1O81A

Tryparedoxin ii from c.fasciculata solved by sulphur phasing
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
152
structure length
152
Chain Sequence
PHMSGLKKFFPYSTNVLKGAAADIALPSLAGKTVFFYFSASWCPPCRAFTPQLIDFYKAHAEKKNFEVMLISWDESAEDFKDYYAKMPWLALPFEDRKGMEFLTTGFDVKSIPTLVGVEADSGNIITTQARTMVVKDPEAKDFPWPNVEAKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Crithidia fasciculata
publication title De Novo Phasing of Two Crystal Forms of Tryparedoxin II Using the Anomalous Scattering from S Atoms: A Combination of Small Signal and Medium Resolution Reveals This to be a General Tool for Solving Protein Crystal Structures
pubmed doi rcsb
molecule keywords TRYPAREDOXIN II
total genus 48
structure length 152
sequence length 152
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2002-11-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1o81A00
3EWLA 4NAXA 4K9ZA 4WKWA 1TTZA 2X8HA 2IMFA 2DMMA 5DJMA 3GSTA 2ON7A 1FVJA 2WULA 3G7IA 1B9XC 1KTEA 4POBA 3VWWA 2N5FA 1V57A 5GSSA 2X8GA 3GNJA 2GT6A 1RQMA 5FHIA 3UOMA 4HUAA 4MPFA 1Q98A 3HY2A 1R7HA 2K8VA 4EL1A 4MJCA 2I9HA 6GSWA 1K0OA 1R4WA 4I2TA 5DJLA 2NDOA 3FKFA 2DJJA 1O8XA 2B1KA 2WJUA 1YF0A 2XPEA 3WD6A 2C0FA 3KM6A 1X9MB 3KH9A 5KN0A 1KBNA 4EF0A 4CHSA 2IMKA 1Z6NA 1XZOA 2BMXA 3LQ7A 4MZWA 3NOFA 3FK8A 2KP1A 2H30A 3C7MA 1ZGNA 3FEUA 3QMXA 1TJDA 1OVNA 4YAPA 1VF3A 3DWVA 2I1UA 1SJZA 5C04A 1AQXA 4K7NA 4N11A 1K0DA 2CQ9A 1AUCA 3F8UA 1B4PA 2HRFA 5JCGA 1A2LA 1W89A 1T4YA 2FHEA 1WIKA 1ZZYA 5IMVA 1PRXA 4TXOA 2LJRA 1OE7A 4BL7A 3Q19A 2JZRA 1Z9HA 2C4JA 3P7XA 1O7UA 2HZEB 1TDIA 5ECQB 1OC3A 3GA4A 1Z5YE 3EURA 5G1KA 3TDGA 3HZ8A 4POLA 1FVKA 3RDWA 1DE1A 3FW2A 3QR6A 1SK0A 1XOAA 2N5AA 1TRVA 2VL3A 2K18A 4I5QA 2IIYA 