUEA 4IN0A 3VK9A 5D8IA 5ECNB 5FT3A 14GSA 4NV2A 4FYBA 22GSA 4AJ6A 5DAKB 4IHUA 2VO4A 4FIWA 1ON4A 3A5WA 2C8UA 5AIVA 3UOMA 1LJRA 3FZ5A 3ZRDA 4I6XA 4PQHA 3UAPA 3S9FA 4MJBA 5DCGA 1O8XA 1M99A 1O85A 5D9XA 2JADA 3FHKA 1ML6A 3L4NA 5CAXA 1LBKA 3LORA 3LG6A 2K6VA 4JZQA 3QFAC 1PSQA 1MTCA 1SJ6A 2VIMA 3GL5A 1B8XA 2PGTA 2IMDA 2LRTA 1U3AA 2VCVA 1VRSD 3EINA 3TKRA 1SD8A 20GSA 3LWAA 1SD9A 2V2GA 3IK7A 5D9TA 1OYJA 3TB2A 2O7KA 2XPDA 4V2NA 5HR3A 5IMFA 5ENUA 3MDKA 3A2VA 4KDXA 2OE0A 2CT6A 6GSUA 1RK4A 5ID2B 4IJ3A 1SKWB 2GDRA 4JR6A 3IPZA 2DJJA 1SYRA 4WBRD 1PKWA 1J0FA 4XS4A 3TCOA 4KB3A 3UARA 5ECKB 2DBCA 4GSSA 1JLWA 1WP0A 3HVSA 1PN9A 3ZIJA 3QR6A 3LQ7A 5ECSA 3D4MA 3BCKA 3KTLA 1AQXA 2VL2C 5ELGA 4GTUA 4OFTA 2C3QA 4YQMA 4DSSB 2C3TA 5J4UA 1K0CA 2OA7A 3GV1A 1YQ1A 2H6ZA 5JCGA 2AYTA 5C04A 4L0UA 4ZBAA 1M0UA 4LA1A 2YWIA 1YDKA 2IN3A 1G6YA 3D4TA 4OCEA 3ZMKA 2H6YA 1XWAA 4H86A 5D9VA 1N8JA 1XOAA 3TJFA 1V98A 1XW5A 3TDGA 5IMVA 2AUVA 2MYGA 3PH9A 5AISA 4EVMA 2CX3A 3WT1A 2H19A 3M9KA 4IJIA 4ZL9A 2N5FA 3FRCA 3C73A 3PGTA 1AQVA 4KDUA 4ISDA 4XTSA 2FA8A 4N10A 2Z9SA 3I69A 2A2RA 2B7JA 3IXRA 3C1SA 4EF0A 1J08A 3CYNA 2FWGA 1OVNA 1G7EA 1JZWA 4EL1A 3ME8A 1BEDA 3VWWA 1R7HA 4NAXA 2VLUA 3GMFA 3ZITA 3ZZXA 3IR4A 4TR0A 3JCML 2DIYA 3MNGA 3UMAA 2QGVA 1WRYA 3U5RE 1OC9B 3DMLA 2I81A 1ZZYA 3RDWA 3I43A 4ECCA 2BTOT 4L5LA 4PURA 5ECMB 4TXOB 5HFIA 1BX9A 2HNLA 3O3TA 1FB6A 1PKZA 2C0DA 2QC7A 3UL3A 2K18A 1PRXA 4I8BA 1K0MA 1EP7A 1B9XC 2P5RA 4NXIA 5A4VA 4BVXA 4NWYA 3F0IA 3EYTA 2L59A 4KX4A 3RHCA 4AJ8A 1WMJA 2H66A 3A3TA 2K9FA 1AC1A 1K3YA 4DSRA 5GZZB 1YEXA 4OO5A 9GSSA 1O7UA 1THXA 1GL8A 5G30A 4V1Ap 1XBSA 2H72A 2NPBA 2FY6A 4WEYA 1BQ7A 3W6GA 2HZEA 5D96A 3BOAA 4EUYA 4I2TA 2JU5A 2MZCA 2AAWA 4WETA 2XBIA 4PGTA 1EV4A 2VCTA 5DQSA 5CO3A 