2CVBA

Crystal structure of a thioredoxin-like protein from thermus thermophilus hb8
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
187
structure length
187
Chain Sequence
LQYPELPLESPLIDAELPDPRGGRYRLSQFHEPLLAVVFMCNHCPYVKGSIGELVALAERYRGKVAFVGINANDYEKYPEDAPEKMAAFAEEHGIFFPYLLDETQEVAKAYRALRTPEVFLFDERRLLRYHGRVNDNPKDPSKVQSHDLEAAIEALLRGEEPPLKEAPAIGCTIKWRPGNEPEVRIG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords probable thiol-disulfide isomerase/thioredoxin
publication title Crystal structure of a thioredoxin-like protein from Thermus thermophilus HB8
rcsb
source organism Thermus thermophilus
total genus 55
structure length 187
sequence length 187
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cvbA00
18GSA 5H5SA 1ABAA 5IMDA 2FA8A 1K0AA 4HEA2 2MMAA 2HSYA 2LS5A 1O8XA 4FYUA 4JRRA 3QFAC 4KX4A 1AUCA 3QPMA 1SL0B 1AQWA 2I3YA 2B5EA 2OACA 3F0IA 4POBA 2MMOA 4DSQA 5ID2A 1K0MA 4QL9A 2DMLA 3E9JB 2FUG2 3UEMA 3G7JA 4E8HA 3PINA 2I81A 2DIZA 3D5JA 3KM6A 2OADA 1S3CA 2FHEA 1LBKA 2VUPA 2FLSA 4V2NA 2GT5A 3EMPA 5B7CA 4I2UA 1ZL9A 3MDKA 2G0FA 1GSFA 3BCIA 3CRTA 1TK5B 2L6DA 2IMEA 2KHPA 2WS2A 2O89A 2R6KA 3GH9A 2CQ9A 4TKYA 2DSAA 5IMCA 2R3XA 2VAFA 2IMIA 2F8FA 1GNWA 3D21A 5J5NA 3LGCA 4V2LA 3M8NA 1YEXA 2H0GA 1THXA 3HD5A 2F9SA 5ELGA 5IO2A 1GRXA 4GWRA 3FR3A 1GL8A 3DGQA 1K0CA 2F51A 4X1UA 1TDIA 1G7EA 3HJMA 1F3BA 12GSA 4KNDA 1V40A 3ISOA 1O73A 1TU7A 5J9BA 2AV4A 5A5KA 4XHMA 5IOXA 2H71A 3DEXA 1X5EA 1X5DA 2B7KA 1GP1A 2H6ZA 2V2GA 3AY8A 1SYRA 3ERGA 4ZIJA 2FD3A 3GSSA 4K8MA 3TRQA 1Y6EA 3GURA 5D9VA 4YQMA 4NPBA 3L78A 4RI6A 3GTUA 4PQIA 2VLUA 1T7PB 4GXZA 3ZTLA 1BEDA 3IV4A 4NWYA 1B4PA 4ECBA 2HT9A 5D96A 3APSA 3HA9A 1PN9A 2FWEA 3KGKA 2REMA 