3BJ5 | Genus

Total Genus 33

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	33
sequence length	130
structure length	130
Chain Sequence	LVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYDGKLSNFKTAAESFKGKILFAFIDSDHTDNQRILEFFGLKKEECPAVRLITLEEEMTKYKPESEELTAERITEFCHRFLEGKIKPHLMSQELPEDWD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Alternative conformations of the x region of human protein disulphide-isomerase modulate exposure of the substrate binding b' domain pubmed doi rcsb
molecule keywords	Protein disulfide-isomerase
molecule tags	Isomerase
source organism	Homo sapiens
total genus	33
structure length	130
sequence length	130
ec nomenclature	ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date	2007-12-03

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3bj5A00

2VAFA 1ST9A 1PX6A 2X99A 6GSUA 2H71A 3ZYWA 2GQKA 3D22A 4X1UA 3C71A 3P90A 2FD3A 2C0FA 3GX8A 3ZVJA 4BA7A 1T4ZA 4PGTA 3FKFA 5CREA 3P7XA 3IDVA 4HU9A 4IP1A 1TU7A 1MD3A 1ZZYA 5AIXA 5KN0A 3HYPA 5D73A 3IE3A 1B4PA 1ZL9A 2P31A 2E2MA 1A0RP 3KH7A 3D4MA 4F0BA 3D6IA 1OC9A 3KD0A 2DJJA 3GNJA 3M9JA 4PURA 1TOFA 2H01A 5HQPA 1B8XA 1OAZA 1X9MB 3M1GA 1R5PA 3RBTA 1Z6MA 1J0FA 2C3NA 2IMDA 5ECMB 4HZ4A 1AXDA 1M9BA 3LFLA 2PVOC 1RQMA 5JWOB 4QL9A 1EV4A 2LRNA 1B9YC 4YAVA 1GRXA 2RUFA 2K8VA 1E6BA 4FYUA 1THXA 2JL4A 4F03A 2GSTA 5F8BA 5EVOA 4ZB6A 2J9HA 4L0UA 4N0VA 4PQHA 1TJDA 5ENUA 4ECBA 4PUFC 3FEUA 5C04A 4JU5A 4ZBAA 4TXVA 4L8EA 1TK8B 1SL2B 3KH9A 4ZXGA 2C0GA 1OVNA 2E7PA 2RUEA 5IOXA 1TRSA 4K8MA 4H86A 1K0OA 4X43A 4V1Ap 3RPPA 2H72A 2K8SA 5FHIA 1GLQA 4MF6A 1N8JA 3EMPA 2CV4A 2H1AA 1K0AA 2A2SA 2IIYA 4OD7A 4MDCA 2LNTA 2LV3A 2TRCP 1PKWA 4F2IA 2J23A 3FHKA 2L59A 2LJKA 4MCUA 1DUGA 3VWWA 1JLWA 