1ON4A

Solution structure of soluble domain of sco1 from bacillus subtilis
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
174
structure length
174
Chain Sequence
HMLEIKDPLNYEVEPFTFQNQDGKNVSLESLKGEVWLADFIFTNCETICPPMTAHMTDLQKKLKAENIDVRIISFSVDPENDKPKQLKKFAANYPLSFDNWDFLTGYSQSEIEEFALKSFKAIVKKPEGEDQVIHQSSFYLVGPDGKVLKDYNGVENTPYDDIISDVKSASTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Sco1
publication title Solution Structure of Sco1: A Thioredoxin-like Protein Involved in Cytochrome c Oxidase Assembly
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Metal binding protein
total genus 51
structure length 174
sequence length 174
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1on4A00
5LCZA 4MK3A 1U3IA 2VL9A 2K18A 4IQAA 1ZCPA 2VO4A 3HYPA 3O3TA 2LJRA 4TKYA 1SKWB 2YNXA 3DVWA 10GSA 4KDYA 4RQRA 1JZRA 1K0BA 3UBLA 5L71A 16GSA 1GSFA 2AAWA 3UVTA 2GQKA 4GSNA 3DGQA 5AISA 2H1GA 2B3SA 2JL4A 2FD3A 2NDOA 4MZWA 2M80A 4AJ7A 4ECIA 4E8HA 4NPBA 2A2RA 1WJKA 4NXIA 2I4AA 4TOPA 3KTLA 3BJ5A 4ILFA 1THXA 3GKMA 3S9FA 5IO2A 1VRSD 2V1MA 5H5RA 3GKNA 4JZQA 4HOJA 4MPGA 4KCEA 3EVIA 5IPGA 3Q18A 1EEJA 3TJJA 4HEA2 2VLTA 2TIRA 4MCUA 4PQIA 1JZOA 1QXHA 5ECRB 1TDIA 1ERTA 1VGLA 2ZCTA 3C7MA 5D9TA 2K9FA 2FY6A 4GF0A 1TRSA 2WCIA 3CSHA 2GVPA 4YAPA 1NHYA 1PKWA 3DRNA 3ZITA 2VCQA 3A5WA 1B8XA 2PVOC 1TK0B 3NIVA 2LQQA 1ABAA 4XCSA 3Q6OA 4L5OA 2HRNA 5ENUA 3ZIVA 2H66A 3L9UA 4LL4B 4IVFA 2GTUA 1DE2A 1U3AA 1G7OA 3EU4A 3D6IA 5IOWA 5ECIB 6GSUA 2MMAA 1BYEA 4F03A 5FT3A 3TJBA 3ZL5A 5A4WA 5E59A 2TRXA 5B6NA 2OKAA 2H74A 3HVSA 1MTCA 3GH6A 2FNOA 4YAVA 2YWOA 1DE1A 1AC1A 2R37A 2VOCA 1YQ1A 5IMCA 3GMFA 4WETA 1U87A 5B8AA 5GAPD 5FWGA 2JU5A 1WIKA 4WBJA 4GTUA 1ZMAA 2FWEA 4POBA 5J9CA 4OFTA 3HHVA 2KOKA 2IMDA 1Z6NA 5EY6A 5ABRA 4TR1A 4WF5A 1IYIA 3KP8A 4V2NA 3TJGA 3U5RE 1M2DA 3KEBA 3P2AA 3ZVJA 3H8QA 5IM9A 2FGXA 3KMOA 1XCCA 4HJ2A 1GP1A 3RAZA 7GSSA 3CXGA 3GHAA 4IQ1A 5JCUA 1HNAA 2K6VA 2AJQB 4MJEA 1EGRA 1PMTA 4HS1A 3HJOA 2BJXA 3ZFLA 1A8YA 2H0GA 5CRWA 2NPBA 1LU4A 2CVDA 1ZL9A 3KJYA 1ILOA 4GQFA 2HFDA 5G5FA 4J57E 4PUFC 1H4OA 2GS3A 1K0AA 2WDUA 2F3MA 3GL5A 1F9MA 4I8BA 1F2EA 1O73A 4JE1A 5F05A 1RW1A 4RQXA 1TXXA 1T8EB 2DJKA 2PMTA 5ECQB 3FZAA 4OCFA 2C3TA 2IMKA 1BEDA 5AGYA 3SBCA 2WZ9A 3APSA 4EL1A 1WE0A 3D22A 2HZEA 4Q5FA 2LS5A 4AGSA 2VLVA 2G2QA 5D9XA 19GSA 2VM2A 5D73A 5E4WA 1ON4A 3FW2A 3I43A 2GT5A 3UIWA 5ELAA 1UC7A 2GSQA 2N5FA 3HVVA 1ERUA 2A4VA 1B4PA 3AY8A 4RUVA 3NOFA 1QQ2A 2IMFA 2H1BA 1TI1A 4G10A 4KH7A 3W6GA 2AV4A 1OC9B 4BL7A 4CW9A 1GTUA 4XS6A 5A4VA 3GA4A 3GL3A 4L8EA 5ECOB 4BVYA 3US3A 5HFKA 2ZUPA 3TKSE 4ML1A 4MA9A 3ME7A 2RIIA 3OR5A 3TJKA 4MABA 2C4JA 4J56E 4Q5RA 4MPFA 1WPIA 1EOHA 2HSHA 1G6WA 3VURA 3MWHA 2EIRA 1SYXA 3GV1A 3VLNA 3KXOA 5CRHA 1VF3A 2B1LA 5LNKe 3WYWA 2YP6A 2C3QA 4LMWA 1OAZA 2P31A 3WGXA 2YZUA 2GSRA 3CSIA 2XHFA 5CO3A 4G9HA 1N8JA 1OVNA 2OE3A 3F4TA 2YANA 3FRCA 3VWUA 3LGCA 4LLRA 1SJ6A 4ECCA 2LQOA 3GTUA 1USBA 2KLXA 1V57A 3M0FA 1YF0A 4KGIA 5J4UA 2AB6A 4PURA 4ZBDA 1XW5A 4HQSA 4JU5A 3CMIA 3P7XA 3PINA 3PR8A 1B9XC 2H8LA 3ZREA 2G0FA 4X0XA 4F0BA 4GQCA 5F06A 5JWRB 5JCGA 4GRFA 5B6MA 3TCOA 1M9BA 2GT6A 4HZ4A 4FYBA 4WEYA 1Q4JA 4FYUA 5KN1A 4WXTA 3KGKA 3LYKA 3BCIA 4YQUA 2L5LA 2HNLA 1GUKA 3LJRA 4G2EA 2CT6A 2H71A 1T00A 2N5AA 2ZNMA 1XPVA 4IS0A 3IR4A 4MP4A 2IFQB 1B9YC 4K8MA 2HI7A 2OJLA 1A0RP 4ZL9A 1SL2B 4CHSA 4E8EA 1Z6MA 4D73B 2DLXA 4F2IA 3ZVJD 4ZB8A 2E0QA 1O81A 2GSSA 11GSA 5HR1A 1SD8A 3ZTLA 2QKEA 3QR6A 3HD5A 5COHA 3MAKA 2CAIA 4HJMA 2C80A 3TKSA 1W4VA 1GSSA 2X8GA 4NV2A 1YY7A 2FCHA 5DVBA 3UOMA 3I69A 4LL1B 4KUNA 3GFKA 1EWXA 1GSQA 3EWLA 3HCZA 3ME8A 2MBTA 2JADA 2YWNA 2GLRA 5D96A 2H01A 5ECSA 1SENA 1PX6A 5HQPA 1GLQA 5GAND 1NHOA 3F9UA 3MDKA 1IYHA 1PN9A 1X5CA 1QGVA 1DUGA 3MNGA 2H6ZA 3F3QA 22GSA 1T3BA 4F9ZA 4TR4A 3KIJA 1K3YA 3CTGA 2HLSA 1T4ZA 3HY2A 3WD6A 1XWCA 3RDWA 3DYRA 2GQMA 5F07A 3ERFA 4MH2A 1SK2A 1MEKA 4AJ6A 5DAKB 1K0CA 3WT1A 1KNGA 3IA1A 5F8BA 2WJUA 1GSDA 5JCWA 1XW9A 3QAVA 5CRDA 1SL0B 2O87A 1B48A 4H86A 1X9WB 2ALBA 4MJAA 2YV7A 4KSOA 4ISDA 1TKDB 1TJDA 17GSA 4TXVA 4OFNA 3ZMLA 1FB0A 1XWKA 4POKA 2B7JA 1X5EA 1FVJA 4DSQA 2XC2A 1EZKA 3WT2A 3ZIJA 2J23A 3HKRA 5H5SA 4N0VA 3P8WA 5CYYA 3EMXA 1Z9HA 2QSIA 4L0WA 1HQOA 1XWGA 5KN2A 2H30A 2OBKA 3APOA 2LJKA 2IMIA 2C0DA 1FOVA 5HFIA 1YF1A 2MMZA 3WGEA 4LMVA 5KEJA 2IN3A 3DIEA 5GSTA 5EVOA 3UBKA 2FA8A 1Z3EA 5AIVA 3DXBA 3IAM2 4KDXA 2P5QA 3VPTA 4MJCA 3DWVA 3ISOA 3CBUA 3CSJA 4GSSA 2VAFA 2BMXA 1AXDA 5HR3A 2CA8A 4BWQA 2MYGA 2CZ3A 4GCIA 1BAYA 3ZYWA 2V2GA 4DVCA 2O85A 1F37A 3E3EA 2CZ2A 2O8VB 2P5RA 3LWAA 1K0MA 4MF7A 2RM6A 5F0GA 2DMLA 1EOGA 5ECKB 3C71A 4JBBA 4L0UA 1HNCA 2PUKC 1SJIA 4EF0A 1V58A 5D9WA 1QK8A 1FO5A 1GLPA 8GSSA 5KN0A 2PBJA 4MZCA 3HJPA 4EDYA 4MF6A 2MMNA 4XRDA 4K2DA 1UVZA 1LBKA 2EIOA 2E7PA 4K7NA 1A2JA 4KB3A 3LORA 4MF5A 5LD0A 3O76A 1K3LA 2V6OA 1PX7A 3GRXA 1MDJA 4IGJA 3TKSC 3TRQA 4AJ8A 4K1FA 2F9SA 5IIZA 1GRXA 2L57A 2ON5A 1YEXA 5D9VA 1ML6A 4PXOA 2LRCA 3IBHA 3F0IA 2V6KA 4TRXA 4WR5A 4XRAA 5G2ZA 4X1UA 2IWTA 1ERWA 2PERA 3BBYA 2WGRA 2M46A 4Q5NA 3M1GA 5CNWA 1YKAA 3FYGA 3LYPA 1PD21 4OFMA 2YV9A 3I9V2 4V2LA 4LA1A 1K0NA 1SYRA 2FWHA 2PN8A 6GSYA 4ZXGA 5INYA 2E2MA 4HU9A 2CQ9A 1FAAA 1ERVA 4O92A 2XBQA 2VCTA 3IK9A 1FW1A 1KBNA 1C72A 4TR0A 2H1AA 1HYUA 2IL3A 2KHPA 1G6YA 4N10A 4JR4A 4IBPA 2YOIA 1WRYA 3DD3A 3GSTA 4EXJA 4NMUA 3F6DA 3RPPA 1OC9A 2FWFA 2VLUA 6GSWA 1FB6A 4HQZA 3SWLA 1T1VA 1PA3A 5IMFA 2OBIA 4GLTA 3ZZXA 1URMA 3TOTA 1PQNA 1TRVA 4GWRA 4P3YB 4XS1A 2C0FA 3O6TA 5DALB 2VD1A 4F0CA 20GSA 5ID2B 1Z7RA 3QCPA 1BG5A 2VIMA 2R6KA 4WR4A 4WBRD 2BTOT 2ON7A 3Q74A 4BPYA 2I1UA 1I5GA 4KNDA 4K7IA 1XOBA 3I6AA 2HXKA 2LJAA 3EYTA 4HZ2A 3L78A 4TXOB 2B5XA 4YQMA 4IP1A 2VCXA 1CQGA 2H6YA 1XVQA 1H75A 3E9JB 2LRNA 4EDZA 4NAXA 1XFLA 1XWAA 1GTAA 2VD0A 1TRWA 3IXRA 4V2MA 1M2BA 3GUSA 5G30A 2Z9SA 2VL2A 5GZZB 4DSSB 2C0GA 3DVXA 5DBQA 4N30A 4ECJA 1A24A 1UN2A 2M72A 4KW6A 3N9JA 2CX3A 5GSSA 1O8XA 1ACVA 5IQYA 3KH9A 2H76A 1VF2A 2ES7A 2VM1A 2AYTA 2L6CA 3UMAA 5CAXA 4PNGA 3EE2A 3QFAC 2DSAA 3RBTA 3IAS2 1MDIA 2IFQA 3G7IA 1EEMA 1MDKA 4KAEA 3H1NA 5IOXA 2HYXA 1M2AA 4D73A 4PUAA 4V1Ap 4ML6A 1GTIA 1UA5A 4ZILA 2TRCP 2CV4A 4POMA 3GIXA 1A2LA 1M99A 1Y6EA 4OO5A 2EC4A 2F51A 2B7KA 2H0HA 1THOA 1PL2A 2FA4A 1FVKA 1I9DA 3ZMKA 1NM3A 3LG6A 3H79A 4ECBA 3LSZA 1JLVA 1YKCA 2RM5A 1XWBA 4ULXA 2CVBA 1ZGNA 1F3BA 1X5DA 3J7Yk 2K8VA 3C1RA 3E0UA 2V41A 2VCWA 1EP8A 1Y25A 3QPMA 2FWGA 2I9HA 4I6XA 3TKRA 3D0ZA 4DEJA 5IO0A 3IE3A 4ZIJA 2HRFA 3UAPA 2YJHA 2I3YA 1K0OA 3G9BA 2PWJA 3FEUA 1A0FA 3F4SA 13GSA 3F63A 2OADA 2DJJA 1XOAA 4G19A 2HE3A 1HNBA 3BOAA 3DEXA 3IRAA 5HR2A 2LEGA 2DMMA 3L0HA 2GZPA 1GULA 2GZZA 2YN1A 3ERGA 2YWMA 4ACSA 5EPFA 2FUG2 3VFIA 4BA7A 3GTUB 2LSTA 4WF4A 1XZOA 1AQVA 1TK5B 2DJ0A 4IW9A 3G7JA 3VPQA 3D21A 3TB2A 2NVLA 1X9MB 5G31A 1R7HA 1ZYEA 1G7EA 1WWJA 1K0DA 1W89A 2JZRA 3RHBA 4JRRA 2B5YA 1NSWA 4PNFA 3RHCA 1DBYA 3APQA 2RUFA 1TOFA 3ERWA 1A2MA 2X8CA 1M7TA 18GSA 4V1Ag 