2HSYA

Solution structure of thioredoxin 2 from saccharomyces cerevisiae
Total Genus 17
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
17
sequence length
104
structure length
104
Chain Sequence
MVTQLKSASEYDSALASGDKLVVVDFFATWCGPCKMIAPMIEKFAEQYSDAAFYKLDVDEVSDVAQKAEVSSMPTLIFYKGGKEVTRVVGANPAAIKQAIASNV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin II
publication title NMR solution structure of the reduced form of thioredoxin 2 from Saccharomyces cerevisiae
pubmed doi rcsb
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 17
structure length 104
sequence length 104
ec nomenclature
pdb deposition date 2006-07-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2hsyA00
2YCDA 2DIYA 2WFCA 2VCTA 4ECBA 2TIRA 2F51A 1Y25A 1PGTA 5LNKe 4D73A 1OE8A 4KSOA 2DBCA 2E2GA 2MBSA 1T3BA 1C72A 2H6YA 3WD6A 3LORA 2IWTA 1NHYA 1PKZA 4AJ7A 2AB6A 3CXGA 4O92A 4MZBA 4MPGA 1GUHA 3D4MA 4PQIA 5IO2A 3EYTA 5CNWA 1Z5YE 3GL3A 3BCKA 5ECRB 1XWKA 1YKCA 4IN0A 4KNDA 5B7CA 4YQUA 3GKNA 3M0FA 3QMXA 4MMMA 4GQCA 4I5QA 1JZWA 3U5RE 2HZEB 3HZ4A 4OD7A 1VRSD 1XWGA 4OFMA 2WDUA 3KXOA 3VPQA 4MZWA 2FGXA 2DIZA 4MZCA 1TP9A 4KDYA 3H79A 2C0DA 4DSSA 3C71A 4GTUA 2JU5A 2WCIA 3ZYWA 4IVFA 1N2AA 3ME7A 1O7UA 2YWNA 4DSQA 2OACA 4TOPA 2VIMA 2C3NA 2VO4A 5AIXA 1SJ6A 5AISA 2K9FA 4RI6A 2H1GA 3I6AA 2GDRA 4JR4A 1AIUA 2VL2A 1A2LA 4DEJA 3P7XA 4FH8A 5D9TA 5LCZA 1H75A 3UMAA 5F07A 2YWIA 3EMXA 1UVZA 4XCSA 3SWLA 3KIJA 3D5JA 4QL7A 1G6WA 5J5NA 1OC8A 1BEDA 1XZOA 2DSAA 1TI1A 4TW5A 4NPBA 1SKRB 4NHWA 2JZTA 1G0TA 1FOVA 3LGCA 3BCIA 4ML6A 4F82A 1NHOA 3HJOA 1PSQA 3GH6A 1IYHA 4E8EA 2ES7A 1B8XA 3KMOA 2IMDA 1JZOA 3A3TA 1GNWA 1VF2A 2LJAA 3CRTA 2H66A 2DMMA 2VM1A 2FNOA 3RBTA 5ELGA 2H0GA 1NM3A 5DAKA 2H76A 1S3CA 1XOBA 4CHSA 1NSWA 1TRVA 2AYTA 3CSHA 2H1AA 1RW1A 4IS0A 4TR1A 1ERUA 4DSRA 17GSA 2YNXA 1T8EB 4BL7A 3UARA 5KN2A 3LSZA 2MMAA 5A4WA 2LEGA 4RUVA 1Q98A 5D9XA 1DSBA 4HJMA 2XHFA 3IAS2 1K3OA 1USBA 10GSA 5JCGA 2V2GA 3HHVA 2PU9C 1F3AA 2HRFA 2PPTA 1AW9A 3W8JA 5JCWA 3H93A 3FZ4A 4XS6A 3C73A 5G30A 2N5FA 5ECMB 