3TUEA

The structure of tryparedoxin peroxidase i from leishmania major
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
166
structure length
166
Chain Sequence
GNAKINSPAPSFEEVALMPNGSFKKISLSSYKGKWVVLFFYPLDFTFVCPTEVIAFSDSVSRFNELNCEVLACSIDSEYAHLQWTLQDRKKGGLGTMAIPILADKTKNIARSYGVLEESQGVAYRGLFIIDPHGMLRQITVNDMPVGRSVEEVLRLLEAFQFVEKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structures of the tryparedoxin-tryparedoxin peroxidase couple unveil the structural determinants of leishmania detoxification pathway.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Leishmania major
molecule keywords Tryparedoxin peroxidase
total genus 54
structure length 166
sequence length 166
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2011-09-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3tueA00
2DC5A 3RAZA 3TKPA 3SWLA 5DJLA 3IXRA 2X8HA 4NV2A 1V98A 2TRCP 2V1MA 1PGTA 3GTUB 1IYIA 1XW5A 4O7HA 2H1BA 4F82A 1YF1A 3GKKA 5ECRB 1NHYA 4QL7A 1VF3A 1XVQA 2C0DA 2R5GA 4EO3A 3FY7A 5AGYA 2FWGA 2DBCA 1M9AA 3O3TA 3TJJA 3EWLA 3KXOA 3NOFA 4K7IA 4ZXGA 2L6CA 1EV4A 4MH2A 1UC7A 5KEJA 2WULA 2PVQA 4HJ2A 6GSUA 3IV4A 1VGLA 3ZIVA 2RUEA 1G6WA 2KP1A 2FWHA 5LCZA 2AB6A 1OVNA 2YN1A 2OBIA 4MABA 2JZTA 3DXBA 2K8SA 2MMZA 2N5BA 3ZMLA 1PL2A 1K0MA 2JSYA 2XPDA 1LJRA 4E8EA 1YKAA 2B1LA 3FR9A 2H1DA 5D9XA 3EMPA 3D5JA 3A2WA 5ID2B 2B5XA 2FA4A 3M8NA 4NMUA 4MP4A 5KN3A 3KJYA 2OE0A 5DCGA 3UL3A 4JR4A 2YWNA 3VURA 1ZYQB 1Q98A 3R2QA 2CVBA 5F0GA 2DJ1A 4V2LA 1AQWA 2HI7A 1PX6A 1JZRA 4AF2A 2H1GA 3QOUA 3WGXA 4XIHA 1GSQA 6GSXA 1R4WA 2XBQA 2FHEA 1AUCA 3F0IA 2EIRA 3P2AA 4TOPA 4OCEA 2PGTA 4GF0A 3HZ4A 3LFLA 3FZ4A 3C7MA 2FCHA 3LXZA 3HYPA 2IN3A 1S3AA 3CXGA 4IJIA 2FNOA 1BEDA 