2MMOA

Solution structure of the oxidised thioredoxin from plasmodium falciparum
Total Genus 25
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
25
sequence length
104
structure length
104
Chain Sequence
SVKIVTSQSEFDSIISQNELVIVDFFAEWCGPCKRIAPFYEECSKTYTKMVFIKVDVDEVSEVTEKENITSMPTFKVYKNGSSVDTLLGANDSALKQLIEKYAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Electron transport
source organism Plasmodium falciparum
publication title Solution Structure of Plasmodium falciparum Thioredoxin
rcsb
molecule keywords Thioredoxin
total genus 25
structure length 104
sequence length 104
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2mmoA00
2R6KA 1EP8A 1DBYA 3DYRA 3IBHA 3WT1A 2GSRA 4N11A 9GSSA 2H76A 3G7IA 3HJOA 3TUEA 1O7UA 1X5CA 5ECQB 3F63A 3H4KA 3US3A 3C1RA 4LMWA 5AGYA 4N10A 2H66A 2I4AA 3QAWA 3EMXA 4POMA 3QFAC 4BVXA 3KEBA 3CSIA 1SKRB 5HR1A 2ON7A 4MF6A 3P8WA 1X9WB 3QOUA 1BYEA 1QMVA 4KDXA 4RI7A 5HFKA 3QD9A 4MABA 1M2AA 1WPIA 4EDYA 3H1NA 2GZZA 4XCSA 4Q5RA 3DGQA 2GSTA 5ECKB 4XS6A 1F3BA 1SK2A 1XWBA 5FT3A 5IMZA 1K0AA 1VRSD 4H86A 5HR3A 3ZYWA 2LQQA 4NV2A 4YQUA 1WWJA 3F6FA 2H0GA 2OADA 1S3CA 1T4ZA 4XIHA 3A2VA 2LJAA 1TDIA 3FHKA 3G9BA 2J9HA 1THXA 5EY6A 5JWOB 4F2IA 1O73A 3OR5A 3M1GA 5DJLA 4BPYA 3D6IA 3M8NA 4TR0A 4KSOA 1QXHA 1GULA 3HVVA 2XC2A 1O6JA 4WBJA 1U6TA 1RW1A 3KH9A 4K8MA 3L9VA 2TRCP 4EC0A 1UA5A 3VI5A 4Q5NA 5ELAA 1XW5A 4P3YB 5H5SA 3KH7A 1EOHA 1SKSB 4PQHA 3N9JA 1PA3A 3VURA 1SJZA 3DIEA 5DALA 2C0GA 3ZFBA 4NPBA 1XVQA 2GLRA 5J41A 3EURA 4F82A 2GQKA 6GSSA 4V2NA 2R5GA 1RK4A 1XW6A 4Q5QA 3D22A 3KCMA 3LORA 1YKAA 5EL8A 2V2GA 3KGKA 5J5NA 4ISDA 1K0OA 1SJ6A 3Q19A 2HLSA 5CRWA 1TI1A 3QAVA 1EP7A 2DJ2A 1ZMAA 1OKTA 4L5LA 5DBQA 1ML6A 3APOA 1G7OA 3UAPA 1SD9A 5DDLA 1ERVA 3EVIA 5KN2A 1ABAA 3IR4A 3A2XA 1SL0B 2RUEA 1AQWA 4BWSA 4K0NA 2A2SA 2PU9C 1H4OA 1TKDB 5H5QA 3GL5A 3KM6A 2FUG2 3W6GA 4RQXA 2AAWA 2QC7A 2EIOA 2VCXA 4V2LA 1YEPA 3FY7A 2DMLA 2LSTA 2NBSA 4ZBAA 1E2YA 4HI7A 2IWTA 2V32A 2HE3A 1Z6NA 1BX9A 2C3QA 1F3AA 1S3DA 2XHFA 4E8HA 2H6XA 2RM6A 3F4TA 