2X99A

Thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni in complex with nadph
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
587
structure length
587
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 191
structure length 587
sequence length 587
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x99A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x99A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x99A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x99A03
2PERA 2X3NA 2GV8A 1PA3A 5B8BA 3HJOA 4OCFA 5KOWA 3E3EA 2WP6A 1WWJA 1NHOA 3VPQA 1W89A 3F8UA 1JNRA 4EF0A 2VCQA 3NH3X 4U2LA 4O92A 3GMBA 4H2PA 3RDWA 4Y4NA 4IA6A 4EMIA 3D1CA 2HSHA 2YG7A 1B9YC 2B5XA 2ZUPA 2ZBWA 5JWQB 2OA1A 2Q6UA 3I9V2 5H5QA 1I9DA 3VWXA 3HZ4A 2YNXA 5C04A 4DGKA 4HEA2 4EE0A 3LZXA 4J33A 4U2TA 2WU2A 2TRXA 3DD3A 4CBQA 1FOHA 2AQJA 2H76A 3NN0X 5HXIA 2YP6A 1GALA 2I1UA 3L78A 1USBA 10GSA 4RI6A 2LS5A 1GULA 2JB3A 1M2BA 2KP1A 2V3BA 5GSSA 4YAPA 3GRXA 1RK4A 3ZZXA 2YVGA 4J2FA 4DSRA 4N30A 1ZYQB 3H8LA 1V59A 3GRSA 2FJEA 4MJWA 4FK1C 1EEJA 5ECOB 3UOMA 4KCEA 2H6ZA 3CYNA 2DMMA 2H72A 2HRNA 1QQ2A 2YWNA 5IOXA 5G30A 2VOCA 2GSTA 4E8EA 3QPMA 1XWGA 3ZMLA 3PO7A 5A5KA 4H4VA 2A89A 1ZKQA 4RUVA 2VQBA 4PNGA 3S5WA 4ISDA 2VVMA 3AECA 4YH2A 2OADA 1GSQA 3GKKA 5HY5A 3DVXA 3ZLPA 4KUNA 1NAAA 3LFLA 4EO3A 5B8AA 1Z6LA 1Q9IA 2DKHA 3IWAA 4O5UA 3AEEA 5D9WA 2JKCA 1TI1A 4POLA 2GDRA 2VD0A 2VL3A 3VI5A 2TIRA 3GWDA 5G1LA 3AY8A 1CC2A 4X43A 3UTFA 2BCPA 5FS7A 1K0AA 1SKWB 2XBIA 3D22A 2XFOA 2XLPA 3SM8A 3LJRA 1B5QA 3K7QX 2VCVA 2HZFA 2EIOA 22GSA 4ECJA 4YAVA 2YANA 2XVEA 1Q1WA 4K5SA 2C0GA 2ZZ0A 2VIMA 4HUAA 4XTSA 2XCGA 3M8NA 2XFQA 4IN0A 1X5DA 1VGLA 4F0CA 4EIQA 3CXGA 5C2TA 1SK1A 2EC4A 2JSYA 3IHMA 3VWWA 3PS9A 1HNBA 3AE8A 1GUMA 1OC9B 4HQZA 5J5NA 5J3RA 3NK2X 3NT6A 5BRTA 1LU4A 3L0HA 4FYCA 3QD9A 3P4PA 4YKFA 3NG7X 2D2ZA 1ZYEA 4UDRA 5ECKB 5IMDA 1O95A 1N2AA 3QOUA 4AJ8A 4XRDA 1XPVA 4RQRA 1U87A 2L6CA 2H8LA 4BK1A 4L8EA 4DSGA 2JU5A 1Y0PA 2HI7A 3IK9A 1TDKA 4ZL7A 4TW5A 4TR4A 1HNAA 3V1WA 1O73A 3KJYA 1GSDA 4HJ2A 3AD9B 4NHZA 1NHQA 2RGJA 5EBKA 3GDPA 