1ON4A

Solution structure of soluble domain of sco1 from bacillus subtilis
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
174
structure length
174
Chain Sequence
HMLEIKDPLNYEVEPFTFQNQDGKNVSLESLKGEVWLADFIFTNCETICPPMTAHMTDLQKKLKAENIDVRIISFSVDPENDKPKQLKKFAANYPLSFDNWDFLTGYSQSEIEEFALKSFKAIVKKPEGEDQVIHQSSFYLVGPDGKVLKDYNGVENTPYDDIISDVKSASTLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of Sco1: A Thioredoxin-like Protein Involved in Cytochrome c Oxidase Assembly
pubmed doi rcsb
molecule keywords Sco1
molecule tags Metal binding protein
source organism Bacillus subtilis
total genus 51
structure length 174
sequence length 174
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02630 SCO1-SenC SCO1/SenC
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1on4A00
5ECKB 1KNGA 1GTUA 13GSA 1SYRA 4GSNA 1QUWA 2R37A 2DIZA 3EU3A 3GKNA 4RUVA 3ZVJD 2OKAA 3EURA 5J5NA 3ZMKA 2FHEA 1MDKA 4KW6A 3I43A 2C3NA 2LTKA 1GL8A 7GSSA 2ALBA 3A2VA 4E8HA 1JLVA 2H1BA 2MMAA 1TRWA 3ZIJA 4TRXA 2YV7A 3HJOA 5EVOA 5CYYA 1M0UA 4GLTA 1OC3A 4IBPA 3F9UA 4MH3A 3C71A 2PBJA 3IXRA 2H1AA 2AYTA 4PQ1A 1GSQA 3CRTA 2V2GA 2VCTA 1X5CA 4OFTA 5ECPB 1F3AA 4ZBAA 3FYGA 4AGSA 3KIJA 3TB2A 2L57A 3QD9A 2R3XA 4IN0A 1NHYA 4HQSA 5J4UA 1ERUA 1OE7A 3ZREA 1FAAA 3O6TA 4OO5A 12GSA 4GWRA 2IWTA 1TI1A 4L0UA 3KXOA 2YWMA 1DUGA 4N30A 5HFKA 1X5DA 2GDRA 3ERWA 5ELGA 2DC5A 5KN1A 1XCCA 2CQ9A 2FWEA 4YH2A 2M80A 4K6XA 4YAPA 3A2WA 3WT2A 1PKZA 3S9FA 3TKQA 4WR5A 1M2DA 1R7HA 4ECJA 1SD9A 1OVNA 1TKDB 3ZVJA 5IO0A 4TW5A 2QC7A 5IMFA 3F4RA 22GSA 1SJ6A 1G7OA 1GSYA 5KN3A 3TJKA 3RPPA 6GSWA 5D9TA 1ST9A 2JZTA 4O92A 3PR8A 1TK0B 2GS3A 1PKWA 2ZCTA 2FCHA 2B7KA 2PMTA 4ULXA 1YEXA 2P5RA 3GYKA 4BWQA 4NV5A 3VURA 8GSSA 5HFIA 4MF5A 4JEDA 3APOA 2V6OA 1YZXA 4XS4A 3ZYWA 1B48A 4IELA 3FK8A 1EGOA 2C0DA 3EU4A 1SJZA 2IMIA 3IR4A 3F0IA 1YKAA 3FZ5A 4HOJA 1O8WA 1WP0A 1SL0B 1T3BA 4HJ2A 1X9SB 3BCIA 3RHBA 4MPFA 4IW9A 4D73A 2C3TA 1A0FA 2YV9A 4KGIA 5CRHA 3GV1A 4X0XA 2PPTA 2N5BA 2H8LA 3VPTA 1K0NA 1A0RP 3UBLA 1AC1A 1SL1B 4IJIA 1TTZA 1X9MB 3M9KA 2B3SA 2FY6A 1WWJA 3E9JB 3GX0A 3IOSA 3RBTA 1ACVA 2P31A 2DIYA 4HDEA 3TGZA 3FHKA 4TR1A 1X5EA 2K9FA 2CVKA 5J9CA 4L5OA 1GLPA 2PVQA 5EY6A 3ZRDA 3E0UA 1K0BA 5J3RA 2LKUA 1B9YC 3H93A 3KCMA 4K9ZA 4EXJA 4GCIA 1M2BA 4V2LA 1GWCA 2KUCA 3VWVA 3L9SA 4QL7A 3VWWA 1U6TA 2IMFA 4BWSA 2FUG2 3RHCA 2WB9A 2ES7A 2O7KA 1GTBA 1XWBA 2D2ZA 1K3YA 1LU4A 1QK8A 3EVIA 1Y25A 6GSUA 3DVXA 3WGEA 2GQLA 4HQZA 5DJLA 2VL2C 5IMAA 2GZZA 1EOHA 1EP7A 20GSA 3HVXA 4ZL7A 1FVKA 2WZ9A 3DYRA 4EDZA 2CV4A 1K0MA 2LEGA 2MYGA 2YZUA 1TP9A 2F8AA 4AJ6A 2KOKA 5ECIB 2GSTA 3WD6A 1Z6NA 2XPEA 1AQXA 4NPBA 5GSTA 4RQRA 4OCEA 4JR4A 2VAFA 1S3DA 3A2XA 3LJRA 5H5RA 4MZCA 2VLTA 3M3MA 2H6ZA 3M8NA 3D6IA 4WEYA 1OE8A 5DCHA 2EIOA 1TDIA 1Z7PA 3FKFA 4IP6A 2C0EA 4PNFA 1BQ7A 1H4OA 2CA8A 3DWVA 2H71A 1ZGNA 4MPGA 1MTCA 2IMKA 3KGKA 2O85A 1WOUA 3GUSA 3CBUA 3EYTA 4GSTA 3ED3A 3UJ1A 1GSUA 4MF7A 1EV4A 4L5LA 4EC0A 1GNEA 2LNSA 1XW6A 1XXUA 3GKMA 4I8BA 3FEUA 2VD0A 4ILFA 4V1Ag 1PD21 2C1YA 2O8VB 1JZRA 4PURA 2PWJA 1J0FA 3IK7A 3ZTLA 1GNWA 4ZBDA 2HRFA 4AJ8A 4TXOB 3U5RE 3BJ5A 4KNDA 4ML6A 1U3IA 1R5PA 5B7CA 1B8XA 2VLUA 1AXDA 3LFLA 1VRSD 2E7PA 5F05A 4ZL8A 3VWUA 4K8MA 3Q19A 3MWHA 3V1WA 5J41A 1ILOA 2HXKA 2C8UA 1QQ2A 1WJKA 1Z3EA 3GHAA 2CX3A 3RAZA 2MBTA 1A23A 3UL3A 5AN1A 4FYBA 1GP1A 1OKTA 3TOUA 4ID0A 5ECRB 2MMNA 3TKRA 2PUKC 2M72A 2H66A 1SK2A 1XIYA 2I4AA 3FR3A 4BA7A 3DEXA 3KMOA 5G31A 1XWKA 1V9WA 5GAPD 2LS5A 1RK4A 3P2AA 5ECNB 2CZ2A 3PINA 3LSZA 3QR6A 1VF4A 1VGLA 1Z5YE 2JU5A 3Q18A 2WJUA 5IOXA 1DE2A 2NDOA 3TKSE 1OC9A 4KSOA 1N2AA 4OD7A 3L9UA 1GH2A 1NW2A 1R26A 3GFKA 5IPHA 5A4UA 2H74A 1GSEA 1KEBA 1UVZA 1Z7RA 2HNLA 6GSSA 1T4YA 3D5JA 1HQOA 1FVJA 2YOIA 4I97A 5J9BA 2FD3A 3FZ4A 5E59A 4MA9A 2N5AA 4F82A 3EE2A 1ZZYA 1M9AA 3W6GA 1GSFA 2KP1A 2PN8A 4I2UA 2DLXA 1OAZA 3KEBA 2IMEA 4MLYA 4PXOA 4OMVA 1SJIA 2IJYA 3KTBA 3SWLA 4YQUA 3IHQA 3UIWA 3C7MA 2YWOA 2B1KA 1EEMA 5H5QA 1K3OA 1NHOA 3DXBA 5LCZA 5FT3A 2PU9C 1EP8A 3HJPA 2GQMA 2TRCP 4O7HA 1YEPA 2ZNMA 3LWAA 1GSDA 2A4VA 3EMXA 2E0QA 9GSSA 3ERGA 2LRCA 4BL7A 5IMVA 3UVTA 1DSBA 3KMNA 1JLWA 4PQIA 1E2YA 3QAWA 2OADA 4ECBA 4KB3A 5A5KA 1HNCA 2KHPA 5IM9A 4XIHA 2I1UA 1YKCA 4XCSA 2FWFA 5ECHB 3VFIA 3O76A 4FH8A 4XS1A 3Q6OA 1HNBA 1XVQA 3APSA 2I3YA 3W8SA 2ZUPA 5F06A 2MBSA 4EO3A 5GSSA 1XW9A 1YY7A 2L4QA 2H30A 4XS6A 4RQXA 1Z6MA 3PGTA 1K0DA 3TRXA 4IKHA 4MK3A 2LSTA 3IPZA 4LL1B 2HE3A 5FHIA 4O5RA 3VLNA 5A4WA 1XFLA 3WT1A 2DJ3A 4AJ7A 2V32A 1F6MC 3IE3A 2A2SA 1YQ1A 3F6FA 3FRCA 5B8AA 4V1Ap 3L0HA 5DALB 3UMAA 4X1UA 4JBBA 4Q5FA 3DGQA 3NIVA 1R4WA 5DAKB 2FNOA 1SD8A 3AY8A 3W8JA 3UEMA 2DSAA 3HXSA 1AQVA 3M0FA 2GZPA 2GSRA 2NPBA 4MF6A 1ERVA 4EL1A 4PX1A 3H4KA 4F2IA 4NHWA 1AIUA 3RDWA 4DSSA 4TXOA 1GUMA 5CP1A 3MNGA 2G2QA 4PUAA 1ZYQB 1GULA 1BG5A 5IIZA 2X8GA 3F8UA 3UAPA 3F6DA 2JADA 1A2LA 4PGTA 4KAEA 1K0CA 1GTIA 4CHSA 2HZEB 2LJRA 2F3MA 4KA0A 3OR5A 2VCXA 4I5QA 5ABRA 2AB6A 1TK8B 5EL8A 3TDGA 3P8WA 3ME8A 3TCOA 2CX4A 2CZ3A 1URMA 1XOAA 1K0AA 4POLA 4Z7XA 4IVFA 3F4SA 2KLXA 5ECSA 2G0FA 1QFNA 1PL1A 1FOVA 4MMMA 1BJXA 1O73A 1WIKA 1K3LA 5COHA 5E4WA 5LNKe 2R6KA 3F63A 3HZ8A 3HVVA 3C1SA 3G7IA 4KCEA 3A5WA 1AW9A 1OKDA 2N5FA 2RUEA 1ERTA 4XHMA 4EUYA 4ZILA 2VCWA 1TW9A 2B5YA 3N9JA 4IJ3A 1T1VA 2XBIA 2XC2A 1F37A 3F4TA 3TJJA 1T00A 4YQMA 4J2FA 4TR0A 2WCIA 3FZ9A 1H75A 4NWYA 1SENA 2OA7A 4TR4A 2F8FA 1XPVA 3GMFA 4MCUA 2B5EA 2E2MA 2IFQA 4TN8A 1FB0A 1JZDA 2FA4A 4TOPA 3DRNA 2H0GA 5JCUA 3TKSC 1B4PA 1HNAA 3IDVA 1DBYA 2JSZA 3GTUA 2L6DA 1GSSA 1CQGA 3TOTA 1A2JA 5CRDA 3LYKA 1TOFA 3GH9A 4GXZA 1YF1A 4K0NA 4TVEA 5JWRB 3D0ZA 5IMDA 2FWHA 1XBSA 2J9HA 4RI7A 2GT5A 1MDIA 1PRXA 5JCWA 5G30A 5H5SA 4ECIA 1I9DA 2FGXA 3G7JA 2HRNA 2QGVA 3J7Yk 1TRVA 2HYXA 5CO3A 1RQMA 4MABA 5D96A 5CRWA 3C8EA 3MDKA 1RW1A 3TKSA 4TR3A 4HU7A 4JRRA 1XWAA 4J56E 3HJMA 1Z9HA 4X43A 1NM3A 2FWGA 4ZL9A 4KSMA 4IQAA 5G2ZA 3HHVA 2H0IA 1ABAA 2YJ7A 3VI5A 5DBQA 3RPNA 4MZWA 4F03A 1WMJA 2H75A 3JCML 1E6BA 3DKSA 2OE0A 3GL3A 3GNJA 5ID2B 2VL2A 1ZCPA 2WDUA 4K1FA 3KTLA 3D21A 2EIQA 1T4ZA 4PQHA 2VO4A 4KH7A 1PX6A 3P7XA 1S3CA 2IMDA 5B6MA 2MMOA 1FO5A 5ELAA 5KN0A 5GZZB 3TJFA 1N8JA 1WE0A 2IPAA 3NZNA 2AJQB 2YN1A 3Q74A 1PN9A 2B7JA 2BJXA 3BD2A 4WR4A 4IHUA 3LG6A 1UN2A 4AF2A 4NXIA 3LXZA 3F3RA 2PGTA 4IQ1A 5IQYA 3HYPA 1TXXA 5DQYA 4N0VA 1GTAA 3I9V2 3DD3A 4N10A 5DDLA 4WETA 2MZCA 4DSQA 5GAND 3UVHA 1YF0A 3GRXA 1FW1A 2B1LA 1O6JA 4EDYA 1GRXA 2E2GA 1BEDA 4KUNA 2GTUA 3GSSA 3U6VA 4HU9A 3CTFA 1EGRA 3ZMLA 5CNWA 3ZZXA 1PMTA 4FYCA 5AIXA 3F3QA 2O89A 2HZEA 4POBA 1M9BA 3HD5A 2AAWA 2VLVA 4K7IA 3IC4A 2JZSA 2NTOA 2R2JA 4JE1A 1SK1A 1USBA 1AAZA 5JCGA 4F0CA 4O32A 4D73B 2XBQA 5ENUA 4OFMA 1EV9A 2J23A 3EINA 3UARA 10GSA 4DVCA 4EVMA 1XVWA 2LQOA 4Q5QA 2VOCA 1BX9A 2OACA 4BPYA 1FHEA 2H6YA 3MAKA 2LRNA 3EC3A 4ZIJA 1ZMAA 4I2TA 3QDNA 4ZB9A 14GSA 3KP9A 5G5FA 2QSIA 5DQSA 3GN3A 2I9HA 4IGJA 2WRTA 1QMVA 2R4VA 1I5GA 3FW2A 1SK0A 3DVWA 2F9SA 2OBKA 5FWGA 2Z9SA 4KDXA 3C73A 4F9ZA 4OWYA 6GSXA 2O87A 2JZRA 1U87A 1AQWA 4LLRA 4PNGA 1AUCA 5IOWA 1JZWA 3IRAA 3O3TA 1CQHA 5LD0A 4KDUA 1WPIA 2IL3A 3ISOA 4LL4B 2VCQA 5G1KA 1TRSA 3GX8A 2RM6A 2AHEA 2DJ2A 3KH7A 2WS2A 2HLSA 1O7UA 5HQPA 4F0BA 5CRGA 2YP6A 2RUFA 1G6WA 1G0TA 2VM2A 1J08A 1F2EA 4OCFA 2NVLA 3KM6A 4P3YB 2L5LA 3VPQA 3FZAA 5F8BA 5HR0A 1SKRB 2YCDA 1G6YA 2H73A 5D8IA 3I6AA 3KP8A 2F51A 4HI7A 1B9XC 4G2EA 4BVXA 2VUPA 4MJEA 3M1GA 2DJ1A 3WYWA 4HZ4A 5HR2A 1M7TA 2JACA 3GKXA 1FB6A 1W4VA 4K7OA 3LGCA 2DBCA 3HVSA 4V2MA 3GA4A 2MMZA 5INYA 2RLIA 2XHFA 3CSIA 2LV3A 3C1RA 2VIMA 4ECCA 5IO2A 5DVBA 5KN2A 1U88A 2WULA 1VF1A 5ID2A 2OE3A 4ACSA 3ZFLA 3WGXA 1TRUA 2C3QA 1OC8A 1KTEA 2DJKA 5G5EA 1PL2A 3R2QA 4TXVA 1M99A 3LYPA 3IBHA 2FA8A 17GSA 1IYHA 5HR1A 2H0HA 4GF0A 1SL2B 4WXTA 4CDOA 2TIRA 2RM5A 4MJBA 4POMA 1F3BA 1O85A 1JZOA 4GQCA 3EWLA 2BTOT 1DE1A 1PQNA 3QOUA 1GLQA 4KX4A 3LORA 4NAXA 1MDJA 3CMIA 2YZHA 2VM1A 3ME7A 2FLSA 5EPFA 4E8EA 3IV4A 1IYIA 2PVOC 3APQA 1PX7A 1T8EB 1A24A 2WGRA 3QAGA 2OJLA 3BOAA 3ZITA 3CSJA 2KP2A 1WRYA 1XWGA 4ISDA 3VWXA 3IAS2 2RIIA 4K2DA 4L0WA 5D9WA 3L78A 2VCZA 1X0RA 2REMA 2H6XA 2X99A 1EEJA 3IA1A 1QGVA 1OC9B 2H01A 3H1NA 2P5QA 5AIVA 1BAYA 2HT9A 2TRXA 2GT6A 2P0GA 1V40A 1SYXA 1VF2A 4QQ7A 1UC7A 2CAIA 3GIXA 2NBSA 4KDYA 2H70A 3CTGA 4EE0A 5A4VA 1PSQA 1ZOFA 3D4TA 2LJAA 3QFAC 3FR6A 1XZOA 2M46A 4Q5NA 2K6VA 1NSWA 1PA3A 1UA5A 4ML1A 5HFGA 2CVBA 2VCVA 2LUSA 5D73A 3TJGA 4G19A 1XW5A 4KE3A 3KH9A 1QXHA 5JWOB 4N0ZA 2HFDA 3N5OA 3QPMA 1TU8A 2PERA 4BVYA 3LXTA 2K18A 3CRUA 4NHZA 4I6XA 3M9JA 4LA1A 1V2AA 1SKWB 2DMLA 2BMXA 4WF4A 4JZQA 3KZQA 5C04A 3FY7A 4LMVA 1Q4JA 2AUVA 1ML6A 3K8NA 1TI3A 1V57A 3D22A 5D93A 1G7EA 4EKZA 1Q98A 4G9HA 4Q5RA 3L9VA 5D9XA 2K8SA 2VL3A 1S3AA 3J7Yb 3KJYA 2V41A 2GLRA 1ON4A 5KEJA 3US3A 2YNXA 2GGTA 4N11A 5IMCA 1K0OA 5F0GA 2GSSA 2VD1A 4MH2A 3H8QA 4CW9A 2L5OA 3GL5A 18GSA 1O81A 3D4MA 4POKA 1HYUA 4ZXGA 2HI7A 1W89A 2H19A 2LNTA 3ZIVA 3LQ7A 4GQFA 4PUFC 2C80A 3LEFA 3IK9A 2QKEA 3NOFA 3SBCA 5CAXA 3ERFA 6GSTA 4WKWA 1JHBA 1YJ6A 4K0GA 3UOMA 2GVPA 1TJDA 3CSHA 3IAM2 3HA9A 2CAQA 4MDCA 5F07A 1O8XA 2IIYA 4HZ2A 4YQVA 4DSRA 3ZLPA 2WFCA 1MD4A 3BBYA 3HKRA 4HUAA 3DMLA 4WBRD 3GKKA 4ZB8A 3CYNA 1ZYEA 2GZYA 2HSHA 3PH9A 5ECOB 3TUEA 1B4QA 3ZFBA 1TK5B 4KCAA 3QMXA 3HY2A 2CT6A 2VL9A 4HJMA 1LBKA 4OO4A 2ON5A 2YWIA 2OBIA 5IMZA 3HDCA 4JU5A 2B6MA 1V98A 3QAVA 1F9MA 1EZKA 2I81A 3DIEA 1U3AA 4IP1A 5AGYA 3FR9A 5JWQB 3TRPA 1XWCA 5G1LA 2YPMA 3G7YA 1A8LA 2K8VA 1M2AA 4WF5A 2DJ0A 2AV4A 4IS0A 1VF3A 5L71A 4ZBBA 4DSSB 2C0GA 4MJCA 2ON7A 1EOGA 1JFUA 2X8HA 3G9BA 1THOA 5DALA 4FIWA 2X8CA 3ZL5A 4XRAA 3I69A 5DAKA 5B6NA 3MSZA 11GSA 1ERWA 3BCKA 1A8YA 4HS1A 4JR6A 5DJMA 4J57E 1GUKA 1BYEA 2CVDA 5ECQB 4OFNA 1PGTA 3VI7A 1LJRA 4G10A 3QCPA 2JL4A 4XS4B 4NV2A 3KD0A 1R5AA 3H79A 2H1GA 1X9WB 5C00A 2H76A 4EF0A 2L59A 6GSYA 1SKSB 2V6KA 4XRDA 1Y6EA 4HEA2 4LMWA 19GSA 1YDKA 2L4CA 2LRTA 3HCZA 1TU7A 3UBKA 4V2NA 2R5GA 3QFBC 5B8BA 5D9VA 2C0FA 2V1MA 1SU9A 2GQKA 4MJAA 3L4NA 4XTSA 1C72A 4GRFA 2HZFA 4H86A 2DJJA 3TRQA 3TKPA 2H1DA 4WBJA 4YAVA 5CREA 5IPGA 2LJKA 4GSSA 4K7NA 4MZBA 2JSYA 2X64A 5ECMB 1FG4A 4FO5A 1T7PB 4TR1B 3HZ4A 2IFQB 3E3EA 2IN3A 4RI6A 4DEJA 1MEKA 3VK9A 4TKYA 2OE1A 2XPDA 2YANA 2H72A 1J9BA 2EIRA 1A2MA 4ZB6A 1EWXA 3GTUB 3TJBA 2LQQA 4L8EA 16GSA 2GSQA 4MP4A 4QL9A 3GH6A 3A3TA 1MD3A 1KBNA 1GUHA 3P90A 1ZL9A 2HSYA 6GSVA 3CXGA 2YJHA 2L6CA 2YWNA 1THXA 2C4JA 1HD2A 5DCGA 1OYJA 5HR3A 2B5XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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