1QUWA

Solution structure of the thioredoxin from bacillus acidocaldarius
Total Genus 20
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
20
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
ATMTLTDANFQQAIQGDKPVLVDFWAAWCGPCRMMAPVLEEFAEAHADKVTVAKLNVDENPETTSQFGIMSIPTLILFKGGRPVKQLIGYQPKEQLEAQLADVLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title NMR solution structure of a novel thioredoxin from Bacillus acidocaldarius possible determinants of protein stability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Electron transport
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
molecule keywords THIOREDOXIN
total genus 20
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1quwA00
5GAND 1XOBA 2KOKA 3UIWA 1OVNA 1R4WA 1R7HA 4YQVA 2A2SA 2CZ2A 2A2RA 4O92A 5DVBA 5B6NA 1PGTA 3ED3A 1B4PA 5IMDA 3L9UA 2LNTA 1ACVA 2LRTA 1K0MA 4RQRA 1UC7A 3FRCA 1VRSD 1GH2A 5A4VA 4MPFA 5ECKB 3I69A 4I2UA 5B7CA 4KE3A 1MD3A 4G9HA 5DDLA 5DCHA 3WT1A 1TK0B 4O32A 1XWGA 4ISDA 4K0GA 1M99A 5FHIA 2R3XA 2QC7A 2VL9A 4V2LA 1B8XA 1XCCA 3GH6A 2VO4A 3KGKA 5IM9A 1M2BA 5DALB 1K0DA 3KCMA 2HXKA 4TXOA 2C1YA 3TJFA 4POMA 5IO2A 1SKWB 3FW2A 3QDNA 4MJBA 4MABA 4D73A 2VD0A 1O85A 1VF4A 1WOUA 2LJRA 3BCIA 2JACA 1YEPA 2V32A 4L8EA 1Z7RA 4LL4B 4KH7A 1EP7A 1MDIA 3QMXA 3GL5A 2ZNMA 4X1UA 1OC8A 3IC4A 3ZIVA 2YCDA 5CYYA 3APSA 2EIRA 4Z7XA 3IAM2 3F3RA 3HD5A 1TJDA 2PWJA 1VF3A 2LNSA 1PL2A 2AUVA 1O8WA 2AAWA 5DJLA 3F8UA 3LYPA 2IFQB 4YQMA 4EXJA 4TR3A 1T4ZA 4GSTA 3TOTA 3UEMA 2B7JA 4NV5A 1TI1A 4EKZA 3O76A 5D96A 1AW9A 4GRFA 5HQPA 4KDXA 4JU5A 2RM5A 4XS4A 5D9TA 3QD9A 4G19A 3PH9A 1M2DA 1T7PB 2H1AA 3ERGA 3VWXA 4K7NA 2BJXA 1PL1A 3TKQA 3ZTLA 1KEBA 1K3YA 3CSIA 2X8GA 3VURA 3US3A 3TJGA 1M9AA 3UVTA 2YZUA 1ZL9A 4K6XA 4WR4A 1V2AA 4GQCA 1HNCA 3D6IA 11GSA 4KA0A 2GSSA 1JFUA 1GUHA 4ZB6A 2L4QA 2MMNA 2WCIA 3LFLA 4ZL9A 4PUFC 3I9V2 5CRHA 3VLNA 1T1VA 3APOA 1XW5A 2HRFA 2LTKA 4ZL8A 1LBKA 3IOSA 4PQIA 5GSTA 3F6DA 3RHBA 3EURA 3TB2A 2DIZA 1OKDA 5ABRA 5LCZA 1QFNA 2V1MA 2WULA 2GZYA 2P5RA 3E0UA 5J9CA 1A2MA 