4LA1A

Crystal structure of sjtgr (thioredoxin glutathione reductase from schistosoma japonicumi)complex with fad
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLQRTIESAAVIVFSKTTCPFCKKLKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSVIQKALSNFSKIETVPQMFVRGKFIGDSKAVLNYHNNNQLQAIVNENKYDYDLIIIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKIAVLDYVEPTPMGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHSLEDAQHFGWSLDKSEISHDWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVSLRDNAVTYLNARGMLLSPHEVQITEKNKKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAIEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVVGASYVALKCAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEITQLKPVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKLNCEAVGVKLDKNGRVVCSDDEQTTVSNIYAIGDINAGKPQLTPVAIHAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDNDIEVYHSHFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRISDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKEDFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKRSGGSAAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of SjTGR complex with FAD
rcsb
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma japonicum
total genus 197
structure length 586
sequence length 586
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2013-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 4la1A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4la1A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A03
5F07A 5BVAA 1SKSB 1B8SA 4UDRA 3ICSA 1CJ4A 1JFUA 3GUSA 3FZ9A 5CRHA 5BULA 4TR3A 1EV4A 2ZNMA 4I8BA 4OPTA 1NEKA 1CJCA 2HZEA 2JAEA 4OFNA 4Q5RA 2GSSA 2YWNA 2OAMA 3D22A 4AJ7A 1Q98A 3M0OA 1YQ4A 3CPIG 1GSDA 2WCIA 1HQOA 3Q74A 4KH7A 2WPFA 4RG3A 1JRYA 4GXZA 1L9EA 4H4RA 1A23A 2B3SA 1E6BA 2VLTA 1KDGA 4HOJA 2VO4A 4C74A 3L1RA 3EAOA 2VD1A 1TI3A 4K1FA 3KMNA 5G30A 2JK6A 3AYIA 3NNEA 3F9UA 3D6IA 1HD2A 4FYUA 4OCGA 3LOVA 3IR4A 4H2QA 3A2XA 4MABA 4ECJA 1QXHA 3AD8B 1GWCA 3P8WA 1R26A 3M3MA 4GF7A 3GX0A 1F8WA 3TRXA 5EPFA 2H01A 2V32A 2CZ3A 4BJYA 1EL5A 4K0GA 3LFLA 4XIHA 4Z26A 2IIYA 1H84A 3BJ5A 3LADA 3C71A 4XS6A 3KD0A 1E7PA 2C66A 5IMVA 5H5QA 4I2UA 1ZX9A 3RP6A 3A5WA 1YKCA 