2C8UA 2QSIA 4MH2A 1SJIA 2H30A 4J2FA 1QUWA 4D73B 3PGTA 5HFIA 2YANA 1K0NA 2H1DA 1WJKA 1PL2A 5ECQB 4NAXA 3EC3A 3QFAC 2D2ZA 2VCXA 1XFLA 5ELAA 5KN0A 4O5RA 3GV1A 3QDNA 4WF4A 1AC1A 4ECIA 1TK8B 1J08A 1AQWA 1B4PA 1SD9A 2DJKA 3KP8A 1KEBA 2F9SA 3E0UA 5G5FA 2QC7A 5C04A 5F8BA 2CZ2A 3VWVA 3A2XA 3HDCA 4LLRA 2YWMA 3P8WA 1PQNA 2H8LA 2C80A 4MK3A 1AAZA 2C4JA 2JACA 1FVKA 6GSYA 1H4OA 1X9SB 1ZYEA 4CW9A 4ACSA 1I5GA 2L5LA 2VD1A 4DSSB 5HR1A 3ISOA 1GUMA 2O87A 1IYIA 1TI3A 1ABAA 12GSA 5G31A 1A2JA 2EIQA 4XTSA 2C1YA 1Z6MA 1JLVA 2R6KA 5DALB 3CSIA 1GSUA 1K0CA 2OBIA 3US3A 2GGTA 2O7KA 3LQ7A 4OFNA 7GSSA 4WR4A 4WF5A 1K0BA 3C7MA 4FO5A 2XPDA 1ZZYA 3ZFLA 1T4YA 4IBPA 3TGZA 2IMIA 1JFUA 3UVTA 2H74A 3F8UA 3FRCA 3FW2A 4AGSA 2X99A 1GTUA 2F8FA 2TRXA 1MDJA 3C8EA 1HNBA 1ZYQB 3IHQA 4IQ1A 4MABA 2DJJA 4I2TA 2BJXA 4ZBDA 5GSSA 2GSRA 5ECKB 1OKDA 2GT5A 4PUAA 1ML6A 2VLVA 3Q6OA 3W8SA 4BPYA 1SL1B 2B5XA 1K0DA 4GCIA 1OAZA 5G1LA 5HFGA 1HNCA 5DAKB 3EU3A 2PERA 2MYGA 3G9BA 3EE2A 5IPHA 1EV4A 2RM5A 2E2MA 5IMCA 1U3AA 3KD0A 3APQA 1GRXA 1MD3A 1TJDA 2GQMA 1BX9A 3KM6A 2FWEA 3GA4A 4MP4A 4LL1B 1X5EA 5AGYA 5GSTA 1G7EA 3EURA 2GZZA 5G1KA 2L6DA 2HYXA 3GMFA 4KCAA 4POMA 1T4ZA 2VLTA 1O8XA 3O6TA 4G2EA 4IELA 5A4VA 4POLA 1DUGA 3WYWA 1JHBA 4ZIJA 2FA8A 3TJKA 3FYGA 1YQ1A 4RQXA 2L5OA 5L71A 2H70A 2HI7A 4L8EA 3DKSA 5IOXA 2C3QA 5FWGA 3GSTA 3ZIJA 3ZTLA 2J23A 3GH9A 5IOWA 3F6FA 1M7TA 3EMPA 4HQZA 3I43A 5GZZB 4BA7A 3QAGA 5E4WA 4OWYA 4KW6A 2LUSA 1GSYA 4GQFA 2YV9A 2LNTA 3EINA 1XPVA 3DWVA 1SYRA 3GN3A 4LMVA 3ZITA 1YF1A 1GSQA 1ERWA 1GSFA 3HD5A 3U6VA 2OE0A 3TKSA 2R37A 3TOUA 2HFDA 2WS2A 3HJPA 2MZCA 3D21A 3EU4A 2ZUPA 1YDKA 2H71A 1TK0B 2CAIA 2H19A 3G7IA 2YZUA 4P3YB 1V40A 1OC3A 3KCMA 2IL3A 4RI7A 3GNJA 3VWXA 1EEJA 2I3YA 1O73A 2X8CA 4ECCA 5HR2A 1OE7A 2MMZA 1THXA 1G7OA 1BYEA 2H1BA 2IPAA 1VGLA 4PXOA 2O89A 4N0ZA 3C1RA 2V6OA 4N10A 3G7JA 6GSUA 4HU7A 4XIHA 4L0WA 4LMWA 5G2ZA 5EY6A 1WRYA 2GZYA 1GLQA 2G0FA 2XBQA 2VM2A 3TJFA 3QCPA 5A5KA 1GP1A 3APSA 2KP2A 4ULXA 5JWOB 1SL2B 2OA7A 4KH7A 3I69A 2LNSA 1K3YA 1GSDA 3CMIA 3D0ZA 3KP9A 4ZB9A 3NOFA 