2LQQA 1A23A 1XOBA 3WGDA 3QOUA 3FZAA 4LLRA 4WF4A 1S3DA 2PUKC 3APSA 2GSSA 2OBIA 4XIHA 3W8SA 4ECIA 3LFLA 1J0FA 3FZ4A 3PINA 3TJBA 1E2YA 1R5AA 2PBJA 2JZTA 1TRUA 2PERA 2LNSA 2YZHA 2LV3A 3UL3A 2KOKA 3DVWA 3D0ZA 1SKWB 1OC9A 1MDJA 4NV2A 3ZRDA 4F9ZA 5JWRB 3CSIA 3RBTA 3FZ9A 5G5EA 1G0TA 4MK3A 1JFUA 4KSMA 3A2XA 3TUEA 1EP7A 3UIWA 1M2AA 4AJ8A 2ALBA 1QMVA 5HR2A 1JZRA 4ID0A 5DCHA 1XW9A 4MJBA 4PQHA 1JZOA 1RK4A 4Z7XA 2YV7A 2HRNA 4HZ2A 4ZL9A 6GSSA 2KHPA 4TXVA 4OFMA 1YQ1A 2H66A 1BYEA 2QKEA 3L9SA 3WYWA 3IPZA 2QGVA 2OA7A 1XWCA 2R4VA 2IFQB 1GWCA 1O81A 3ZIJA 2VIMA 1MD3A 4TW5A 4WXTA 3GH9A 2B7JA 5J9BA 5CNWA 4FIWA 3VWUA 5COHA 2K8SA 2OACA 2RIIA 4IJ3A 3O76A 2DMLA 3PGTA 2M80A 4F2IA 2YWMA 1FG4A 3EU3A 1M0UA 5ECMB 4ZB9A 1OKTA 4HDEA 4NPBA 3MAKA 4V2NA 1EGOA 1PL2A 2G0FA 1SD9A 4MJEA 4KGIA 2LUSA 3ZZXA 4JRRA 2R5GA 5E4WA 2J23A 2CVBA 3MNGA 4J56E 1AIUA 2VCWA 3ZLPA 2DSAA 1ZL9A 1HNBA 4KA0A 5LCZA 4EKZA 5E59A 2GSQA 1GUHA 4GSSA 2BTOT 4N10A 2LJAA 1OC8A 4PX1A 1V40A 4GTUA 1EP8A 2V6KA 3TRPA 4MDCA 1N2AA 1T1VA 2TRCP 3UVTA 3EINA 4FYUA 4K0NA 1DSBA 3ZVJA 4KAEA 4XTSA 2YV9A 3V1WA 1FO5A 1GSSA 3EC3A 1WJKA 3IOSA 4EC0A 3MWHA 4L0WA 4PQ1A 2GDRA 3WGEA 3KCMA 1CQGA 1OE8A 1SENA 1DBYA 3BCKA 3WT2A 1TU7A 4IQAA 4DEJA 1F6MC 4CDOA 3FHKA 5CRWA 2JADA 2WCIA 5D8IA 3ME7A 2OE1A 1QGVA 2I81A 2O7KA 1BAYA 3LXTA 3GUSA 4E8HA 3F63A 2RLIA 4XS4A 4GCIA 5D93A 5G30A 5IMDA 4EE0A 4ZILA 2C80A 2H6XA 1NW2A 2TRXA 2B5YA 1C72A 1M7TA 4J2FA 1SK1A 5CP1A 1XBSA 2FGXA 2HSHA 3KMOA 4O7HA 4JE1A 3GTUA 2HYXA 1GUMA 3TJJA 1QUWA 2NTOA 1ZCPA 3IHQA 4OMVA 3E9JB 12GSA 2LRTA 1PGTA 4ZBAA 4TR4A 3P2AA 3DIEA 1G6YA 4ISDA 4JU5A 4IVFA 2VD0A 1HD2A 1EEJA 3HJOA 3CSHA 3KEBA 4KDXA 1CQHA 1K0NA 2VCTA 2GQLA 5DAKB 2YANA 1T3BA 2X99A 4OFNA 3QD9A 4PURA 10GSA 3FR6A 