4LL1B

The structure of the trx and txnip complex
Total Genus 30
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
30
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPAKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKCMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The structural basis for the negative regulation of thioredoxin by thioredoxin-interacting protein
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin-interacting protein
molecule tags Antitumor protein/protein binding
source organism Homo sapiens
total genus 30
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence D
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-07-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ll1B00
3MNGA 1XPVA 3QFAC 3CXGA 3L0HA 2H75A 2PU9C 4EE0A 2NDOA 4HZ4A 3KGKA 4Q5QA 2FHEA 2RM5A 1YJ6A 5H5RA 4JRRA 4OCEA 4PUFC 2X8GA 4DSSA 3W8SA 2ALBA 3KZQA 2AV4A 4YQVA 5IO2A 2YJHA 4BA7A 3DEXA 2VD0A 3LG6A 1R4WA 3MDKA 4OWYA 4HDEA 4ZB6A 4Z7XA 4EXJA 3HYPA 2R2JA 4HOJA 1ZOFA 4TN8A 4K8MA 1A23A 1NW2A 2XHFA 3ZITA 1SKWB 1IYIA 3EC3A 1PRXA 2PPTA 4WBRD 1PD21 4LMWA 1AXDA 3D4MA 4POLA 5J4UA 2GQMA 1SD9A 3IXRA 2MZCA 3IBHA 2YCDA 5CNWA 3TKSC 1XOBA 1ZCPA 3O6TA 4NHWA 2WZ9A 3GYKA 2MMZA 1B4PA 1K0MA 4K7OA 1YF0A 2DJ2A 4TR3A 11GSA 1EEMA 1JHBA 4ZL9A 2NVLA 2P0GA 1F3BA 4MABA 2YWNA 2IFQA 3DYRA 1FO5A 3TKSE 2QSIA 4NWYA 1VF1A 3CTGA 4IELA 4OFTA 1MDKA 4L5OA 3CSIA 2DMMA 4ID0A 2HYXA 2L57A 5IMDA 3KTLA 2WCIA 5LD0A 2V6OA 2C4JA 3UOMA 4WR4A 1XWBA 3RHCA 4TXOA 4TRXA 5ECPB 3GURA 5GZZB 4K9ZA 2DJ3A 3DWVA 4EC0A 5G1KA 4HQZA 3ZFLA 1BAYA 4XTSA 5D9WA 5DALA 1EV9A 1OC3A 1PX7A 3KJYA 2I81A 3TKPA 1GTUA 2VLVA 2GDRA 4WBJA 1NSWA 1T4YA 4KH7A 3GUSA 5HR0A 4N0ZA 1AAZA 3DVXA 3ME8A 2H0IA 4V2NA 1XWAA 2XC2A 1SKRB 4MK3A 1J9BA 1HYUA 2KHPA 2K18A 1X9MB 3UJ1A 1G7EA 4WF5A 4X0XA 4G9HA 4N10A 3F3QA 2L4QA 3MWHA 3H8QA 1EOGA 2K9FA 2R3XA 3IHQA 1FVKA 2B1LA 3HY2A 3UEMA 1B9XC 2BTOT 4TR1A 5G30A 1TOFA 5EL8A 2DC5A 2HRFA 3BCIA 1M2DA 2YZHA 2YWOA 1LU4A 3ZMLA 2MMNA 3QPMA 4MH2A 2OE0A 1H4OA 4PNGA 5F05A 3P7XA 5KN0A 