3ZVJD 3ME8A 1O81A 1WIKA 2G2QA 4WBRD 2WB9A 2CAIA 3OR5A 2R3XA 5DQYA 2R6KA 1M2DA 1XOAA 2L6DA 3HVXA 2OBIA 2VOCA 3GIXA 2YZUA 5EL8A 5GAND 1Z5YE 2WGRA 2O8VB 2V6OA 2YV9A 4L0WA 2C8UA 4TR3A 3QFAC 2FUG2 3QOUA 5JCGA 1DE2A 2B6MA 4GWRA 1JLVA 4EE0A 4IQAA 3PGTA 4MH3A 2MMNA 3HJOA 3KMOA 5ECLB 4KW6A 2WZ9A 1OKTA 4TOPA 2GS3A 1V98A 1V2AA 1WP0A 3F6DA 2JACA 3QD9A 5AGYA 1UC7A 5H5SA 3GKKA 5F05A 3F4TA 2LNSA 4KGIA 6GSWA 1BYEA 1DE1A 2EIQA 1WJKA 2CAQA 1T7PB 3GN3A 4D73B 3TJKA 2DSAA 4POKA 4JBBA 1BX9A 5H5RA 4EF0A 1F9MA 2IWTA 3IRAA 1BQ7A 1GSEA 2YWIA 3P8WA 2O87A 2VL9A 3P2AA 4DSQA 5IPHA 3VPTA 4O5RA 4I97A 2H30A 3IK9A 1EWXA 2CT6A 3A3TA 1ZOFA 4TKYA 2FA4A 4OMVA 1GTAA 3EVIA 2NTOA 3FZ4A 3GTUB 5ECSA 1GULA 1S3CA 5A5KA 4WXTA 4MABA 4KA0A 4MPFA 4ECCA 4ZB8A 4D73A 4PX1A 3KCMA 4IP6A 2ZNMA 1TU8A 1GSDA 1Z6NA 4JRRA 2IMKA 1M2AA 3UAPA 2PGTA 2B5XA 4PQIA 1MTCA 3VLNA 4BPYA 2M46A 2HSHA 4KE3A 4POBA 2HLSA 5IMVA 3ERFA 5D8IA 2L57A 2FCHA 4CHSA 2JU5A 1GNEA 2FGXA 3HVVA 4AJ7A 3GTUA 2BJXA 2PUKC 5ECIB 2C3TA 1A2JA 2WJUA 3EYTA 4GQCA 2H66A 3UIWA 2HRFA 1YDKA 5ECRB 1TI1A 1EV9A 3EURA 1TRWA 3DD3A 5CAXA 2FWHA 4EUYA 19GSA 4X0XA 1X5CA 4RI6A 1WWJA 3TCOA 2PERA 5EPFA 3IK7A 2VLTA 4G9HA 3GYKA 3NZNA 1U88A 4LMWA 4HJMA 3FRCA 1R4WA 4MH2A 4G2EA 3A2XA 1GL8A 3EE2A 7GSSA 2ZUPA 5LNKe 1WMJA 3W8JA 1GUMA 1G6WA 3H93A 5CRHA 1GSUA 1RK4A 3LEFA 2XHFA 1O8WA 3LG6A 2OACA 16GSA 5CNWA 2C80A 1G6YA 2YWOA 4ZBBA 1B48A 1JZOA 4BWSA 1KTEA 2P5RA 2V32A 3F3RA 1QGVA 1GTBA 2I4AA 5G5EA 1OYJA 5KN2A 1RW1A 3K8NA 1V58A 1PL2A 2FWGA 2MZCA 1OKDA 3VURA 4IS0A 2CZ2A 1XWGA 1TDIA 4J56E 3HCZA 2L6CA 5F07A 1AAZA 4WF4A 3TKSA 2JSYA 1NM3A 3HHVA 1U6TA 3KEBA 5EY6A 2NDOA 3KJYA 2YN1A 5G2ZA 1PL1A 2QKEA 3R2QA 4NPBA 1U3AA 2VCZA 3EC3A 4MZBA 5ABRA 2H73A 2B1LA 2XPDA 3CTFA 2KP2A 