4K8MA

High resolution structure of m.tb nrdh
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
84
structure length
84
Chain Sequence
TVTVYTKPACVQCSATSKALDKQGIAYQKVDISLDSEARDYVMALGYLQAPVVVAGNDHWSGFRPDRIKALAGAALTAHHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Glutaredoxin-like protein NrdH
publication title The crystal structure of Mycobacterium tuberculosis NrdH at 0.87 angstrom suggests a possible mode of its activity.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule tags Electron transport
total genus 24
structure length 84
sequence length 84
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-04-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4k8mA00
1T4YA 3ZITA 2CX4A 5GSTA 3J7Yk 2JZRA 4EC0A 1UN2A 2HZFA 2VAFA 3M8NA 2DMLA 4TR1B 3LYKA 4NV5A 4YAVA 2IFQB 1XXUA 1J9BA 2F9SA 4GRFA 2FA8A 4IVFA 2WULA 2LRCA 1Z7RA 3VI7A 3DMLA 2RIIA 3TRXA 1V98A 2WB9A 1AQWA 1GRXA 5JWRB 1M99A 1MD3A 4I97A 4IKHA 2F8AA 1JZWA 1OYJA 2LNSA 4OFTA 5INYA 6GSWA 2YOIA 1B9YC 1ZZYA 2YPMA 2H1DA 5D9WA 3EMPA 4KNDA 3GH6A 1OE7A 4NHWA 2M80A 4HJMA 4DSQA 1U88A 4TR4A 1JZDA 2LRNA 1GP1A 4L0UA 2HYXA 1NM3A 3V1WA 2PWJA 2EIQA 2GTUA 1SD9A 2VOCA 4G19A 1JZRA 1YKCA 4NPBA 5DVBA 3IC4A 6GSTA 2VL9A 5IIZA 1Y25A 4HZ4A 2PU9C 4Q5QA 2C80A 3ZL5A 1S3DA 2L5LA 1JLVA 2XPEA 4OMVA 1LJRA 1G6YA 2LV3A 1GSQA 2NPBA 3OR5A 2CAIA 5B7CA 5IQYA 1F37A 4WETA 1IYHA 4ISDA 5ECIB 3HVSA 3TOUA 5JWQB 2JSZA 5IMCA 4D73B 5ID2B 3E3EA 3ZRDA 3UEMA 2FUG2 3QMXA 2J23A 2ZCTA 4KCEA 4EDZA 3PGTA 3FZ4A 1RW1A 1BQ7A 1GUMA 2I9HA 1GLPA 1SK1A 4YH2A 1OKDA 1ST9A 1GSDA 3Q74A 1T4ZA 4EO3A 4WEYA 2LJAA 3IAS2 17GSA 1ML6A 2GZYA 1AC1A 3HHVA 4L8EA 4G2EA 3P2AA 1O85A 1N8JA 4GSNA 5ECRB 2I81A 2QGVA 2HZEB 2TRXA 1FB6A 