4LA1A

Crystal structure of sjtgr (thioredoxin glutathione reductase from schistosoma japonicumi)complex with fad
Total Genus 197
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
197
sequence length
586
structure length
586
Chain Sequence
SQWLQRTIESAAVIVFSKTTCPFCKKLKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSVIQKALSNFSKIETVPQMFVRGKFIGDSKAVLNYHNNNQLQAIVNENKYDYDLIIIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKIAVLDYVEPTPMGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHSLEDAQHFGWSLDKSEISHDWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVSLRDNAVTYLNARGMLLSPHEVQITEKNKKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAIEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVVGASYVALKCAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEITQLKPVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKLNCEAVGVKLDKNGRVVCSDDEQTTVSNIYAIGDINAGKPQLTPVAIHAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDNDIEVYHSHFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRISDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKEDFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKRSGGSAAV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
publication title Crystal structure of SjTGR complex with FAD
rcsb
source organism Schistosoma japonicum
total genus 197
structure length 586
sequence length 586
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2013-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 4la1A04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4la1A01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4la1A03
3LORA 4NHWA 3TKRA 5L46A 4IW9A 1DBYA 4NMUA 1UC7A 2IFQA 2G0FA 1YY5A 2B9YA 1U6TA 4IQAA 3FR6A 1JU2A 2CVDA 5G1LA 4EO3A 4TM1A 2H72A 2MMZA 5J3RA 1GV4A 4FYUA 4POBA 5IMCA 2XCGA 5U1OA 2HE3A 4TR4A 3DVWA 5A4UA 1PHHA 3UEMA 2CAIA 4F0CA 5JCWA 3MWHA 1IYIA 3CRUA 1GERA 4KCEA 5LV9A 4ZL7A 3UTHA 3AYIA 1THOA 2ZUPA 4MMMA 3EMPA 4B63A 2H0GA 4EM3A 3D0ZA 3FK8A 4ZXGA 4F82A 1GULA 1HQOA 2TIRA 2GQWA 3C4AA 1A0RP 5IPGA 3HVXA 1BGNA 1GUMA 3Q18A 1SEZA 5HFGA 2DKHA 3BHFA 2V32A 1DOCA 4Y4LA 1MDIA 4EUYA 2EIOA 2EC4A 4EDZA 3EC3A 2YWOA 3IK7A 1ELIA 5D9WA 2JBVA 1A24A 3KH9A 3H79A 1T3BA 4KX6A 4OVIA 3UAPA 3GA4A 2Q6UA 5GAPD 3T37A 3EAOA 2P5RA 4ZBAA 3M12A 1ON4A 3FZ5A 1VRSD 4YAPA 5DALA 4J31A 3F8UA 1HNAA 1F6MC 4I5QA 3VI5A 4HS1A 