1ON4A

Solution structure of soluble domain of sco1 from bacillus subtilis
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
174
structure length
174
Chain Sequence
HMLEIKDPLNYEVEPFTFQNQDGKNVSLESLKGEVWLADFIFTNCETICPPMTAHMTDLQKKLKAENIDVRIISFSVDPENDKPKQLKKFAANYPLSFDNWDFLTGYSQSEIEEFALKSFKAIVKKPEGEDQVIHQSSFYLVGPDGKVLKDYNGVENTPYDDIISDVKSASTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords Sco1
publication title Solution Structure of Sco1: A Thioredoxin-like Protein Involved in Cytochrome c Oxidase Assembly
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 51
structure length 174
sequence length 174
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1on4A00
5ECIB 3GA4A 3CYNA 1MDJA 2YWIA 3O76A 1PGTA 4F9ZA 2C3QA 1USBA 2LKUA 1YKAA 2IPAA 3LYKA 1HNBA 4GSTA 4FIWA 3L9UA 1Z3EA 3APSA 1A0FA 2VUPA 3UOMA 5EPFA 5CO3A 5G2ZA 4TR3A 5EVOA 2VCVA 5G30A 2OA7A 1XXUA 3RHBA 6GSTA 2PWJA 1LBKA 5GAPD 4BVYA 2FGXA 5AIXA 4KSOA 3EE2A 4OD7A 4CDOA 1E6BA 1O6JA 3VFIA 5CYYA 3RPNA 1XFLA 2N5AA 5J41A 1PKZA 3BOAA 3MDKA 4AF2A 4D73A 1PD21 1PA3A 5HR2A 2GQMA 2VL3A 2HSYA 3KD0A 4POMA 1SYRA 2PPTA 4MK3A 2IL3A 2LRNA 2OJLA 2V6KA 1B9YC 2LEGA 1XOAA 4AJ6A 2K18A 3QPMA 2FWGA 1TOFA 1OVNA 2PGTA 3GKMA 5GSTA 3DWVA 4NPBA 2CZ3A 3EMPA 4F03A 2GT5A 3TGZA 3UL3A 1VF2A 1F9MA 2OADA 2H0IA 5ELGA 1SJ6A 2KP2A 1TI3A 4WBJA 1GRXA 1GWCA 3CXGA 2FWHA 1T4YA 4FO5A 2LTKA 4PGTA 2DIYA 5GAND 2TRXA 1JZDA 4BWSA 1GULA 3F4RA 2IMKA 1GP1A 2V32A 1G0TA 2GS3A 2CA8A 3Q19A 2L5OA 2V2GA 4GSNA 2B7JA 4KDXA 4H86A 1O8WA 5LD0A 3VLNA 1R26A 1GNWA 1NHOA 3HVVA 8GSSA 2H0HA 4ECJA 3PR8A 3F4TA 1K0AA 2R3XA 3QMXA 3VPTA 3KTLA 3HYPA 1OC9B 1K0CA 1SKSB 3A2XA 1GSEA 1NW2A 3HKRA 2LS5A 2NPBA 1SKRB 2LQQA 4ULXA 3F6FA 4L8EA 3G7IA 4DSSB 4HU9A 4F0CA 4EE0A 1DE1A 3UIWA 4IKHA 3APOA 1TXXA 2H73A 2XPEA 3IR4A 3VWVA 4BL7A 1UA5A 2YJHA 3UAPA 5IO0A 3VWXA 4EKZA 1M0UA 2YV9A 3NIVA 4MJAA 1PMTA 3GN3A 2JU5A 5CREA 2AUVA 5CAXA 1GLPA 4OFTA 4KX4A 5L71A 3HZ4A 3EURA 4IJ3A 3GRXA 4KDYA 5IMFA 5IMDA 3KTBA 3KXOA 3WT1A 1U6TA 4IW9A 4NMUA 3D22A 3FYGA 2J23A 