2GSQA 1IYHA 4LMVA 4POLA 1K0NA 5ID2A 3APQA 2CAIA 5G5EA 2H8LA 2F8AA 4KX4A 4CW9A 2VL9A 2YN1A 3TDGA 4PX1A 4AGSA 3MAKA 4PURA 2NDOA 3MSZA 1JHBA 3EWLA 2VCTA 4N30A 1QGVA 1THOA 2J23A 1SL1B 2IMDA 4JR6A 3CBUA 2YOIA 2CAQA 2CZ3A 4IQAA 3E3EA 3LYPA 3TOTA 4NV5A 4HU9A 1YJ6A 1GTAA 1ZL9A 2OE0A 2K18A 5F07A 4IKHA 5INYA 3IDVA 1V57A 1HNAA 3WGXA 4IN0A 5IQYA 1T00A 4FH8A 2I9HA 1U3AA 2KP2A 1AW9A 3M0FA 2VL3A 1GWCA 2OBKA 3QFBC 2X8GA 4ZBDA 1ERWA 1T4YA 3QCPA 2C0EA 3QMXA 4MCUA 7GSSA 2N5AA 2V6OA 1UVZA 3BJ5A 3HZ8A 2N5BA 3LJRA 4FIWA 2IMKA 4KB3A 5H5RA 2GZYA 2EIRA 1O85A 2VLUA 3P7XA 1WOUA 2IJYA 4MLYA 5ECHB 4ECJA 3L0HA 2F8FA 1XWAA 2PVQA 3DVXA 2LRCA 5D9TA 4AJ8A 4MDCA 5ID2B 2MZCA 2LJRA 1QFNA 1YF0A 1EEMA 3GRXA 2C80A 2HFDA 2X64A 2JACA 3CSHA 4I97A 4MF5A 2K6VA 5ECMB 2B5YA 5G2ZA 5ABRA 2JADA 1V58A 2PPTA 1ZGNA 4HUAA 4ILFA 3ZZXA 1QUWA 3VI7A 4MH3A 1YF1A 16GSA 1M9BA 2MBTA 2R3XA 3ZLPA 1SD8A 1ZZYA 1X5DA 5JCWA 1OC8A 3A2WA 4MH2A 2PUKC 4MJBA 4YAPA 3QAGA 3VPQA 3DMLA 2CVKA 1PSQA 2DIZA 3LWAA 5B6NA 3EU4A 4MP4A 4J2FA 3F3RA 1WRYA 1IYIA 2C1YA 1TRUA 1O8XA 2GZPA 3KTBA 2BJXA 4NAXA 1JLWA 2IL3A 4KA0A 3Q18A 3WYWA 5JWRB 2BTOT 1NHYA 1YDKA 4HQZA 1A8LA 3GH6A 3P2AA 3EU3A 4FO5A 1BQ7A 1ZYQB 4MK3A 2H72A 3PH9A 4G19A 1K0BA 2YCDA 2JL4A 3VK9A 4TKYA 2H1AA 2VO4A 5D9XA 3BD2A 3IPZA 5J3RA 4TR1A 2EC4A 3FZ4A 1V98A 2HT9A 1XCCA 5CRDA 5IM9A 1TJDA 1NHOA 3D5JA 3BCKA 1U88A 1YKCA 1G7EA 1MEKA 1KNGA 1XBSA 1DUGA 3HD5A 2M46A 3RHCA 1OYJA 1X9SB 2LTKA 1HD2A 2I1UA 1MD4A 1K3LA 4OMVA 4EVMA 1N8JA 1F37A 2LNTA 2X99A 4CDOA 2H0HA 3EE2A 2H75A 4J56E 3H8QA 1R5PA 5CNWA 3DVWA 5D8IA 4MZCA 2XPEA 2BMXA 4OCFA 1Q4JA 4ZBBA 1FVJA 1VGLA 4ECCA 3GX0A 1PKZA 3DKSA 1ZYEA 3HYPA 1G0TA 2AUVA 1GTUA 2E2MA 2VM2A 3DEXA 4GF0A 1M7TA 2B5XA 4K1FA 2YV9A 1EEJA 5IMFA 4WBRD 2NTOA 2VOCA 4ZB8A 4KCEA 2DIYA 3GKXA 4GTUA 2VD1A 2H6YA 2IMEA 3KJYA 1TU8A 4L0WA 4PXOA 2CA8A 2PGTA 4O5RA 3KIJA 2P0GA 4IELA 1M9AA 2O89A 5CREA 3F9UA 3DD3A 4MMMA 1Z7PA 1VF3A 2DJ3A 5A5KA 2C4JA 4YAVA 4LL4B 5A4UA 4LLRA 1TRWA 3IHQA 4KW6A 3DRNA 4TR1B 1O81A 4GQCA 4N0ZA 3KXOA 3D4TA 2V1MA 3KTLA 5AISA 4IW9A 4OD7A 2JSYA 5G1LA 4POKA 4IHUA 19GSA 5HFIA 3UOMA 1G6YA 3KMOA 1AC1A 2MYGA 1CQGA 1DE2A 2H30A 1EZKA 4IP6A 3ZVJD 5DQSA 5C00A 1OKDA 1XIYA 1FAAA 2HSHA 5CYYA 3FR6A 3HKRA 3I9V2 2LRNA 3FRCA 1ST9A 4EE0A 2H1BA 4MJAA 2L5OA 2QGVA 4IP1A 1ON4A 1E6BA 3CTGA 3KMNA 4F0BA 4XRDA 4KNDA 2V6KA 5ECRB 2FWHA 1WJKA 2RIIA 3TRPA 1GUKA 5F8BA 3GH9A 3RPNA 5B7CA 1Z7RA 4KAEA 1I5GA 2HSYA 3O3TA 1DE1A 3ERWA 1OE8A 3L9UA 1FO5A 5IMVA 5LD0A 2A2RA 1FOVA 2VCVA 4CHSA 1FG4A 4K7NA 5EVOA 5HQPA 3R2QA 2WCIA 5JCGA 3K8NA 1TK5B 2GT5A 3GKKA 13GSA 1GSEA 2FNOA 2JU5A 2F9SA 2V41A 1QQ2A 5EPFA 2C3NA 3C71A 2HRNA 3W8SA 2HNLA 4BVYA 8GSSA 1R7HA 2FA8A 1ZOFA 2CVDA 5IPHA 4K7OA 4ULXA 1PKWA 2WFCA 1H75A 2L6DA 3FKFA 2DSAA 3TKSA 4EKZA 1B9YC 4GQFA 5J4UA 2L6CA 1T3BA 1XOBA 1PX6A 2GS3A 3GYKA 4EO3A 3VWXA 3TRQA 2YWOA 4OCEA 2VCWA 2B1LA 3MDKA 2IIYA 5IO2A 1GSYA 2MMZA 1JZRA 4DSQA 3RAZA 3M9KA 3TCOA 5GAND 3QPMA 5ECIB 1OVNA 4PGTA 3TKSE 12GSA 2L59A 3WGDA 2DBCA 1LU4A 2H1DA 3GMFA 2REMA 2K9FA 4KE3A 3APSA 4YQVA 4K6XA 1TRVA 3UL3A 1TI3A 2NVLA 1FHEA 5IOXA 3ME7A 2LEGA 1B8XA 5DAKA 3LSZA 3HXSA 4ACSA 1XWCA 1EOGA 3D0ZA 1Z5YE 3ZRDA 1AQVA 3QR6A 2ZUPA 3E0UA 4XS1A 3VWUA 1SK0A 3IRAA 4L5OA 4DSRA 2VL2A 1R26A 5AN1A 3TJBA 2B7JA 4WETA 5KN0A 2WDUA 3TOUA 2B7KA 5AIXA 4NHZA 5IPGA 5JWQB 11GSA 3TB2A 3ZMKA 2I3YA 3HY2A 1AXDA 2AB6A 3KZQA 2IFQA 4IS0A 3HHVA 2KOKA 4PUFC 5G30A 2D2ZA 3GIXA 5FHIA 1MTCA 2X8HA 4WEYA 1HYUA 4X43A 5GAPD 2ZNMA 2AHEA 1WP0A 1G6WA 3NZNA 1Y25A 1GNEA 4TXVA 3WT2A 1MDKA 1ERUA 3TKRA 2P5RA 2R37A 3LG6A 1GL8A 4LL1B 3ZMLA 4MZWA 5LCZA 1TK8B 3KP8A 3VFIA 2ON5A 1X5EA 3CYNA 4EDZA 1VF2A 3V1WA 4MA9A 4MZBA 1FW1A 1PD21 3GURA 2QKEA 3UBKA 3EC3A 2HZEA 3ZVJA 1TRSA 1BJXA 2M80A 2IMFA 2WJUA 1EV9A 1PN9A 2C3TA 1SL2B 18GSA 1K0CA 3H93A 2H0IA 4EF0A 5F0GA 4BA7A 1K0DA 4WR5A 2I81A 3IK9A 1YY7A 5G1KA 4O32A 1V40A 3UVTA 3C8EA 4I6XA 3TJFA 4KH7A 5CAXA 5DAKB 2WS2A 3FZ9A 3UIWA 4EUYA 5IMCA 4OFTA 4NXIA 3GSSA 5FWGA 3WD6A 3HJPA 4AF2A 2E2GA 2RLIA 4MPFA 3L4NA 17GSA 2GSSA 2EIQA 4IQ1A 3ZITA 1KTEA 2C0DA 2AYTA 1OC3A 1PL1A 2FCHA 2H70A 4MJCA 2JZSA 1A0RP 1A0FA 2RM5A 2LS5A 4IJIA 1GSSA 3FK8A 2IFQB 3ZFLA 4O7HA 2CX3A 1ILOA 2R4VA 4QL9A 4RQRA 5DCHA 4OO4A 2MMAA 5KEJA 3M9JA 1B9XC 3C7MA 2DLXA 2CV4A 2PBJA 2DJ0A 4JEDA 2WZ9A 3U6VA 3U5RE 2WB9A 2CZ2A 1RQMA 1PRXA 1JFUA 1TK0B 4HDEA 2VD0A 4G2EA 3I69A 5E4WA 2P31A 3GFKA 2E0QA 2YJHA 1SYRA 2KP1A 1F9MA 4Q5FA 3HJMA 1U87A 3BBYA 2RUFA 2GTUA 2HZEB 2M72A 4IBPA 2HXKA 3ZL5A 2FY6A 4E8EA 1XZOA 3CRTA 1DSBA 3D21A 4JE1A 3IA1A 2FGXA 4TR3A 3LXTA 1SENA 1NW2A 1V9WA 5CP1A 2WRTA 2VLVA 2H6ZA 3W8JA 2GVPA 1K3OA 2ALBA 1SYXA 4EXJA 2AV4A 3HZ4A 1M2BA 1A23A 4G10A 1YQ1A 1TP9A 14GSA 1VF1A 4Z7XA 3VPTA 3IV4A 4XS4A 1PX7A 2FA4A 4TXOA 2VM1A 3E9JB 2GT6A 4IJ3A 3UEMA 2PMTA 4HJMA 3ZTLA 3EMPA 2LRTA 5ENUA 5E59A 3RBTA 1PQNA 2KHPA 5IMDA 1GRXA 5J9BA 4QQ7A 3H79A 4I5QA 3ERFA 4XTSA 5ECPB 4FYUA 4WKWA 1GLPA 2MMNA 4LA1A 3BCIA 4HZ2A 3FZAA 3O76A 4HQSA 4ECIA 4RI6A 1LJRA 3GA4A 4I2UA 4IVFA 1XWKA 3FW2A 3RPPA 3IC4A 3UJ1A 2PN8A 4ZILA 5D9WA 4ID0A 3GX8A 1A2LA 5DCGA 1UN2A 2LQOA 4BWQA 4GSTA 1GNWA 1I9DA 4F9ZA 3CTFA 6GSTA 1X0RA 1A2JA 4KDYA 2L4CA 4OFNA 3GNJA 4JR4A 3UMAA 4J57E 4TRXA 2TIRA 1N2AA 4NHWA 5ECNB 2H19A 3BOAA 1CQHA 4MPGA 1VF4A 1TU7A 4OO5A 5DJMA 1GLQA 2H74A 3LQ7A 4POBA 4F0CA 2X8CA 1KEBA 3L9SA 5HR2A 4JU5A 1Z3EA 1HNBA 4OWYA 5A4WA 4XS4B 3F6DA 3WGEA 1EWXA 4X0XA 3FR3A 2JZRA 4HZ4A 2HYXA 2FWEA 6GSYA 2ES7A 1JZOA 2LJKA 2LV3A 4IGJA 4TXOB 4F03A 3FR9A 2Z9SA 3ERGA 2CQ9A 3PGTA 4ZIJA 1AQXA 1GP1A 2GQMA 4I2TA 1M2DA 3PR8A 3EYTA 2F3MA 2L4QA 4WF5A 2OKAA 2B6MA 3LEFA 4ZL9A 2TRXA 3GSTA 5ECLB 2OA7A 1C72A 4KGIA 3VWVA 4AJ7A 3GKMA 1SK1A 2YWMA 2DMMA 3IAS2 2B5EA 1GSFA 4NWYA 2GDRA 4ML6A 5G5FA 1A24A 3ZREA 1B4PA 5CRHA 4GCIA 2C0FA 4GRFA 2G0FA 3ISOA 2GGTA 5F06A 1EV4A 5HFGA 3F4SA 1QK8A 1T7PB 4ZB6A 2LKUA 2FLSA 3J7Yb 2MBSA 1UC7A 1EGRA 1U3IA 1Q98A 3TKPA 3TKQA 5B6MA 2OJLA 4PUAA 4BL7A 4DSSA 5C04A 4V1Ag 4FYBA 2O7KA 3GKNA 2H73A 3IAM2 1XFLA 4ML1A 4JZQA 1JZWA 2WGRA 3F3QA 2AJQB 1GSQA 3GN3A 3AY8A 5JCUA 1V2AA 1T8EB 3F4RA 2YZHA 5DVBA 4DVCA 4YH2A 1WMJA 2R2JA 3HDCA 20GSA 3RDWA 3TJJA 1W4VA 3CXGA 3P90A 4GLTA 5J9CA 4K2DA 2YZUA 3DXBA 1Z6MA 2VCZA 2OBIA 2XBIA 4QL7A 3C73A 4L8EA 3C1SA 2WULA 1OE7A 5IOWA 2FHEA 4ZL7A 4FYCA 4KUNA 4D73A 2ZCTA 3Q74A 2IMIA 1M99A 3M3MA 1NM3A 1LBKA 1J0FA 1AUCA 4TOPA 3FZ5A 3GTUA 1PGTA 4JRRA 2JZTA 2KUCA 1J9BA 4DEJA 1XVWA 1K0MA 2L57A 5ECOB 1A2MA 1K3YA 4PQIA 2K8VA 3TKSC 4XHMA 1URMA 1YZXA 1GTIA 3I6AA 3GHAA 1EGOA 4V2MA 2HRFA 2QSIA 3TJGA 4KDUA 4N0VA 2H1GA 2OACA 4GSNA 1HQOA 4AJ6A 3L78A 5F05A 3LXZA 3GUSA 1ACVA 4DSSB 1AIUA 3S9FA 1ERTA 1J08A 3RHBA 3HVXA 5DALB 2O85A 3VLNA 1X9MB 4ZB9A 3G7JA 2VIMA 3IK7A 1HNCA 3TGZA 3KD0A 3HVSA 1TTZA 4KCAA 2G2QA 5GSSA 2VUPA 4TW5A 1GTBA 3UBLA 3EINA 1KBNA 2L5LA 4HEA2 2HI7A 6GSXA 2VLTA 1FVKA 4EL1A 2H01A 4K9ZA 2YNXA 1XWGA 5D9VA 4XRAA 3UARA 5DQYA 4HOJA 1R4WA 1F2EA 6GSUA 5IIZA 2FWGA 5IMAA 4GWRA 2N5FA 2OE1A 2HZFA 5CRGA 2LUSA 1BEDA 3I43A 4WF4A 5D93A 4YQMA 4K7IA 3NIVA 4D73B 2VL2C 1OC9A 5B8BA 5ELGA 1GSDA 1MDIA 2NPBA 1BG5A 4WXTA 1A8YA 3IXRA 3UVHA 4KSMA 3MNGA 2P5QA 2IN3A 1R5AA 2DC5A 3GTUB 3A3TA 4RUVA 3HA9A 3D4MA 1FB0A 1USBA 4MF7A 2LNSA 2IPAA 4HU7A 3F8UA 3G7YA 3GL3A 2CX4A 2E7PA 1S3AA 2C8UA 3DWVA 1B4QA 3VWWA 3CRUA 4HJ2A 2JSZA 3PINA 1FB6A 10GSA 3ME8A 4WR4A 5GSTA 1JZDA 4GXZA 3ZIVA 4HS1A 6GSWA 2K8SA 2DJ1A 3KP9A 1YEXA 2VAFA 3J7Yk 3FYGA 1XPVA 2KLXA 4ZXGA 6GSVA 4G9HA 3SWLA 2B1KA 2FWFA 1SU9A 1SJIA 3O6TA 1Y6EA 2A4VA 2CVBA 4JBBA 1GUMA 2YPMA 4PNGA 5D96A 4I8BA 3MWHA 1F6MC 1XW9A 4NMUA 2YWNA 5COHA 4ECBA 5G31A 1TOFA 4ZL8A 4V1Ap 1ZCPA 3F0IA 2YP6A 3Q6OA 2GQLA 4MJEA 1GUHA 2DJJA 5HR0A 1SKWB 1MD3A 3LFLA 2PERA 3ED3A 4TN8A 4PQ1A 1MDJA 2O87A 3ZIJA 2B3SA 3GV1A 1Z9HA 3IOSA 2H71A 1BAYA 5KN1A 3HCZA 1JLVA 1M0UA 2PWJA 2YWIA 5CO3A 1OC9B 2PVOC 1TXXA 4GSSA 1TW9A 2YANA 22GSA 3N5OA 4PNFA 2O8VB 3CSJA 3A5WA 5A4VA 5L71A 1GH2A 4OFMA 3LYKA 2VCQA 1WE0A 3NOFA 2XBQA 5D73A 2FD3A 4L0UA 2DJKA 3SBCA 3QDNA 1OAZA 1T1VA 5ECSA 5IO0A 1WIKA 1W89A 1XOAA 3CMIA 2XPDA 4X1UA 2MMOA 4TVEA 1AAZA 5GZZB 2YJ7A 5AIVA 1GSUA 2F51A 3TJKA 3JCML 1PL2A 2CT6A 2YV7A 1NSWA 1B48A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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