3VRBA 2J3NA 2VM1A 2WOVA 2WDQA 4O7HA 3CSIA 2A8XA 4Z24A 5LNKe 1LTXR 1S3AA 4B67A 2YCDA 1OC8A 2B5XA 1BQ7A 4GRFA 3P7XA 1UKVG 2WP9A 4ZCDA 1ZP0A 3IC4A 2WU2A 3I43A 2IMKA 4MMMA 5GZZB 3F3QA 3O6TA 3HZ4A 2CULA 1B9YC 12GSA 3DRNA 3HVXA 2YP6A 2YLTA 4TM4A 4ECIA 4ICYA 4WBRD 1FHEA 1TKDB 4K7ZA 4A6NB 5F06A 1BYEA 1H82A 1K0JA 2RGHA 3FYGA 3AWIA 3TKSC 2J9HA 1DSBA 3UEMA 2E2GA 4GRTA 4JDRA 1GNEA 1TI1A 1PXAA 2P5QA 1XXUA 4MDCA 2I4AA 3H4KA 5EOWA 2H70A 2A4VA 3IHGA 4PUAA 1Z6MA 5ECNB 2YPMA 1GRAA 3NYEA 1SK2A 6GSUA 4H7UA 3KP8A 3IDVA 2K8SA 3NKSA 1JNZA 3NG7X 1E39A 1FEAA 2XYOA 1PBBA 1U3IA 3F4SA 1S2YA 2LRCA 4DNAA 1PBEA 3URHA 1Y56A 4HZ4A 1FVJA 3VRAA 1E1MA 1E1KA 1MD3A 3QFAC 2JB1A 4RG4A 4X4JA 1M6IA 1ZMAA 1O81A 2G0FA 3M8NA 5ECSA 3ZYXA 1GNDA 5JCGA 2IFQA 4QL9A 1XIYA 2ES7A 3HCZA 2Q7VA 1Y6EA 5ECLB 1SJ6A 5HR3A 4MLYA 5KEJA 3U6VA 1D4DA 1K0MA 3IWAA 2V3BA 3N5OA 2FJBA 3BI4A 6GSWA 1DXLA 2VCVA 3A3TA 2CX4A 3LGCA 3V3OA 1H7WA 3H8LA 3CPJG 5J4UA 3GTUB 3TKSA 13GSA 2GQKA 4PQ1A 5AN1A 5M0ZA 1IJHA 2DJKA 5FMHA 3GWDA 4KDXA 4DSSB 4NXIA 1GPEA 1XW9A 3DMEA 4YKFA 5JCUA 3P4QA 2OA1A 1QGVA 1YDKA 1CQHA 2GEWA 3PR8A 5HR1A 3L4NA 3GSIA 3TJBA 3F63A 2H1AA 3P90A 2CZ2A 1XHCA 4RUVA 3DJEA 4Y4MA 1OJ9A 1PXBA 1LBKA 2YNXA 1Z6NA 2W0HA 2H88A 4AJ6A 1VDCA 1L9CA 4K5SA 2C4JA 3ZRDA 2DKIA 2BXRA 3D0ZA 3AE5A 1AC1A 4N0VA 2QA2A 1EGOA 4MZWA 4EM4A 4XWZA 2IMEA 5CO3A 1MDJA 5LV9A 2L4CA 2Z9SA 1G6WA 4JRRA 1TXXA 3IF9A 5U63A 3UKHA 2YG5A 3GV1A 4KDUA 3TRQA 2R37A 4MK3A 2BXSA 2LNSA 2XPEA 1ILOA 5KN1A 2HXKA 2WS2A 1H81A 1VF2A 1N1PA 1U6TA 3BI5A 1UN2A 3E0UA 5A4WA 1FECA 4XRAA 3ED3A 1JNRA 4E8HA 1L9DA 3C4NA 4EVMA 4YT0A 2NVLA 2YG6A 2WPEA 3QFBA 1XANA 4PNGA 3LWAA 4OVIA 3CSJA 3QCPA 5B6MA 1GOSA 4OPLA 2H75A 2GB0A 1PJ7A 5KN0A 4NV2A 1ZCPA 2REMA 4GF0A 2A2RA 4U8PA 2HT9A 1MEKA 3AE1A 1FB0A 1BGJA 1F6MC 2ON7A 2GS3A 4K7IA 1K0IA 2EQ9A 3QPMA 5D9TA 3LB8A 1OYJA 4DSGA 5ECHB 5COHA 5B6NA 4V1Ap 1G7EA 4G10A 4TM0A 2WDVA 2XDOA 3UTHA 3TKRA 2VL2A 2ZCTA 1PXCA 1QO8A 3KMOA 2YZUA 3ZFLA 5ELGA 3FG2P 4KSMA 4KUNA 2VM2A 3IOSA 2QAEA 1CQGA 5IO2A 3UL3A 2R0CA 1PS9A 1CHUA 3FBSA 2WP6A 1PA3A 1XBSA 3BBYA 2VCXA 3K7QX 1SEZA 5CRWA 4IV9A 1O94A 1MTCA 2C0GA 3ZVJA 5KVHA 2ZZ0A 2GR3A 3DH9A 2GZPA 4EDYA 4Z2RA 3DJGX 3CRUA 1KBNA 2H0HA 1IYIA 4A7AA 4FYCA 5IPHA 1GRTA 1JZRA 3O76A 2YZHA 