4GQFA 2H6XA 4KDXA 1XCCA 2P0GA 3O76A 2O85A 1MDKA 5HFGA 2HE3A 1FG4A 4HEA2 1SK0A 3FK8A 3M8NA 3APSA 3GX0A 4DSSB 2R4VA 1TK5B 3Q74A 3ME7A 1YF0A 3C1SA 4I2TA 2VLVA 2C3QA 4I6XA 4ML1A 4ECJA 1G0TA 4TXOB 4Q5QA 4V1Ag 4EL1A 2AHEA 3CTGA 2V41A 4TVEA 1XVQA 3QPMA 4KCAA 5C00A 2V6KA 3MNGA 2YZHA 5B8BA 3DWVA 4E8EA 1GUHA 1SKRB 4EO3A 6GSXA 3MSZA 3VK9A 4XRDA 4P3YB 2LQOA 1K3OA 2H1BA 5F06A 2WDUA 2DJKA 4HQSA 1R26A 5KEJA 1AW9A 4IQ1A 2GZZA 4DSSA 2NBSA 1HQOA 2AV4A 4MJEA 3H4KA 2X8GA 2AYTA 3CSIA 4FYBA 4Z7XA 1SKWB 4KAEA 3QMXA 5DALB 1GUKA 3I6AA 4POLA 4TXOA 1QFNA 2R2JA 3F4SA 1THOA 1GP1A 3EMXA 2CQ9A 1G7EA 5ID2B 1TI3A 4EDYA 3DRNA 4EXJA 4IKHA 4RI7A 5D9TA 1A8YA 2AB6A 4IHUA 3WGEA 1AIUA 2HYXA 11GSA 4KX4A 1VRSD 5B7CA 1WRYA 2G0FA 1HNAA 4XHMA 2XBQA 4BVXA 3FZ5A 5COHA 2DJ1A 2O89A 1HNCA 3ZITA 4DVCA 5GSTA 3BBYA 1Y6EA 1XXUA 2E2GA 2DMMA 4WBJA 3GV1A 5DALA 1T00A 4L5LA 2VL2A 4GLTA 2YCDA 1MDJA 1M99A 4V2MA 5DBQA 1JHBA 2DJ0A 2KUCA 1ABAA 2VL3A 2K9FA 1AC1A 2LQQA 3ED3A 4ZL9A 3H1NA 5ID2A 1Q98A 3LJRA 1YY7A 1FB0A 1G7OA 18GSA 3I9V2 6GSVA 4DEJA 4L5OA 2YPMA 3Q18A 2H1GA 3CMIA 2PMTA 5F0GA 3UBKA 1SENA 5G1KA 3WGXA 2VCWA 1F3BA 1M7TA 3IOSA 4TR0A 4ECIA 4WF5A 2L4QA 5E4WA 1V40A 5DAKB 4V2NA 1AUCA 2VUPA 2OE3A 4IELA 3FYGA 1HYUA 1Z7RA 3S9FA 3BCKA 2BTOT 1OC8A 2DJ3A 2YJHA 2AJQB 2WULA 4HU7A 5ECKB 2F8AA 2O7KA 4K7OA 5DCHA 4FO5A 1GLPA 1FW1A 2A2RA 4LA1A 3E9JB 5LD0A 4CW9A 5G1LA 3HZ4A 2H74A 3G7JA 1J08A 1MDIA 4KUNA 4DSRA 4KB3A 2L5OA 2B3SA 4JEDA 4MF5A 2QSIA 3DMLA 2OJLA 2H6ZA 2YV7A 3TRQA 5DAKA 1X9SB 2X8CA 3MWHA 2GLRA 5IMAA 5IO0A 5DQSA 1YKCA 1XWBA 3QAVA 4TRXA 4GF0A 3IPZA 5KN3A 10GSA 1SD9A 1VGLA 3HVSA 2VM2A 3KTLA 3EU4A 1QQ2A 4HS1A 1X0RA 4OCFA 2B5YA 3PINA 3M9KA 4RUVA 3TRXA 4WR4A 3IC4A 3IXRA 3RDWA 20GSA 1GTIA 3ZLPA 2KHPA 