4P3YB 2AHEA 3LSZA 1ML6A 2VOCA 1S3CA 1EWXA 1XBSA 1BAYA 2OKAA 1NSWA 3LXTA 4N11A 3FK8A 4Q5QA 2KUCA 4MH2A 3TRXA 5F07A 2VAFA 1CQGA 2CAIA 4I97A 3M9KA 2L6DA 8GSSA 2YN1A 1BYEA 2VUPA 3ISOA 2GSQA 1O7UA 4F82A 3GL3A 3MWHA 2L6CA 1K0AA 4ZBBA 3A2VA 2L59A 2G2QA 4XS4B 1G7OA 4KW6A 3WD6A 2H8LA 3GUSA 3QAVA 1PD21 5F05A 2ALBA 4X0XA 1ZYQB 5ID2A 1PMTA 2G0FA 5DJMA 3TKSA 5F0GA 4EDZA 4F9ZA 3LG6A 5ECPB 5DBQA 1GSQA 4GF0A 3F4TA 2MBSA 1YY7A 3D4TA 4IP6A 2X64A 4NV2A 4OO5A 5B6MA 1AAZA 1HYUA 4AGSA 5ECNB 1BX9A 2YANA 3M0FA 4L0WA 5DAKB 4J56E 2VCVA 2H6YA 2IN3A 3DVXA 4MF6A 1UN2A 3VPTA 1EEMA 2F8FA 4TR1B 2IPAA 5EL8A 3P2AA 3TOUA 3PR8A 1GNWA 4TR0A 4X43A 5EVOA 1SJZA 4HZ4A 3RHCA 3P8WA 5D8IA 1GSDA 3MDKA 3IA1A 4ZB9A 2K8SA 3VK9A 1FAAA 4XTSA 3VI7A 1QGVA 2MBTA 1J08A 2DJKA 2F51A 1USBA 3LXZA 1JZWA 1TKDB 3TCOA 2GVPA 4MH3A 1RK4A 2I3YA 3GX8A 4N0ZA 4NXIA 3IDVA 4ILFA 4V2NA 4LL1B 4ZBAA 4BVYA 1DE1A 1S3AA 3GRXA 5IMVA 1GLQA 1JHBA 1XWAA 1PRXA 2V41A 5J41A 1AC1A 4KGIA 4AJ8A 2EIQA 2YWIA 2C80A 6GSWA 2C0DA 2B1LA 3UBKA 5HFIA 2WZ9A 6GSUA 4TVEA 3MAKA 2HFDA 4GWRA 1YF1A 5KEJA 1SJIA 3QFBC 3GKXA 5B8BA 3KP8A 1SU9A 4HJMA 1Q4JA 5LD0A 4Q5NA 1X5DA 2KHPA 3KMNA 1U87A 1OKTA 3JCML 1PN9A 2GQMA 2LS5A 2B5EA 2H01A 3C8EA 1ABAA 3Q6OA 2HT9A 4L5LA 3L4NA 1SKSB 1T00A 5JCUA 5IMFA 3EMPA 2HLSA 4IQ1A 1SKRB 1X5CA 4ULXA 4EF0A 2CA8A 2M46A 1XWCA 2P0GA 4PXOA 3M3MA 2K8VA 2DSAA 1XVQA 3ERFA 4JZQA 4N10A 1ZZYA 1RW1A 18GSA 2WRTA 4WR5A 4NHWA 2LSTA 3PINA 2JADA 1K3OA 2JU5A 4HUAA 5AISA 3UBLA 2HZFA 4QQ7A 3IK9A 1IYIA 1Z6NA 2GDRA 2ON7A 2X8HA 4KDYA 4KNDA 4K8MA 4IGJA 1G7EA 4F0BA 2L5LA 3S9FA 2TRXA 4WXTA 3GMFA 1K0OA 3E3EA 1EP8A 3HY2A 16GSA 2IMFA 5ELGA 2QSIA 4XS1A 2HSYA 4TW5A 4MF7A 2QGVA 3GH9A 5KN0A 3ME7A 4CW9A 2HZEA 4MDCA 1U3AA 5ELAA 3ZLPA 4JEDA 4HZ2A 4YAVA 2GT5A 3IE3A 5HR0A 4HS1A 1WP0A 4FYBA 2R4VA 5G1LA 3OR5A 1EV9A 5HR1A 2H1DA 1VGLA 1THXA 2FA4A 1SYXA 4EDYA 4ZBDA 3GNJA 5IPHA 2NDOA 4HEA2 4DVCA 3C7MA 3KZQA 3LJRA 2E2MA 3FEUA 1ZCPA 3IPZA 4E8HA 1SK1A 1VF2A 2VLTA 1AXDA 1ZGNA 3C73A 3DEXA 2HYXA 2TRCP 4XCSA 3GV1A 4JR4A 2IL3A 3DWVA 1T4YA 1SENA 3SBCA 1TRUA 4WF5A 2H0HA 2NBSA 4PURA 1GSFA 1J0FA 3R2QA 5G31A 4FYCA 1DUGA 2BMXA 4K1FA 3TGZA 1EOGA 3GYKA 4O7HA 2DBCA 4POKA 1GTAA 1V9WA 1RQMA 3GFKA 1TXXA 4AF2A 1UA5A 4OD7A 2H70A 1F9MA 2CQ9A 3UAPA 3M8NA 2FWEA 2LV3A 2MZCA 1R5PA 3GSTA 4V2MA 3G7JA 5AGYA 2VL2C 1SL2B 1WPIA 4K7OA 4OO4A 2YPMA 3GKMA 3L78A 1EV4A 4XHMA 5KN3A 2HE3A 2H1BA 1A2JA 3F3QA 3WGDA 4QL7A 2E0QA 4WF4A 2OBKA 4GXZA 2LJKA 3EU4A 2GLRA 1WRYA 3DKSA 1OC9B 2ZCTA 6GSXA 2RLIA 3F9UA 5D9VA 3I43A 2HZEB 4TN8A 1YEXA 2JZTA 4MZBA 2REMA 1K3LA 1B4QA 1G6WA 1UVZA 4JE1A 2JSYA 2EIOA 3LQ7A 1QMVA 2O87A 2OACA 1Z3EA 4IP1A 1V40A 2DJ3A 3TUEA 4ACSA 2WGRA 3A3TA 3GKKA 1H75A 1BQ7A 2ZUPA 2CAQA 4IW9A 3UJ1A 2D2ZA 2CVBA 2VLUA 2I4AA 1X9MB 2XC2A 2AYTA 5INYA 2LRNA 4XS6A 5HFGA 2C3QA 6GSVA 3DGQA 2PGTA 5AIXA 4HOJA 2H30A 1OE7A 1TU7A 3ZYWA 2LKUA 1GTUA 2H72A 3FR3A 2C0EA 5H5RA 3DD3A 3NZNA 1X0RA 3ERWA 1ILOA 3Q74A 1I5GA 3VI5A 4DSSA 3KP9A 3FYGA 3C71A 1SYRA 2E7PA 2NVLA 4TXOB 1QXHA 4KCAA 4ECCA 2B5XA 3UVHA 2YJHA 2JZSA 4D73B 1EEJA 3EMXA 4I8BA 4IQAA 3CYNA 5IO0A 2H76A 3HJMA 3KXOA 2IJYA 4CHSA 4ECBA 2IIYA 3K8NA 5H5SA 2RM6A 4RI7A 2PMTA 2A4VA 3FY7A 3RBTA 4OCFA 1GNEA 2FNOA 2DMMA 2NTOA 4AJ6A 4J2FA 2VCXA 2PPTA 1M2AA 3ZFLA 3GURA 3QCPA 2L4CA 1EZKA 3RAZA 1FVKA 1A24A 2M80A 2MMZA 4PUAA 2WB9A 1O81A 3NOFA 4N30A 1JLWA 2B7KA 1GP1A 1NHOA 1W4VA 5D73A 3U6VA 3UARA 3EVIA 5HR3A 2FCHA 4HDEA 4Q5FA 2FY6A 3ZL5A 2B5YA 1THOA 12GSA 2JSZA 1T8EB 2LQQA 3KH9A 2V6OA 2CZ3A 3F4SA 1AQWA 2WFCA 4ZXGA 4K7IA 1WWJA 3D22A 4ID0A 3CMIA 5F8BA 2MMOA 3KM6A 2IMKA 3TRQA 3QR6A 1Z7PA 2R37A 4G2EA 1PKWA 3EU3A 1A8YA 3BOAA 5HR2A 3HVVA 3RDWA 3HCZA 1ZMAA 2MYGA 3LWAA 4DSSB 1XFLA 4PNGA 4HJ2A 2DJJA 5ECIB 4CDOA 1A23A 4EE0A 5KN2A 3KD0A 1A0RP 3FR6A 1V98A 1XOAA 3TJKA 5ECOB 1TRWA 3DIEA 3KIJA 5A4UA 2N5AA 1XW9A 3N9JA 2L5OA 3KMOA 1JLVA 4RI6A 5IOXA 4HQZA 4IHUA 4I6XA 4EUYA 4FIWA 3L0HA 4OWYA 13GSA 3N5OA 3EC3A 5J9BA 2TIRA 4PGTA 5COHA 1QK8A 3A2XA 5FT3A 5CAXA 2H0GA 3M9JA 3QPMA 1O73A 2YJ7A 3FR9A 3VPQA 5G5FA 3IAS2 3M1GA 1YDKA 3HHVA 5C04A 3G7IA 4KUNA 5AN1A 9GSSA 4KDUA 5ECMB 4EL1A 4OMVA 3CSJA 2O85A 1F6MC 4OCEA 3BD2A 4QL9A 3VWVA 4F03A 2J23A 1QQ2A 5IQYA 5IOWA 2VM2A 1GSYA 1YZXA 2AV4A 4KB3A 2O7KA 3DMLA 1OAZA 4MCUA 1J9BA 1YF0A 2VCTA 3H4KA 4HU7A 4L0UA 2VIMA 3GTUA 2AB6A 1SJ6A 4Q5RA 3AY8A 14GSA 1NM3A 2NPBA 1XWKA 5ID2B 5DQSA 3TJBA 3HVSA 1F3BA 1GSEA 3TKPA 1F3AA 4KSMA 4ZIJA 3HA9A 2LJAA 5CREA 2ES7A 2V6KA 1WIKA 1FVJA 1MDKA 3RPNA 4POBA 2FWHA 4DSQA 2YV9A 5D93A 1ERTA 2B3SA 2PN8A 4WETA 3FZ5A 5JCWA 2YP6A 2CX4A 1EOHA 4L5OA 2RIIA 2OE1A 4TRXA 2PVOC 3KH7A 4IELA 1N8JA 2VLVA 2XPDA 2R5GA 4ML6A 2LQOA 1M7TA 4N0VA 3F0IA 1BJXA 2OADA 1YQ1A 3O3TA 4JRRA 1LU4A 3CTFA 3O6TA 2O89A 4YQUA 2KP2A 2AJQB 2C8UA 3GKNA 4GCIA 4YAPA 2F3MA 1VF1A 5A4WA 2FLSA 4TOPA 1N2AA 2GGTA 5GZZB 4JBBA 10GSA 1SD9A 1TI3A 4KCEA 2BTOT 1XWBA 2J9HA 4GQFA 4BPYA 1B9YC 5J3RA 2OA7A 3F63A 2GS3A 3LEFA 4FO5A 3TDGA 2YOIA 2RUFA 1YKAA 1B48A 3L9SA 4ML1A 2N5FA 4MZCA 2H19A 1X5EA 1AQXA 3GTUB 5H5QA 3CBUA 4GTUA 2HSHA 4IBPA 1U6TA 3IV4A 1DSBA 5ECHB 3Q18A 3TJJA 1WE0A 2IMEA 2VCZA 1KBNA 5E59A 1HD2A 2IFQA 4HQSA 1AQVA 2X8CA 4PX1A 4WKWA 4MZWA 1FHEA 5E4WA 2H75A 1H4OA 4K0NA 2H71A 4DSRA 1C72A 2HRNA 3TKSE 2OJLA 3VWUA 2E2GA 3HDCA 2GSTA 1TDIA 1XXUA 3BBYA 2MMAA 1NW2A 1Z5YE 1FO5A 5DQYA 2FD3A 1HNBA 4MA9A 2WS2A 4FYUA 6GSSA 2FUG2 5KN1A 2DC5A 4WBRD 4GSNA 1M0UA 4MMMA 2R2JA 2YV7A 2O8VB 5LNKe 1XW6A 4IJ3A 3D5JA 3LGCA 2VD1A 4F0CA 2KLXA 3L9VA 3TKSC 3DRNA 1Z6MA 3APQA 2X99A 3CRUA 4MP4A 4XRDA 1JZOA 5CP1A 2PBJA 2VL3A 4RQXA 2C3TA 1ON4A 3C1RA 2H66A 2Z9SA 1URMA 3D21A 1I9DA 1ERVA 1K0NA 3GA4A 1GTIA 4V1Ap 3VWWA 1A8LA 2KP1A 19GSA 1IYHA 3DVWA 5CRDA 5HFKA 3GIXA 2CVDA 5D9XA 4MJEA 3ZREA 5ENUA 5A5KA 1PA3A 3KEBA 3BCKA 4MK3A 2PUKC 1A2LA 4K9ZA 3UL3A 6GSYA 1F37A 4OFTA 4IN0A 1MEKA 2C4JA 2GQLA 2F9SA 4F2IA 5EY6A 3HXSA 5GAPD 2FGXA 2JL4A 2DJ1A 3IK7A 1SL0B 4BA7A 5ECQB 1BEDA 2OE0A 1FB0A 3CRTA 5IMAA 1NHYA 3HKRA 4PNFA 2GT6A 2YWOA 2P5QA 4KAEA 1GLPA 2F8AA 3IXRA 3P90A 5ECRB 1KNGA 2I81A 1HNAA 3WGEA 1A0FA 1BG5A 4IKHA 3ZVJA 2DLXA 3A2WA 4POLA 2PU9C 1O8XA 3DYRA 1X9WB 3ZMLA 3FKFA 4ZILA 2CV4A 2XBIA 6GSTA 4K2DA 5G30A 5CNWA 1SL1B 2GZZA 1JZDA 4J57E 3MSZA 1GUKA 2B1KA 4XIHA 