3R2QA 3WYWA 4YSXA 4EQXA 1J0FA 3ZVJD 2E5VA 3QVRA 1S3BA 1Z7RA 1LPFA 4EMIA 4AJ8A 1GSFA 2O8VB 4FIWA 4TKYA 4ZL9A 1SK0A 1COYA 2OJLA 2G2QA 4GUVA 3DGQA 1AUCA 4GSNA 4GCMA 3MDKA 3GYIA 3QAVA 4TLZA 3LZWA 2E4GA 2NTOA 1GL8A 2IL3A 4H86A 1O6JA 3GSTA 5HQPA 2XLTA 2B1KA 1RYIA 1LU4A 2F8AA 1XPQA 1PSQA 3NK1X 2NDOA 2YLXA 1NHOA 5INYA 4B68A 3V1WA 3D1CA 2LKUA 2VVLG 3WE0A 2WFCA 1QUWA 4K9ZA 2XFPA 3OZ2A 4ZIJA 1JZOA 1LJRA 3G5SA 3JSKA 1ERTA 2OBKA 4CNKA 3M13A 4AT0A 4ZILA 4NHZA 4WR4A 3NOFA 2WB9A 4HB9A 3ZL5A 4A99A 2CQ9A 1BAYA 1WOUA 5CP1A 1GV4A 2R5GA 3VK9A 4BJZA 4JQ9A 5A4UA 5KVIA 3C1SA 1RSGA 4YH2A 2JZSA 1R4WA 4PURA 4OO5A 1K3YA 2VOUA 4YXDA 4YWOA 2L5OA 1BJXA 1CJ3A 5EB5A 4BVXA 6GSYA 5HFKA 3Q6JA 2GVCA 3AE6A 4F03A 1F8RA 1PX6A 20GSA 2VL9A 3SQPA 3RAZA 5ID2B 1X9SB 2N5AA 2XFOA 2EC4A 4M52A 2YN1A 2XLRA 3GSSA 3I6AA 2R4EA 1K0DA 3VI5A 3TUEA 2K8VA 4B65A 1TU7A 1VGLA 2BCPA 2LQQA 4CDOA 3CYNA 3FY7A 3DA1A 1YKAA 2PVQA 1EOGA 1G0TA 1YJ6A 3D8XA 1ACVA 1REOA 3K8NA 3D4TA 3DXBA 1OC3A 2EQ8A 4TM3A 1S2QA 3L0HA 2F9SA 3ALJA 5JCLA 1K3LA 3IPZA 4TOPA 2H74A 4KX4A 4LA1A 2ZZBA 3GMCA 2C65A 3K7TA 2B7RA 2EQ6A 3AE7A 2VCTA 5CREA 2BA9A 2VQBA 2FLSA 1TRVA 5CRDA 3EC3A 1LQTA 2VD0A 3AEAA 3GDNA 1GLPA 1ZKQA 2HNLA 4V2MA 3NT6A 3FZ5A 4TLXA 1OJCA 3LJRA 3WGEA 3ZMKA 1M2BA 4MA9A 1IYHA 3C1RA 4EQRA 4C3YA 3E3EA 1JRXA 3UOYA 1TDIA 1T3BA 2C76A 1XWCA 3LZXA 2BS3A 2GRTA 2AAWA 3ERWA 4NWYA 3TKQA 5C04A 4MZCA 3LXDA 3EU4A 4IJ3A 3P2AA 2A87A 2WOWA 3SFEA 2XVJA 3D21A 4I59A 3L9UA 4IJIA 3UIWA 1MDKA 3EWLA 4TR1A 3VPTA 1B8XA 2WBAA 2MZCA 3AY8A 3RHBA 2RUFA 1PBCA 3U5RE 2OA7A 3H93A 5EBKA 4D03A 1ONFA 5FS7A 1CF3A 2H89A 2C3DA 2X99A 3QVPA 3GHAA 1WMJA 3MSZA 2BK3A 3DIEA 2XVFA 2OADA 3VR8A 1JLWA 1CJ2A 2C7GA 4UP3A 4YSHA 1SKWB 3QAWA 1URMA 2RLIA 4HI7A 4DSRA 2TRCP 3BNUA 1ZY8A 1V58A 4POBA 3BOAA 2VVLA 3AEDA 4YTPA 3M9JA 7GSSA 2M46A 3LEFA 4RQXA 2ZUPA 4IVOB 1WWJA 1Z9HA 2HI7A 22GSA 5IO0A 1O7UA 2YJHA 1O73A 4K8MA 1JZWA 4USRA 4YAVA 1AQWA 3DVWA 4L5OA 3T37A 2H66A 3FR6A 4IQ1A 2YV7A 3ISOA 3VQRA 1PDHA 3HKRA 2GQWA 1KTEA 2L59A 3A2VA 5ECOB 3HY2A 4CY8A 4LMVA 3VI7A 3PH9A 2N5BA 4C77A 4U8MA 2V61A 3GL3A 3EPTA 3ME8A 3G7YA 3UKKA 2OLNA 3EMXA 2JU5A 1B4VA 4B1BA 3LYPA 4UDPA 2H71A 1PKWA 2Q0KA 2WDRA 1WPIA 2X8HA 2D2ZA 3EINA 4BA7A 3GYJA 3M9KA 2FNOA 5DJMA 1RP0A 4ADWA 