5J3RA 3LEFA 3DMLA 4XHMA 4KX4A 4EVMA 3H4KA 3LXZA 2JSYA 2C3TA 2PMTA 3LG6A 2DJ3A 4IP6A 2CX3A 3P2AA 3UEMA 1V98A 5DBQA 2L59A 3GTUA 1EEMA 3LJRA 3HVXA 2LQQA 4O7HA 1M99A 1SYXA 1TRWA 4K9ZA 1OYJA 3R2QA 2HT9A 4PQ1A 2VD0A 4YQMA 4EO3A 5CRHA 4BWQA 1WPIA 4J57E 1A8LA 3UL3A 3IRAA 5DALA 4IJIA 5B8BA 2Z9SA 5C00A 2KLXA 2M46A 5IMFA 4JBBA 1Z9HA 1A24A 1GWCA 2OE3A 3ZVJA 1TTZA 3KTBA 4F0BA 4AJ8A 4EUYA 3RPNA 1FG4A 2N5AA 2AHEA 2JADA 4PNFA 1THOA 3FEUA 2AAWA 3F3RA 1B4QA 3PR8A 1QK8A 1HQOA 4K0GA 4ZILA 4IHUA 4NXIA 1TU8A 2QGVA 4EL1A 2WJUA 1K0MA 2C0EA 2IN3A 3VI5A 1OKTA 2OJLA 5EL8A 2DJ1A 1FHEA 1S3AA 4PURA 3V1WA 4YAPA 1EOHA 3UJ1A 3NZNA 4ZXGA 1PRXA 2H01A 1Z6NA 3TCOA 2OBKA 1XXUA 5ENUA 4Q5RA 2GT6A 3E3EA 3F3QA 5KN1A 1T7PB 2A4VA 2R3XA 3LYKA 2I1UA 1XIYA 1ERTA 1XW9A 4GWRA 5HR0A 4HUAA 5H5SA 3KGKA 4V2NA 4WBJA 4EDZA 1SL0B 3F4SA 1DE1A 1ZGNA 2GS3A 2LRNA 1TDIA 2LKUA 4BVYA 1YJ6A 1SKSB 3IR4A 1PL1A 4GRFA 2JZRA 3RDWA 5ECPB 1EOGA 1R4WA 3CSJA 4OO4A 3TUEA 3IOSA 3QPMA 3IK7A 2YWOA 2K8SA 2B7KA 2WRTA 3GIXA 4IW9A 1K0AA 2K6VA 5CAXA 4K8MA 4YQVA 2O8VB 20GSA 5HQPA 2CA8A 2H6ZA 4I6XA 1F9MA 3D6IA 2M72A 1OC9A 4QL9A 2MMNA 3OR5A 6GSTA 4X0XA 4ECJA 3KH9A 4KCEA 2NVLA 1XWAA 2A2RA 2HSHA 4KGIA 2EIOA 2RUEA 1YY7A 2HNLA 2VL9A 2B6MA 1SENA 3GUSA 3VFIA 4F2IA 4XS4A 4EXJA 2CT6A 1GH2A 4OCEA 2A2SA 1UC7A 3CTFA 1GTBA 4JRRA 3GTUB 4NV2A 2PWJA 5E59A 2RLIA 5F06A 4K7IA 1NW2A 3ERWA 4HEA2 1HYUA 3GURA 2GVPA 3N9JA 4PNGA 2V32A 2HE3A 5EPFA 1JZDA 9GSSA 22GSA 1X9MB 2YZHA 5D96A 3D22A 4N30A 3P90A 2YJ7A 2VCQA 1TXXA 4GSNA 4MJEA 2I81A 4HU9A 2GQLA 1M9AA 2YJHA 4N0VA 3NIVA 2L4QA 3IDVA 1V2AA 1R5PA 2FCHA 2F8AA 2JZSA 1TW9A 2FWFA 4NMUA 5FHIA 6GSXA 1M0UA 2IMEA 3G7YA 2KHPA 4ZL9A 4NHZA 4Z7XA 1A2MA 2VAFA 1O8WA 4GSTA 1QQ2A 2C0GA 1W4VA 2B5EA 1JZRA 4F03A 4FIWA 4IJ3A 1X5CA 2WGRA 1WE0A 1X0RA 2CAQA 4NV5A 4IP1A 3TDGA 1YEPA 3L9SA 3SBCA 3L4NA 3JCML 4K6XA 4PQHA 1R7HA 1F3BA 5IMAA 3S9FA 3ERGA 5D93A 2J9HA 1FW1A 4RQRA 2H72A 4WEYA 4MDCA 1ACVA 3TKRA 3DGQA 2GLRA 3KMNA 3LWAA 1B9YC 5CP1A 3L0HA 2CVKA 5D73A 4X1UA 1SKWB 4MA9A 4IKHA 3BBYA 1URMA 2BMXA 2B1LA 