2V1MA

Crystal structure of schistosoma mansoni glutathione peroxidase
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
163
structure length
162
Chain Sequence
SWNSIYEFTVKDINGVDVSLEKYRGHVCLIVNVACKGATDKNYRQLQEMHTRLVGKGLRILAFPCNQFGGQEPWAEAEIKKFVTEKYGVQFDMFSKIKVNGSDADDLYKFLKSRQHGTLTNNIKWNFSKFLVDRQGQPVKRYSPTTAPYDIEGDIMELLEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Combining Crystallography and Molecular Dynamics: The Case of Schistosoma Mansoni Phospholipid Glutathione Peroxidase.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
molecule keywords GLUTATHIONE PEROXIDASE
total genus 64
structure length 162
sequence length 163
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2008-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v1mA00
2DIYA 5D9VA 3QDNA 2GSQA 5DDLA 3N9JA 5DALA 1A0FA 4POLA 3APSA 3K8NA 3D21A 2B7JA 4ECIA 1UN2A 4YAVA 4ILFA 4HQSA 5ECIB 1WP0A 3L9UA 5C04A 5CYYA 3C73A 3LQ7A 1C72A 2DJ1A 4GXZA 1S3CA 3QOUA 1YF1A 2GS3A 3EWLA 4ZL8A 1A23A 1S3DA 1M2AA 3RDWA 4V1Ap 3GUSA 3DWVA 5ELAA 2PGTA 1OVNA 3QD9A 3VK9A 2N5BA 4DSSB 5JCWA 1B9XC 11GSA 1EOGA 2X99A 2QGVA 20GSA 1PMTA 1VRSD 4CDOA 2TRCP 1KEBA 1AQVA 2PPTA 1M0UA 1SKWB 2NPBA 1YEXA 4NXIA 2CVBA 1WE0A 5JCUA 1O8XA 3CXGA 1T4ZA 5J4UA 4WBRD 1G0TA 4ECBA 1F37A 4BVYA 4RUVA 1QFNA 1XVQA 1TKDB 3GA4A 5J9CA 3EURA 3QFBC 4TR4A 2CZ3A 2ZCTA 1GUMA 2RM6A 1DE2A 3ERWA 1XCCA 3GSSA 1V2AA 9GSSA 4F9ZA 3VPQA 3LGCA 1XWKA 5INYA 3C1SA 2JACA 1GLPA 4NMUA 5DVBA 3IK7A 3KZQA 1RW1A 1X0RA 1A2MA 3TRPA 2CV4A 4LA1A 1XWBA 3ZIJA 1DBYA 5FWGA 1NSWA 2A2RA 2IMEA 2B5YA 1JZRA 4BWSA 3IA1A 4LLRA 3HA9A 3DRNA 3P8WA 4WR4A 2IMKA 2YV9A 1PL1A 3EMXA 3WGDA 3UBKA 1PSQA 2YWMA 1PX6A 2IIYA 3FYGA 1AQXA 4ACSA 2V6OA 