4LL1B

The structure of the trx and txnip complex
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPAKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structural basis for the negative regulation of thioredoxin by thioredoxin-interacting protein
pubmed doi rcsb
molecule tags Antitumor protein/protein binding
source organism Homo sapiens
molecule keywords Thioredoxin-interacting protein
total genus 30
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ll1B00
1OE7A 3FZ4A 2LNTA 4X0XA 1DBYA 4FO5A 2KOKA 4L5LA 5E59A 5IPGA 1FG4A 6GSWA 2X8CA 3RPPA 1B4PA 4O7HA 5IMZA 1GSUA 2FWGA 2VLUA 3IHQA 2H71A 4ZILA 3GL3A 3VURA 4ULXA 1TDIA 4XS6A 4ZB9A 2NDOA 3IPZA 2CAIA 2WGRA 4F9ZA 1GUHA 1RW1A 4JEDA 4EC0A 3CBUA 2X99A 5CRGA 1PL2A 2X8HA 2H75A 3EU4A 5G2ZA 2N5AA 2C0DA 4DSSA 5AIXA 2WFCA 3VWXA 4K0NA 4HQZA 3QPMA 4LLRA 1XWGA 5B6NA 3D0ZA 5ECMB 4DEJA 3G9BA 4QL9A 3V1WA 3ED3A 2BTOT 6GSTA 1EOGA 4EF0A 3G7IA 1VF1A 3VWWA 2R4VA 1GTIA 5D9XA 3QAVA 2OBIA 2YANA 2C80A 1GSQA 3D5JA 4G10A 2L5OA 1GLPA 1TRVA 3FR3A 1TRWA 3TUEA 3I9V2 1EZKA 4Q5QA 1HYUA 1M2AA 3Q6OA 1E6BA 3S9FA 2ON5A 1CQGA 3QCPA 4TR1B 1PKWA 2ON7A 2QSIA 1F3AA 3WGEA 2H74A 14GSA 1GSFA 2JACA 2PU9C 1SYXA 3EMPA 1W4VA 4TKYA 3C71A 4IGJA 3A2WA 3ZITA 1EOHA 1O73A 1LJRA 5A4UA 4OMVA 5KN0A 3GYKA 1PKZA 3E9JB 1Z6MA 3PINA 3HY2A 5IO2A 4NV2A 5J3RA 2LEGA 1GSYA 4HJMA 3N5OA 5CRDA 2C0FA 5IMAA 1XVWA 2GDRA 2L4QA 3TRXA 4MF5A 4ZBDA 5ELAA 2H73A 1BX9A 5H5QA 4CHSA 2HSHA 1SKRB 2FWEA 3KZQA 1PRXA 4HU9A 5G30A 2QKEA 3GHAA 5D96A 4HEA2 3K8NA 2MMAA 3JCML 4Q5NA 3TJJA 4TXOA 1YEPA 4V2LA 1N2AA 3UOMA 3GKXA 3GNJA 1GNWA 3MNGA 4NHWA 4GSNA 5IOWA 2DMMA 3F6FA 1FVKA 4TR4A 3KMNA 1Y25A 4NXIA 3IC4A 2GQLA 4GQFA 3LJRA 3RDWA 4XS1A 6GSYA 3H4KA 4XCSA 1R4WA 2WZ9A 4I2UA 3HD5A 3EU3A 1F9MA 3WT1A 1QQ2A 1ST9A 1NSWA 3VI7A 1THOA 2E7PA 2F3MA 4GRFA 2GZYA 2EIOA 4PURA 5A5KA 1OE8A 3GSTA 4LL4B 4ZB6A 1ZYQB 1UVZA 2I4AA 1W89A 5G1LA 4DSRA 4HQSA 1GUKA 2YOIA 3PH9A 1U87A 4V2NA 17GSA 1KEBA 4YH2A 3ERWA 4AJ6A 3M9KA 2YZUA 1SD8A 2H66A 