4XTSA

Salmonella typhimurium ahpc t43a mutant
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
160
structure length
160
Chain Sequence
SLINTKIKPFKNQAFKNGEFIEVTEKDTEGRWSVFFFYPADFAFVCPTELGDVADHYEELQKLGVDVYSVSTDTHFTHKAWHSSSETIAKIKYAMIGDPTGALTRNFDNMREDEGLADRATFVVDPQGIIQAIEVTAEGIGRDASDLLRKIKAAQYVAAH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Alkyl hydroperoxide reductase subunit C
publication title Salmonella typhimurium AhpC C165S mutant
rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 51
structure length 160
sequence length 160
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, O, P, Q, R, S, T
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2015-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4xtsA00
1GLPA 1NW2A 1GL8A 3FW2A 3UVTA 3MAKA 5E4WA 4IJ3A 5JWQB 1SKSB 3QDNA 3KH9A 4V2LA 2AHEA 5KN0A 1DUGA 4I5QA 2CVKA 3I43A 3OR5A 3U5RE 4F82A 3V1WA 4EE0A 4BWQA 4RQRA 2WJUA 3GMFA 1TDIA 1K0BA 3APQA 2OACA 2L57A 2BJXA 2NBSA 5CO3A 2IFQA 1UVZA 2LEGA 5EPFA 4ECIA 3LXZA 2DLXA 2I3YA 2RUFA 2LV3A 4I8BA 5IQYA 4MA9A 3QR6A 4TRXA 2C80A 4ML1A 4RQXA 4Q5QA 4WBJA 5ECMB 1NM3A 5F8BA 5HFGA 2L59A 1PL2A 3IK7A 1K0OA 2IMFA 3A5WA 2HYXA 5D9WA 4WEYA 2DJKA 4XRAA 5CRHA 3KMNA 4IN0A 1OC9B 2VO4A 1HQOA 1OE8A 3GA4A 3F9UA 4FIWA 3A2XA 3RAZA 3TJJA 1FB6A 2REMA 2C0FA 1AXDA 3GL5A 2NPBA 3D5JA 2YN1A 1A2JA 4EUYA 1F6MC 3VPTA 2H75A 1X5DA 3QMXA 4IW9A 2DC5A 1TXXA 1IYIA 3IV4A 1XWBA 2MYGA 3GSSA 1GSUA 1BJXA 4EC0A 2DBCA 3DMLA 5HR2A 4KX4A 4QQ7A 1QK8A 4I6XA 4KA0A 2VL2A 4POLA 1W89A 1SKWB 3G7JA 4E8HA 1XVQA 4O32A 1GNWA 4ULXA 3C7MA 3MDKA 4FH8A 4X1UA 1TI1A 3FKFA 2JZTA 3M9KA 1GSDA 3GN3A 1X0RA 11GSA 3CRTA 1U87A 3U6VA 4MP4A 2EC4A 5IO0A 4OFNA 3O76A 6GSVA 2PVQA 2O85A 4J2FA 1DE1A 1SENA 3GH9A 1I5GA 3KIJA 3CMIA 1G6WA 2GT5A 2YOIA 5DAKB 4N11A 2YZUA 3FHKA 1IYHA 4I97A 3EYTA 1ABAA 1SKRB 2AB6A 4PNGA 4FYCA 3BD2A 2F9SA 2FWFA 1PX6A 2Z9SA 4LMWA 5ELGA 5B6NA 4Q5RA 5ABRA 2A4VA 2DMLA 1MD3A 2XHFA 2FY6A 2G2QA 2QC7A 2O89A 4PXOA 1OC3A 2YWOA 4GXZA 5ECRB 1BYEA 3E0UA 2BMXA 1TRSA 2B1LA 3QD9A 4HUAA 