2HFDA 4I2UA 3WT1A 2VD1A 2HZEB 1USBA 3TOUA 5CP1A 4V2LA 1OE8A 2YWMA 4IGJA 1PMTA 1AQXA 3GH6A 1FO5A 1M0UA 2DC5A 3TRPA 3IAM2 5H5QA 1YQ1A 4FH8A 2IMEA 4KDYA 3HDCA 4PUAA 3WT2A 2RM6A 1XW9A 4AF2A 3A2WA 1VF4A 5D9XA 4HDEA 1EZKA 1JZWA 1NHYA 1EOGA 1K3YA 2XC2A 3KP9A 3CXGA 13GSA 3E0UA 1A8LA 3N5OA 1VF2A 2HZEA 1IYIA 1PGTA 2FA8A 1F2EA 5A4UA 3F9UA 2C1YA 3NOFA 1PX7A 3AY8A 3L0HA 4K0GA 5ECHB 1O85A 3RAZA 4ULXA 5HFKA 4FYCA 2TRXA 5CRGA 3HJMA 4J57E 4K7IA 1IYHA 5ECOB 2JZSA 4N0ZA 4LLRA 1SK2A 2JZTA 2IFQB 1X5DA 2GZPA 1KNGA 1M2BA 4KDUA 1GH2A 3UOMA 4K0NA 1TRVA 5D9WA 4MA9A 3CSJA 1Z7PA 4YAPA 2VCVA 1YJ6A 3H8QA 4XIHA 3L9UA 5IIZA 5IQYA 3L4NA 2WRTA 3UBLA 3ZFBA 4ACSA 3QAGA 5IOWA 2REMA 1K3LA 5DCGA 5GSSA 2H8LA 4GCIA 1J9BA 2H6YA 4YQUA 3A5WA 1QMVA 1F3AA 4ZL8A 2IFQA 4HUAA 3UJ1A 4ZBDA 4IN0A 1JZDA 2MMAA 3TOTA 4GTUA 2NPBA 3WD6A 4TR1A 1X9WB 2YJ7A 4IBPA 3TB2A 3F6FA 3F0IA 4MLYA 2FY6A 3VI7A 1I5GA 4AJ6A 3C7MA 2PBJA 2PPTA 1BG5A 4KSMA 4PNGA 5B6MA 3ISOA 3ERWA 2ES7A 2FNOA 4NHWA 3LWAA 2OA7A 4IVFA 3KP8A 1U87A 1CQGA 4JR4A 3LSZA 4NWYA 1Z3EA 3IR4A 3ZFLA 4ZILA 1S3AA 2I3YA 3J7Yk 5ECPB 3FZAA 3RHCA 2F9SA 2H70A 1UN2A 1T1VA 2ZCTA 4MJBA 2DIZA 2MMZA 4FIWA 3KZQA 3GKNA 1W89A 3UL3A 2HZFA 1EGOA 1ZYQB 1EP8A 5IMCA 3PH9A 3GURA 2ALBA 2FHEA 2BMXA 1BAYA 3F4RA 4RQRA 3UMAA 5IPGA 4OO4A 5FWGA 4YH2A 4O32A 2OKAA 1GSSA 2LUSA 3GKXA 2GSSA 1GSQA 3CBUA 4NAXA 4OFTA 2VLUA 2KOKA 2PWJA 3GA4A 4ZIJA 1TXXA 2HSYA 2H1DA 3GRXA 4NMUA 2F51A 1QXHA 2B1KA 3GUSA 2DMLA 1FHEA 3H79A 3D0ZA 3TKQA 2B7KA 2HT9A 4BWQA 5CRWA 1NSWA 2L4CA 2X8HA 1F37A 2E0QA 2LJRA 4NXIA 3FR6A 4I5QA 4MJCA 2HNLA 4ML6A 1YEXA 3HY2A 1FVJA 1XIYA 1LBKA 1HNBA 1Q4JA 3Q6OA 3ZIJA 3ZREA 4MP4A 2GTUA 4Q5FA 1H4OA 3TJFA 3ZMKA 3MDKA 2AUVA 1ERVA 1R7HA 4WR5A 3GHAA 5JCWA 2H75A 1HD2A 2C4JA 