2CVBA

Crystal structure of a thioredoxin-like protein from thermus thermophilus hb8
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
LQYPELPLESPLIDAELPDPRGGRYRLSQFHEPLLAVVFMCNHCPYVKGSIGELVALAERYRGKVAFVGINANDYEKYPEDAPEKMAAFAEEHGIFFPYLLDETQEVAKAYRALRTPEVFLFDERRLLRYHGRVNDNPKDPSKVQSHDLEAAIEALLRGEEPPLKEAPAIGCTIKWRPGNEPEVRIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords probable thiol-disulfide isomerase/thioredoxin
publication title Crystal structure of a thioredoxin-like protein from Thermus thermophilus HB8
rcsb
source organism Thermus thermophilus
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 55
structure length 187
sequence length 187
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cvbA00
4NV2A 2I3YA 4RI7A 1G6WA 2I9HA 4DEJA 1TDIA 1N8JA 2IJYA 2DSAA 1AQVA 2VCTA 1LBKA 3IV4A 2H01A 1Z7PA 1SK1A 2O7KA 1XWKA 2WZ9A 3FEUA 1YQ1A 5GZZB 8GSSA 4EL1A 1ERVA 2WULA 5DDLA 4TVEA 4YAVA 1RW1A 4G9HA 2PBJA 3EWLA 2L5OA 3FRCA 2G2QA 3HZ8A 2RLIA 1B8XA 3TJGA 2PWJA 4D73A 2JADA 4EUYA 4BVXA 4MH2A 16GSA 4OFTA 2V32A 4K7OA 3IAM2 4IQAA 5IOXA 2PVQA 1MD4A 2LSTA 4HJMA 2YV7A 2H0GA 2H1GA 3D22A 5IMDA 1M2BA 1GNWA 1M2DA 1MDJA 4OO4A 1QMVA 2H1BA 2H0IA 4EXJA 2P5QA 5G2ZA 1O6JA 3D5JA 3IDVA 2E0QA 5GSSA 2L6CA 5CO3A 2L6DA 3EURA 3WD6A 3M1GA 3GYKA 1Y6EA 3CYNA 4HU9A 3WGDA 2GSRA 2E7PA 2FA8A 5IPGA 4TR4A 1AUCA 1VGLA 3DIEA 1TK8B 2QKEA 3EC3A 1V98A 3APSA 4ISDA 2F9SA 5D9VA 5DAKB 3RDWA 4TW5A 1WRYA 2PUKC 4GRFA 2M80A 4O92A 2YPMA 4WXTA 3K8NA 4K2DA 5ECKB 5GAND 1PMTA 2FGXA 1TRVA 1QK8A 2IMKA 2VL2C 2MMOA 1ILOA 2ON5A 3TRQA 3FHKA 3MSZA 5LNKe 5IPHA 1SJ6A 4F2IA 5D93A 3UVTA 2GLRA 1KNGA 3QOUA 4ECJA 3LYKA 2IN3A 2HT9A 3I9V2 1SK2A 2GZZA 3VPQA 1YY7A 1XVQA 