2XBIA 1WE0A 4DSQA 1CQGA 3WGXA 3MNGA 4EF0A 4POBA 3WGEA 2OBIA 1RW1A 4KE3A 1TRVA 3CTGA 2HI7A 4X43A 1TP9A 1NSWA 2IJYA 1OC8A 1WMJA 3FR9A 1R5AA 4JRRA 3J7Yb 1VRSD 5KN1A 3UL3A 2RM6A 4EO3A 3HXSA 2V6KA 1XW6A 5F0GA 5DBQA 1YEPA 3HVXA 3KP9A 1T7PB 2H30A 1NHOA 4MF5A 1JLWA 2H1DA 3H79A 4XS6A 1GP1A 3LXTA 1AC1A 1HNCA 1XVWA 4TVEA 1ZL9A 2V41A 4TKYA 9GSSA 3TKSC 1WPIA 1ZZYA 3UOMA 5L71A 5FHIA 1J0FA 4KSOA 3D22A 2IWTA 5ID2B 4NHZA 5B8BA 1X9MB 3IHQA 1XZOA 4TR1B 2H70A 1TK5B 5CAXA 17GSA 4MH3A 1M9AA 3ERWA 3D4MA 1XFLA 4F9ZA 2CV4A 4IHUA 3SWLA 3M0FA 2PVOC 2YWIA 1TU8A 1PRXA 1SU9A 3KEBA 3MSZA 5GAND 1TW9A 1A0FA 1U6TA 1ON4A 4AJ6A 1UC7A 4LLRA 1CQHA 5JCUA 3QPMA 3IC4A 1B4PA 4XS4A 3QFAC 3GKXA 4N0ZA 3ZYWA 3EU4A 3HJPA 20GSA 1PL1A 2H76A 3IE3A 3P2AA 3KM6A 2FWHA 5DQSA 3FK8A 1Z6MA 2GQLA 2V32A 2WULA 3KGKA 1VF4A 4O92A 5HQPA 3ISOA 1A8LA 3P8WA 4DVCA 1GNEA 2DIZA 1TK8B 3GYKA 1YDKA 1TRWA 1N2AA 4XRDA 4MZCA 2OJLA 1E2YA 4YH2A 2AUVA 5IMVA 2C3NA 2PWJA 4EL1A 4EXJA 4KH7A 3HY2A 3DGQA 1THXA 2KOKA 1B8XA 1YF1A 2HRFA 4KDUA 2WZ9A 1M0UA 5ENUA 5KEJA 3TGZA 2DSAA 3KD0A 3UARA 1XPVA 1OAZA 1TRUA 5A5KA 1EEMA 1VF3A 3HJOA 1MDJA 1F3AA 1QUWA 4RI7A 2D2ZA 2VCZA 1JZDA 2FWEA 3JCML 2H1GA 4ISDA 1PQNA 5LD0A 2H66A 1XXUA 1O8WA 4F0CA 2C8UA 2LRNA 2B1KA 3G7YA 4HS1A 4LL4B 2I9HA 4RUVA 2E2MA 2KP2A 1S3AA 2VL2C 2OKAA 4HQZA 2NDOA 3EWLA 1J9BA 5GZZB 1R4WA 5AN1A 1TI3A 3F4TA 1FOVA 1GSQA 1YQ1A 2YWMA 4K1FA 1TTZA 2JADA 4WR4A 3ERFA 1WJKA 3EINA 2G0FA 2WGRA 4TR3A 4JZQA 4ZL8A 3HJMA 4GTUA 2ES7A 4KSMA 2GZZA 6GSUA 3ED3A 4EDZA 3UEMA 2JZRA 4NV2A 5HR3A 1USBA 3C71A 3SBCA 2YV7A 4IVFA 3E9JB 1Y25A 5D8IA 4TW5A 2LUSA 2CT6A 3QAGA 2FHEA 1M2BA 4KNDA 1OC9A 2OE3A 2YV9A 5IO2A 3HVVA 3TRPA 3VWVA 1JLVA 1T1VA 4IELA 1WRYA 2I81A 5JCWA 3VFIA 2N5FA 2KUCA 3GX8A 3RHBA 3KH7A 5DCHA 3H1NA 5A4UA 4Q5NA 1F37A 1ZYEA 4JR4A 5IOXA 1Z3EA 4KAEA 3L9UA 1G0TA 3ZFLA 4CW9A 5G2ZA 2GTUA 2B5EA 4MH2A 2JU5A 3GTUA 4OFTA 3VWUA 1RQMA 2KP1A 1C72A 1PSQA 3F0IA 3N5OA 4F2IA 2GQMA 4CHSA 2X99A 2P5QA 2R6KA 4WF5A 5IOWA 2VLVA 4MABA 2C0GA 3KMOA 2H6YA 2K18A 4O5RA 4OCFA 2LRTA 3EMXA 2EIRA 3LG6A 2LS5A 