2MYGA

Solution structure of the dithiolic glutaredoxin 2-c-grx1 from the pathogen trypanosoma brucei brucei
Total Genus 26
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
26
sequence length
97
structure length
97
Chain Sequence
GAMPSIASMIKGNKVVVFSWVTCPYCVRAEKLLHARTKDITVHYVDKMSEGEQLRGEIYQAYKHETVPAIFINGNFIGGCSDLEALDKEGKLDGLLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma brucei
publication title Solution structure of the dithiolic glutaredoxin 2-C-Grx1 from the pathogen Trypanosoma brucei brucei
rcsb
molecule keywords Dithiol glutaredoxin 1
total genus 26
structure length 97
sequence length 97
ec nomenclature
pdb deposition date 2015-01-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2mygA00
5DALB 4NHWA 1U3AA 5H5SA 3FK8A 3K8NA 4JZQA 3GH9A 2YPMA 3VWWA 4FYCA 4GF0A 4I5QA 4FYUA 2FWFA 1E2YA 2V6OA 1GUKA 3UBKA 3KD0A 1ZGNA 5AGYA 3DMLA 1QFNA 3KMOA 5F05A 2PVOC 4LLRA 5KN3A 3MNGA 3TOUA 4TXOB 1MTCA 4ACSA 2HLSA 4EF0A 3C8EA 1KNGA 3GTUB 2H1DA 3ME8A 3RDWA 3GL3A 5IM9A 4RUVA 3QOUA 3VWXA 5HFIA 3UBLA 2IN3A 1XFLA 5ELGA 3F4RA 1QXHA 1ST9A 6GSWA 5DQSA 1FVJA 3F9UA 4NWYA 2VAFA 1OC8A 1ZYQB 4X1UA 2K8VA 4BA7A 2C0GA 2WDUA 3IAS2 1U3IA 2YZUA 2LRCA 1SL2B 1BX9A 5D93A 1NW2A 1U6TA 3GH6A 2PUKC 2GQKA 3HY2A 3KTLA 2JADA 5DALA 1PSQA 2LJRA 1SL1B 1JHBA 1YZXA 3I43A 2FWHA 2VO4A 1PRXA 3IA1A 1B9XC 2AAWA 4LL4B 2MBSA 2LTKA 4E8EA 5F06A 5JCGA 4DSSB 4MZWA 4EC0A 1R7HA 4OD7A 2FLSA 2C3TA 5EVOA 4L0WA 3IRAA 3GHAA 2EC4A 3TKQA 3DGQA 2WZ9A 1KTEA 3EVIA 5AISA 3L4NA 4GQCA 3WT2A 2PBJA 2RUEA 1WIKA 2V1MA 1AQWA 4GRFA 4IJ3A 2NVLA 4J2FA 2HZEA 1OE8A 3M9KA 1SJZA 2J23A 4OO5A 4KX4A 4JR6A 4DVCA 2WGRA 5ID2A 2GDRA 3D22A 2LV3A 2H8LA 2H0GA 4PURA 4MMMA 1TRUA 