4LL1B

The structure of the trx and txnip complex
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPAKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structural basis for the negative regulation of thioredoxin by thioredoxin-interacting protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-interacting protein
molecule tags Antitumor protein/protein binding
source organism Homo sapiens
total genus 30
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ll1B00
4HI7A 1FG4A 1EOGA 3G7IA 2VO4A 5B8BA 1V57A 5CRDA 4BVYA 3KJYA 2H0IA 4MH3A 2X8HA 3P8WA 2RIIA 4HJ2A 4GSTA 1SKSB 3UVTA 3HXSA 4IBPA 4KGIA 3UBKA 2R3XA 1SJZA 5ECPB 4NPBA 1Y25A 1YDKA 5CAXA 1XWGA 5DALB 5ID2A 2VL9A 3FR9A 5AIVA 3NOFA 3BCIA 3CYNA 3EINA 1O73A 5DBQA 2FGXA 3EVIA 4MF5A 4CDOA 2PVQA 4FYUA 4OO5A 4HZ4A 4XS1A 4N0ZA 3TB2A 4YQUA 16GSA 4N11A 3GKMA 4G19A 3MAKA 3GSSA 2H73A 4HOJA 2VM1A 4L5LA 4ZL8A 1GUHA 1ZCPA 3F6DA 3GURA 3GUSA 5CNWA 2X8GA 1USBA 2PWJA 3HJOA 2KOKA 3I43A 2YPMA 2MYGA 3O3TA 4IJ3A 1TI1A 1T8EB 5J9CA 1F37A 5J5NA 2ON7A 3DIEA 2DLXA 3UIWA 3CSJA 1ZYQB 2CAIA 2XBIA 2RUFA 4OCEA 2WCIA 4EKZA 1GUMA 1N8JA 1DUGA 2RM5A 4MJBA 4NV2A 1GULA 2C3QA 3F3RA 2YWNA 3ZTLA 5HFGA 5DJLA 1SKWB 2HT9A 3FZ9A 1THOA 3QFAC 2LJKA 1GRXA 1PKZA 3IR4A 5IM9A 4AJ6A 4AGSA 3VPQA 2AYTA 1GNEA 3QOUA 2DIYA 3VI7A 5IO2A 4TXOA 2L4CA 2HZEA 1ZGNA 4HS1A 3VFIA 2EIRA 2OE1A 5L71A 2D2ZA 3RPNA 5E4WA 1MDIA 2YWMA 3KEBA 1RW1A 1XIYA 3GKNA 1ERVA 2GSQA 3HJMA 2NPBA 3TJGA 5CRGA 1F3BA 3TOUA 4JU5A 4XS4A 4MZCA 3TKSC 1Z3EA 3QCPA 2O8VB 1O8WA 3LFLA 4O7HA 3WT2A 3I6AA 1GWCA 3M3MA 2LRCA 2K8SA 4L8EA 2H71A 4D73A 1AIUA 2LEGA 2N5BA 3APSA 3P7XA 3CXGA 3S9FA 5DCGA 2OE3A 4HQSA 5KN3A 2C0GA 4I8BA 5A4VA 5E59A 2C0EA 2B7JA 1SENA 4PNGA 1B9XC 4ZBDA 4V1Ap 1PGTA 5IMDA 4I6XA 2WJUA 5D93A 4FH8A 1OE8A 5IMFA 1GUKA 1WWJA 1E2YA 3ME7A 2HRNA 3UEMA 4GCIA 3HCZA 3UMAA 1TK0B 2YV9A 2BTOT 3ME8A 2L5OA 3ERWA 4ECBA 4KW6A 1EEJA 4F9ZA 5HR3A 2OBIA 3RDWA 1GTAA 3R2QA 3QAGA 3ERGA 2AJQB 1V9WA 4G2EA 1ZL9A 4JBBA 1T4YA 1BX9A 4TR3A 3HZ4A 2WRTA 4JEDA 2KLXA 4L0UA 3FK8A 5G1LA 3D4MA 2IPAA 1ERWA 4EDYA 4PGTA 4IP6A 4IJIA 2LS5A 1YF0A 13GSA 4FIWA 3L9VA 2FWHA 2H75A 3JCML 3L78A 4F0CA 2REMA 5CREA 1SYRA 6GSVA 2QSIA 1BAYA 1WOUA 2WB9A 4IVFA 1B9YC 6GSYA 1KEBA 4N0VA 1HYUA 1X0RA 4HEA2 4CW9A 2GTUA 2B5EA 1XOBA 3CSIA 2F8FA 1QFNA 2PERA 3EURA 4FYBA 2GLRA 1A2LA 4OWYA 3TDGA 2H01A 4K1FA 1OC9A 4HU7A 4L0WA 4TKYA 1YY7A 1FO5A 3H4KA 1MDJA 3OR5A 4PUFC 1VGLA 2LUSA 5J4UA 1GTBA 3GX0A 4RQRA 5HQPA 2GSTA 1OC3A 4Q5FA 3TRPA 1R7HA 1K0CA 4XRAA 1T1VA 1SK2A 2GS3A 3D22A 1Q98A 4NAXA 3UOMA 5A4WA 3DRNA 2L5LA 4NWYA 4WKWA 4EL1A 4YAPA 3C73A 4JE1A 5ECHB 2FWEA 3F4SA 3N5OA 3EU4A 3GRXA 2BJXA 2L6CA 4K0NA 4MH2A 3Q6OA 2VIMA 1V2AA 5DQYA 1A0FA 1ZOFA 4I5QA 1XPVA 3GIXA 3A2WA 1J08A 1GNWA 3CMIA 4I97A 5JWRB 2IJYA 2TRXA 5B8AA 4I2UA 1V58A 1XOAA 1LU4A 2HSHA 4LA1A 1K3OA 3WD6A 2L6DA 4OFTA 2E0QA 3HVSA 1M2DA 2CVBA 1Z5YE 1VF1A 5IPGA 2YWOA 5IMZA 2LJAA 1YKAA 5LCZA 1FAAA 2FA4A 3L4NA 3F6FA 4K7OA 5D9XA 3IHQA 1WPIA 1PA3A 1SL2B 1SK1A 3KZQA 3TOTA 1EWXA 4DSQA 4PQHA 4ZL7A 2YP6A 3I69A 5IIZA 1PQNA 4OO4A 4WR5A 2I1UA 3HDCA 1OKDA 2RUEA 3PINA 2JZRA 5JWQB 4MLYA 1NM3A 3VWXA 3PH9A 2H8LA 4G9HA 4KNDA 2EC4A 1JLWA 1R4WA 3KMOA 3M9JA 1U3IA 1OVNA 3W8SA 5B7CA 2VLUA 1A23A 3AY8A 3WGDA 1TRSA 2A4VA 2AB6A 4OMVA 2DJ1A 2CAQA 2P0GA 2B7KA 3M8NA 3G9BA 5G1KA 2VCZA 5DJMA 2K6VA 1XWCA 14GSA 2KHPA 3UJ1A 3LQ7A 5EVOA 2XHFA 3FEUA 4I2TA 6GSXA 5A5KA 3D4TA 2H6ZA 2VCVA 2KP1A 2GQLA 1Q4JA 2O87A 4LLRA 2MBSA 2K9FA 3C1RA 1FVKA 1TI3A 1G6WA 2XPDA 4GSNA 1TP9A 3E0UA 3WYWA 2HYXA 3GL5A 4NMUA 1A2JA 3V1WA 3UBLA 4EO3A 1AQWA 2H1GA 2P5RA 4ECJA 2CV4A 3I9V2 4YAVA 2FNOA 3LYPA 5IOXA 1XXUA 3TKSA 5J3RA 1G7OA 1GL8A 2O89A 5GZZB 1OE7A 1RQMA 3FHKA 5IO0A 5ID2B 2H6YA 3F8UA 2YWIA 5G30A 2LJRA 5DAKA 4RQXA 4TOPA 1NW2A 2ES7A 2AHEA 4GQFA 1WIKA 3NIVA 4WEYA 5KN2A 1K0DA 1KNGA 1XBSA 4PXOA 1EV9A 3CTFA 3F9UA 1V98A 4IGJA 3GNJA 4K2DA 4N10A 1MEKA 1XWAA 3M1GA 1QMVA 2CQ9A 2MMOA 3QAWA 2C0FA 5ELGA 4QL9A 4BA7A 2H72A 4MZBA 1S3CA 3GSTA 4RUVA 1KTEA 5DVBA 3KP8A 3M0FA 1MDKA 2DJJA 2O85A 4PQIA 3L9SA 4LL1B 1FHEA 1EGOA 3FZ4A 3H93A 5D9VA 1PN9A 5F8BA 4EXJA 2DJKA 2B5XA 3UVHA 3KD0A 1ILOA 3RPPA 2JZTA 3LWAA 5HR1A 3MDKA 3LYKA 2L57A 2PMTA 4TN8A 3QPMA 3A3TA 4KE3A 1SD8A 1T3BA 1QUWA 1XZOA 2E2GA 1U6TA 4TXOB 1EEMA 3F0IA 1OC8A 2HZEB 3IPZA 3FZ5A 3BBYA 1K0AA 4PX1A 3GFKA 2GSSA 4AJ8A 1G6YA 22GSA 2HFDA 2FUG2 3QMXA 4IN0A 5GAND 4QL7A 1OAZA 10GSA 4XS4B 5A4UA 4KCAA 4ISDA 4AJ7A 3VPTA 4POLA 3SWLA 4GSSA 2JSZA 3EU3A 1BQ7A 2AUVA 2IMFA 4HDEA 3C1SA 4D73B 17GSA 1SKRB 1W4VA 4KDXA 4YH2A 1YJ6A 3HVXA 1M2AA 4ZXGA 5G5FA 2G0FA 5FT3A 2DC5A 3HJPA 2L4QA 3DWVA 1TRWA 3GN3A 3GTUB 2RLIA 4RI7A 3EE2A 4XCSA 4ZIJA 1T00A 2FWGA 2YN1A 3GKXA 4CHSA 4MF7A 1A8LA 1ON4A 3K8NA 3HZ8A 1MTCA 3APQA 4X1UA 5EL8A 4Z7XA 2V1MA 2YNXA 3DGQA 3CTGA 2VL3A 5D73A 2LRTA 3UARA 5DDLA 2F9SA 5J41A 1ERUA 2HNLA 4KSMA 1R5PA 5IQYA 2DMLA 2LSTA 4BL7A 4V2MA 4GF0A 4BWSA 3D0ZA 1F9MA 5AN1A 2GZYA 3WGXA 2WGRA 2VCXA 4MP4A 3GTUA 5ABRA 4NV5A 1URMA 4ZB9A 4O32A 4RI6A 7GSSA 2HLSA 3ZRDA 3IK9A 2E7PA 2A2SA 2HI7A 2KUCA 4ZBAA 3ZREA 1EZKA 4F2IA 1G0TA 3KCMA 2VUPA 4K7IA 3QR6A 2GGTA 1YKCA 1YEPA 2WDUA 2FLSA 2O7KA 1HNAA 3ZIJA 4TR4A 1PMTA 4V2NA 2WS2A 1OC9B 2PN8A 1JFUA 5KN1A 1VF4A 3LXZA 4F82A 3HA9A 4TR1A 4TR0A 3KGKA 4DEJA 4L5OA 2C4JA 4O92A 4ZL9A 1Z7RA 1BJXA 2P31A 1XFLA 1TW9A 4EVMA 5IOWA 2RM6A 3E9JB 3FY7A 3D6IA 4XIHA 1ERTA 2FA8A 3TKQA 4PUAA 1MD4A 3C71A 2Z9SA 1A2MA 4FO5A 1FOVA 4HUAA 4ULXA 2HE3A 4J56E 3IE3A 4ILFA 2GQMA 1HQOA 1JZWA 3IBHA 2GZPA 1UN2A 4DSSB 3KH7A 4ECCA 1GTIA 2M80A 1TU8A 11GSA 1TOFA 4J57E 1E6BA 2JZSA 1N2AA 1G7EA 2I3YA 4XRDA 1WJKA 1Y6EA 3CRTA 1THXA 1AC1A 2YZHA 5FHIA 1DBYA 4GXZA 2VM2A 5CYYA 2QC7A 3RHCA 2IFQA 2KP2A 1K0MA 3DXBA 4H86A 5DQSA 5ECSA 2DJ2A 2F8AA 2H19A 4WBRD 3IOSA 2MZCA 3KXOA 1TTZA 4XHMA 3IXRA 2GT5A 2GVPA 4NHWA 1JLVA 2H0HA 4DSSA 3N9JA 4FYCA 1WRYA 1GH2A 2X99A 20GSA 3KP9A 4OD7A 2LQQA 2R37A 2N5AA 2HXKA 1FW1A 3IDVA 4JR6A 2BMXA 1FB0A 2PUKC 1EOHA 4X0XA 1M9AA 1DE2A 3P90A 3SBCA 3DVXA 4N30A 1GP1A 3ZMLA 5EY6A 2YOIA 1ZMAA 2VD0A 2MMZA 3FZAA 2B1LA 2GQKA 5IMAA 3TCOA 1VF3A 2EIOA 1M2BA 5C04A 1A0RP 1ZYEA 1TK8B 4E8HA 1ABAA 3UL3A 3WGEA 3GH6A 4QQ7A 4KUNA 1F6MC 2NDOA 4KX4A 5KN0A 3TKSE 4MPGA 4WXTA 5ECKB 3KIJA 4ZB6A 2ZNMA 1IYHA 4K8MA 1Z6MA 1A24A 3QDNA 5G5EA 6GSWA 1XCCA 3HHVA 3DMLA 2CVKA 2ZUPA 3QAVA 5ECOB 3IAM2 4K9ZA 4HU9A 3EMXA 1BG5A 8GSSA 3KH9A 2J23A 4LMVA 2VCWA 4XS6A 1O81A 4Q5NA 1HNCA 3TJKA 2PU9C 4F0BA 3IRAA 3LG6A 1WP0A 1NHYA 3H8QA 3Q19A 2TIRA 4GWRA 3LGCA 1M0UA 4KA0A 5DAKB 2V32A 4IQAA 2H70A 1F2EA 1VRSD 2TRCP 3GV1A 4GLTA 4ZB8A 1GSFA 4POKA 5ECRB 5HR2A 1M9BA 2ON5A 1X9MB 2YANA 3PR8A 3H79A 1XWBA 3DVWA 3BJ5A 6GSSA 2YJHA 2H66A 5G2ZA 1SJ6A 4Q5RA 5GSSA 4BWQA 1CQHA 4AF2A 1GSUA 5JCGA 3TJBA 1BEDA 1W89A 1DE1A 3GHAA 3GL3A 4K0GA 18GSA 3KM6A 5F06A 2PGTA 3D5JA 4ZBBA 3VI5A 2IL3A 1HD2A 3F63A 4KDUA 1ML6A 5CO3A 2NBSA 2PPTA 3IK7A 3F4RA 1O7UA 2XBQA 4ACSA 2L59A 3UAPA 3QFBC 1LJRA 1UA5A 2K8VA 2XPEA 4V1Ag 1XVWA 4LMWA 1QXHA 1U87A 2JSYA 3VWWA 1B4QA 2JACA 3FYGA 4K6XA 4E8EA 3ZITA 3EWLA 5HFIA 2AAWA 3GX8A 3A2XA 3A5WA 1PSQA 2LNTA 2F3MA 2LV3A 3TKRA 4WR4A 4ZILA 4TXVA 6GSTA 2M46A 1T7PB 1NHOA 2LRNA 4JR4A 5CRHA 1FB6A 2CX3A 2I9HA 3TJJA 1SYXA 4V2LA 1S3AA 2OKAA 4IW9A 3RHBA 2IWTA 1O85A 2P5QA 4Q5QA 3U6VA 2FWFA 1C72A 1AXDA 1HNBA 2C8UA 2E2MA 3APOA 3HD5A 4KH7A 4LL4B 4J2FA 2H1BA 4XTSA 2R5GA 3KMNA 4IS0A 3C7MA 3HYPA 1M99A 1T4ZA 3IAS2 2R2JA 1EP8A 4EF0A 2C80A 2V41A 2DIZA 3L0HA 4G10A 2R6KA 2DSAA 2G2QA 1PKWA 3ISOA 1GSYA 1BYEA 2HZFA 1ACVA 3ZFLA 5CRWA 5IPHA 3FKFA 3F3QA 3ZVJA 1X5EA 1KBNA 5DALA 3IC4A 5JWOB 2VCTA 3ED3A 2DMMA 3ZYWA 4IELA 4HQZA 1GTUA 2LTKA 1K3YA 3GYKA 3Q74A 3GMFA 1XW5A 3M9KA 2OE0A 3VWUA 5AISA 4MJAA 2DBCA 4ID0A 4IQ1A 4EUYA 3HY2A 1H4OA 2VLTA 3HKRA 2XC2A 2GZZA 1R5AA 3ZMKA 2V2GA 2CX4A 2AV4A 5HFKA 1U88A 2MBTA 4TRXA 2YJ7A 1SD9A 3A2VA 1GLPA 3IA1A 1V40A 4OCFA 4NXIA 1J9BA 5INYA 2V6KA 3DKSA 1IYIA 1PX6A 5ELAA 3TGZA 2LQOA 2QGVA 3TRQA 4EC0A 2VL2C 4MJEA 5ECMB 1YEXA 5C00A 4JZQA 2IMDA 1Z6NA 3J7Yb 1AUCA 4TR1B 4IHUA 2ALBA 5ECNB 4EE0A 2DJ3A 2NTOA 2PBJA 4PNFA 1JZDA 2VAFA 4KCEA 4O5RA 2JADA 2WZ9A 