1XPVA

Solution structure of northeast structural genomics target protein xcr50 from x. campestris
Total Genus 11
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
11
sequence length
78
structure length
78
Chain Sequence
MALTLYQRDDCHLCDQAVEALAQARAGAFFSVFIDDDAALESAYGLRVPVLRDPMGRELDWPFDAPRLRAWLDAAPHA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure of Northeast Structural Genomics Target Protein XcR50 from X. Campestris
rcsb
molecule keywords hypothetical protein XCC2852
source organism Xanthomonas campestris
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 11
structure length 78
sequence length 78
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05768 DUF836 Glutaredoxin-like domain (DUF836)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1xpvA00
4HS1A 3H8QA 1TW9A 2AJQB 3FKFA 3QAVA 5ECRB 3F3RA 4Q5NA 1K0OA 3FZAA 9GSSA 3GKMA 1X9MB 5ECIB 3HCZA 4K7OA 3QOUA 2P5QA 3F8UA 3EYTA 3FK8A 1LU4A 2M80A 5IOWA 1V57A 2WULA 4JR6A 4CHSA 3Q74A 1G6WA 5F07A 2YNXA 2QGVA 6GSYA 4GCIA 1PL1A 3F0IA 4K9ZA 3UMAA 2DJ2A 1T8EB 3GV1A 1GLQA 2I9HA 3UJ1A 1UC7A 4Z7XA 1WOUA 5IOXA 4NHWA 5D73A 5IO0A 3HJPA 3TGZA 3VPQA 2VIMA 3DXBA 3DWVA 2RIIA 3IBHA 5B6NA 1GSSA 2VO4A 4O5RA 3IE3A 3UOMA 1U88A 3KEBA 2ES7A 2KP1A 5IMVA 3R2QA 4N30A 3W6GA 1GNEA 2H1GA 4HJ2A 1QGVA 2IPAA 2LJKA 5DVBA 5A4VA 2FNOA 4XS1A 3KMOA 4TRXA 1GNWA 2CT6A 3GKKA 2KP2A 2FUG2 1Y6EA 2OA7A 5LNKe 5D8IA 5DALB 3QAWA 4TR1A 4ZL8A 3TB2A 2B5EA 2N5FA 4POBA 18GSA 1SJZA 5HFIA 2R3XA 11GSA 1ZZYA 2H8LA 1A8YA 4ZBAA 5DQYA 1W89A 1H75A 3N9JA 2IIYA 4NV5A 4K8MA 4H86A 3MAKA 5F0GA 4YQVA 5E4WA 4MF5A 4FH8A 5D93A 1THXA 2H1BA 3ZL5A 1TU7A 1G0TA 1T00A 3W8JA 3WGDA 4XCSA 1YQ1A 3UVHA 1G7EA 3TOTA 2VCQA 5A4WA 1B9XC 1FAAA 5ECNB 1BJXA 1PX6A 3HDCA 1C72A 4YQMA 5EL8A 3IHQA 4PGTA 1ERTA 4HQSA 1M9BA 5GSSA 1PGTA 1VRSD 2DJKA 5AIVA 5J3RA 2YOIA 4KAEA 2ON7A 3A3TA 5LCZA 2VAFA 4X43A 1OKTA 4HZ4A 4XIHA 3DRNA 2HLSA 5J9BA 2M46A 5G1KA 5IO2A 3KJYA 2A2RA 1EGRA 2NBSA 2VL2A 13GSA 3DMLA 2DJ3A 3IV4A 4CW9A 3TJKA 2LV3A 2H1DA 4XHMA 3P8WA 3GMFA 4IBPA 2RM5A 2VL2C 