4BWSA 4K1FA 3TJGA 3J7Yb 3VWVA 2L4QA 1WWJA 1XZOA 2PU9C 4KGIA 1JLVA 2OKAA 2C1YA 1BJXA 2VM1A 3P90A 2WULA 3NOFA 2WRTA 3MAKA 2PGTA 2V2GA 3LEFA 1HQOA 4EE0A 3BBYA 5B8BA 4K9ZA 5EY6A 1ZCPA 2DJ3A 1GUMA 3H93A 5EPFA 2CVKA 2HNLA 1FO5A 4GSSA 3CSJA 2A4VA 3IV4A 4TOPA 2HRNA 2C3QA 5JWRB 2OJLA 2I4AA 2FD3A 2IMFA 2A2RA 2H75A 3CSHA 3WT1A 3FR3A 1TI1A 2K18A 4DSSA 1SL0B 1PD21 2GTUA 3GX8A 1ABAA 4HQSA 1YEPA 2RUFA 2LQQA 3P7XA 1QK8A 5CP1A 4AJ6A 2EIRA 4BL7A 2B1KA 1PQNA 1DE2A 3TKSE 3CTFA 4X0XA 3KXOA 1GSFA 2QC7A 4MPFA 3IC4A 3FZAA 1SKSB 1K0DA 5JWOB 3TRXA 3HA9A 3VURA 3GA4A 5KEJA 4YAPA 4NAXA 5A4WA 3SWLA 2H19A 2LNTA 3FRCA 2FGXA 4CDOA 3IK9A 3TJJA 4V2NA 2DLXA 4NV2A 4AJ8A 4ZB9A 1A8YA 1RW1A 3DYRA 1TI3A 4DEJA 4OFMA 3V1WA 3PGTA 5IOWA 5ECPB 12GSA 2OBIA 2L59A 1GSQA 1M2DA 1W4VA 4N11A 1MD4A 3TGZA 3UIWA 2F9SA 5GAND 2VL2A 3CXGA 2HSYA 3GN3A 4KA0A 2H1GA 2L5LA 2YN1A 2OBKA 1XXUA 1FG4A 2MYGA 3IHQA 4XIHA 2DJ0A 4JRRA 3ME7A 2GZZA 2D2ZA 1X9MB 3ISOA 3QCPA 1PX6A 1BEDA 2YCDA 2R37A 1GUHA 1XBSA 1T1VA 5D9XA 3EURA 4BVYA 3CYNA 1EEMA 4NV5A 1QUWA 1TW9A 4POKA 4ZXGA 2LUSA 1SK0A 3M9JA 2IFQB 4ZL9A 1GL8A 1TRWA 5A4VA 1LU4A 2RM5A 2JZTA 2N5FA 4V1Ap 1K3YA 2O87A 1XIYA 2F3MA 1G0TA 3O76A 5ABRA 1VF2A 2WJUA 1AUCA 4K0NA 1MDJA 1JZOA 4XS4B 1Y6EA 1PL2A 2HYXA 4OCFA 4ID0A 3P2AA 5G1LA 1EOGA 1ERWA 3NZNA 3LFLA 2HZFA 1I5GA 2WFCA 3F63A 3EWLA 3R2QA 1KBNA 2B7JA 1PKWA 1IYIA 2NPBA 3PH9A 4IP6A 3KIJA 4MP4A 4GSNA 4EL1A 4MDCA 5ECIB 1DBYA 3KCMA 4IKHA 6GSYA 4XTSA 5G2ZA 4ZILA 3GIXA 2N5BA 1URMA 4QQ7A 4MPGA 1THXA 3HCZA 2DSAA 2MMZA 1H4OA 1SJ6A 3DWVA 5D73A 2EIOA 2FHEA 2H6ZA 2K9FA 2X8CA 2R3XA 1XVWA 4N10A 2BTOT 3UOMA 4KW6A 1QGVA 2VCTA 2IJYA 2VL3A 1SENA 2ON5A 2V6KA 5G5EA 2AYTA 5IMVA 2YOIA 1UVZA 1E6BA 