4MZCA

Atomic resolution structure of pfgrx1
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
106
structure length
105
Chain Sequence
EAVKKWVNKIIEENIIAVFAKTECPYCIKAISILKGYNLNSHMHVENIENPDMANIQAYLKELTGKSSVPRIFINKDVVGGCDDLVKENDEGKLKERLQKLGLVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Glutaredoxin
publication title Atomic resolution crystal structure of glutaredoxin 1 from Plasmodium falciparum and comparison with other glutaredoxins.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 37
structure length 105
sequence length 106
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2013-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mzcA00
3ZITA 2K18A 2VCXA 1M2BA 4G2EA 4MF5A 1TRVA 2GT5A 3CYNA 2TRXA 1EP7A 2H6ZA 2KP1A 3IR4A 3WGDA 1RK4A 2EIQA 2PGTA 3UBLA 4BA7A 17GSA 3GFKA 3DVWA 1XWCA 1U87A 4KAEA 1ZCPA 1HNCA 4JU5A 1FVKA 1V9WA 2H73A 11GSA 1A2LA 5F05A 4N30A 2PPTA 2K9FA 1QUWA 2LRNA 3BOAA 2VL9A 4NV5A 3LXTA 1MTCA 5ELAA 2LTKA 3HJOA 2N5BA 1S3CA 1PKWA 4FH8A 3ZVJD 2YWNA 1A8YA 3EVIA 3KP9A 1XOAA 2JACA 2IL3A 3C8EA 4TR4A 3ZMKA 5CO3A 2I3YA 2EIRA 3KGKA 4EE0A 1Z7PA 4OMVA 3IAS2 4KDUA 1OKDA 5B8AA 1K0DA 5AISA 4MLYA 1EOGA 3LG6A 1PMTA 4CDOA 5KN0A 2LNTA 1GNWA 1E6BA 3H1NA 2QSIA 3O76A 4V2MA 3KCMA 2C4JA 4IBPA 1SKRB 5DALA 1VRSD 1SL0B 1YJ6A 2ON5A 3GYKA 1LBKA 5ABRA 5IMDA 2OKAA 2JSYA 1VGLA 20GSA 5KN1A 2C0EA 3FR6A 1SJIA 2B1LA 3CTFA 5E59A 3BD2A 2WRTA 2OA7A 3VPQA 4Z7XA 4KA0A 1WJKA 1FB6A 4KE3A 3BJ5A 2WULA 1M0UA 4JR6A 2V2GA 4PXOA 2N5FA 2NBSA 2F3MA 1JLVA 3KJYA 2VL2A 5ENUA 2LEGA 2GLRA 3DXBA 5LD0A 2REMA 2HI7A 1ZYQB 3KZQA 5KEJA 3ERFA 1YF0A 2NDOA 2FLSA 4MJCA 2X99A 3US3A 3MDKA 1Z7RA 4AJ7A 2C1YA 5KN2A 3DWVA 1SK0A 4DVCA 3Q18A 4ZL8A 3LXZA 4YQVA 1TI1A 2YWMA 3IRAA 5G5FA 1SD9A 1GSUA 2O85A 3GHAA 1ZL9A 1TW9A 4GF0A 3KEBA 3KTBA 2B7KA 4RQXA 3D0ZA 6GSUA 3PINA 2HSYA 4TKYA 3HDCA 3GN3A 4HZ4A 2C0GA 2FCHA 2AB6A 2F8FA 1EEJA 1X9SB 3LYPA 1ON4A 5EVOA 5J9CA 3TOTA 4HDEA 5GAND 1SU9A 2CX4A 3EINA 3QAWA 4WR4A 2VIMA 2C3QA 2GQLA 3D4TA 1SENA 5DQYA 6GSSA 1B48A 1R7HA 1TJDA 