4MF7A 5H5RA 2GQKA 1O8WA 1O81A 2X64A 1K3LA 1WIKA 3GIXA 1A2JA 2P5RA 2HLSA 3ERFA 2L4CA 4HEA2 4ZB9A 2PMTA 3ZIVA 3U6VA 1PD21 2IMDA 3J7Yk 2KP2A 4KH7A 2OKAA 4NMUA 1YEXA 4N30A 5CNWA 3HVXA 2HYXA 4J56E 3TGZA 1Z5YE 4O7HA 2C0GA 1GSUA 3LQ7A 2WRTA 3ZMLA 2K9FA 2CZ2A 4XCSA 2IL3A 2GGTA 3HZ4A 2VCZA 3G7JA 3ZMKA 4EE0A 4HQSA 4X1UA 1F3AA 1XWGA 1N2AA 1I9DA 2FD3A 3IK9A 4JR6A 2LS5A 3EU4A 5LD0A 2BTOT 3KH7A 3PH9A 2FWGA 5F8BA 3C73A 1BG5A 1U3AA 2REMA 5IIZA 1GP1A 3ZITA 3DKSA 4TR1B 2XBIA 5E4WA 3GMFA 2TRXA 2JSZA 4PNGA 5JCGA 3O3TA 4J2FA 3KEBA 4HS1A 3QMXA 1HYUA 1O73A 1W4VA 2P0GA 3HJMA 3F8UA 3QAWA 3L9VA 3EVIA 5C04A 4EDZA 4KB3A 1WOUA 5CYYA 2NBSA 2JZRA 1BX9A 2I81A 1HD2A 1OE8A 3G7YA 2CVKA 4RQXA 1YJ6A 1OYJA 2P31A 4JBBA 3TKSE 6GSWA 5CAXA 5DALB 1F2EA 5HR2A 3MDKA 1TU8A 3QAGA 5HFGA 3SWLA 7GSSA 1TK0B 2LJAA 2H66A 2GQLA 1GSQA 3A2WA 4JE1A 2L4QA 2DC5A 2R3XA 5A4WA 5ECLB 1BEDA 4JR4A 5GSTA 4GSSA 3WT1A 2M46A 3L4NA 2YANA 5J9CA 3H4KA 2M72A 4ECIA 1FW1A 1F3BA 1TI3A 4MLYA 4WBRD 1Z3EA 4L0UA 2V2GA 4GSTA 1OC9B 4O5RA 2HZEA 5G1LA 1X9WB 4FYUA 2H70A 1RQMA 3DMLA 3F0IA 3FZAA 2NTOA 5LCZA 2VL3A 2YJ7A 2MBTA 2C1YA 3FZ9A 3LXTA 3VWUA 1SJZA 5GAPD 2JU5A 3QR6A 5AN1A 4WF4A 3QAVA 4IJIA 1GULA 4FH8A 4F03A 2H1AA 3H79A 3CSIA 2AUVA 2H6XA 3D21A 2OA7A 1EOHA 1NSWA 4NV5A 4DVCA 1URMA 2N5FA 3LORA 4ZBBA 1TOFA 1UA5A 3HVSA 3Q18A 4WF5A 5G30A 3TKRA 4XS6A 3IAS2 3UARA 4HZ2A 4ZB8A 1SL2B 19GSA 1MTCA 3J7Yb 4TXOA 1GTUA 3WGEA 5JWQB 3UEMA 1JZRA 4HQZA 2HFDA 3M8NA 4LMWA 14GSA 4L5OA 2H72A 1GWCA 4POBA 4N0VA 5IMFA 2DJKA 4EF0A 3FW2A 2B7JA 1AXDA 3LXZA 4OD7A 3F9UA 1FO5A 3EMPA 2CAQA 4OFNA 2CX4A 1PX6A 2D2ZA 3VLNA 1SD8A 1YKCA 3C71A 5D73A 1MDKA 1JLVA 3ZVJA 2ON7A 3DYRA 3F6DA 2H6YA 3TJKA 4I6XA 2F51A 1Y25A 3GH9A 4N11A 