1SK1A 1XZOA 3IA1A 2MBSA 4GRFA 2LEGA 1XW6A 4JZQA 2F8FA 5HR3A 1XOBA 4ZB9A 3DEXA 4GSSA 1SYRA 4ID0A 2I1UA 9GSSA 1DBYA 2H0GA 3HA9A 1GTUA 4E8HA 4HZ2A 3KGKA 4CDOA 2VL2C 1I9DA 5INYA 1O7UA 4G19A 1UA5A 1KBNA 3L9VA 2RLIA 2WS2A 3ZTLA 3C8EA 1PSQA 2VCXA 4O7HA 4XTSA 3VFIA 1PA3A 2XBIA 2YWNA 3U5RE 3QCPA 4NV2A 3FR3A 3D4TA 5B8AA 4QL7A 1M9AA 5HFIA 2CZ3A 1ML6A 2V2GA 4JE1A 2FLSA 1EP7A 3GSTA 1AQWA 3IAS2 3APQA 2N5BA 1XWAA 3LQ7A 3I43A 4HI7A 1SJIA 4K1FA 3UVHA 3BCIA 22GSA 2DIYA 1SYXA 4OO5A 1V57A 4PNFA 2K6VA 1NHOA 2L5LA 3KM6A 5D93A 8GSSA 1SU9A 1FOVA 2JSZA 3KXOA 5ELAA 4MMMA 1S3DA 4IW9A 3TKRA 5FT3A 4O92A 2LRTA 2IJYA 1EOHA 5A4WA 2FWEA 1XWKA 3LORA 3APOA 3C1RA 1ZYEA 2HXKA 1A2MA 3KIJA 2QGVA 4EC0A 17GSA 4F0CA 4AJ8A 1V9WA 2H19A 4MK3A 3LXTA 1FB6A 3US3A 1YEPA 4XCSA 1LJRA 2WCIA 4MJAA 3TKPA 3PR8A 3LYKA 1FAAA 2LS5A 2IL3A 3TKSE 1PD21 3U6VA 1ON4A 1X5EA 1EEMA 3CRTA 3D21A 3RPNA 2VCTA 2OBKA 4J2FA 4XS4B 3HJPA 3VWVA 4MZWA 4MF7A 5B6NA 5IMZA 1LU4A 3QFBC 3VWXA 2IMFA 3EWLA 2GDRA 5CRDA 5LCZA 3DXBA 3ZZXA 5J41A 1K0MA 3TJJA 3WYWA 5A4VA 3GH9A 4YQVA 3WGDA 2GGTA 1SJZA 3SBCA 2A4VA 2N5AA 2HI7A 1Y25A 5IM9A 1B4QA 2LKUA 1A2LA 5KN1A 4I8BA 1Z9HA 3ERGA 1CQHA 4Q5RA 1WE0A 3F63A 3GFKA 3W8SA 3M3MA 4XS6A 5JWRB 4HQZA 4BL7A 5ECQB 4LL1B 5IMDA 4XS4A 2MMOA 2P5QA 3W6GA 4EKZA 4K7NA 1ZMAA 1OE7A 2V1MA 1N2AA 2OADA 3IBHA 2YANA 1T8EB 4Q5NA 1KEBA 2ON5A 3FW2A 4OFNA 1SL0B 3QR6A 4KH7A 12GSA 4EVMA 3TJGA 1BJXA 2FWFA 2K18A 4HJ2A 3UVTA 2B5EA 3RHBA 4BVYA 1ACVA 2H0HA 3F8UA 3KMNA 3Q19A 4N10A 4RQXA 4TW5A 1TK0B 5ECNB 4TR4A 5J4UA 1VF3A 2GZYA 4K9ZA 2C0DA 3LGCA 4XS1A 2VD0A 4N30A 2EC4A 2GSRA 2N5FA 3C73A 1BEDA 6GSYA 1TP9A 5AISA 1F6MC 1ZCPA 5G30A 1GSFA 2GVPA 2GT5A 3E3EA 1JFUA 4K2DA 1EEJA 4G10A 5HR1A 5J5NA 1T3BA 4ISDA 3LXZA 2IPAA 1A23A 