2YV7A 3GSSA 1GP1A 3ZFBA 4ZB8A 1SKSB 2CA8A 1BX9A 1PL1A 2LJRA 3HZ4A 6GSWA 2B3SA 5IM9A 2RLIA 5A4VA 4XS4B 4N11A 2VCTA 4AGSA 1NHOA 3DGQA 3EYTA 2HXKA 4GRFA 2IFQA 2Z9SA 4HI7A 3RDWA 1ZYEA 1KNGA 5FT3A 2WCIA 1WOUA 2L4QA 3IC4A 3RPNA 1H75A 3TKSC 4L0WA 5DBQA 1WWJA 3RHBA 1XW6A 1FAAA 4MJAA 4PGTA 1GSDA 2TIRA 2FA8A 5ECMB 1PSQA 2CT6A 5DJLA 2N5AA 2G0FA 1AQXA 1GTBA 3O3TA 3DMLA 1A2MA 3GSTA 2H8LA 2F51A 6GSXA 4N0ZA 3DVXA 2RM6A 5ECKB 1X9WB 5CRGA 5G31A 4MZWA 1YY7A 4K0NA 4ZILA 2R3XA 3F4RA 1A2JA 4IP6A 3LSZA 1G6YA 1JFUA 2KUCA 1EOHA 3CXGA 4HJMA 1K0OA 2FY6A 3GIXA 3ED3A 2OE3A 1OC9B 1AAZA 1F2EA 3UIWA 5ELGA 3LJRA 2X8HA 2AAWA 1SYRA 2VCWA 1NM3A 4Q5NA 1JZWA 13GSA 3TJFA 2H1BA 4G19A 4MDCA 2IWTA 1V57A 4FYCA 2TRCP 5H5QA 4K2DA 3RBTA 2YANA 4LMWA 3EE2A 4TR1B 1YKCA 3GKMA 3HJMA 1U88A 4XS4A 5IMCA 4QL9A 1F37A 2V32A 4F2IA 3TKSE 5IOXA 1MEKA 5DDLA 3DEXA 2XBIA 1VF1A 5IMZA 5AGYA 3EMPA 2RUFA 3QDNA 2MMAA 4YQMA 9GSSA 4IQAA 1SJ6A 1SK1A 1K3OA 2H1AA 4GCIA 3C7MA 2DJJA 1UC7A 1HQOA 1T7PB 1A8LA 4DEJA 2XC2A 2GVPA 2NPBA 5C00A 2OE0A 1GSEA 1VF4A 1EGOA 2BJXA 2MMNA 4ILFA 1AQWA 2JSZA 3UVHA 1F9MA 3FHKA 1QXHA 3O6TA 3ZYWA 5CRWA 1TU8A 1ZGNA 5LNKe 2HNLA 1Q4JA 4DSSA 5IO0A 5ECPB 2XHFA 2GSTA 5DAKB 4AJ8A 1GTIA 3VI5A 3J7Yb 1OC9A 4EL1A 4KX4A 1XXUA 4V2NA 1XBSA 3SBCA 1FOVA 2C80A 4X1UA 4IJIA 1A0FA 1AW9A 3IPZA 2LRTA 4GQCA 3C1SA 5CRHA 1GH2A 4MA9A 4KSMA 2H0IA 4EXJA 4TVEA 2DMMA 5HFGA 4TR1A 4BPYA 2I81A 2H75A 3A2XA 3EC3A 2CAQA 3IA1A 4GLTA 2YZHA 2HZFA 3G7YA 3HCZA 3DKSA 3EURA 2ZCTA 2MYGA 1T1VA 2DJ1A 4PNGA 3L0HA 1U6TA 3RPPA 1K0AA 4KW6A 2WJUA 5IMFA 3M0FA 3HYPA 1LU4A 1XWBA 3KM6A 4ML6A 1TU7A 4BWQA 2R6KA 1GTAA 3HVVA 3F9UA 4JR4A 3TKSA 1R5PA 3D21A 3ERWA 4PURA 1HNAA 1XPVA 1K0CA 3CBUA 5D9XA 1V98A 3FZ5A 2C3NA 3AY8A 4EC0A 2GSQA 5IPGA 5ECHB 2P5QA 3H93A 4KGIA 1FW1A 4WEYA 2HLSA 1XVQA 3TKRA 4P3YB 1J08A 2OBKA 5GZZB 4FIWA 2ON7A 2CZ3A 2DJ2A 1MD4A 1NW2A 1GTUA 2X64A 2G2QA 5DAKA 2L6DA 4V1Ap 2GS3A 4MMMA 4HU7A 2E0QA 1Y6EA 4GSTA 2ALBA 3P7XA 2YWOA 1GSQA 3BBYA 2QC7A 2DC5A 1K0NA 3KP8A 16GSA 2VCZA 4I6XA 2H72A 1A23A 1CQHA 3QMXA 4ULXA 3QPMA 2RUEA 3FZ4A 2GGTA 8GSSA 4XCSA 4ECBA 1QQ2A 3IHQA 2JL4A 3D4MA 5FWGA 4WETA 3GURA 3TDGA 2BMXA 3TKPA 4F82A 3MNGA 3GV1A 7GSSA 2EIOA 1G7EA 4IP1A 1ERWA 5LCZA 1K0BA 3L4NA 2YV9A 1PL2A 4JEDA 1PN9A 3ZIVA 5ECOB 1URMA 2ZNMA 4HUAA 1DSBA 1YEXA 4IW9A 1USBA 3NOFA 1OAZA 2V1MA 3VWXA 3VWWA 4XTSA 4NMUA 4FYBA 3APOA 3GUSA 1X5CA 4ZBDA 4O32A 4JZQA 3WGXA 2HZEA 3DIEA 4K1FA 5DJMA 2MZCA 2KP2A 3KXOA 3TCOA 2L6CA 2JZTA 1GL8A 4IN0A 1Q98A 3TOUA 2A4VA 1GSSA 4LL4B 3F3RA 3N9JA 2VM2A 1GUHA 2YNXA 3VK9A 3F4SA 3ZIJA 1XFLA 3D6IA 1TP9A 4MPGA 5A5KA 4ECJA 5HFIA 1HD2A 2HSHA 3FEUA 2GZPA 2NVLA 4LA1A 2IJYA 5D8IA 1XIYA 2X8CA 3FRCA 4WR5A 1AUCA 1OKTA 1VF2A 2I1UA 3ZL5A 2GSSA 3CSIA 3F3QA 1Y25A 3KTLA 4POMA 4PQIA 4OWYA 4KNDA 5H5RA 2V6KA 1M99A 6GSTA 1OE7A 4WXTA 4EDYA 3U5RE 4OO5A 1EP8A 1YF1A 3HA9A 3IXRA 3VI7A 1WPIA 1XWKA 3UARA 2GDRA 2O89A 3WT2A 5J41A 5D73A 3P8WA 5JWOB 1X0RA 1O6JA 4ZL9A 3TJKA 4QQ7A 1I9DA 3TB2A 3HZ8A 3NZNA 3A3TA 4HU9A 4L8EA 3IV4A 4MJEA 5ECSA 5AN1A 3H79A 4OFTA 5JCWA 1CQGA 3LFLA 5DCHA 1S3AA 4MZCA 3I69A 3Q6OA 1PGTA 2HE3A 4MH3A 14GSA 4ECIA 3L78A 4Q5FA 3GRXA 4EF0A 3GH6A 4KCAA 2RIIA 2FWEA 2PU9C 2HFDA 2YJHA 4OD7A 4KB3A 1G7OA 2LKUA 4K9ZA 4POKA 2I9HA 4LLRA 3GMFA 1K0MA 5GSSA 4KDYA 3WD6A 1SK2A 2M46A 2AV4A 4KSOA 1V2AA 4F0CA 4KH7A 1JLWA 1GRXA 1ILOA 2O87A 2H6XA 2YPMA 1GWCA 1TDIA 2GZYA 1WE0A 5A4WA 4YH2A 2DJKA 1ACVA 2H30A 3LORA 1NSWA 1WMJA 1KTEA 2IMEA 1JZDA 3F4TA 3TGZA 3C73A 3A5WA 1XWAA 2H1DA 2IN3A 4FO5A 2VAFA 4WKWA 2FWHA 2L59A 3P90A 1EV9A 1AQVA 1THXA 5D9WA 3V1WA 1XVWA 4HOJA 2R37A 1S3DA 4TXOB 1X9MB 5B6NA 4XRDA 3QAVA 3J7Yk 1J9BA 5L71A 4MPFA 1Z5YE 5EPFA 1EV4A 4MZBA 4K8MA 5F0GA 2CVDA 2K8VA 3QFBC 2VCVA 4XS6A 2FD3A 4K7IA 4PQ1A 4OFMA 3MAKA 2L5LA 3I43A 4I5QA 1U3AA 2FNOA 1BG5A 5G1KA 1BYEA 5JCGA 4O5RA 1B4QA 3QCPA 5ID2B 4IJ3A 1A24A 4ZBBA 3TJBA 4Q5RA 4J56E 3TUEA 2M72A 4BWSA 2CVBA 4I2UA 3GX0A 1ZMAA 5B7CA 10GSA 3RAZA 2B6MA 5J9BA 4X43A 3I9V2 1TI3A 1MDIA 2FA4A 3TRXA 3IBHA 4GQFA 2DIZA 5CP1A 2R4VA 1WRYA 5AIXA 1IYIA 4BVXA 5B8BA 1V40A 3UJ1A 2QKEA 4OO4A 2DJ0A 2R5GA 5D96A 1VF3A 3M3MA 