3APSA 4FO5A 1OYJA 4TKYA 4IVFA 2DJ2A 4L0UA 5GSSA 4HUAA 4BL7A 2IL3A 1OC3A 5B6MA 3ZVJA 4YQUA 2GQKA 1X9MB 1NM3A 3RDWA 2YOIA 1XXUA 1K3OA 2N5FA 4LLRA 1JZWA 2P5RA 1WOUA 3PGTA 1JFUA 3DMLA 1K0NA 4BPYA 4EDYA 4TR4A 1A8LA 3HJPA 3UMAA 1MDIA 1FO5A 3F6DA 1GULA 1ABAA 4GQFA 4Z7XA 2LV3A 4OO4A 2C4JA 3DVWA 4BWQA 6GSTA 4KE3A 1XCCA 5F05A 4ZILA 1SL2B 2YV7A 3MWHA 1TK5B 2LQOA 1EP8A 2MBSA 3IPZA 4LMWA 1YQ1A 1UA5A 4DSSA 5HFIA 2CZ3A 14GSA 1QK8A 2Z9SA 1WRYA 1JLWA 1YKCA 3U5RE 1GUMA 4TVEA 4K7NA 4AJ8A 2GSTA 2TRXA 1GWCA 2QGVA 1SJZA 6GSWA 1QUWA 2IMKA 2VL9A 1K0AA 2GT6A 2IFQB 3A3TA 1MEKA 4KAEA 5KN0A 3N9JA 5IPHA 2VLTA 3IRAA 2GZYA 3CYNA 3HDCA 1TP9A 4MJCA 4PNGA 1TI3A 3IAM2 3ME8A 5ECNB 3KZQA 2OACA 4HZ2A 3GSTA 3UJ1A 2HE3A 4P3YB 4KW6A 2XBIA 3WT1A 4IELA 3UIWA 1TRWA 1HD2A 3MDKA 3G9BA 2AAWA 3GUSA 1FHEA 1SKRB 1TK0B 2GVPA 2CAQA 4OWYA 4RI7A 4OFTA 1BYEA 2L59A 3VWXA 1M2DA 2DJ0A 2LNSA 2K9FA 4NHWA 1A2LA 1O6JA 2EIQA 1ZCPA 3DEXA 2PPTA 2E2MA 4TW5A 2KUCA 1WP0A 4ML6A 4MA9A 4FH8A 4EXJA 4BVXA 2PERA 1ILOA 3TJBA 22GSA 4G2EA 4L5OA 3TRXA 5IOWA 2FGXA 3FW2A 2RIIA 3IC4A 4KSMA 3KGKA 4ECCA 5CRGA 3QMXA 2O7KA 1VRSD 5ELAA 4HJMA 1SYRA 5AIXA 2DMMA 4TR3A 1JHBA 4TR1A 2H74A 1F37A 4JU5A 5ECIB 5IM9A 4V2MA 1ERTA 3W8SA 1FW1A 4I97A 3PH9A 3BCIA 19GSA 5H5SA 1O81A 2E0QA 1F9MA 5G5FA 2K18A 4KCAA 1SK1A 2V6KA 2H6XA 1I5GA 4WR4A 2H70A 5DBQA 1Y25A 1TJDA 3FYGA 2M72A 3EU4A 4G10A 3I6AA 3RPPA 4FYUA 4O92A 2HSYA 4G9HA 1SK2A 3HVVA 2H0GA 5CO3A 3ZMKA 3C1SA 4WBRD 2XPEA 3IE3A 1EZKA 2MMNA 3GURA 5ECHB 5D93A 1AXDA 4MPGA 5EVOA 1THOA 3QD9A 5ECLB 2VLUA 4WR5A 2H30A 2PVOC 1KTEA 3GL5A 2QC7A 1BJXA 1O8XA 4NXIA 3EMXA 1ZZYA 1YEXA 4PUAA 3HY2A 3EU3A 2C0GA 5ECKB 5ECPB 4K1FA 8GSSA 4NAXA 4EF0A 3ZTLA 3BD2A 5ECMB 1GL8A 1OE7A 3N5OA 