2CVBA

Crystal structure of a thioredoxin-like protein from thermus thermophilus hb8
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
LQYPELPLESPLIDAELPDPRGGRYRLSQFHEPLLAVVFMCNHCPYVKGSIGELVALAERYRGKVAFVGINANDYEKYPEDAPEKMAAFAEEHGIFFPYLLDETQEVAKAYRALRTPEVFLFDERRLLRYHGRVNDNPKDPSKVQSHDLEAAIEALLRGEEPPLKEAPAIGCTIKWRPGNEPEVRIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords probable thiol-disulfide isomerase/thioredoxin
publication title Crystal structure of a thioredoxin-like protein from Thermus thermophilus HB8
rcsb
source organism Thermus thermophilus
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 55
structure length 187
sequence length 187
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cvbA00
2MMNA 2N5BA 1QXHA 3BCKA 1ERUA 1SK0A 4GQCA 2OBIA 1M0UA 5FWGA 2E7PA 4WBRD 2VAFA 1TW9A 5IMFA 1FO5A 1SD9A 5ECMB 4J57E 3PINA 3QPMA 3G7YA 3KMOA 3KTBA 5IO0A 4N10A 1QMVA 2MYGA 2M46A 2O87A 2CVKA 3MNGA 1F6MC 1ZYQB 3FR9A 3LSZA 5B8BA 2AUVA 4FO5A 3HVVA 4TXVA 3GIXA 5F07A 3J7Yb 2R3XA 1O6JA 4WR4A 1ZGNA 2V41A 1LJRA 3L9VA 3KTLA 3UAPA 5J3RA 1TK0B 1PA3A 3HJOA 1HD2A 1J08A 5J9CA 5JCUA 4JE1A 4E8EA 5D93A 1OE7A 5IPGA 3DD3A 1T7PB 4KSMA 1K0OA 3GUSA 4HU7A 1X5DA 3QCPA 4GSSA 2RM5A 3UBLA 1RQMA 2J23A 4O5RA 3D22A 5G1KA 2GQLA 4PX1A 2GSRA 1PSQA 2MZCA 1SYRA 3C71A 4GTUA 1S3AA 5H5SA 1PN9A 3HHVA 3GSSA 4GSTA 2HXKA 3E9JB 4ZBDA 2BMXA 3QAWA 1ST9A 4DSSA 2ZUPA 4ECBA 4IHUA 2HE3A 4X1UA 4NPBA 2CT6A 1V58A 2EC4A 4DVCA 1ILOA 1TOFA 3F4RA 1TRVA 3ZTLA 3SWLA 3PH9A 1OYJA 4H86A 4Q5QA 4MJEA 2CA8A 1Z6MA 5DVBA 2YJ7A 2AV4A 5EL8A 3D21A 5F0GA 4AF2A 1JZRA 3CYNA 2DC5A 3QMXA 3ZFLA 3L9UA 1MD4A 1SJIA 2P31A 1Z7RA 4K6XA 1MTCA 2FA4A 3RPNA 5JCWA 4Q5RA 3G9BA 5HR2A 