2J23A 2KLXA 3IE3A 3DD3A 2VLVA 4ID0A 1M2AA 2XPEA 4NWYA 2K6VA 3ZRDA 5HR0A 1TK8B 4L0UA 3F8UA 2A2RA 1TRUA 5JCUA 4TXVA 1I5GA 4I2TA 2H0HA 5F8BA 1SL2B 2GTUA 3VPTA 4TXOA 3W6GA 2LS5A 2IMFA 3BCIA 2IIYA 1W4VA 3U6VA 2H6YA 3LGCA 1PA3A 3Q74A 2WS2A 1PX6A 1ERVA 3WGEA 4CW9A 4E8HA 3QD9A 3HKRA 2H70A 3I6AA 2VD1A 1QFNA 3IK9A 3FZ9A 2JU5A 2QGVA 4IGJA 3CMIA 1GNEA 4IS0A 5DCGA 3GL5A 3UAPA 2PUKC 3VLNA 2VLTA 1TKDB 2MBSA 4ECCA 4LL1B 4G10A 3UVTA 5IMVA 1G0TA 4XHMA 1WIKA 1GSYA 2AHEA 3CSHA 2DSAA 3H8QA 1ST9A 4FYUA 1H4OA 3DYRA 4XIHA 5ECRB 4I97A 1T00A 3PH9A 1K3YA 1R5AA 2MMZA 3C71A 4MK3A 4GSNA 2JADA 1BQ7A 1SKWB 3G9BA 4IHUA 1GUMA 4GXZA 4OCEA 2AUVA 2CV4A 4L5LA 5HR1A 4ACSA 3VWUA 5F07A 4EKZA 5E4WA 5CRDA 5HFKA 3UOMA 1X5DA 1UA5A 1QGVA 2HT9A 1J0FA 1AC1A 4IKHA 3G7JA 2F8AA 5J4UA 1SJZA 1UVZA 1TRSA 3GX8A 3TKQA 5ECNB 3FYGA 5GAPD 2VOCA 2NTOA 2H66A 2IPAA 3KH9A 1AXDA 5D9VA 1EGRA 4HJ2A 3UMAA 1GULA 1F3BA 4PX1A 2CQ9A 3VURA 1PRXA 1BJXA 4QL7A 3CTGA 2XPDA 3D22A 1RQMA 3GKKA 4CHSA 2RM5A 1ML6A 1Z6MA 4HQZA 3UL3A 3GH9A 2LJAA 1WP0A 3P2AA 3VFIA 3IDVA 1FO5A 4HQSA 1FHEA 1O85A 3ZLPA 5IIZA 5D93A 5DALB 1MDJA 1YEPA 1IYHA 3HVSA 4TR3A 3IAM2 3L9UA 1M9BA 3CSJA 4IVFA 3K8NA 4NXIA 2VL3A 1R26A 5CAXA 3GKXA 2L4CA 2YN1A 4ZB9A 2P5RA 3M9KA 4TR0A 2MMOA 4ISDA 3DRNA 1XWGA 1M9AA 4LMVA 4ZBAA 3F63A 1ZOFA 1PQNA 1QK8A 3KIJA 1SYXA 2CVKA 3KD0A 2E2GA 3F6FA 3IK7A 1O8XA 2I4AA 3CRUA 1T4ZA 2JZSA 4JRRA 4EVMA 3WYWA 3HJPA 3HHVA 3QAGA 1M2DA 4PUFC 4TRXA 2C0DA 2YOIA 2GQMA 1B9YC 4MF6A 2LRCA 4PQHA 2VD0A 1OVNA 1K3LA 5EY6A 2V6OA 3APSA 2FUG2 2WZ9A 2PVQA 1Z6NA 12GSA 4YAVA 4HS1A 2PMTA 2MBTA 4L5OA 2H1GA 5IQYA 3F0IA 2B1KA 4ZIJA 3G7IA 1MDKA 4Q5QA 4JE1A 1TRWA 3W8SA 2OACA 3ERGA 4I8BA 4F03A 1HNBA 3TRQA 1TOFA 1NHYA 1Z3EA 4H86A 2GSRA 3UEMA 5HR2A 2EC4A 3C1RA 6GSYA 2C3TA 3JCML 2YCDA 2H76A 1DBYA 3IOSA 5HQPA 4JBBA 1XW9A 5C04A 2DBCA 4WBRD 5JWRB 2OJLA 2CZ2A 19GSA 2FWGA 4N10A 1XCCA 3GA4A 4YQUA 3HD5A 4IELA 1SL1B 3KMOA 2VUPA 2IMDA 5J3RA 4ZB6A 3NIVA 1OC3A 2C8UA 3MWHA 4DSRA 4K0GA 2P0GA 1SD8A 1ERUA 2YWIA 2O7KA 1THOA 1E2YA 4RI7A 4YAPA 2HRNA 5J5NA 1M7TA 4IQ1A 3E9JB 1YDKA 2B5EA 5JWQB 1X5EA 4K6XA 4GTUA 1G6WA 4OCFA 2IFQB 2KHPA 3HY2A 4X0XA 5COHA 1YKAA 1DE2A 2J9HA 5G1LA 2ES7A 4V1Ag 3MSZA 2OE1A 2YP6A 3F6DA 4MABA 3GNJA 1LJRA 5IOWA 4HZ2A 1HYUA 2C0FA 1F3AA 2IMIA 4EO3A 3QFAC 1PKZA 22GSA 3ZMLA 3E3EA 2LSTA 4POBA 5DVBA 3D5JA 2GQKA 4KDXA 3PGTA 1C72A 4O92A 1N2AA 1TK5B 5G2ZA 3KMNA 4N0VA 4TN8A 1EWXA 2BTOT 1W89A 3M8NA 2ZUPA 4PNFA 2JZRA 3ME8A 4TW5A 1JHBA 3A2WA 3LEFA 2WB9A 4MJBA 1R4WA 1AIUA 3PR8A 1XZOA 1V58A 4D73B 1BAYA 6GSVA 2LUSA 1RW1A 3HXSA 4MF7A 5D9TA 4ZL7A 5G5EA 5G30A 1O81A 3WT1A 2H0GA 5IMAA 2IMKA 5DQSA 3RHCA 1GLPA 4BVYA 2WGRA 1FVJA 1OC8A 3TJGA 2VM1A 2OBIA 2PN8A 1B8XA 18GSA 3ZVJA 2H19A 3SWLA 2LJKA 2DJ3A 1QMVA 4K7NA 5ECQB 2XBQA 4POLA 2AYTA 4XS1A 1DE1A 3A2VA 3GTUB 3ME7A 2R2JA 5F06A 2B7JA 1PX7A 2DLXA 5CREA 2FGXA 4NHZA 4TOPA 3FZAA 2PERA 4DSSB 1GSFA 1EEMA 2YZUA 1PD21 2V41A 1F6MC 2FWFA 1TTZA 4DSQA 3ISOA 4GSSA 3HVXA 1TXXA 3W8JA 4BL7A 1O73A 3FR3A 4AJ6A 2LNSA 3GKNA 2D2ZA 2DIYA 3OR5A 1KBNA 2B5YA 1OYJA 2OADA 2PWJA 4E8EA 1T4YA 2X8GA 1MD3A 1XW5A 1XOBA 3ZTLA 3ZZXA 2A2SA 3ZREA 3EU3A 3LYKA 4D73A 1JZOA 4GWRA 4ML1A 3S9FA 1B4PA 2GT6A 3FW2A 4MP4A 3M9JA 2L57A 2E7PA 3FR9A 2M80A 2LQQA 3TJJA 2O8VB 2B5XA 5CYYA 4F0BA 4NPBA 2K8SA 3TRPA 5A4UA 1ERTA 4RUVA 3LQ7A 5H5SA 2P31A 5AIVA 5EL8A 4EUYA 2DMLA 2L5OA 5ID2A 4ZXGA 5FHIA 2H71A 3EMXA 1B9XC 4KUNA 4NAXA 4WF5A 5INYA 2PBJA 2LV3A 3VWVA 4KCEA 4MCUA 4MH2A 2E2MA 4WF4A 1GLQA 3LWAA 1N8JA 4NHWA 5CNWA 1TK0B 3UBKA 3GTUA 4PUAA 1JZRA 2H74A 3E0UA 3L9SA 2LQOA 5GSTA 5B6MA 1Z9HA 2VLUA 2F9SA 1O8WA 1A0RP 1ZZYA 1OE8A 1YQ1A 5HR3A 1BEDA 2PVOC 5ECIB 4EDZA 1KEBA 4XRAA 3FKFA 5IO2A 2WDUA 3FY7A 4OFNA 3GL3A 3KH7A 1FB0A 4HEA2 4WBJA 1O7UA 3FK8A 1GUKA 3QR6A 2H01A 2GZZA 4RQRA 2VL2C 3CRTA 3APQA 1T3BA 2FHEA 5IPHA 1FG4A 3R2QA 2HYXA 4O7HA 3N5OA 3M1GA 2WFCA 1UN2A 1DUGA 5KN3A 1ABAA 4V2LA 2VO4A 3EWLA 3Q19A 4J2FA 2YJ7A 2KOKA 2VCQA 3BCKA 1EZKA 4NV2A 3EU4A 5ECLB 4AF2A 4F9ZA 1U3IA 2CAIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
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