1WJKA 5F06A 4ZIJA 16GSA 2ES7A 3EU3A 3TJKA 2R5GA 3C1RA 1Q98A 1ZGNA 3FR3A 1EWXA 3P8WA 1TKDB 4IGJA 1SL0B 2HYXA 2PUKC 1OKTA 4ZILA 4PQ1A 4CDOA 1B4PA 2L5LA 2HSYA 3ZVJA 4GCIA 5IO0A 2D2ZA 5J9CA 2VAFA 5JWQB 2JSYA 4GF0A 4V1Ag 2R4VA 1PL1A 3HVVA 4ZB9A 1QFNA 2YOIA 3EMXA 4KCEA 1PX7A 2MMNA 2V32A 1WE0A 3CTFA 4D73A 3APQA 4GQFA 1X5DA 3UBKA 3FKFA 1UA5A 4F03A 2RIIA 3F6DA 2HZFA 4ACSA 1M7TA 2OE3A 2P31A 5DALA 2WJUA 1F37A 1TRSA 11GSA 4LL4B 2MMOA 4BVYA 2YWNA 3ZYWA 3O76A 3QAWA 5A4UA 2MBSA 4HZ2A 2DIZA 4KDYA 4ZBDA 3KM6A 4PQIA 3GKXA 1F3BA 1XVWA 3GX8A 4O5RA 3APSA 1T8EB 1AIUA 1A0FA 3FZAA 6GSVA 1GH2A 1HNAA 1YEPA 2F8FA 1Z6MA 2B1KA 4KH7A 2H74A 5CYYA 4IP1A 3L9UA 4HUAA 3H93A 2XPEA 3VI5A 5ECOB 5EVOA 3IHQA 3ISOA 1QXHA 4POLA 1I5GA 4KA0A 4Q5QA 2H71A 2LJAA 4BWSA 2X99A 1A0RP 2GLRA 1FAAA 2B7KA 1ZYQB 1EGOA 3QCPA 2QKEA 12GSA 4IVFA 1SK1A 1K3OA 2H0GA 2FHEA 1XWCA 2IJYA 3D22A 2YWOA 5ECHB 1M2DA 4GWRA 5CNWA 4LMVA 2GSSA 5ECLB 3KJYA 3LSZA 3ERGA 2X64A 4GSTA 4J2FA 3DXBA 4FH8A 4POBA 2FGXA 1FVJA 4EXJA 2PWJA 4TOPA 4ZBBA 1XW9A 4XRAA 1FW1A 3QMXA 4IW9A 2JZSA 3Q18A 2VD0A 3KP8A 3CBUA 1CQGA 3PINA 2DJ0A 1Y6EA 4QL7A 3GN3A 2C0EA 3GTUA 3GRXA 5CP1A 2MMZA 1GNEA 1XXUA 4XS1A 3Q19A 2LNSA 1ERTA 1YF1A 4YAPA 4E8HA 1QUWA 2IFQB 3C8EA 4K1FA 6GSTA 5D93A 1AQWA 3GFKA 4L0WA 2WGRA 2FWFA 4Q5RA 4TKYA 3WGXA 1ERVA 3F4TA 1M2AA 2DSAA 4QQ7A 1ERWA 3TRXA 2GQLA 2OBKA 1FHEA 2DMLA 3CXGA 2VUPA 5LCZA 1G7OA 2DLXA 2H0HA 1Z3EA 3F63A 2ZUPA 4F0BA 3HKRA 5LNKe 1EGRA 3CTGA 3GNJA 1GTIA 1S3DA 1X5CA 5HFKA 5CRDA 1S3CA 4PXOA 3IK9A 3W8JA 2L6CA 1HNBA 1OAZA 2HE3A 3D5JA 4ECJA 1GUHA 4XS4B 1GUKA 4RI7A 2R37A 3BBYA 3DGQA 1ZL9A 5IMCA 2YJ7A 1SL1B 4LL1B 4HOJA 2VCWA 5JCWA 5JWOB 1SKSB 3HVXA 4KE3A 3J7Yk 4GSNA 5IO2A 4MZBA 2GQMA 2GT5A 1G0TA 2VL3A 3EVIA 2L6DA 