1B8XA 5AGYA 1TU7A 3QDNA 2LQOA 4O92A 3TUEA 2LRCA 4MF5A 3V1WA 1F2EA 2O7KA 1WPIA 2WFCA 5KN3A 3WD6A 3TKQA 1N8JA 2LJKA 3UARA 3TJKA 4JRRA 4GQFA 1YDKA 5IOWA 2IMEA 1DUGA 1Q98A 3VURA 2CV4A 4K8MA 1TRUA 2MMNA 4GF0A 3QAGA 3SBCA 1VF4A 2H01A 2CQ9A 3IAS2 2C0GA 2L6DA 2I81A 4I2UA 2CX3A 1PX7A 2JACA 2WRTA 2KLXA 4ECCA 5ECOB 2VD0A 2E7PA 2FWEA 1GTAA 12GSA 2YCDA 3KZQA 5AN1A 2TRCP 2DBCA 2HNLA 1SK2A 4AJ7A 3KIJA 3E0UA 1G7EA 3ME7A 1OC9A 3P8WA 1GUHA 5B6NA 3TB2A 1SD8A 3K8NA 4OFNA 3ZIVA 13GSA 3IPZA 1XVQA 2I9HA 5JCUA 5J5NA 1MD4A 3LORA 2AV4A 2K8SA 1A2JA 3LGCA 4X0XA 1YZXA 3LSZA 1FW1A 4XIHA 2PMTA 1MTCA 5IOXA 2C0DA 4I8BA 4EF0A 4GTUA 2X8GA 3EINA 1XW9A 3N5OA 2HRFA 5A4WA 3I9V2 5J4UA 1CQGA 2LNSA 1X5DA 5D96A 5DBQA 2C80A 4EDYA 3IE3A 1PX6A 2ON5A 1TW9A 3EC3A 4PURA 5DQYA 4N11A 3GH6A 3N9JA 3ZZXA 1VGLA 3PH9A 2HZEA 2NTOA 1PSQA 2X8HA 4PQIA 4FYCA 5F0GA 1SK0A 5G5EA 1XVWA 2LSTA 18GSA 3QD9A 3ZYWA 1K0OA 4MABA 3L9SA 6GSUA 4YAVA 3KP8A 3D4MA 1WJKA 3H79A 3QR6A 2H6YA 5IPGA 4ZBDA 4TRXA 3WGXA 4ZXGA 1OKDA 2VLVA 4PUFC 1S3DA 2I4AA 5B7CA 3WGEA 2OBIA 3L78A 5ECSA 2DJ1A 3CSJA 2JZTA 1ILOA 2KHPA 2KUCA 1YJ6A 2RUEA 4OO5A 4DSRA 4MPFA 3FHKA 4BVXA 1MDIA 1I5GA 4I2TA 5B8AA 4TR4A 3UJ1A 1V98A 5ECMB 3WT2A 3ISOA 3DIEA 4K0NA 1K3OA 20GSA 1XWGA 4ZBBA 2O89A 5CRWA 1KTEA 3TRXA 3LG6A 4DSQA 2WGRA 1GTBA 2L4QA 4MZWA 4ID0A 1S3CA 3LXTA 2C0FA 2FWFA 2IMFA 5DAKA 1T1VA 3HA9A 1BEDA 4PX1A 3IHQA 1T7PB 4PXOA 2PVQA 3DD3A 1K0MA 4CHSA 2MMAA 1KNGA 4XTSA 3UEMA 2D2ZA 3EYTA 3IOSA 1A8YA 1XWAA 1EGOA 2HLSA 4ECBA 1AIUA 3TOTA 3LFLA 1K0NA 4FYBA 4WETA 2VL9A 3FEUA 3D0ZA 1YKCA 5INYA 2C0EA 3DMLA 3F8UA 2HFDA 1GSUA 2I1UA 4Q5RA 1QGVA 1XWCA 3GL5A 3P90A 4PUAA 1N2AA 1W89A 2DJKA 2YNXA 4MZBA 5HR3A 1Y6EA 4JR6A 1EZKA 3HXSA 1T4ZA 3IAM2 1FOVA 3LJRA 3RBTA 2H1AA 1XW6A 1BYEA 1FO5A 1EWXA 2GGTA 2HSHA 2H30A 3QAWA 5COHA 5LCZA 2EIOA 1ERWA 1X5EA 4TKYA 1EV4A 1A0RP 2F8FA 2NBSA 3DYRA 2HI7A 2VM1A 3I43A 3CBUA 2E2MA 4ZB6A 1K0DA 1XPVA 22GSA 2F3MA 4Q5FA 1F3BA 1WIKA 2H66A 3P2AA 5IMZA 4QQ7A 2RM5A 3LWAA 19GSA 2NVLA 3G7YA 3GH9A 3C1RA 3ERGA 1XCCA 4KW6A 1BAYA 5FT3A 