3TB2A 4IJIA 2I9HA 1TXXA 2JSZA 3KP9A 3HHVA 3APSA 4PGTA 4I2TA 2DIYA 2IL3A 1J9BA 1ON4A 3H1NA 1T4YA 3FR9A 2H72A 3ZTLA 5LNKe 4QL9A 1AIUA 2AV4A 1GNEA 1Q4JA 17GSA 4Q5QA 6GSUA 1F9MA 2CAQA 1SK2A 4XS4A 1IYHA 5J9BA 2AJQB 2NTOA 5ECRB 4PNFA 2XHFA 1XW9A 3TKSC 2TRCP 2L57A 5G1KA 3LJRA 4GWRA 1V9WA 3U5RE 2VL9A 2FY6A 2VD0A 1G7EA 5IPGA 2DMMA 1EGRA 3GSSA 2CA8A 2VCWA 3LGCA 3HDCA 3WGDA 6GSTA 4O32A 3RAZA 4WETA 4G2EA 1OVNA 4NMUA 1UN2A 4POMA 2DBCA 4CHSA 3HXSA 4TN8A 1V58A 13GSA 2CAIA 3VI7A 5D9VA 2HZEB 1X5DA 4HJ2A 4GCIA 3F4SA 5ID2B 1NHYA 1OAZA 3ERWA 3ZFLA 3ZREA 1DUGA 2FUG2 4BWQA 2VCXA 3FZ4A 5EL8A 4L5OA 2PWJA 2XPDA 3HKRA 1Z7PA 2XC2A 4MLYA 1XW5A 1Z7RA 1O8WA 2CQ9A 2YV9A 5HR1A 3TOTA 4KDUA 1GTBA 2VCZA 3UVHA 2LSTA 4KSOA 3VFIA 4P3YB 3D21A 2YV7A 2JU5A 3ZLPA 5E59A 4EUYA 1B4PA 4TXVA 3TJBA 1Z9HA 1ZOFA 4QL7A 3E9JB 2IMDA 1F3AA 2QSIA 5IMDA 2GZPA 4HZ2A 1B4QA 3QAGA 4NHZA 2OACA 2O89A 3H8QA 1S3CA 3ZZXA 4BPYA 4WBJA 1DSBA 4J57E 3KZQA 2GT6A 2VD1A 2KHPA 3KH9A 1M9BA 4MA9A 2I1UA 2VCVA 4ML1A 2FWGA 4MF6A 4MJEA 5DBQA 3LYPA 1GTAA 4PQIA 2R2JA 2B3SA 4PXOA 1SKWB 4OWYA 2CZ3A 4Z7XA 5D9WA 2R5GA 2AHEA 3QAWA 1PX7A 3PR8A 2H30A 2VCQA 4F2IA 4AJ7A 2CZ2A 2H73A 1R5PA 3KEBA 4OFNA 1UA5A 2X99A 1EOHA 3FZ9A 2IMIA 2VLTA 4MZCA 2LKUA 4IELA 3C71A 2HE3A 2C0DA 3FYGA 2EIQA 3DVWA 2VOCA 2NBSA 2KP2A 3BCKA 5HR3A 2B6MA 1TK5B 1Y25A 2H70A 18GSA 5ECOB 1O6JA 1M2BA 3FKFA 3A3TA 3IE3A 3U6VA 3UJ1A 2RLIA 2E2GA 4MF5A 1AXDA 3F3QA 1Z6MA 1EWXA 2GQLA 5C04A 3F3RA 5CRWA 3NIVA 3ZRDA 3ZVJD 1GH2A 3EE2A 1M9AA 3OR5A 3BCIA 1B48A 3APOA 2H01A 3O3TA 4MCUA 4RI6A 2JZRA 4F0CA 1USBA 1H75A 1OE7A 4J56E 4Q5FA 1ERUA 4MABA 3N5OA 3CSIA 1ERVA 3IR4A 4WR5A 4V2LA 1TKDB 1TRSA 3IAM2 1BG5A 3TKRA 4WF4A 5DCHA 1N2AA 1J08A 1G6WA 