3A2VA 2F8AA 2B6MA 3RAZA 2OE0A 3L9SA 3NIVA 3F9UA 4OFMA 2HNLA 3F4RA 3CBUA 2CVKA 1O6JA 1ZCPA 2PU9C 2IFQB 2X8CA 2LKUA 1TRUA 1XWKA 2J9HA 3RBTA 3Q19A 4IKHA 3D5JA 2FD3A 4YH2A 2I1UA 3I6AA 2GQMA 3ZVJA 2TIRA 1T7PB 1GP1A 2LSTA 3I9V2 2YCDA 1OYJA 2PWJA 5IPHA 1XW9A 1TOFA 4KGIA 5DAKB 1PSQA 5DALA 5KN1A 3PGTA 5G31A 4F9ZA 2DJJA 4IS0A 1EOGA 4EC0A 1ZYQB 1GTBA 2CZ3A 4EDZA 5B7CA 1YEPA 5G5EA 1FVJA 4CDOA 2NDOA 4ZB6A 1OC9B 1DUGA 1V58A 2LQOA 2K8VA 1A2MA 4G10A 2BMXA 4GQFA 1ZMAA 1ACVA 1YZXA 4JU5A 5B8BA 4K7NA 4KDUA 2H74A 3GYKA 4WF5A 1JFUA 2G2QA 4PXOA 6GSSA 5HR1A 2C0FA 2WGRA 5D9VA 4K0GA 3DYRA 3F4SA 3HY2A 3IRAA 3LGCA 2BTOT 3H79A 4BA7A 2N5BA 2R6KA 2LJAA 3C7MA 3KH9A 2H1AA 2IMIA 1T4YA 3VLNA 2DBCA 2E7PA 5ECMB 4TR3A 1T3BA 3GH6A 1YKCA 4IN0A 4IQ1A 4BVYA 1DE1A 3A5WA 3VFIA 3K8NA 4V2NA 2QKEA 3LYPA 1S3AA 1GUMA 1SD9A 3KCMA 5ID2B 3RDWA 2D2ZA 4EE0A 4TXOB 5HR0A 4RI7A 3L0HA 2CX3A 2H0GA 3QMXA 1U6TA 4KE3A 1NSWA 2XC2A 1BQ7A 5ECSA 2JZSA 2K8SA 5J4UA 3TUEA 3HXSA 5IMFA 4ECBA 1IYIA 1X5DA 1W4VA 4IP6A 3C1RA 4KA0A 2P5RA 4YAVA 2EC4A 5IMDA 1HNBA 2CAQA 2IFQA 3LFLA 3SWLA 1FW1A 1SKWB 4LL4B 4FYCA 3TRPA 1GTIA 2CZ2A 4WKWA 2LRNA 5CRHA 2EIRA 3Q18A 2YZHA 3HZ8A 4K7IA 2DJ0A 3ZITA 3H1NA 2GQLA 2YJ7A 5DAKA 2H0HA 2GT6A 1PX7A 3D21A 1GL8A 4QL7A 2GTUA 2QC7A 2L57A 4PUAA 1OC9A 4F03A 2MZCA 1JLWA 3KTBA 2VD1A 2FWHA 5ELAA 4BWQA 4HEA2 1J9BA 1EV4A 2GZYA 3PH9A 2O7KA 4EDYA 4ISDA 1HNAA 1B9YC 6GSXA 2VUPA 2F3MA 4ZILA 3J7Yb 3TKSC 4MDCA 1SJIA 3KZQA 2B3SA 2KUCA 1O85A 1K3LA 2HT9A 1KEBA 1ON4A 4POLA 3QR6A 2YPMA 4TW5A 4OCEA 1MDIA 5AN1A 2LRTA 1GSUA 2OE3A 1SL0B 2AYTA 3TKSE 3TKRA 1M99A 4IJIA 1EP8A 2C0EA 3M1GA 2F9SA 1MEKA 2VCTA 4NMUA 2VD0A 3I69A 2X99A 1M2BA 3LXZA 4L5LA 1FB6A 4KNDA 4MH2A 2PVQA 2K9FA 1JHBA 1YJ6A 1TI3A 2O85A 4HI7A 2C4JA 4IP1A 3ME7A 4GSSA 2JZTA 5ID2A 2GDRA 2GQKA 3J7Yk 1ST9A 2VLUA 3VK9A 4TXOA 4MJCA 1QQ2A 3KTLA 2A2SA 2MMOA 2A4VA 5JWOB 2TRXA 4JR4A 2E0QA 1B4PA 4E8EA 2C80A 5AGYA 1AQXA 4OFTA 2AV4A 3UIWA 4I2TA 4KSOA 1XW5A 1MDJA 3LG6A 3ZRDA 3ZFBA 1LBKA 2AAWA 4XS6A 5EVOA 3ZMLA 1O8XA 2K18A 1ZGNA 1GWCA 2OJLA 3EE2A 3RPNA 4HDEA 2OACA 2LNTA 