4K1FA 2MMOA 2AJQB 1TRUA 3EVIA 3WD6A 3BD2A 3MSZA 2HZEA 4HU7A 4K2DA 4KUNA 2EIQA 2FNOA 1F6MC 2K8VA 3ZIJA 4K0NA 3TGZA 1OE8A 3CBUA 2HNLA 4BL7A 1XBSA 1M0UA 1R26A 1Y25A 2YPMA 1G6YA 4GQCA 3LYPA 3DXBA 2PUKC 1BX9A 5FHIA 3IRAA 1GUMA 3IOSA 5JWOB 3DVWA 4MJEA 2GZPA 2H0HA 1XWCA 2I9HA 2OE3A 5CRWA 1SL2B 5IOWA 4IGJA 1NHYA 1UA5A 2GZZA 3N5OA 4G2EA 1LBKA 2G0FA 3QCPA 2GSQA 4MP4A 1B4QA 1JLVA 3A2VA 3ZREA 1K0NA 1ERUA 2JACA 2B5YA 3KCMA 5ECSA 4F9ZA 2IMIA 4HUAA 14GSA 4JE1A 4LA1A 5CRDA 1U87A 1JZRA 5C04A 6GSWA 3FZAA 1GUHA 3ERGA 2CVKA 4XHMA 4QL9A 1FB0A 3KP8A 2FA4A 1U6TA 1K0AA 2TRCP 4CW9A 2AUVA 4WETA 4HU9A 5ECOB 4NXIA 1DSBA 2D2ZA 4TOPA 3FYGA 5KN3A 3BBYA 4F82A 3ZMKA 2CVBA 3C1SA 3GX0A 1SD8A 3F0IA 3IV4A 1FB6A 3UIWA 4EL1A 5IPHA 4N11A 3NZNA 3TOTA 1HNCA 1T7PB 1BYEA 4AF2A 1GSYA 2VLTA 2OBKA 1E2YA 1GSDA 3GL5A 3M0FA 1TTZA 5EPFA 5HR1A 1Y6EA 12GSA 2C3NA 2ZNMA 4OFMA 2IPAA 5ECLB 4MH3A 1A2LA 1VF4A 1WMJA 2XPEA 3UAPA 4EVMA 1PL1A 4IHUA 4L8EA 16GSA 4J2FA 1JLWA 3WGXA 1U88A 3GTUA 1TDIA 3CMIA 3H93A 4IBPA 3HVVA 3EINA 3TRXA 5INYA 4GF0A 2LRTA 3FRCA 1R5PA 3A2XA 4AJ8A 3F4RA 5KN2A 5E59A 1XXUA 2H1GA 1GSQA 3RPNA 1GULA 4O32A 1WRYA 3S9FA 1R5AA 1VGLA 2GQLA 2V32A 5IMZA 4F2IA 1YEPA 2HRNA 2EIRA 4JU5A 2E2GA 2ZCTA 5JWRB 2OE1A 2YOIA 1DE1A 1KNGA 5HFKA 1DE2A 5GAPD 1K0BA 4WR5A 1G7OA 3I9V2 2I4AA 3LJRA 2A4VA 2HSYA 2YV9A 1X9SB 1FG4A 2M72A 3RDWA 4O92A 2PVOC 4MPFA 4JZQA 2CX4A 3C71A 4XIHA 3HCZA 4BWSA 1B9YC 3LQ7A 2BJXA 3I43A 2LSTA 1AC1A 4X1UA 3A3TA 2L4CA 1TXXA 1V57A 2H01A 3FHKA 4D73A 3GRXA 1SK0A 1M2AA 3CSHA 1WJKA 1XOAA 3ZVJA 4GWRA 2I1UA 4XS6A 2RUFA 6GSXA 1TKDB 3G7IA 2LTKA 1PL2A 5IMFA 2VCXA 2VD1A 3C8EA 3HVXA 2TRXA 4L0WA 1F9MA 3GKXA 2GSTA 2VCWA 1O8WA 1C72A 4YAPA 1GSEA 4KGIA 1N8JA 4DSSB 1ML6A 3KMNA 3ZYWA 1M9AA 1SK1A 2DBCA 2CZ2A 1OAZA 2GS3A 2PN8A 3ZVJD 5J9BA 1AW9A 2IMKA 4YQMA 4OFNA 1GSSA 2A2SA 4NV5A 2KUCA 5HFGA 4ZL7A 4NV2A 1GTAA 5IOXA 3GIXA 3M9JA 5J41A 4MF5A 1KTEA 2F3MA 4LL1B 1FHEA 6GSTA 3RBTA 4PUAA 2F51A 5LCZA 2CAQA 3GA4A 3LXTA 4POKA 2REMA 1O73A 2BMXA 1TP9A 4MF6A 4V1Ag 2OA7A 3QR6A 1B48A 1Z5YE 1JZWA 4ZB8A 