1NG3A 3AEBA 2YVFA 4AT0A 3MNGA 5L71A 3QFAC 2IFQB 4H86A 1T4YA 2B5EA 2PGTA 1V58A 1KEBA 3F4SA 4BPYA 2H19A 2REMA 5ID2A 2GSTA 2R4VA 2V6OA 3TKQA 1FVKA 3NNEA 3E3EA 1EP8A 4MJAA 1GXFA 1GWCA 1WPIA 5CYYA 4DSSA 4GRTA 3ICSA 4EF0A 4U8LA 1ERUA 1F9MA 2GR1A 1KTEA 1GTEA 2PHHA 3AYJA 1XOBA 3FZ9A 1LQTA 3ALJA 1OYJA 3V1WA 3AD9B 2DIZA 2CQ9A 3IAM2 4MJBA 3NYEA 1M64A 4JBBA 1D4EA 4IQ1A 5JCNA 1S3EA 4IA5A 4EQXA 3P90A 1TRWA 4DSGA 2GEWA 1VRQB 1KFYA 2R3XA 2J23A 3KP8A 4D03A 2WDRA 3FPZA 3AB1A 10GSA 3FYGA 1DJQA 3A2XA 5HR0A 3QVRA 5IQYA 3NN0X 1B9XC 2KOKA 5G30A 2VAFA 4OO4A 2DJ2A 4TM4A 3ZLPA 3KIJA 4CW9A 1PBBA 2WB9A 2JSYA 2KUCA 3AEFA 1N2AA 1XW6A 2WOWA 4ID0A 2FA8A 4MK3A 3G9BA 1YKJA 2AUVA 4AJ6A 4BK2A 2BYBA 3AE5A 4U2SA 2BMXA 5HFKA 5HR2A 1CC6A 5JWOB 1K0BA 4K5SA 1GESA 5EPFA 3GHAA 2O87A 3C7MA 3LZWA 1XWGA 3PVCA 3C1RA 5IOWA 3APOA 4OPIA 3ABVA 4A9WA 2IIYA 3CSJA 1K0OA 5A4VA 1IUWA 5FS7A 4EMIA 2HZEA 3ZREA 5ID2B 5KN0A 3TJFA 4ZIJA 3CGDA 1EV4A 1VF3A 3CMIA 1PBDA 3ZYWA 5B6MA 4XWRA 3VWUA 3Q6JA 2BS2A 4D73A 3IC9A 2YLWA 4DSSB 2AR8A 2YG3A 3KKJA 1XPVA 2GF3A 1M2DA 1YDKA 2HNLA 1BGJA 5E59A 1E2YA 4GQFA 3NIXA 1EGOA 1OJCA 4GRFA 2I4AA 4PNGA 2XPDA 2A89A 1COYA 1CHUA 2ZZCA 2CAQA 5CRGA 3FBSA 5KOXA 3NK1X 1GTAA 4CY6A 1I5GA 1UA5A 4XXGA 1NPXA 3F8RA 1VGLA 3KCMA 4YT0A 2MBSA 2OE0A 5KRQA 4UP3A 1K3LA 2C4JA 1O8WA 4BK1A 1Q1WA 1MXTA 4K9ZA 1XVQA 2H8LA 1N8JA 1XBSA 2WP9A 4B1BA 3UBKA 2OJLA 1MEKA 1FVJA 4XRDA 2RGOA 3GKKA 2ZBWA 1K0AA 3M8NA 2IVDA 3NZNA 4Z25A 3ZZXA 4AOSA 5D8IA 5BVAA 4MF7A 1WOUA 5INYA 4J57E 3ZVJD 2FJDA 1XWBA 3CTFA 3ZIJA 3TJJA 2B7RA 3KXOA 2DLXA 2BS3A 2C1YA 1DE2A 1LTXR 2C67A 3L8KA 1K0DA 3C71A 3C73A 4YTPA 3NYFA 1JRXA 2FWEA 1W4VA 4AT2A 5C04A 2R45A 5ECQB 5ECMB 3NN6X 4U2TA 3CRTA 3COXA 1A2JA 1MD3A 3E0UA 1JZDA 4I2UA 5KVIA 2B1KA 2JKCA 2CX3A 3N9JA 1ERTA 4OO5A 2IPAA 2EIQA 1OJDA 1NHOA 2KP2A 1E1NA 4MLYA 1VG9A 1EZKA 2GZYA 4ZN0A 3HY2A 4D73B 2VOUA 5AIVA 4NTEA 1ML6A 5KOWA 1EL7A 2XFUA 3GIXA 4WXTA 3EINA 1H75A 1QLBA 3QCPA 4Y4MA 4I8BA 3UIWA 4ECJA 2OA7A 6GSWA 1RK4A 4HOJA 4YXDA 3PGTA 1RYIA 2C0EA 4BVXA 1R4WA 4X4JA 2OA1A 3TOUA 4X9MA 3RP7A 3H8IA 1OKDA 1YY7A 5CO3A 4XHMA 1EGRA 1F8SA 2QKEA 2AAWA 3FZ4A 4C74A 1WRYA 1O7UA 1OJTA 1ERWA 4FYBA 4J56E 1EEJA 3UOXA 2FNOA 2OALA 3LB8A 2V61A 1ZY8A 2E5VA 4CNKA 4OPGA 3HYPA 3U5RE 3CN8A 2C73A 3P2AA 2ES7A 4KNDA 2H70A 4J2FA 2GQKA 4U8NA 1Y0PA 2VL9A 2GAGB 3KTLA 5EOWA 4IVOB 3A3TA 3QAWA 1AQXA 2DJ0A 2L5LA 2VCXA 