1M2BA 2FLSA 2DJ1A 1BG5A 2I4AA 3DVWA 3HJMA 4EO3A 4PX1A 3ZFLA 5L71A 1USBA 1R5PA 2YANA 5AGYA 5ECPB 3F9UA 2H73A 2VCQA 4X1UA 1GRXA 1SL2B 4BWQA 1GTAA 5FWGA 1FOVA 4NMUA 2QSIA 3H79A 2LRCA 5IM9A 4P3YB 1NHOA 2GZZA 2BJXA 2XBQA 1VGLA 2N5BA 5KN0A 3QAVA 5IMZA 1DSBA 3ERFA 3TKPA 3MWHA 1EZKA 3G7YA 2HLSA 3UBLA 4FYUA 3KP9A 3M9JA 2PN8A 4K9ZA 1TOFA 2WCIA 5AIXA 4YAVA 3U6VA 4K0GA 4WF5A 2CVBA 5IMAA 1Q4JA 4MF7A 4WR5A 4ZL8A 1TK8B 1G6WA 2YPMA 4F9ZA 2E0QA 3DWVA 3IAM2 4DEJA 2FWEA 5B6NA 4NHWA 3GX0A 3ZMLA 1PL2A 1HNCA 4GXZA 2G2QA 3W8SA 5GAPD 1AAZA 4EC0A 3KIJA 2H1DA 1A8YA 5CRHA 4GLTA 3IBHA 4HI7A 2VM1A 3O6TA 3D6IA 6GSXA 1YF0A 1T4ZA 1JHBA 2WFCA 1OKDA 3GA4A 3NOFA 1U87A 1TRWA 4MA9A 1QMVA 3GSTA 2IWTA 1FVKA 3R2QA 2YCDA 5FHIA 5IMDA 3VI7A 3WGEA 1PA3A 1T1VA 2HRNA 3QD9A 1KBNA 4HU7A 4L8EA 2YNXA 3BJ5A 3L9SA 3KH9A 5DDLA 5KN2A 4JR4A 2P0GA 1AXDA 4G2EA 5KN1A 2PVOC 1K3LA 2PU9C 1DUGA 1WOUA 2CZ2A 5HQPA 3HCZA 2O87A 4KW6A 3K8NA 2B1LA 2I3YA 3C71A 3CSHA 1TDIA 3LXZA 2P5QA 4ZL7A 2V6KA 3H8QA 3VWUA 3E9JB 2OBIA 2B6MA 2YV7A 2NTOA 1B48A 5DJMA 4POKA 1JFUA 4Q5NA 2FNOA 3GKKA 3I6AA 2OACA 2TIRA 3WGDA 1A8LA 5IPGA 3D21A 3QAGA 3KXOA 5J3RA 2LQQA 1IYIA 4IELA 4MLYA 3ZREA 1TK5B 2H8LA 3SWLA 2CA8A 4GQCA 5GSTA 4EDZA 3FK8A 3V1WA 1V9WA 4PUFC 4TR1B 1N2AA 3CSIA 5G1LA 2HI7A 1O81A 3TKSC 3LJRA 1EOHA 4HDEA 2YN1A 4D73B 3TKQA 2M72A 2CV4A 3IA1A 4G9HA 4RUVA 2YZUA 5EY6A 2V6OA 4TXVA 3TRQA 2R2JA 3IRAA 2X8CA 4O92A 4KSOA 3IAS2 1I9DA 4HJ2A 2CAIA 2F8AA 2GVPA 1ILOA 1O6JA 3FR9A 5D9WA 3FW2A 4NV5A 5A4WA 4K8MA 5G1KA 3IC4A 2E2MA 3KGKA 5J9BA 1GLPA 1TJDA 4ZXGA 2KLXA 1X5EA 1GSSA 5DCHA 3KH7A 4EKZA 2H1GA 2BMXA 4HS1A 2C0GA 1ABAA 4XS6A 1K0AA 4MCUA 2DJKA 4OWYA 4ML1A 3TOTA 2X8GA 2LKUA 3IDVA 2K8SA 2J9HA 4MPFA 4XRDA 1OE8A 5F8BA 5J41A 6GSSA 3GKNA 3DYRA 4NHZA 1QQ2A 4MH2A 2LEGA 3US3A 2GGTA 3CSJA 3HY2A 4PNGA 4TR4A 1V57A 1GSEA 3KCMA 3H1NA 2YWMA 3KMNA 4YH2A 2LQOA 1SK2A 1M9BA 3VFIA 3QDNA 2LV3A 2WDUA 4PUAA 3N9JA 4HQZA 4MH3A 1B4QA 3FYGA 2B3SA 4TN8A 5IPHA 4DVCA 1XWGA 2LNTA 4IQAA 1EV9A 3M3MA 2GS3A 2DC5A 3LGCA 5COHA 1IYHA 2F51A 2ZNMA 1X0RA 3E3EA 2REMA 4PNFA 4MF5A 1ZMAA 4ID0A 2H1BA 4KSMA 5CRGA 2VOCA 1RW1A 1EEMA 1MDJA 3GTUB 2GSTA 1XFLA 1WWJA 4TRXA 3GHAA 3Q6OA 3F3QA 2FD3A 1EOGA 1BAYA 3DKSA 4O7HA 4ECIA 2A2SA 3F4RA 3MSZA 5G2ZA 2DJ3A 4WF4A 1TK0B 2OADA 3J7Yb 2H30A 3GH9A 3GSSA 4WR4A 2L5OA 3VURA 5CREA 2F3MA 4N11A 1U88A 2CZ3A 4AF2A 1MD4A 3F8UA 4DSQA 2G0FA 3VPQA 1EEJA 1GSUA 1F3AA 1O73A 5HR2A 2MBTA 5GAND 1TRUA 1TXXA 2LJRA 2RUFA 4K7OA 3M0FA 2AHEA 3I9V2 3QOUA 2C4JA 3F3RA 5H5QA 1ZYEA 4KNDA 1A2LA 2AB6A 3CMIA 3DEXA 4N0VA 1XCCA 1K0DA 5G5FA 3DD3A 3TJBA 3HJOA 1OC3A 3MAKA 3UIWA 1A2JA 3Q74A 4FO5A 2ON7A 4POMA 4CW9A 2X8HA 2V41A 3H4KA 3LYPA 2MMAA 2AV4A 5IOWA 1ACVA 1EP8A 1F9MA 1E6BA 4AJ7A 1XVQA 3A2XA 1R4WA 5ELAA 1X9SB 1PMTA 2HFDA 4LMWA 3QFBC 3A2WA 5A5KA 2VD1A 1TTZA 5E59A 1QGVA 2M80A 5ECQB 1V2AA 3KTBA 1NW2A 1YY7A 6GSWA 4EE0A 5H5RA 3PR8A 5IOXA 4K0NA 2E2GA 5B8BA 1XOBA 13GSA 1T4YA 2VLTA 2TRCP 4V2MA 2FCHA 1CQHA 3RAZA 1ZOFA 1SJIA 2H1AA 4FYCA 5JWRB 4Z7XA 3HA9A 5ECRB 2CX4A 5B7CA 5D73A 3UJ1A 1MDKA 3GURA 2GTUA 2NDOA 4L5OA 1W89A 2KHPA 2YP6A 2I1UA 1VF2A 2B5EA 4MPGA 1NSWA 3TKSE 2V1MA 3HZ8A 1ZCPA 3CRUA 3KMOA 1SENA 2IMKA 5LD0A 4RQRA 2PMTA 4K7NA 3KD0A 2L4QA 4BPYA 5DBQA 4IP6A 1GWCA 3GL3A 4MJAA 3G7IA 1X9MB 1VF4A 4K2DA 3P90A 5DQYA 2N5AA 4F2IA 4MJEA 2IFQA 3VWVA 2C1YA 5H5SA 1HYUA 3TGZA 5EL8A 3F4SA 4OFNA 1R26A 4MK3A 2WZ9A 3ED3A 2K8VA 2TRXA 5HR1A 1URMA 3QPMA 4JE1A 1Z5YE 3G7JA 4RI6A 2RM6A 4EDYA 1JZDA 1O8WA 3EU4A 3APOA 1DE1A 2WB9A 3LEFA 