1ZZYA 2KP2A 3QMXA 2N5BA 1OKDA 1N2AA 5DQSA 4I5QA 3TOUA 5JWQB 3IK7A 1A8LA 3LFLA 3HA9A 6GSTA 3FR9A 5ECLB 3IDVA 2MZCA 1PKZA 3LXTA 1V98A 1TW9A 2H1DA 3EURA 1ST9A 1KEBA 3GX0A 3F6FA 1O8WA 3KTBA 4ID0A 2NTOA 2VL2C 5A4UA 1K3OA 3J7Yb 2HZFA 3M9KA 4FYCA 2CX4A 2WS2A 2O7KA 2H0IA 3KMNA 1R4WA 1XIYA 1GNEA 3VWVA 2KUCA 5CRGA 3GSSA 3D5JA 4XS4B 4MJBA 2OE0A 4WKWA 3L9SA 4K6XA 3FZ9A 5J3RA 3GKKA 2VCVA 4J2FA 5ELGA 1M0UA 4TW5A 4OWYA 2DC5A 1TI3A 3NZNA 2X64A 2X8HA 1PSQA 4I97A 4EUYA 5CREA 1RK4A 5AIXA 3IPZA 2L5OA 5ECHB 2F8FA 3DKSA 1OC8A 1OYJA 2LKUA 1JHBA 5ECPB 3KD0A 3GYKA 3EC3A 3Q19A 4Q5QA 3TRXA 3F4RA 2JSZA 2LNSA 4BVXA 1AAZA 3FKFA 12GSA 1S3DA 4PQHA 2D2ZA 4HUAA 5G5EA 1PGTA 4ZBAA 2GGTA 4XTSA 1VF1A 4AF2A 2YZHA 3GNJA 1GSYA 5IMVA 4BWSA 2B6MA 1J0FA 1YZXA 1M9AA 4ZB9A 1O6JA 4IHUA 1F3AA 3HDCA 3UVHA 3IV4A 2JSYA 1BQ7A 5DJLA 1S3AA 1HD2A 2L4QA 3TKPA 3FZ5A 2L59A 5G1LA 1T7PB 2GQLA 4ZL7A 2YWIA 1JFUA 1QFNA 3GURA 4PGTA 1G0TA 1GH2A 2YCDA 2JZSA 5DCHA 4Z7XA 5H5QA 5HR0A 4KX4A 4N0ZA 2QC7A 2R3XA 3FY7A 1YJ6A 2IJYA 2H72A 2AHEA 3A2VA 2LRTA 5D8IA 1CQHA 2F8AA 3W8JA 2A2SA 2KP1A 5DALA 1GUMA 2OE1A 4F82A 5ID2A 3GX8A 3H4KA 2H19A 3VK9A 3VWXA 1V9WA 1ZOFA 2LUSA 3FHKA 1BJXA 3M3MA 4K0NA 3C1SA 3UJ1A 1E2YA 4IJIA 1X0RA 4IELA 1ZYQB 2NBSA 3DMLA 4POLA 4TXOA 4CDOA 3V1WA 3IOSA 5DDLA 1JZWA 2C8UA 1WP0A 4NHWA 2PVQA 3ZRDA 2DIYA 4KCAA 2H70A 4FH8A 1SL1B 1SKRB 2RLIA 4O7HA 2XPEA 4MMMA 4K0GA 4X43A 4XIHA 2HT9A 1EP7A 2WULA 1AQXA 4EVMA 3QFBC 6GSXA 3TJFA 3N5OA 2WB9A 3ZLPA 3A3TA 1EV4A 4TVEA 4JR6A 2CVKA 3FZ4A 4QQ7A 2DJ3A 1EV9A 5D93A 5ECNB 1R26A 4DSSA 3KM6A 5G1KA 3JCML 1XXUA 4IP6A 4N11A 3HJMA 1OE7A 1WMJA 2FLSA 3QAWA 2DBCA 2I81A 3A2XA 1T4YA 2VCZA 4EO3A 4MZBA 2PPTA 6GSVA 5IMDA 2H6XA 3UEMA 4DSRA 2V32A 1TP9A 4ZBBA 2L4CA 4IKHA 4TR1B 4I2UA 1J08A 1SD9A 2FHEA 2OA7A 5DQYA 2LTKA 1Z5YE 1X9SB 3GKXA 4NHZA 1AW9A 1GL8A 4FIWA 1PRXA 4HI7A 3KZQA 1SK1A 3A2WA 4JEDA 3RPNA 3TGZA 1O7UA 2JZTA 3CYNA 4KSMA 2X99A 5JWOB 2GSTA 2HSYA 2E2GA 3LQ7A 1R5AA 3HXSA 2MBSA 2CAQA 1SJZA 1XW6A 2EIQA 1GNWA 1GUHA 1OC3A 1GWCA 3EMPA 5IPHA 3BD2A 5J5NA 3TDGA 1TK8B 1V2AA 2DJ2A 3TRPA 1B4QA 1SKSB 4PX1A 3VWWA 1XBSA 3IHQA 1O85A 3QD9A 5C04A 3FR3A 4TR3A 1AUCA 1Z7PA 3PH9A 2HZEB 1QMVA 4MDCA 3ZFBA 2J9HA 5B8BA 14GSA 1R5PA 1GSUA 3K8NA 2R2JA 1U88A 4YH2A 4RI6A 1E6BA 3TKQA 3PGTA 2OACA 4OO4A 3G7YA 5EL8A 1J9BA 1AQWA 2RUEA 2H73A 2XPDA 3M8NA 2IPAA 3H93A 3LEFA 3W8SA 3QAGA 4I2TA 3VI5A 9GSSA 3HVXA 3WGDA 2P0GA 4ZL8A 3FR6A 4OD7A 4KDUA 4EE0A 4K9ZA 3C73A 2C3NA 2K8SA 2MMOA 5AN1A 1BX9A 2B1KA 1YDKA 2LNTA 4PQ1A 3GN3A 6GSSA 1VF4A 2VUPA 1GTBA 5IMAA 4KA0A 2C0EA 5C00A 1RQMA 5FHIA 5DAKA 1YEPA 2XBIA 3IC4A 3BCKA 4IN0A 5CP1A 4EKZA 1XVWA 2AUVA 4KE3A 3CTFA 2QGVA 4HDEA 1PL1A 5HFGA 2PU9C 3R2QA 1NW2A 1AIUA 2L6DA 3ED3A 1JLWA 2GZYA 3VI7A 3KP9A 2DJ1A 2O89A 3L9VA 4OMVA 4K7OA 2WFCA 1MD3A 1DSBA 5B7CA 4MH3A 5ECMB 4QL7A 4GSTA 4EC0A 2REMA 3LXZA 2PGTA 4XS4A 2H75A 1S3CA 4RI7A 1TU8A 5A5KA 1GSEA 3KCMA 3F3RA 3QDNA 3QOUA 1MD4A 3P90A 2YJ7A 4YQVA 3D4TA 1A23A 2GDRA 3CRTA 4OCEA 4XHMA 3UARA 2B5EA 4O5RA 5KN3A 2WRTA 3U6VA 2IIYA 1FG4A 1V40A 4MLYA 2LV3A 1QUWA 1Q98A 4IJ3A 3HZ8A 2DIZA 1F6MC 2R4VA 4NV5A 3MSZA 4FO5A 3TUEA 1TTZA 4NWYA 1OKTA 2IMEA 3FK8A 1KTEA 2YPMA 1JZDA 5DJMA 1LJRA 5IMZA 3C8EA 2VL3A 3L4NA 3UL3A 4TN8A 3HZ4A 4ZB6A 1U6TA 1WOUA 5J9BA 3CRUA 3F8UA 4HU7A 4QL9A 1SK0A 1FHEA 1TRUA 4L5LA 3EU3A 2R5GA 3GH9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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