4L8EA 3EU4A 1V2AA 4RI7A 1LJRA 3HYPA 1TXXA 1U88A 2DC5A 3UEMA 4AGSA 3DGQA 2DIYA 4DSRA 3DVXA 4BA7A 1GTAA 4ZL8A 2VLTA 4K6XA 2RUEA 18GSA 2PPTA 3N5OA 4I2UA 1SYRA 5F07A 3LSZA 3KIJA 2OJLA 1ERVA 3IXRA 2XHFA 2VM1A 4TOPA 3UAPA 4ZBDA 2YPMA 1EV9A 4IKHA 4K2DA 3AY8A 3WGXA 2AB6A 2B6MA 3FRCA 2WRTA 2XC2A 2WZ9A 3I69A 4HJ2A 3QFAC 2VCVA 3UBKA 4YH2A 4QL9A 4IS0A 3PH9A 3QAVA 1SL0B 4IELA 3N9JA 4LL1B 3C73A 2H8LA 3O6TA 3GIXA 4OCFA 1QXHA 3VFIA 3ERGA 5IMZA 4HI7A 3BOAA 4HEA2 2ES7A 1XIYA 5D96A 1XW6A 1K3OA 1GP1A 1SKSB 1FW1A 3U5RE 1K0AA 3TOTA 3CSJA 3DMLA 3C71A 4XHMA 3FYGA 3L4NA 4OFTA 4WETA 5CREA 3RPNA 5ID2A 2B3SA 5F06A 2H74A 2B7KA 2AHEA 3TRQA 1SJIA 2VLVA 2R37A 4TN8A 3UJ1A 4N30A 1ZOFA 2C8UA 1PX6A 4Q5NA 1LU4A 1ACVA 1R5PA 5ECNB 1F37A 3M1GA 2C1YA 3TCOA 4Q5RA 4JBBA 2H01A 3ZTLA 1K0BA 2H73A 5D9WA 3KP8A 1FAAA 2C3NA 4PXOA 1EV4A 3DRNA 3ZITA 4TXOB 4KH7A 2I3YA 4WR4A 5J41A 1JLWA 1Z7PA 1J08A 1X5DA 4ZIJA 3VI5A 1TW9A 2KUCA 5AIVA 5IPHA 3F0IA 3Q6OA 4TKYA 5H5QA 2LS5A 2H72A 4MH3A 3L9VA 2DIZA 1M2BA 3RAZA 3VPQA 2A2RA 6GSYA 2LKUA 1X9SB 1JHBA 2F9SA 4X43A 5KN1A 4IHUA 2ZNMA 3M9JA 2MBTA 4YQMA 3Q18A 2VO4A 2OE3A 4IBPA 4TR1B 2IWTA 16GSA 5ECRB 1Y25A 1OC9B 4PUAA 3A3TA 1U3IA 2WDUA 2H19A 2OKAA 3EMXA 4BPYA 4NMUA 1A0RP 1GULA 3HJMA 4ZBBA 2CA8A 2IMEA 2OE0A 1YF1A 4GLTA 1KNGA 4QL7A 4LMWA 4MABA 2H1DA 2LEGA 2C0GA 2AUVA 4HU7A 1XWKA 1XWGA 4NXIA 3GX0A 3APQA 4D73A 3L0HA 5GAPD 4ULXA 1EZKA 2YJ7A 1GTUA 4K7IA 5CO3A 1JLVA 1F2EA 5ECPB 3QDNA 1QK8A 3CRTA 2R6KA 2FWHA 3H93A 4ZB8A 4PQIA 1YY7A 5C00A 3P90A 1MD4A 2O87A 1ST9A 5DALB 2LSTA 2VCZA 3F9UA 3TB2A 3ZVJD 2GQMA 2E2MA 1SKRB 2YOIA 3GKKA 3KTBA 4KB3A 2G2QA 5ELAA 2WB9A 1J9BA 5D73A 1ON4A 3VPTA 1SL1B 3HZ4A 2K9FA 3TGZA 2O85A 2LNTA 4NHZA 3ZIVA 5J9CA 3GL3A 4L0UA 3IDVA 3IRAA 