1XWKA 1Z9HA 5AISA 4MJBA 4ECJA 3FHKA 3ISOA 2HYXA 3VPTA 2WS2A 3C8EA 1IYHA 2IMKA 4O92A 2IMFA 5G1KA 3PGTA 1PMTA 22GSA 3E3EA 2P5QA 1SKSB 2REMA 3LXTA 5GZZB 1WRYA 1TXXA 3H93A 2VAFA 5DQSA 4EE0A 3QFBC 1PD21 3F4RA 2VIMA 1XXUA 1RQMA 3LORA 1UA5A 2PWJA 1ERWA 4KX4A 3US3A 2PBJA 2VCQA 4GF0A 5E4WA 4GTUA 1F6MC 5ECQB 2AYTA 2J23A 1O8WA 2OA7A 2L4CA 5D9TA 1EV9A 3HVSA 4FYUA 4KDUA 3TOTA 5CO3A 1QMVA 2XBQA 1MDKA 3UVTA 4YAVA 1SJZA 7GSSA 2HLSA 2H0HA 3P2AA 1U88A 4TW5A 4ISDA 5JWOB 3GN3A 5DCHA 5C04A 2FY6A 3W6GA 4HI7A 5EY6A 1EEMA 2CT6A 2R6KA 5IQYA 4HUAA 2H6YA 1DSBA 3D21A 2X8GA 1DUGA 2B7KA 4OO4A 4MF7A 2LV3A 2OJLA 1AXDA 1FO5A 1HNCA 5F06A 3FKFA 1XBSA 1M2DA 3UARA 1XZOA 5ECSA 1SL2B 5C00A 3VFIA 4DSSB 3KH7A 2LJAA 3IR4A 3VWUA 1TRSA 1K3LA 4IQAA 3RAZA 2DJ1A 2LNSA 2TRXA 1ZGNA 2OE1A 1VF4A 2K9FA 3UIWA 1EP8A 4K0GA 2DJ2A 1GTBA 5G5EA 1YF0A 1ERUA 2VUPA 2CVKA 3GUSA 1ZL9A 1AUCA 4BPYA 5DVBA 3P8WA 3ZRDA 1A0RP 3O6TA 1I5GA 3QR6A 1C72A 1OKTA 1USBA 4HOJA 4ZB8A 3Q18A 4G9HA 5DJLA 5J9BA 2JADA 4MJAA 5GSTA 2VCZA 5J9CA 2DSAA 2I3YA 1SL1B 4HJ2A 5HR2A 1F3BA 5IMVA 2LTKA 2QC7A 1K0NA 3GA4A 1HQOA 2FUG2 4ILFA 2QGVA 4AGSA 1NM3A 1K0AA 2H01A 3VWVA 4PUFC 2C0EA 2VLVA 4OFNA 2N5BA 2DJKA 2WULA 4JR6A 1BYEA 1X5CA 4ZL7A 2B3SA 3W8JA 4YQVA 4YQMA 2PGTA 4WBJA 1UN2A 4MPFA 5AIVA 4OWYA 1S3AA 4PUAA 1MD4A 1Z3EA 1MEKA 1TU7A 4ZL8A 2YPMA 3FK8A 4JE1A 4E8HA 3ZTLA 4MH2A 4H86A 4JR4A 2M80A 4ECCA 4TXOB 4BVYA 2IL3A 2AAWA 2LKUA 1TK0B 5ABRA 2VLTA 1V58A 4GQCA 4NMUA 3ZMLA 4K7IA 3A2XA 3LQ7A 4EUYA 4IP6A 2E2MA 1XIYA 4OCEA 2LRTA 4KSMA 3CTGA 3HJPA 2GZPA 5EL8A 1VGLA 5LD0A 4BVXA 1JFUA 4ACSA 2JZSA 3IE3A 4N10A 1B9YC 3RPNA 5H5RA 1EGRA 2KLXA 4K9ZA 2MMOA 5KN1A 1XWBA 10GSA 1AQVA 3I6AA 5B6MA 3CRTA 1HNBA 3LYPA 4CW9A 1MDJA 3ZFBA 1M9BA 3TGZA 4GSSA 1G6YA 5F05A 1BEDA 2PUKC 3ME8A 5ECHB 4X1UA 4N0VA 4POMA 4F2IA 2EC4A 1H75A 5KN3A 1OVNA 1K0CA 5LCZA 1SENA 3TKRA 2FGXA 3HJOA 5AGYA 5FWGA 1GULA 2AB6A 2VL3A 2FA4A 3KCMA 2D2ZA 3HZ4A 2ZUPA 1WJKA 1X9MB 2A2RA 2NBSA 1V40A 4MA9A 16GSA 2V1MA 1FW1A 2N5FA 4WBRD 4WKWA 