1ON4A

Solution structure of soluble domain of sco1 from bacillus subtilis
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
174
structure length
174
Chain Sequence
HMLEIKDPLNYEVEPFTFQNQDGKNVSLESLKGEVWLADFIFTNCETICPPMTAHMTDLQKKLKAENIDVRIISFSVDPENDKPKQLKKFAANYPLSFDNWDFLTGYSQSEIEEFALKSFKAIVKKPEGEDQVIHQSSFYLVGPDGKVLKDYNGVENTPYDDIISDVKSASTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of Sco1: A Thioredoxin-like Protein Involved in Cytochrome c Oxidase Assembly
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Bacillus subtilis
molecule keywords Sco1
total genus 51
structure length 174
sequence length 174
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1on4A00
3F4SA 3MWHA 2AV4A 3QAVA 5JCWA 3IA1A 4IP1A 1KBNA 4KDXA 1TDIA 3C8EA 5IPGA 4IELA 4V1Ap 1PL1A 4IQ1A 3TCOA 3CRUA 4IBPA 4PUFC 2R6KA 4ZB9A 1XXUA 1MD4A 4IGJA 2MMZA 5JWQB 2IFQA 1SYRA 1GNWA 3GA4A 1DSBA 3PR8A 2VCVA 3GIXA 3EURA 1XOAA 1X9WB 5CREA 2N5AA 3GKNA 4KDUA 1T4ZA 1NSWA 2IPAA 2KP1A 2DJJA 2MMNA 4HZ2A 3KZQA 2H6YA 3CYNA 2OA7A 1SD8A 2HT9A 3QCPA 2EIRA 1SL1B 3GL3A 3VFIA 4G2EA 3GSSA 2CT6A 2WB9A 4ULXA 2H1AA 1U87A 5DJLA 1YEPA 5B6NA 1WOUA 2VL2A 3L0HA 5ECIB 1AUCA 2CX4A 1Z5YE 3EC3A 2DBCA 1XW5A 2DJ2A 4N0ZA 2JZSA 1SK0A 1WRYA 3TJJA 3GHAA 1Y25A 1M9AA 2VD1A 4PUAA 1ERVA 4HOJA 1TTZA 2J9HA 3IDVA 4YAPA 1EP7A 1BAYA 3C7MA 1BX9A 3ZYWA 3ZLPA 1LU4A 3KXOA 4YQVA 12GSA 3GH9A 2JADA 1Z7PA 1EGRA 6GSTA 3FY7A 5DCHA 3IAM2 2XPDA 5A5KA 4ZBDA 4IJIA 4MJAA 3FYGA 3R2QA 1DUGA 5ECHB 1AAZA 3EU3A 4HQZA 1T4YA 2B5YA 1X5CA 2LTKA 1ST9A 3GX0A 1X9MB 3V1WA 3KTBA 1BG5A 4ACSA 2PUKC 2LUSA 1OYJA 1JZRA 1V40A 4LMWA 2FA8A 1QUWA 3VWWA 5G1KA 2X8HA 1GULA 1RK4A 2M46A 2E7PA 5CRWA 2VM1A 1EOHA 3TOTA 