2MZCA 5HR1A 3RHCA 1TKDB 2XBQA 3LXZA 1PX7A 3LWAA 4HQSA 3D4TA 2H70A 2H71A 5ECIB 4I6XA 1A24A 4OCEA 1Y6EA 2JACA 3HCZA 2FWEA 3SBCA 4KE3A 1BG5A 1NHYA 2HFDA 4NV5A 3HVSA 2CX4A 3K8NA 3L78A 1EOGA 4F0BA 2H76A 2CVDA 3MDKA 1GH2A 4FH8A 1ZMAA 5EY6A 4V1Ag 3CXGA 3ED3A 1V9WA 3F6FA 2IFQA 1HQOA 4KDUA 1KEBA 5ELGA 3BJ5A 2FWFA 3VWXA 5L71A 5IOWA 1X0RA 2KP2A 1LBKA 1XPVA 5IMCA 1THXA 5DVBA 3ZYWA 2B5XA 4KDYA 1PN9A 1A8YA 2C3TA 5AGYA 3UBLA 4AF2A 2H0HA 2R2JA 3R2QA 1EWXA 20GSA 6GSTA 1IYIA 1M2DA 4K0GA 1YEPA 4TR3A 2IN3A 1VF2A 1WMJA 4MZBA 5HR3A 6GSXA 5A5KA 2E0QA 1VGLA 4I97A 3LG6A 3TJKA 1THOA 2M46A 3IE3A 3ERWA 4POMA 1XWBA 1H4OA 3A2VA 2AYTA 5IO2A 4XS4B 3S9FA 4ML6A 4ZXGA 2V6OA 1TK8B 2H75A 4KX4A 4EO3A 1FHEA 4KNDA 4K1FA 4MLYA 1ZYQB 2YWOA 1UN2A 3ZREA 1U87A 1K3YA 4GQFA 1VF4A 3QCPA 3HKRA 5IMFA 4OO4A 1FB0A 2H1BA 3IK7A 1AW9A 3TJFA 3KH7A 1AXDA 4O5RA 1ML6A 3LEFA 2H1GA 2F8FA 4MH2A 4BVXA 2MMZA 2F51A 4ECJA 5B8AA 3CBUA 3VK9A 5AISA 4LMVA 4Q5QA 4ZB6A 2NPBA 3G7JA 1X5CA 1GLQA 4JR6A 1W4VA 1MTCA 4Q5FA 2WS2A 5JCUA 1G7OA 3FR9A 2WFCA 3IR4A 4JZQA 1QFNA 1MDIA 5KEJA 1Z3EA 2E7PA 1IYHA 2YN1A 4MF7A 2P5RA 1PA3A 2N5BA 3VLNA 5CAXA 1TI3A 3E3EA 2VCQA 3GHAA 3KJYA 4L5LA 1T4ZA 3W8JA 2DJKA 4YQUA 4GRFA 2AAWA 3C8EA 3RPPA 1ERWA 3DYRA 4KCAA 1UC7A 2NVLA 3EE2A 3KGKA 3HVXA 2MMNA 1TP9A 2DJ0A 1GNWA 3A2WA 2DJ1A 4ZL7A 2HI7A 2EIRA 3FZ5A 5IMAA 2CVKA 1PD21 1O6JA 2K6VA 2PMTA 5ECHB 1OAZA 3TKQA 3IV4A 1F3AA 3BBYA 2ZUPA 5DQSA 2VL2C 1RW1A 4DSSA 3DD3A 3GKXA 2WGRA 2DJ2A 2F3MA 5DDLA 4BVYA 4LL4B 1HNCA 4RQXA 4G10A 3TRXA 1WE0A 3HD5A 3HVVA 4IGJA 2C0DA 1GUKA 1TRSA 2H0GA 4XS1A 2V41A 1T7PB 4OWYA 2FLSA 1SD8A 4MF5A 2FD3A 4X0XA 5INYA 3TJGA 2GSTA 1E6BA 2P5QA 1GSDA 3EYTA 5KN3A 2HLSA 3GURA 2E2GA 1BJXA 2YWIA 5ECOB 5KN2A 3G9BA 2RM6A 3ZL5A 