4MCUA

Crystal structure of disulfide oxidoreductase from klebsiella pneumoniae in reduced state
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
NAQITDGKQYITLDKPIAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVRQKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKDLTQAWAVAIALGVEDKITAPMFEAVQKTQTVQSVADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMYVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVAQYADTVKQLVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative Sequence, Structure and Redox Analyses of Klebsiella pneumoniae DsbA Show That Anti-Virulence Target DsbA Enzymes Fall into Distinct Classes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Klebsiella pneumoniae
total genus 58
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mcuA00
3H8QA 2K8SA 5HFKA 2IJYA 2C1YA 4I6XA 1YQ1A 1X9WB 2F51A 4F0CA 1OC8A 4KA0A 3QMXA 3DEXA 2NBSA 3LYKA 5ECSA 1V9WA 2V41A 3F4RA 2B5YA 1PQNA 1MEKA 1XPVA 4L5OA 2X64A 4IP1A 3VFIA 5JWOB 2HZEB 3TKSE 1YDKA 1OC9B 1PD21 2VL2C 2C3QA 1URMA 5CRDA 3HJOA 4L5LA 1PN9A 4POLA 1N8JA 1XWGA 2FWFA 17GSA 1T00A 1ML6A 2OE1A 4KNDA 1YF1A 2BTOT 4F2IA 5B6NA 2DBCA 4N10A 4ZB8A 4ILFA 3M1GA 4K0NA 3IR4A 5DCHA 2IMFA 3UMAA 1J9BA 3KZQA 3D6IA 3FEUA 1XBSA 3G9BA 1A8YA 1NHYA 3KH7A 1Z6MA 4LA1A 5HFIA 2DJ3A 3DVXA 1T3BA 4OFMA 1TP9A 4GQCA 3GX8A 2H0GA 3GN3A 2L4CA 5D9XA 3C1SA 1AQWA 1GUKA 6GSWA 1G7EA 3I9V2 3FRCA 1E6BA 2AAWA 3GL3A 4RQXA 5KEJA 3EINA 1WP0A 3O3TA 4X43A 2DJJA 2F8FA 1FO5A 3UEMA 1FAAA 1SD8A 3QPMA 4POMA 3OR5A 4I2UA 1GSQA 2QSIA 1OAZA 1W89A 5ELGA 5A4WA 5IMCA 3D4TA 5AISA 1SYXA 2VCTA 4NAXA 2N5AA 4MF6A 3LQ7A 2H1GA 3R2QA 1ZYEA 4XS4A 2LS5A 3QAWA 4RI6A 4PQHA 1WRYA 2NTOA 3MAKA 2DJ1A 4F82A 4V1Ag 2E0QA 4DVCA 4X0XA 4PUAA 9GSSA 3L9UA 4KAEA 2LQQA 2FWGA 2HRFA 1X9SB 3E9JB 4EO3A 4WEYA 3GKMA 4EKZA 4DSSB 1DUGA 3PGTA 5DJLA 1TI1A 5EY6A 4ZL7A 1GRXA 1FVKA 1SKWB 1QFNA 4TKYA 1M7TA 1GTAA 3WGXA 2M80A 3BBYA 4OCFA 3D22A 2IIYA 5A4VA 2LJKA 2C0FA 4IQAA 1SL1B 4XHMA 2GSTA 3ZITA 2YJ7A 1TU8A 3CSIA 3ME8A 5A4UA 3WT2A 4HZ2A 5ECOB 4P3YB 4XS6A 5D9VA 4G9HA 3TB2A 3DXBA 1KNGA 5G2ZA 5D9WA 5JCUA 4EDZA 4HI7A 1X9MB 4PGTA 5DJMA 1DE1A 3GKXA 1SU9A 3IC4A 1THXA 2YZUA 2QC7A 2FA8A 3V1WA 5JWRB 4YQVA 5IPHA 2N5BA 2YP6A 1TOFA 4XS1A 1XW5A 2ZUPA 5ECPB 4JEDA 4YQMA 4FYUA 4OMVA 2GTUA 2GSQA 5J4UA 2PGTA 2KUCA 2MZCA 3Q19A 3KM6A 4HS1A 5LNKe 4TR4A 3GKKA 2HZEA 4MZBA 3VWVA 4NMUA 5ID2B 1A2JA 2FUG2 1OC9A 3DMLA 3US3A 1GP1A 3H4KA 3O76A 2XPDA 2LJAA 1M2BA 5HR2A 2GDRA 2DC5A 5HR1A 3IRAA 1R26A 4O7HA 4TRXA 1I9DA 1TK5B 1JLVA 5HQPA 1DBYA 5ABRA 4TXVA 5DALB 3HHVA 5B7CA 3CTGA 1FOVA 2EIRA 2R3XA 4GF0A 1A0RP 4J56E 2REMA 4GSSA 2CX4A 4GXZA 1YKAA 5IPGA 2B1KA 6GSXA 2VLTA 3O6TA 1ST9A 2I4AA 4ZBDA 3P7XA 5IMVA 4ACSA 1NW2A 5IQYA 5DDLA 4F9ZA 12GSA 2OADA 4J57E 1YEXA 1PSQA 5GSTA 2HE3A 4MP4A 4TW5A 1SJIA 2YWIA 5IMFA 1TRWA 1F6MC 4BPYA 3UVTA 1SK1A 3EE2A 5INYA 5D8IA 1SK2A 3D21A 4NV5A 1U3AA 5GAPD 1EP8A 3GYKA 3DD3A 4YAPA 1RK4A 3WD6A 1K3LA 3ZFLA 1GUMA 5AIVA 4K7IA 4WBRD 3CYNA 3GFKA 5DQSA 1XVWA 2H8LA 3CTFA 1M9AA 3MSZA 2L6DA 4HJMA 3UIWA 2XBQA 4Q5NA 2KHPA 4HEA2 2HZFA 2H66A 4WETA 1XWKA 5D96A 2OACA 2CA8A 4IBPA 1XVQA 1Y6EA 4GQFA 2FLSA 1AAZA 5CRWA 3TKPA 3F3RA 1ABAA 3ZMKA 4BL7A 1QUWA 1GTIA 1LBKA 1EV4A 2VCWA 3A2XA 1AUCA 2B1LA 1K0AA 2L59A 3I43A 2AJQB 1HNAA 1F2EA 2CAQA 4K6XA 5C00A 1AXDA 2H6XA 1N2AA 3IAM2 1S3DA 2HI7A 1JZDA 1CQHA 1SD9A 4EC0A 4G10A 1F9MA 1JZWA 2O85A 3KH9A 2WRTA 2JSYA 1EP7A 2B6MA 2H0HA 3IHQA 2YWNA 1IYHA 2N5FA 1LU4A 1DE2A 2K8VA 3Q74A 1U88A 3M0FA 1TW9A 3PR8A 2IPAA 3UOMA 3APOA 5D93A 1OKDA 4ZXGA 1EEJA 1ERWA 1PMTA 4JBBA 1R5PA 2H19A 2OKAA 3LJRA 1Y25A 2YANA 3P8WA 2R4VA 2H71A 3F8UA 2FGXA 4O5RA 4H86A 22GSA 3C1RA 4I8BA 1Q4JA 2ZNMA 4TR1A 2A4VA 2K6VA 4HZ4A 5CNWA 2F9SA 4YQUA 4BWSA 3J7Yb 3DVWA 1I5GA 5CO3A 2OE0A 2GZYA 2YV7A 2PU9C 1BQ7A 3NZNA 3GH6A 2H6ZA 2H73A 5ID2A 4TOPA 5J41A 1HNCA 8GSSA 4GSTA 3SBCA 3NOFA 1SJ6A 2GQMA 4GLTA 4N0VA 4FYCA 1XOAA 1TRSA 3KTLA 2E7PA 5DALA 3GSTA 16GSA 3HCZA 2HLSA 1A8LA 4NV2A 4MH3A 1JFUA 2WZ9A 2AUVA 4LMWA 1CQGA 4ZIJA 1V40A 3L9VA 1FG4A 2V6KA 2GT6A 2JL4A 2WJUA 2L6CA 4ML6A 1GTUA 2M72A 4WKWA 5LCZA 1JZOA 2C0EA 5KN3A 2RM6A 3ZVJD 3W6GA 2JADA 3TRQA 3GMFA 3TKRA 3TRPA 4MK3A 2CVDA 2C80A 3BCIA 2IMIA 2H1DA 4ZL8A 4PNFA 3L78A 3EWLA 3TDGA 1B8XA 5F05A 4EF0A 3HJPA 4WR4A 5F06A 1X5DA 4MPGA 3KEBA 2LV3A 1E2YA 3TJJA 2AB6A 4F03A 1OC3A 1GSEA 2TRXA 2ES7A 2I9HA 2L57A 2YWMA 2B7JA 2FNOA 5ELAA 1S3AA 2MMZA 2XBIA 2TRCP 3FR3A 3TJFA 5LD0A 4AJ8A 6GSSA 2C8UA 3IE3A 3ERGA 1QK8A 4AJ6A 3LSZA 2ALBA 5CREA 2X8GA 1HQOA 1J0FA 2FHEA 2VL2A 1GL8A 4IN0A 1F37A 4KDYA 4WBJA 1G6WA 4IVFA 3Q6OA 1Z3EA 5GSSA 3VI7A 3NIVA 3QFAC 1QXHA 1SYRA 5COHA 2G0FA 3ZMLA 1FVJA 20GSA 2IFQA 1VF3A 3GKNA 4OFTA 2RIIA 3HYPA 2O7KA 4OWYA 3ERWA 2VL9A 1M99A 3RDWA 2LKUA 4AGSA 1HD2A 2C3NA 4MCUA 6GSVA 3LGCA 2O87A 3N9JA 4XRAA 1EEMA 3C71A 3HKRA 1M2DA 1GULA 4L0UA 3FZ5A 4K2DA 4K9ZA 4PX1A 5HR0A 1VF2A 3I69A 2IL3A 2WFCA 3N5OA 4MJEA 5CYYA 3F4TA 5KN1A 2VIMA 2VOCA 2IN3A 5IO2A 1O7UA 1C72A 1XWAA 4KUNA 2GSRA 3RHBA 4PQIA 4KDUA 1YZXA 3GNJA 2C0DA 2J9HA 4ZILA 3A2WA 3F4SA 4QL9A 3UAPA 1EV9A 4OFNA 4K7OA 3ZVJA 5IMAA 3FK8A 2YV9A 1K3OA 2ON5A 2VAFA 1YJ6A 2VLVA 4ZB9A 2VM2A 3KIJA 1WOUA 3D0ZA 3KJYA 3A5WA 3LFLA 3HY2A 4RUVA 4ML1A 4KX4A 1TTZA 1U6TA 3KP8A 4RQRA 2XHFA 3CBUA 1R4WA 1ERUA 2K9FA 1U3IA 4TXOB 1OKTA 2CZ2A 6GSTA 5HR3A 4ZL9A 5B6MA 1YY7A 2FWEA 1T4ZA 4NHWA 4IW9A 1X0RA 4MH2A 5DVBA 1M2AA 5GZZB 4ECJA 2HYXA 3L0HA 4HUAA 2MYGA 3C7MA 1J08A 3F0IA 4GRFA 4MMMA 3F6FA 2B7KA 3ISOA 2CVBA 4IP6A 2AV4A 3ZIJA 3TKSC 1XFLA 1QMVA 4LMVA 5J3RA 1KBNA 2IMDA 3TUEA 1K0CA 2X8HA 1EGRA 5DBQA 1EOGA 5F07A 1AC1A 4BWQA 4HOJA 5CRHA 2MBSA 3EU3A 1RQMA 3QCPA 4LL1B 1S3CA 5ECMB 1ACVA 1SENA 2PPTA 2I3YA 4I97A 3H93A 1OE7A 2VCXA 5E59A 3EYTA 2J23A 3ERFA 4ECCA 4D73B 1AIUA 4MJAA 3EVIA 3CXGA 3C73A 1U87A 4ID0A 2FY6A 5ECQB 1GNWA 2MMAA 4TR0A 3VK9A 3E3EA 4MPFA 1H75A 2B3SA 1O73A 3EMPA 1O85A 2DJ2A 1BEDA 5FT3A 4HU9A 2BMXA 3QD9A 3GX0A 4V2LA 2V1MA 2K18A 1BJXA 3GIXA 3GSSA 3ED3A 4K0GA 1B48A 3FZ4A 2PVQA 1XZOA 3IK7A 1W4VA 1R5AA 4BVXA 3HZ4A 2XC2A 2DSAA 3EU4A 4N30A 4MF7A 4PXOA 2GLRA 4IQ1A 3TGZA 4K8MA 4KDXA 2LSTA 5KN2A 3UJ1A 1O8WA 4JR4A 2DMLA 2CQ9A 1K0DA 2QGVA 3FR9A 2R5GA 3GA4A 5FHIA 4DSSA 1BX9A 4ZBBA 1PL1A 1SJZA 4CW9A 2H76A 5JCGA 4GWRA 3EC3A 2G2QA 3CSJA 2IMEA 1ZL9A 1SK0A 4YAVA 2H74A 3WGDA 2GT5A 1XWCA 4KCAA 3BD2A 2WS2A 19GSA 4Q5FA 3DRNA 1A24A 5J9CA 1WWJA 2P5RA 4O92A 2H1BA 2NDOA 5G1LA 4NXIA 3VWWA 2OJLA 3ZYWA 1IYIA 2H72A 2YOIA 5H5RA 2VD0A 1V2AA 3UARA 2GVPA 4WF4A 3VWXA 3MDKA 3APQA 1F3BA 2XPEA 2DJKA 1XOBA 4HQSA 4EDYA 3ZREA 5B8BA 2ON7A 3Q18A 1O8XA 2JZRA 2VUPA 4Q5RA 4FO5A 1B4QA 3TJBA 4ZBAA 18GSA 3F3QA 5AIXA 4JE1A 4DSRA 10GSA 1XXUA 2E2MA 1MTCA 4IHUA 4LLRA 2A2RA 5EPFA 3IAS2 4XIHA 4L0WA 5CP1A 3LG6A 3ZIVA 1AQVA 3W8SA 3ZL5A 4V2NA 3QOUA 3FZAA 4MABA 1Z6NA 3MWHA 1GTBA 2L5LA 14GSA 1V98A 4POKA 11GSA 2JU5A 4WR5A 4TXOA 3UL3A 3M9JA 2OBIA 5ECHB 1Z9HA 2V2GA 4JZQA 1FHEA 1YEPA 5F8BA 5AN1A 4FH8A 1GSYA 4CDOA 2LQOA 1OVNA 3VPTA 3DYRA 2YN1A 2CAIA 5IO0A 4ISDA 3IXRA 2YPMA 1FB6A 1BAYA 3LORA 3RPPA 1UA5A 1WPIA 4JU5A 2GZPA 4MZCA 2X99A 4PQ1A 3ZZXA 3DWVA 1K0OA 4ECBA 3HXSA 3GL5A 1WJKA 1B9YC 1K0BA 4DEJA 1MD4A 3GRXA 1A2MA 2RLIA 3F9UA 1QGVA 1M0UA 4L8EA 3HVSA 1SL2B 3J7Yk 1DSBA 2PBJA 2I81A 3QAGA 1GSUA 1TK8B 3KXOA 3GV1A 5G1KA 1GLPA 3FZ9A 1TRVA 4K7NA 3LEFA 3QDNA 3WGEA 4HU7A 5ECRB 3TCOA 4D73A 4AJ7A 3VLNA 3DGQA 1X5EA 2LRCA 3I6AA 3P2AA 3E0UA 3W8JA 3APSA 2FCHA 3L4NA 3AY8A 3KP9A 3EMXA 1EOHA 4J2FA 3M3MA 2ZCTA 1EZKA 2JZTA 2MBTA 4N0ZA 2YCDA 1O81A 4QL7A 3IOSA 2CT6A 2PERA 4ECIA 1M9BA 4ZB6A 3K8NA 5GAND 3LWAA 4KSMA 2OBKA 4NPBA 1SKSB 2O8VB 1GUHA 3HD5A 4NWYA 1V57A 2BJXA 2F8AA 4E8EA 3GTUB 3VWUA 4EXJA 4XTSA 2YJHA 1Z5YE 2GSSA 1ERTA 2I1UA 4IS0A 2D2ZA 5G30A 4JRRA 4K1FA 2VCVA 1T1VA 1VRSD 3ZTLA 5ECKB 1GH2A 3C8EA 5ENUA 4IJIA 3KD0A 13GSA 2AHEA 5F0GA 1GSSA 4YH2A 2P5QA 4CHSA 3CRUA 1MDJA 3CRTA 1G6YA 4AF2A 4I2TA 3RBTA 2WULA 2FA4A 5A5KA 4NHZA 2DJ0A 1AW9A 3GHAA 3KGKA 2VM1A 3GUSA 3M8NA 2OA7A 1SKRB 2H6YA 2DMMA 4PNGA 3KCMA 1YF0A 1KTEA 3UBKA 5IIZA 1R7HA 2M46A 4OD7A 3HJMA 5HFGA 1UVZA 2L4QA 2VCQA 5JCWA 3HVXA 1USBA 4ULXA 2AYTA 1VF4A 3ZFBA 1WE0A 1BG5A 4HJ2A 2PN8A 4HQZA 3GURA 1TJDA 1FB0A 2C3TA 3EURA 3HDCA 2MMNA 1FW1A 3TOTA 2H0IA 1A0FA 2LRNA 3A3TA 2IWTA 4IELA 3HZ8A 1ERVA 3F6DA 1TI3A 1PL2A 1ZGNA 2HSHA 3P90A 1A2LA 2DLXA 4MDCA 2JACA 2VLUA 2FWHA 1O6JA 3WT1A 3CMIA 5D9TA 2O89A 2H01A 1K0NA 5DCGA 2OE3A 1B9XC 2YZHA 4FIWA 2C0GA 2CX3A 3RHCA 1MD3A 2LEGA 1TDIA 1TRUA 2B5XA 2JSZA 1PKWA 3F63A 2P0GA 3QFBC 4MLYA 2EC4A 4RI7A 2CZ3A 1XCCA 1HNBA 1WIKA 1GSFA 1RW1A 5D73A 1PGTA 1ILOA 3DIEA 1LJRA 2E2GA 2KLXA 2GS3A 2LNSA 4IKHA 4GCIA 3VURA 5DAKB 3LXTA 3BCKA 3MNGA 5DQYA 1JLWA 4WXTA 3BJ5A 4MA9A 4OO5A 2RM5A 4N11A 2R37A 1EWXA 2R2JA 2H75A 4TR1B 3HA9A 1TU7A 2FD3A 2B5EA 1TKDB 2DIYA 1ZCPA 3JCML 3IPZA 1Z7RA 3RPNA 5EVOA 1PX6A 4KH7A 5FWGA 1EGOA 1PRXA 3FW2A 3ZRDA 1OE8A 4V1Ap 3H1NA 1T8EB 6GSUA 5E4WA 1WMJA 3DKSA 2KOKA 4E8HA 3UBLA 4DSQA 4X1UA 2F3MA 2JZSA 1QQ2A 2HFDA 7GSSA 1PKZA 2MMOA 1NHOA 2P31A 2H30A 1Z7PA 4MJCA 2HSYA 2C4JA 3GH9A 2LTKA 2L5OA 3LXZA 3KMOA 3M9KA 2WB9A 1ZZYA 4BA7A 2NPBA 1XW9A 3ZLPA 2PWJA 2RUEA 3WYWA 3FKFA 2GQKA 3HVVA 1T7PB 5CRGA 3GTUA 3VPQA 1YKCA 1TK0B 1VGLA 2WDUA 3TRXA 4GSNA 4Q5QA 5J5NA 4TVEA 2Z9SA 5IMDA 5KN0A 4MF5A 4XRDA 4GTUA 3IA1A 1MDIA 1OYJA 4OO4A 1NM3A 4G2EA 4EUYA 1UC7A 4JR6A 1V58A 1BYEA 2GZZA 5H5QA 1K3YA 5ECNB 2A2SA 2IMKA 1H4OA 3TKSA 1GSDA 4PUFC 4Z7XA 2V6OA 2VL3A 4BVYA 2QKEA 1XW6A 1KEBA 2YWOA 5J9BA 1PA3A 4TN8A 1UN2A 3QAVA 1VF1A 1JHBA 1GWCA 2VCZA 2HXKA 2TIRA 3IDVA 3FY7A 1T4YA 2HRNA 4HDEA 1A23A 3TKQA 1JZRA 1GNEA 4WF5A 2WCIA 3RAZA 1Q98A 2V32A 2VD1A 2LNTA 3UVHA 2DIZA 5IMZA 1ZYQB 4O32A 1PX7A 5G5FA 3SWLA 4MZWA 3IBHA 2RUFA 2PUKC 3G7IA 2CVKA 2PVOC 3BOAA 1ON4A 1X5CA 1G7OA 4OCEA 3FHKA 2NVLA 2KP2A 4FYBA 1SL0B 4G19A 4KE3A 3TJGA 3KMNA 1B4PA 3FYGA 1TXXA 5CAXA 2WGRA 2R6KA 4XCSA 4KSOA 4I5QA 1ZOFA 2VO4A 3H79A 3LYPA 5IOWA 4POBA 1NSWA 4PURA 5ECIB 5ECLB 4KW6A 4XS4B 2IFQB 4KB3A 1GLQA 4MJBA 2HNLA 6GSYA 4IJ3A 4KGIA 3IK9A 3L9SA 2KP1A 2X8CA 2LUSA 5C04A 3FR6A 3ME7A 4KCEA 2YNXA 4LL4B 4EL1A 4IGJA 2EIQA 1HYUA 2H1AA 4F0BA 3U6VA 1XWBA 2CV4A 3A2VA 5G31A 1ZMAA 3KTBA 5IOXA 1G0TA 5L71A 5H5SA 5DAKA 5EL8A 4V2MA 3U5RE 2GQLA 2PMTA 3CSHA 1THOA 3VI5A 3D5JA 4EE0A 3D4MA 3PH9A 5AGYA 1F3AA 3S9FA 4TR3A 3G7YA 3TJKA 4QQ7A 3QR6A 5JWQB 5G5EA 1K0MA 5B8AA 2LRTA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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