2GB0A 2FA4A 2H74A 1GRAA 3ZMLA 1GRBA 4TR0A 3EE2A 5G2ZA 4G2EA 2DJKA 2K8SA 1H4OA 3DMLA 3GX0A 2MBTA 2O89A 3RP6A 5FS9A 3GMCA 4UDRA 1E6EA 2F8FA 1YQ1A 3P4QA 5BULA 2QSIA 4B66A 3F3RA 3P4PA 2E7PA 4PX1A 2JSZA 3VRAA 4YTMA 1CBOA 2DJ1A 1NAAA 5E4WA 2XFNA 1M7TA 1GSYA 5EL8A 2IMIA 2AJQB 1ERVA 2RUEA 2Z9SA 1GALA 1QUWA 3OR5A 1R5PA 1NENA 4ZB8A 4A7AA 1TTZA 2VOCA 1GRXA 2O9ZA 2I0ZA 4I59A 1PSQA 4IELA 1GH2A 2C3QA 1H81A 4RUVA 1TDNA 2LUSA 4JNAA 4K6XA 2K18A 2YZHA 4BA7A 4OPDA 1Q4JA 3CYNA 1X9WB 2VIMA 4I6XA 2E4GA 4HQZA 3UOMA 5IMZA 1JLVA 5COHA 2CZ3A 1EL5A 3DD3A 2BXRA 2GQFA 4IHUA 1X5EA 5DAKA 2H01A 4UDPA 2E2GA 1GSSA 3DIEA 5CNWA 3S9FA 4DSRA 3ZFBA 3GWDA 4PNFA 3CSHA 2RLIA 3UMAA 3VWXA 3GMFA 2AV4A 3EU4A 2IMEA 4H2RA 5A5KA 4K2XA 1R7HA 3F6FA 4KW6A 1GTIA 4AOXA 1D7YA 3TKSA 1PBCA 3I6AA 3PINA 4MP4A 1THXA 1M9BA 3RNMA 3LSZA 1TW9A 3NTAA 1ZMCA 1SK1A 2YLTA 3HZLA 4NPBA 3ADAB 4KSOA 1KDGA 4ECBA 2O7KA 3URHA 3F6DA 4MF6A 5IMDA 2BABA 2VRLA 3B3RA 1NSWA 2EQ7A 2L5OA 2N5FA 3GRXA 3L4NA 4AGSA 9GSSA 4DEJA 2WPCA 4HU7A 4APNA 3PS9A 1EL8A 4NAXA 4H4PA 2V5ZA 1MOKA 3P7XA 4L0WA 4J36A 2HQMA 4Q5NA 1EV9A 3BBYA 2XLPA 4XTSA 1NHSA 4HB9A 4RQRA 3DKSA 3UKKA 2VL3A 2VZ2A 1GNEA 1O8XA 3ZYXA 3HVVA 3LYKA 1CJCA 3ATRA 1RSGA 3Q9TA 4GSSA 3H4KA 3P4SA 1TU8A 3KZQA 3UBLA 5F05A 3AE7A 1N4UA 2V60A 2PVQA 1BG5A 3L78A 5GZZB 1YZXA 5HYMA 1ZOFA 3RHCA 3HZ4A 1TDOA 1PN9A 4KDXA 2Q0KA 3G5QA 3N5OA 3GWFA 3ERWA 3A2WA 5DAKB 1TRSA 3HJPA 2VRMA 1TI3A 1AQVA 3QOUA 4PQHA 2XBQA 5DBJA 1Q98A 1KBNA 1CQGA 1E39A 1X5CA 3GH9A 1OVNA 3KU9A 1WJKA 1PDHA 2YWLA 2APGA 2ON5A 1F3AA 1XXUA 2YM2A 3LADA 2FBWA 4TM0A 2C7GA 3EU3A 2VQBA 3QSSA 3G5RA 2I9HA 2VVMA 1SKRB 2WQYA 2YV7A 4YSYA 2YR4A 1KSSA 2WZ9A 1AW9A 1IUVA 1LBKA 2X8HA 1XVWA 3QSEA 3A2VA 2PWJA 4TLXA 5KN1A 4DSQA 5HQPA 4JR6A 3QAGA 4PXOA 2FJBA 3BI2A 1ZYQB 1K3OA 4FX9A 4WBJA 1GL8A 1DE1A 4CHSA 1JRZA 5GSSA 4FO5A 2OLNA 1B8XA 6GSXA 4TR3A 1PXBA 2E2MA 4OPCA 2PUKC 1G0TA 4BWQA 1TYTA 2K6VA 3IV4A 1OC9A 3KH7A 3ZVJA 3HHVA 3WGXA 1LQUA 3M0FA 1YEPA 5ECLB 4HJMA 1TK0B 1GUHA 2IJYA 4IP1A 1Z6MA 4Z7XA 4PUFC 2AAQA 1M9AA 2VCWA 4BJYA 1DOEA 1NHRA 3DGQA 2B7KA 4H2PA 3SWLA 5KWFA 3F4TA 3GL5A 1GSEA 2LEGA 1OE7A 6GSUA 3IE3A 1QK8A 5LD0A 1K0LA 3HJOA 3GTUA 2OACA 2X50A 2ZZBA 2GS3A 6GSVA 2GT5A 1L9EA 3TB2A 1PX7A 1O81A 1GEUA 2BS4A 2C8UA 5J4UA 2C3DA 1VDCA 3TRQA 4Z2RA 2WPFA 4E8HA 5DCGA 1T8EB 3AE3A 5BUKA 3O0HA 3P8WA 2R9ZA 1DODA 5D9VA 2I1UA 4ADWA 3MAKA 2LSTA 1JZOA 1K0NA 