2CVDA 3FW2A 3LEFA 3I43A 5AIVA 2NDOA 5KN0A 3UOMA 3APOA 1EEMA 3E9JB 5HFIA 3WGDA 1NW2A 4X43A 3BBYA 4K1FA 1GL8A 1EWXA 2HT9A 2ZUPA 2H6YA 3N5OA 5DQYA 2VO4A 3ERWA 2PPTA 2ZNMA 5DJLA 2CZ2A 2GS3A 3MSZA 2YNXA 3IHQA 4PNGA 5IMDA 1XBSA 4KDUA 9GSSA 1U3AA 1GUKA 2LEGA 1TXXA 2IMKA 5IPGA 4FYBA 3ZFLA 4XS4B 2PGTA 2H8LA 13GSA 1Z5YE 1XOBA 4IP6A 3C1RA 4ZBBA 4Q5FA 5A4WA 1HNAA 1EEJA 1OKTA 1SJ6A 2VM1A 2OA7A 3A2VA 2F51A 1TW9A 2H0IA 1HNBA 4HU9A 1YEXA 1XIYA 2P0GA 5F0GA 3D5JA 2VM2A 3ED3A 4ECBA 2YJHA 4BL7A 1X9WB 2H73A 4YAPA 1T00A 2X8GA 4E8HA 1M9BA 1A2JA 3QAWA 4CHSA 1HQOA 4ZXGA 1WOUA 1XZOA 2B5EA 2IMDA 5D93A 3DXBA 3RHBA 5DAKA 4BA7A 5L71A 10GSA 4POLA 2GSTA 1YY7A 3ERFA 5GZZB 1K0OA 1G0TA 22GSA 8GSSA 1TRUA 2HE3A 3CSHA 4BVXA 2FD3A 1BEDA 5DJMA 3UMAA 3RPPA 2R3XA 4K8MA 3Q6OA 4MJAA 5E59A 2YANA 4J56E 1LBKA 1GTBA 5ECLB 4F0CA 2VL2A 1WIKA 4K7OA 5FHIA 4WBJA 4IBPA 3HA9A 1VF3A 5F05A 3I9V2 4GXZA 4PX1A 2WFCA 3D4TA 3GV1A 4KE3A 3CBUA 2E2GA 4MABA 2YV7A 2L4CA 3IDVA 3NZNA 1PGTA 4GSSA 2DIYA 1GTUA 2GSQA 3TKSA 1O81A 2YN1A 3DWVA 1SJZA 2XC2A 2AUVA 1F2EA 2GQLA 5D9TA 2GQKA 2OBIA 3O76A 2H71A 2KUCA 1W4VA 4MF6A 4IELA 2RM6A 4MF5A 5IO2A 4KCAA 4DSSA 2N5AA 7GSSA 4POKA 1GWCA 4PXOA 4JU5A 2LTKA 2FY6A 4V2LA 4F2IA 3GNJA 1K0CA 1M2BA 3G7IA 3ZTLA 3ZIJA 3BJ5A 4QQ7A 5FWGA 1R5PA 4XS1A 1SYRA 4OWYA 2VD0A 3KMNA 4TOPA 3WD6A 4O7HA 1BJXA 2C3NA 2O89A 1BX9A 3GSTA 5COHA 5IMFA 3DGQA 2DJ3A 4YQMA 5H5QA 3CTFA 3BD2A 1FVKA 5HFGA 4RI7A 4ZL9A 3AY8A 5B6MA 1ZYEA 3CSJA 2D2ZA 1GUHA 4MH2A 2C1YA 4K9ZA 3IAM2 3IE3A 1V9WA 5B6NA 5CRGA 1LU4A 1YKAA 1Z3EA 1ACVA 3D0ZA 2ON7A 3WYWA 1T3BA 5IMZA 2NVLA 4G10A 3ZREA 5KEJA 3WGXA 2X8HA 2HSHA 5CRDA 1A0FA 4ZIJA 4P3YB 4QL7A 4MK3A 3EWLA 3GL5A 2CAQA 1KEBA 2YZHA 2FWGA 1M0UA 1R7HA 16GSA 