4KDYA 5H5SA 3J7Yk 3KTLA 1YF1A 4TW5A 3MWHA 1K0OA 2M72A 5CP1A 2FY6A 2B1KA 4P3YB 2VLVA 3RAZA 4PURA 5GAPD 1PRXA 1VF2A 4EDZA 19GSA 1NSWA 3GA4A 1TDIA 2HRFA 4WF5A 4POBA 3HVVA 2VCQA 5D9WA 5DCHA 1JZRA 2C3NA 4K7NA 5JCUA 1S3DA 4ML6A 5AGYA 6GSUA 5B6NA 1WE0A 3ZVJD 4GQCA 1X5CA 1X9WB 4MCUA 2QKEA 4BPYA 5B6MA 4YQVA 4WETA 5LD0A 1SU9A 1PL2A 1YQ1A 3GH9A 4NHZA 3D21A 1QK8A 2JU5A 1I9DA 2B5YA 5FWGA 5EPFA 4TVEA 1B4PA 2R4VA 2IFQB 3KTBA 5LNKe 3F4TA 1AW9A 4MMMA 1ZZYA 2IMIA 4HZ2A 1XW9A 1GSDA 5HR0A 12GSA 5D9TA 3FW2A 3FR6A 1I5GA 1K0NA 2HSYA 5IMVA 1RK4A 5COHA 1O8XA 2K18A 1LBKA 2WULA 3VURA 4DVCA 1MD3A 2IMKA 2H6XA 2FCHA 3E3EA 1TKDB 1EGRA 3VLNA 5H5RA 4MABA 1OKTA 4OFMA 4MJCA 4HJMA 5KEJA 3LEFA 1XVQA 4ECIA 3CRUA 4GRFA 1PD21 2A2RA 1U3AA 4MZWA 3G7YA 2GDRA 1ST9A 3LXTA 1EV4A 1XW6A 5F05A 3PGTA 4JRRA 1EP7A 4IKHA 1JHBA 1JZOA 2I81A 1SL1B 3ZFBA 1B8XA 1QGVA 4DSRA 1WMJA 3BOAA 4X43A 1SJIA 2VD1A 2X8CA 1M7TA 4BVXA 2NVLA 5F0GA 4IP1A 3LORA 3EC3A 3MNGA 3BD2A 5JCWA 4KAEA 3W6GA 2IMEA 3P2AA 4POMA 1QQ2A 1XWKA 2OADA 2CA8A 2IIYA 5D8IA 2V6OA 2FHEA 2C0DA 4KSOA 1Z7PA 1K0BA 2LKUA 2YV7A 1O6JA 3O76A 2MMAA 3NZNA 1R26A 1TXXA 2IN3A 3US3A 1SK0A 3LSZA 3ZL5A 1Z9HA 3GKKA 1CQGA 1GSEA 1DSBA 5ENUA 3L9UA 4WBJA 3Q18A 4YQMA 1TRVA 1F3AA 2X64A 5ECLB 5GSTA 1AQXA 1PX7A 3U5RE 1K3LA 2OBKA 3TUEA 2J9HA 3QD9A 2WFCA 3CSHA 3LJRA 2PVOC 1B48A 1YZXA 2CT6A 2LNSA 1TK5B 3ZLPA 2DJ0A 3ZZXA 9GSSA 4ML1A 1TJDA 3FRCA 1GSSA 1A8YA 2GSRA 1FVJA 5F07A 3G7JA 3ZIVA 1PL1A 1J0FA 4MK3A 2VOCA 3W8JA 1UVZA 1GSQA 5H5QA 2CVDA 3CBUA 3H1NA 4GTUA 3TRXA 5G31A 4MF6A 3EMPA 4F03A 2CZ2A 1TRUA 1TU7A 5AIXA 1SL0B 2N5FA 4WF4A 1H75A 3IV4A 3MSZA 1OYJA 2EIQA 2OA7A 2H76A 2JL4A 2YZUA 3WT1A 3DYRA 3RBTA 2F51A 3C8EA 4MDCA 3EYTA 2H0GA 1AAZA 3ERFA 2H74A 5D96A 2C1YA 3TJFA 2H30A 2MMNA 1GLQA 2CZ3A 2YCDA 2B3SA 3DEXA 1X5DA 5ECIB 5ECQB 2C3TA 2OJLA 2VL2A 1AQVA 4MPFA 1X9SB 2GT6A 2FD3A 3VWVA 2ZCTA 2OACA 4MA9A 4PQ1A 5IMCA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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