1M2DA 1YY7A 1JHBA 1GTUA 2H19A 3MDKA 3H93A 1XXUA 3DEXA 2C80A 1ERVA 2B5EA 2L57A 4KE3A 3HCZA 1V9WA 2B5XA 2YJHA 1KTEA 3ZZXA 2HSHA 2XBQA 4TR4A 4HUAA 2GSQA 1RW1A 1K0NA 2GGTA 2LRCA 2PBJA 4IBPA 4KDYA 5G2ZA 2PVOC 1I5GA 5C04A 1G0TA 4WXTA 2YWIA 1EV9A 1S3DA 5IIZA 1ON4A 2F3MA 1U3AA 3UBKA 1BJXA 3H4KA 3GKKA 1S3CA 3GKNA 2C0FA 1PL2A 2DJJA 5G30A 3VPTA 2VCXA 1M9AA 3ZLPA 3VI7A 3TKPA 1TKDB 5DCHA 4EKZA 1TJDA 3EU3A 3IV4A 5JWRB 4N11A 3F6FA 1BAYA 1BG5A 3D4TA 4OMVA 4J2FA 2O8VB 5A4WA 3RDWA 4YQMA 3P2AA 3F3QA 4F9ZA 2JADA 4Q5FA 2WULA 3ME8A 1F9MA 4PQ1A 4RI6A 2DLXA 2L5LA 5JWOB 4XRAA 2IMEA 2H0IA 5DAKB 3WGDA 3AY8A 2JSZA 4HEA2 3VI5A 1DE1A 3EU4A 4MZCA 2VUPA 3FZ9A 1AAZA 4MH2A 1V98A 2HI7A 2HYXA 3EVIA 2E0QA 2H1DA 2LQOA 3GH9A 1O81A 5G1LA 4HZ4A 4ISDA 3ZFBA 3TJGA 5DAKA 1X9WB 1ABAA 2PPTA 2WGRA 3GKXA 4BL7A 2ALBA 4LMWA 1OKDA 2K8VA 3IHQA 4IJIA 5HQPA 4KDUA 3WGEA 1A0RP 4ULXA 2BJXA 1Z5YE 4GCIA 5CO3A 2GS3A 5DCGA 2JL4A 2C4JA 2VOCA 1FG4A 2XBIA 4PQHA 4ACSA 5CREA 1J9BA 2R6KA 3GRXA 1B9XC 4LMVA 1NM3A 1OC3A 3DKSA 4XS1A 5IMCA 1SL0B 3F6DA 4WEYA 2YP6A 3GURA 4FYBA 3LWAA 4D73B 3BBYA 5A5KA 3BJ5A 3TKRA 1XIYA 4NXIA 4MP4A 3EINA 5J5NA 3M1GA 2G0FA 2GT6A 5AN1A 2HRFA 2H1AA 3GNJA 3KP8A 4KW6A 1G6WA 1PX7A 2WZ9A 5LD0A 1MDKA 4F82A 1XW5A 5HR3A 2PGTA 3CRUA 2V2GA 3IAS2 4MABA 3QDNA 4EO3A 4POMA 4EDZA 4HZ2A 5H5QA 1GLQA 2EIOA 1SKRB 3ERGA 3NZNA 2QC7A 4KSOA 2ES7A 4ZXGA 1YKAA 3M0FA 2V32A 4MK3A 5IOWA 3LFLA 4ZBBA 4V2MA 2F8AA 3IPZA 1M2BA 2KUCA 3VWXA 1DSBA 3NIVA 3APSA 4G9HA 3VURA 2PN8A 4OCFA 1CQHA 4QQ7A 2VCVA 1HQOA 3I9V2 1GL8A 3KM6A 3LGCA 3C1SA 4HU9A 2IL3A 5KN0A 1QQ2A 2IPAA 1XWGA 3D5JA 2IMFA 4MJCA 2VL2A 3GYKA 4EE0A 1YKCA 2LNSA 2VLTA 2DMLA 3TJBA 4TKYA 1TK5B 4NMUA 1EEMA 4LLRA 4EXJA 5HR1A 5ECQB 2LS5A 3KD0A 4MMMA 1F37A 1EOGA 2H01A 4K1FA 2AYTA 4K9ZA 3KZQA 2HNLA 1DUGA 4AJ6A 1R26A 2E2GA 3EMXA 1AXDA 3ZMKA 2IJYA 3TKSC 3GH6A 6GSSA 3I69A 3G7JA 4F0BA 2CAQA 1Q98A 2PMTA 2H0HA 3H1NA 1PX6A 4RI7A 2X99A 1X9SB 1XWBA 5DQSA 2HLSA 1NW2A 4HJ2A 4IJ3A 5ECRB 1W89A 2TRXA 5C00A 8GSSA 1ZOFA 4N0ZA 1K0BA 5D8IA 1TU8A 3HDCA 4FH8A 1SKWB 3R2QA 4ZL8A 4GWRA 3GTUB 4OO4A 1M7TA 4DSRA 2YNXA 1X5CA 3MWHA 5E4WA 2X64A 1T1VA 5EY6A 3P8WA 3ZIJA 2TIRA 1GTBA 1YF1A 5ID2B 2QSIA 3QR6A 5FHIA 3KP9A 3TRQA 2DBCA 4KNDA 1K3OA 6GSWA 2VCWA 1UC7A 4ML1A 4OFNA 1R5AA 2GLRA 1B4PA 4MLYA 4BVXA 5H5RA 6GSTA 13GSA 1PKZA 2RLIA 2OKAA 1A23A 3GX0A 1AIUA 3N9JA 1YEXA 3HVSA 4KB3A 2CVDA 2R2JA 4MH3A 4ECIA 3DGQA 2B1LA 4XCSA 4F03A 2JZRA 2VLVA 4MJBA 1TRWA 4NHZA 1E6BA 5E59A 3A2WA 2YCDA 1EP7A 3GA4A 2WFCA 4OWYA 4JU5A 2I4AA 5HR0A 1YJ6A 3LEFA 4MDCA 1A2MA 4WR5A 5ECKB 2HRNA 1OC9B 1AW9A 3CRTA 2PERA 2VM1A 4X0XA 3VFIA 5J4UA 4K8MA 1HNCA 3FK8A 4GSNA 1M9BA 3LYPA 3HYPA 3TJKA 2KHPA 2DJKA 2LRNA 2N5AA 2CAIA 1OC9A 4ZBAA 2EIRA 1BQ7A 3U5RE 3WGXA 4HQZA 4K0GA 3TDGA 1AQXA 5D73A 2LUSA 1KNGA 5JWQB 3UVTA 2KLXA 4DSQA 3W6GA 5IO2A 1GSYA 2G2QA 3MSZA 3RBTA 4Z7XA 1F3AA 5KN2A 4DSSB 2L4QA 4L5LA 2A2RA 3JCML 4OD7A 1SJZA 2V1MA 2H74A 14GSA 1EGOA 4KX4A 3KMNA 2GT5A 1BX9A 2O7KA 1XCCA 1VF4A 1G7EA 2I81A 1XWKA 4OO5A 5G5EA 5DALB 1PL1A 1EOHA 1FAAA 5D96A 5B6NA 2LV3A 5J41A 2C3QA 1TDIA 4BA7A 1VRSD 3ZVJD 4ML6A 1MEKA 1GWCA 3GL3A 5DALA 1X5EA 3UJ1A 5ECPB 2CZ2A 3F4TA 2ON7A 4IGJA 1K3LA 1SL1B 3L78A 4HDEA 1U88A 3IRAA 3KH7A 1Z6NA 3TKSE 3FEUA 1B4QA 2BTOT 2OE3A 7GSSA 2AJQB 1K0CA 2H71A 1XW9A 1TRUA 4WF4A 1FB6A 4BPYA 4RUVA 5FT3A 3H8QA 3IAM2 4NHWA 3VWUA 2IMKA 4WBJA 1A0FA 2H1BA 3PR8A 3BOAA 4G10A 2H30A 4I6XA 2KP1A 3Q74A 1ERTA 2H0GA 3P90A 5AISA 1K0AA 10GSA 1TP9A 1O73A 2B7JA 5DDLA 1ZYEA 1M2AA 4MJAA 3UOMA 3HA9A 1GNWA 3C8EA 3EURA 3TJJA 4HI7A 1V57A 1GSUA 3E3EA 4YQVA 2VM2A 3TOUA 4WF5A 3Q19A 3MAKA 2X8CA 5F8BA 2C0EA 2QKEA 5ECIB 2L6DA 16GSA 2H8LA 2L59A 4V2LA 4LA1A 4KA0A 5D9VA 1GUKA 1ML6A 4KUNA 2M72A 3SBCA 1XOAA 1JFUA 1ZL9A 5IOXA 4IW9A 1HYUA 1YQ1A 4K2DA 1F2EA 4FYUA 4FIWA 1WMJA 3FRCA 3CSHA 2H66A 2FLSA 4KCAA 4BWSA 1U3IA 2NPBA 4ILFA 4TXOA 3GKMA 3VK9A 1WPIA 5D9XA 4KAEA 2JSYA 3CMIA 2CQ9A 2KP2A 1SKSB 2JACA 4TR0A 1Y25A 2MMAA 4MF7A 3LYKA 2C0GA 4E8HA 1USBA 3KCMA 3TKQA 4HS1A 4IKHA 3O76A 2NBSA 1XWCA 2XPDA 1G7OA 3HZ4A 5HFKA 2DIYA 2Z9SA 4HQSA 1DBYA 4V1Ag 4FYCA 3NOFA 4BWQA 2GSTA 2B1KA 2TRCP 5D9TA 3IA1A 3IE3A 9GSSA 1TRSA 5IMAA 1N2AA 3I43A 4CW9A 19GSA 3GHAA 2ON5A 4CHSA 4PUFC 6GSVA 4KDXA 3DMLA 3BD2A 5CRWA 3HXSA 4JZQA 4PUAA 3M3MA 1X9MB 1R5PA 5INYA 2OADA 1QK8A 1XVWA 2IIYA 4LL1B 1IYIA 2AAWA 2LRTA 3C73A 1FVJA 1K3YA 5D9WA 2L5OA 5CRGA 4G19A 4O32A 5GAND 1RK4A 2IMDA 3DYRA 2LEGA 3O3TA 5KN3A 3Q6OA 1J0FA 1YZXA 3D6IA 4PGTA 1XPVA 2C3NA 3IK9A 2CZ3A 3WT1A 4KGIA 1UN2A 1XW6A 4NWYA 4GQFA 2GZYA 3F0IA 1TI3A 2IMIA 2FUG2 1TI1A 2EIQA 3TKSA 2DJ1A 3IXRA 3UVHA 5GSSA 3ERWA 1KEBA 3QOUA 5GZZB 1FB0A 3KJYA 3W8JA 3TJFA 1H4OA 1SK1A 4GF0A 3IK7A 2K8SA 4JR6A 5DQYA 4XTSA 3IDVA 1WRYA 3FZ5A 1B8XA 4CDOA 3QFBC 1GUHA 2A4VA 3QAVA 3LXZA 4RQXA 4DEJA 4IQ1A 1PMTA 5B8AA 4IS0A 3DVWA 3V1WA 3EYTA 2P0GA 1MDIA 5IMVA 1IYHA 1EV4A 2NTOA 3FZAA 4YQUA 5IQYA 2E2MA 1OE8A 2GQMA 4IQAA 4WETA 3LJRA 2FA8A 3P7XA 5CNWA 3C7MA 4EDYA 1O7UA 4PURA 4YAVA 2IWTA 2LJAA 2PVQA 2R4VA 2LJKA 3FZ4A 2FD3A 2RIIA 4L5OA 2HT9A 3IOSA 3UARA 5ECOB 3FW2A 4K0NA 4HOJA 4EL1A 3HD5A 1ACVA 5AIVA 4WKWA 1U6TA 4ECJA 4GLTA 4RQRA 2GVPA 4EUYA 2OBKA 2PWJA 2JU5A 1OVNA 1WOUA 3D4MA 3DWVA 2H1GA 3EC3A 1ZZYA 3F8UA 2YWMA 4N0VA 5CRHA 4K7IA 4ID0A 4V1Ap 3H79A 2LSTA 3RHCA 4K7NA 1SYXA 3GL5A 4L8EA 4IN0A 2I1UA 4TW5A 1T4ZA 1YDKA 4MCUA 2X8GA 2GZPA 1MD3A 4O7HA 4AJ8A 5HFIA 4I2TA 1WP0A 2VCQA 1O8XA 1GSDA 1WIKA 1HNBA 1QUWA 1TU7A 3GV1A 5DJMA 3TUEA 4MZBA 1OKTA 1GSEA 2JZTA 1PGTA 2VL3A 1OAZA 1CQGA 3GMFA 4G2EA 3APQA 4TN8A 2XC2A 1XVQA 2D2ZA 2YV9A 3VWVA 3M8NA 2DIZA 4GRFA 2YZUA 1PD21 2H72A 5B6MA 3FHKA 4IP6A 5G5FA 1ERWA 2C3TA 3CTGA 1GH2A 1EWXA 6GSUA 4LL4B 2H6YA 5F06A 1FW1A 5JCGA 3ZMLA 3F3RA 2IFQB 5ECSA 1DE2A 1THXA 1GSFA 3DRNA 4PNGA 3VPQA 3F9UA 3ED3A 5CP1A 4ECCA 2IFQA 2F8FA 2YN1A 3CXGA 2FGXA 4QL9A 2HFDA 3I6AA 4ZILA 3GFKA 3A2VA 3RHBA 1B48A 1HNAA 3ZRDA 1GUMA 2CV4A 4NAXA 1FHEA 1A2JA 1T00A 5CYYA 3DVXA 3KIJA 4YH2A 2GTUA 4TR1B 4MZWA 1FOVA 1V40A 4IELA 2CVBA 5A4UA 1AC1A 1VF2A 4EVMA 2FCHA 2DJ3A 3F63A 1E2YA 5ECLB 2YPMA 2YV7A 3OR5A 4JEDA 1SK2A 4MA9A 1URMA 2FY6A 4TR1A 2YWNA 1TTZA 3S9FA 3FKFA 1EP8A 3TOTA 4POKA 4JBBA 2NDOA 5LCZA 4I8BA 3KGKA 2FWHA 1EEJA 3KXOA 4XHMA 1LU4A 1BYEA 1WE0A 1XZOA 1TK8B 2C0DA 12GSA 2OA7A 5DJLA 2XHFA 3TCOA 4L0WA 1MDJA 2VL9A 5EPFA 2HSYA 4IP1A 1N8JA 3CTFA 1GNEA 5AGYA 1PRXA 3KH9A 1SU9A 3FY7A 6GSXA 1GTAA 3G7IA 1O85A 4ZB6A 3VLNA 2B5YA 1T3BA 3LQ7A 4N30A 1YF0A 1AUCA 3EMPA 4TOPA 3IC4A 1A2LA 3F4SA 2B7KA 1SJ6A 4POLA 2M80A 2REMA 3IBHA 4EF0A 2FNOA 1GLPA 1SL2B 2H76A 4EC0A 2K18A 1O8WA 1U87A 5HFGA 1QFNA 4XIHA 1GSQA 3CSIA 2R37A 5GAPD 3UIWA 2VD0A 2WS2A 3HKRA 4TR3A 1C72A 2YWOA 3W8SA 2I3YA 4ZB9A 3CSJA 4O92A 4KH7A 3EWLA 5ELGA 2AHEA 1K0MA 2O85A 3UMAA 3ISOA 2C1YA 2H6ZA 1I9DA 3UL3A 3Q18A 3TGZA 1PQNA 3TB2A 1SD8A 2GSSA 2WCIA 1QGVA 4ZB8A 1VF3A 3HZ8A 4PNFA 4TXOB 2K6VA 5ELAA 2AB6A 1GTIA 4MF5A 1UVZA 3N5OA 1B9YC 2I9HA 1UA5A 1WJKA 4J56E 4XRDA 5KN1A 2ZNMA 2WB9A 2C8UA 3ME7A 1NHYA 5GSTA 2H75A 2O89A 2B3SA 2JZSA 1T4YA 5L71A 4OCEA 2V6OA 2XPEA 2OE1A 1XFLA 1WWJA 1Q4JA 3DIEA 3FR6A 4I5QA 1VGLA 5KEJA 3ZITA 1LBKA 2GQKA 4I97A 5ECNB 4BVYA 2OE0A 4POBA 1R7HA 2MBSA 4ZL9A 1YEPA 3C1RA 4OFTA 5DBQA 5CAXA 1AQVA 3L9SA 3K8NA 1GULA 3O6TA 4V2NA 4ZIJA 1BEDA 4MPGA 3HVXA 5IMDA 4PXOA 3GN3A 3QFAC 2YANA 3ZVJA 3ZIVA 2VD1A 3VWWA 1VF1A 5LNKe 4XS6A 4L0UA 4X43A 3APOA 2L4CA 1XBSA 1GRXA 3L4NA 1R4WA 2DJ2A 1JZOA 3FR3A 3UEMA 3LXTA 5ECHB 2V6KA 18GSA 4TRXA 3A3TA 2GZZA 4QL7A 4ZL7A 1Z3EA 1W4VA 2GDRA 2OACA 1A24A 2DSAA 4D73A 3GX8A 1H75A 2LKUA 4IVFA 3LG6A 2RUEA 4KCEA 4JR4A 3M9KA 1M99A 2VO4A 3US3A 1NSWA 4TVEA 2P5RA 4P3YB 2MMOA 2MMZA 3WD6A 2ZCTA 3A5WA 1Z9HA 2F9SA 1K0DA 2NVLA 3E0UA 5ABRA 3EE2A 2VCTA 2H70A 3ZREA 1SENA 2K9FA 1F3BA 1Y6EA 4NV5A 2A2SA 1JLWA 1ZMAA 5IM9A 2WDUA 1X0RA 6GSYA 2LQQA 1AQWA 1PKWA 1JZWA 1GP1A 2DMMA 2X8HA 2VIMA 1XWAA 4MPFA 4JRRA 2FWEA 2LJRA 4HJMA 1FVKA 2YZHA 5ENUA 2L6CA 1A8YA 1GSSA 2P5QA 2H6XA 1Z7PA 5AIXA 2DJ0A 2F51A 2PUKC 2FWGA 3WT2A 22GSA 1A8LA 3LORA 2FWFA 2J9HA 1T8EB 4MF6A 4NV2A 4OFMA 1XOBA 20GSA 3D0ZA 2QGVA 3J7Yk 1ZCPA 4XS4B 4PQIA 4I2UA 3HY2A 3ERFA 17GSA 3RAZA 3ZYWA 2RUFA 3TRPA 5J9BA 2H73A 4AGSA 4YAPA 4GXZA 1TXXA 1V2AA 3DXBA 3HJMA 3KEBA 2B6MA 3U6VA 4XS4A 3BCIA 3A2XA 5F05A 2VL2C 2WJUA 11GSA 5CRDA 3CBUA 5A4VA 3L0HA 2KOKA 2CX4A 3HJPA 2HZEB 5EVOA 3WYWA 2PU9C 4K7OA 5COHA 5IMZA 3FYGA 2IN3A 4Q5NA 4AJ7A 1JZDA 4F0CA 2HZFA 2CX3A 3GSTA 2N5FA 2VLUA 1OC8A 3IR4A 2FHEA 2WRTA 2HZEA 4F2IA 3ZL5A 5IPHA 1NHOA 3QAGA 3GTUA 2LTKA 2OJLA 2VCZA 5G31A 1JLVA 2MBTA 1EGRA 2YOIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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