1OYJA 3PGTA 2PMTA 2H76A 4NMUA 1PGTA 1O7UA 4ECBA 2H70A 5DAKA 2DSAA 1YY7A 1RQMA 6GSUA 4BWQA 1A24A 4YH2A 1Z7RA 2IFQB 2VLUA 1SL0B 3NOFA 1TI1A 4O7HA 1WPIA 2HXKA 4ZXGA 4BPYA 4RUVA 5DBQA 1VF2A 1YKAA 4HJMA 5GAND 3HXSA 2CT6A 1O85A 5DDLA 4G19A 4TXOB 1GLPA 3ZZXA 4KCEA 1QGVA 2MBTA 4J57E 2HFDA 2LQQA 1K3OA 1SJZA 3WGDA 4KCAA 3DRNA 3ISOA 3D22A 1BQ7A 3LXZA 4ULXA 1A2JA 3SBCA 5DQSA 1Q4JA 3E0UA 4MF7A 3WT2A 4PQHA 2CQ9A 3KMOA 4CDOA 2LJKA 1ERTA 1WP0A 4GTUA 5D93A 3TOUA 4PXOA 1VRSD 3F4SA 2LNSA 3CTFA 2F9SA 5F8BA 4V2MA 3VWWA 3FR6A 3QAVA 2VUPA 2R5GA 5A4UA 1LJRA 20GSA 2JSZA 4ML1A 1ERVA 4J56E 1GNEA 3EU4A 2PERA 1K0OA 2VM1A 5ID2A 3WGEA 3GNJA 3A5WA 3GSTA 1V40A 4LLRA 3HKRA 2VIMA 4TR0A 5AIVA 2HT9A 3R2QA 2WJUA 2O85A 6GSYA 4MJCA 3GV1A 13GSA 3TDGA 2B7JA 4OMVA 4IP1A 2YWMA 3E9JB 4TVEA 4IVFA 5IO0A 5ECHB 5B8AA 4ECCA 4DEJA 2PWJA 3F9UA 4HI7A 2K6VA 5CAXA 3FKFA 1BEDA 2KP1A 5HR3A 2VCVA 2AHEA 2O7KA 1JZDA 3ZRDA 1IYHA 4AJ6A 5COHA 2Z9SA 4KE3A 4I2TA 4ECIA 3TJGA 2M46A 2LRCA 1PKZA 4EF0A 2JADA 3TJJA 2VCTA 2GVPA 4MZBA 3RPPA 2H30A 1MD3A 2FWFA 5IPGA 1FW1A 1V9WA 2H6YA 2LS5A 2OJLA 4MDCA 2DJKA 5DCGA 4ZIJA 1ACVA 4KAEA 3VPTA 2NPBA 2G2QA 4XRDA 1EZKA 4MJBA 2ON5A 1W4VA 1Z7PA 1TK5B 3QOUA 1ZYEA 4POBA 1ABAA 4KDUA 3AY8A 1JZOA 3HD5A 4JR6A 4P3YB 2O89A 2O8VB 2YJ7A 2FD3A 1UN2A 2H71A 4L5LA 2YZUA 5AN1A 4MJAA 4POMA 4GQFA 3US3A 3TJFA 1OC9A 2H6XA 3FEUA 1NHOA 1O6JA 3HA9A 2IIYA 5ELAA 1Z3EA 3TJKA 3IC4A 3H1NA 3Q19A 4KSMA 1PA3A 1GSUA 1GTIA 3G9BA 2NBSA 2XBQA 1QUWA 3ZL5A 1GWCA 3J7Yb 3ZLPA 3UVHA 1EGRA 1V98A 2OACA 3TJBA 2LV3A 4KDYA 4H86A 2OBIA 1DBYA 4EUYA 2MBSA 1YDKA 4KB3A 1FVJA 4V1Ap 2L5LA 1EP8A 3FZ5A 3F4TA 4V2LA 4ACSA 2YV7A 4GXZA 4HZ2A 2CVDA 2H19A 3ME7A 4NHZA 1XW5A 3KH7A 1YEXA 5F06A 1T8EB 4I8BA 4IQAA 1S3DA 3W6GA 2F8FA 5A5KA 3DIEA 3FW2A 5IM9A 3F6DA 4PX1A 2C1YA 1W89A 3GX8A 3PR8A 2ES7A 3I6AA 1T4ZA 4EDZA 4XCSA 4F0CA 2YN1A 5D9XA 2X99A 2WGRA 3GTUB 3F3RA 4ZB9A 3APSA 1HNBA 1YKCA 2YNXA 4FYCA 3UBLA 6GSVA 4PGTA 5GSTA 5ECQB 3GFKA 4FYUA 1JFUA 4OO4A 1T3BA 1GSFA 1V58A 1A0FA 1TW9A 4WF4A 2C0FA 1XFLA 4ISDA 1SK2A 2AAWA 2V6KA 2VL2A 