4XRAA 4AGSA 3MAKA 5J9BA 5HR0A 4ILFA 5ELGA 1R5AA 3GKMA 5GAPD 5CYYA 3D5JA 3JCML 3ZL5A 5IO2A 4TR1B 6GSSA 1NW2A 1H75A 1DSBA 1A0FA 3G9BA 2H76A 2PN8A 3GL3A 2YP6A 1UVZA 2TIRA 3DVXA 1XPVA 2OE1A 4JR6A 2WFCA 4ZL7A 4LMVA 5J9CA 3A2VA 3IV4A 2EIRA 3QDNA 2YNXA 1O6JA 4PXOA 1GNWA 5DVBA 4F82A 4OFMA 1XWCA 3DKSA 1ZGNA 3N9JA 5D96A 2VCQA 4YQMA 5J3RA 3DYRA 3ZRDA 1K0NA 3L78A 1YKAA 2IN3A 5AN1A 3NIVA 5DJLA 4NHZA 3TUEA 3VPQA 4MPGA 1VF1A 5E59A 1ERWA 1XVWA 4GXZA 1T4YA 3DVWA 3UARA 5D9VA 2Z9SA 1B9XC 2LSTA 3SWLA 3GL5A 4LL4B 1SJ6A 2AAWA 2RIIA 3EINA 2IMIA 5JWQB 2R37A 5IMFA 2CA8A 2PVQA 5DDLA 3G7IA 4EDZA 1AQVA 4GSTA 1TTZA 1JZRA 2X64A 3BOAA 2GQLA 2CVDA 1QUWA 1ERTA 2HRNA 3HXSA 3UEMA 3TKSC 2LJAA 5CO3A 3VI5A 1EGRA 2M80A 1A24A 1SD8A 3TGZA 2MBTA 1PQNA 2LRCA 3BD2A 3TDGA 2I9HA 2NVLA 2CX3A 1O8XA 4N11A 1E2YA 2QC7A 1K0CA 1WOUA 1W4VA 4KCEA 1TKDB 3VWUA 2MYGA 1YZXA 3IHQA 1XW5A 3FZ9A 3DIEA 2C0EA 6GSTA 3FY7A 3EU3A 2OE0A 2CVBA 3ZMLA 1MD4A 1SKSB 1XBSA 2RM5A 2LTKA 4KNDA 2F3MA 1C72A 4NV5A 1GSYA 4WEYA 1QK8A 2JZRA 2VM1A 2KP1A 4IJIA 3HZ8A 1TRUA 2GQMA 2EIOA 14GSA 1K0DA 4QQ7A 3J7Yb 1GWCA 1XFLA 3DGQA 4WKWA 4WETA 2I81A 5AIVA 3G7YA 2ON7A 4PQ1A 1PKZA 1MEKA 2JADA 1ERUA 3TJBA 3O6TA 2VO4A 3BJ5A 4POMA 2DLXA 2GT6A 5L71A 4MZCA 1FVKA 1ILOA 1PN9A 4TN8A 2XPEA 4K6XA 2PU9C 5JCUA 3CYNA 3HD5A 5DJMA 4IJ3A 1O73A 3GSSA 2B7JA 2D2ZA 3FR9A 4KSOA 5G31A 5GZZB 2CVKA 3L9SA 2DJ2A 4OWYA 4OCEA 3KTBA 4GSNA 3GMFA 2DBCA 3HKRA 2CX4A 2H0IA 2VIMA 3I69A 1OC3A 2GSQA 2M72A 3CRUA 1TW9A 1WPIA 3CSHA 1YF1A 1K0BA 1OC9B 3V1WA 3F3QA 3LYPA 2R5GA 2KLXA 4HOJA 1URMA 5G5FA 1SL1B 2YOIA 4F9ZA 1PRXA 3QAWA 3M0FA 3O3TA 1U3IA 3ZIVA 5HR2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3BJ5A

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