4MPGA 5DAKA 3ZZXA 2OE3A 3CTGA 1PSQA 1ERWA 22GSA 2IMIA 3W8JA 2R6KA 1DBYA 4LA1A 1CQHA 2LRCA 3EWLA 1SK0A 4JR6A 1OE8A 3W8SA 4TR1A 5F06A 2YWMA 3MNGA 1EGOA 7GSSA 4NHZA 1GSUA 5G2ZA 1PX7A 1XVWA 4KSOA 2CVKA 3ZMKA 3QOUA 3KTBA 3ZIJA 1TP9A 4MLYA 5AIVA 4I2TA 1OC3A 4RUVA 3P7XA 4WEYA 2OBIA 5FWGA 1GRXA 5IMZA 1FB6A 4MF5A 2V2GA 3GSSA 1OYJA 1GWCA 4NPBA 1GULA 1TU8A 2FHEA 3EYTA 4TR4A 3G9BA 3HJOA 1TOFA 5GSSA 1E6BA 4BWSA 2PVQA 4LLRA 1TK5B 2CT6A 4KX4A 3WYWA 1HQOA 1T3BA 5J5NA 3QAWA 5IMCA 1W89A 1TK8B 1O6JA 3IHQA 3FZ9A 4FH8A 2L57A 1FG4A 5EPFA 1XZOA 4NMUA 1TTZA 2LEGA 2H6ZA 2GZPA 2VL2A 3DXBA 1G6YA 3LORA 1LJRA 1V57A 2C3NA 4G10A 4MJAA 2ON5A 3J7Yb 3WT2A 5J4UA 4EO3A 4ECIA 2B6MA 5C00A 4WBJA 3UOMA 1FOVA 1Y25A 2IWTA 1PKZA 2FWGA 3EE2A 3W6GA 3H1NA 3ZITA 5IPGA 2DJ2A 4TKYA 4V1Ag 2N5BA 4DEJA 1XIYA 2VCQA 5G5EA 3GX0A 2GTUA 1G0TA 2H6XA 1QUWA 5IIZA 3D0ZA 3HZ8A 1F2EA 3CXGA 2WDUA 5B8AA 3F6FA 5JWRB 1MDJA 4LMVA 2DJ0A 1EGRA 3RPPA 3U5RE 4ZB8A 4BVXA 2K6VA 3BJ5A 2XHFA 2C0GA 1Z9HA 4LMWA 1ERUA 1ST9A 1XPVA 3VFIA 4BL7A 3IRAA 2I1UA 3NIVA 3A5WA 2M72A 1B9XC 4O5RA 4EC0A 3F4RA 1YKCA 4E8EA 2YWNA 2FA8A 2PERA 1K0CA 2C0FA 5G1KA 4HI7A 4IJIA 3EINA 3ME8A 2VCWA 3G7YA 1E2YA 2XPEA 1GL8A 2FWFA 4GLTA 1AIUA 2HI7A 3GN3A 3PGTA 4IS0A 5D9WA 1PQNA 1X9SB 3SWLA 3H8QA 3FZ4A 3HZ4A 1SK2A 2DIYA 1AUCA 3I6AA 1R5AA 3E9JB 4PQ1A 1FW1A 1U3IA 3HYPA 4BWQA 2RUEA 3KJYA 2YNXA 2H0IA 5L71A 5JWOB 1JZRA 1DE2A 4I5QA 1SD8A 3FZAA 3J7Yk 4ECJA 2K9FA 3HVXA 5ECSA 1TRVA 3ZRDA 1GUMA 3ZFBA 2GSRA 2K18A 3IR4A 2EC4A 1TW9A 1U88A 4TXVA 3D4MA 3QFAC 1GSSA 3Q19A 3HJPA 1YJ6A 2IMDA 17GSA 4XRAA 1R26A 1MD4A 2LUSA 5DALA 3UMAA 3LYKA 2JZRA 4MJCA 2I9HA 3TRPA 3H79A 2VM1A 5DCGA 2DMLA 1WMJA 2P31A 1M9BA 5CO3A 2YZHA 5JCGA 4H86A 2QKEA 4NAXA 3WGXA 3FHKA 4PQHA 5CRWA 1GTBA 1ZOFA 1MTCA 5CRGA 1S3DA 1PX6A 3GHAA 3CSHA 4ZL7A 4NWYA 1Y6EA 4IVFA 4OFNA 4AJ7A 2CX3A 3KTLA 3TKRA 3ZVJD 4OFMA 5ECLB 3QAGA 3V1WA 4YH2A 2WJUA 1OC9A 3H93A 3C1SA 1K0BA 4GSSA 1ZYEA 2HNLA 2H1GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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