3ICRA 2DSAA 3W8JA 4MJWA 1HYUA 2ACZA 1M9AA 3LJPA 5J60A 2AAQA 4Y4LA 3IBHA 3BI2A 1L0VA 5B8BA 2L57A 1GRBA 1XCCA 3IRAA 2YWIA 1Z6LA 4K8DA 3CTFA 1NHYA 1GP1A 4O5UA 3NZNA 4BK2A 3GX8A 4GQCA 4IVMB 2CAQA 1VRQB 5KWFA 5IPYA 3Q18A 4WBJA 5H5RA 4IW9A 2IN3A 2IVEA 4Z25A 3UVHA 1EGRA 4O32A 1FG4A 3NTAA 2KLXA 2FJAA 3VLNA 4K7NA 1KF6A 1D7YA 3PINA 3CNTA 1PN9A 5G5EA 2KP2A 1VG9A 3ERGA 2H76A 1PBFA 3GD4A 3DK4A 2BCGG 2Z5YA 4DGKA 5IMAA 1M0UA 4XWRA 2WGRA 4H4VA 1X5CA 1XWGA 2IMFA 1ZK7A 4K2XA 2O89A 2AJQB 2C72A 1BZLA 1GSSA 2BABA 4H4SA 1QMVA 3WD6A 5ABRA 2A89A 5JCNA 3VWWA 2GZYA 4JNQA 4FO5A 2HRNA 2JKCA 4TW5A 3DGZA 4TXOB 4MPGA 3NK2X 1EP8A 3AD7B 3NH3X 1T1VA 1IUSA 2KP1A 4CY6A 1TRBA 4EQSA 2LQOA 2N5FA 2CVBA 1RW1A 2RIIA 3SWLA 4ACSA 3QDNA 3KA7A 2GGTA 1PHHA 1ML6A 2LJKA 4WXTA 3FKFA 1EWXA 1C72A 2YLWA 2LJAA 3I69A 5CYYA 4H4XA 1PQNA 5ID2A 3F8RA 2C0EA 4X0XA 4JR4A 1ZOYA 1NHPA 2K9FA 1PMTA 1TW9A 1XOBA 2ON5A 3VURA 3F8PA 3GRSA 2XVIA 4XS4B 3TGZA 2YG3A 4WEYA 3NYCA 4ZBAA 3QJ4A 1FOHA 1B5QA 2CX3A 3IA1A 3VWXA 1T4YA 2R45A 4N30A 2OALA 2HSYA 2R3XA 1EOHA 1DE1A 4WETA 3H8QA 5KRQA 4BK3A 4OD7A 3Q9TA 4ILFA 3DVXA 4K2DA 3EE2A 5L46A 5DAKB 1KEBA 1DUGA 4OPCA 2B76A 3Q19A 1OC9B 2C1YA 3APQA 4ECCA 3AXBA 2H0GA 3K7MX 1JOAA 1JRZA 2JACA 4AP3A 2RUEA 1GTEA 3KH7A 1U88A 1USBA 1W4VA 1CBOA 3E1TA 4G9HA 3FW2A 3UBLA 2C3CA 2GT6A 1GTAA 3BD2A 3AEFA 4IBPA 2WOIA 2C3QA 3ZMLA 3UKQA 4KX6A 4ZB8A 2GQMA 3ADAB 3DWVA 4EUYA 2WETA 1PRXA 1F9MA 1K0LA 1A2JA 3ZLPA 3GFKA 2FWFA 2JZRA 4LIIA 1GLQA 2CA8A 2IMDA 4EKZA 1FB6A 1EZKA 4CNJA 2I1UA 4U8JA 1K0BA 2PUKC 2R46A 1ZGNA 1E2YA 2AB6A 2YR5A 1YQ3A 2L5LA 4MJEA 3DD3A 4H4PA 1PL1A 5LCZA 3GN3A 4IHUA 2LRNA 2QC7A 4BPYA 2WP5A 4ZL8A 4ML6A 4AT2A 2HRFA 4WF5A 1XPVA 5GRTA 2EIOA 1PN0A 2QA1A 1XOAA 5G1KA 2JADA 2H1BA 1YF0A 3QMXA 3HXSA 3DYRA 4IP6A 2C3NA 2GSTA 4EIPA 2R4JA 3FEUA 3PGTA 4AGSA 4GSSA 1B4PA 2DLXA 5A4VA 4JE1A 2B9WA 4ZN0A 5KOXA 1K0OA 5DALB 2H1DA 2XPDA 3QFAA 1NHSA 4K7OA 3AE2A 1TOFA 4G19A 4HS1A 1QJDA 3NIXA 4PABA 3UTEA 4U8OA 2LUSA 4EIQA 3CNJA 4U8LA 4JY2A 4NV5A 3DEXA 3JCML 3TKSE 4YQMA 5D8IA 2AYTA 2OE0A 4EXJA 2MMOA 1OJDA 1GSEA 1WE0A 3IV4A 2FWGA 3FR9A 5IMFA 2V3AA 2GF3A 5JCIA 3NIVA 4HEA2 3UP5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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