4BA7A 4LL1B 3QCPA 1ZCPA 6GSWA 1WMJA 5KN2A 2YWMA 5A4UA 3TKSC 3Q74A 2A2RA 1ERUA 3KJYA 2VM2A 4JE1A 2BTOT 1C72A 16GSA 3EU3A 2VCXA 2YANA 1GUMA 4LMWA 2MBSA 4WXTA 2VIMA 4ZL7A 2MMZA 3DRNA 4KDUA 2FD3A 3A3TA 4JEDA 1O8XA 4OCFA 1K3YA 2L5LA 1HNCA 3F63A 1PRXA 2CVDA 7GSSA 2WS2A 1XIYA 4MJBA 2H8LA 3EVIA 3HCZA 5JWQB 1B4PA 4XS1A 2RM6A 2YOIA 1HNAA 2IJYA 3O3TA 1QMVA 2QGVA 5DCGA 1FAAA 3ZL5A 4MA9A 5ENUA 4MMMA 2PU9C 4HUAA 3M1GA 2XBIA 2FNOA 4OCEA 4X43A 4POBA 5ECHB 2F9SA 1KEBA 4WEYA 1PL1A 5GZZB 2B5EA 3HD5A 4MJCA 1Z9HA 3QOUA 4KB3A 1PQNA 2P31A 3WYWA 2LV3A 4JBBA 1TK0B 4RQRA 5E59A 4IJIA 4V1Ag 4GQCA 1YY7A 4K7IA 3BBYA 1SD9A 2E2GA 1OKTA 3U6VA 5DCHA 2I3YA 2RLIA 2CX4A 2V1MA 3VI7A 3Q6OA 4F0BA 5G1LA 2HZFA 1F3AA 1FG4A 5HR1A 1Y25A 3BD2A 1GSFA 5IMCA 5H5SA 4RUVA 2MMOA 4IQ1A 1ON4A 4BWQA 3L4NA 3LYPA 2GZPA 3D21A 2KOKA 1WE0A 1URMA 2HXKA 3FY7A 3UBKA 3C8EA 3I69A 2GZZA 2OBKA 5ECRB 2J9HA 3VPQA 4PNGA 3ZMKA 4IGJA 2R2JA 5CRGA 2B7KA 4TN8A 1G7OA 3F3RA 2AHEA 3KP9A 4I6XA 4POLA 1WOUA 2YWOA 1ERVA 4L0UA 3TOUA 4ZILA 5ECQB 3ZLPA 1EP7A 2OE0A 2VCTA 4K2DA 4K7OA 4ML6A 5IM9A 4K0GA 2DSAA 4G10A 1KBNA 3ZVJA 3GL3A 4HQZA 1TRSA 3ZRDA 2EIQA 3MSZA 2H74A 1OAZA 3J7Yk 4TW5A 2X64A 5EL8A 4MLYA 4ZL9A 2JSYA 3E9JB 4PNFA 2YPMA 2H76A 3PGTA 1ABAA 1A24A 2PERA 5B6MA 4EUYA 1X5CA 6GSXA 5G5FA 6GSYA 3IRAA 2HZEB 3L0HA 3KH9A 1G6YA 4N30A 2O85A 4LLRA 2H0GA 1ZZYA 3F4SA 4YH2A 2PN8A 3PINA 1CQHA 4J56E 4QL9A 3TDGA 4KE3A 2C3NA 1V40A 1AC1A 4Q5QA 2DLXA 3CTGA 3FR3A 1H75A 1TRWA 2G0FA 2VCZA 4LA1A 3KH7A 5E4WA 1DSBA 4K6XA 4MCUA 3AY8A 5ID2A 4MPGA 5F07A 5LNKe 1V9WA 1XZOA 2H71A 9GSSA 2H72A 2ON7A 4TR0A 1SKWB 4GXZA 2DJ0A 2FY6A 2L4CA 3ZTLA 2N5BA 4MH2A 4KGIA 4O7HA 2V41A 5ECNB 2MYGA 2GZYA 4HJ2A 3IDVA 4J2FA 1M2DA 5A5KA 2E0QA 1X9MB 4IP1A 3EMXA 1X9SB 2WDUA 3FZAA 2VL2A 5D73A 4TXVA 5DAKB 4XHMA 3GSSA 2AB6A 1ZMAA 3GKKA 3W8SA 3LXZA 3DGQA 5IPHA 14GSA 4TXOA 2PUKC 3H4KA 3FRCA 2JZRA 3GNJA 1EP8A 1GTUA 2KP1A 2CT6A 1HQOA 3FZ4A 1U3AA 2VL2C 1A2MA 4V1Ap 2H1GA 1GSYA 2GSQA 3M9JA 3GX0A 4L5OA 1ZGNA 1AAZA 4J57E 2FA8A 1THXA 1M2BA 2JZSA 3C7MA 5DDLA 1U88A 5C04A 4XRAA 2RIIA 1AQXA 1M9AA 2WZ9A 3RAZA 1HYUA 2B1KA 3QAVA 4TR1A 1T3BA 1SL2B 1YEXA 4K7NA 3QFAC 1Z6MA 3ERWA 5AIVA 2H70A 2IMIA 1XOBA 3VK9A 3APQA 2FA4A 3IC4A 2LRTA 3UVTA 3RDWA 1RW1A 3C71A 1EOGA 2YJ7A 3GUSA 1DBYA 4ZBAA 11GSA 3GYKA 1JHBA 3G9BA 4XS4A 1O73A 1WRYA 3DVXA 5CNWA 3KMOA 5JWRB 1PN9A 2YZHA 3VWWA 1RK4A 1ZYQB 4V2LA 2DIZA 1QUWA 4DEJA 5J3RA 4YQVA 4IN0A 2ZNMA 2R4VA 4HU7A 4TOPA 2P5RA 1V58A 3MNGA 4MJEA 1XBSA 2GTUA 4ISDA 2A2SA 3M0FA 2AAWA 2GSSA 4NAXA 4WR5A 2H75A 1TTZA 1YF0A 4ZIJA 1M99A 4YQMA 2WB9A 1JFUA 2QSIA 1ST9A 1UVZA 3ZREA 1AQWA 4IHUA 3FZ5A 1Q4JA 1GSQA 2WJUA 3FKFA 4IP6A 1J9BA 1HD2A 3L9VA 2YWNA 3R2QA 4AGSA 1NSWA 1UC7A 4XRDA 3KGKA 1FB0A 3BCKA 4HJMA 4N10A 2JADA 2GSTA 3D4TA 2VO4A 1Z5YE 3IV4A 2M72A 2AYTA 1NM3A 4LMVA 1TKDB 2OKAA 2DMLA 5JWOB 2H1DA 2YP6A 4RQXA 3O6TA 4HI7A 4IQAA 2PVOC 3FR6A 3P7XA 4MP4A 3TRQA 1J08A 1ZL9A 3CMIA 3VI5A 1A2LA 2DJ3A 3CRTA 1IYHA 3TKRA 1V57A 3TKSA 4WR4A 4EC0A 2LJRA 2XC2A 5ECPB 2M46A 1LJRA 4XCSA 1MDKA 2B1LA 2GQLA 1OC3A 1AW9A 4BPYA 1OC8A 3W6GA 1MEKA 1SU9A 4GCIA 2XHFA 5AISA 2A4VA 4CW9A 2MZCA 4KUNA 1BG5A 5D9XA 3GHAA 2VLUA 3CSHA 5D9WA 5HQPA 4MF7A 5G31A 1B4QA 1MD3A 2GQKA 4F82A 4JU5A 4RI7A 3KEBA 3GMFA 1O7UA 4ZL8A 3W8JA 4ZB9A 3HJPA 4POKA 5GSSA 1YQ1A 2LNTA 3IBHA 3RPPA 5FHIA 2DJ2A 3TCOA 2FCHA 1F6MC 1H4OA 4WF4A 3A2VA 4OFMA 1TP9A 3HHVA 1ACVA 5G1KA 3IA1A 4IBPA 2CAQA 2IFQB 1TRVA 2K8VA 1OE7A 2G2QA 4FH8A 3HVXA 4O5RA 5DALA 1JLWA 4OWYA 5IO2A 2K9FA 1S3AA 4YQUA 3M9KA 6GSSA 1QK8A 1AQVA 1V2AA 2IWTA 4HZ2A 2ZCTA 2P5QA 1IYIA 5KEJA 4IS0A 3J7Yb 2C8UA 1XW5A 1VF1A 5H5QA 3GV1A 1M2AA 2CAIA 2HE3A 5D93A 3C73A 1R7HA 3ZITA 3H8QA 5J9CA 1GSDA 2X99A 5IMAA 2XBQA 2YV7A 5EY6A 1T8EB 6GSVA 4MDCA 4WF5A 1BX9A 3UMAA 1GNEA 5DQSA 2C1YA 3ME8A 4NHWA 4JZQA 1TJDA 4WKWA 4OO4A 3GKNA 3GURA 3QFBC 3HJMA 2VCQA 1ML6A 3TKPA 17GSA 3WGDA 5ID2B 1SK1A 4NV2A 3EU4A 1Z7PA 4RI6A 1I9DA 3M3MA 4HOJA 3JCML 4EDZA 3U5RE 1GTIA 3UBLA 2OE3A 1B9XC 3GTUB 3GSTA 1SYXA 2CVKA 2EIRA 1R5AA 1THOA 1RQMA 1SJZA 2YZUA 1ERTA 1FVKA 5B8BA 4N0VA 3ZIJA 1QFNA 3GKXA 3H1NA 3IK7A 2L6CA 2NDOA 