4WETA 3ZVJA 4BVXA 1FAAA 2H19A 1BYEA 1GSNA 3IAS2 3UARA 1GSUA 1G6WA 1DJQA 3NGCX 1T7PB 1SEZA 4Z2TA 4L0UA 1B48A 4XS4A 2F8FA 1TXXA 4TR3A 2GVPA 3QAGA 2YPMA 2V6KA 4XWZA 4TOPA 1XANA 2E2MA 2GT5A 2A2RA 2IVDA 2C3NA 2B6MA 2FWEA 4NMUA 3CMIA 1IUSA 5HYMA 3V3OA 2XC2A 3CNSA 1G6YA 2GTUA 2FJDA 2XPEA 4XWRA 1BJXA 2WOVA 2C8UA 2MBSA 3RHAA 2YV9A 3UVHA 3NK1X 1SL2B 1DXLA 4GSTA 1UN2A 2B9YA 5JCLA 3KTLA 3N9JA 5D93A 3F6DA 2GQMA 2RM6A 3LQ7A 3ZL5A 2C67A 2C64A 2GF3A 2GSQA 2VO4A 1WRYA 3G9BA 2VRMA 4U8KA 3Q18A 1EV9A 4PGTA 5CQFA 3G7JA 3P1WA 1JZWA 5IQ1A 4XCSA 1F8WA 4GLTA 3IHGA 1ERVA 4YXDA 3UTHA 3KIJA 2LNSA 4POMA 4EC0A 4OPCA 1TYTA 1XWKA 1MD4A 2WEUA 1ZMAA 3NN6X 3KH7A 4H50A 2DJ0A 3HXSA 2C72A 4XS1A 4BJZA 2X64A 1XBSA 3TJKA 1L9EA 2DMLA 2Z9SA 4EQRA 3JCML 2FA8A 2R37A 1G7EA 5CREA 1Y56A 5ENUA 2RGOA 4ZL9A 2X50A 2WPFA 3TKQA 4N0VA 3LG6A 4XS4B 3WT1A 2FNOA 3IAM2 1NHPA 2YLSA 1T3BA 3AXBA 3BNMA 3TKSC 1TDFA 4HB9A 2RABA 2YR5A 3EPTA 1F2EA 3BOAA 2B7RA 2GMHA 1S3CA 5JCNA 3DGHA 3EU3A 5EVOA 2GVCA 3QCPA 1K4QA 5J9CA 1V40A 1PBCA 2C3DA 1XW6A 2XBQA 4N0ZA 1SENA 2C1YA 5DJLA 4ZXGA 1PXCA 1M7TA 3H93A 4ICYA 1GWCA 3IHQA 3IK7A 1KSSA 1PXBA 1N4UA 1L9CA 1DSBA 2WFCA 3DXBA 2GQFA 4KDXA 3FIMB 3ZMKA 4APNA 5LV9A 2PYXA 1PBFA 4A79A 2JSZA 2PHHA 1G0TA 4P3YB 2R4JA 5FS9A 4E8HA 3CTGA 1SJ6A 1FECA 1CJ2A 3GHAA 3DWVA 1WIKA 1NG4A 1EOGA 2H66A 1IUXA 1U3IA 3DJJA 4K7ZA 1CHUA 1ONFA 1XDIA 3B6DA 2HXKA 3RNMA 2YQUA 2VLUA 4OPIA 3DMEA 4H4RA 2C75A 2C73A 2E1MA 4PUAA 1CBOA 1X9SB 2DKIA 5M10A 2EQ6A 1Y56B 4B66A 2O87A 4HI7A 4EVMA 2C3TA 5IM9A 4NEWA 2L57A 2EIQA 1S2YA 1J08A 3DGQA 2OALA 2YG6A 2ARDA 2IMFA 1PN0A 2H70A 3AE6A 1JRYA 4U8PA 1CC6A 4AOSA 1R4WA 3LXTA 4I5QA 5G5FA 3I6AA 4LU6A 4AT2A 1FO5A 2MZCA 4YTMA 5F0GA 5F06A 3ERWA 4IJ3A 5DVBA 2IL3A 5CRGA 2F5ZA 2AYTA 1AOGA 2WHDA 3AYIA 4IV9A 4OVIA 4KSOA 2CQ9A 2JZTA 4BL7A 4C3XA 2IWTA 3KP8A 1LJ1A 1GUHA 1SD8A 2CVKA 4YT0A 2L5OA 4B68A 1A8LA 4Z25A 1LQTA 4BWSA 2GZZA 2WGRA 1RW1A 5DAKA 3DK9A 4CHSA 3ALMA 4ADWA 1PBBA 1FG4A 2WRTA 2YLXA 2BMXA 4U8LA 3GUSA 3DH9A 1XWAA 3G5QA 1PRXA 1Z6NA 2GR2A 1ZL9A 3C73A 5ECPB 1TDOA 2CULA 4Z44A 2B1LA 4GQCA 1SL0B 2LSTA 4XRAA 5DQSA 2JL4A 5IPYA 3QAVA 2BYBA 3F6FA 4OD7A 4TM4A 3ZDNA 1A8YA 2YJ7A 4MJEA 4QL7A 3CN8A 1EOHA 1PL1A 2WBAA 2JADA 1E1MA 2C0DA 2B7KA 3KLJA 1GLPA 1PJ5A 3BJ5A 2PPTA 4IGJA 1QK8A 3VURA 1AW9A 2KLXA 1EP8A 4PUFC 2YWIA 4JBBA 5IMZA 5COHA 1BF3A 5HR1A 2OBIA 4J36A 3UOXA 4JE1A 1E1NA 5AIVA 5DCHA 1PJ6A 5JWRB 1R5PA 1K0IA 4K5RA 3APOA 3HVSA 2YWLA 4ECBA 2LEGA 2OKAA 4I97A 4TXVA 4EL1A 2F8AA 2F51A 2F9SA 3CSIA 1Q1RA 1PKWA 4H4TA 3Q6JA 2O89A 4K9ZA 1VF2A 1CJ4A 4KCAA 3TJJA 1VRQB 4MH3A 4I58A 4GF0A 3I3LA 2B5YA 1S3DA 5KVHA 5DAKB 2L5LA 1F9MA 2I4AA 1V57A 3UCLA 4UDPA 3FY7A 2IIDA 1J0FA 1FL2A 4TR0A 3A5WA 5IQYA 4BVYA 3CGCA 1D4DA 5IPGA 1AXDA 5CRHA 1FCDA 3LWAA 5BULA 5DQYA 1JLWA 3US3A 2VLVA 4GCIA 2LV3A 1XW9A 5IQ4A 4ZB8A 1CJCA 3VWUA 2MMAA 3FW2A 4E0VA 4MCUA 4TVEA 2H01A 4MABA 5CKUA 5J7XA 4IW9A 1K0JA 2BXRA 1RP0A 1SK2A 3Q6OA 2XVJA 4KW6A 3CTYA 3FRCA 3U5RE 4OPDA 4ZB6A 2K8VA 1PS9A 3LZWA 2X8GA 3M13A 2GQLA 2H1DA 3LXZA 1RSGA 4WKWA 1F6MC 1YY7A 5EOWA 1FEBA 2GB0A 3TB2A 1QFNA 2IN3A 2C0EA 2E2GA 2VM2A 1E1LA 2YZHA 1ZGNA 1TTZA 1KDGA 2FA4A 3ZTLA 4OO5A 5F07A 2GEWA 4B64A 3WD6A 3VPTA 1YQ1A 3FR3A 3UAPA 1KNRA 1KTEA 3UTGA 5AIXA 3D6IA 3F0IA 3ZVJD 1DOCA 2H1AA 1GLQA 4GSNA 4C3YA 1X9WB 2BXSA 2WDRA 4FK1A 4H4SA 4ZL8A 1DNCA 3MWHA 4A7AA 1JHBA 1RQMA 2V60A 4WEYA 3EMPA 1JZRA 5HQPA 4DSHA 4ZIJA 3NRNA 5JWOB 3RBTA 2VM1A 2LTKA 3CGEA 5D8IA 3FMWA 2KHPA 4ECIA 2XPDA 1O8XA 3KTBA 4MK3A 2C4JA 3RHCA 4TM0A 4FIWA 2AAWA 5FS8A 2FLSA 3RHBA 2HSYA 4J56A 4ZN0A 4PNFA 4Z24A 1XVWA 1GTEA 4J56E 2ZNMA 1VQWA 4ECHA 4ECCA 1UKVG 2WDUA 1ACVA 2X8CA 5G31A 3CGBA 3UKQA 4PAAA 2B7JA 4RG3A 2QAEA 3MDKA 4KPRA 3R9UA 3EC3A 3P90A 1BG5A 1GTUA 2JB2A 4K22A 1TDEA 3OR5A 4OFNA 2VL2A 2IMKA 5ECSA 4WR5A 3F3QA 1SJIA 2REMA 4IQ1A 2GR3A 1GXFA 1E6EA 2V3AA 3FR9A 3DJDA 1GRFA 5G1KA 1GRBA 2PBJA 3CSJA 1MTCA 2XVHA 3LYPA 2A87A 2KOKA 4N9XA 2FY6A 4RSLA 2OE1A 2BK5A 2GR0A 1K0DA 2AUVA 5LNKe 3GIXA 4X0XA 2CX4A 4MP4A 3HJMA 5J4UA 3RPNA 3BNUA 3M9JA 1JEHA 1OC9A 1FVKA 1CL0A 3ALLA 4Z7XA 4F03A 3ZITA 3GNJA 3E9JB 2DIZA 3W8SA 2AV4A 3GRTA 1IUWA 2OJLA 4TR1A 2YV7A 4AF2A 4Q5RA 1V9WA 2VLTA 5CO3A 1NEKA 1K3YA 2WS2A 3COXA 2YLZA 1H83A 5DDLA 4EQSA 4NV2A 2L4CA 5IMCA 5F8BA 3WGEA 1AAZA 3QSMA 4WBRD 1GEUA 2UZZA 4K2XA 3GH6A 5EL8A 3RP6A 4C74A 3D21A 2VL2C 1TK5B 2K6VA 3DK4A 3GSTA 1DOBA 1H75A 5KRQA 3UL3A 2O7KA 1D7LA 5L46A 2DSAA 1IJHA 1EL5A 1YY5A 1NG3A 4ID0A 2QKEA 2YG5A 2C66A 3CPHG 3BBYA 1TRBA 4B1BA 2GH5A 2XYOA 1B4QA 3UKHA 4K7IA 1MD3A 3AE9A 2R5GA 4MPGA 5HFIA 2MMOA 5ECQB 1VF3A 1N4VA 3F4TA 2AAQA 4J2WA 5FMHA 1QUWA 3RPPA 3J7Yk 1M64A 1SYRA 1GREA 5ER0A 1JLVA 4NWYA 3PGTA 2BC0A 2RUFA 3GYKA 3S61A 4H4PA 3HY2A 4PX1A 3TJBA 2LKUA 2I9HA 2PVQA 5IOWA 1OJ9A 5D96A 4F2IA 2GQWA 1AIUA 3W6GA 3DRNA 1YJ6A 1H86A 1NSWA 2FHEA 3G5SA 1XW5A 1SJZA 1GRHA 2GZPA 1M6IA 4IVFA 4X1UA 4TR1B 2WQYA 1YKCA 4DEJA 3LEFA 4I8BA 4Z2UA 2CAQA 1I5GA 2I81A 4L5LA 3ICSA 1BWCA 4GCMA 4GXZA 3BD2A 1H82A 1ZOVA 4HOJA 2CZ2A 2APGA 5ID2A 2LNTA 1GT8A 3M1GA 4H4ZA 3KXOA 3UBKA 2ON7A 2JBVA 3P4QA 3AE3A 1TJDA 1F8RA 1EGOA 2WPEA 1GSFA 2IMDA 4HZ4A 1TOFA 1F37A 2Q7VA 4EQWA 1JOAA 1REOA 4IQAA 3TRXA 3CTFA 2DJ1A 2XLSA 1VG9A 2CAIA 1GSEA 3R2QA 3FZ5A 4H2QA 4K7OA 3KD0A 2CT6A 2WJUA 3ITJA 1OKDA 5KXJA 2XFPA 1YF0A 2HQMA 3HKRA 3P8WA 4RI7A 4EM4A 2YG4A 2EQ9A 2VCWA 2IIYA 3K7TA 3NIVA 2BA9A 1JZOA 3PR8A 1YF1A 3AE4A 2WB9A 5KEJA 2RLIA 3ZIJA 1SKRB 1GTIA 1RYIA 1ML6A 4POKA 3TKPA 1BKWA 3LB8A 4BURA 3P9UA 4HU9A 2C3QA 3KKJA 3IXRA 1GNEA 3CIRA 1D5TA 4YSYA 2GAGB 2VD1A 3TKSA 4AOXA 2YR6A 1VDCA 3TKSE 4KNDA 4YTNA 4I2UA 1CF3A 4LMWA 2J9HA 4H4WA 5DALA 1URMA 3QR6A 4GUVA 5GSNA 2N5AA 3V76A 3L4NA 2R6KA 4V2NA 4GRTA 2XFNA 3HZLA 2R0PA 3AEGA 1BAYA 3OZ2A 2DBCA 5AGYA 4CCQA 2H73A 3D5JA 1O6JA 3WGXA 2GGTA 5JCKA 1G7OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3UJR A;  4H4U A;  4OPU A;  1PMT A;  1X5E A;  4PAB A;  3NS1 B;  3SFE A;  3PH9 A;  1FEA A;  4MZC A;  2OA7 A;  1XXU A;  4IP1 A;  1MOK A;  4OMV A;  2POZ A;  2A2P A;  2W3S A;  5L71 A;  4K0N A;  3UP5 A;  3NTD A;  1K0O A;  1IYI A;  1B4P A;  1ON4 A;  2C65 A;  3IBH A;  5KMP A;  4G8T A;  1BGJ A;  3MAK A;  2PS2 A;  3V3W A;  4HQS A;  5KWF A;  4G7F A;  2XLR A;  3KCM A;  1U88 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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