2JSYA

Solution structure of tpx in the oxidized state
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
MAEITFKGGPVTLVGQEVKVGDQAPDFTVLTNSLEEKSLADMKGKVTIISVIPSIDTGVCDAQTRRFNEEAAKLGDVNVYTISADLPFAQARWCGANGIDKVETLSDHRDMSFGEAFGVYIKELRLLARSVFVLDENGKVVYAEYVSEATNHPNYEKPIEAAKALVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Probable thiol peroxidase
publication title Reversible conformational switch revealed by the redox structures of Bacillus subtilis thiol peroxidase
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
molecule tags Oxidoreductase
total genus 42
structure length 167
sequence length 167
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2jsyA00
1GLQA 4MPFA 4MZCA 2O87A 2DMMA 4ML1A 2VCVA 4K9ZA 5A5KA 2YJHA 3A2XA 3IDVA 4PGTA 5IM9A 2LSTA 3O76A 2AJQB 4ZB8A 1PN9A 1BYEA 1Z3EA 2MMAA 4Q5FA 3UBKA 3EC3A 5LCZA 4ZL9A 1HYUA 1THOA 5CRHA 1KTEA 1YKCA 5B8BA 4NV5A 4FYCA 3TOTA 2IMIA 1PL2A 4EO3A 3KXOA 5E4WA 1AQWA 2A2SA 2HXKA 1URMA 3V1WA 3UVTA 2YZUA 3BOAA 5CO3A 1SJZA 4ID0A 1JLWA 2WZ9A 3TJGA 3F0IA 4G2EA 3KMOA 5ABRA 4EDZA 5IMZA 5F0GA 3GHAA 4L5LA 1WE0A 4PNGA 1HNBA 1GSSA 4POLA 3LYKA 4KCEA 3QFAC 2QSIA 4Q5NA 4EKZA 3A2VA 3VI5A 5D9WA 3D5JA 5IPGA 3I69A 3TJBA 4F9ZA 2A4VA 3KCMA 4EC0A 1R5PA 1X5CA 1TRSA 4J57E 4HJ2A 3UBLA 5ECSA 3C71A 2TIRA 1MD3A 2G0FA 11GSA 3FRCA 4JRRA 1XFLA 4O32A 3UMAA 1ABAA 4K1FA 3IAS2 3UARA 1KNGA 2FWHA 1NW2A 1OE7A 3P7XA 3C1RA 2P0GA 4Q5RA 2EIQA 4YAVA 2PVQA 1HNCA 14GSA 4YQUA 1QGVA 2LUSA 1EV9A 1AIUA 3ZFBA 1EV4A 3D6IA 4V1Ag 5ECKB 4ULXA 4OO4A 3LORA 4MA9A 2MMNA 1MEKA 1UC7A 4KSMA 5A4UA 1K0AA 2HZFA 1WP0A 1VGLA 3HDCA 2PN8A 2ZCTA 3IE3A 2PPTA 3DRNA 1LJRA 1LU4A 2QGVA 2VD0A 4ZXGA 1OVNA 5ECLB 3H8QA 4HDEA 2NPBA 4IVFA 4F0BA 4XS4A 2I9HA 4GSNA 4N0VA 2JACA 3UAPA 3LXZA 1GSUA 2DJKA 1TXXA 1PX6A 4ECJA 4PUAA 4DSSA 2H1DA 2E7PA 1ACVA 2F8FA 2YWMA 5A4WA 2OE0A 2PWJA 4OWYA 4JBBA 1FVKA 3WYWA 1J0FA 1OE8A 3H1NA 1SL1B 1YKAA 4KGIA 1X9MB 1TI3A 1OKDA 3GFKA 1OKTA 2BTOT 2DMLA 4X1UA 3JCML 5IOWA 4AJ8A 5B6NA 1DE2A 2DIYA 3BJ5A 1ZGNA 1WMJA 1VRSD 2QKEA 