1N8JA 1GLPA 4TXOA 1A8YA 3GKXA 1UA5A 3GX0A 2AUVA 5A4UA 5IMVA 2XPEA 3L78A 1Q4JA 4L5OA 1EP7A 5IMZA 2H0HA 2ON7A 2REMA 1O85A 2HLSA 2EIRA 2AV4A 3GL5A 2K18A 3LYPA 2NPBA 1GULA 3FR3A 3TRPA 1FB6A 4I8BA 4JZQA 5IQYA 13GSA 2XBIA 1RQMA 4ZL8A 5AIVA 4F0CA 1FB0A 2VUPA 4AJ6A 2B1KA 5B8AA 3DEXA 4Q5FA 3UIWA 5J9BA 1HD2A 3TKSC 3EVIA 3GKMA 3ZVJD 4GLTA 2PN8A 3VLNA 1OC9B 3UBLA 3TRQA 3GRXA 4I2UA 4KDXA 2PBJA 3IXRA 5J41A 4NWYA 2H73A 2LQOA 4POBA 2B3SA 2O85A 2AJQB 2WB9A 2FWHA 3UVHA 1BG5A 3LXTA 1OVNA 1XVQA 2KUCA 1TK5B 1I9DA 4XS4B 4EC0A 3Q19A 2PVOC 4BVXA 4K7NA 1MD4A 1FAAA 3HJMA 4TR3A 4FYUA 2GSSA 2FUG2 3MNGA 3FR9A 2P31A 3Q74A 1ZL9A 4YAVA 16GSA 1EV9A 1QXHA 4JEDA 3A5WA 4MF7A 1GSEA 2PUKC 1CQGA 2EC4A 3KTLA 3IA1A 2MBTA 1YF0A 3FZ9A 2CV4A 1AQXA 1BQ7A 3UAPA 1XWCA 1XVWA 3ZREA 2N5BA 4HZ4A 5D8IA 4HS1A 2G2QA 1J9BA 4WBRD 2B7JA 2GZPA 5FT3A 5ECHB 2KP1A 1U88A 1WOUA 2P5QA 1PX7A 4HQSA 1CQHA 3TJJA 1XW6A 4PUFC 3LFLA 2NTOA 1EWXA 1GL8A 5DQSA 5CRGA 4ISDA 4LL4B 2E0QA 2P0GA 2LSTA 4TRXA 3VWWA 3ME8A 5ECSA 4KUNA 3MAKA 3MDKA 4GF0A 3GKKA 8GSSA 1BJXA 2WULA 4MJBA 2DC5A 4ML1A 1XCCA 3HVSA 1ZCPA 1AXDA 2HRNA 4G9HA 3RPPA 4TXVA 1O6JA 4G10A 4MJCA 1M2BA 3DXBA 5ID2B 4YH2A 4GXZA 2VL2C 3FKFA 4ZBBA 1TKDB 5JCUA 1PN9A 1QFNA 5COHA 4MF5A 1ON4A 1PMTA 3RAZA 4WKWA 1XBSA 3ZLPA 3HXSA 3E9JB 3M1GA 3VURA 2FY6A 1QGVA 2V6KA 1U6TA 2FLSA 5DCGA 2DJ0A 1LU4A 2R4VA 2TRCP 3HYPA 3ED3A 4JR6A 4TXOB 2IJYA 4LA1A 4MLYA 3GX8A 1QMVA 1U3IA 1EZKA 3IAM2 2VLUA 1TRUA 4N11A 3FY7A 3HA9A 1Z7PA 4PX1A 1M9BA 2ZNMA 3FK8A 3BJ5A 2FA4A 3FZ5A 4ZB6A 3L9UA 2OE1A 1ZOFA 3BOAA 1A23A 3ZFBA 4MF6A 3F6DA 4XRDA 1TU7A 2E7PA 5KEJA 2LJRA 2R5GA 19GSA 1LJRA 2QKEA 5EVOA 5JWQB 1VF4A 1R5AA 2M80A 3K8NA 4FYBA 3ZMLA 2R2JA 5IM9A 1A0RP 2I9HA 4K1FA 5GAPD 2VCZA 4HJ2A 2ALBA 3TJGA 3ERFA 4MCUA 1MEKA 3D4TA 3TKSE 3MSZA 5B6NA 1S3DA 2HZFA 3RHBA 2RM6A 1WP0A 2OADA 3QOUA 1M2AA 2LS5A 5HR3A 2CQ9A 1GUKA 1G6YA 4JU5A 2X8HA 3I9V2 4HZ2A 4TR4A 3H1NA 2FD3A 2LJKA 2IIYA 1SK2A 1XWBA 3IC4A 1KTEA 1SU9A 3N5OA 4J56E 3GHAA 1LBKA 3EWLA 3O3TA 4K2DA 11GSA 4E8HA 5IMDA 1PA3A 3WGDA 5LD0A 4IQAA 