9GSSA 5J9CA 2CX3A 2P0GA 1R5AA 2AB6A 2G2QA 3Q18A 4XRAA 5COHA 1V40A 4L0UA 3A2XA 2YNXA 2C3NA 4V1Ag 3G7YA 3GSTA 3F8UA 1WPIA 3E0UA 4K7IA 2C0EA 3DRNA 2XBQA 3TUEA 1SK1A 2RIIA 1O81A 1FHEA 2PPTA 3HJOA 2ZNMA 4MJBA 2R4VA 2DJ2A 1YDKA 2V32A 5G30A 3LG6A 3GKXA 2YWOA 2IMKA 2LRNA 4F9ZA 3LWAA 2KP1A 3IDVA 3A2VA 1X9SB 1AW9A 1GTUA 4MH3A 5IO0A 4LMWA 1YQ1A 4PX1A 2GS3A 4EVMA 3HVSA 1FB0A 1AQXA 1GSDA 1RQMA 3CMIA 5HFGA 2C4JA 3C1RA 5B6NA 2KOKA 3KJYA 3ZVJA 1T7PB 1OKDA 1I9DA 1MD3A 2FA4A 5HQPA 4ML6A 2PN8A 3FZ5A 1HYUA 1K0CA 1S3AA 3E3EA 1JZDA 4WKWA 2O8VB 3DD3A 4TKYA 5CNWA 4F03A 5F0GA 4JE1A 4KAEA 3KGKA 3DIEA 1GRXA 5G5FA 1O85A 2ES7A 1TU8A 3EINA 2MMAA 4NPBA 2H6YA 1K0AA 3BOAA 4K6XA 4MZBA 3BJ5A 3TJKA 3F0IA 3EU3A 4YH2A 1XW6A 3KTBA 1MDKA 5DAKB 3GYKA 1HNAA 2AUVA 1GSEA 1OC3A 3H79A 2HSHA 2TRXA 2GSTA 3UL3A 1A23A 1M2AA 2I3YA 3TKSA 2OA7A 1TDIA 1ZZYA 1M99A 1JZWA 4ECIA 2H6XA 3BD2A 4ZL7A 4I97A 4KSMA 4DSRA 4WF5A 4O92A 2E2MA 3ZIVA 4I2UA 4K7NA 5DQYA 4I8BA 2X8HA 5GZZB 1G6YA 2C80A 3GV1A 4GSTA 1R4WA 4OO4A 2XBIA 3SBCA 3L9SA 1EV9A 4KCEA 3QR6A 4IN0A 1TOFA 2BMXA 1VGLA 4ILFA 1GLPA 3VK9A 4ULXA 2NDOA 4ZBDA 4L8EA 3DXBA 3MSZA 1THOA 2JSYA 4PUAA 4IP1A 2B1LA 2YP6A 1O7UA 2J9HA 1YF0A 4KH7A 3ZL5A 2YANA 4ISDA 1HNCA 4BVXA 3QMXA 4I6XA 2DJ1A 1EEJA 3D0ZA 4NXIA 1ACVA 4GLTA 4IW9A 4TW5A 2C8UA 1PA3A 2GT5A 4RQRA 1SJIA 2WB9A 4K7OA 1VF3A 1EV4A 2JL4A 5L71A 1B9YC 4KCAA 3GRXA 3GKNA 3LYKA 2VM2A 1F6MC 2V41A 4YQVA 3D4MA 1O8XA 4K8MA 3LQ7A 1GULA 2LQOA 4HZ4A 2ON7A 5DAKA 3MDKA 1W89A 4KUNA 4N30A 3HVVA 4HOJA 3QAVA 2B5YA 1MDIA 4IQ1A 1WP0A 5KN1A 3GX0A 4FYBA 2P31A 2CV4A 4N0ZA 4TR1A 2H0HA 3LORA 1SU9A 1NSWA 1X5CA 5FWGA 5A4UA 1XOAA 3QFBC 3KMNA 5ECHB 1A8LA 1OKTA 4XHMA 2GSRA 2BJXA 2B5XA 1Z3EA 