1FHEA 3GH6A 3IOSA 2DMLA 3ERWA 3IHQA 1M2DA 4XS6A 2RM6A 6GSYA 1ERTA 1S3AA 3CTGA 1G7OA 3E0UA 3HDCA 4JR4A 3APQA 5HFGA 1GTAA 1AIUA 1B4PA 1ZMAA 4L0WA 1UN2A 4POBA 2M72A 3DWVA 2V6OA 4MH2A 4MF6A 1V98A 1GSSA 3RDWA 2B6MA 3IRAA 1KNGA 1YKAA 3QD9A 4Z7XA 5L71A 2GZYA 4OO4A 4O7HA 2N5FA 5G1LA 4LMVA 3C1SA 3DVWA 1KTEA 4IHUA 1DE1A 4K6XA 4MJEA 3KEBA 2I81A 3WD6A 4TW5A 5G30A 2RUEA 5CRHA 5KN3A 4KSOA 1S3DA 1VF3A 3CXGA 2PU9C 5A4UA 1Z6MA 4RUVA 2H1BA 2GQLA 3ME8A 4KH7A 4WETA 1JZOA 3I69A 3TRPA 4RI6A 4N11A 3FZAA 5D9VA 4MABA 10GSA 2FWFA 1TRVA 14GSA 1AC1A 4LA1A 3GX8A 2H30A 4ZL8A 5D8IA 2R37A 3RAZA 1X5DA 3KD0A 4KE3A 1XFLA 1EV9A 3HZ8A 3L9UA 2ON5A 3ZVJA 4MZWA 2WRTA 1MDJA 1MD3A 1VF2A 4O32A 2L5OA 5D73A 3WGDA 4I2UA 4N10A 2FA4A 2OE0A 2IFQB 4IS0A 3F4TA 1TJDA 3VLNA 4MCUA 4AF2A 1QQ2A 3KTLA 4GF0A 1A0RP 2K8SA 2H0GA 4JU5A 5EVOA 1HNAA 4WEYA 4IW9A 4EO3A 3DVXA 3TGZA 4EKZA 2K18A 1F37A 1AQVA 1FAAA 1AW9A 3LQ7A 5J3RA 4ZILA 4HQSA 2P5QA 4L5OA 1TW9A 1O6JA 1JHBA 2O85A 1I5GA 3G7JA 4OFNA 1BQ7A 1TP9A 2DJ1A 8GSSA 4KCAA 3MSZA 2IMEA 5ECSA 1M2BA 2DJKA 4F2IA 2H71A 2H6XA 3C71A 5ELAA 2YJHA 2H19A 4PQ1A 1THXA 4JZQA 1F6MC 4F82A 2P31A 2XBIA 3D5JA 1YF1A 3PGTA 3D6IA 2REMA 3S9FA 1F9MA 4J57E 3KH9A 1GLPA 2L5LA 1OC3A 3W6GA 1XCCA 4NV2A 3TKSC 2GZZA 1C72A 1XWKA 3HZ4A 2OBKA 1ERUA 2H74A 1VGLA 1A2JA 3VWVA 5G31A 2MMAA 2KP2A 2XPEA 3LEFA 1HQOA 3GNJA 4E8EA 1NW2A 4HZ4A 2HFDA 4K2DA 3LXTA 3VWUA 1V58A 2B1LA 1SL2B 6GSUA 1A8LA 4TXOB 3FZ4A 1GSDA 2DJ0A 2H01A 3IXRA 1GSEA 1H75A 3ZITA 5HR2A 1K0DA 5IMVA 4IKHA 4P3YB 3VPQA 4F0BA 2M80A 3H93A 2WDUA 3BBYA 2OE3A 2K6VA 3IV4A 1O81A 4NPBA 4FO5A 4MMMA 1RQMA 2OKAA 1EEJA 2JACA 2PVQA 1G6WA 2VL3A 1XW9A 2DIYA 4AJ6A 4TKYA 3QDNA 3GV1A 4ML1A 1O8WA 4BWSA 1K0BA 1XWCA 