4YAPA 5HR0A 4O32A 3L9SA 2FD3A 1ABAA 2HFDA 1J0FA 3G7JA 1T4YA 3UAPA 2C3TA 2GVPA 1F2EA 2VCTA 1TU8A 1EP7A 1XVQA 3PR8A 2OBKA 2YZHA 2F51A 3HVVA 5DCGA 1SU9A 1BG5A 4GCIA 1YY7A 2IMIA 2VO4A 1GL8A 1OC8A 5FT3A 4QL7A 4MZCA 1WIKA 3TJBA 3D4MA 3I43A 4BWQA 2A4VA 4POLA 3LYKA 1A8LA 5B8AA 4L5OA 3BOAA 2V32A 1ON4A 5HR3A 3ZIJA 3GSSA 4IELA 1F37A 1V2AA 4WEYA 2MBSA 3QMXA 3A5WA 2C3QA 3UEMA 1ZZYA 2CZ3A 2X64A 2ALBA 4TOPA 4J2FA 3DIEA 5ID2A 2CAQA 5HQPA 1ILOA 5HFKA 2P31A 3TJGA 3FY7A 5ECLB 2GQMA 4OFMA 2PPTA 1HD2A 1EEJA 3IOSA 5D9VA 2MBTA 4NWYA 2L59A 1K0BA 2M72A 1K0MA 2FWHA 3CSHA 1KNGA 1XW5A 2DIZA 1HNAA 2IIYA 4NV5A 3W8SA 2FLSA 4KGIA 2DIYA 3ZREA 4IKHA 2RM6A 4KDXA 2PVOC 4TR3A 2PERA 3EINA 1Q98A 2C1YA 2V41A 2DLXA 3F8UA 1JZWA 4N30A 4NPBA 5CYYA 4ZBBA 5ECKB 4KB3A 3HA9A 3TJFA 3J7Yb 1WE0A 5CRHA 1BJXA 3D22A 1GSDA 4FH8A 4PXOA 2OKAA 3VK9A 2C8UA 2J9HA 2H0GA 2CVDA 4KH7A 4D73A 1SJIA 3QDNA 3N9JA 1BQ7A 2GQKA 2ZCTA 4ZBAA 3HKRA 4MPGA 3M9JA 2DJ0A 3L9VA 3C1RA 3IK7A 4OO5A 4I2TA 3A3TA 3TJKA 3U5RE 1N8JA 2R2JA 4ML1A 3BBYA 3GV1A 2H19A 2C3NA 1O81A 4V1Ap 3FEUA 3GH6A 4FYCA 3IK9A 3U6VA 2GSSA 4CDOA 1OC9A 1T1VA 4X43A 20GSA 5KN2A 2O85A 4KW6A 2FNOA 2PN8A 2P5RA 3CMIA 4QQ7A 3FR6A 1K3OA 1X9WB 5F0GA 1EWXA 1GRXA 3NOFA 5L71A 4MDCA 2LQQA 3ZIVA 3KP8A 1QUWA 4HDEA 2FHEA 2IJYA 1B48A 3FYGA 1WPIA 2HI7A 4PQIA 5IMDA 3GL5A 1PX6A 1G0TA 2VL2C 4MK3A 1S3CA 4IHUA 1ERVA 3FW2A 5D93A 3UJ1A 1FHEA 2RUEA 2JSYA 2VM1A 1GTAA 1J9BA 1XW9A 4FYBA 4KNDA 4KA0A 1TKDB 3QAGA 4MCUA 1K0DA 3MWHA 2JL4A 3HHVA 4HS1A 3UBLA 2WCIA 1JZRA 3IAS2 6GSXA 4IVFA 1LBKA 1ZMAA 3G7YA 5ECIB 2LQOA 2GT6A 2H1BA 4Q5RA 3IRAA 1GUMA 3P7XA 3EYTA 4XRDA 1XPVA 4EL1A 1WP0A 1DE2A 2O8VB 4WF5A 1TK5B 1PN9A 3KEBA 3L9UA 4F0BA 1K0OA 4F0CA 4PQ1A 5DQYA 1X5EA 4K1FA 4PGTA 1SL0B 3TRPA 1YZXA 18GSA 2O89A 1QXHA 1WOUA 2B5YA 1AQXA 1XFLA 1XOAA 9GSSA 1FVJA 2JZTA 1KBNA 4IJIA 5IOXA 3D6IA 1GSEA 2YWOA 3H8QA 3DEXA 2YWIA 1PQNA 4PQHA 2O7KA 2G0FA 4IBPA 5DALA 2GLRA 5COHA 3FZ9A 1M7TA 4RQXA 2E2GA 1TP9A 5JCGA 1WMJA 1QFNA 3M3MA 2YJHA 1AAZA 4LA1A 