1XCCA 2ACZA 3HCZA 3ZDNA 2VVLG 5IMFA 4H50A 1I9DA 4YQMA 4RG3A 4ZL9A 3D4TA 5F0GA 3TRPA 2P31A 5EBKA 1S2QA 5KEJA 1GRHA 2GDRA 4PQ1A 1QGVA 4HUAA 4NWYA 3CGEA 2WRTA 3VR9A 2H71A 1FB6A 2GMJA 1GSFA 3GRSA 3GN3A 1GTHA 4GDEA 4H4XA 3KA7A 3A5WA 3QFBC 3GURA 5IPYA 1G7OA 3GYKA 5DBQA 5J41A 1OE8A 2I81A 1BX9A 2JADA 4K8DA 3GUSA 1TOFA 2A2SA 2FHEA 2M46A 1KSUA 1OC9B 3NIVA 1ACVA 3GSTA 1F8WA 2XFOA 1Z6LA 3BNUA 4GCIA 3BHKA 1U88A 2QCUA 3EANA 4ZCDA 1M2BA 4XCSA 3K7MX 2CZ2A 4QL9A 1M0UA 3GKNA 2FY6A 5HY5A 4TR1B 2R2JA 1E1MA 3G5SA 3U6VA 5JCMA 4YSZA 4IJ3A 3GTUB 4K7NA 1FL2A 4JY3A 2VLUA 2LNTA 2CVBA 2R5GA 2WESA 3QJ4A 4LMWA 1RQMA 2HSHA 2Z5XA 5F06A 4ICYA 3RBTA 4POMA 4GCMA 3CBUA 2XLUA 2L59A 1XZOA 2PYXA 3DA1A 5JCIA 4B65A 4OWYA 1H7XA 2C0DA 4MJWA 4H4QA 2WBAA 2LQQA 1PXCA 5J60A 4RQXA 2C3NA 3C4NA 1K0CA 4WEYA 1UKVG 2JL4A 2QA2A 4BVYA 2GR3A 2AHEA 5DQSA 3DGZA 4EQWA 4IGJA 3BNMA 3UOZA 1E1LA 5IOXA 5IMVA 2GZZA 1U3IA 3AEGA 1S2YA 2RIIA 2M72A 3CNJA 3K8NA 2YPMA 6GSYA 1BZLA 5H5RA 18GSA 3L9VA 5B6NA 3FIMB 4V2NA 2C3TA 2AYTA 4EE0A 1FO5A 3UP5A 3UKQA 5IQ4A 3M9KA 3UVTA 5J9CA 4K22A 4N0ZA 3CGCA 2N5BA 2YQUA 4O5RA 3NHOX 4E8EA 2HRNA 5D9TA 1S3DA 3DJJA 4FK1C 3K7QX 1V98A 1PJ5A 2P0GA 1ZX9A 1NHQA 2VCZA 2BC0A 4JEDA 2B76A 4Z2UA 1TDFA 2YLZA 1Z7RA 2YR6A 3LEFA 2VL2A 4H4RA 4MZWA 4TN8A 5JCLA 2H6YA 3GYIA 1GLPA 5FWGA 4EC0A 4AJ8A 1K3YA 1EOHA 1PKWA 1DUGA 4TXOB 3C1SA 4ECCA 2QA1A 5JWQB 4OPUA 1OJ9A 2KHPA 2GZPA 4IS0A 3VURA 1MD4A 4X9NA 1IUXA 3NTDA 3H1NA 3HD5A 1TRVA 5ECSA 5JCGA 4GLTA 3AEAA 3ZMKA 3W6GA 4TM3A 2W0HA 1URMA 3DJEA 1SYRA 1XW9A 2YNXA 5ECNB 1PJ7A 3Q19A 4JR4A 3DVXA 2B9XA 4PAAA 5M0ZA 3VPQA 1GPEA 2X64A 4ZBBA 2VD0A 2JB2A 2V41A 4TXVA 4H4WA 1CJ2A 4NEWA 1A8YA 4U8OA 1Q9IA 4YH2A 2WETA 2B6MA 4DVCA 2FWGA 2H88A 2H89A 1AQWA 1QJDA 5EY6A 3ZRDA 3UP4A 2HXKA 1SYXA 4OPLA 4RG4A 3GDPA 4N0VA 2K9FA 3QVPA 1M2AA 4M52A 3HDCA 1XOAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1SKS B;  3W8S A;  2POZ A;  1D7L A;  2NVL A;  3TDG A;  1LJ1 A;  3A7A A;  1TRB A;  4POK A;  1V9W A;  2C3C A;  3V5C A;  2FCH A;  4DHG A;  1TDI A;  1V59 A;  1W89 A;  4K7I A;  1GRT A;  4GME A;  3BJ5 A;  1LJR A;  1E6B A;  5FS8 A;  2BA9 A;  2CDU A;  5B8B A;  2DML A;  3LXZ A;  3LGC A;  2NDO A;  4ISD A;  3KUM A;  2CFY A;  1OAZ A;  3VWW A;  4GR1 A;  4FK1 A;  3LQ7 A;  2H75 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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