1OC9B 2WB9A 4OMVA 4CHSA 3I9V2 18GSA 2IIYA 3P8WA 3FEUA 2GSRA 3E3EA 4NV5A 1T1VA 1XWKA 3TJGA 1XOBA 3CBUA 3WD6A 2PU9C 3IDVA 3TJKA 2L57A 3ZFBA 4NPBA 2LSTA 3EE2A 1IYHA 3TKRA 4KDXA 3ZITA 4ECJA 2ES7A 2JZSA 1JLVA 3LYPA 2VL2C 3KD0A 1G7OA 3APQA 2VM1A 1HNCA 2MZCA 4XRAA 5DVBA 2VL2A 2C0EA 2WRTA 2JSZA 4MH3A 2C1YA 2H6YA 2A2RA 2IWTA 1TRUA 4RQXA 4YAPA 3US3A 3AY8A 2XC2A 1X5CA 4PQ1A 5H5RA 2ON7A 5F07A 2CVKA 4MCUA 1SENA 4X0XA 2P0GA 1OKTA 3VPQA 5FT3A 1M99A 4NWYA 1V2AA 1T8EB 1OE8A 3UVHA 4H86A 4POLA 3M3MA 4MZBA 2MBTA 1PD21 1MTCA 3A2XA 1SD8A 3NIVA 4WEYA 3ZLPA 2PMTA 4O5RA 6GSYA 4FYCA 5J5NA 5D9WA 2WDUA 4ECBA 4IN0A 3FZAA 3GIXA 1GTAA 1KNGA 4J56E 1USBA 3GN3A 1TK8B 1B8XA 4ZBAA 4WBJA 1ZYEA 4X43A 5B8BA 1O8WA 4XS4B 4K2DA 1F3BA 5G2ZA 1TXXA 3G7IA 1V57A 3TKQA 2OE3A 3CRTA 4GQCA 3FKFA 3J7Yk 4CDOA 3WYWA 2GT5A 2VCTA 1V9WA 1TOFA 3WT2A 1SKWB 2BMXA 2WFCA 5GZZB 1J9BA 3FZ5A 1EWXA 2AUVA 2IMFA 4K0NA 2CA8A 3PR8A 2DJ3A 2R37A 1GRXA 1PRXA 2DLXA 1SK0A 2H6ZA 4V1Ag 1XFLA 4OO5A 1UVZA 3ERWA 1PA3A 2CQ9A 2VUPA 1G6YA 4HDEA 3ZZXA 2B7KA 1S3DA 1T3BA 3LG6A 1VF4A 2H19A 4GWRA 3TCOA 4HS1A 4L5LA 4EKZA 3HJMA 5ECQB 3GTUA 2LEGA 1X5DA 4KCEA 4JZQA 2M46A 1RK4A 2WGRA 2GLRA 3UEMA 3GH6A 2VCQA 2VO4A 2VIMA 2H1AA 1O7UA 2HZFA 2C3QA 2H71A 3O6TA 3UBKA 1RQMA 3GSSA 1SYXA 3M1GA 5A4VA 4N30A 4F2IA 1FVJA 3GA4A 3GH9A 1Z3EA 4TXVA 3J7Yb 4AJ7A 1O85A 2KP2A 1GH2A 2P5QA 2YPMA 1GUHA 4XS1A 1GNWA 1OAZA 3D0ZA 3LJRA 5CAXA 1AAZA 1B9YC 5B6NA 2OJLA 2C8UA 2CX3A 2PBJA 4XS6A 2NPBA 3F4RA 3U6VA 1V58A 2YWIA 3TOUA 4MMMA 3TKSE 4QL9A 4PQHA 1QMVA 4YQMA 4N0ZA 2OADA 2NDOA 4ZIJA 1W89A 1SJ6A 3EYTA 1XVWA 2VD1A 5HQPA 1DBYA 4PX1A 2OKAA 4HU9A 4O32A 5ID2A 1Z6MA 5AIVA 2VL3A 3ME7A 4Q5RA 3PINA 1PL1A 2LJAA 1TW9A 3HXSA 2OE1A 1A8YA 4I6XA 5CREA 12GSA 4E8HA 1HNAA 5IMVA 3H1NA 3C71A 1YEPA 3KP8A 3KEBA 2X99A 1A2MA 4EDZA 1YZXA 1AIUA 2D2ZA 2LRCA 3GYKA 4F03A 5D8IA 5IIZA 4GSNA 4DSSB 2IPAA 1BAYA 3QCPA 5HR0A 2V2GA 2LTKA 2HZEB 1VF1A 4OCFA 2C0FA 1SL1B 7GSSA 3EINA 1MD4A 4KGIA 2VAFA 2RLIA 5G30A 3M9JA 1R5AA 3QPMA 4G19A 3D4TA 2J9HA 2HRNA 1U6TA 4PNFA 3WGDA 1ZMAA 2E2GA 2HFDA 3UOMA 3QFAC 4HI7A 1SJIA 4MDCA 4K9ZA 1WE0A 5ENUA 1F6MC 4J57E 4V2NA 5A4WA 1JZOA 2FD3A 4IQ1A 1OC8A 3QAGA 4TRXA 1HNBA 1U88A 3HD5A 4YQVA 2V6OA 2I4AA 1ZL9A 4K6XA 2H72A 4GRFA 4ZBBA 4GLTA 2V32A 3GHAA 4MZCA 3DRNA 5D9TA 4TXOB 1PKZA 5IPGA 3C73A 2GSSA 4IJ3A 1Z9HA 1AW9A 5AN1A 1AC1A 4RI6A 3RHCA 4ILFA 5LNKe 3QAWA 1A0RP 3FZ9A 3QDNA 3H93A 4MF6A 1PQNA 1MD3A 3LWAA 4WKWA 5JWOB 5ECSA 3ED3A 3DVXA 2X8CA 3Q6OA 4KDUA 3HVSA 3UAPA 3KP9A 2IFQA 1X5EA 2JZRA 2CAIA 2J23A 1DE1A 4KH7A 3F6FA 1H4OA 2JADA 3GKNA 3CRUA 2OBKA 3KH7A 1YY7A 2AJQB 1XPVA 16GSA 4D73A 4I5QA 2VD0A 5J4UA 3KTLA 2YWOA 2FUG2 2H0HA 4LL4B 3BBYA 4ULXA 5ABRA 4ML1A 1TDIA 4DSQA 1MDJA 4XTSA 4K0GA 1DUGA 5COHA 1SL0B 2AYTA 1X9SB 5L71A 1ERUA 1GSFA 1ZGNA 5DCHA 1VF2A 3CSJA 4K8MA 5DAKB 2G0FA 1M7TA 4F9ZA 2NVLA 4AJ6A 2VLVA 1TI1A 2GGTA 3EC3A 3L9SA 5LD0A 5JCWA 1FVKA 1FB6A 3LYKA 4WF5A 3IA1A 1NHOA 1SU9A 3GL3A 4K7OA 17GSA 2JU5A 5B8AA 3ZIJA 3VI5A 2K8VA 5F8BA 1GNEA 1G0TA 2YP6A 2YCDA 2JACA 4MK3A 2YJHA 3ERGA 3VWUA 3M9KA 1EEMA 4IHUA 4IQAA 5JWQB 3W8JA 4XHMA 1XWBA 1XZOA 3ERFA 4DVCA 1FB0A 1GUKA 4MF5A 3DKSA 4ZB9A 3DIEA 2OA7A 4BWSA 4Q5FA 3F3QA 5IO2A 4KDYA 4XRDA 3KMOA 2NTOA 1M2BA 2CX4A 3W6GA 3HA9A 5FHIA 5D96A 13GSA 2FY6A 2BTOT 3CTGA 1BX9A 1EGRA 1A23A 5DALB 1XWGA 1B4QA 3D22A 1M0UA 4X1UA 4MZWA 1HYUA 3LQ7A 4MJAA 1SD9A 1FAAA 3GKXA 3BCKA 3TJFA 3F8UA 1TU7A 4MPFA 4KX4A 5CRWA 6GSSA 4PGTA 3Q19A 3LEFA 