4MH3A 1QGVA 3CSIA 1ERWA 3A5WA 1XW9A 3QCPA 1X5CA 2QSIA 2LS5A 1XOAA 4K0GA 1F3AA 4MDCA 1U87A 3UVTA 3FR9A 1ZCPA 1QUWA 3DVWA 4ZB9A 19GSA 2C0GA 2JZSA 3KCMA 3VURA 4F0BA 1KBNA 1ZOFA 2DC5A 1AAZA 3VWWA 3WGEA 2R6KA 5D9XA 5KN3A 1MDKA 4HS1A 2B7KA 3F3QA 2HRNA 2L6DA 3HZ8A 2WJUA 4PNFA 2M72A 4F82A 3GFKA 1A2MA 4Z7XA 1X5DA 1SL0B 1KTEA 3FZ9A 5J4UA 1GTAA 1DUGA 3FRCA 1NSWA 2O8VB 3TKRA 4ML6A 1JLWA 3D6IA 3M3MA 5ABRA 1V57A 1Z7PA 4RUVA 5EVOA 1XW5A 1F9MA 3RDWA 5KN2A 4HZ2A 5EL8A 5JWOB 2WCIA 4KW6A 6GSVA 1GSYA 3KH9A 5CO3A 4IP1A 3GL3A 20GSA 2VCZA 3DVXA 3C7MA 1WPIA 2OKAA 2OE1A 1DSBA 5GAND 5H5SA 2O7KA 4AJ8A 4XS6A 1JFUA 4OCFA 1A8LA 4ZL7A 2HXKA 4BWSA 2H70A 2K18A 3C71A 3VWUA 1EOHA 1THOA 3TJGA 5AIXA 5AN1A 6GSSA 5DALA 1HYUA 2H0HA 4PQIA 2R5GA 1VGLA 3H8QA 5IPHA 2BJXA 3KIJA 3L78A 4MZBA 1XWAA 4NAXA 3ZZXA 3H1NA 4PUFC 1SENA 4KUNA 4WR5A 1X9MB 2H1GA 5HR2A 5CP1A 2IMFA 3RBTA 5G31A 1EV4A 3O3TA 2B7JA 4BWQA 5GSSA 1S3AA 1AXDA 3LJRA 2PUKC 2H76A 4WXTA 4HUAA 4MPGA 4POMA 2P5QA 3KGKA 1CQGA 2WDUA 2NTOA 1OC9A 1VF2A 3EC3A 5GAPD 3CXGA 2CZ3A 2OADA 3FHKA 4TN8A 3BCIA 3M9JA 1UVZA 1Z6MA 4TRXA 1Q4JA 4JZQA 3LORA 1ILOA 5ECSA 4AF2A 1PQNA 2H1BA 4KGIA 1O73A 3A2WA 3KMOA 5CRWA 2N5BA 4EUYA 5CYYA 3D22A 3KXOA 3UAPA 4L0WA 1ZYQB 1NHYA 2KHPA 4N11A 5ELGA 2QKEA 1W89A 2TRCP 2DJ1A 5B8AA 2Z9SA 1FAAA 2JU5A 5DAKB 2PN8A 1A8YA 3TRPA 3HJPA 2P31A 3GH9A 2YCDA 4PQHA 2B1KA 1I9DA 2VLVA 3TUEA 3ZYWA 1OVNA 3KTLA 3TB2A 3GUSA 3LWAA 4ILFA 4K7IA 3UBKA 5LNKe 1OE8A 2AYTA 2PVOC 2H6ZA 5F8BA 2FNOA 2YJ7A 4KX4A 2ON5A 2X8CA 2VL3A 1G6WA 2MZCA 3RAZA 3HKRA 1MTCA 2PVQA 5C04A 5ELAA 1TU8A 2JSYA 2CVKA 3CRUA 4RI6A 2HNLA 3GSSA 1T8EB 4MJBA 2GSRA 3GX0A 1A23A 1TI3A 1V58A 4MZCA 4JE1A 2K8VA 1M2AA 2BTOT 2C0DA 1SYXA 3CRTA 1EGOA 5ECHB 