2YWOA 3WGEA 3TKSA 2MBTA 3FHKA 4DSSB 1BQ7A 9GSSA 1SKSB 1U88A 4NMUA 4IQAA 3QFBC 4ZB9A 4AJ6A 2B1KA 2L5OA 4O92A 1YQ1A 4EXJA 3TJGA 2B1LA 3D0ZA 3BJ5A 1DSBA 1Z7RA 1QXHA 1XWCA 2GSTA 1FAAA 2LEGA 4N30A 1M2BA 4NAXA 5F06A 3GKXA 3TKQA 4Q5RA 3GX0A 2WDUA 4G2EA 4ZL8A 4LL4B 4V1Ag 3TKPA 2Z9SA 1AQXA 5AGYA 3N9JA 2FCHA 2H1AA 3LEFA 1J0FA 2FA4A 3RHBA 1W4VA 1EZKA 4RI7A 2TRCP 2OE1A 3ERWA 4IN0A 4RQRA 2DMMA 3C7MA 3EVIA 6GSVA 3MNGA 3QCPA 3LWAA 4ZB6A 1OE8A 3P8WA 2ZCTA 1R26A 3F4TA 2ZNMA 2QC7A 3TB2A 1TU8A 3EU4A 3P7XA 3BBYA 4HQZA 3M9JA 1GUHA 3GYKA 3I9V2 2DJ2A 3L4NA 4FYBA 4ML6A 2A2RA 2CA8A 1SYXA 4LMVA 5D93A 3LJRA 4KUNA 1K3YA 1V98A 3GA4A 3LQ7A 3Q19A 1BAYA 2WGRA 2HSHA 2HRNA 2GVPA 2HXKA 4MA9A 5IMAA 13GSA 2HZEA 1M2AA 3F8UA 1TTZA 4L0UA 2VCTA 3FRCA 3I43A 2LQQA 4IJIA 4Q5NA 2YJHA 5ECSA 1T1VA 1TP9A 3DYRA 3RDWA 2M72A 17GSA 1AQVA 1FW1A 3CMIA 3F63A 3FZ4A 3U5RE 1UC7A 2JACA 2XPDA 1ST9A 4WXTA 5D8IA 3A2XA 4JR6A 1A24A 2P5RA 4MZBA 1LJRA 3F6DA 2MZCA 5G31A 1Q4JA 4OO4A 3J7Yb 3EURA 5DQSA 2GZYA 4MPGA 4HQSA 2KP2A 4GLTA 3W8SA 3VPTA 6GSWA 1Z6NA 1NM3A 3IBHA 4EE0A 2ON7A 1VGLA 2IJYA 3ERFA 3F4RA 1QMVA 2B6MA 2VD0A 2P0GA 1F37A 2AAWA 3GL5A 3KCMA 4HZ4A 1LU4A 4L8EA 4FIWA 2BMXA 1GWCA 1OYJA 4LA1A 4AJ8A 3TDGA 2F8AA 1TW9A 5B6MA 1I9DA 3GRXA 1K0DA 1X9MB 3Q74A 4J2FA 1JLVA 5KEJA 2O87A 5INYA 3RBTA 4IGJA 4BPYA 1X9SB 3ZFLA 4KE3A 4ZBDA 4G9HA 5ECNB 4GF0A 1EEJA 2B5YA 4N10A 2M46A 3Q18A 2C80A 2OE3A 1EGRA 1XWBA 4FH8A 4JBBA 3TKRA 4ILFA 1F2EA 2E2GA 3F6FA 2MBSA 3HZ8A 2RLIA 1NW2A 1TI1A 3MSZA 3JCML 2VCQA 4D73B 5JWRB 1PL1A 2LQOA 4AGSA 4XRAA 3SBCA 2YNXA 5DCGA 4BVYA 1W89A 3KTBA 5HFGA 4PX1A 4JU5A 3J7Yk 5F07A 1K3LA 3HCZA 4OWYA 3P2AA 2L59A 1F9MA 5ECLB 4ECJA 1C72A 4MK3A 5GZZB 1TK8B 3FR6A 4POLA 4TN8A 