3MNGA 3I43A 1PD21 1GUMA 4QL7A 3G9BA 5CRGA 1J9BA 1WJKA 1OAZA 1EEMA 2OE1A 4XS1A 2H72A 2X8CA 2A2RA 2GVPA 3LWAA 7GSSA 2VL2C 2DLXA 3UOMA 3TKPA 2VUPA 2LRNA 2E0QA 2DC5A 3W8SA 1Z9HA 2KLXA 1PMTA 1J0FA 5CNWA 5IOXA 3FK8A 3GL5A 2OJLA 3LXZA 2XBQA 3L4NA 3D21A 3O76A 4NHZA 5F0GA 3D4TA 1V57A 4OFTA 2KHPA 4TRXA 3UAPA 4EL1A 5HFIA 3LORA 2I3YA 2C0DA 1YZXA 2CQ9A 1XWAA 1Z3EA 4EC0A 2PMTA 1GSYA 3LYPA 5H5SA 2I4AA 2VM2A 1K0AA 3RPPA 2ALBA 4WBRD 5DQYA 2FGXA 2AAWA 1A8YA 1XOBA 2YN1A 5C00A 4PQIA 3Q18A 3ERFA 2HSHA 3US3A 1CQHA 3FKFA 5DAKB 4HEA2 4KGIA 3ED3A 2LRCA 5HFKA 4XCSA 2DIZA 3F4RA 1B48A 2RM5A 3BD2A 4MJBA 2JZTA 3H1NA 3HVSA 5ECRB 1ZYEA 2LV3A 4F0CA 1O7UA 1PN9A 2C4JA 5ECQB 1GRXA 3SWLA 4NAXA 3EVIA 2LKUA 4ISDA 2JZRA 2RIIA 3M9JA 4GQFA 2MMOA 2R3XA 2R2JA 3CSIA 1XW6A 3FR3A 2GSQA 3GUSA 3VK9A 4ZXGA 2GLRA 1SJZA 1HD2A 4GCIA 1WE0A 4KX4A 3LGCA 1T3BA 1SK2A 2CVKA 4TR3A 4AGSA 2EIQA 1E6BA 2R4VA 3RHCA 2VCZA 4ID0A 1B4QA 2I9HA 4ZB8A 2LQOA 4RQRA 3FZ9A 4NXIA 4D73A 2F9SA 5D9XA 5ECNB 4XIHA 2VCXA 3EMXA 2GQKA 1YY7A 2V41A 5KEJA 2L57A 2CAIA 2TRCP 4G10A 3IPZA 3FRCA 3DGQA 1UVZA 4J56E 4DSSA 1YEXA 2FWHA 1M2AA 2ES7A 3VWXA 3EYTA 1LJRA 1OVNA 4HU7A 3TJKA 1K3OA 2EIOA 4YQMA 1K0NA 2YPMA 3SBCA 2FCHA 5FWGA 1U6TA 2HSYA 2VOCA 1FOVA 4TXOA 2D2ZA 1MEKA 1NM3A 2H8LA 4HJ2A 2LS5A 4N0VA 1MDIA 4BA7A 4POKA 5IPHA 4DEJA 1AQWA 5G5FA 5GSSA 2VL9A 4NMUA 4TR4A 2YP6A 4BL7A 4TR1B 4TVEA 4KUNA 4K0NA 3F63A 5JCGA 2GSRA 2RLIA 2YWMA 2IMDA 2F3MA 1G0TA 5GSTA 4EXJA 4LLRA 4LL4B 3QR6A 2XHFA 4KB3A 3CSJA 5AGYA 5ECOB 1Z7RA 4V2LA 2L4QA 5KN2A 2QC7A 3GRXA 4CDOA 3Q74A 4XHMA 3HXSA 4IP6A 1FVKA 1R4WA 3TKRA 3HVVA 3Q19A 4OD7A 3DRNA 3DMLA 2WGRA 1SKWB 3DD3A 1PSQA 3DXBA 4Q5FA 3A2XA 2IWTA 2PGTA 22GSA 4MZCA 3TKSE 3A5WA 