4HZ2A 2A2SA 3HCZA 5EVOA 5ECIB 4N0VA 1ZGNA 2CZ2A 4NPBA 1XWAA 1YKAA 1SL1B 2H0HA 4HU9A 1YF0A 2R5GA 3VURA 2IL3A 4L8EA 1O73A 3H93A 3DKSA 3A2VA 4YQVA 2CX3A 2C3TA 5HR0A 4ML6A 4L0WA 1X9SB 2E2GA 2VL3A 2GZPA 3GFKA 4HU7A 5ECNB 3F8UA 2AJQB 1QGVA 4HJ2A 4OD7A 1AIUA 2H01A 3FZ4A 2GGTA 3ZIJA 2HLSA 2L5LA 4E8EA 4V2MA 3CRUA 3CYNA 1B9XC 1ERTA 3C1SA 1G7OA 3L9SA 3UMAA 3C73A 1SYRA 1F3BA 2V6OA 1QMVA 1SD9A 3VWWA 2LKUA 1V9WA 2YNXA 3VPQA 2ZUPA 4J57E 3LFLA 1G7EA 5DCGA 4BPYA 3UBKA 4K7IA 3L0HA 1PD21 2C1YA 1I9DA 3ZRDA 1KBNA 3LSZA 2YANA 5D93A 2VCQA 1EOHA 4K8MA 4TXVA 5JCGA 4WBRD 2ZNMA 3GHAA 6GSYA 1XCCA 14GSA 5ECSA 2C4JA 3KXOA 3FR6A 4K0GA 4GQCA 1XOAA 3TJFA 1WWJA 1Z9HA 3ME8A 1Z7RA 2YCDA 1A2LA 5IM9A 10GSA 1R5PA 2H6ZA 5KN3A 3ZTLA 3FZAA 2IFQB 2HSHA 2QGVA 2RM5A 1QXHA 2VOCA 3W6GA 13GSA 3A3TA 3BCIA 4GWRA 1E6BA 1M2DA 1OE7A 4BA7A 1YZXA 1TU7A 3EU3A 1JFUA 2LNSA 2O87A 3QAVA 1JZOA 1YEXA 2L4CA 5ID2A 3F4RA 4MLYA 1GTAA 2QSIA 5FT3A 4TR1A 2MMZA 3TKQA 4MCUA 5GAPD 1GTUA 4K9ZA 5F05A 1K3OA 1O85A 5G1LA 1SJZA 1K0CA 4GCIA 4Q5FA 2WDUA 2H0GA 2VM1A 5CRDA 5IMDA 1EP7A 2FA4A 3KJYA 1LBKA 1AQXA 4OMVA 2F51A 1M2AA 5KN2A 5J41A 2B5YA 4TOPA 2OE1A 2WFCA 2HFDA 3ZZXA 4BWSA 1FW1A 2GZYA 3H4KA 5IMFA 4X0XA 1JZRA 4DSSB 2JSYA 2P0GA 1XWKA 5ECKB 2X8GA 1A24A 2VM2A 3GV1A 2M46A 4MJCA 2IMEA 2KHPA 3DRNA 1ZCPA 3G9BA 3HZ8A 2VLTA 4V1Ag 4N10A 3KP8A 3KZQA 2XPEA 3TCOA 4OO5A 3NIVA 3FRCA 4ZL9A 1SYXA 4P3YB 4ZB9A 3VI5A 5DJMA 4PNFA 2ALBA 1K0AA 1J08A 2GSSA 3TB2A 4L5LA 1B48A 1XW5A 2GQKA 3PR8A 4F0BA 2YP6A 4EVMA 3WT1A 4PX1A 3UJ1A 2FCHA 1H75A 3I6AA 2R4VA 4HEA2 3TDGA 1Z7PA 2IMKA 3LGCA 2B7KA 2L6DA 3PGTA 2H6XA 1O8XA 3RPNA 3NOFA 2CAQA 2LJKA 2HZEB 3CXGA 2LRCA 1K3YA 2H8LA 2GSQA 1KEBA 4NMUA 5D9TA 5DALB 4G2EA 3Q19A 3HZ4A 4IQAA 4WKWA 1PN9A 1ERWA 2IPAA 3LWAA 2OA7A 1JHBA 2K8SA 4WXTA 2JACA 1H4OA 1GULA 4GSNA 2PPTA 2EIQA 2A2RA 5AIVA 5D9VA 3C1RA 1DSBA 1GSEA 1OKDA 3QCPA 2WS2A 3GUSA 5B6MA 4HQSA 3G7IA 1XOBA 5D9XA 1ZOFA 1VF2A 5G1KA 1GTBA 4ZXGA 4J56E 2PGTA 4LMVA 5H5RA 2VL9A 3UBLA 3H8QA 2HSYA 4LA1A 3WGDA 3LJRA 2C0DA 2I4AA 5AGYA 2K8VA 2LQOA 5IPGA 3F3QA 