5B6MA 4G19A 16GSA 3F4TA 1F37A 4GXZA 1TRVA 1AQVA 5D96A 5CRDA 5DCGA 4IQAA 1EP8A 1XCCA 2YWMA 3UMAA 1XWGA 4KNDA 4KDXA 2FWEA 4ZIJA 4JU5A 5CYYA 2M72A 1SYRA 1FAAA 3P8WA 5ECNB 5LCZA 3TRQA 2A2SA 3LXZA 2GLRA 2PERA 1GLQA 11GSA 5J3RA 20GSA 5CO3A 5JCUA 3A5WA 1X0RA 3UEMA 1CQHA 2OE1A 1SYXA 5H5QA 4JEDA 4LA1A 5E4WA 5JCWA 2I81A 3DVXA 1PL1A 4POBA 3UVTA 1K3LA 5D9TA 1C72A 5IMAA 4EKZA 2N5AA 1ML6A 3C7MA 5ECQB 4LL1B 3RHBA 1XWBA 5IOXA 4OFTA 3RPNA 1PMTA 3I9V2 1YF1A 3C1SA 1ZYEA 3QDNA 2B5EA 3H4KA 2LS5A 6GSXA 3ED3A 4Q5NA 4JR4A 4HI7A 3L78A 4XRDA 3HYPA 3G7JA 2K6VA 4IVFA 1YEXA 5B7CA 1Z6NA 3M0FA 1XWAA 5CREA 1MEKA 3UARA 3FEUA 2VLUA 3I69A 4YAVA 5ECMB 2H71A 2QGVA 3J7Yk 3KM6A 4ZBAA 5LD0A 3GUSA 8GSSA 5J41A 4Q5RA 1LJRA 1GSSA 2GSSA 1A2MA 3HJPA 4XCSA 2MMNA 2H0IA 4TRXA 5JWQB 3C73A 1TJDA 1WJKA 1F2EA 4F0BA 4EDYA 4ZBBA 3L0HA 2XPEA 3S9FA 1U88A 2H1BA 1YKAA 3WGXA 5H5RA 1V57A 2WS2A 2F8AA 1TK0B 2PVQA 3QD9A 2FCHA 2HI7A 3CRUA 1OC9B 1AC1A 5AN1A 5AIVA 4PUFC 1ZMAA 1F3BA 1TU7A 3FHKA 4TXOA 3EC3A 4HJMA 3TKPA 3IK7A 2TIRA 2H66A 2QKEA 2E7PA 2CVBA 5F07A 2L4CA 1K3OA 3GURA 4HU7A 14GSA 1K0MA 4DSQA 3GTUA 1GSUA 4TR0A 1FVKA 1A0FA 2DMLA 5ELAA 1ILOA 4GQFA 5D8IA 2HXKA 3PINA 2H1AA 1GNWA 4ZB6A 1M7TA 1T3BA 5IO2A 2YWNA 1JFUA 1WRYA 4HU9A 3EYTA 3GFKA 2YWIA 2G0FA 2E0QA 2X64A 2LNSA 2JZSA 2MBTA 2GSQA 2FNOA 2OE0A 3QPMA 2ALBA 5ENUA 1KEBA 2O7KA 3VPQA 2K8SA 5A5KA 1JLWA 3HZ8A 3AY8A 2IPAA 3JCML 1K0OA 1FW1A 5HR2A 4MH2A 3ZMKA 3D6IA 2CVDA 3F6FA 2VLVA 4OCEA 2DC5A 5CRGA 2YZHA 1ZL9A 2REMA 4FH8A 1GP1A 1T8EB 19GSA 4HS1A 3D4TA 3IXRA 5J5NA 2Z9SA 3FR6A 3HZ4A 2L5OA 5HFKA 3ZMLA 4E8HA 2P5QA 4WR4A 5KN0A 1HNBA 1PGTA 1PN9A 3WYWA 3CRTA 1EGOA 4EDZA 4WEYA 1OC9A 5IMCA 1JZRA 4ECCA 1BYEA 3WGEA 4G9HA 2O85A 