4MZBA 4AGSA 2PUKC 1PKZA 4BWSA 3M9JA 4X1UA 1H4OA 4K2DA 4KB3A 3TJFA 1K3OA 3BOAA 1XVQA 3APQA 1TDIA 2C8UA 2WS2A 1O73A 1XXUA 5EY6A 3C71A 1BX9A 1SD8A 1JLVA 1TI1A 1B4QA 3QFBC 1EEJA 3EMXA 1OE7A 1YY7A 4MZCA 1OKDA 1KNGA 6GSVA 3QPMA 4LLRA 3IXRA 4GSTA 4K0NA 2YJHA 4GRFA 4PQIA 5CAXA 2LTKA 2R37A 2E2MA 2O89A 5JCUA 1DSBA 2XBIA 2NTOA 1R5AA 2VCWA 4MPGA 2H0IA 4X0XA 3LYKA 3L9UA 4FYUA 1ZYEA 1Z6MA 2JSYA 4ZIJA 3G9BA 1UA5A 1F9MA 6GSWA 4KW6A 3M9KA 1PN9A 5G30A 2B1KA 2HYXA 1HQOA 3HVXA 3EURA 2JZRA 4NPBA 1A2LA 2GSTA 5DDLA 4TOPA 4ZBDA 4ID0A 4ZL9A 5D9WA 1A0FA 4MPFA 4I8BA 3UAPA 3C1SA 2MBTA 3KGKA 3F3QA 1ML6A 4OWYA 4OCFA 3EVIA 1UN2A 1YF1A 1R26A 3BBYA 3ZREA 3LQ7A 3ZYWA 3WYWA 4GTUA 14GSA 1R7HA 3GTUB 1UVZA 4OO4A 2HRNA 1XWGA 2LS5A 2ZUPA 5GAPD 1BYEA 2ON5A 1GSQA 3E3EA 2WJUA 5INYA 3LJRA 4O7HA 2FWEA 3M3MA 2V2GA 1T4ZA 4WXTA 5H5QA 5CRGA 1EOHA 1HYUA 2REMA 1VF2A 3GKNA 3CRTA 5HR3A 12GSA 1Z3EA 1XVWA 3FHKA 3TJBA 5CRDA 1E2YA 3IAM2 4HJMA 4DSRA 5J5NA 3WT2A 4MF6A 3P7XA 1JZDA 4HOJA 2CVBA 1XW6A 5KN3A 3O3TA 5FT3A 1X5EA 2PN8A 2VCVA 4MF7A 3KMNA 1TRSA 1PKWA 1K0MA 1SKSB 1XZOA 1GLPA 3UARA 3US3A 2HZEB 5GAND 1XIYA 5CRWA 4KX4A 3GURA 1F3BA 5GSTA 2VM2A 4IGJA 3ZIVA 2R2JA 4GLTA 3ERFA 3LORA 2NVLA 4MZWA 2LJRA 5FWGA 3APOA 3RHCA 1NM3A 3N5OA 2IWTA 5C00A 5ECQB 1XPVA 2J23A 4JZQA 3IOSA 3LXTA 5G1LA 1JZRA 2CV4A 3HKRA 2VLTA 3IAS2 1V40A 3CSHA 1X5CA 3CMIA 1AUCA 1FHEA 4ZB8A 4MABA 5F06A 1GUKA 1RW1A 2AB6A 2JADA 8GSSA 1DBYA 1X9SB 1F6MC 2X8HA 4JEDA 3CYNA 5B6MA 2F51A 2RM6A 4BL7A 2CAIA 5KEJA 5HR2A 3G7JA 1OC8A 4L0WA 2L5LA 5A5KA 4DEJA 3VWUA 2WB9A 19GSA 5J9CA 1TP9A 3D0ZA 4MK3A 2GLRA 1YDKA 3GH9A 3GL5A 4NWYA 4K1FA 1TK8B 4Q5QA 4L8EA 4BVXA 2AHEA 1A2JA 5KN0A 4POKA 1LJRA 5D9XA 5DJMA 2HSHA 5ECKB 3QD9A 4ILFA 4WR4A 1VGLA 3D4TA 4F0CA 3GKXA 3HVVA 4J2FA 4N0ZA 2YP6A 3KD0A 2L4CA 4D73B 2JSZA 2R5GA 5IMZA 3QFAC 5CP1A 1E6BA 3GTUA 1OC3A 1MDKA 4P3YB 3PINA 2FWGA 1HD2A 1I9DA 2CA8A 4AJ7A 3ZZXA 2C3TA 3DVXA 1SU9A 2HXKA 1AIUA 3FZ9A 4G19A 1VF3A 4N11A 5JWQB 2L59A 1EP7A 3MWHA 4AF2A 2B5XA 3VPTA 3HVSA 1K0DA 4JBBA 1T1VA 1WJKA 2DIYA 4ZBBA 3TRXA 4POMA 3UVTA 1SL1B 3MNGA 4NV2A 3ERGA 4YQUA 10GSA 3F6DA 1VF1A 1XOBA 2H01A 17GSA 1Z7RA 1FVKA 1AC1A 4ULXA 3VURA 2H76A 2VL3A 3WD6A 2AUVA 3GL3A 1SYXA 2I4AA 1V9WA 1DE2A 1A23A 2V1MA 1USBA 4F2IA 4PNGA 2GSSA 2K6VA 3ZTLA 2HZEA 1Z5YE 5CYYA 1ZL9A 1RQMA 3WGEA 4TVEA 2PMTA 4GXZA 3EU3A 2H6ZA 1GH2A 2BJXA 1ZOFA 5C04A 3VWWA 4DSSB 4BPYA 4DSQA 5ECLB 4J57E 4ECCA 2DJ1A 2HE3A 2PBJA 2KOKA 2C3NA 4ACSA 5IIZA 2YN1A 1BAYA 3TCOA 4G2EA 4G9HA 4N0VA 2YWMA 4TR4A 22GSA 1K3YA 4OMVA 1ERUA 3APSA 4V2LA 4XS4B 5CREA 4GWRA 3GRXA 4MJAA 2DLXA 1U3IA 3LSZA 3UBKA 3PR8A 2FHEA 1PRXA 1TXXA 1M2DA 1SENA 2YV9A 2XPEA 3HJOA 4LL1B 5LD0A 1MD4A 3ED3A 2TRCP 5IPGA 4FO5A 2H70A 1X0RA 1GSEA 2GSQA 1AQWA 2GT5A 1TK5B 2VLVA 1AAZA 5ECPB 5AISA 2EIOA 4RI6A 1O81A 2FWFA 4WEYA 5DBQA 5DJLA 5ABRA 2JU5A 5HFKA 4KH7A 1TJDA 3ZIJA 2KLXA 3DD3A 5IQYA 2CX4A 1WIKA 1Q98A 5KN2A 3MDKA 4MJBA 3IDVA 3TJJA 3FYGA 3EU4A 4D73A 2G0FA 4OFNA 1VF4A 4HQZA 2H71A 1TRWA 4J56E 1NHYA 3JCML 4RQRA 1XBSA 1SK0A 3ISOA 5CO3A 2L6CA 7GSSA 4OD7A 1K0NA 2I3YA 1PA3A 2YWOA 3RHBA 3CSIA 3G7YA 2CVDA 4XRDA 4MA9A 3F63A 4E8HA 3DKSA 3BD2A 4V1Ag 4PURA 4LMWA 2B7JA 2XPDA 5COHA 2Z9SA 2PVOC 3GSSA 1AQVA 1O7UA 1F37A 1GSYA 3H93A 1R5PA 1THOA 2V6KA 2JACA 4KSMA 1R4WA 1SK2A 4MH3A 2HI7A 4NHZA 2C0DA 1EEMA 1URMA 3E9JB 3DGQA 4WETA 2HRFA 2OKAA 1QUWA 4PNFA 4V2MA 3QDNA 2ZCTA 4EUYA 4LMVA 4AJ8A 1QMVA 1FO5A 1O8WA 3GN3A 4PX1A 1OAZA 3GX0A 4TR0A 4KCEA 3O6TA 3BCKA 2IMFA 1MD3A 3P90A 3H4KA 4YAPA 4OO5A 3L4NA 1KBNA 2RUEA 3V1WA 4DSSA 4Q5FA 1K0AA 4IHUA 3VWXA 2PGTA 4TN8A 1YF0A 3FW2A 4MP4A 3G7IA 4I2UA 4L0UA 2N5AA 2YV7A 2R4VA 3LEFA 1K0CA 2B1LA 1WPIA 4MJEA 1NW2A 2YZUA 2ALBA 1SJ6A 3DVWA 5EPFA 5H5SA 2ZNMA 3TKPA 1BEDA 3F4TA 4XS4A 3CXGA 3HZ4A 4EKZA 1GTAA 4I6XA 1PL2A 2LQQA 1KTEA 4ML1A 3FY7A 2MYGA 4I5QA 5FHIA 5D9TA 2OADA 1CQGA 1JZOA 2H19A 1J08A 1B8XA 1M9AA 1XWBA 2C0GA 4ECIA 2DMMA 3GSTA 2HSYA 2OE1A 1M0UA 3HA9A 5B8AA 5JCGA 3IPZA 2XBQA 3GHAA 4IVFA 3GA4A 4HUAA 4O32A 5IM9A 4GQCA 4I97A 2QSIA 2EIQA 1JZWA 1SK1A 3KH7A 3A2WA 5JWRB 2H72A 2WFCA 3HHVA 4JRRA 2DIZA 5CNWA 4EO3A 1TK0B 1GRXA 1U3AA 1XWCA 1F2EA 5J41A 3D22A 2DC5A 2V6OA 3UL3A 4QQ7A 2OBKA 3VI5A 1PMTA 1WE0A 1TU8A 1EWXA 3FRCA 3OR5A 4ECJA 3E0UA 1IYHA 2WZ9A 3U6VA 1N8JA 2OBIA 3IK7A 4FYBA 2GSRA 5L71A 3AY8A 1MTCA 2WRTA 3IR4A 2MMAA 5G5FA 4ML6A 4EF0A 1TKDB 2B5YA 3VWVA 2IJYA 4WBRD 4KDXA 2IL3A 16GSA 2MMZA 1WWJA 4N10A 3FR6A 3IK9A 3EINA 2HFDA 3BCIA 1K0BA 2RLIA 4DVCA 4QL9A 5F8BA 4RUVA 1QFNA 2CQ9A 2LEGA 4KUNA 2IN3A 2YWNA 1S3CA 2LUSA 2F8FA 3FEUA 3DEXA 2B7KA 3TOUA 5GZZB 5H5RA 5A4UA 3ZFLA 5JCWA 4MCUA 4GSNA 2RUFA 1EZKA 3Q6OA 3S9FA 1WP0A 5DCGA 1S3DA 5E59A 3LWAA 2WDUA 2YANA 2M72A 3M0FA 1M7TA 4ZXGA 2X64A 1XFLA 3DIEA 3KM6A 2IMDA 2FGXA 4F82A 3GUSA 4F0BA 2FY6A 1F3AA 4IELA 4MMMA 3WT1A 1GSFA 1BG5A 4EL1A 5D96A 1I5GA 1B48A 1QXHA 3C8EA 5ENUA 1NHOA 3EWLA 1AXDA 2MMNA 3I43A 4IQAA 1Z7PA 2LRCA 1U87A 2L4QA 2DMLA 3FR3A 3L78A 4FIWA 4ZB9A 2GZZA 3FZ4A 4HZ2A 2GGTA 3U5RE 4KDYA 1Y25A 3ME8A 3D4MA 3ERWA 3ZLPA 1J0FA 4V1Ap 1TTZA 1WMJA 2L6DA 4Q5RA 5IMCA 4WF4A 3EMPA 1GTUA 1G6YA 20GSA 3IA1A 1AW9A 1QK8A 2H66A 1GUHA 1G7OA 3HD5A 1ERWA 4GF0A 4NXIA 2PPTA 1XWAA 4TKYA 5IMAA 1V98A 2VCXA 1A8LA 3CSJA 1ABAA 2I81A 2P31A 3QCPA 3NZNA 3F6FA 3CRUA 2H6YA 3BJ5A 3L9VA 2X8GA 5ECHB 1HNCA 2VCZA 2HZFA 4LA1A 1SL2B 2YWIA 4HU9A 4ZL7A 2O8VB 4XTSA 4HU7A 2V41A 3GFKA 2NPBA 3M8NA 1N2AA 2FCHA 1OVNA 2V32A 2PERA 1YKAA 4RQXA 2LNSA 2VOCA 2GZPA 3TDGA 1XOAA 1OE8A 4JE1A 4WR5A 4MLYA 1M2AA 3WGXA 1FG4A 3SBCA 1SKRB 3RPPA 5HQPA 2GVPA 4L5OA 1V2AA 3P2AA 4K6XA 2H30A 2VM1A 2FA8A 2E2GA 2WCIA 1ERVA 2P0GA 2IMEA 3KXOA 2MBSA 1X9WB 1CQHA 4EXJA 2H6XA 2VL9A 4TXVA 3D6IA 4WBJA 3FZ5A 1EGOA 2FA4A 1Z6NA 3UEMA 2H73A 1PQNA 1TRVA 4PUFC 1FOVA 2O87A 6GSTA 3TKQA 3GX8A 1XCCA 2H75A 5ELGA 3HYPA 5G2ZA 3TRQA 1A24A 1FB0A 2IMKA 2JL4A 3UBLA 5F05A 4IJ3A 6GSUA 3MSZA 3GIXA 4PQ1A 3KIJA 3EC3A 2C1YA 3TKSA 1A0RP 4IW9A 3A2XA 4TR1B 2GS3A 2C3QA 3HJMA 1Z9HA 3TJGA 3ZVJD 1PD21 2XHFA 3QAGA 1YEXA 3IC4A 3GNJA 1ILOA 3CTGA 5ECOB 3VI7A 4O92A 3W8SA 2DSAA 4NAXA 4EVMA 4KCAA 1Q4JA 5DCHA 1SYRA 1WRYA 1GSDA 3O76A 3CTFA 5AIXA 3ZMKA 3KP9A 4AJ6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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