2VCXA 4EE0A 1OC9A 1ST9A 2LRNA 3D4MA 1AQXA 1WJKA 2VCZA 5H5QA 3ZRDA 4MLYA 3F3RA 2LRTA 3OR5A 5C00A 3F9UA 2HNLA 4HQSA 3APOA 4ZB8A 2KHPA 1T4YA 4IGJA 4ECIA 2HT9A 2O87A 2DMLA 5F06A 2B3SA 3UVTA 2H66A 4FYBA 1PN9A 4BVYA 1BQ7A 2A4VA 3GX0A 1PSQA 4GTUA 1FOVA 2I1UA 3MAKA 2H75A 1K0DA 2B7JA 2N5AA 3UARA 5KN2A 3L78A 3BOAA 1NW2A 1EV9A 2YWMA 1EOHA 4TR0A 1T4ZA 3IK9A 1PX7A 3D6IA 5A4UA 3VI7A 1O73A 4HEA2 4ACSA 1XBSA 3ZREA 3I43A 1YDKA 4GXZA 3FK8A 1Z7PA 3KTBA 2GQLA 3G7JA 5G31A 1GP1A 1JZDA 5HFGA 4JR6A 2ZUPA 4ZB6A 1LU4A 2L4CA 4IP1A 1C72A 1QQ2A 3G7YA 1PMTA 1GSYA 5GAPD 1R5PA 3K8NA 5B7CA 1KEBA 2PUKC 4WXTA 1OKDA 1QXHA 2F8FA 4IW9A 4MF7A 2EC4A 4OFMA 4XS4A 3GKMA 5JCUA 1W4VA 5J41A 3HZ8A 1MDKA 4JBBA 2VM2A 2GZZA 2O85A 2PN8A 3IR4A 1Z7RA 4YAVA 2B5YA 1URMA 2YANA 2CVDA 4QQ7A 11GSA 5CNWA 5DQSA 2YV9A 5G1LA 3ZYWA 3TRPA 3LSZA 3EURA 2VOCA 1X0RA 4IS0A 1XW6A 1GSEA 3RHBA 1EOGA 1ACVA 4F0CA 4PQIA 2RUFA 2DJKA 9GSSA 1TRVA 1SKSB 2H8LA 4HQZA 1N8JA 1RW1A 1J08A 5CRHA 3HKRA 3DYRA 4GSSA 3KH9A 1XOAA 10GSA 5DJMA 2CT6A 3VFIA 2DIZA 4NHZA 5DQYA 2BJXA 4IP6A 5IMDA 5EL8A 3HVXA 2JL4A 1T00A 2R3XA 2FLSA 1CQGA 3VK9A 2IMDA 2DIYA 2GS3A 3FRCA 20GSA 4HU7A 1FG4A 1K0CA 2ALBA 1G7EA 3TUEA 5HFKA 2HRFA 3FHKA 2XHFA 4KNDA 3NZNA 4DSRA 2RM5A 2V41A 2GDRA 4YH2A 1ON4A 4N0VA 1M2AA 3DWVA 5A5KA 1TRSA 2DJJA 3GRXA 1B4PA 1U3IA 2KOKA 3O76A 4LL1B 4PUFC 4PURA 5CRDA 2VCVA 3DGQA 3HJOA 5JCGA 1DE2A 5KN1A 2G2QA 3E9JB 3WGEA 3A2VA 3IBHA 5GSTA 5GAND 4PXOA 2EIOA 3E0UA 3KIJA 5JWRB 1ERVA 3HHVA 4LMVA 3H79A 2LS5A 2ZCTA 5HR3A 4WETA 1A2JA 6GSVA 2WJUA 4JRRA 1AQVA 3F4TA 5FWGA 2YNXA 4POMA 2NBSA 1K3LA 1TKDB 3ZVJD 4FIWA 2H01A 2E7PA 1M9BA 1F3AA 3Q74A 5J9CA 3TRQA 1HQOA 3IHQA 2GSQA 3C8EA 3M0FA 1T7PB 1B9XC 1CQHA 1DSBA 1F2EA 4HOJA 