4MCUA 2H74A 2GLRA 5D8IA 2DSAA 2DIZA 3VWXA 4DSSB 2PMTA 3IA1A 4HQZA 1K3OA 2FA4A 1J0FA 2VCQA 1MDJA 4JBBA 3HVVA 3W6GA 2KLXA 2VL2C 4FIWA 1QK8A 1K0AA 5D96A 5G5FA 2K6VA 4XTSA 4OO4A 1GSSA 4O92A 3K8NA 4IGJA 5HQPA 4K6XA 1YF1A 3FEUA 4FYUA 3U5RE 1TP9A 3KP9A 4F9ZA 4TR0A 4ULXA 3TKSC 1SKSB 1USBA 2AB6A 4ECIA 3TKPA 1RK4A 2FLSA 3GTUB 2H6XA 11GSA 1MDIA 3M1GA 1TOFA 2VCVA 2VCTA 2AAWA 3FKFA 1EGRA 1E2YA 3ZFBA 3LFLA 4KH7A 2FHEA 2L59A 3P8WA 4HJ2A 1UA5A 3JCML 4N10A 2GQMA 2E7PA 1K0BA 1QMVA 3SBCA 4PURA 4WR4A 3KD0A 4K0NA 1V40A 1UC7A 1GLQA 1WMJA 2XBIA 2LQOA 3ZIVA 2FWEA 4J57E 3HVXA 2H75A 1R4WA 2VCXA 2V41A 2CX3A 1FOVA 3LSZA 1EP7A 1SU9A 2V6OA 3C8EA 2C0FA 4G9HA 4ZB6A 3QAGA 3H93A 5IO0A 2L6CA 1B48A 4E8EA 4MF7A 1Z6NA 1TK5B 3F6DA 2KOKA 3BOAA 3TJFA 3EMXA 3F9UA 4KSMA 3IBHA 3TJJA 3ERGA 3UL3A 5J9CA 2VCWA 1PMTA 3DYRA 5J5NA 4ZL8A 5J3RA 5H5RA 1U3IA 2AJQB 1Z9HA 2RUEA 4O5RA 18GSA 2B5XA 3GX8A 2HLSA 1YF0A 3UJ1A 4FH8A 5G1LA 4MJCA 1EP8A 5J41A 4OCEA 1BG5A 3VLNA 2MMZA 2AHEA 4KDYA 2FGXA 4LL1B 3Q19A 1TI1A 3IXRA 5EY6A 2VUPA 4XS4A 2JZTA 1SK0A 5D9VA 2MMAA 2GGTA 1JHBA 5LCZA 1XW6A 4IN0A 1GH2A 2FWHA 2IL3A 2F3MA 2MMNA 1THXA 3LXTA 3MAKA 5A5KA 4TW5A 3PINA 4F03A 3ME8A 3GURA 1BAYA 1XWBA 4J2FA 5G30A 1XCCA 2GT5A 2LKUA 4GLTA 12GSA 1YEPA 3D4MA 4MP4A 5ECOB 3M0FA 3SWLA 4TXVA 2H01A 3A2XA 4JR4A 2N5FA 4CW9A 5DALB 2MBSA 4PUAA 3VK9A 2CVBA 1ERTA 3APQA 3L4NA 2CV4A 3VPQA 4ECJA 1K0NA 4V1Ap 5KN1A 4GWRA 1WWJA 1BYEA 4TR3A 2C3TA 4EE0A 3KH7A 1ON4A 5E4WA 1GSEA 2XPDA 5IMVA 3TGZA 1XWKA 3FYGA 4GSTA 4Q5NA 3F6FA 1PX6A 1JZOA 1CQHA 4IHUA 4KAEA 2XBQA 4I2TA 1J08A 1EZKA 5IM9A 1OC9B 4BPYA 4TXOA 1I5GA 1TK8B 2KP1A 5G1KA 1WE0A 4IQAA 4Q5RA 1HNCA 1GULA 1NHOA 3VFIA 3HY2A 3F4SA 2IWTA 4OFNA 2GT6A 1T7PB 4EDYA 4YQVA 4HEA2 