5DVBA 1Z5YE 3H1NA 2H0IA 4PNGA 1H4OA 1T00A 1WOUA 2YWMA 4MZWA 2IFQB 3UBLA 5IQYA 1ML6A 2GSQA 3EE2A 3WT2A 4HOJA 5L71A 4L0WA 2CAIA 2AHEA 4GRFA 4PUFC 4ULXA 5C00A 2QKEA 3GV1A 3QDNA 2PMTA 2JSYA 5J41A 3ZIJA 1USBA 3HDCA 2GSSA 2KOKA 3KTLA 4TXOB 1E6BA 2IL3A 5ECQB 3DWVA 3O3TA 2H75A 3CYNA 3FZ5A 4DSSA 2R4VA 1M0UA 1SKRB 3CXGA 3HVVA 1HNAA 2JSZA 5IMZA 1MTCA 11GSA 1TI3A 1XBSA 10GSA 4I6XA 3FY7A 3QMXA 2VL2C 4WR4A 1SL2B 1ZCPA 1URMA 2DJ3A 1A8YA 1SD8A 3G9BA 1EP7A 3EU3A 2ZUPA 2CVKA 1QGVA 4IBPA 4EO3A 4J57E 4TR3A 4F0CA 1RW1A 1XW9A 4HU7A 2JZSA 4L5LA 3ZRDA 5JWQB 4IP6A 3CSHA 1TRVA 4LMWA 3I6AA 2OKAA 1WMJA 3CSJA 3US3A 4MLYA 2FWFA 1O8WA 2LUSA 2LRNA 2TRXA 2GQLA 5H5RA 3ZIVA 4KA0A 2LJRA 2LJAA 3DVWA 4IVFA 2YZHA 4KDUA 3FEUA 2YV9A 1GSDA 2E2MA 2PPTA 3LORA 3D4MA 2OJLA 1QK8A 1WIKA 2K9FA 3TUEA 1GSSA 2D2ZA 3HKRA 1FHEA 4IELA 5F05A 4JR4A 1B48A 3KMNA 1MDIA 4NV2A 2B7JA 5JCUA 3F3RA 3H79A 4RQXA 1XXUA 2DLXA 1XFLA 3N5OA 7GSSA 1PGTA 3GL3A 2YWIA 2R37A 4PNFA 4LL1B 3LSZA 2VL3A 2VL9A 3D6IA 1AC1A 1ERVA 2GTUA 1YKAA 2O8VB 2YANA 1V9WA 4LLRA 3NIVA 4KGIA 5CYYA 5GSSA 2R5GA 1A8LA 2KUCA 1ILOA 2C0DA 2A4VA 3W6GA 3KP8A 2V41A 2R2JA 4Q5FA 2H1BA 4EC0A 3MAKA 1UVZA 1SU9A 2QGVA 3E0UA 3QAWA 2E7PA 3TRXA 1XWKA 4ZXGA 2OBKA 3CSIA 3H93A 1ERWA 5CRDA 2IMKA 1FVKA 1EV9A 5HQPA 1J08A 5ECRB 3VPQA 4AJ7A 1WWJA 2WB9A 3NOFA 1HNCA 4POMA 3IOSA 2VM1A 2H72A 3EMXA 2H73A 1DE1A 1PL2A 2J23A 3A2VA 4KAEA 2V1MA 1RK4A 4YAVA 1X0RA 3A2WA 4NV5A 3UJ1A 5B8AA 1DUGA 1XW6A 4WR5A 2VIMA 2NBSA 2XHFA 4FYCA 1M9BA 1JZWA 1ZOFA 4KCEA 5IPHA 4XRDA 3UMAA 1TKDB 1X9WB 3KH9A 3G7YA 19GSA 1SD9A 1JZRA 5CRHA 1IYHA 4GTUA 3FK8A 4PQHA 3ME8A 2O7KA 2VOCA 1T3BA 2V6KA 2MMZA 5COHA 3PGTA 2ON5A 2GQKA 4H86A 4I8BA 2RUEA 3ED3A 2X8HA 1B9XC 1CQHA 4PQ1A 2HFDA 4MJAA 3G7IA 3VURA 4GSTA 1YZXA 1N2AA 3TOUA 3IAM2 1OC8A 3IE3A 1TJDA 4D73A 1SK0A 4OD7A 1O6JA 4EL1A 3FKFA 2PVOC 1A2MA 3MWHA 4TVEA 4L5OA 3ZITA 4OFMA 1JLWA 3DKSA 1V57A 5IIZA 5DBQA 4O7HA 2BTOT 2H1DA 1MD4A 3TGZA 3WYWA 5D9XA 2K18A 3CBUA 2GS3A 4CHSA 20GSA 1YF1A 2IFQA 2VM2A 3GX8A 4YH2A 1XZOA 3QAGA 1Z6MA 2RIIA 4EDZA 3GHAA 3GH6A 5IMFA 4F03A 5LNKe 1TRUA 2H6XA 1FVJA 5A4WA 3ZZXA 3VK9A 1GTIA 1PKZA 1WP0A 2M80A 4Q5QA 22GSA 4ECCA 3QD9A 4ACSA 3M1GA 4TXOA 3M3MA 1RQMA 3QR6A 2B5XA 4IQ1A 1CQGA 4WBRD 3BOAA 2RUFA 3VWXA 2XBIA 4TR0A 3I69A 4ZBAA 1ERUA 1TOFA 3P90A 5B8BA 4CDOA 2RM5A 2JZTA 5HR1A 4GQCA 3R2QA 1GTAA 1E2YA 1WE0A 1U3IA 2IMFA 3KXOA 2PGTA 2LV3A 3TJJA 3TOTA 5IPGA 3VWUA 4EVMA 2GLRA 1KTEA 3IAS2 5ECHB 3OR5A 2BJXA 1YF0A 4ISDA 2EC4A 4MPFA 5IOWA 2E0QA 2VD1A 2HRFA 5DDLA 2H6YA 2MYGA 4N11A 1VF1A 4K0NA 1GSYA 3TRPA 1SKWB 3EYTA 3UIWA 1BX9A 4Z7XA 1UN2A 2H1GA 1K3OA 2YCDA 1JFUA 4KH7A 4XTSA 2L57A 4K7NA 4G19A 4NXIA 3ZVJD 1G6YA 1ERTA 1GLQA 4IJ3A 5E59A 5IO0A 2OBIA 5JCWA 1OKDA 2IWTA 1B9YC 2LKUA 2CT6A 2DBCA 2YZUA 2H74A 2AJQB 2KLXA 1B8XA 4KSOA 2C3NA 2A2SA 2PWJA 2V32A 2VCWA 1Q98A 4F82A 4FO5A 2JADA 1TRWA 2G2QA 2CV4A 1ACVA 4G10A 4OCEA 3IHQA 4TR1B 4X0XA 4XS6A 1HQOA 3DMLA 3F3QA 2FWGA 1GULA 4EF0A 2XPEA 1PX6A 2VCZA 5J3RA 3F4SA 4J56E 1YKCA 2WULA 3FR9A 2RM6A 1KEBA 2PN8A 1TRSA 2LNSA 2GDRA 1SK2A 5ECPB 4BWQA 1V2AA 2AB6A 1EV4A 2CX4A 5G5EA 1SK1A 1PMTA 4HUAA 2N5FA 5JCGA 1PX7A 4TOPA 3VI5A 5ECIB 1GTUA 2P31A 1XOAA 5C04A 1WRYA 1HD2A 3C73A 3QOUA 1J9BA 16GSA 4IP1A 3LG6A 2DC5A 4KSMA 2C8UA 3VFIA 3GFKA 5E4WA 3LYKA 2WZ9A 5AISA 2C3TA 5HFKA 4ZL9A 4ZL7A 3KD0A 1ZYQB 2V6OA 5CAXA 5D9WA 4QQ7A 1VF3A 3CTGA 3WGXA 2L5LA 3HY2A 3M0FA 3WT1A 3WD6A 4MZCA 3KH7A 1B4QA 1V58A 1WJKA 4DVCA 2H66A 2IPAA 2YOIA 1O7UA 5F8BA 3ZMKA 5DAKB 3D4TA 4BA7A 4HZ2A 2GQMA 3ZLPA 2GT6A 2EIOA 1G0TA 1SENA 1BJXA 1X5CA 1XPVA 3ZFBA 5DCHA 3L9SA 3UOMA 4TR4A 2FY6A 3VLNA 2DJ0A 1H75A 2LSTA 1EP8A 5D73A 2OA7A 4YQUA 4MH2A 5DQYA 3GIXA 5CP1A 5CREA 2HI7A 4JE1A 2HYXA 4MDCA 2K6VA 3IA1A 3DD3A 3Q6OA 4I2TA 1M9AA 3HVSA 4BL7A 4O32A 4PGTA 3QAVA 1GTBA 2HE3A 3TCOA 5ECOB 2NTOA 5HFIA 2C3QA 5DALB 1HYUA 3HVXA 1F3AA 2VO4A 3H8QA 1VF4A 4ZBBA 2AYTA 5KN1A 5AIVA 4IS0A 3O6TA 5FT3A 4MJBA 2L4QA 4K2DA 4TW5A 5KN3A 1FG4A 3BD2A 3E3EA 3PH9A 3IDVA 3KMOA 1Z9HA 2TIRA 5EVOA 1PRXA 3EWLA 4XS4B 2IN3A 2I9HA 4V1Ap 2P5QA 3TJKA 3KEBA 2LNTA 2C0GA 3UVTA 5H5QA 3UARA 4GSNA 1OAZA 5LD0A 1K0OA 1ZGNA 2PU9C 5EY6A 1T4ZA 5D9TA 2MMNA 1QUWA 2LRTA 3RAZA 2PBJA 5CRWA 2C0FA 1XW5A 3D22A 4I5QA 4ZB8A 3TJFA 3L0HA 2CVDA 5FHIA 2DJJA 1OC9B 3W8JA 4WEYA 4N0VA 5ENUA 4MP4A 1XIYA 1PQNA 3GSTA 5DJLA 4ID0A 2K8VA 1M99A 3RPNA 4HU9A 4KDYA 1DBYA 1AIUA 4IHUA 3DIEA 1A2LA 2FNOA 2HNLA 4WF4A 3IR4A 3DVXA 3UVHA 4TXVA 2DJ1A 2I4AA 2I1UA 1HNBA 3L9VA 6GSXA 2YWNA 4O5RA 5HR2A 5G2ZA 3HJPA 1NHOA 1MDJA 14GSA 4POKA 2J9HA 1XWGA 2EIRA 5KN0A 1EGOA 1M2DA 3FW2A 2C1YA 4HJMA 2L4CA 1GH2A 2N5AA 1O85A 4V2MA 2L6CA 5GAPD 4PXOA 4MJEA 5HR3A 1EEMA 3IC4A 3IRAA 3ZMLA 3TKSE 5KN2A 1EWXA 2F3MA 4JZQA 2YV7A 3FZ9A 1VF2A 1G7OA 2WCIA 2HZFA 2O85A 3ZL5A 1JZDA 4TR1A 1PSQA 1IYIA 4JEDA 4OFNA 1NHYA 2PVQA 3UBKA 3H4KA 4MF5A 2CZ2A 3RHCA 1SJ6A 1FO5A 5CRGA 2IIYA 2DJKA 5JWOB 1GUKA 6GSSA 2DIYA 4GCIA 1PD21 3GKMA 4ML1A 1BG5A 4YQVA 5IMVA 1A2JA 5GSTA 6GSUA 5A4VA 5G5FA 3V1WA 4MMMA 1Z7PA 3HYPA 4F9ZA 1A0FA 5B6NA 5CO3A 3SWLA 3KIJA 4GQFA 4I97A 2CAQA 3FZAA 3KP9A 4WKWA 4CW9A 3IXRA 1YY7A 4KB3A 4K7OA 4EDYA 5J4UA 2LJKA 4MH3A 1TK0B 2CX3A 4HS1A 1SJZA 2QSIA 3EINA 1SL1B 2OE0A 4HJ2A 3GKNA 1I5GA 4F2IA 3VWWA 5G30A 1Z3EA 3ZREA 2FWHA 2C0EA 1T8EB 5ID2B 2GZZA 2YN1A 1O81A 2C4JA 2CZ3A 1U87A 3KZQA 2H01A 8GSSA 5DAKA 1ZZYA 3DXBA 1YJ6A 4EUYA 2WJUA 3C71A 1SJIA 2NVLA 3LFLA 1F6MC 2FGXA 1MDKA 3WGDA 1AXDA 2AUVA 2H76A 1GSQA 2H19A 1R5PA 1OC3A 2GSRA 2X99A 4WBJA 1GSUA 4K0GA 2XC2A 3M9KA 1MD3A 5G1KA 4KCAA 4OFTA 4HI7A 3ZVJA 3TKSC 3DRNA 5ECMB 1XCCA 6GSYA 2JZRA 3RPPA 3KJYA 4K6XA 5ECKB 1FOVA 3IK9A 3UAPA 2H0HA 3CRUA 3C1SA 4MF6A 2JU5A 5CNWA 5DALA 4OCFA 5A4UA 2IMDA 5ELAA 1FB0A 2NPBA 4K9ZA 4HDEA 4BVXA 2B3SA 1AAZA 1R4WA 1A23A 1GSEA 1XVQA 4XS4A 4EKZA 3HZ4A 3ZYWA 1A0RP 4XS1A 4ECIA 5EPFA 1WPIA 1YEPA 1S3DA 1U3AA 1BYEA 1M7TA 4KDXA 4MABA 4DSRA 3GMFA 1ZYEA 4MJCA 1GLPA 1QFNA 3GN3A 2LRCA 3NZNA 3A5WA 2WRTA 4PURA 4NHZA 3TJBA 4X43A 3C8EA 2YPMA 4BWSA 4WETA 3GTUB 5AIXA 4IKHA 3APQA 3UL3A 3IPZA 4RUVA 1KNGA 2VL2A 2N5BA 1OC9A 4GSSA 2EIQA 3IK7A 3BCKA 4XCSA 1FB6A 2ES7A 4XIHA 3LXZA 5LCZA 2NDOA 2XBQA 4YAPA 2X64A 4KW6A 3HXSA 4AF2A 4WF5A 5IM9A 2YP6A 4E8EA 1EOGA 1Y25A 2VCXA 1XOBA 2K8SA 4MCUA 1GNEA 3APOA 3S9FA 3K8NA 3CTFA 1PKWA 4K1FA 3EC3A 3LXTA 4NHWA 4OMVA 1K0BA 3VI7A 1R7HA 1ZMAA 2CVBA 1G6WA 3ME7A 4F0BA 2YJ7A 2H30A 1OE7A 3GUSA 1NSWA 4P3YB 1JZOA 3GKKA 2VCVA 1XWAA 5F0GA 2GGTA 1OVNA 3LYPA 1MEKA 6GSTA 1EOHA 1N8JA 1UA5A 2VLVA 1TXXA 2GZPA 1QQ2A 1R5AA 2LTKA 4QL7A 3A3TA 2PUKC 2HLSA 2H70A 2WFCA 3FYGA 2X8CA 5EL8A 5DJMA 3PR8A 5HR0A 2X8GA 2ALBA 1GUMA 3HHVA 4K7IA 5ABRA 1JHBA 1S3AA 1AW9A 3C1RA 1YDKA 3L9UA 4N0ZA 4DEJA 1OKTA 3F9UA 3HJOA 4MF7A 1K0NA 4PUAA 1PA3A 1THOA 1KBNA 4TRXA 1U6TA 2VLTA 1VRSD 1XVWA 3U6VA 3VWVA 4ZILA 2PERA 3O76A 1DE2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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