4HOJA 3F63A 2NDOA 4WETA 1YKAA 3DVWA 14GSA 6GSSA 1T1VA 3H8QA 4MH3A 3PINA 3FHKA 2H6XA 5D9VA 3HKRA 4WXTA 1O81A 4V1Ap 2YN1A 5DDLA 3CYNA 1AUCA 1WWJA 5AN1A 4POKA 2KOKA 2I4AA 2LRCA 1SD8A 2PGTA 5DCHA 3FZAA 2HSYA 4F9ZA 5F0GA 4L5LA 2GSQA 2L57A 3KJYA 2CVDA 4K0NA 4OO5A 2VL3A 4Q5QA 1AQVA 4V2MA 1V58A 1F6MC 3VI7A 3PH9A 4PGTA 2GTUA 1GTAA 5F05A 4FYCA 2CVBA 1M2DA 2ZCTA 4KDUA 4O32A 2IFQA 1ERVA 2RUFA 3TRXA 5B6MA 1R26A 1Z3EA 1T00A 1TOFA 5DQYA 2CZ3A 1V57A 4MPFA 3IE3A 3ZZXA 2PVQA 3IBHA 3DVXA 4XS1A 3QAWA 3HVVA 2VCVA 1PKWA 1BAYA 2DJ2A 2JSZA 1GTIA 2WZ9A 5G5EA 3A2WA 3M3MA 3BD2A 4OMVA 5JWRB 1MDKA 2GQKA 3VPTA 2FHEA 2YP6A 2CX4A 1YEXA 2RIIA 1PX6A 1KNGA 4G19A 5CYYA 2ON5A 6GSWA 1EGOA 5ABRA 3HZ8A 3F4TA 3TOTA 6GSVA 3O76A 1U87A 5IPGA 3A2VA 1PD21 3VWUA 4ILFA 1VF1A 5J4UA 2VOCA 2IMKA 3DD3A 4MJAA 1KBNA 1YZXA 3L9VA 4HI7A 1UN2A 5ECLB 1Z7RA 5KN3A 1WMJA 3QFBC 1B48A 3CTGA 3TKPA 3TB2A 4IGJA 3C1SA 1E6BA 2BTOT 4KAEA 2X64A 3HY2A 4I97A 1MDIA 5D9WA 5INYA 4DVCA 1WIKA 2YPMA 5DVBA 3FR6A 3HCZA 2B5YA 1VF3A 1V9WA 3QD9A 4L0UA 4ZL7A 4JE1A 1MTCA 5IO0A 1B9XC 4AF2A 4QQ7A 1J0FA 3WT2A 3F0IA 2DLXA 5ID2A 5ECIB 3DIEA 2LTKA 3ZMKA 1SK1A 4KSMA 3APOA 2L4CA 5CO3A 1X9WB 4V1Ag 18GSA 1X5DA 3M8NA 1XW5A 4OCFA 3W6GA 1SK0A 4KB3A 3WGXA 2YOIA 2MMOA 2HZEA 2NBSA 4K7OA 5ECOB 1TRSA 1SJZA 2YV7A 4Q5NA 3KEBA 2H0IA 4HDEA 5CREA 3TKQA 2V41A 4TR1B 3ZIVA 3IK9A 5CRWA 1DE2A 4KA0A 2XC2A 4ZB8A 3KZQA 2VCWA 3DRNA 3CRUA 5ECNB 4TVEA 3RHCA 1GNEA 2IMFA 2OKAA 4XRAA 5IIZA 4EF0A 4ID0A 4TKYA 4V2LA 1EGRA 2F3MA 5H5QA 3F9UA 1JLWA 1K0OA 2IFQB 2HXKA 1W89A 1F2EA 1F37A 1FO5A 5HFKA 2C0FA 3GFKA 2LV3A 4H86A 3WGEA 3QR6A 2FWGA 4WR5A 4X43A 3DYRA 2P5RA 4EKZA 4EE0A 3UOMA 5GAND 1DBYA 3Q18A 4EDYA 1RK4A 3TJBA 1EP8A 1XOAA 3UBKA 3KH7A 4BWSA 2DMLA 1FVJA 3QAVA 4KE3A 1HNAA 3M9JA 3F4RA 3AY8A 3WT1A 3CBUA 1E2YA 5DJMA 2X8GA 3GYKA 4TN8A 3M9KA 4ZBAA 1ZMAA 2LRTA 5CRDA 5H5RA 2H75A 2GSTA 3IPZA 5J9CA 3ZL5A 1GSSA 1Y6EA 3ZRDA 1ST9A 1A0FA 2K8VA 3VK9A 3J7Yk 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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