2WULA 1M9BA 5C00A 1TK5B 3MWHA 1XWBA 2AJQB 4ACSA 2H6XA 3A5WA 5KN1A 3GIXA 5JCWA 2OE1A 1TK8B 2IFQA 3HVSA 1JLVA 1J0FA 1FVJA 4XS6A 1YEPA 1AXDA 5DJLA 3HDCA 4TVEA 2BJXA 2RUFA 4HQSA 4NXIA 3NZNA 1ZYEA 4KCAA 4P3YB 1XWKA 4TXOB 4EXJA 2F8AA 1E2YA 3US3A 3GX8A 1G6WA 3FK8A 3I6AA 3ZFLA 3MAKA 2WCIA 3TJBA 4KSMA 1PKWA 4MH3A 2VLTA 1B48A 1SJIA 2M80A 1SL0B 2DMMA 5J9BA 3KMNA 4KCEA 4V2MA 4GLTA 1YF1A 2BMXA 4ML1A 3D5JA 1TU8A 2H6ZA 3HZ8A 1U3IA 1TI1A 2QC7A 1NHYA 2LUSA 5D9VA 1T00A 2H1BA 2O8VB 1Z6NA 1EEMA 3DVWA 4TR1B 3FZ9A 4G9HA 4I5QA 3TRPA 3IXRA 1JZWA 2GLRA 4G19A 1SL1B 2HRNA 3TJFA 4GWRA 5KN0A 4IVFA 2R37A 5F8BA 2N5FA 3ED3A 3LQ7A 5D9TA 2FUG2 3S9FA 5CP1A 2C3TA 3HJOA 1BJXA 3GTUA 4XS4B 1EOHA 2ZUPA 3DKSA 2XPDA 1ZOFA 3ZFBA 4PQ1A 4G2EA 2GT6A 5ELAA 1F37A 5IQYA 3BJ5A 4L5LA 4I97A 4GSSA 4HZ4A 1PL2A 3A2WA 4JR4A 5ABRA 4DSSA 4YAPA 3F3QA 2L59A 2X8CA 3FW2A 3H93A 3BCIA 3FR9A 5HR0A 5HFKA 2REMA 4DVCA 2VOCA 5HFIA 3DXBA 4N0ZA 2L57A 5IIZA 2P0GA 1EV9A 4NV5A 5CRHA 1DE2A 3VWUA 1M7TA 2GDRA 4FYUA 4QL7A 1OE8A 5HFGA 3TKSE 2B6MA 1VRSD 3KCMA 1TDIA 1O85A 1O81A 3UVHA 3GFKA 1LU4A 1X9WB 2IN3A 4KA0A 2YN1A 2R5GA 2ALBA 4ILFA 5ECKB 1K3LA 3G7JA 1JZRA 4F2IA 1JZOA 1A23A 2VAFA 1W4VA 3C1SA 3DEXA 2ES7A 4EL1A 5CRDA 1R5PA 2JSZA 4HDEA 5A4VA 1EEJA 3EWLA 3NOFA 3IK9A 1GUKA 2IIYA 5DVBA 4MF6A 3CSIA 1GLQA 5H5RA 2Z9SA 2GVPA 3RHCA 3TJGA 1AUCA 1GH2A 3D6IA 2HYXA 1Z7RA 1QQ2A 2PBJA 2H19A 3ZVJD 4KAEA 4PQHA 4GRFA 2LJAA 3CRUA 5JCGA 1K0BA 1SENA 2FHEA 4KH7A 4HS1A 4V2NA 5D8IA 1OYJA 3CTFA 1A8LA 3SWLA 1WWJA 2DJJA 4E8HA 1EGRA 4Q5NA 2R6KA 2JL4A 1X0RA 3M8NA 4MZCA 3LEFA 3F0IA 1FB6A 4X1UA 5F06A 5F05A 2FLSA 2MBTA 5FWGA 3Q18A 4NHZA 2HT9A 4EO3A 4WBRD 1WP0A 5IMVA 4IELA 4KNDA 4L0WA 4D73B 3OR5A 3F9UA 4AJ8A 4LL4B 2EC4A 4K1FA 2GSRA 3ZMLA 5DJMA 1QXHA 2K6VA 1GSSA 2B3SA 5DALB 2V6OA 4Z7XA 4O32A 1R4WA 4E8EA 1U87A 10GSA 3KM6A 4EVMA 2VCWA 3E3EA 2QKEA 4ECIA 2C4JA 4ZB8A 2OACA 2CVBA 3F6DA 1FHEA 3HY2A 1UN2A 2IMDA 2O87A 1VF3A 2F51A 1BQ7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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