1K0OA 4RUVA 2YWNA 3LWAA 2WFCA 9GSSA 3VWWA 1SYRA 5D96A 3CXGA 1C72A 3FW2A 4IN0A 2K18A 3OR5A 3RAZA 1OYJA 2F51A 1MTCA 1A24A 1SL0B 3SWLA 2AHEA 3F4SA 2DIZA 5J41A 2C4JA 2CX4A 3GH6A 3APOA 3VLNA 3A3TA 3KTLA 3TKPA 1MDJA 2GTUA 4WR5A 1Z6NA 3HJMA 1LBKA 1JHBA 1Y25A 1PGTA 3EE2A 3QPMA 2EC4A 3E3EA 5A4VA 1U87A 1FHEA 3C8EA 5C04A 1ST9A 3WD6A 4WETA 3TJFA 1YZXA 6GSSA 2RM5A 3FKFA 1BQ7A 1WRYA 3CTGA 4WF5A 4OFNA 2M46A 1B9YC 4TR1B 4N30A 3F4TA 1XBSA 3ISOA 5IMCA 4ILFA 2VCWA 1EP8A 2VIMA 2LJAA 2CAIA 1V58A 1VF3A 1A0RP 1K0MA 2VO4A 1FOVA 5CRWA 1V2AA 4K8MA 2LNTA 5AGYA 5LNKe 3FEUA 1KBNA 5JCWA 1PQNA 1UN2A 1SK0A 3HZ4A 1B48A 4K0NA 1T7PB 2FWEA 2H6YA 2WJUA 1GSEA 5DALB 3ZVJD 6GSVA 3C7MA 3DYRA 1A2MA 4AF2A 2XC2A 4HZ4A 1Q98A 2DJ2A 1TK8B 1GUHA 1OC3A 1XVWA 1AW9A 2J9HA 4GCIA 4RQRA 1Z5YE 4MJAA 3IRAA 2OBKA 3GYKA 3MSZA 3IK7A 5CP1A 1GTUA 5G2ZA 4I5QA 4JU5A 2IFQB 1TU7A 4HI7A 3IK9A 4P3YB 2K8SA 1M2BA 4DEJA 3M1GA 4F2IA 1XOAA 3IXRA 3GX0A 1K0DA 2L5LA 4FIWA 3VWXA 3TKSC 5JCGA 4PXOA 5ID2A 3TKSE 2B5XA 5JCUA 1FB6A 2FD3A 5IQYA 1T8EB 1XWCA 4MJEA 2OA7A 5ELGA 2IJYA 3G9BA 1WPIA 1ZYEA 2VCZA 1K0NA 1AC1A 4HUAA 2RLIA 4MF5A 3MAKA 3HVSA 4QQ7A 2X8GA 5ECNB 2P31A 3GTUB 4I2TA 1Z7PA 1K0BA 3GKXA 4BVXA 1ML6A 3KM6A 4MCUA 1OC9B 4FO5A 2VLUA 5D9TA 2PVOC 1T3BA 4LLRA 4L0WA 4TXOA 4XHMA 3LFLA 2NVLA 6GSYA 3P90A 4ZIJA 2I3YA 1ZYQB 2F3MA 1ON4A 2OBIA 3Q18A 3M9KA 2CZ3A 2DJ3A 2JADA 2AB6A 1SENA 3ZVJA 5DJMA 5GAPD 1GH2A 3G7YA 1K3LA 3BCIA 4EXJA 2LNSA 4IGJA 20GSA 2GQMA 3C1SA 6GSWA 1V57A 3F63A 4JR6A 1U3IA 3HKRA 3U5RE 1DUGA 2WCIA 1NSWA 2VCTA 2FY6A 4EE0A 4I6XA 3H4KA 3F3RA 1NM3A 3I6AA 4MZWA 4I2UA 1XW9A 1F9MA 4MF7A 1Z9HA 2LKUA 3GMFA 4CW9A 3TCOA 2RUFA 4EVMA 3N9JA 1AQXA 2CA8A 4YH2A 3GH9A 2LRCA 4H86A 1JZWA 3GKKA 2HSYA 1THXA 1FB0A 2DC5A 4NAXA 2FGXA 1XCCA 4XS1A 5COHA 3D21A 3LXTA 2ES7A 3SBCA 2JL4A 5KN1A 3QMXA 4GQCA 2L5OA 3KH9A 3DVWA 1BJXA 1G6WA 3QAGA 3UIWA 3DIEA 5KEJA 1GULA 4HJMA 3FR3A 3L78A 3KH7A 3QR6A 4L0UA 2VD1A 1QMVA 5CREA 1SU9A 3IPZA 5F8BA 2R6KA 2H73A 4BA7A 2AUVA 3ZIVA 1J9BA 2I81A 2WGRA 3GKMA 1XWGA 4Z7XA 5ECOB 4ZL7A 1A0FA 