4J57E 1GSUA 2YNXA 1YJ6A 1S3CA 1Z7RA 4H86A 2PGTA 1PQNA 1NHOA 2V1MA 4GSTA 2L6DA 1XVWA 6GSUA 3UARA 2GSRA 1GL8A 4FYBA 4L5OA 5GZZB 2AJQB 2L4QA 4MA9A 1SK2A 4HOJA 4RQRA 2V32A 5IOXA 3CMIA 3KMNA 5H5SA 4JR4A 1A2MA 1BEDA 3ISOA 2LTKA 2REMA 3A5WA 5LD0A 1F3BA 3HXSA 5G1LA 2GT5A 3US3A 3UVHA 1Z6MA 5F05A 2MMAA 5EL8A 2GQKA 1YZXA 11GSA 3C1SA 1TOFA 3HJPA 3ZFLA 2GTUA 5HR0A 3L9UA 1GLPA 2CAQA 2HZFA 1I9DA 2QSIA 2CAIA 4MPGA 1WWJA 3CYNA 3BCIA 2IL3A 4ECCA 2HSYA 3UMAA 5ENUA 1B4QA 1T8EB 2LRCA 3JCML 3KP9A 1R26A 2IMDA 3M9KA 3GYKA 4NWYA 3CTGA 4FO5A 1FB6A 2GVPA 3FY7A 1K0CA 3ZMKA 2GZPA 4TR0A 3GFKA 4XCSA 3IC4A 4EVMA 5A4WA 5JWOB 1PSQA 1TRWA 5B6MA 3GH6A 1O8WA 4YAVA 3KZQA 3APOA 5D9TA 5A4UA 2IPAA 13GSA 5ECSA 2DJ3A 4P3YB 1XXUA 1GSFA 5DCGA 4WEYA 5GAND 2L57A 3IAM2 1GNEA 2MYGA 2A4VA 2P0GA 5HFKA 3VURA 3O3TA 1A8LA 4CW9A 3F4RA 1XW5A 1ERUA 3P8WA 5HQPA 2LJKA 4PUFC 4RUVA 1WRYA 1OYJA 3DKSA 5CRDA 1DE2A 4D73B 4GWRA 4PNFA 1JZWA 3QPMA 2X64A 4ACSA 17GSA 4TRXA 2ZCTA 2R3XA 1NM3A 2FCHA 3D21A 3H1NA 2YWNA 5FWGA 3TKSA 3TKSC 1X9WB 2L6CA 1T00A 1UA5A 2HZEA 3F3QA 3HA9A 3KTLA 2HE3A 4EXJA 9GSSA 4IP6A 3BD2A 1BQ7A 1VRSD 4LA1A 1H75A 2B5EA 3I9V2 3H79A 1PKZA 2GLRA 2BJXA 4G2EA 4TR1A 3I6AA 1GRXA 1S3AA 4O92A 3GSSA 3ERFA 2F8AA 3IK9A 1O73A 2HNLA 2GGTA 2L59A 5IM9A 14GSA 4POKA 3LGCA 2FA4A 5B8BA 1AC1A 1ILOA 4HS1A 5DBQA 4GSNA 1WP0A 3M3MA 3D6IA 2IMIA 2IJYA 2VLUA 3H8QA 5HFIA 3GKMA 19GSA 3CTFA 5IPGA 4WR5A 3MSZA 2B1LA 2O8VB 2YP6A 2JZSA 2X8CA 3GMFA 1K3LA 3CRUA 5CRHA 4QQ7A 4WBJA 2C0EA 2HT9A 4F0CA 3GX8A 2FUG2 2XBIA 3TOUA 3LYKA 1TU8A 4HJMA 4IW9A 3Q74A 3E0UA 4HU9A 2PVOC 3IBHA 1SL2B 5J3RA 3NIVA 5A4VA 3SWLA 7GSSA 1M9AA 5F0GA 2QC7A 3IA1A 2DLXA 3QFBC 3F4TA 5DALA 2HXKA 5CRGA 1GTBA 5FT3A 2PN8A 2JSZA 5GSTA 1DUGA 1XCCA 3C1RA 