3QR6A 3A5WA 3H4KA 3RPNA 1TTZA 4KA0A 3BJ5A 4GCIA 3C1RA 1XWCA 2I81A 4JEDA 2R6KA 3F4SA 2HZEA 2C3TA 2H76A 2CZ2A 1GLQA 2IJYA 1K0BA 2F51A 2F8AA 1ZOFA 2B6MA 3VWWA 4XCSA 2HXKA 5CYYA 4MJEA 3CMIA 1GSDA 1QFNA 2HYXA 3LGCA 2P31A 2LKUA 2FWEA 3HCZA 2WCIA 1X9WB 4TN8A 1XWAA 4ZL9A 1EP7A 3EVIA 3TKSC 1BG5A 1GTUA 4D73B 5E4WA 3GFKA 3UBLA 1A24A 3TKSA 3GV1A 5IQYA 1GSSA 1LBKA 3FR6A 1A0FA 1WMJA 4I8BA 3TDGA 2FWFA 3JCML 4TR1B 3SBCA 3IAS2 2LNTA 2VCWA 1U87A 4KUNA 1GSUA 4Q5QA 1I9DA 4HZ4A 4TXOA 2ON5A 2X64A 4KB3A 4BA7A 1KBNA 3Q18A 1E2YA 2CV4A 5C04A 2B5EA 1PKWA 4ISDA 3MNGA 4ZL7A 3QFBC 3GNJA 3V1WA 4LA1A 4ZL8A 2YJ7A 2IMEA 4I2TA 3VLNA 5IMCA 1WWJA 5G5EA 1ERWA 4DEJA 2MYGA 2I3YA 3VPTA 3VWVA 3I69A 4RUVA 3H8QA 3MSZA 5IMAA 4I2UA 2F3MA 1J0FA 2HLSA 3LXTA 1Z5YE 5AISA 3CTFA 2R2JA 4RQRA 2HSHA 3S9FA 5IMZA 3GX8A 5HR1A 3TOTA 3LORA 2YZHA 4N11A 2I9HA 2C80A 2QSIA 2GTUA 3L0HA 4OFNA 2M80A 4POKA 4V1Ap 1B48A 2KLXA 1GLPA 3KMNA 2H73A 2IMIA 2REMA 3GMFA 2GZPA 3CSIA 2B1KA 2AHEA 5IOXA 1YJ6A 1XIYA 1Q4JA 1EEJA 2LQQA 5DDLA 4KSOA 1K0OA 3RBTA 1V40A 4OD7A 5ECOB 4ID0A 3IOSA 4J2FA 2O89A 1H75A 3TB2A 4L8EA 3TGZA 4JE1A 5DAKA 2R4VA 2L5OA 3DD3A 5ELGA 2PWJA 2DSAA 5D73A 1XW9A 5IO0A 1WPIA 1UN2A 3L9UA 3KM6A 2WS2A 5INYA 5J3RA 5EY6A 2L4QA 2F9SA 2QKEA 5CP1A 4AGSA 4IBPA 4CW9A 1WIKA 1S3CA 3FR3A 3CSHA 2WZ9A 2TIRA 3IK7A 2A2SA 2H0IA 5D9VA 1TU8A 1ML6A 1THXA 2GQMA 2K6VA 5IMFA 4N10A 2AV4A 5HR2A 2MMAA 4WF4A 2ZNMA 2RM6A 5E59A 4ZBDA 5J9BA 3QAVA 1YF0A 4IKHA 2LUSA 3KCMA 2L6DA 3D21A 4L0WA 2C3NA 2YZUA 1EGOA 1Y6EA 3ZFLA 1R7HA 3ISOA 2MMOA 1GTBA 4F0BA 1K3YA 2LJRA 1N2AA 4POBA 3L9VA 2O8VB 3F63A 3L4NA 5DALA 1U3AA 3P90A 5G1KA 3P7XA 2LJKA 4EVMA 1R26A 4EL1A 4EUYA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite