2H72A

Crystal structure of thioredoxin mutant e85d in hexagonal (p61) space group
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
DKIIHLTDDSFDTDVLKADGAILVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIADEYQGKLTVAKLNIDQNPGTAPKYGIRGIPTLLLFKNGDVAATKVGALSKGQLKEFLDANLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Thioredoxin mutant E85D in Hexagonal (p61) Space Group
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Escherichia coli
total genus 29
structure length 107
sequence length 107
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2h72A00
1W89A 4MCUA 3RHCA 5IMDA 2P5QA 3ME7A 4ZBAA 4NHWA 2YWIA 4MK3A 3CMIA 2FY6A 1O8XA 3L4NA 2VCXA 2ZCTA 1PSQA 5IIZA 2R5GA 3J7Yk 1GTAA 1M2BA 1TTZA 1XFLA 2WGRA 3F0IA 1XWKA 4Q5FA 5CRHA 2MBSA 4O32A 2CT6A 2IMIA 4YQVA 4I5QA 3QFAC 1O6JA 1QFNA 2OJLA 5DCHA 4I97A 4DVCA 1HNAA 4G2EA 4WKWA 3FYGA 1WPIA 1YF0A 3G7YA 4ID0A 5GAPD 2IMFA 1T7PB 1JZOA 1GL8A 5EY6A 3GH6A 4OMVA 1KTEA 4OCFA 4HQSA 1TRWA 4NV5A 1M9AA 1KEBA 3ZFLA 2JSZA 3GSTA 4XCSA 4V2LA 3RPPA 4IJIA 1SK1A 2FA4A 3MAKA 4EUYA 4LLRA 1QXHA 4TXOB 2MMNA 1USBA 5AISA 4MA9A 2PERA 1B4PA 3GSSA 3APQA 4QL9A 4KDUA 4GSNA 2P0GA 1YZXA 4D73B 3F6FA 2L6CA 3HJPA 4TN8A 2DJ1A 22GSA 1PX7A 1CQHA 2H1AA 4TRXA 1A2LA 2VO4A 3BBYA 2H1GA 3CRUA 1FO5A 4FO5A 2VL9A 5CRDA 2HXKA 2YV9A 2VUPA 2G0FA 2N5AA 1N2AA 3L78A 2H01A 2L5LA 2HZFA 2B1KA 2R2JA 1GLPA 1AXDA 5F06A 3HCZA 3C73A 4MPFA 4I2UA 5HR2A 2Z9SA 2GZPA 5G1LA 1TK0B 4ZB6A 1ON4A 5GZZB 1SL0B 2YWNA 2C0FA 1M2DA 2YANA 1H4OA 1OE8A 3WGEA 5KN3A 1T1VA 1XBSA 3TOTA 2GVPA 4ZIJA 1KNGA 1A0RP 4IHUA 4ECJA 3NIVA 3MNGA 1O85A 1V2AA 4FIWA 3FZAA 4WF5A 2O7KA 3TKSA 1JLWA 3C1SA 2MYGA 1OC3A 3KZQA 2X99A 3IXRA 3ZMLA 2AB6A 3TRXA 2CX4A 1J0FA 2F3MA 2DLXA 2M80A 2I1UA 3EMPA 3FK8A 2DJ2A 4ZBDA 1TJDA 2R6KA 3FR9A 1QQ2A 1BEDA 4L8EA 2CAQA 3EURA 4HUAA 3V1WA 4L0WA 3D5JA 2WS2A 4MF6A 4PUFC 2NPBA 1NHOA 4ECBA 3QOUA 1PGTA 1ZYEA 3HY2A 1WRYA 3F4TA 3D21A 4KCEA 5D93A 2GZYA 3Q19A 1GH2A 1OAZA 3KIJA 1E2YA 2B3SA 1K0NA 5DAKA 2D2ZA 4MH3A 1B8XA 3F6DA 1VGLA 4ISDA 1WMJA 2KOKA 2B7KA 4K6XA 2A2RA 5G31A 3CBUA 2HFDA 3HZ4A 3GV1A 4OO5A 3TKQA 5L71A 5ID2A 2VLVA 5ECMB 3APOA 3ZVJD 5A4WA 1Z5YE 2H72A 1HQOA 1QGVA 3HYPA 4TXVA 2EIQA 2RLIA 4V2NA 1SKWB 3O6TA 3TDGA 4JU5A 1JZWA 2ZNMA 3C7MA 4N0VA 3VWVA 4ZL7A 1DBYA 5ECSA 1EP7A 5J4UA 1FG4A 1URMA 2IFQB 2QSIA 3GMFA 3KM6A 1XW9A 5IO2A 1NHYA 3HJMA 4F2IA 2B6MA 3GX8A 1EP8A 1MEKA 1EEJA 1GTIA 2VCTA 2FWEA 2VCVA 2JU5A 1R4WA 1SK2A 2RUFA 1R5AA 3LG6A 1PL1A 3GKNA 4EDYA 4ML1A 4MDCA 1XXUA 1GWCA 2JZTA 2CV4A 2V6OA 3Q74A 1TDIA 1K0CA 3HDCA 4IGJA 3UBLA 2GQMA 3NOFA 1TU7A 2XC2A 1XOBA 3IV4A 5ECKB 3CYNA 2O87A 2L5OA 3M8NA 2YNXA 3DVXA 2OACA 3N5OA 1I5GA 4HQZA 3M9JA 1UN2A 5DQSA 5IMZA 1AQXA 2E0QA 3TJFA 4K0NA 2C0EA 3GIXA 2HLSA 2IMDA 1EEMA 3ERFA 3KH9A 4RUVA 4ACSA 1EOHA 4K7NA 4KCAA 1OKDA 1X0RA 20GSA 3GH9A 1N8JA 2E2MA 4K0GA 5JWRB 4PNFA 1G6WA 5H5RA 1B9XC 3IBHA 2IWTA 4PNGA 2HSYA 3EWLA 1SL2B 2X8CA 1X9MB 1TI1A 1THOA 4YAPA 2B5EA 4HOJA 1B4QA 1YJ6A 5JCWA 1PA3A 3W6GA 2B5XA 3VI5A 1TOFA 2H0GA 1ZL9A 1V40A 1K3YA 2LKUA 4XTSA 2DBCA 5IMVA 2CA8A 1ERWA 4ECIA 2RM5A 2MZCA 2WRTA 2LQOA 2YV7A 1YQ1A 1BG5A 5F07A 3F9UA 4QL7A 2AAWA 1Y25A 3GTUA 4MP4A 5B6MA 4K7OA 2PMTA 2WDUA 3CXGA 1F2EA 4EO3A 2ALBA 3FZ4A 1PKZA 4MZWA 3ZRDA 3GYKA 2OBKA 5LD0A 3VPQA 2HI7A 4GWRA 3RBTA 5DCGA 1ZYQB 2EIRA 4FYBA 4QQ7A 1EWXA 4TR0A 5IPGA 5JWOB 1O7UA 1PQNA 3LXTA 4KW6A 2DMMA 1XZOA 2VL2A 4F0CA 2H19A 3IOSA 4MJBA 2DJ0A 2C3QA 4XHMA 4RI6A 2FLSA 2FNOA 2H1DA 4HDEA 1O81A 2BJXA 4KA0A 1X5DA 3IDVA 4HU9A 2PBJA 1ZMAA 3QD9A 4AJ8A 1MDJA 2LJAA 5D9XA 4OCEA 16GSA 4HJMA 4RQRA 4ZBBA 5G1KA 1ACVA 4I2TA 5FHIA 1E6BA 3TCOA 1K0AA 3IR4A 2WJUA 2K8SA 3LWAA 2RM6A 2GSRA 4DSQA 1G7EA 1SYXA 13GSA 3U5RE 1X5EA 2ON5A 2J9HA 3GNJA 3JCML 3TKSE 2A4VA 1GSFA 4G9HA 4DSSA 1A8YA 2L6DA 2FGXA 5D96A 3IA1A 1TK8B 3QMXA 3ZFBA 2F51A 5FWGA 1SD8A 3GRXA 5IOWA 1PN9A 2LJKA 2VM1A 1FOVA 3TRPA 2CAIA 1Z6NA 1SKSB 5G5EA 3QAVA 3D4MA 1WIKA 4HZ2A 4MF5A 1Z6MA 2LJRA 3LYKA 3GL3A 1A2JA 4IVFA 1XWAA 5CP1A 3VK9A 4PUAA 1SYRA 4HZ4A 3TKPA 2XPEA 1UA5A 3P7XA 4PXOA 4NPBA 3TKSC 2A2SA 1T8EB 2K8VA 5IO0A 2GTUA 1FHEA 3H1NA 1TI3A 3U6VA 2YN1A 2GS3A 4MPGA 5CREA 1V57A 4ULXA 3BJ5A 3LGCA 4WXTA 5G5FA 9GSSA 4X43A 1G6YA 4POBA 1BJXA 1ILOA 1AAZA 1EV9A 1WE0A 2LTKA 3C8EA 1GRXA 1MD4A 2WFCA 2KP1A 3UEMA 1DE1A 6GSTA 3E9JB 2C80A 3F4RA 3G7JA 5CYYA 3TOUA 3P8WA 3HVSA 2FWHA 3TGZA 1PD21 2X8HA 1ZZYA 1VRSD 2B5YA 2PVQA 3TJGA 4E8EA 5C04A 1Y6EA 4J56E 1ZGNA 3UVTA 2FA8A 4V1Ag 1G0TA 3PR8A 2I81A 2M46A 3IRAA 5A4UA 4MH2A 1K3OA 2I9HA 1DE2A 1GUHA 2L4CA 4ZXGA 3KD0A 2NBSA 1DUGA 4IP1A 4KSMA 1HNBA 2EIOA 4AGSA 5AIXA 2HRNA 1PMTA 3F4SA 3QCPA 3LJRA 1RK4A 2XHFA 2LSTA 4YQMA 5B7CA 2KP2A 3A2WA 2KHPA 1FW1A 2IPAA 3OR5A 4J57E 3TJJA 4RQXA 5CO3A 1XVWA 1F3AA 1SJZA 3D4TA 1GSDA 5AGYA 2MMOA 2FCHA 3EVIA 5H5SA 1SENA 1DSBA 4KAEA 4DSRA 2E2GA 1PRXA 1MTCA 4EXJA 2H73A 2O89A 2OKAA 4JR4A 4BVYA 3HVVA 5IMFA 4PGTA 4PX1A 1A8LA 4MF7A 4TVEA 2H6ZA 3M0FA 4IELA 1U6TA 2LS5A 2HYXA 2K9FA 1OC9A 2CX3A 2YP6A 2IL3A 3DEXA 2VLTA 4BWQA 2BTOT 4LL1B 1GULA 1ZCPA 1K3LA 2B1LA 5DAKB 1CQGA 1BQ7A 4P3YB 3M3MA 2C4JA 3EYTA 2BMXA 2I3YA 1A2MA 4JE1A 3UL3A 3F3RA 2PUKC 1SJ6A 2PWJA 3NZNA 3HKRA 3ZIJA 2PN8A 1Z9HA 5ID2B 3KMNA 4KH7A 1TU8A 1FB6A 11GSA 1R26A 1KBNA 1ERUA 3P90A 3IK9A 5E4WA 6GSVA 3WT2A 3VI7A 1H75A 5ELAA 2HRFA 2YJHA 1X9WB 1TKDB 4MMMA 3PINA 1VF1A 2HSHA 4BVXA 3QDNA 1A0FA 18GSA 1K0OA 1Z3EA 3AY8A 3HA9A 1XOAA 3FRCA 4LL4B 3GL5A 3DKSA 2IIYA 4G10A 4WETA 2CVKA 4WR4A 3RAZA 1YKCA 4MZBA 4TR3A 3QR6A 1GNEA 4MJCA 3M1GA 1GUMA 2TRXA 3HZ8A 5ABRA 5INYA 2H76A 1U88A 2NTOA 4HU7A 2VLUA 3PGTA 1T3BA 3WYWA 4NAXA 1LJRA 1ERVA 2QC7A 2YZUA 3TUEA 5ECNB 2PVOC 5D9WA 3A2VA 5J41A 4EC0A 4ECCA 4Q5NA 3A2XA 3DWVA 4ZL8A 1T4ZA 1XW6A 3MSZA 5A5KA 4KE3A 5HFIA 3WGDA 3MWHA 4PURA 4ZB9A 1AC1A 5GSSA 2V1MA 3C71A 3DRNA 4EDZA 1M0UA 4AJ7A 4DEJA 2GSTA 3KXOA 5KN2A 4LA1A 2LRTA 1GSYA 2C1YA 4OWYA 2R3XA 2CZ3A 1HD2A 1TXXA 4K2DA 4WBJA 3VPTA 2VM2A 3A5WA 5EVOA 2XBIA 3LQ7A 4Q5RA 4FYUA 2OBIA 3M9KA 1SD9A 7GSSA 1PKWA 5HR1A 2OE3A 3HJOA 4XS6A 1YY7A 4I8BA 1MD3A 3CSHA 2AJQB 5CNWA 3VFIA 3UIWA 2P5RA 1K0MA 2NDOA 19GSA 2K6VA 5J5NA 3ZYWA 4V2MA 5ECQB 3F63A 3DYRA 4Z7XA 5FT3A 4GTUA 2HNLA 3EC3A 3IPZA 2K18A 3ZVJA 3DGQA 3CSJA 1C72A 1AW9A 3QAWA 3VWUA 5ECPB 2VD0A 2B7JA 2GDRA 4JR6A 2WCIA 3UJ1A 1O8WA 3GTUB 1XCCA 1EZKA 3MDKA 1FAAA 4K1FA 4WF4A 1RW1A 5KN0A 3ME8A 2H70A 3SBCA 2H30A 3TKRA 1G7OA 6GSXA 1U3AA 4FYCA 3CSIA 3FZ9A 3TB2A 2QKEA 5JCGA 1YEXA 3SWLA 4AJ6A 2IN3A 3LSZA 1Z7PA 1VF4A 3ZZXA 1NW2A 5IMAA 1Z7RA 4X1UA 5GSTA 1GSSA 4EKZA 4NHZA 4I6XA 1R5PA 3UARA 5LNKe 3RPNA 3ZL5A 2DJJA 1UC7A 3C1RA 1ABAA 1IYHA 4PQ1A 2JZSA 3KJYA 2IMKA 2PU9C 2YWOA 4KSOA 3KMOA 1T00A 5J9CA 2O8VB 3GHAA 4L0UA 2XBQA 1OE7A 1JZDA 4LMWA 4MLYA 4L5LA 2QGVA 4OFTA 5ECOB 3L9VA 4KUNA 1S3DA 1LBKA 4E8HA 2VCZA 5B8AA 2V41A 3IK7A 5D9TA 3VWWA 3FKFA 2P31A 3HHVA 5A4VA 2TIRA 3CRTA 3QFBC 5J3RA 3DVWA 2VIMA 2DC5A 1JZRA 1BAYA 4POMA 5DVBA 4WBRD 5CRWA 1A23A 2ON7A 3WGXA 4DSSB 3GKMA 2PGTA 1VF3A 1W4VA 4GSSA 2C8UA 1SU9A 3GX0A 4JZQA 1U3IA 2N5FA 2VL3A 3GUSA 3GFKA 2LQQA 3UBKA 3EU3A 5IM9A 1A24A 5ENUA 4MABA 2H0IA 3D6IA 2VCWA 4KB3A 1GSEA 3S9FA 2AHEA 1RQMA 2VD1A 5HFGA 4GLTA 3O3TA 4IKHA 5ECLB 1FVKA 2JZRA 5IPHA 2VOCA 2MMZA 1MDKA 2IJYA 3VLNA 1XW5A 4IW9A 3VURA 3I6AA 1XVQA 5D73A 5B8BA 1M9BA 4AF2A 4BL7A 3FR6A 1JHBA 1F6MC 2YOIA 2LRCA 2O85A 3HXSA 1M2AA 2AYTA 4ILFA 2IMEA 3KGKA 3ZLPA 8GSSA 3LEFA 4PQIA 1IYIA 1NSWA 4CHSA 3HD5A 1PX6A 1XWGA 3KTLA 3ISOA 14GSA 2LUSA 3K8NA 1BYEA 4MJEA 4YAVA 1BX9A 1THXA 2LV3A 1EGOA 4JRRA 3KTBA 1JFUA 6GSYA 3IE3A 4EL1A 4HI7A 6GSUA 1HNCA 3ZREA 2C0GA 2JACA 1YF1A 2N5BA 2YJ7A 1SJIA 4IQ1A 4F0BA 4K9ZA 12GSA 2H71A 5ECIB 4N30A 1EV4A 5ECRB 4IN0A 3BOAA 3FY7A 2C3TA 1J9BA 4TXOA 3TJBA 1SKRB 4IBPA 1SL1B 4WEYA 5JCUA 2WZ9A 5CAXA 4GCIA 4D73A 4YQUA 4WR5A 2DIZA 2JADA 3QPMA 1U87A 1SK0A 1GLQA 1XPVA 1OKTA 3L9UA 4X0XA 1F37A 1O73A 1AQVA 4TKYA 5H5QA 1YEPA 2LNSA 1B48A 1OVNA 5DBQA 2M72A 5KN1A 1AIUA 4GRFA 2OE0A 2LNTA 4GF0A 3F3QA 3G7IA 4O92A 3BCIA 1OC9B 5G2ZA 4F82A 3FW2A 4BWSA 2DSAA 3QAGA 4LMVA 6GSWA 1EOGA 4POKA 2GQKA 6GSSA 3GA4A 4XS4B 4Q5QA 4TR1B 4KGIA 4J2FA 3GKKA 2FD3A 3HVXA 2AUVA 1XWBA 3ZTLA 4HEA2 1UVZA 3ERGA 5KEJA 3DIEA 3A3TA 4K8MA 1GNWA 3TRQA 4ZILA 2CQ9A 5JWQB 1GSQA 2H8LA 3I69A 4GSTA 3ED3A 3E3EA 4F9ZA 2DJKA 4ZL9A 4XS4A 2V6KA 4KX4A 4TR1A 2WULA 3EINA 4N11A 1WP0A 2H6XA 2VAFA 5HR0A 2VCQA 4OFNA 4BA7A 1LU4A 3KP8A 2GZZA 2TRCP 3VWXA 4ML6A 4H86A 3TJKA 1F9MA 1X9SB 1GTUA 4O5RA 2GSSA 5DJMA 1ZOFA 4NWYA 2FWGA 2OE1A 2JSYA 1YKAA 4XS1A 2H74A 2F8FA 1TP9A 3N9JA 1QUWA 2YPMA 4JEDA 3ZITA 3DXBA 3APSA 5F0GA 10GSA 2JL4A 1T4YA 3IHQA 2H0HA 3LFLA 2ES7A 3H8QA 3G9BA 3L9SA 1OC8A 2C3NA 3L0HA 1WWJA 4L5OA 2DIYA 3KCMA 5DALB 4OO4A 2EC4A 1ST9A 1TW9A 1V58A 3I9V2 5D9VA 4N10A 3BCKA 2LRNA 1AQWA 3UAPA 17GSA 1FB0A 2CVDA 3J7Yb 2KUCA 2I4AA 4XRAA 1TRSA 3FR3A 1GSUA 4YH2A 2GLRA 5CRGA 3D22A 3WT1A 4G19A 2CZ2A 1J08A 5C00A 1TRVA 1YDKA 5DALA 4TW5A 3DD3A 5E59A 3P2AA 2R37A 4EE0A 1S3CA 2WB9A 4IP6A 2YCDA 1V9WA 2MMAA 5G30A 4XRDA 2V2GA 2F9SA 5EPFA 3UOMA 2DJ3A 2HZEB 4POLA 1VF2A 1HYUA 2IFQA 3FHKA 2HE3A 2RUEA 1MDIA 1Q4JA 4EF0A 4F03A 3KH7A 3RDWA 2DMLA 1S3AA 3E0UA 2HT9A 4TOPA 2XPDA 4O7HA 4NV2A 5IMCA 2FHEA 2YWMA 2GT5A 4TR4A 2RIIA 3I43A 2HZEA 3Q6OA 4ZB8A 4GQFA 2X64A 2VL2C 3W8SA 2H75A 3ZMKA 3WD6A 3DMLA 2L57A 4NXIA 4RI7A 3GN3A 1V98A 5DQYA 1M7TA 1XIYA 3IAS2 5HFKA 1GUKA 1NM3A 4IJ3A 4XIHA 1QMVA 3RHBA 5IOXA 2AV4A 1PL2A 2G2QA 3LXZA 2FWFA 3H93A 4OFMA 1WOUA 2OA7A 3GURA 2V32A 3Q18A 1XWCA 3BD2A 1QK8A 2PPTA 5IQYA 4GQCA 4MJAA 2FUG2 4KDXA 2LEGA 2GSQA 3ERWA 2GGTA 1WJKA 2J23A 3FEUA 1K0DA 3EE2A 4CDOA 2GT6A 2E7PA 5B6NA 1EGRA 1R7HA 4JBBA 1I9DA 4N0ZA 5COHA 3EMXA 2NVLA 3GKXA 3O76A 1Q98A 4CW9A 4GXZA 2H1BA 2KLXA 3US3A 2CVBA 5J9BA 5GAND 2L4QA 1ERTA 2GQLA 2F8AA 4HJ2A 4FH8A 1OYJA 2YZHA 3H79A 4OD7A 5F05A 4BPYA 2H66A 3F8UA 5HR3A 3KEBA 1GTBA 4IS0A 1FVJA 3FZ5A 3ZIVA 5EL8A 1ML6A 4MZCA 3EU4A 5DDLA 3W8JA 3KP9A 3D0ZA 3R2QA 3UVHA 4IQAA 2H6YA 4K7IA 5AN1A 2R4VA 1TRUA 4NMUA 3LYPA 5DJLA 3CTGA 1JLVA 1GP1A 4V1Ap 4KDYA 4EVMA 1TK5B 2REMA 3LORA 5HQPA 5ELGA 1M99A 2ZUPA 5LCZA 2X8GA 3H4KA 5ECHB 2OADA 3IC4A 1X5CA 5AIVA 1AUCA 2MBTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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