3IXRA

Crystal structure of xylella fastidiosa prxq c47s mutant
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
161
structure length
159
Chain Sequence
b'GSHMNIGDTLNHSLLNHPLMLSGSTCKTLSDYTNQWLVLYFYPKDNTPGSSTEGLEFNLLLPQFEQINATVLGVSRDSVKSHDSFCAKQGFTFPLVSDSDAILCKAFDVIKEKTMYQVIGIERSTFLIGPTHRIVEAWRQVKVPGHAEEVLNKLKAHAE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Biochemical and Structural Analysis Indicates that PrxQ, a Cys Based Peroxidase from Xylella fastidiosa, possesses high reactivity towards hydroperoxides
rcsb
molecule keywords Bacterioferritin comigratory protein
source organism Xylella fastidiosa
molecule tags Oxidoreductase
total genus 55
structure length 159
sequence length 161
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ixrA00
1MDIA 4XS4B 4TN8A 3Q18A 3CXGA 1HNCA 1EOGA 1SK2A 4MMMA 2A2RA 4I8BA 4FYBA 3AY8A 1BX9A 2WCIA 5HFGA 3C7MA 1ACVA 2MMOA 4HZ2A 5L71A 4V2NA 3MDKA 5AIXA 5INYA 3KXOA 5A5KA 2B6MA 3EMPA 3UAPA 3NOFA 2LS5A 2YJ7A 1PD21 2LSTA 1PL1A 2C0FA 3LSZA 4JU5A 3GMFA 3TKRA 1ABAA 2NBSA 2HFDA 2AJQB 2P5QA 1ILOA 2V41A 1M2DA 3IV4A 2H19A 2LQQA 4RUVA 3M9KA 6GSVA 1ZCPA 2PU9C 3GH9A 4WR4A 2VCTA 2VLTA 5HFIA 5HR3A 1FHEA 2YZUA 2CX4A 2L6DA 2IJYA 4BA7A 4QQ7A 1YEXA 1EGRA 1T8EB 1ZYEA 2AHEA 1G0TA 2G0FA 4HS1A 1EEMA 1XCCA 3BCKA 3M3MA 1YDKA 2LJRA 2JADA 4E8HA 1SJ6A 1X5DA 1K0AA 2I9HA 3KMNA 2VCWA 4LA1A 4N10A 2E2MA 2QGVA 4XS6A 5F05A 1TJDA 4MJBA 4OCFA 1AIUA 2A4VA 10GSA 3E3EA 4OO4A 1T4YA 4OFMA 4XCSA 2HRNA 1W89A 2YN1A 1VRSD 4HU7A 3DIEA 2WB9A 4L8EA 2B3SA 3DKSA 4JR4A 5B6MA 5DALB 1OKTA 1SK1A 3EWLA 2B1KA 2H01A 5EVOA 1MTCA 3IK7A 5A4WA 6GSSA 1DE1A 1R26A 2FWFA 1OYJA 4GXZA 4EC0A 2GGTA 4XRAA 2R4VA 3UVTA 3GSTA 2H1AA 3V1WA 2RUEA 2YWOA 4I97A 1THXA 2FLSA 3VLNA 1GULA 4EO3A 1AC1A 13GSA 1M9AA 5F8BA 4OWYA 2QC7A 5EL8A 1ZMAA 3D6IA 1SJZA 3EYTA 2V32A 1TRVA 2H66A 3GURA 3ERWA 3A2WA 3FRCA 4KCAA 3CSIA 2KUCA 3EINA 1OE8A 2HI7A 2K8SA 4F0CA 3BBYA 2N5FA 2FHEA 1YZXA 3G7IA 5D73A 3UBKA 3VWVA 1KEBA 4EF0A 4J57E 1G6WA 1T1VA 4LL1B 5LD0A 4OO5A 3KH7A 1ZOFA 3W8JA 4ECJA 4KCEA 2KOKA 2C3QA 1GSFA 1B48A 4FYUA 3TKSA 3C8EA 3IE3A 2GSQA 3DMLA 1GLQA 4MJEA 5KEJA 3UOMA 4TXOA 4GSTA 5ECNB 5AIVA 4MCUA 2H6XA 3DWVA 4ZB9A 2H1DA 2VL2A 3APSA 4XRDA 1F3AA 4GSSA 1OAZA 1O7UA 3GTUB 3PINA 4HU9A 1UN2A 4X1UA 2HNLA 2R37A 1UA5A 2VOCA 1N2AA 1TOFA 1K3OA 5IMZA 2RM6A 1RQMA 5EY6A 3GRXA 3O6TA 3H1NA 3GV1A 3C1RA 1JLVA 1G7EA 2WS2A 1F2EA 3A5WA 4DSSA 2GSRA 3DYRA 1AQXA 3D0ZA 5CRWA 2VCZA 5ECQB 1BEDA 2VM2A 2CVKA 4XS4A 7GSSA 2M80A 4WF4A 3TJFA 5DAKB 1DUGA 2X64A 5B6NA 1OE7A 1TP9A 1PX7A 4ML1A 2CX3A 1MEKA 1PKWA 1T00A 4TR0A 4L5OA 4YH2A 4BVYA 2L5OA 4PX1A 3RPPA 1U3IA 2GDRA 4XIHA 3HDCA 3H79A 2VL3A 3WGXA 2H73A 2TIRA 2H72A 2WRTA 2YWIA 2K8VA 3LWAA 1FB0A 6GSTA 5F0GA 4KDYA 3DVWA 2X99A 3FEUA 4K6XA 4DSQA 3APQA 4EVMA 3KM6A 1VGLA 1WRYA 3ZYWA 4NV5A 1ZGNA 17GSA 4EDYA 4RQRA 1HQOA 1XZOA 1SKRB 3HCZA 1J9BA 4LMVA 5KN2A 2HSHA 2XC2A 5ECKB 4TR4A 1BYEA 3W6GA 1QFNA 3QFBC 1V9WA 5LCZA 1DBYA 2LJAA 2LQOA 4BVXA 3CRUA 8GSSA 12GSA 1S3CA 2L4CA 4BPYA 2KLXA 4MK3A 2GS3A 4IN0A 3Q6OA 4GQCA 3D4MA 1M2AA 4ZBAA 2EIQA 4POBA 4H86A 2GQLA 3VI5A 4AJ8A 5G1KA 5G2ZA 3GX0A 1GSDA 2GVPA 3O76A 1U87A 3GA4A 3WGDA 4EKZA 2OE1A 4GSNA 5ELAA 2P5RA 2VUPA 4RQXA 4N11A 1RK4A 1GUKA 3APOA 4G9HA 1EZKA 5DJMA 3ERGA 4O5RA 3ZL5A 3TJJA 1XXUA 2H0IA 3UMAA 3ERFA 4MP4A 5DCGA 2HYXA 3FZ4A 4TKYA 1X9WB 1VF4A 4PNGA 3GN3A 1A2MA 2F8FA 4IP1A 2IMEA 5J3RA 1GUMA 1THOA 2E0QA 2REMA 5IIZA 5C04A 1SKWB 3PGTA 1M9BA 4YAPA 1X5EA 14GSA 2O89A 1TK5B 4O7HA 2IWTA 1YQ1A 3TRQA 2GZYA 4WXTA 5KN1A 3J7Yb 3F6DA 2CQ9A 2PMTA 2DC5A 3QDNA 4HI7A 4L0WA 2PGTA 3F8UA 3C73A 4MJCA 2VLVA 1PL2A 2XPEA 4JE1A 1K0CA 3D5JA 1XBSA 1XVQA 1GSYA 5ECHB 3BCIA 3GTUA 4TVEA 4LMWA 1SL2B 1T7PB 4ULXA 1EOHA 3LEFA 4WKWA 1SYXA 4N30A 1FAAA 3S9FA 3VURA 2GLRA 2M46A 4JR6A 3F4SA 5JCUA 4G2EA 4KA0A 1F37A 2KP1A 3W8SA 5CO3A 4ISDA 3D4TA 1OC8A 1X0RA 1TK8B 3M0FA 3VWUA 1WIKA 2LJKA 3E9JB 4FYCA 1R5PA 1O81A 3TKQA 1TK0B 3HJMA 3KH9A 1QMVA 2EIRA 3QPMA 4I5QA 4IBPA 1I9DA 2LRNA 5DAKA 5D9TA 3O3TA 1XW5A 3DVXA 3TKSC 2H0HA 2QKEA 4KAEA 2C80A 3QCPA 2DJJA 2H0GA 3IDVA 3FR9A 3HHVA 3JCML 4FO5A 3TOTA 1AXDA 3ED3A 2VL2C 1TRSA 4F2IA 3HY2A 1U6TA 4HZ4A 1XWBA 2FY6A 4IVFA 2I3YA 3FKFA 6GSUA 3D22A 5AISA 4ECIA 3CTFA 3GFKA 4Q5QA 3VWXA 2HXKA 3GYKA 1Z6NA 1JHBA 2RIIA 3F6FA 5FWGA 3TOUA 5B8AA 3ZREA 3TUEA 1IYIA 1WJKA 3GX8A 3VPQA 1GSQA 4POKA 2DJ2A 2VM1A 4NAXA 3HYPA 4TOPA 2A2SA 3L9SA 4MLYA 4YQUA 4OMVA 2JSZA 4HQSA 3FZ9A 4FH8A 2AUVA 1XVWA 1XOAA 2I4AA 4IHUA 1MDKA 1C72A 4K7OA 5C00A 4NV2A 2L59A 3EU3A 2OADA 4RI6A 2YV9A 2LEGA 2FUG2 3GH6A 3CTGA 1I5GA 4MZCA 4EUYA 3VK9A 4V1Ag 3GL3A 1M2BA 4LLRA 1PKZA 2AB6A 3A2XA 4XHMA 3QAGA 4EXJA 3RHBA 2CAQA 2PVOC 1ERUA 2VAFA 1FB6A 1E2YA 3DD3A 2JZRA 4PUFC 1WWJA 1EV4A 3IHQA 5IMVA 22GSA 2M72A 2JL4A 4F9ZA 1SENA 4KSOA 1WMJA 4DSRA 3HA9A 3ZZXA 1T4ZA 1YKCA 2LRCA 1J0FA 1GWCA 3PH9A 4PUAA 4ILFA 4NHWA 2FA8A 1S3AA 3HVXA 2LUSA 2PN8A 3ME7A 4MF5A 4WETA 3ZVJD 2H8LA 2ON5A 1YY7A 3IAM2 1IYHA 5IQYA 5IOWA 16GSA 1BAYA 1SD8A 3G7YA 4BWQA 4KB3A 4JEDA 1EGOA 4KX4A 3KGKA 4WF5A 1HNAA 1PRXA 1Z7PA 5D9WA 1Z5YE 4BWSA 1KTEA 3SWLA 1LBKA 2OKAA 3F4TA 2Z9SA 2I1UA 2IFQB 2IMFA 4XTSA 1B9YC 1XWCA 3P8WA 1QGVA 2VD0A 2ES7A 1GNWA 1CQGA 2CA8A 1EP8A 4TR1B 2VLUA 1GSUA 3Q74A 5F07A 2LRTA 3FW2A 1NHYA 3GKMA 3HD5A 3IOSA 1X9SB 5HR2A 2IL3A 4MABA 4NPBA 5IM9A 2GQMA 4G10A 1FVKA 1TI1A 3TRXA 1JZRA 4MPGA 1EV9A 1XW9A 5ECOB 3P2AA 1LU4A 3L9VA 3HVVA 1A8LA 4ZB6A 3H4KA 4I6XA 5GSTA 2ALBA 4KGIA 2YWMA 3ZLPA 1XPVA 4AGSA 3I9V2 2DIZA 2ZUPA 5D9VA 4V2MA 2YNXA 3H8QA 5GAND 1ERVA 1F3BA 3LJRA 1O73A 3C71A 2IMIA 1A0FA 4ZXGA 3RBTA 2ZNMA 3ME8A 5J9BA 2XPDA 2X8CA 4CDOA 5ECLB 4TW5A 3GSSA 3WT1A 1K0MA 2HRFA 1OC3A 1WP0A 1AUCA 2B1LA 4PNFA 1F6MC 4K8MA 3ZMKA 2NDOA 2BMXA 1A8YA 1Y6EA 3GKKA 3GUSA 1UC7A 3KD0A 4JBBA 3EVIA 4BL7A 4KE3A 1SKSB 1K3YA 3ZTLA 1TXXA 1TI3A 3DRNA 3TJKA 4O92A 3U5RE 2B5XA 1Y25A 4NMUA 4KSMA 2WZ9A 2CVBA 3TB2A 1H4OA 2YOIA 2LNSA 4K0GA 4K2DA 3I43A 4POMA 3KJYA 3IBHA 1B8XA 1JFUA 4QL9A 4IKHA 2TRCP 3Q19A 4MDCA 4MF7A 3CRTA 3GHAA 1K0OA 1JZOA 3WD6A 2EC4A 2PPTA 3LG6A 1YF1A 3L9UA 1PX6A 3KTBA 4ID0A 5HFKA 1GP1A 2OBKA 4WBRD 3DEXA 2MBTA 2FWHA 2O8VB 6GSYA 2PWJA 4ZB8A 4EE0A 1GRXA 2VCVA 1J08A 1N8JA 3IXRA 4GWRA 2R5GA 2FNOA 5ECIB 4L0UA 2FWGA 4I2UA 1Z6MA 3FK8A 3LXTA 5DALA 2R3XA 4K7IA 1PSQA 4POLA 1O8XA 2LTKA 2C0EA 4K1FA 2CV4A 3HXSA 4IJIA 2B7KA 3PR8A 2RUFA 1SD9A 5J9CA 1USBA 4N0ZA 3HJPA 2L5LA 4NWYA 4X43A 1KBNA 2MBSA 1DSBA 1ERTA 4O32A 2V2GA 3ZIVA 3GKXA 3KP9A 1XFLA 5CP1A 2XBIA 1HNBA 5ECSA 5ECRB 3FZAA 1VF3A 1ERWA 5IPHA 1AAZA 5KN3A 4OFTA 1U3AA 4J56E 2OJLA 5DQSA 4V2LA 3LQ7A 1FVJA 4TRXA 2DMMA 3QAWA 4NHZA 4KDXA 4OFNA 4QL7A 5ECMB 2LV3A 5G30A 2FCHA 1OVNA 2VCQA 2IFQA 4JRRA 5B8BA 1R5AA 4EL1A 3LGCA 2C3NA 1DE2A 3TJGA 2MMZA 2NVLA 2L57A 3N5OA 4ECBA 3MSZA 2KHPA 4HJMA 3VFIA 4MA9A 4PQ1A 4TR1A 3F3RA 1AW9A 3WT2A 2XBQA 1FG4A 2C0GA 1XWGA 1XWKA 3L78A 1JLWA 1FO5A 2MMNA 3GIXA 5D93A 3UBLA 1SJIA 3WGEA 2DSAA 3QFAC 2H1GA 3KEBA 1R4WA 3IPZA 2CT6A 5ECPB 1B4PA 3EE2A 3F3QA 1TRWA 3ZFLA 1A2LA 2GT5A 2N5BA 1NM3A 4HJ2A 5G5EA 4GF0A 1YKAA 1ML6A 3ZMLA 1GNEA 2WFCA 3ISOA 5J4UA 3QMXA 3BOAA 5CRHA 3WYWA 3NZNA 3ZITA 1ZL9A 1ZYQB 4Q5FA 1G6YA 2YPMA 3GL5A 5IOXA 3TRPA 1LJRA 3QAVA 4Z7XA 3FYGA 3EURA 4F0BA 4F82A 3DGQA 2LKUA 3HZ4A 1Q4JA 4F03A 1PN9A 5IMAA 2WGRA 4AF2A 1GSSA 5D9XA 2AYTA 1VF2A 2HLSA 1V2AA 3I69A 3VPTA 4ML6A 5CAXA 2DLXA 5GSSA 4GQFA 4J2FA 5ENUA 4FIWA 2F51A 4L5LA 4PQIA 5G31A 1PQNA 1ST9A 1GTBA 4AJ7A 3A3TA 1SL1B 3KMOA 1BJXA 1MD4A 3VWWA 2VCXA 2C1YA 1RW1A 2XHFA 3UJ1A 5CRDA 2O85A 1QUWA 3ZIJA 5JWRB 5CYYA 2E2GA 4HQZA 2OE3A 1TTZA 5IO0A 2L6CA 4K0NA 3EMXA 1MD3A 2WULA 3FHKA 2ON7A 2VL9A 4ZIJA 2GSTA 2GQKA 4OD7A 2G2QA 1SL0B 1R7HA 5E4WA 3KCMA 4HEA2 2TRXA 2L4QA 1X5CA 3IAS2 3BJ5A 2LNTA 4HUAA 2IMKA 5J5NA 1GLPA 1GH2A 1CQHA 2OA7A 1GTUA 2IMDA 3LYPA 3GKNA 4GCIA 2RM5A 2C4JA 4DVCA 4E8EA 1QXHA 2VO4A 3M8NA 9GSSA 2F3MA 2DIYA 3HKRA 2KP2A 1JZWA 2CVDA 3IK9A 2GZZA 4MH3A 2C0DA 2R6KA 3KP8A 2FWEA 3I6AA 3F9UA 4CW9A 3E0UA 3CSHA 4ZL8A 3TJBA 1XW6A 1HD2A 3MNGA 4IW9A 2O87A 5GZZB 1WPIA 3SBCA 1MDJA 4ZBDA 3UIWA 2B5YA 2JU5A 5JWQB 5DQYA 4IQ1A 2YWNA 1YEPA 4HOJA 2QSIA 1V40A 2H6ZA 1TKDB 2F9SA 5JCGA 2IN3A 5A4VA 2H74A 4KUNA 5COHA 4K9ZA 2AAWA 3NIVA 3GNJA 2CAIA 4GLTA 5F06A 4LL4B 19GSA 3UEMA 5LNKe 4ZL9A 4K7NA 4PXOA 4MJAA 2X8HA 2NPBA 1TRUA 2C3TA 6GSWA 3R2QA 4D73B 3F4RA 1NHOA 4N0VA 2K18A 1ZZYA 2H1BA 3CBUA 4KW6A 2V6KA 4YAVA 4MPFA 3QOUA 5CRGA 5G1LA 3QR6A 4MZBA 3K8NA 2V6OA 4PQHA 4PURA 1URMA 3FR6A 3M1GA 4ZBBA 1KNGA 5DCHA 5CNWA 2K6VA 1EP7A 3BD2A 3N9JA 5HR1A 3L0HA 3RDWA 4IS0A 11GSA 1G7OA 1K0BA 2FGXA 3HZ8A 3EC3A 2GTUA 5G5FA 3ZRDA 2DJKA 5IMDA 2YANA 1OC9B 1GTIA 1UVZA 2VIMA 2B7JA 1TU7A 3LYKA 2DJ3A 1TDIA 1M7TA 