3ME8A 1ZYQB 2B7KA 3EYTA 3LXZA 3QCPA 1PQNA 2H6ZA 4MCUA 1DUGA 4MDCA 2OACA 1ZCPA 3EU3A 2C0EA 3DD3A 2B5XA 2MMNA 2LV3A 4I8BA 3D5JA 3LEFA 5G5FA 2HE3A 2H76A 2PU9C 5F06A 2LNTA 3CMIA 4KUNA 2CQ9A 3IK9A 2AB6A 3KM6A 2C3NA 3FHKA 4MJBA 2QKEA 3QAVA 3L0HA 1H4OA 3FY7A 1B4QA 1QUWA 2C0FA 1SKSB 4PNFA 5LD0A 4MMMA 2YCDA 1PGTA 4KE3A 4L0UA 2CX3A 2JADA 5KEJA 2VUPA 3KMNA 1F2EA 4GSNA 2LUSA 1SJIA 5G30A 2Z9SA 4RQXA 2VCZA 2OE1A 2DBCA 19GSA 3ZYWA 2GSTA 3DVWA 1G7OA 2V2GA 1A2LA 2X64A 5CNWA 1O7UA 1LBKA 1E6BA 3HY2A 4QQ7A 4NPBA 2LSTA 1Z7PA 3VI5A 1F9MA 4KCEA 1GSYA 3ISOA 2LQQA 5GAND 2VLVA 4JZQA 2O87A 3Q19A 3M3MA 4G9HA 2H70A 1R7HA 1GSQA 5IOWA 3BJ5A 3PH9A 3FZ9A 2L6CA 2J23A 4OWYA 3VURA 4WF5A 2WULA 3I69A 6GSTA 12GSA 4Q5RA 4DSSA 3EE2A 2EIQA 1FOVA 4ZL7A 2I1UA 3F63A 1MDIA 5D8IA 1B8XA 3ZRDA 1TRVA 3QAGA 1Z9HA 5EPFA 3W8JA 2FWHA 3MDKA 1MD4A 2I4AA 2VCVA 4HJMA 4XCSA 1E2YA 1JFUA 5B8BA 1U3AA 3C8EA 2LEGA 4F03A 4O92A 1XVWA 1ERVA 1EEJA 2FWGA 2ON5A 1XIYA 4D73B 4K0GA 2CZ2A 1T1VA 1GRXA 4KDUA 3PGTA 1VF1A 3KXOA 5IPGA 1YEPA 5HR1A 2KHPA 1A2JA 3VWUA 1USBA 3WGEA 4MABA 3ZTLA 3KGKA 2J9HA 1GUHA 1Q4JA 1GSDA 3ZREA 3R2QA 3UIWA 2MYGA 1Q98A 4FYCA 2I3YA 5GSSA 2K8SA 4TXOB 2OJLA 2ZUPA 4ML1A 1JZWA 2IN3A 1ERTA 1X9WB 5HR3A 1FHEA 1WJKA 4WKWA 4ECCA 2HZFA 2TRXA 4PUAA 2OE0A 1J08A 3KH7A 3D6IA 1W4VA 1BG5A 4FYBA 5AN1A 1TDIA 5AIVA 5B6NA 3N5OA 2LS5A 1YKCA 2R37A 4ZBBA 3CTGA 1PKWA 1GUKA 2GDRA 3VWWA 5G1KA 1CQGA 3BBYA 7GSSA 2NVLA 1AXDA 1OKDA 5J5NA 2DJ0A 3LWAA 1BQ7A 1TI3A 2YJHA 3L9VA 4GF0A 4AF2A 2WFCA 3RPNA 1ST9A 3WT2A 3TKQA 4OFTA 3I9V2 4O5RA 1HYUA 2PWJA 5ECNB 1M99A 1U88A 3IRAA 2B6MA 1JZDA 4PNGA 4OCEA 1SD8A 1KNGA 1YQ1A 4RI7A 4MP4A 1WMJA 4J2FA 2YNXA 3TRXA 1JZOA 3GFKA 3ERGA 3ZVJD 1LU4A 5HFIA 1OYJA 2H19A 2H1DA 4YQUA 4PQHA 3OR5A 3Q74A 1K0DA 1GNEA 1SENA 2VCWA 4LL4B 5J9BA 5G31A 2EIRA 2KOKA 1M9AA 1FAAA 3GURA 2YWIA 3QR6A 3BCKA 3FK8A 5ECKB 2E2GA 2RUFA 2IWTA 2IPAA 4JE1A 3GIXA 3HVSA 3J7Yb 4E8HA 3EINA 2L5OA 1TRWA 3TUEA 2HRNA 2GGTA 3KCMA 1X9SB 1ZGNA 4BA7A 2P31A 4TXVA 1UVZA 2D2ZA 3LXTA 1NM3A 2FCHA 3GKMA 4X1UA 3GTUB 17GSA 2VCTA 4IN0A 3IDVA 1ILOA 5AGYA 5CREA 3KP9A 2LNSA 4JBBA 4HDEA 3KH9A 4BPYA 1EGOA 3F3QA 4DSRA 3F8UA 3A2XA 5IMAA 4XS1A 3QAWA 2PN8A 3TOUA 2H66A 6GSUA 4TR3A 1TXXA 2WCIA 3GKNA 5CO3A 4IW9A 4I2UA 4KDYA 3FR9A 3FRCA 3IC4A 5G5EA 3TDGA 4IBPA 4MPFA 5CRGA 2GTUA 3M0FA 2H74A 2IFQB 2JZTA 4IP6A 4XS4A 3H4KA 2V1MA 1I9DA 1HD2A 1OE8A 2E0QA 3DIEA 4N10A 4XTSA 4MJEA 1Z6NA 2DMMA 1AC1A 4ISDA 2H1BA 2RM5A 5B6MA 2C4JA 2FGXA 5F05A 4EF0A 5ECMB 1TU8A 2BJXA 5JWOB 2C1YA 2VL3A 1GSEA 4TXOA 2H6YA 2QSIA 3ED3A 1HNBA 1MDJA 4TR0A 2KP1A 3ZMLA 2LRTA 1M2BA 2WZ9A 5HR2A 6GSVA 2MMOA 5GSTA 3TJGA 2YP6A 1ZMAA 1FO5A 1XPVA 2CVDA 2VAFA 4E8EA 2YPMA 2LJKA 3P90A 1GWCA 1BX9A 4JEDA 1SYRA 4HJ2A 5ID2B 2CAIA 5C00A 2DJ3A 2VM1A 2LJRA 2NTOA 2X8GA 3DEXA 1I5GA 4MF6A 5JCGA 2FA8A 1EGRA 1A24A 5IMZA 2H71A 2O8VB 3FW2A 1OC9B 2GSRA 2OBIA 3D0ZA 3EMPA 3M8NA 4MK3A 2HNLA 5E4WA 4CW9A 4LL1B 5EY6A 1PX7A 3BOAA 1TK8B 2XBIA 2H8LA 4ZB8A 1R26A 1UC7A 2IMFA 1GTBA 3VWXA 4CHSA 2AAWA 4K7OA 4OD7A 3FKFA 1EV4A 3IE3A 2RLIA 2JSZA 2JU5A 3LG6A 3CYNA 1LJRA 5D9WA 5A5KA 2C8UA 1JLVA 3GKKA 4GQFA 2DLXA 1WIKA 4MH2A 1K3OA 4ZBDA 4N30A 4MH3A 3KTLA 3AY8A 4MPGA 1BJXA 3VFIA 3KEBA 2PUKC 3TJKA 3F4SA 2EIOA 3U5RE 4J56E 2XHFA 1TOFA 5ECLB 1XW5A 2WJUA 3L78A 3F0IA 4Q5QA 3LJRA 3M1GA 3A2VA 1G6WA 1H75A 1F3AA 1T4YA 1ZYEA 5AISA 2PMTA 3NOFA 5HFKA 5DQSA 3TJBA 3W6GA 2BTOT 4G19A 1SKRB 4GTUA 6GSYA 2GZYA 3E0UA 2H30A 1VF3A 3GX8A 2EC4A 3IAM2 5DBQA 3APQA 14GSA 2G0FA 4DSQA 4IVFA 3FZAA 1VF4A 2VL2A 2GQMA 4OMVA 5G2ZA 1EP8A 4KB3A 4KA0A 1HNAA 1JHBA 1M7TA 1UA5A 1FVKA 4I6XA 2NBSA 5J3RA 2C0DA 4KAEA 1MTCA 2WB9A 1XWGA 1GLQA 3EVIA 2YANA 1GSSA 5IMDA 3UBLA 3TGZA 1T3BA 1THXA 5DCHA 2GQLA 1XOBA 1G6YA 2F8FA 4ZB9A 2VL2C 3BCIA 2NDOA 4IHUA 1PKZA 2LRNA 3H1NA 3KTBA 2H6XA 3FR3A 3M9KA 1N8JA 3A5WA 3NIVA 3VPTA 1B48A 1PD21 3ZL5A 2MBSA 3UJ1A 3HZ4A 1VGLA 3D4TA 3TKSA 4KH7A 4HS1A 2CT6A 2KUCA 4AGSA 2VL9A 1NHYA 1YDKA 4MJCA 2K9FA 3IAS2 4F0CA 2HXKA 2YN1A 1Y25A 2P5RA 3FZ5A 5KN0A 2ALBA 1YY7A 2XPDA 3US3A 1GSUA 1O85A 3O76A 2IJYA 1ABAA 5B7CA 4Z7XA 10GSA 1ZL9A 1WPIA 1BAYA 5D93A 3ZFBA 2F51A 5ENUA 3Q18A 3HDCA 3RBTA 5ECPB 4DEJA 3WD6A 3ZZXA 3G9BA 2K18A 2FLSA 5ABRA 4GCIA 3ZIVA 3HZ8A 4FO5A 1YZXA 3FEUA 1V58A 6GSWA 5ID2A 4BVXA 4EL1A 1R5AA 4KW6A 3GYKA 3P7XA 4YH2A 3UAPA 3HKRA 1EV9A 2VLTA 1TW9A 2ON7A 2REMA 1DE1A 3ZITA 1WOUA 2OA7A 3DVXA 1XZOA 1T8EB 2V32A 1OC9A 2HYXA 4EDZA 1XXUA 2HLSA 6GSSA 2VO4A 2H73A 2FHEA 4MZBA 1X5EA 3H8QA 4POKA 1SL2B 2WDUA 5DAKB 4K9ZA 4TRXA 1TK0B 3HYPA 2R4VA 3GRXA 1V57A 4TOPA 2WS2A 1NW2A 1AAZA 2O7KA 3DYRA 3GH6A 4EE0A 5H5SA 5A4UA 1WWJA 2DJ2A 4XS6A 4IGJA 2RUEA 2H72A 4IQ1A 1QQ2A 4MF7A 2DIZA 1K0MA 4ULXA 1K3LA 2AUVA 2HFDA 1OKTA 4NHWA 2PBJA 3I43A 1O8WA 4V1Ag 3EU4A 3VLNA 5IIZA 3QPMA 3TOTA 2AHEA 2YJ7A 4KGIA 2AJQB 5IPHA 1ERUA 2LRCA 3GHAA 1EOHA 1PRXA 5HR0A 1ACVA 4X43A 1XW9A 1GSFA 2VLUA 2FA4A 5ECHB 3E3EA 2H1GA 5D96A 2CX4A 2M80A 4N0ZA 1SL0B 1A0RP 2BMXA 1TP9A 4IELA 4K8MA 3F4RA 1TK5B 4YQVA 4NV2A 4TVEA 2XPEA 4V2MA 4MZWA 1O81A 2H0IA 4G2EA 4I5QA 4Q5NA 4AJ7A 4KDXA 1BEDA 5EL8A 3F9UA 1Z3EA 3APOA 1B9YC 3LSZA 5IOXA 4HZ2A 4NWYA 3JCML 3CBUA 1A8LA 3O6TA 3TJJA 3GSTA 3IPZA 5H5RA 2R3XA 3U6VA 4EC0A 3F6DA 5D9TA 5KN2A 3DGQA 5LNKe 2ZNMA 5CRDA 1O73A 3HXSA 1YF0A 3GL5A 5EVOA 4WXTA 2OADA 3QFAC 2C3TA 4ZIJA 4EKZA 3C1RA 4KSOA 2H0HA 4OO4A 3PINA 2IMIA 1PA3A 4IJ3A 1AQWA 3HD5A 1SJ6A 3S9FA 1DSBA 4L0WA 3CSIA 4PX1A 1WRYA 3UARA 4RI6A 3G7YA 2V6KA 2CAQA 4X0XA 1MEKA 2X8HA 4F0BA 3ME7A 1GL8A 4D73A 1GTIA 2KLXA 1X5DA 4KX4A 4EDYA 2AYTA 2L4CA 3TKSE 2YWOA 4MF5A 1K0BA 1HNCA 4BL7A 1Y6EA 3IBHA 4IP1A 2R6KA 4V2LA 1XFLA 1J0FA 3KMOA 2LKUA 3IXRA 1R4WA 5CRHA 5IQYA 5LCZA 3FZ4A 4HQZA 1PL2A 4I2TA 1ZOFA 4KCAA 1YJ6A 3TRQA 3LFLA 2WGRA 2CVKA 2HRFA 3HVXA 1TU7A 2QC7A 1YKAA 2N5AA 4AJ6A 3KD0A 4OFMA 4YAPA 4POMA 3G7JA 3HCZA 3J7Yk 1JLWA 2LJAA 2K6VA 3P2AA 2CA8A 4GWRA 2YZUA 5HFGA 4ECJA 2YV7A 1XW6A 4JR4A 5DAKA 3HJOA 3W8SA 1SD9A 2MZCA 3MNGA 2DMLA 4GRFA 2B5EA 5DCGA 4OFNA 4XHMA 5D9XA 3KIJA 1IYIA 2HT9A 1OC3A 3GH9A 1O6JA 4BWQA 1FB0A 5G1LA 13GSA 1EWXA 4PXOA 3LYPA 3UMAA 1M9BA 2M72A 5DJMA 4KSMA 1AW9A 2K8VA 3RPPA 1T7PB 1URMA 2FWEA 1EP7A 1MD3A 2YZHA 1U87A 3CTFA 2KP2A 3TB2A 4MJAA 4O7HA 4EXJA 1V98A 2H01A 4L5LA 2A4VA 2L5LA 4LMVA 2ES7A 4QL7A 1QGVA 3KJYA 4FIWA 4ZL9A 22GSA 2HI7A 3C71A 3E9JB 4N0VA 5COHA 1QXHA 5J41A 2MBTA 4NV5A 4QL9A 2H0GA 2MMAA 3F6FA 4V2NA 4ZILA 3ZVJA 1OAZA 3ZMKA 2PERA 2HZEB 3GNJA 2F3MA 3RHCA 5IM9A 2N5FA 4HZ4A 4O32A 1U6TA 2MMZA 1FVJA 5FHIA 1KTEA 1SJZA 4ML6A 3TKPA 2F9SA 1AIUA 3VWVA 3WYWA 2R2JA 2B3SA 3ERFA 2A2SA 3HJMA 4WEYA 4PGTA 5IMCA 5HQPA 1Z6MA 1V9WA 1QMVA 4G10A 4WETA 1X5CA 2L57A 2XBQA 4PQIA 2FNOA 4LMWA 3WGXA 3H93A 4J57E 2LTKA 3G7IA 4K1FA 2VIMA 2VCQA 3GMFA 1THOA 3GTUA 1OE7A 3I6AA 2LQOA 2I9HA 3C7MA 5E59A 1GTUA 5IO2A 3PR8A 2DJKA 1XBSA 4JRRA 1OC8A 3RHBA 1ML6A 4IKHA 2E7PA 1CQHA 1MDKA 3CRTA 2FWFA 4HEA2 5JWQB 3D4MA 1ERWA 4JU5A 4OO5A 5L71A 3UVTA 3ZLPA 5AIXA 1V40A 3TKRA 1W89A 2F8AA 4ZB6A 2OE3A 2P5QA 4WR5A 4EVMA 1SK0A 4IQAA 1SYXA 1K3YA 3QMXA 1R5PA 2FY6A 4HU9A 1XWAA 2IFQA 4POBA 4TR1B 3TJFA 2H75A 2G2QA 3UEMA 1GP1A 1EZKA 3IV4A 2C0GA 5DQYA 1K0NA 5DJLA 1NHOA 4DVCA 5DALB 2GLRA 2PVOC 3UOMA 1BYEA 1U3IA 1SK2A 3HVVA 2P0GA 4EO3A 2O89A 1ZZYA 3UVHA 3NZNA 1IYHA 1EEMA 2IL3A 3TCOA 4HOJA 2M46A 1K0OA 3CSHA 5F8BA 1SL1B 2GVPA 3FR6A 5IO0A 2FD3A 1K0CA 3CRUA 4XRDA 1G7EA 1GH2A 4K6XA 1T00A 4HUAA 4HU7A 18GSA 3HHVA 2GZZA 4WF4A 2TIRA 4NAXA 4GQCA 3O3TA 3KP8A 3TKSC 4XS4B 4P3YB 3WT1A 1FB6A 2L59A 2JZRA 5CAXA 2E2MA 1FG4A 4F2IA 2PVQA 1B4PA 1TI1A 2L4QA 1N2AA 2GZPA 2C80A 4H86A 1AUCA 3GN3A 2VCXA 3Q6OA 5ECRB 4OCFA 3F4TA 2RIIA 3GV1A 3RAZA 3EC3A 1J9BA 4K7IA 1RQMA 1GNWA 2C3QA 1VF2A 3CSJA 3IHQA 3GKXA 4TKYA 5GZZB 2DC5A 2FUG2 1X9MB 4XRAA 5A4VA 2HSHA 2OKAA 3BD2A 3LORA 3DKSA 3MSZA 3ZFLA 5IMFA 3LYKA 2B1LA 2B1KA 5GAPD 3GL3A 5F0GA 1SK1A 2WRTA 4MLYA 3SWLA 5KN3A 1F3BA 2GSSA 4ZXGA 3IR4A 4JR6A 1S3AA 2XC2A 8GSSA 4EUYA 4N11A 1XOAA 3SBCA 1A8YA 3F3RA 3VI7A 4PURA 16GSA 2HZEA 4F82A 3IOSA 2GT5A 3V1WA 1RK4A 5FT3A 4NHZA 1F6MC 4K7NA 6GSXA 5IMVA 3A2WA 3GX0A 3M9JA 5F07A 2DJJA 4PQ1A 5ECOB 4MA9A 3DMLA 4TW5A 1ON4A 1M2DA 1TRUA 4L8EA 2X8CA 2VOCA 1K0AA 2R5GA 1TRSA 4K0NA 5ELGA 4K2DA 1Z5YE 1Z7RA 3UL3A 1KBNA 5H5QA 3L4NA 2DSAA 4YQMA 3MWHA 3MAKA 2GT6A 2VD1A 4GSTA 4MZCA 4WBJA 3H79A 4HI7A 2I81A 3L9SA 1SU9A 2JSYA 5ECSA 2AV4A 5ECQB 4RQRA 1HQOA 1PN9A 2IMDA 4XIHA 1XWCA 2OBKA 1GULA 3DXBA 5JWRB 1GTAA 4L5OA 4FH8A 1FW1A 2VD0A 4IS0A 2YWNA 3A3TA 2YOIA 4GSSA 4AJ8A 4IJIA 5CRWA 4FYUA 2GQKA 5D73A 2V41A 1TTZA 3D22A 4KNDA 3HJPA 1QK8A 2H1AA 2VM2A 5A4WA 1TJDA 4I97A 5CP1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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