2TRCP 1A2LA 5KEJA 2H1DA 2LSTA 1Z6NA 5B7CA 1QGVA 2V6KA 4MZWA 1B8XA 2B1LA 8GSSA 2CA8A 2L57A 3ME7A 2Z9SA 1PA3A 3GH9A 3I69A 4HZ4A 1XWCA 1O6JA 1U3AA 4AF2A 3O3TA 3J7Yk 2C0GA 3AY8A 4MJCA 1R26A 4WXTA 2YV9A 1FAAA 2F9SA 5J5NA 1R7HA 1H4OA 3DVXA 1ZYEA 3TKSC 3DWVA 5D8IA 2MZCA 4Z7XA 3MAKA 4L0WA 5D73A 2XPDA 2P0GA 3EVIA 4POBA 5JWRB 1XCCA 3GURA 3DVWA 1GH2A 1TW9A 4KAEA 3LXZA 4P3YB 2WJUA 3OR5A 5ID2B 3GIXA 4GXZA 1JZDA 2I9HA 1M0UA 2MMZA 1AW9A 5CP1A 1GLQA 2CVBA 1GNEA 3ZVJD 2YCDA 1PGTA 2KP1A 3EC3A 4WF4A 5CAXA 5H5SA 2F8FA 3L0HA 2H1AA 1OKDA 4IP1A 3A2VA 3KGKA 3KM6A 2IMDA 5HFIA 2FA8A 4I6XA 4F82A 1V57A 4ECIA 3QD9A 2V2GA 2B6MA 3DGQA 3SBCA 5IPHA 2AHEA 2H0IA 2IMEA 5EPFA 4F03A 5J4UA 4MH3A 2L6CA 4G2EA 4K6XA 4I5QA 3MSZA 3ERFA 1TI1A 2OE0A 3ERGA 3SWLA 4LL1B 1ACVA 1Z5YE 1ZCPA 1PX7A 19GSA 3KH9A 1S3DA 2OADA 5CRWA 1TOFA 4IW9A 2LJRA 5A4WA 1DE1A 2WRTA 2IN3A 4D73B 5GAND 2H1GA 3CRUA 2C4JA 3F6DA 1X9SB 3TOUA 1MTCA 4MLYA 2GT5A 2LUSA 3LEFA 1G7EA 3LG6A 3IBHA 2GSRA 2KHPA 3APSA 4IS0A 5DJMA 4EVMA 3KD0A 2E0QA 2GSTA 3E0UA 1SD9A 1MDIA 1THXA 2B7JA 2H8LA 4RI7A 1OC3A 1OC9B 3VI5A 3EMXA 2DC5A 4XS4A 3O76A 3ZMKA 1A2MA 2HSYA 3R2QA 3FZAA 2GSQA 4JZQA 3CYNA 3H79A 1FB6A 5IO0A 5GAPD 3Q74A 1GP1A 1XOBA 1TJDA 2HZEA 4TRXA 12GSA 2DJ3A 2YN1A 3NZNA 3BCIA 4L8EA 4J57E 1GTUA 5FHIA 1XW6A 2HT9A 5IMCA 4RUVA 3GX8A 3IAM2 3FR9A 3C1SA 4EKZA 1OAZA 4EDZA 4I8BA 4PX1A 4WR5A 5ECRB 3TDGA 1JLVA 4FIWA 3UL3A 2M46A 1OYJA 5IIZA 1UC7A 1I9DA 1PSQA 3ZZXA 3WT2A 3D4TA 1TRUA 1J08A 5ENUA 4N11A 3F4TA 4IQ1A 4POKA 4GSTA 2GTUA 1V98A 2NVLA 3MDKA 1JLWA 3M1GA 2AJQB 5D9WA 1ZOFA 3DKSA 1T7PB 3BCKA 2JU5A 6GSVA 3NIVA 1VRSD 2YWMA 3LFLA 3KP9A 2O87A 4ECBA 1URMA 4G19A 1X5DA 2K6VA 2MMNA 3CSJA 1R5AA 4JU5A 1YF1A 1AQWA 3EE2A 3GX0A 4YQUA 2ZNMA 4V1Ag 3WD6A 3HZ8A 1NW2A 1O85A 1GWCA 4O5RA 5DALB 3UVHA 5JCUA 2F8AA 1B4QA 3QFAC 5G31A 2VL9A 2VCWA 2VCVA 2R5GA 2H6ZA 2H70A 4L0UA 3RHCA 1M99A 4XIHA 4DVCA 1SJ6A 4KUNA 4PNGA 1E2YA 2JSZA 3F3RA 1SKWB 3CSIA 5G5FA 3F3QA 3IDVA 3BD2A 2VD1A 5ELGA 5DAKA 2YNXA 4AJ8A 1NHYA 