3TUEA 5AIVA 4ZBDA 2GSSA 2H1AA 1O85A 3W6GA 4OCEA 4D73B 1TOFA 3FZ9A 3CSJA 3HJOA 4IS0A 2WDUA 1E6BA 2H01A 1K3YA 1K0CA 3HD5A 1WWJA 3WGEA 2GZPA 2H19A 5CRGA 3ZL5A 1V40A 3HVVA 3WT1A 1WIKA 3AY8A 1M99A 2X8CA 4N0ZA 2YPMA 1VF1A 1XWBA 3LEFA 4KH7A 4KX4A 5IMAA 1QUWA 5G1KA 4EF0A 4MJCA 3F3QA 1M2AA 4O5RA 1RK4A 2H0GA 4FYUA 2V1MA 1TP9A 2C3QA 2LEGA 4HU7A 1MDKA 2L57A 3A2WA 1FAAA 1H75A 3TJJA 3DEXA 2L59A 8GSSA 1O8WA 2M72A 1EOHA 4WKWA 4KUNA 3GRXA 4XS6A 4IKHA 4JZQA 4E8HA 1TRUA 4IP6A 1SKRB 2O7KA 2R2JA 3F6DA 1SJIA 2HNLA 2YV7A 4IQAA 4FH8A 5F06A 5DAKA 4OCFA 1RW1A 3KZQA 1SK2A 2XBIA 1Z6MA 3EMPA 2B5EA 1E2YA 3DXBA 2FA4A 2F8AA 1NHOA 2OE3A 3VK9A 3HZ8A 1BEDA 2KLXA 19GSA 2H1GA 2YOIA 5EY6A 3HCZA 3MWHA 1QXHA 2DLXA 3IAM2 3GIXA 2JZRA 3PR8A 1QQ2A 5HR0A 4PUFC 1XPVA 1N8JA 4PURA 3BD2A 1G6YA 4K7IA 4K6XA 2HE3A 1O7UA 1T4ZA 4F03A 2K6VA 4ZB9A 4KW6A 4G10A 2NBSA 4JEDA 1GTAA 4ML6A 2GS3A 1GP1A 3KJYA 3CSIA 1M9AA 2YCDA 4IP1A 4DVCA 4MABA 4TR0A 3APQA 4ZILA 1X5DA 2P5RA 3DVXA 4ZBBA 2IMKA 2OJLA 2HFDA 4XRDA 4XCSA 2H8LA 3FY7A 1DSBA 1ZZYA 2LQQA 3ZTLA 3M9JA 3HHVA 4GSTA 3NIVA 3EINA 5HFKA 2VL2A 4HQSA 2LS5A 2FWGA 3GX8A 4OO5A 1A2JA 1HD2A 2C3TA 2L6DA 2IN3A 3W8JA 3LYPA 1OC8A 3TRQA 5J5NA 3FZ5A 1I5GA 3DWVA 5JWQB 4WBRD 3RBTA 4MF6A 3F4RA 2C0DA 3FR9A 3CMIA 5GZZB 2HSHA 3IC4A 2GGTA 4MZBA 1TKDB 1XXUA 4PQIA 4TXVA 2CZ2A 2O8VB 2GLRA 2C1YA 6GSXA 1GWCA 1FO5A 3KEBA 4KDYA 2R5GA 2VCXA 3QAWA 4XIHA 4K7NA 1SL2B 5G31A 1YEXA 3MNGA 5IO0A 4GQFA 1MDIA 2VOCA 3UL3A 2VL9A 2YNXA 4XS4B 1R7HA 3QD9A 4MLYA 2HT9A 4DSQA 3QOUA 2N5AA 2JZTA 16GSA 2XPDA 1TK0B 4V1Ap 4DSSB 4TN8A 1B9XC 3GUSA 3IR4A 1TTZA 1WOUA 2I1UA 5HR2A 3ZYWA 1IYIA 1A8LA 1XIYA 1UVZA 2NTOA 4EDYA 1U3AA 5AISA 2N5FA 5CNWA 2RUEA 1T00A 4F0CA 2X64A 1XW6A 3EU3A 4EL1A 3TRXA 1TW9A 5DVBA 4ACSA 1DBYA 4NXIA 4HQZA 3O6TA 4YQVA 1HQOA 1GSYA 1XWAA 3ZREA 1A23A 2HZEA 2XBQA 3DD3A 2YANA 3BCKA 4NHZA 1YEPA 3TRPA 3HYPA 2MMZA 2J23A 2PBJA 5B6MA 4GTUA 5H5QA 1A2LA 2DJ0A 3L9SA 1AXDA 1YQ1A 2R3XA 2H72A 3I43A 1AQVA 4K0GA 4KDUA 1AUCA 3CRUA 2VAFA 1ERTA 2EIRA 5C00A 3LQ7A 4JR4A 5HFGA 3EMXA 5H5RA 12GSA 1EGRA 5LD0A 5HFIA 2HLSA 2JU5A 2LV3A 4MDCA 2FA8A 3RHCA 3RPNA 3ZFLA 5DQYA 2GSRA 1B4QA 4TW5A 2AV4A 2VLTA 3CYNA 5GSSA 4GRFA 2MMOA 2L4QA 4K2DA 4PX1A 2HI7A 1GLPA 2CX3A 2GZZA 2RIIA 3FZ4A 2PERA 3HVXA 2IL3A 4OFMA 13GSA 1W4VA 1HNAA 3IBHA 1ZMAA 3ZITA 1WJKA 2BJXA 2P5QA 5G30A 3L4NA 1BG5A 3EWLA 4O7HA 1SYXA 1X9SB 4GF0A 3QDNA 4MK3A 2KP1A 4PQ1A 5DJLA 5B8AA 2JSZA 5ECIB 4HEA2 1JZDA 3EURA 1DE1A 2CAQA 4LMVA 2CV4A 3F8UA 1RQMA 2V6OA 1XOBA 4KCAA 2LRNA 3EYTA 5IPHA 4HZ2A 1XWKA 3IOSA 1Q4JA 4IBPA 2H1BA 2H66A 3ZRDA 3HJPA 3UJ1A 2F9SA 2OE1A 3HY2A 2V6KA 2XHFA 1B8XA 4NMUA 3ZMKA 1K3OA 3I9V2 4IHUA 2I4AA 2H70A 1M0UA 3KIJA 4RI6A 2X99A 1GUMA 2YV9A 3RHBA 2KP2A 4IJIA 2B3SA 3GNJA 1PSQA 3BBYA 4K7OA 2CVKA 1ZOFA 3WGXA 1GTBA 1Y6EA 2Z9SA 3ZMLA 4HOJA 5ID2B 5FHIA 3GV1A 5DDLA 1VF2A 2BMXA 2GQLA 2V2GA 1ERUA 3LGCA 4OD7A 3US3A 3GL5A 4ECIA 2C0EA 2JSYA 2DSAA 4TR4A 2VLVA 1I9DA 1SKWB 2YJ7A 5B7CA 2FWFA 4ZL8A 1X9WB 2GT5A 4KSOA 3L9UA 4F82A 3K8NA 3FHKA 1T1VA 4MMMA 1O8XA 3RDWA 4WXTA 3HA9A 2H71A 7GSSA 4L5OA 1F2EA 1IYHA 2O89A 3MDKA 3ZLPA 5KN0A 5KN3A 2OACA 4TXOB 2FLSA 1S3AA 4G19A 3S9FA 2G2QA 2REMA 2C80A 2L6CA 2HRFA 2V32A 4BWSA 1JLVA 5JWRB 2C8UA 4LL4B 1EGOA 3D4MA 2GQKA 2LJKA 4MPGA 1M7TA 2YN1A 4X0XA 3ERWA 1ZL9A 2YP6A 2RM6A 1SD9A 4LA1A 3D0ZA 5CRDA 3QAVA 3FK8A 2DJ1A 1O81A 2YWIA 2ZUPA 3TDGA 1TDIA 1BAYA 4LMWA 3CSHA 3ED3A 1M9BA 2GZYA 2PGTA 1R4WA 17GSA 1CQHA 2VUPA 5EL8A 5J4UA 4AJ6A 3E9JB 5DCHA 2FCHA 4KE3A 1CQGA 4IW9A 5FWGA 5ECQB 3C73A 2LQOA 5E59A 3PH9A 3ZIJA 2VM1A 4PNFA 4ECCA 5J9CA 4HS1A 5D93A 1EEJA 4MP4A 5HR3A 3J7Yk 5DBQA 1F3AA 1M2DA 3UVHA 1YJ6A 4V2NA 2KUCA 4GXZA 5L71A 4GLTA 5ECPB 4QL9A 1G0TA 1PL1A 2B6MA 2E0QA 4KNDA 3APSA 4IELA 2C0GA 1H4OA 1ZCPA 2KHPA 3N5OA 2FNOA 4POBA 2WS2A 3P2AA 1N2AA 5JWOB 2HRNA 2B1KA 3RPPA 2L4CA 3CBUA 6GSTA 4Q5QA 1R26A 5J9BA 2PUKC 5G5FA 1TK5B 5J3RA 1S3CA 3D4TA 3GN3A 5DQSA 4HU9A 4NHWA 4DSRA 5HQPA 5IMFA 4LL1B 3FYGA 1S3DA 2GSQA 4BL7A 4PQHA 2X8HA 18GSA 1O73A 1SD8A 5G1LA 3KP8A 2FUG2 1QK8A 2CVDA 3CRTA 3EU4A 3NOFA 2WB9A 5ELAA 5IO2A 1EP7A 4TR1A 1YDKA 1UA5A 3KP9A 3UOMA 1VF4A 1GL8A 4EUYA 3WGDA 1FG4A 3GSTA 2E2MA 3GA4A 3W8SA 4TVEA 2K9FA 1EWXA 1FW1A 1JZOA 5DALA 2ON5A 3KGKA 1NHYA 3ME8A 1GSDA 2IIYA 4OFTA 2AAWA 4OMVA 4GSSA 3GKNA 3TB2A 4FYBA 3M8NA 1V9WA 2H75A 3LJRA 4BVYA 1SJ6A 4KDXA 1XVQA 1TU8A 4N11A 3G7JA 3VI7A 5GSTA 3KMNA 4G9HA 5DAKB 2H6ZA 2K8VA 2LRTA 1MD4A 4YQMA 2IFQA 2XPEA 3DMLA 5HR1A 5FT3A 5CAXA 5EPFA 1PD21 4WBJA 4XRAA 2MBTA 4MH2A 5ECHB 2R4VA 4ISDA 3L0HA 3TGZA 2H0IA 3U6VA 2M80A 4NWYA 1U6TA 2LJRA 4CDOA 3QFBC 6GSUA 3M0FA 1J08A 2MYGA 3PINA 3TKSA 3UEMA 3ME7A 2CT6A 3GTUA 4KAEA 1SKSB 1X0RA 4RI7A 4RQXA 4KA0A 2CVBA 4WEYA 1Z7RA 2N5BA 2YZHA 4O92A 1OC9A 1ERVA 3D22A 2FHEA 3HXSA 5D73A 3G7IA 4V2LA 5F07A 2IWTA 4XTSA 3LG6A 2VL2C 4TRXA 1YY7A 1G7EA 3QCPA 5D9XA 3A5WA 2ZNMA 5IMVA 3P8WA 5DCGA 1OAZA 1GNEA 2GDRA 1KEBA 4GWRA 3GL3A 3KTBA 3TKQA 1YF1A 3VWVA 2R37A 3H79A 1TJDA 5AIXA 1GRXA 2NDOA 3L9VA 3ERGA 4J56E 1F6MC 3EVIA 4IJ3A 3VFIA 2EIOA 2GSTA 2WULA 2TRXA 1GUKA 3TKRA 3F9UA 5H5SA 4ECBA 3TJKA 2E2GA 10GSA 1QFNA 2VCQA 4TR3A 1B4PA 3LSZA 5IOXA 1ILOA 5GAND 2O85A 2HYXA 22GSA 2MZCA 3Q19A 2ALBA 2KOKA 4J2FA 1XZOA 1PRXA 3Q74A 2VL3A 1X5EA 4I97A 3F6FA 5ECRB 3E0UA 1PMTA 2H76A 4TOPA 4CHSA 4V2MA 5IIZA 4AGSA 3DGQA 1A8YA 4TKYA 2C0FA 4ZBAA 2WRTA 1V98A 3ZZXA 4X43A 3VPTA 3O3TA 3ERFA 3M3MA 1T4YA 1GTIA 4NPBA 4ZB6A 1W89A 2H6XA 1FVJA 1F37A 4E8EA 5INYA 1F3BA 3J7Yb 1EZKA 2DJJA 5CYYA 4L8EA 1TI1A 2IMDA 4JE1A 1YF0A 2IMEA 4I8BA 1SK1A 1JZRA 2C3NA 1EOGA 1EEMA 1G7OA 1O6JA 2TRCP 2JZSA 2MBSA 4D73A 4WF4A 3KD0A 5G5EA 2AYTA 2HZEB 2B1LA 4YAPA 3VPQA 1PX7A 1PKZA 2ON7A 4AJ7A 2GT6A 3GSSA 2B7JA 2LTKA 2OADA 3Q6OA 4MJBA 4N10A 2A2RA 3FR6A 4MH3A 3IA1A 5D9VA 4POMA 4WR4A 1TRVA 4KB3A 2B5YA 3NZNA 2B7KA 3IV4A 3CTFA 2DBCA 2H30A 4QL7A 2V41A 3PGTA 4BWQA 1ERWA 3TOUA 1PKWA 4IQ1A 1AAZA 5EVOA 2H0HA 2QC7A 5D8IA 4NV2A 5KN2A 1XW5A 2GVPA 3H93A 5ENUA 2IPAA 1GSQA 2PU9C 2D2ZA 3R2QA 2YWOA 3IHQA 3FZAA 5ECMB 2VM2A 1JFUA 4POKA 3VURA 1GSFA 2H74A 3GURA 2OKAA 1USBA 3WT2A 5AN1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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