3U5RE 2IMEA 3LFLA 3Q6OA 1FAAA 5IMCA 1O81A 1TRVA 5CRGA 1TK0B 1GTBA 3LYKA 3G7JA 3ERWA 2VM2A 3F6FA 3FZ9A 3U6VA 1HNAA 2JU5A 4PURA 4XS4B 2FCHA 1SKSB 2C0DA 22GSA 5ABRA 1G0TA 2FGXA 1Q98A 2GLRA 2V2GA 2E0QA 4MZCA 3TUEA 1N2AA 2N5FA 2YANA 3LEFA 1AQVA 2FLSA 4F0BA 4IW9A 4DVCA 3KXOA 5CREA 2R4VA 1KEBA 2HLSA 3APOA 3RAZA 4CHSA 5IMAA 1I9DA 3CRUA 1K3LA 3TB2A 1XVQA 3K8NA 1YF1A 1USBA 1TRSA 3F63A 1EGOA 3BCKA 1ZGNA 3W8JA 4FYBA 8GSSA 1MTCA 1J0FA 1SU9A 5IIZA 3UVTA 4BVYA 1K0DA 4GLTA 2JZSA 3FZ4A 5JCWA 3QD9A 1GLQA 4ZILA 2R37A 1RK4A 1O8XA 2FWGA 3H79A 2YWIA 2VO4A 5L71A 3L9UA 5KN1A 2JL4A 2PBJA 3CSJA 1WWJA 1A2MA 2C0GA 2C3QA 3L78A 5ECMB 2LNTA 1T1VA 5D8IA 1BJXA 3C73A 3H4KA 3L9SA 1A8YA 5CP1A 1T00A 2CZ3A 5IQYA 4Q5RA 5B8BA 4F03A 1TJDA 2CX3A 2FWEA 3FY7A 2F8AA 1QMVA 4HQSA 1K0CA 5F0GA 2C8UA 1TU8A 1SL1B 5G1LA 2K8SA 5ECIB 5D96A 3HVSA 2V1MA 4MMMA 4MCUA 4ZL8A 1OKDA 1KBNA 1XVWA 3QAWA 1OKTA 3IK9A 4KW6A 3KP9A 1HD2A 2B1KA 2LRNA 4TW5A 5G5FA 1GL8A 5JWQB 2KLXA 2V41A 2H72A 3DMLA 3GKMA 3VWXA 2FUG2 1ILOA 3OR5A 4QQ7A 4X43A 5HQPA 2XBIA 4AJ7A 2P5QA 4FH8A 3FR3A 2WDUA 1M9BA 4FO5A 2H73A 5EY6A 3APQA 2L6DA 2X8CA 3LSZA 3IK7A 4RI6A 1YQ1A 3V1WA 4BVXA 1ST9A 4MA9A 1G6WA 1SYRA 1U3AA 2GTUA 3WYWA 2VL2C 1EP7A 1GUKA 3M9KA 3TRQA 1PKWA 2DIYA 4E8HA 1F37A 3KH9A 3LGCA 4JBBA 2ON7A 3Q74A 3A2WA 3QDNA 1EV4A 1THXA 2GT6A 2VL9A 1AQXA 4ZBAA 5LNKe 1Z6NA 4TKYA 2H0GA 3D6IA 2JSYA 1S3CA 2IJYA 5DALB 5KEJA 1GNWA 5G5EA 3FK8A 5ID2B 2HSHA 2J9HA 4XS1A 3QFBC 7GSSA 2CV4A 2CAIA 1X0RA 4OCFA 1H75A 1PSQA 1GP1A 3J7Yk 4I97A 2RM6A 4TR4A 4E8EA 4K6XA 4AGSA 5EVOA 3GH6A 1PN9A 1OC8A 2X64A 1J08A 2GGTA 5B6NA 4GCIA 3O76A 4XRAA 3KD0A 3ED3A 2B6MA 2QC7A 4RQRA 3QAGA 3ERFA 4NPBA 2LKUA 4TR1B 2VOCA 3IAM2 5D9TA 1X9WB 4KNDA 1ZYQB 1PMTA 2YP6A 5JCUA 1EWXA 2E2MA 1XW6A 3ZIVA 3IR4A 2IL3A 1MEKA 2WB9A 1WE0A 5CO3A 5AGYA 1DUGA 2DLXA 3HZ8A 2GSSA 4PQ1A 3GL3A 5ECNB 3VURA 2GQKA 4GRFA 2E7PA 3HDCA 5FWGA 3LORA 2HZEB 2LEGA 2OADA 3EWLA 2IMDA 5ECKB 1E6BA 1SYXA 5B6MA 1AIUA 5DQYA 3E3EA 3FR9A 4IN0A 3KIJA 3IAS2 3DD3A 2B7KA 4ML6A 3VI5A 2C3TA 1A0RP 4IP6A 1EEJA 5F07A 5CYYA 