2M46A 4WBJA 2LJKA 1V58A 4F0CA 1KEBA 1PD21 1YZXA 1XPVA 1OC8A 2DJ2A 2IPAA 3EURA 5DAKA 4ZB6A 3ZFBA 4TR3A 1GLQA 2H01A 1K0BA 3P2AA 4G19A 3GYKA 2RM5A 3TJGA 1GTBA 3P7XA 3IV4A 1VF1A 1TI3A 4HJMA 1Y25A 2H76A 3TOUA 1GP1A 4HQSA 1Z7RA 4YQVA 2IMEA 2KP1A 1MD3A 1NM3A 4OCFA 5HFGA 4KUNA 4LLRA 4MMMA 1DBYA 1SKRB 4N0ZA 3IE3A 2VCXA 2VLVA 5F05A 4BA7A 3GIXA 1K0NA 2ALBA 3F6FA 1T7PB 5ID2A 4WKWA 2HZEB 2ON5A 1SU9A 1V40A 1TW9A 2GQKA 2F9SA 3LXTA 2VL2A 3DRNA 10GSA 2C0FA 1T3BA 2O85A 2HXKA 4GRFA 2LSTA 1TI1A 4JRRA 5B8AA 1A24A 2RLIA 4TW5A 2B5YA 1C72A 17GSA 5ECIB 4X43A 1GSDA 1FO5A 2GSRA 4DSSA 1B9YC 3ZVJD 1X9WB 1KNGA 4G10A 5F07A 3ZLPA 5G5EA 2FA4A 2C3NA 2CAQA 1Z9HA 2YV9A 3BD2A 1YKAA 3AY8A 2XC2A 1TU8A 1HQOA 1BJXA 1M9AA 2H70A 2I9HA 1XW6A 2FWHA 2HSHA 1JZOA 2ZCTA 3SBCA 2GZPA 1Z6NA 2VL9A 3KEBA 4I5QA 1SK0A 4OD7A 4MZCA 3EC3A 3ERWA 3WYWA 4ECBA 4N30A 2JL4A 4RQXA 2IIYA 2HT9A 1MDIA 2HRFA 4QL9A 2LRNA 3GUSA 3GH6A 2YJHA 4XIHA 3HYPA 4J56E 1VF3A 1WIKA 5DALB 1K0OA 3ME7A 2RUEA 4MABA 4JEDA 5EPFA 1W4VA 2GT6A 2LUSA 4ML6A 3L9VA 3N5OA 4MP4A 4BL7A 3C7MA 5INYA 3L0HA 3EMPA 5KEJA 1OC9A 5ABRA 4XCSA 2WRTA 2J23A 2JZTA 19GSA 2PBJA 4HEA2 1XWBA 2CVDA 3G9BA 3ZL5A 4AGSA 4TXOA 2OJLA 3RHBA 1FB0A 2IL3A 4K6XA 1A2MA 1AW9A 1JLVA 2LS5A 1Z7PA 3DVXA 5C00A 5J5NA 2VCZA 3LFLA 2KP2A 3RBTA 1GULA 2DMMA 3FEUA 3NIVA 1T00A 3HJPA 1GSQA 2EC4A 5IQYA 2GZYA 2R6KA 5KN3A 4MJCA 4F82A 2WULA 3TKSA 1RQMA 4V2LA 2GSQA 2XHFA 2JACA 4XHMA 4TR1A 3M8NA 1THOA 1QK8A 4HZ4A 4MF6A 3HD5A 4TVEA 3ZTLA 1MEKA 2OKAA 4IBPA 1GTUA 1E2YA 4KAEA 4OFMA 1UN2A 4O32A 1PGTA 1UC7A 1JZRA 2JZRA 1F2EA 2KUCA 4K7IA 4ULXA 5B6MA 6GSYA 2IMIA 4CHSA 1A23A 3E0UA 2H0IA 7GSSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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