4G19A 3HDCA 2D2ZA 4GQCA 4AJ6A 2L5OA 1XVQA 2H6ZA 1G7EA 1B8XA 4MCUA 1URMA 1V58A 5G31A 5ECLB 5IIZA 2L4CA 3GL5A 1B48A 2MMOA 3M0FA 4V1Ap 2DBCA 2RM5A 2FNOA 2VCXA 4I8BA 2ON5A 1VF1A 2CZ2A 2A2SA 1XWAA 3GKNA 3WT1A 2PWJA 1HNAA 1MEKA 3FR3A 1O85A 4XRAA 3VI7A 3VWVA 2J9HA 4GF0A 2VM2A 2CV4A 3KXOA 5IO0A 2VD1A 5IQYA 4WF5A 2GS3A 1U3AA 1YKCA 4WBRD 4N0VA 2H0IA 1SU9A 1YDKA 4G9HA 4KW6A 4HZ4A 3QAGA 4MF6A 2VUPA 4EUYA 3DXBA 4DVCA 2JL4A 4DSQA 3J7Yk 4MJAA 3D22A 2LQOA 4IP1A 5LNKe 1ERTA 2H1AA 5J4UA 3GRXA 1SYXA 2CT6A 4IQ1A 3EVIA 2I4AA 4NHWA 3LJRA 1WPIA 1AAZA 1YEXA 1F9MA 2H6YA 4K7OA 1M99A 3GTUB 1HYUA 2LRNA 1AQWA 2P31A 2Z9SA 2XPDA 1EEMA 1TK5B 2CZ3A 4IN0A 1TI1A 5D9XA 5EPFA 3DEXA 3LORA 5D9VA 1M9BA 3F3RA 1B9YC 1BX9A 2PVQA 3ME8A 2EC4A 3F6DA 4HQZA 1GSYA 1Q4JA 3W6GA 3ZMLA 1GTIA 4GXZA 1YKAA 2C3QA 1A2JA 4E8EA 2YZUA 2EIQA 8GSSA 4BWSA 2CX3A 1A0FA 2EIOA 1ZYEA 5AIXA 4K8MA 2L5LA 1JZDA 3H4KA 2AV4A 2YCDA 2GZZA 1ABAA 4PGTA 5AN1A 4DSSB 22GSA 1WOUA 5JCWA 5JWQB 4ECBA 5B7CA 3J7Yb 1GSEA 1QQ2A 2VL9A 1PMTA 4ML1A 4FYCA 3LYPA 3GV1A 4OD7A 4KUNA 3OR5A 4EDYA 3TKPA 3ZFBA 2VOCA 4N0ZA 5G5FA 3GN3A 1UVZA 2V2GA 1EGRA 4TVEA 2VL2A 1PL1A 5ECKB 5HFGA 4AJ7A 4F82A 4XS6A 2MBSA 2KLXA 4ILFA 5F8BA 2O89A 1FOVA 3NZNA 5ABRA 2RUFA 2TIRA 2JU5A 2JSYA 1GSQA 1I5GA 2FY6A 1OKDA 1NSWA 5EVOA 4X1UA 5J5NA 4YQVA 1N8JA 4V2MA 5H5RA 3HHVA 2FA8A 4O32A 3I43A 5G2ZA 1U6TA 1EOHA 2M72A 2NBSA 3PR8A 5DAKA 3M8NA 1PKWA 3TKSE 3G7YA 4BWQA 3EMPA 4OO5A 1V98A 1TK0B 3RHBA 4MMMA 5DQYA 4F03A 3F4SA 1MDKA 1SJ6A 1X5EA 2OADA 4KCEA 4MP4A 4MZCA 2GZYA 1G6WA 3KD0A 5ID2B 4RI6A 3TKRA 3QAWA 2OBKA 5CYYA 4V2LA 4JEDA 3U6VA 1USBA 4KSOA 6GSVA 1AQVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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