1ZZYA 3VK9A 5DJLA 4NAXA 3G7YA 1HQOA 4IS0A 17GSA 5D9VA 1GRXA 4KX4A 1WIKA 3M3MA 1XCCA 1MD4A 4LL4B 1X5EA 1CQHA 2H1BA 5J5NA 3IDVA 1XIYA 2AB6A 1OC9B 3RHBA 3VWVA 1SENA 4RI7A 4WKWA 4DSRA 1SJ6A 3ZTLA 4MLYA 2MMAA 1OE7A 5H5QA 3SWLA 1Z9HA 4GSNA 2HZFA 3BJ5A 3VWUA 2ZUPA 2RUEA 1A8LA 1X5CA 3KTBA 3UMAA 2RIIA 4L0UA 2L5OA 2DIZA 3GSSA 1AUCA 1SJIA 1XWKA 9GSSA 5GSSA 3UBKA 2N5AA 1M7TA 4N30A 4ECJA 1TK8B 2QKEA 2NTOA 2WRTA 1NM3A 2RLIA 2R6KA 4FIWA 2PGTA 3O3TA 5HFIA 3EMPA 3HJPA 1I5GA 1QQ2A 5ECRB 3D4TA 3D5JA 1F3AA 4WEYA 4WXTA 2A2RA 5AISA 1TU7A 2M80A 3VPQA 3EYTA 1OVNA 2I3YA 3JCML 1AQWA 3C7MA 4N0VA 2FY6A 1ERWA 2DJJA 3GKNA 4DSQA 1V2AA 1BG5A 19GSA 3CYNA 1MDIA 3C1RA 5CRHA 3BOAA 2JZRA 3I69A 2VL3A 3PH9A 2H66A 2VCQA 4I6XA 3D21A 1F2EA 3GH9A 1URMA 3EURA 2DJ0A 2HI7A 3TCOA 4KDXA 4IQ1A 2VAFA 4GSSA 1M2BA 5DCHA 1VF3A 3F8UA 3VI7A 1Z6MA 2GT5A 4GSTA 5G31A 5G2ZA 1WOUA 2WFCA 1TI3A 3HJMA 3TKQA 1EOHA 3MAKA 2CA8A 4YAVA 1UC7A 2XPDA 5E4WA 1ZMAA 2WULA 5ELGA 2C0EA 4PQIA 2TIRA 3VLNA 2B5XA 2H1AA 3HHVA 3IA1A 2B5EA 3EU3A 4TXVA 2IN3A 4Q5FA 5JCGA 3DGQA 2IWTA 4Q5NA 3PINA 4HS1A 3NIVA 5H5SA 4ZBDA 1QFNA 4EO3A 2FWHA 3P90A 1ON4A 4IJ3A 3TKSA 1R7HA 4K7IA 2H74A 1UVZA 1ZL9A 5FT3A 2MYGA 1THOA 5HR2A 5IMVA 2GZYA 4JR4A 3DKSA 4JEDA 3KM6A 10GSA 1M99A 2AYTA 3UARA 3ZFBA 1XW9A 3WT1A 5ENUA 2DMLA 3Q18A 6GSSA 2LJRA 2N5BA 1FOVA 4QL7A 5DVBA 4K7NA 1RW1A 3LWAA 2FA8A 18GSA 4OO5A 5AIXA 5A4VA 1X5DA 5D73A 2GSRA 3CRTA 3VFIA 2KOKA 2O87A 4D73B 2VCZA 4KA0A 2L6CA 2P5RA 1U3IA 3L9VA 3GHAA 4I5QA 4MZWA 2LJAA 2X8HA 3TRPA 1XWGA 3D0ZA 3KEBA 3EE2A 4K0GA 4XS4A 4HJ2A 3N9JA 2B3SA 1QXHA 3EMXA 5DJMA 5A4WA 4PNFA 5J3RA 4ILFA 3IPZA 2LQOA 2EC4A 3GKKA 3IE3A 4MPGA 4EKZA 1TRWA 2C80A 4ZBBA 2EIOA 4EDYA 3M1GA 1K3YA 2H6ZA 2P31A 5J9CA 4G10A 4YQUA 4I2UA 1B8XA 3HJOA 3GMFA 3TKRA 2QGVA 3P2AA 4O5RA 5B7CA 2LUSA 4LMVA 4KSOA 1XZOA 2JZTA 3QMXA 2HE3A 1PQNA 3P8WA 4HEA2 4RQXA 3HZ4A 2J23A 1GH2A 1CQGA 3GN3A 2WS2A 4IJIA 2DJ1A 3UL3A 2KP2A 2L59A 4IKHA 4OD7A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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