4XTSA 3J7Yk 2FUG2 1BJXA 5HR0A 3D22A 2HRFA 3HJMA 1USBA 1Y6EA 1DE2A 2PERA 1TRUA 4GWRA 3QAGA 5J5NA 4POLA 3UARA 1PRXA 5IQYA 2BTOT 1M99A 4G19A 1K0CA 1YQ1A 4I6XA 1TU8A 3ISOA 1X0RA 4F9ZA 1CQGA 4WF5A 5LCZA 3UMAA 3F9UA 3TJFA 1QGVA 1O8XA 4MA9A 2CVDA 4O5RA 4GQCA 2G2QA 4E8HA 3GTUA 2E2MA 5IIZA 1I9DA 1GL8A 3IK7A 1YDKA 2O7KA 2I1UA 1R26A 1GTBA 4O92A 3I9V2 4WF4A 4YAVA 1SJIA 1FB6A 3F0IA 1OKTA 1YF0A 1G7EA 4OFMA 3LSZA 3TDGA 1K0OA 2C8UA 1XBSA 4ZIJA 2GGTA 1V9WA 3UIWA 5DAKA 4I5QA 4MDCA 4EDZA 3GKMA 2LJKA 2B7JA 3UJ1A 1GSFA 3L9VA 2GS3A 3GN3A 3H4KA 3PINA 2CA8A 4GTUA 4I97A 1SJ6A 1ZCPA 3H8QA 4TXVA 2VCWA 1PX6A 3ZMKA 4EE0A 1MDKA 3UBKA 2B5EA 3K8NA 2OBIA 2IIYA 1QFNA 4K7OA 5D9TA 5FHIA 1EWXA 4JE1A 4POMA 4RQXA 2LNSA 4ZL9A 4BVYA 3TUEA 2YCDA 2AUVA 2VO4A 3O3TA 1FO5A 2PWJA 2WJUA 1T7PB 5F8BA 3ZREA 1ZOFA 3CRTA 3KGKA 3GSTA 2DMMA 3M8NA 4FYCA 4Q5QA 1NHOA 4X1UA 1GSQA 3ZFBA 3IBHA 5ID2B 1S3CA 1R5AA 3H79A 4QL9A 2TIRA 2HE3A 1LBKA 6GSSA 2YANA 3GKKA 4D73B 3M1GA 3O6TA 2YWNA 1E2YA 4OCFA 1M7TA 3ZZXA 1WPIA 1PQNA 3CMIA 11GSA 3EU4A 4WR5A 5C04A 3ZFLA 2GT6A 4DSSB 3P2AA 3I6AA 2YWOA 2ON7A 4TR0A 4FYBA 3UEMA 3HYPA 4ZBBA 1F3AA 4HDEA 1GSUA 1HNCA 1GUHA 2HLSA 2WZ9A 2DSAA 1QMVA 5EL8A 4IJ3A 2OADA 1XWGA 4K9ZA 3UBLA 2YWIA 5DJMA 5F05A 5KN1A 1K3LA 2VD0A 5ELGA 3CTFA 2NVLA 1GP1A 5DDLA 1FG4A 3LFLA 2L6DA 2IMKA 4OO5A 1TOFA 5HR3A 2AJQB 5H5QA 1HYUA 4V1Ag 2K8VA 5J41A 1GTUA 5FT3A 4MH3A 3DKSA 5J9BA 2QKEA 2LEGA 5DBQA 4OCEA 4ZB6A 4TR1A 3ERGA 3BCIA 1GNEA 3TKQA 3GFKA 2X8GA 2QSIA 2H1GA 3VI5A 5INYA 4H86A 1WMJA 3MDKA 4MPFA 3DIEA 4X0XA 1SL0B 6GSVA 4BWQA 4GSTA 1B8XA 1GWCA 3IAS2 1XWBA 5IMAA 3F3RA 4K1FA 4K7NA 2V32A 4HJMA 1G6YA 1H4OA 5G5EA 3KH7A 2H6ZA 3Q6OA 2B3SA 2P0GA 3N9JA 4HI7A 2DJ3A 5D93A 