3ERGA 1V2AA 4TR4A 4RQXA 5DJMA 3O6TA 3HVXA 4ZB8A 4POLA 4WBRD 4V2MA 1A2JA 4FO5A 4KE3A 3EMPA 1AAZA 2P5RA 4MJAA 5GSSA 2IIYA 3L9UA 3HJMA 2F8FA 3VI5A 4LMVA 3TRPA 4TR3A 2MZCA 2GGTA 4F82A 3Q74A 4EO3A 3UAPA 1N8JA 4O5RA 4YQMA 1TK8B 3KP8A 3VPTA 4ECJA 1O73A 4GTUA 2VUPA 1K0BA 5AIXA 4PQHA 2H76A 5CAXA 1SD8A 2M80A 4O7HA 1ERTA 2RM6A 4TVEA 1WE0A 1RK4A 5FT3A 4HUAA 2HRFA 2OE3A 5DDLA 1EP7A 4EXJA 3IBHA 1XVQA 4G10A 3F6DA 1A24A 4OMVA 1EZKA 2WCIA 2LRTA 3ZFBA 3ZITA 6GSVA 5B8AA 4WXTA 2HFDA 1X9WB 3HD5A 1DE1A 5ECKB 2H74A 2F51A 4H86A 3WD6A 2VIMA 2MMOA 1XOBA 2DIZA 2R6KA 5DVBA 4FIWA 1GWCA 2CX4A 3Q19A 3GL5A 2ZUPA 4HDEA 3GKMA 2DJJA 1UC7A 5G31A 1J0FA 1YKCA 10GSA 5ECLB 1NM3A 3QFAC 4TR1B 2X8GA 4K0GA 3W8SA 1LBKA 1A2LA 1BQ7A 2LEGA 1NHOA 4IS0A 1S3DA 2L6DA 2LJAA 4MK3A 3RBTA 3N9JA 4IBPA 4X43A 1VF1A 2GVPA 3W8JA 4D73B 1SKRB 4N0VA 4HQZA 22GSA 3TDGA 5GSTA 1XWKA 1T00A 4XS1A 3D5JA 2JACA 1G7OA 5ECSA 1Q98A 1VRSD 3M8NA 4L5LA 4JBBA 2FA8A 1SD9A 5IIZA 1QQ2A 3A2WA 3DEXA 5IMZA 3RPPA 2M46A 2ZCTA 3GNJA 2LJKA 2C0FA 1YJ6A 2GZYA 2L6CA 3ZYWA 2HT9A 4YQUA 2DJKA 5HR0A 3ERFA 2KLXA 3ZIJA 1WMJA 1GTIA 3LXTA 3VWUA 1WOUA 3APQA 3TJFA 3FY7A 3KH7A 4XS6A 1A0RP 4MF7A 4KB3A 4AF2A 5GAPD 1U87A 2YJHA 3CTGA 3I6AA 1TTZA 1OYJA 1B8XA 4PNGA 3TCOA 3FW2A 3DKSA 4PQ1A 5F8BA 4ZL8A 3G9BA 3IPZA 4IGJA 5FHIA 3VLNA 2KUCA 1XWCA 1V98A 3W6GA 5KN2A 4IHUA 3RHCA 4AGSA 7GSSA 3MWHA 3M1GA 2PMTA 1QMVA 2CT6A 1FB6A 4MJCA 1XPVA 5C00A 3CBUA 3IOSA 5INYA 1K0NA 1X5EA 1VF4A 2YJ7A 1HD2A 1CQGA 1BAYA 4KDYA 1GSYA 1PKZA 3LSZA 2GQMA 3GKKA 1M0UA 2B7KA 1FOVA 4HEA2 3L9VA 5IMFA 5CRHA 1TP9A 4CW9A 1YY7A 2VL2C 1Z5YE 4K2DA 4D73A 5IPHA 3GMFA 2IWTA 4ECBA 2IFQA 4RI7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite