4MCUA

Crystal structure of disulfide oxidoreductase from klebsiella pneumoniae in reduced state
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
NAQITDGKQYITLDKPIAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVRQKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKDLTQAWAVAIALGVEDKITAPMFEAVQKTQTVQSVADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMYVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVAQYADTVKQLVEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Comparative Sequence, Structure and Redox Analyses of Klebsiella pneumoniae DsbA Show That Anti-Virulence Target DsbA Enzymes Fall into Distinct Classes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Klebsiella pneumoniae
total genus 58
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4mcuA00
1Z6NA 3CTFA 6GSXA 2F8FA 1JZDA 1TXXA 3ZFLA 5CRHA 3F6FA 4MZBA 2O8VB 3GL3A 13GSA 1SU9A 2V32A 3A5WA 1E6BA 3EYTA 2O87A 3GHAA 1A2MA 5DQYA 2KP1A 4TR4A 3ZYWA 2VCQA 4HZ2A 4K9ZA 4DEJA 1SJ6A 1ABAA 3IA1A 2V41A 5DCHA 1FW1A 4FO5A 3KTBA 2K8VA 3GSSA 6GSUA 1XFLA 3RAZA 1AQVA 3FW2A 4IP6A 2WJUA 3Q18A 2PPTA 2VLTA 10GSA 2VD0A 2HT9A 3WT1A 4MA9A 3G9BA 2QSIA 2FA8A 2GZPA 1DSBA 1MD3A 5GZZB 5EVOA 3FHKA 2LS5A 2KOKA 2GQKA 2FA4A 5CRDA 2XHFA 4GQCA 1W4VA 5FT3A 2CX4A 2GVPA 4MJCA 3GN3A 2IMFA 4JE1A 1O85A 4XS4A 1ERVA 5AGYA 1HQOA 3ZMKA 3I9V2 4ECJA 1NM3A 4Q5FA 4NV2A 5COHA 5GAPD 2L4CA 5ECMB 5LCZA 3U5RE 1GUMA 5CYYA 1WIKA 5ABRA 3LWAA 2PVQA 4NMUA 2GT6A 5A4UA 1OYJA 4DVCA 2XPDA 3M9JA 2YWOA 1T8EB 2IWTA 4YQUA 3FR9A 4ILFA 2AUVA 5HFKA 4WETA 3HJPA 5INYA 3CYNA 2MMOA 2GDRA 4K0NA 4POMA 3US3A 1J9BA 2H6ZA 1TU7A 1T7PB 3HVSA 2YOIA 1GLPA 5G5FA 3SWLA 3GV1A 2B3SA 1I9DA 3IPZA 2IFQA 3M9KA 3VWWA 2QC7A 5ID2B 3QOUA 2KLXA 3TKSE 5EPFA 1T1VA 5CO3A 4Q5NA 1YF1A 4KCEA 2H71A 5E4WA 4J57E 4L0UA 3GTUB 3QAWA 3FR3A 2NVLA 4QL7A 1GTIA 3TJKA 5C04A 3A2VA 4N10A 3FKFA 3TKPA 2CQ9A 2OA7A 3GMFA 3IC4A 3FRCA 11GSA 4G10A 5J41A 1DE1A 1GTAA 3EWLA 2O89A 1LU4A 1PMTA 2L6DA 4AGSA 1QUWA 2YJHA 4MMMA 4KAEA 3ZRDA 4ACSA 4OD7A 4JZQA 2RLIA 3FZ4A 2WCIA 4TR1A 4XTSA 5JWOB 4XCSA 3EU3A 2V2GA 5J4UA 1QK8A 3ERGA 4KDXA 1WMJA 4OWYA 1PX7A 1YF0A 5G1KA 4IGJA 1V9WA 4KNDA 4IVFA 1MDIA 3LSZA 1X5DA 2DJ3A 1TK5B 2MZCA 5B6MA 4RQRA 4TKYA 2FHEA 2R6KA 2H6XA 2PMTA 1PD21 1V57A 5KN1A 3J7Yk 1A24A 1GTUA 1AUCA 4PUAA 2PWJA 5DAKA 4WR5A 2E0QA 3DRNA 1OC8A 2TRCP 3HYPA 1HD2A 3VWXA 5IPGA 5CRWA 3DEXA 4ECBA 3R2QA 3ZLPA 5F06A 2AB6A 4ISDA 3FZ5A 3WT2A 1ZYEA 1B8XA 3QCPA 5ELGA 2C80A 4EDZA 2OE1A 4OO4A 3VI5A 3I43A 2H74A 3GSTA 1K0MA 1EZKA 2CAIA 4K8MA 2J9HA 1RQMA 2LQQA 4TW5A 3F0IA 1GH2A 1U88A 4OMVA 3QPMA 4GSNA 2K8SA 2HRFA 2ALBA 4ZBAA 1XXUA 4OFNA 2VCZA 2WDUA 5F8BA 3TJBA 3ZIVA 2YN1A 2R4VA 3UJ1A 1SL0B 1XWKA 5IOXA 4TXOA 1EOGA 1SL1B 4AJ7A 3EMPA 4KX4A 2VCXA 2N5AA 2R5GA 2IMIA 3IDVA 1GSFA 1TKDB 1M99A 2EIQA 1U87A 3QMXA 1F3BA 2K9FA 2MMAA 5DVBA 3D0ZA 4ZIJA 3UIWA 1K3YA 4E8HA 2AJQB 2KUCA 1YKCA 2VO4A 2CZ2A 3TRXA 1XWBA 2Z9SA 4Q5RA 2H1GA 3LORA 3BBYA 1EP8A 2H8LA 2X8HA 1MDKA 3HZ8A 3VLNA 4BPYA 2E2MA 1NW2A 1EV9A 2OBKA 1R4WA 4KDUA 5D73A 4DSRA 2GSQA 1AC1A 4NPBA 2LUSA 1JHBA 4KB3A 4D73B 2FY6A 1PL1A 3C71A 3NOFA 2L5OA 3TGZA 3EE2A 2DIZA 4TR1B 1GSDA 3HXSA 3O76A 3CSHA 1T3BA 1TP9A 4EE0A 3EVIA 2J23A 2HI7A 3MWHA 4G19A 5G5EA 3UAPA 4N11A 4ULXA 4ZB8A 2V6KA 1U6TA 1AAZA 3DIEA 1KEBA 2V1MA 5ECQB 1A23A 2CVKA 2YWNA 4O5RA 1GWCA 1F37A 2GQMA 2GZYA 1YY7A 1IYHA 1AQXA 1AQWA 1VF3A 2X64A 3BJ5A 2DJJA 3TCOA 3N9JA 1EP7A 4JU5A 2B7JA 1JLWA 2LJRA 1WPIA 4ZXGA 5F05A 4F82A 1RK4A 2DLXA 2GLRA 5G31A 1O7UA 4PXOA 4FYUA 1O6JA 4LMWA 4MABA 2MBTA 3H4KA 2WB9A 1WWJA 5B8BA 3RPPA 2YWMA 3APQA 2MYGA 4OCFA 5D93A 3HHVA 3HA9A 1CQGA 1PSQA 5IO2A 2NDOA 3GUSA 4K7OA 3L9VA 5J9BA 4I2UA 1OE8A 4BA7A 3QFBC 3F9UA 2L4QA 4NV5A 4IJ3A 4Q5QA 5G30A 2GQLA 3F4SA 2PBJA 4K1FA 3L0HA 3D4TA 1Z7PA 4I97A 1B48A 2OACA 4ML6A 1YQ1A 12GSA 4TXOB 2LRTA 1OC9A 1FB0A 3F3QA 3C1SA 2FGXA 4K7IA 3WGEA 1M0UA 5ECKB 1XVQA 3GIXA 4EDYA 3GFKA 1TRVA 2LJAA 1K0OA 4YAVA 2N5BA 2DJ1A 5G1LA 4GSSA 3WGXA 1G0TA 3MAKA 1G7EA 3DKSA 1PL2A 3CRUA 5ECPB 2RUFA 1V58A 4NWYA 3EMXA 5D8IA 7GSSA 5F07A 2CA8A 2FCHA 4MDCA 1VF2A 4EKZA 3IR4A 1WRYA 4MPFA 4OFTA 2PN8A 1WP0A 1QFNA 3E9JB 3ZREA 2O85A 6GSVA 4LMVA 3LEFA 2R3XA 1DE2A 3F63A 5B6NA 2L57A 4HS1A 2DBCA 4OFMA 2VCVA 3ISOA 2LKUA 3KJYA 1THOA 3F4TA 3HY2A 4I6XA 5A4VA 1SJIA 5D9VA 1EOHA 3LXZA 5ECOB 3UMAA 3VPTA 3IOSA 2D2ZA 3ZITA 2ES7A 2PUKC 1B9XC 3HDCA 4CW9A 1XW6A 2AYTA 3LQ7A 1O8WA 1ZYQB 3CSIA 3ZTLA 3TOTA 3FEUA 4QL9A 2I9HA 1TI1A 1XWGA 1SYXA 4HUAA 2VLVA 3GKKA 3WD6A 4F2IA 2XBQA 4DSQA 2OE3A 3FY7A 3UL3A 4JBBA 1USBA 2LRCA 3TKRA 2OADA 4HEA2 1GUKA 3Q19A 3W8SA 22GSA 5D9TA 4CHSA 2H72A 1OKTA 4NHZA 1ST9A 4PQ1A 2C8UA 4PURA 5HFGA 2GSRA 3NZNA 1AIUA 4RUVA 1J0FA 1G7OA 4JR6A 4Z7XA 1AW9A 1GULA 3KCMA 1TK0B 4HU9A 1Y6EA 3TB2A 9GSSA 3L9SA 5DALB 5B8AA 1XOBA 6GSWA 3KIJA 4KA0A 4WXTA 4ZBBA 2JACA 1A2JA 4XRAA 2HSHA 3HVXA 3KP8A 4V2NA 4JR4A 4I5QA 20GSA 3ZL5A 1ZOFA 3VI7A 4J2FA 4I2TA 4HJMA 4XIHA 1OE7A 4TOPA 2IMEA 1JFUA 3UBKA 3F4RA 1FHEA 4HJ2A 1GSUA 2P0GA 1OC9B 2YANA 3DWVA 4ECIA 2ZCTA 3G7JA 1N2AA 5ECNB 3PH9A 3NIVA 3UARA 3WYWA 2AAWA 2C3NA 2CVBA 1Z7RA 2YV7A 1SK1A 3L9UA 3VK9A 3IK7A 4EXJA 2B7KA 2H75A 4ECCA 2I81A 2TIRA 4TRXA 3VWUA 2LNSA 2B5YA 1TK8B 1H75A 1FO5A 1YZXA 2X8CA 4MF6A 2MMZA 2NTOA 2C0FA 4LL1B 5IMZA 2IPAA 1YJ6A 4WKWA 5ECSA 1M2BA 4GRFA 4KGIA 5J5NA 1URMA 2HNLA 3LYKA 3O6TA 3RDWA 3RBTA 5JWQB 1OVNA 1M2AA 4MF7A 1V40A 3HJMA 3OR5A 4IS0A 3QR6A 3CTGA 1CQHA 2YZUA 2C0DA 5JCWA 2VL3A 3TKSC 4V2MA 3MDKA 3QD9A 1KNGA 3VPQA 3DGQA 2H73A 2H70A 4HU7A 3H8QA 5CREA 1AXDA 2LRNA 1THXA 3QAVA 1K3OA 1DUGA 4MH2A 4F03A 5D9XA 3ED3A 3Q74A 4F0BA 3A2XA 3KH7A 3V1WA 5EL8A 4EF0A 1ZL9A 3BOAA 2H1BA 1OAZA 1XWCA 1EGOA 2CAQA 4XS4B 1QQ2A 4MPGA 1MTCA 2GGTA 4PUFC 5DBQA 1XW9A 3IRAA 1ZZYA 1TRUA 3W8JA 2A4VA 4IJIA 2VOCA 3G7YA 4WR4A 1K0DA 1K0NA 4MK3A 2C4JA 3GURA 5EY6A 4PX1A 1XWAA 1ON4A 1FB6A 1S3AA 1I5GA 1QXHA 4IQ1A 4L5LA 4HI7A 1G6WA 3HKRA 3N5OA 2DIYA 3D5JA 4AF2A 1TRSA 3C8EA 3UVTA 3KD0A 2JZTA 1EEMA 1BX9A 2HZEA 2PERA 4XS6A 2IFQB 2O7KA 1NHYA 2IJYA 2G0FA 2MBSA 3KZQA 4TXVA 1GSYA 1U3IA 5DJLA 1T00A 1PX6A 1NSWA 1JZWA 3ME8A 2NBSA 1XPVA 1TOFA 1OC3A 3HVVA 5HQPA 2CX3A 3GKXA 1O73A 1PQNA 1O8XA 3IE3A 2N5FA 3IV4A 4POKA 3CSJA 4MP4A 5C00A 1X9SB 3U6VA 5CAXA 2H1DA 3TOUA 5HR3A 4OCEA 3WGDA 3LG6A 2MMNA 3ZZXA 3GRXA 3TDGA 4EL1A 2H19A 1U3AA 2CVDA 2EIOA 3GA4A 3P8WA 3PINA 1XW5A 3HCZA 3E0UA 2DJKA 5IPHA 1FOVA 2IN3A 3PR8A 3E3EA 5FHIA 1R26A 2HRNA 1W89A 2KHPA 1HNBA 1R5PA 2FUG2 2A2SA 4GSTA 2VUPA 3QFAC 5DQSA 1PRXA 4IP1A 2VL9A 2RM6A 3KH9A 2FWGA 2VCWA 1A8YA 1K0CA 3M1GA 4EC0A 1YEPA 2JSZA 1A0RP 4MH3A 2P5RA 5DAKB 3LGCA 1V98A 1JZRA 1SKRB 2FWHA 4CDOA 4KW6A 4O7HA 2GS3A 3HD5A 1WJKA 1O81A 2LQOA 1TU8A 4XHMA 1SJZA 5JCGA 4LLRA 3A3TA 1FAAA 3LYPA 2H76A 1SKSB 3QAGA 3I6AA 2YJ7A 3UVHA 4DSSA 3AY8A 3RHCA 4JRRA 4K7NA 4I8BA 1SK2A 2YZHA 4K0GA 2WGRA 4EO3A 1X9WB 1G6YA 2OBIA 2H0GA 1SK0A 4E8EA 3DXBA 3P90A 5IM9A 4N30A 4MJEA 2VIMA 3KMNA 1ERUA 3ERWA 1TDIA 2DMMA 2X8GA 1E2YA 4BWSA 1ERTA 3GKNA 2WS2A 2XC2A 5B7CA 3ZIJA 3HJOA 4K6XA 3KP9A 4F0CA 5H5QA 5CNWA 2QGVA 4V2LA 3UOMA 1R7HA 4WBJA 3TJJA 2HZEB 4AJ8A 2H0HA 1PKZA 5D9WA 3GTUA 5AIXA 2VAFA 1XIYA 2GSTA 4WF4A 2LTKA 1GUHA 2M72A 3M3MA 2QKEA 2VM2A 2V6OA 1A8LA 3H79A 4MLYA 2BMXA 1T4ZA 4RQXA 4TVEA 1GP1A 3H93A 1UVZA 1F3AA 1K0AA 4HDEA 2HE3A 3BCIA 3M0FA 5FWGA 1GNWA 1A2LA 1S3DA 2C0GA 1TI3A 3ZVJD 3FZ9A 1GTBA 5DDLA 1FG4A 2L59A 1B4PA 4OO5A 5ECLB 2F8AA 3CMIA 5GAND 19GSA 1QMVA 1HNAA 1ZMAA 4PGTA 1VF4A 5IMCA 2JU5A 5IMDA 3BCKA 3TRPA 5HR1A 3KM6A 2WFCA 4FYCA 5IOWA 4ZB9A 2JSYA 1N8JA 5D96A 4POBA 2EIRA 1BQ7A 2GZZA 4GWRA 6GSSA 3ME7A 3C1RA 2F51A 3IAM2 4RI6A 2HLSA 3IK9A 2DMLA 1F9MA 1Q98A 5ECRB 5F0GA 4FH8A 2IMDA 3EU4A 2HZFA 2PVOC 3L4NA 3C73A 4PQHA 2B1LA 2FNOA 2DJ2A 2CV4A 3IAS2 5IMVA 2H6YA 4DSSB 1YKAA 1ZCPA 4PNGA 1VGLA 1Y25A 4L0WA 1PA3A 2F9SA 3O3TA 3DYRA 4IELA 2ZNMA 4TR0A 2JADA 2IIYA 4KSMA 4XRDA 1M9AA 1SYRA 2ON5A 1UC7A 3IHQA 5LNKe 2VD1A 4MZWA 2RM5A 2CT6A 4IBPA 2DJ0A 2DC5A 4GTUA 2H01A 4YAPA 2LSTA 3F6DA 1EWXA 4X1UA 2HFDA 5G2ZA 3CBUA 4RI7A 5ELAA 2VL2A 2VCTA 2XPEA 1PKWA 3TUEA 2GT5A 1X0RA 3A2WA 4X43A 2E2GA 2BTOT 2WULA 3G7IA 4TN8A 2G2QA 2C3QA 3FYGA 5HR2A 18GSA 2C3TA 3P7XA 4D73A 3H1NA 2LEGA 1SKWB 1MDJA 4H86A 3M8NA 3TKSA 2B1KA 4IN0A 2K6VA 3GX0A 1YEXA 2R37A 2JZRA 4POLA 1ZGNA 5KN3A 5DCGA 1MEKA 1BEDA 2OKAA 4HZ4A 1FVJA 5ECHB 2VL2C 1TRWA 1J08A 5HR0A 3GYKA 3TJGA 4O92A 4GF0A 2GTUA 4KUNA 3D21A 2OJLA 2KP2A 2L6CA 1Z5YE 3KEBA 4HQZA 1GLQA 5H5RA 2K18A 1SD9A 4TR3A 2EC4A 5J3RA 2BJXA 5CP1A 3RHBA 1ERWA 2P31A 4G2EA 4O32A 1BAYA 3GH9A 3IBHA 2IL3A 5E59A 3VWVA 5KN2A 2LJKA 2FD3A 1X5EA 1SENA 4ZL7A 5GSSA 2JZSA 4L8EA 3D4MA 4GXZA 1LJRA 3TJFA 2P5QA 1UN2A 1S3CA 1M7TA 5DJMA 5A4WA 1C72A 2I4AA 3GX8A 4ZILA 1LBKA 1B9YC 3KTLA 4EVMA 2CZ3A 2M80A 1BG5A 4BWQA 4ZL9A 1ILOA 2E7PA 2YV9A 4N0ZA 1IYIA 2H66A 3S9FA 1VF1A 1UA5A 3ERFA 3DVWA 2RUEA 4IQAA 5GSTA 5HFIA 1OKDA 3CRTA 2C1YA 4V1Ag 1BYEA 2ON7A 1JZOA 2YWIA 5ENUA 4L5OA 1GL8A 4K2DA 3EC3A 5LD0A 4PQIA 3FZAA 3LXTA 2PU9C 3FR6A 1SD8A 3GNJA 4ZB6A 5AISA 3DVXA 14GSA 1QGVA 3L78A 2GSSA 4LL4B 1X5CA 1KBNA 2DSAA 4BVYA 3P2AA 1EEJA 2FLSA 3K8NA 4MZCA 2LNTA 4YH2A 5CRGA 2REMA 2R2JA 1NHOA 4WEYA 1PGTA 5L71A 1XBSA 2VLUA 3ZMLA 3EURA 1Q4JA 1TJDA 1A0FA 2HYXA 5IMAA 4KE3A 2RIIA 4YQVA 4ML1A 4XS1A 6GSTA 3LFLA 4IHUA 5IO0A 3F3RA 4P3YB 2JL4A 1DBYA 1EV4A 2OE0A 4AJ6A 2ZUPA 4GLTA 4ID0A 4NHWA 3UEMA 1ACVA 5KN0A 2H1AA 3IXRA 3KGKA 1EGRA 2B5XA 1GSQA 4KSOA 4HQSA 3TRQA 2NPBA 1R5AA 1GNEA 1V2AA 2H30A 1X9MB 1YDKA 1VRSD 3DMLA 1KTEA 3VFIA 1K0BA 3JCML 1BJXA 3SBCA 5IMFA 2IMKA 4YQMA 3ZFBA 2YCDA 2X99A 1TTZA 17GSA 3DD3A 3QDNA 2YNXA 4WBRD 2FWEA 4GCIA 4J56E 1XOAA 5JWRB 2FWFA 5AN1A 2HXKA 3CXGA 2B6MA 1Z9HA 5KEJA 4KDYA 4MJBA 6GSYA 1HYUA 3C7MA 1T4YA 1GRXA 3GH6A 3VURA 3I69A 1PN9A 3BD2A 5IIZA 5H5SA 8GSSA 3TKQA 4QQ7A 1H4OA 2WZ9A 2M46A 5ECIB 4HOJA 1GSSA 4KCAA 5AIVA 5JCUA 4ZL8A 1GSEA 1WE0A 1XZOA 2WRTA 1XVWA 4X0XA 4F9ZA 4IW9A 1MD4A 2L5LA 4EUYA 2C0EA 1M2DA 4FYBA 1TW9A 3GKMA 4KH7A 1F6MC 1ML6A 3J7Yb 2AV4A 4N0VA 4MF5A 4GQFA 3HZ4A 4PNFA 1F2EA 2F3MA 2YPMA 3MNGA 1M9BA 5DALA 3GL5A 4G9HA 1RW1A 4MCUA 2AHEA 3W6GA 3KXOA 3Q6OA 4WF5A 2HSYA 5ID2A 4JEDA 16GSA 4ZBDA 4IKHA 3EINA 4NAXA 3ZVJA 1K3LA 3F8UA 1B4QA 4BVXA 2YP6A 2LV3A 3LJRA 3APSA 3KMOA 3FK8A 4V1Ap 1Z6MA 4BL7A 2PGTA 3PGTA 5IQYA 5J9CA 2XBIA 2A2RA 2TRXA 3APOA 1JLVA 2B5EA 2H0IA 3UBLA 2I1UA 3MSZA 1HNCA 4FIWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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