2KOKA 4GLTA 5CP1A 3BOAA 1NHYA 1U88A 2CV4A 2LJAA 1TKDB 2VCTA 3APOA 4GSNA 3A2WA 3F8UA 3QFAC 3ZTLA 2WFCA 2HZFA 2CZ2A 2L59A 3TKSA 5E59A 5ECPB 1K0MA 3APSA 5JCUA 3IR4A 4KAEA 3GTUB 3EMPA 3WT1A 1ML6A 1Q4JA 1OC8A 1V2AA 2VCQA 4MPGA 4ILFA 4TOPA 2HNLA 4WKWA 5KN0A 4FYUA 5GAPD 2EC4A 3TJBA 3LG6A 1EP8A 1N8JA 5CYYA 3QPMA 2ZNMA 1SD9A 4EUYA 1YJ6A 3P90A 4JBBA 20GSA 2AB6A 3FW2A 4LL1B 1R5PA 4J2FA 2V6KA 3NOFA 3TJGA 2L6CA 1WP0A 2X64A 3FHKA 5DVBA 2JSYA 4V2MA 1THOA 3LYKA 1OC9A 3KMOA 3KMNA 2C3QA 2H1DA 2YJ7A 1JFUA 2C0EA 5HQPA 2GDRA 5B6MA 3U6VA 4AJ7A 3U5RE 1JZWA 4PX1A 4PGTA 4JRRA 1PA3A 1A0FA 5F06A 3FR6A 1JLWA 3ZIVA 3CSHA 4BVXA 4HS1A 2LNTA 1T8EB 3LJRA 3VURA 1IYHA 16GSA 3HJPA 2VAFA 4KCEA 4MJCA 2AYTA 3WGEA 3EE2A 3ZL5A 5ID2A 3RPNA 2C0GA 3EWLA 3P8WA 4N30A 5DCGA 1AQXA 2FWEA 2MBSA 3GYKA 2HRNA 2C3NA 3GMFA 4MF5A 4ML6A 3KP8A 4ECBA 2HZEA 3C73A 2FWGA 4K0GA 4Q5RA 1DBYA 5JWOB 6GSWA 4JR6A 1ZYQB 2HXKA 2IMIA 2GT5A 1EZKA 4ECIA 2PPTA 2FLSA 3UL3A 1X9SB 3HKRA 3WYWA 2WCIA 2GQMA 1U3IA 1ABAA 2PVOC 3JCML 3UVHA 2B1KA 2JL4A 3A2VA 3HA9A 2BMXA 5GZZB 4I2TA 5JWRB 3E9JB 3QMXA 2F8AA 3ZVJD 1TXXA 1U3AA 4MZBA 18GSA 4MK3A 3N5OA 1X5EA 2CZ3A 2BJXA 2H76A 2H0HA 1ON4A 4F03A 4FH8A 3E3EA 5B7CA 5CO3A 3IE3A 4YQUA 1ZZYA 2A4VA 2VLVA 1TRWA 5DQSA 4JEDA 3PH9A 1XVWA 5IMZA 2F51A 1FVJA 13GSA 2RUFA 4KNDA 5F07A 4EF0A 2N5BA 4ECCA 4L8EA 3D0ZA 3C1RA 1IYIA 4DVCA 3QOUA 3GKXA 3WT2A 3W8JA 4Q5NA 3BJ5A 2V1MA 1T00A 2CX3A 4XS4B 2MYGA 2L4CA 1KEBA 3KCMA 1XVQA 2PBJA 1HNBA 1EOGA 4YH2A 1FB0A 4AJ8A 4L5LA 1PL2A 5D96A 2VLUA 2JSZA 1GTIA 2QGVA 2PN8A 3VI7A 1XZOA 1PKWA 3L9SA 5B8AA 4ECJA 3P7XA 3F6FA 5DALA 2C80A 3IC4A 1SK1A 2XC2A 5D9WA 5A4WA 3M0FA 1OKDA 1TRSA 5AIVA 4PXOA 2O87A 3KM6A 2H0IA 5B8BA 5IMDA 1M0UA 2FY6A 1QXHA 2LQQA 2FD3A 6GSXA 2WS2A 2C0FA 2VIMA 5IOWA 2MZCA 4EDYA 4L0UA 1OE7A 3TB2A 5J9CA 4MF7A 4K7IA 4BPYA 5EPFA 4PURA 5EY6A 3DEXA 1Q98A 1RW1A 3RHBA 1TU7A 5ECLB 2FNOA 3IK9A 2GTUA 4XRDA 2GZPA 1TK0B 4IQAA 2R5GA 2HI7A 1OE8A 4CHSA 2O89A 2O8VB 3NZNA 3TOUA 4WXTA 2NBSA 1OC9B 1SKSB 4MLYA 1VF1A 5LNKe 4QQ7A 3G7IA 1GH2A 2YV9A 1B9XC 1W89A 4GRFA 4NHWA 5AISA 2YNXA 1PX7A 2VLTA 1SENA 2AHEA 3F6DA 2IMFA 1SU9A 4CW9A 1BEDA 1B9YC 1XPVA 1ACVA 1BYEA 1TI3A 1PGTA 1JLVA 3FEUA 1ZGNA 19GSA 1JZDA 3ZRDA 5ENUA 1GUKA 4RI7A 4ZBAA 4FIWA 4IN0A 5GAND 4DSQA 3OR5A 2YZHA 1AXDA 3L78A 1T1VA 1Z6NA 17GSA 2HZEB 4XRAA 3WGXA 3TRXA 1O85A 5ABRA 2G0FA 3TRQA 1WWJA 1A2LA 1VRSD 3KP9A 4DSRA 1O73A 4PNFA 2A2SA 5AN1A 3KIJA 1A2MA 2F8FA 1F2EA 1SYXA 3J7Yb 2NPBA 1VF4A 1W4VA 2H70A 4HU9A 4WBJA 3G7YA 2GSSA 4NV5A 4GXZA 3RBTA 1YKCA 5LD0A 2B7KA 1ZL9A 4KSMA 3EINA 4I8BA 2JU5A 2LJRA 1N2AA 4ZL7A 2ZUPA 4OMVA 5H5RA 3HVXA 1TI1A 2ZCTA 2NTOA 2YOIA 5E4WA 1A23A 1R7HA 1URMA 4IVFA 5AIXA 4V2NA 1K3YA 2HYXA 2NDOA 2LRTA 3M9KA 3A3TA 5IMFA 3HD5A 1XIYA 2WULA 1ERWA 2H66A 1SKRB 5IM9A 4TN8A 5IO2A 2C1YA 5HR1A 4EVMA 2FHEA 3CBUA 9GSSA 5J4UA 3QAWA 4NWYA 2V2GA 3GURA 1GLQA 3NIVA 3HCZA 5IO0A 5ECMB 2B5XA 3DYRA 4PQHA 2GSTA 2LSTA 3AY8A 4X43A 1M9BA 3HHVA 1UA5A 1PKZA 4G9HA 1F3BA 4GSSA 3BCKA 1FW1A 1MTCA 3ZMLA 3VPTA 3D4MA 3KJYA 2J23A 1TK5B 3FR9A 2IJYA 3M3MA 4XS4A 3FZ5A 3MAKA 1UC7A 4HUAA 2CAQA 5G2ZA 5A4VA 4MP4A 5IMCA 2E2GA 2P5RA 2H75A 4KW6A 2KUCA 2K9FA 2TRXA 1A24A 3HJOA 2IL3A 3F3QA 5DALB 3ZIJA 2YZUA 4PNGA 1J08A 4K8MA 4WR4A 5ECKB 2OACA 1ILOA 4KA0A 2YV7A 4OWYA 5CRDA 1QK8A 2Z9SA 2H73A 1WIKA 1EGOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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