2EIQA 3KXOA 2PVQA 2B5EA 1B9XC 1YDKA 2HXKA 3GTUA 2HRFA 2I1UA 3F0IA 2JZRA 4OFTA 2I81A 3LGCA 1YKCA 1G7OA 3C7MA 4ZIJA 2FWFA 4MABA 4K7NA 2IFQA 2IWTA 1CQHA 1LU4A 3QAWA 5DBQA 1O8XA 5JWQB 3GKNA 2K8SA 3ZL5A 4XTSA 2H76A 2YWNA 3KIJA 1ERTA 3BJ5A 4ID0A 4RI6A 3ZFLA 3M0FA 1A23A 3KMOA 1AC1A 5CNWA 5IM9A 4EO3A 2HRNA 4MP4A 3DMLA 5A4VA 3RBTA 1FOVA 3GKMA 2GGTA 2H30A 4KCAA 1K3YA 4TN8A 3TKPA 11GSA 1AIUA 2RUFA 1NHOA 3GKKA 3L78A 2VOCA 5B8BA 4WR4A 5ECNB 4BWSA 3M8NA 6GSSA 4TXVA 5ECPB 2HNLA 2CX4A 4MJEA 2R3XA 1FB0A 3TKQA 4XRAA 1EGOA 1GSSA 5GSSA 5INYA 2NPBA 3HJMA 2PMTA 4DSQA 4K2DA 3TKSE 2CX3A 4TR0A 4BA7A 2XHFA 1ML6A 1SK0A 3KJYA 2A2SA 2XC2A 1JHBA 2VM2A 1RK4A 3VLNA 2G2QA 3TRQA 2OACA 5CREA 4PNFA 3F9UA 3WGXA 5HR1A 2H72A 3KTLA 2V6OA 1Z7PA 4E8EA 3C73A 2XBIA 5AN1A 4XHMA 5F07A 3IV4A 3FRCA 5F8BA 2HZFA 4EXJA 3DYRA 4TR1A 1V9WA 3EURA 4XS4B 1U6TA 1M2BA 2FCHA 4WETA 2LJKA 3GMFA 1JZOA 3APOA 2OE3A 2MYGA 2HZEB 4GLTA 1KTEA 1VF2A 4ZL9A 4V2MA 4HZ2A 4NAXA 2XPEA 4KCEA 1M9AA 13GSA 2WDUA 4J56E 1T8EB 2R37A 2LRNA 1EV4A 2RIIA 1T4ZA 2LRCA 2CQ9A 3L4NA 3FZ5A 1O7UA 1U3IA 5EVOA 5IMFA 1Q4JA 2VCXA 1R5PA 1TTZA 1IYIA 4NHZA 3Q19A 4I97A 4HU7A 3UBKA 2VL2A 5HFGA 4IN0A 2CZ2A 3QOUA 4JRRA 4LMWA 1SK2A 2B1KA 2K8VA 2LS5A 2KP2A 2BJXA 2L5LA 1YJ6A 3GRXA 3IA1A 3F63A 3F4SA 3WYWA 4LMVA 3ZVJA 4BL7A 4OD7A 1XWAA 1MD3A 2WB9A 3HCZA 3TB2A 1A0FA 3P90A 1A8YA 3DRNA 2DBCA 1Y6EA 1SYRA 3H1NA 4IJ3A 4K8MA 1A2JA 4N0ZA 2RM5A 5LNKe 2ES7A 1WWJA 3DXBA 4AJ7A 4EDYA 1BAYA 3GFKA 2H6XA 2BMXA 4TVEA 1QK8A 1YKAA 5ECOB 4KSOA 3LSZA 4GWRA 1A24A 4KDYA 4MZBA 2NTOA 3EWLA 2YJ7A 4Q5FA 1TK8B 4RQRA 1Z7RA 2AV4A 2VD0A 3TCOA 2EIRA 3HVXA 2B5XA 3CXGA 3HYPA 3ZLPA 4KE3A 1SK1A 2CV4A 4OCFA 4ZXGA 5J41A 2RLIA 1YEXA 3LWAA 3DD3A 5DAKB 2HE3A 2YV7A 3RHBA 1X0RA 5DDLA 3WGDA 2AUVA 3APQA 2DJJA 1G6WA 1VF3A 2DMLA 3VPQA 3ZYWA 3IXRA 3CTFA 1PL1A 1YQ1A 3GTUB 2GZZA 4MF6A 2KUCA 2K18A 4ML6A 3KTBA 2YP6A 3TKSA 2GS3A 2L6DA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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