5CYYA 3IPZA 3ZL5A 5HR1A 3ZMKA 3AY8A 4KDYA 4EKZA 5LCZA 3US3A 1U3AA 2CVDA 2TIRA 1B9YC 2DIYA 1EOGA 1HYUA 2FLSA 3CSJA 2GT6A 2AV4A 4HI7A 3K8NA 3HHVA 5J5NA 4BVYA 2MZCA 3L9VA 3DVXA 3HA9A 3IOSA 4JR6A 3FZ5A 2HNLA 2OBKA 3WD6A 4MJAA 3HDCA 3IRAA 4POMA 4I2TA 3ZLPA 5H5QA 3ZVJD 2YJHA 3BCKA 3TOUA 2K6VA 2DJ2A 4K7OA 3HVSA 3DIEA 1QQ2A 2CX4A 1JZWA 1MD4A 1WIKA 1G6YA 2NTOA 3ERGA 2B7JA 5DVBA 4ECBA 2J9HA 4D73B 2IIYA 3TJGA 4OFMA 1U3IA 2EIOA 1FAAA 1MEKA 3DWVA 4MJBA 2VUPA 4IGJA 1AW9A 1EV4A 1FVJA 1X9WB 2V2GA 1SJ6A 4TR4A 3ZIVA 2VAFA 2VCVA 4KB3A 3NZNA 2VD1A 1F9MA 3EVIA 5AIXA 3GKMA 4YAPA 1R7HA 6GSTA 1A23A 2FUG2 4TXOB 1URMA 2OE0A 3LORA 4QL7A 3EURA 1SK0A 3M1GA 3Q6OA 4V1Ap 1A8YA 2LSTA 1WOUA 4KW6A 4GF0A 1FB0A 3TKSE 2YJ7A 3N9JA 1YY7A 2VIMA 3RBTA 2HE3A 2PU9C 2L5OA 5C04A 1O7UA 4V2NA 2O7KA 2JSZA 2CVBA 2E7PA 4NV5A 1DBYA 3GSTA 3LEFA 1EWXA 5GSSA 8GSSA 1XW9A 4IKHA 1W4VA 3FYGA 1V2AA 3DVWA 3E3EA 1S3DA 3F6DA 1OKTA 1T3BA 5INYA 4GRFA 3TOTA 3CTFA 4ZBDA 5G30A 1GTIA 1BG5A 3F3RA 4IP6A 1T00A 5F07A 5IMCA 3IXRA 4I2UA 2GSRA 1Z6NA 1ST9A 2X8CA 4KGIA 3GH6A 3IAM2 3VWXA 4GQFA 3ZREA 5G31A 3ZFBA 1MDIA 4MF7A 5DJLA 1PGTA 1EGRA 3GL3A 1V98A 4WR5A 3KTBA 1SK2A 3D21A 3EE2A 4IQ1A 1ZMAA 2HT9A 4FYUA 1XBSA 3FZ9A 4XIHA 5DAKA 2RLIA 1BX9A 3IDVA 2XPDA 4G10A 3HYPA 2MBSA 4DSRA 2VCWA 4PQ1A 1Z5YE 4TN8A 1UA5A 2C3QA 4HJMA 3APOA 4AGSA 2H19A 1PKZA 1AUCA 2ON7A 4XTSA 4JEDA 3MWHA 1PMTA 4MK3A 3L4NA 5HFIA 1XWCA 1R26A 1PX7A 1T8EB 1Q98A 2DMMA 1GSFA 4K6XA 5J9BA 4K7NA 3GX0A 2KLXA 3W8JA 4AJ7A 3EC3A 5GSTA 3EMPA 1V57A 1K0MA 2WB9A 2H74A 3I69A 2V1MA 4YQMA 3A2WA 4LL1B 3QOUA 5F06A 3CSHA 1FO5A 2CA8A 5H5SA 2N5BA 2CZ3A 5ECOB 4DSSA 4XHMA 4JU5A 5J3RA 3GTUB 3M8NA 1M99A 4NHWA 1T4ZA 3DD3A 2FD3A 1SD8A 4HDEA 2B5XA 1AQWA 3Q74A 3PINA 4MDCA 4HOJA 1DE2A 1F2EA 3TJBA 3UVHA 1GWCA 2FNOA 1GLQA 1ERVA 4JE1A 1HD2A 2CQ9A 1ACVA 2VCTA 5CRGA 22GSA 4ZILA 4EDYA 1GUHA 2F3MA 5IPHA 1PA3A 1GUMA 1XIYA 3RPPA 2QKEA 2FGXA 1XWGA 1T4YA 3LYPA 1MDKA 3C8EA 3BBYA 2MBTA 2NVLA 5JWRB 2YPMA 4PUAA 1AQVA 3DXBA 2JL4A 2C0EA 3CSIA 3F4SA 2HZEA 5D73A 4ZL7A 3GIXA 1QFNA 2H0IA 4GSTA 4K2DA 12GSA 3D6IA 3GKKA 2H73A 3W8SA 1X5EA 1FHEA 4GSSA 4HZ4A 5DALA 4CDOA 3VI7A 1HNAA 1PKWA 3Q18A 2AAWA 1WP0A 6GSXA 1EEJA 4BVXA 5B7CA 3IBHA 4YQUA 1TJDA 1YJ6A 4ZB6A 2AYTA 4IP1A 3R2QA 2LNTA 2L6CA 16GSA 1O6JA 1RK4A 3GRXA 3UIWA 1S3CA 3M9JA 5C00A 3WT2A 4ZBAA 4DEJA 2IMIA 4H86A 4KUNA 3IA1A 4ACSA 1K3LA 2GLRA 2I1UA 3L78A 5EY6A 1MTCA 5A4VA 3HD5A 4MPFA 4ILFA 2R3XA 5IMAA 5CP1A 1Y6EA 4K0NA 2XC2A 3GURA 4GLTA 5LNKe 4OWYA 2VD0A 2YZHA 1BAYA 2TRXA 4MPGA 3WYWA 3HKRA 1M9BA 3PH9A 4L0UA 2P31A 1O81A 1ML6A 3FR3A 6GSSA 2E0QA 3ME7A 2P5RA 3QFBC 5CRWA 3DEXA 3LQ7A 1ZYQB 1GRXA 2LJRA 5CNWA 4XS1A 4ZB8A 5A4WA 4PURA 3D0ZA 2DJ1A 2FWGA 1B4QA 5ECLB 3CBUA 1GSYA 2GDRA 3DYRA 1UN2A 4N30A 6GSWA 5J4UA 4WF4A 7GSSA 5DQYA 4PQIA 1BQ7A 1HNBA 4D73A 2RUEA 2LQQA 5FWGA 1X5CA 3FEUA 1TK0B 4KCEA 1SJIA 4MZWA 3O3TA 4PUFC 2XBQA 4ECCA 1FVKA 2H72A 2PN8A 2O8VB 2J23A 2GS3A 3ZMLA 2VLUA 4WETA 4ZIJA 4O7HA 2WRTA 2R2JA 2FA8A 3P7XA 3VK9A 5IMZA 1GUKA 3GNJA 5B8AA 4TXOA 4MJEA 5HFKA 3BOAA 4Z7XA 4ZBBA 4YAVA 1TKDB 4AJ8A 3FY7A 1LU4A 3ZITA 5D96A 3ZVJA 1EGOA 2IMDA 3RDWA 1VF1A 1GH2A 2PMTA 4IBPA 1SL0B 4NXIA 4NWYA 3P90A 4OCEA 1KNGA 1TOFA 1U88A 3F6FA 5ECQB 1ERUA 5ECPB 5ECHB 1OYJA 4F03A 1K0DA 3RHCA 3KCMA 4L5OA 3TKPA 2X8HA 3TRXA 3IR4A 3GKNA 2HZFA 1YKCA 3VLNA 2H1AA 2RIIA 3J7Yk 4FYBA 5DDLA 3IAS2 4MZBA 5E59A 1V40A 5CREA 3TJKA 4IS0A 3TUEA 3KTLA 4PGTA 1SK1A 3O6TA 2PUKC 1A2MA 2L4QA 5J9CA 2PERA 1EV9A 2M80A 4MF6A 2MMAA 4OO4A 5COHA 1K0NA 3S9FA 2MMOA 2F8FA 2VCXA 2BTOT 1V58A 4RI6A 3UAPA 4KDXA 2OADA 1A0RP 1OVNA 5G5FA 2YWNA 4XCSA 5G5EA 5IIZA 1M7TA 2JZSA 4KCAA 1EP8A 2N5AA 2H1BA 2R37A 4XS4B 1SL2B 2X64A 4MMMA 3D4TA 18GSA 4QL9A 3TKRA 3I9V2 1FG4A 2B6MA 3LYKA 4TR0A 4ID0A 4NAXA 1VGLA 3BJ5A 3IK9A 2LTKA 2DJJA 1AAZA 2MMNA 4G19A 2B3SA 5EL8A 2M72A 4ECJA 2TRCP 4BL7A 1N8JA 2K9FA 3QAWA 4POKA 2DJ0A 3TRQA 1Q4JA 2CAIA 3TKSA 1EZKA 5JWOB 1LJRA 2F8AA 4JBBA 3APSA 5AISA 4IJIA 2HRNA 2IN3A 4FO5A 2PBJA 1GSSA 2WCIA 2GVPA 4PQHA 1NHYA 2GSTA 1ILOA 4G9HA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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