4K8MA 5KN1A 4NHWA 3F63A 3ZYWA 2OACA 3DGQA 1EGOA 1T3BA 3TRXA 4LL1B 5KEJA 1GL8A 1XCCA 2C3NA 1X5DA 1U87A 1VF4A 5AISA 2B5YA 2VCVA 4X43A 2EIRA 1A0RP 4K7NA 5IM9A 4MJBA 3M3MA 3VWWA 2GTUA 2IMFA 4ML6A 2C8UA 4ZBDA 2JZSA 3QFBC 3BOAA 2ZNMA 1HNCA 2KUCA 3IOSA 4OWYA 1IYIA 4ZB6A 3H1NA 2K8VA 1K0CA 1PGTA 2G0FA 4NAXA 2AHEA 2H30A 3EYTA 2CV4A 2VCQA 2O87A 1F37A 2GZYA 5EY6A 4FO5A 3ZFLA 3IXRA 2GSSA 5COHA 3ERGA 1SJIA 1R4WA 2C80A 2B6MA 2DIYA 3ZTLA 2C0FA 1Z7RA 4KUNA 3GNJA 2CQ9A 4POLA 3FZ4A 3KMNA 1ERUA 3DVWA 4PUFC 1SU9A 3GH6A 1PA3A 3CRUA 4GWRA 4DSSA 5FT3A 1TXXA 1G7OA 4Q5QA 2NPBA 1VF1A 1WJKA 1TRSA 1HQOA 1M0UA 3G7IA 2BJXA 2AAWA 3TJJA 4NHZA 1AIUA 2RIIA 3KJYA 3NIVA 4TR1A 2BMXA 2H1DA 1A0FA 2GSQA 2LJKA 1XW5A 2JL4A 3CXGA 2OE3A 1GTAA 1CQHA 1WMJA 5F06A 3L0HA 1JHBA 5JWOB 4MZCA 5ABRA 1YKAA 2GQMA 2L57A 3F3QA 3LEFA 5KN2A 4JU5A 1ZOFA 5J41A 3KZQA 3HD5A 3O6TA 5JCWA 3UIWA 3HJOA 4IP1A 4IP6A 2DJ3A 1HNAA 4OCFA 2KP1A 4HDEA 3LSZA 4XRAA 2CVBA 1NM3A 2C4JA 3IRAA 1ZZYA 3LWAA 2KLXA 2CAIA 4KA0A 3EE2A 1K3YA 1T4ZA 3F4RA 3ZZXA 1F9MA 4CHSA 5H5QA 1K0NA 2LKUA 1FG4A 4OO5A 2OE0A 1XWCA 1X9SB 3ISOA 4MP4A 4Q5RA 1V58A 1R5PA 2B1LA 1XWAA 4YH2A 1JZDA 2PU9C 3C1SA 2RUEA 1GSEA 2YN1A 4IELA 5J3RA 1BQ7A 3DVXA 2DMLA 1QFNA 1DUGA 3VWXA 1TU7A 1USBA 2MZCA 4XHMA 4PURA 2WCIA 1ST9A 3G9BA 2AV4A 4AGSA 2MYGA 3KP8A 4QQ7A 2GSTA 3CTGA 1SK0A 4BVYA 4HZ4A 1GTBA 6GSYA 2HI7A 5ELGA 5D8IA 3HDCA 5HFIA 4GQCA 4K9ZA 5A4UA 3NOFA 2WS2A 9GSSA 2QC7A 4E8EA 4KX4A 3L9UA 4POKA 2V6KA 3P8WA 3WGXA 4K0GA 4Q5FA 2KHPA 4XRDA 4J57E 1E2YA 1GSFA 4KDUA 1AAZA 2H8LA 1RK4A 3UOMA 2YNXA 2YZUA 1OKDA 3LG6A 11GSA 4I2TA 1TRWA 3A3TA 2B5EA 5F07A 3UBKA 2X8GA 4L5LA 6GSXA 4BWSA 1S3CA 4AJ7A 1ERWA 3TJBA 4YQUA 1Z6NA 3FY7A 2ALBA 4KDXA 3HA9A 3H8QA 3CRTA 3HKRA 5HFKA 2IFQB 5D9WA 2DJ0A 1EEMA 4JEDA 5CRWA 2X99A 1F6MC 3APOA 3ME8A 3UVHA 1U3IA 3LFLA 4GF0A 4TOPA 2N5BA 3FK8A 2LRCA 4V1Ap 2CA8A 3WT2A 4YAPA 5AGYA 1K0AA 10GSA 4ECCA 4HI7A 3WYWA 1SL0B 1A8LA 1T1VA 2B5XA 1CQGA 1QXHA 1V57A 1QQ2A 5D96A 1XXUA 1TK5B 3DWVA 3ED3A 1R26A 2X8HA 1XOAA 3HVVA 3N9JA 4MPGA 2IPAA 3QDNA 3GTUB 2FUG2 2CX3A 5G1KA 1K0OA 4XS4A 3IHQA 1X5CA 4MJCA 1PQNA 1O8XA 1K0MA 5CREA 3RPPA 1XW6A 4K1FA 3H93A 2VCWA 2YWMA 5CRDA 4GXZA 3BCIA 2OBIA 2VCXA 4K6XA 3QCPA 5JCUA 2PERA 2IMIA 3MWHA 5ECRB 1J0FA 3GKNA 5E59A 4AJ6A 2GS3A 2V41A 3IPZA 2FWFA 1M9AA 1PL2A 5IMVA 1VRSD 3ERWA 1Z6MA 3VWVA 4TR0A 4V2LA 3FR9A 1MDIA 4WKWA 2H75A 3GA4A 3I69A 1T7PB 4KCAA 1EEJA 1THOA 3M9JA 1G7EA 1FAAA 3KXOA 3DXBA 12GSA 2C0EA 2VUPA 1PKWA 4AF2A 3TKSC 3KTBA 3A5WA 1DBYA 3GKXA 5G5EA 2AJQB 1ZYEA 2E2GA 4MH3A 5IO2A 4KSOA 3BBYA 1DE2A 2F3MA 1TTZA 1AW9A 3OR5A 3P90A 4V1Ag 4IS0A 1V40A 3GKMA 5FHIA 4ECBA 1PRXA 4NWYA 4F0CA 5D9TA 1GRXA 2V6OA 2QGVA 1HNBA 1EP7A 2F8FA 3BJ5A 4ULXA 5L71A 2F8AA 4L0WA 2PPTA 4I8BA 1GNEA 5DBQA 4IN0A 3CSJA 2GT6A 5B6NA 1EV4A 3R2QA 3UL3A 3TB2A 1A2MA 4XIHA 3TJFA 4LMVA 1GSDA 1XIYA 4ID0A 2Z9SA 5C00A 2JSYA 3IE3A 2N5AA 4RI6A 4RUVA 5DJMA 2RM5A 3US3A 3GL5A 3P7XA 4IQ1A 4F9ZA 1WP0A 2CZ3A 1K0DA 1H4OA 2K6VA 1FB6A 3LYPA 5DCHA 4MCUA 1B48A 1B4QA 3M0FA 2LTKA 3C8EA 2OE1A 2YCDA 2GZPA 1SYXA 4MMMA 1SYRA 1U88A 1GH2A 4PQ1A 1SKRB 5DAKA 2YZHA 3QD9A 4MF5A 3FZ5A 4POMA 2ZCTA 2GDRA 13GSA 2H19A 1TJDA 5ECPB 4QL7A 4KW6A 4E8HA 1NHOA 1ON4A 5EVOA 3F4TA 4BA7A 1JFUA 1T4YA 3SBCA 2A2RA 2RUFA 4CW9A 5IOWA 2VM1A 2K18A 2VLVA 2FWEA 2R37A 4ZXGA 2VAFA 5IQYA 4LLRA 3MAKA 1T8EB 4Q5NA 4TKYA 3E3EA 5KN3A 1OAZA 5J5NA 1X9MB 5ID2B 2DMMA 1K3OA 4YQMA 2HRNA 2I1UA 3O76A 2IIYA 5CRGA 1EOGA 2R6KA 2LQQA 1SKSB 4DSRA 2TRCP 5EPFA 1NW2A 4JRRA 4FYCA 1TI1A 4GQFA 2FY6A 3A2VA 4BPYA 1ZMAA 1KBNA 1UC7A 3U5RE 4F82A 3TDGA 1AQXA 1M99A 4XTSA 1B9XC 2OJLA 3VPTA 3VK9A 1YF1A 4V2NA 2HRFA 3F4SA 4PGTA 2IFQA 1ERTA 1MD3A 3KIJA 4ZL9A 3ZLPA 3APQA 2DJJA 3HJPA 1TW9A 3VURA 1O7UA 5G31A 2YWIA 5IMCA 4I2UA 4KSMA 1XOBA 2HNLA 3ZL5A 4GCIA 5ECOB 4IKHA 3KM6A 4HU7A 2YOIA 2IMEA 1LU4A 3GUSA 2HZEB 2E2MA 2V1MA 3KD0A 4N0ZA 4PQHA 4FYBA 4TXVA 3TUEA 1FVKA 2DJ2A 4CDOA 3GTUA 2WJUA 4PQIA 4MA9A 2DIZA 1EGRA 2L59A 3CTFA 2XC2A 3F6FA 4V2MA 1ZGNA 2VO4A 4IW9A 1XFLA 2A2SA 3FYGA 2VL9A 3D4TA 4G10A 4HJ2A 1DE1A 4EVMA 3RBTA 5DALA 1AQWA 2CT6A 3ZRDA 3RHCA 1UVZA 4EC0A 3AY8A 2QSIA 1ZCPA 3IC4A 2DJ1A 4MZBA 4K0NA 4TXOB 4GSNA 3D6IA 4OFMA 1QGVA 5DQSA 3TKSA 4OMVA 3N5OA 1A24A 1KEBA 5CP1A 1J9BA 2HXKA 1NHYA 1DSBA 1EV9A 5ECNB 3QPMA 5CRHA 2R2JA 4XS1A 3L78A 1ACVA 2MMZA 2YWNA 3NZNA 2C3TA 1PKZA 3BD2A 3ZIJA 1B9YC 4PXOA 3TOTA 1S3DA 4TR3A 2MMAA 2I4AA 5AIXA 1OC9A 3GX8A 3FR6A 5AIVA 3GKKA 1UN2A 4PUAA 3BCKA 5F0GA 2NDOA 2TIRA 1KTEA 3KGKA 1C72A 1YEPA 4GTUA 1X5EA 1PN9A 1U6TA 2C3QA 4O32A 4P3YB 2AYTA 1OC3A 1VF2A 1M2AA 1JLWA 1H75A 4QL9A 1M9BA 2AB6A 4X0XA 2KOKA 3LJRA 2J23A 5JWRB 4IVFA 2LJRA 2CVDA 3E0UA 3KH9A 3L9SA 3S9FA 3I43A 4K7IA 4KE3A 3KCMA 4LL4B 3PGTA 1K0BA 4KDYA 5EL8A 5ECSA 4F0BA 1FVJA 4H86A 3UMAA 1VF3A 2HSYA 2FCHA 2PN8A 3HY2A 1OC8A 3HHVA 4TN8A 4NXIA 2A4VA 1XVWA 4MZWA 5ECMB 6GSVA 5ECIB 1O85A 1SENA 2YWOA 1EZKA 2EC4A 2VD1A 3ZVJD 1OE7A 2O8VB 1V9WA 1T00A 3JCML 3ZREA 2LUSA 5ELAA 3UAPA 1R7HA 1GUMA 3CSHA 4MABA 3MNGA 5G5FA 2K8SA 1MEKA 2X8CA 2NVLA 2EIQA 2FNOA 3F3RA 2LEGA 2R4VA 4DSSB 1YF0A 2O85A 3M9KA 2DBCA 5ECHB 1FHEA 4YQVA 4EKZA 1G6YA 2VLUA 5B8BA 2RM6A 3C7MA 2HSHA 4G19A 4EDYA 3QFAC 3GURA 1GLQA 1Q98A 3FR3A 1XW9A 1TRUA 2FWHA 3TKPA 4KAEA 4ACSA 1LJRA 2YP6A 2H76A 4D73B 2H0HA 4PNFA 3TCOA 1ML6A 3P2AA 5ID2A 1FOVA 4MF6A 5D9XA 2VLTA 5ENUA 2OADA 3KP9A 2HE3A 2JACA 4MDCA 3W8SA 4TRXA 3TOUA 3GSSA 5H5SA 3E9JB 6GSTA 1WWJA 1ABAA 1V2AA 17GSA 2R5GA 1BAYA 4L8EA 1WPIA 3ME7A 2WB9A 1BJXA 5DJLA 2LQOA 3EU3A 4IGJA 5DQYA 2GVPA 4WEYA 2GT5A 2O89A 3EINA 5HQPA 3VI7A 1OKTA 5KN0A 2H73A 5B7CA 2VIMA 3CBUA 1SKWB 3W6GA 3KMOA 1EWXA 3W8JA 2LRNA 1W89A 5A5KA 4OCEA 2IWTA 1X0RA 2LNSA 1OVNA 3Q19A 3GFKA 2YJHA 2FHEA 2WDUA 3ZFBA 1YDKA 2B1KA 1EP8A 4RQRA 2OBKA 4N10A 2XPDA 4DSQA 1AC1A 4Z7XA 4MPFA 4IHUA 3V1WA 2WFCA 2XHFA 4NPBA 1SD9A 4IJ3A 1GUKA 1XPVA 2PGTA 3GL3A 4MJAA 4WR5A 4IBPA 4WETA 1SL1B 4KGIA 4AJ8A 1R5AA 3IA1A 5FWGA 2B7KA 3UBLA 1GTIA 3RHBA 1I5GA 5ECQB 4HOJA 2VD0A 1TP9A 2XPEA 3FKFA 1IYHA 3DEXA 2MBSA 4ZIJA 4PX1A 5F05A 4FIWA 4HUAA 5B6MA 5A4VA 1Q4JA 1GSYA 2VM2A 18GSA 3TKQA 1A23A 4BWQA 3GN3A 2LNTA 2LRTA 4I97A 1E6BA 2MMNA 1PL1A 3TRPA 1GSSA 3VI5A 4ZBAA 2L5LA 2H74A 3C1RA 3GHAA 2JZTA 20GSA 4MK3A 5J9BA 2PVOC 1XZOA 1QUWA 5HR3A 3KTLA 3HCZA 1XBSA 4ZL8A 3UJ1A 1A2LA 3PR8A 1XWBA 5HR1A 3GRXA 3VFIA 4ZILA 4MJEA 1GUHA 3GV1A 3HXSA 1YZXA 3CMIA 22GSA 2VL2A 2H71A 2YV9A 3DD3A 1S3AA 4ML1A 4GLTA 3IR4A 1ZYQB 4WBJA 2FA4A 4G2EA 1FB0A 2C0DA 1TKDB 4LA1A 5INYA 1M7TA 4BL7A 1Z9HA 2B3SA 5DVBA 1J08A 2HZFA 2ZUPA 1PSQA 3D4MA 4JZQA 6GSSA 3HYPA 3A2XA 2ES7A 4ILFA 4I5QA 3D0ZA 4WR4A 4XS4B 5J4UA 3GX0A 2DLXA 3EMXA 5IMZA 5B8AA 3GSTA 5IMAA 4EO3A 3LGCA 2FLSA 1THXA 3DRNA 4KNDA 3IBHA 1BYEA 2VOCA 2H6ZA 5HR0A 2WGRA 3Q6OA 1PX7A 1WE0A 1B4PA 1JZOA 3I6AA 4ZL7A 1ZL9A 2EIOA 3Q74A 1JZWA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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