4KNDA 1H75A 1XOBA 4IP6A 1E6BA 5AGYA 3TKSE 3DXBA 3TKPA 1A24A 4PGTA 2HZEB 5D8IA 2YJHA 4P3YB 2GZPA 2H70A 4DEJA 2IIYA 3OR5A 1VF1A 3IA1A 5ID2B 2YZHA 1FW1A 3P90A 3FZ5A 5IPGA 5ELGA 2PUKC 3KTLA 2JZSA 5IO2A 2GT6A 4MZWA 3A2VA 4YQVA 5JWOB 3US3A 1Z9HA 1GUHA 2X8GA 1PMTA 4WEYA 5B7CA 1SYRA 2MMAA 4IQAA 4V1Ap 1TW9A 3F0IA 5J41A 1EWXA 2OACA 1Z7RA 5H5QA 2P31A 2H30A 4NXIA 1BQ7A 2OE0A 1OKDA 2O7KA 4EDZA 1TU8A 2H6YA 1O6JA 2PVQA 3LXZA 5KN0A 1T3BA 2ZCTA 5DDLA 3F63A 1QQ2A 3RAZA 3VI7A 2OBIA 5IMFA 2YCDA 2V1MA 4TXVA 2CZ3A 3CMIA 3H93A 2HE3A 2JSYA 2CZ2A 1K0NA 2H76A 3CSJA 2P0GA 4KH7A 2BTOT 5ABRA 2JACA 3G9BA 3UL3A 18GSA 5E59A 4KDUA 4JZQA 3HVSA 4RI7A 2MYGA 1U88A 2FA4A 3LORA 1Z3EA 3U6VA 1O8WA 4GTUA 5DVBA 1B9XC 4WBJA 4XS1A 2R2JA 5FHIA 1A2JA 4OCEA 2J23A 1S3DA 5DBQA 1NW2A 1GL8A 2VD1A 3TCOA 1M0UA 1A0RP 2WJUA 4ACSA 3MWHA 4Q5NA 4MF6A 3HJOA 1V58A 3TGZA 2DBCA 3M9JA 4CHSA 3MAKA 4HDEA 3J7Yk 1XIYA 5JCWA 4Q5RA 1ON4A 2B5EA 4ECCA 4GRFA 4IELA 4IGJA 3RHCA 2I81A 3G7JA 1F9MA 3C1SA 5H5RA 1AQVA 5AN1A 5GAPD 1PA3A 1GSEA 3D21A 2EIOA 4X0XA 1W4VA 4I2TA 1QK8A 1Q98A 1M99A 5EPFA 2YV7A 2E7PA 2HSYA 2WDUA 3KZQA 3RPNA 5HR0A 1BG5A 4AJ6A 2N5AA 3IRAA 3TDGA 2DMLA 2D2ZA 3EU4A 2HT9A 1PGTA 2C8UA 3IC4A 1HYUA 1FOVA 4D73A 1WE0A 3KIJA 2AV4A 5IMCA 3IR4A 2JZTA 2GSSA 4IJ3A 3UARA 1X9MB 1YF0A 5CREA 3LFLA 2J9HA 4YQMA 4ZL7A 4TR3A 1XWAA 1WOUA 3ZVJA 2YP6A 1EEJA 2MZCA 1YJ6A 5FT3A 5H5SA 2K9FA 1SK0A 4TXOB 2H71A 5D96A 2DJ0A 1OC9A 2H75A 3QD9A 3FR3A 4WR5A 1K3LA 2FD3A 1V98A 3FY7A 1A23A 1GTAA 2F8AA 2DJ1A 1AQWA 1JZDA 20GSA 5A4UA 1K0DA 2PBJA 2HZEA 3UVHA 3L4NA 1O85A 2HZFA 1NSWA 4ZILA 2RLIA 5DJLA 5HQPA 4DSSB 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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