2OE0A 2C4JA 1MEKA 2H30A 2K8SA 2LUSA 3UARA 4IJ3A 4EVMA 1N2AA 4RQRA 3IR4A 2KP2A 2B5YA 3DD3A 1FB0A 3IOSA 4POBA 4X1UA 4LL4B 2R37A 1GNWA 3L0HA 1ZL9A 3VI5A 3ZVJD 3GA4A 1PD21 2H66A 1FO5A 3HJOA 3KJYA 1HD2A 3GKKA 1O8WA 1TK0B 2HSYA 4I8BA 2V2GA 1R26A 2FCHA 4IQ1A 2RUFA 2O87A 4RQXA 4XRAA 3L9UA 4ZILA 4XCSA 4KB3A 2I4AA 3U6VA 4KSOA 1GSUA 3E0UA 4HU7A 3TKSE 5IMAA 1M7TA 5IOWA 3LXZA 4N0ZA 3G7JA 2IPAA 4ML1A 2PBJA 4OD7A 2YWOA 3DRNA 4PQ1A 4X0XA 5LD0A 1K3YA 1VRSD 3TOTA 2JL4A 3F0IA 5ECPB 3EINA 3FZAA 5F07A 3ZMKA 3F4RA 3EU3A 3IK7A 1IYIA 3L9SA 3ME7A 1F3BA 2WRTA 2A2SA 3MWHA 3TKQA 3DIEA 1FW1A 2R2JA 3PR8A 2VLUA 1QQ2A 4O32A 3VPTA 2IIYA 5ECNB 4MJEA 1YDKA 4NV2A 2JADA 1S3CA 2VIMA 1URMA 3EU4A 3LG6A 4MPFA 1AUCA 1GSFA 1T1VA 1K0MA 3G7YA 1PX7A 4N30A 4DSRA 1FG4A 2JACA 5AGYA 4HI7A 4HDEA 2J9HA 4V1Ag 2IMEA 1OC8A 4TKYA 5CREA 3W8SA 1VF1A 2F8FA 4CDOA 4DEJA 3N9JA 1WP0A 4AJ7A 1U6TA 2L4QA 5HR0A 1ZGNA 3F4TA 2DBCA 2YZUA 2H19A 5JCUA 4IJIA 1O8XA 6GSXA 2R4VA 2CT6A 2MMOA 3LYPA 3FR6A 5DCGA 4YQUA 4ECCA 2EIRA 1X5EA 2C0EA 1TDIA 1DE2A 3CYNA 3TCOA 4K2DA 4LMWA 2AV4A 4NXIA 4ZB8A 4K7NA 1TRVA 1KNGA 3GRXA 1OC3A 5F06A 2V32A 4GCIA 1X9SB 1B4PA 3KTBA 3W8JA 1Y6EA 5HFKA 3R2QA 2DJ0A 3EYTA 3MDKA 1G7EA 1AQVA 4TR1A 3Q18A 2YWIA 3UVHA 2IFQA 1ZMAA 3KZQA 2H0GA 3EVIA 2HRFA 3HD5A 3NIVA 4XHMA 2K9FA 2C8UA 2WGRA 3KP8A 3GYKA 1XWCA 3HJMA 5DCHA 1PN9A 2TIRA 3HZ4A 4L5LA 3S9FA 4GQFA 2X64A 4LA1A 3HCZA 2VD1A 4DVCA 3G9BA 3D21A 3CMIA 2YWNA 2GZPA 4GF0A 2I3YA 3US3A 1PRXA 1DBYA 2GVPA 4OO5A 2G0FA 2EC4A 5DQSA 1SL1B 2DJJA 1GTIA 2OE3A 1V2AA 1PSQA 2B6MA 1SKRB 2H1AA 3UBLA 1XWGA 2V1MA 1VF4A 5ECMB 1M9AA 2GSSA 1AQXA 2I1UA 1A24A 1OAZA 3WT2A 4EL1A 3F63A 3UIWA 1SK2A 5A4VA 4GTUA 4IS0A 2DJKA 3CTGA 5CNWA 2M46A 3DKSA 3QR6A 2P5RA 5CAXA 4NWYA 1PA3A 1Q98A 2H72A 2WZ9A 1A0RP 1C72A 4FYCA 3O6TA 3LGCA 5FT3A 4PGTA 5JCWA 2VLTA 3I6AA 4D73A 5ID2A 5HR1A 5B8BA 4AJ6A 2O85A 3IV4A 4I5QA 3QDNA 1O6JA 14GSA 1XFLA 1K3LA 1WRYA 2IMIA 5C00A 3C1SA 5D73A 1AIUA 1K0DA 3WT1A 2OBKA 4AGSA 1GNEA 3GN3A 5IOXA 3TRQA 3ZMLA 4L5OA 3TJKA 1DE1A 4FO5A 3PH9A 4MA9A 5EPFA 2RLIA 3HYPA 4ZBAA 2XHFA 5ECQB 2NBSA 2LSTA 3P90A 3GHAA 1M2DA 1WJKA 3EE2A 4TXOB 2OACA 2CQ9A 5J9BA 2L57A 1EOGA 2HZEA 4I6XA 3TDGA 4EF0A 1PKWA 1TKDB 3VWVA 2LRTA 1YQ1A 3FK8A 3IPZA 1PL1A 4HOJA 2A2RA 2FWFA 4EKZA 4HQSA 3QD9A 3LQ7A 1XPVA 2HI7A 2YP6A 1TRWA 4ACSA 1TU7A 1SD8A 2YWMA 2LJKA 1MD4A 4V2NA 6GSYA 4KDXA 1RQMA 2E0QA 4IW9A 1TRSA 3GIXA 2G2QA 2DJ2A 5DDLA 3ZLPA 4MZWA 2C3QA 1TJDA 3KM6A 3FZ5A 1O7UA 1QXHA 2LJRA 2X99A 4JRRA 3MNGA 6GSUA 2B3SA 1QFNA 3GKMA 3M9KA 5JCGA 2EIOA 3H79A 2IN3A 3QAVA 2PERA 1B4QA 2DMMA 2B1LA 3GKXA 4JEDA 5G2ZA 2OJLA 3QPMA 1B9XC 3F3RA 4EXJA 1FHEA 3QOUA 4WF4A 3KEBA 4XIHA 3FR3A 5AISA 4WF5A 1ABAA 2LQQA 3C73A 4MLYA 1PKZA 2GDRA 4GQCA 4LMVA 5ENUA 4ID0A 3GTUA 3NOFA 4H86A 4BVYA 5HR3A 5A4UA 3QFAC 1PL2A 1F6MC 1H4OA 1XVWA 4KA0A 4NMUA 4MMMA 2V6KA 4QL9A 5DBQA 4N0VA 1YZXA 3ZVJA 1XVQA 3GMFA 4TVEA 1EV9A 2MBTA 1A2LA 3DEXA 2WS2A 1SKWB 2DLXA 3APSA 1TTZA 3L9VA 2A4VA 3TJBA 4LLRA 2REMA 3FY7A 1SL2B 3F8UA 2HFDA 3A3TA 2ALBA 4V2MA 2MYGA 3HXSA 2ES7A 3P7XA 1G7OA 5ECKB 4ZBDA 1SJIA 3RPNA 1H75A 1X0RA 1B8XA 3BCKA 2LNTA 3HDCA 3GKNA 3I69A 1FVJA 2IJYA 3H4KA 2RM5A 1R5AA 1AW9A 2CA8A 3EURA 2E2MA 3J7Yb 2BMXA 1ERUA 4WKWA 3ISOA 3IK9A 4NHZA 2L5OA 3RHCA 2QC7A 2YV9A 3IRAA 4I2UA 4JR6A 1E6BA 1YJ6A 5G5EA 2GZZA 1ERVA 4WBRD 4OFMA 4XRDA 3QFBC 5CRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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