1TI3A

Solution structure of the thioredoxin h1 from poplar, a cppc active site variant
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
113
structure length
113
Chain Sequence
AEEGQVIACHTVDTWKEHFEKGKGSQKLIVVDFTASWCPPCKMIAPIFAELAKKFPNVTFLKVDVDELKAVAEEWNVEAMPTFIFLKDGKLVDKTVGADKDGLPTLVAKHATA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Solution structure of a natural CPPC active site variant, the reduced form of thioredoxin h1 from poplar.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords thioredoxin H
total genus 32
structure length 113
sequence length 113
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-06-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1ti3A00
1GL8A 2R5GA 3ERGA 1GTIA 3VWXA 2FA4A 3JCML 5D9TA 2JZRA 3KEBA 1THOA 1SU9A 4JRRA 1WIKA 1TRSA 2ZNMA 1V98A 3D4TA 4XRDA 2JACA 1AIUA 2DIYA 3A2VA 4IBPA 5AISA 3DYRA 1XCCA 3UEMA 4IQ1A 2K9FA 3HYPA 3G7JA 3RBTA 3FR9A 2IFQB 2DJJA 4MLYA 2DJ2A 1SD8A 2RUEA 2TIRA 3ERWA 5HR2A 5ID2A 3ZIVA 2GLRA 4G10A 3FZ4A 2DMLA 1E6BA 14GSA 3BCKA 4FYUA 1GSYA 4HI7A 1YKAA 2YZHA 4O32A 4ZXGA 3C7MA 1BG5A 2DMMA 4OCFA 2RUFA 3GX0A 4ZB8A 5G5FA 1XIYA 2V6KA 1ZGNA 4OWYA 3FY7A 2B5YA 1VF4A 3IOSA 4HOJA 2V2GA 3NIVA 5DCGA 5A4VA 1B9XC 1EOHA 1F9MA 2PBJA 3DD3A 2Z9SA 3APOA 3CSJA 4MH3A 3GKMA 4ZILA 2OACA 1R26A 2B5XA 1YEXA 4KW6A 1T7PB 5D9WA 3TKSA 1FVJA 2YWNA 4ZL7A 4IS0A 3A2XA 4YQUA 1SK2A 1U3IA 5IMCA 2H72A 4V2LA 3IRAA 5D96A 3TJBA 3F3RA 1BAYA 5G31A 2NVLA 1OYJA 1RK4A 2PPTA 1K0CA 4V2NA 1YKCA 4TVEA 3GNJA 4V2MA 1ERVA 1Z7PA 5IPHA 4L0WA 2QC7A 2LQOA 4HUAA 2JZTA 3IE3A 3P7XA 3GV1A 1GULA 2QKEA 4GCIA 3UBKA 1XVQA 2IWTA 2GVPA 3D22A 4POLA 1NHOA 2YANA 1FG4A 1M9AA 1HNBA 1SK0A 2HT9A 4KB3A 4DVCA 1GSFA 3WD6A 3TKSE 4TXOB 3HJOA 4HQZA 3W6GA 3GIXA 2HRFA 3VI7A 5HR0A 1DE1A 2KP1A 4TKYA 4CHSA 2H0IA 5ECIB 1A8YA 2LKUA 3ERFA 2IL3A 2PVOC 3GA4A 5ECHB 3FZ5A 1AC1A 3WT2A 1HNAA 2MYGA 4GLTA 1AW9A 1XWAA 5DAKA 4ECJA 5HR3A 1BEDA 4MPGA 3KMOA 3TOUA 4XHMA 4OO5A 4LMWA 2VM1A 1V2AA 3QR6A 4CDOA 3ZREA 1WWJA 3VWWA 2MMZA 1THXA 3QAGA 4MF6A 2DSAA 3CRTA 2F3MA 2QSIA 2VUPA 2H74A 1TRWA 2O7KA 2I9HA 4IJ3A 2ALBA 2VOCA 1K0MA 2OBIA 5E59A 2CZ2A 1OKDA 4XS4B 3M9KA 5GAND 2KLXA 5IQYA 2FA8A 2A2RA 2H1DA 2H73A 4EO3A 2I4AA 1GNWA 1SJIA 2YJHA 3ZRDA 3H4KA 3E0UA 2M80A 3MNGA 3A5WA 3D6IA 2VCZA 2WB9A 2KHPA 1TKDB 3P2AA 1DUGA 5GAPD 2HSHA 3LG6A 1YF0A 2CT6A 2R6KA 1XOAA 4N0ZA 1A24A 4GWRA 1U88A 4GF0A 3IR4A 1XVWA 5CNWA 3I43A 3KCMA 1XFLA 3CMIA 2I3YA 2GZZA 1JFUA 3H1NA 4K9ZA 5CRGA 1B48A 2GZPA 3NZNA 3F4TA 1G7OA 3KMNA 1ZYEA 2PGTA 2VCXA 2REMA 4I8BA 2GSRA 2VCVA 1ST9A 3KP8A 3LXZA 3QAVA 3LXTA 1MD3A 3TDGA 2K18A 1XXUA 4GQFA 1SJ6A 3HD5A 4NPBA 2KUCA 4J2FA 2DJ1A 3M1GA 1F3BA 1G0TA 3BBYA 1E2YA 3TGZA 2DBCA 3WGXA 4QL7A 3GTUB 3P90A 4DEJA 3KIJA 5HR1A 1ZL9A 5IPGA 3HJPA 2LQQA 5ECKB 2R2JA 2PVQA 3KP9A 4KDYA 2IMDA 3KZQA 3UBLA 4PQ1A 4N30A 2LRNA 5D73A 5ECSA 4KNDA 2AHEA 4O7HA 5G1KA 4D73B 1GUKA 5ELAA 1QFNA 5ECQB 5JCUA 7GSSA 1PX7A 4TW5A 3KTLA 4MH2A 1XWGA 3GHAA 2H0GA 1I9DA 2F9SA 3EMXA 3J7Yk 4EKZA 1WP0A 3TOTA 2C4JA 1T1VA 3MAKA 2V41A 2DLXA 3F9UA 1U3AA 2FNOA 4PUFC 2GSSA 4MPFA 2VCTA 3IAS2 2YP6A 3HZ8A 4ACSA 1O8XA 4ML1A 2CAIA 1A0FA 2ON7A 4ZL9A 4JR6A 1AXDA 1YY7A 3EE2A 2O87A 3G9BA 2OE1A 4MZWA 5ECRB 1S3CA 3RPNA 3N5OA 2IMFA 4AGSA 3I9V2 2HE3A 4KDUA 5EVOA 2C3NA 4J56E 3F3QA 6GSSA 3TKQA 2I1UA 4KSMA 2KP2A 1M2DA 4YH2A 4LA1A 1W4VA 3EU3A 2DJ3A 2WULA 1M99A 1XBSA 1TU8A 4K1FA 5D9VA 2FWFA 1XW5A 1TI1A 5CP1A 2EC4A 3US3A 6GSUA 2EIQA 3UOMA 4ECBA 5IO0A 1QQ2A 2J23A 4ILFA 3FR3A 3EVIA 4WF5A 3VPTA 4KAEA 4XTSA 3L9UA 1ZOFA 1ZYQB 4HEA2 1O8WA 4J57E 4OFMA 3QFAC 1C72A 3GN3A 4AJ6A 4OCEA 5KEJA 1SYXA 4G9HA 4TRXA 2BMXA 2FD3A 4F0BA 2PN8A 3ISOA 3EC3A 1XWCA 2NPBA 3TRXA 4X43A 3GX8A 2GDRA 2H0HA 4Q5QA 3HVVA 2R37A 3FKFA 2L59A 3ED3A 3KH7A 4K6XA 2C3TA 2AYTA 6GSWA 3L9VA 16GSA 1LJRA 1BX9A 4BA7A 5HFGA 4LL4B 1MTCA 2XHFA 4POMA 3M8NA 1OC9A 2L5LA 4JR4A 3W8JA 1SL0B 1Q98A 5IMDA 1QXHA 5F06A 1GTBA 1PKZA 1ERUA 5AGYA 5F05A 2H1BA 1SKWB 2PWJA 3L9SA 20GSA 4L0UA 1TRVA 1GP1A 1JZWA 1TK5B 1UC7A 2LSTA 3KXOA 1GLPA 2MMOA 4MA9A 1XOBA 3HXSA 5DAKB 19GSA 4TR3A 4ZBBA 4GSSA 1AQXA 4ML6A 4EC0A 3FK8A 2N5AA 4HZ4A 5HQPA 3D0ZA 2LRTA 1QGVA 4EVMA 3TCOA 3F4RA 2H01A 1DBYA 4JEDA 4EUYA 1FHEA 1K0AA 2HFDA 5D8IA 1FB0A 3M0FA 4ECIA 1GSQA 3ZL5A 4KH7A 1K3YA 2P5QA 1TK0B 3H79A 5KN3A 3SBCA 1X0RA 5B6MA 5KN0A 4ECCA 2WDUA 1NW2A 2H1GA 4DSSA 2AAWA 4HZ2A 4K0GA 1EZKA 4HJMA 2N5BA 1NSWA 4MJBA 5ELGA 1X5DA 3J7Yb 1N8JA 2L4CA 4V1Ag 5D9XA 4IN0A 4TR1A 1ZZYA 2YZUA 4AJ8A 2F51A 3HY2A 3GKXA 3TKSC 4KCEA 1SL1B 3GH9A 4G19A 1TU7A 4GSNA 5J41A 1R5PA 1YJ6A 4KGIA 2R4VA 5EL8A 4L8EA 3LGCA 1B4QA 1F2EA 5IMVA 2VCQA 1Z5YE 2LV3A 3H93A 3QMXA 22GSA 1TJDA 2IMKA 4GSTA 4IJIA 5G2ZA 1JHBA 12GSA 2YWOA 4NWYA 3FRCA 3CTFA 3M3MA 1WRYA 1KTEA 2ON5A 2VLTA 4MK3A 1ON4A 2HSYA 4YQVA 3F0IA 3HA9A 2ES7A 2AV4A 1WOUA 3U6VA 3UJ1A 1HD2A 2JSYA 3ZLPA 3KJYA 3L4NA 2DJKA 1K0OA 3N9JA 4RUVA 1VF3A 5DALA 3GSTA 2CX3A 2ZCTA 4V1Ap 1XWBA 3HVXA 3IAM2 4KDXA 2JZSA 3DGQA 3LYPA 3PR8A 1K0BA 1JZOA 1PL1A 3A2WA 2H19A 2YOIA 4JZQA 1K3LA 1WMJA 3WYWA 6GSYA 1H4OA 2P0GA 3VURA 2LS5A 1SKSB 4F2IA 5IOXA 1O81A 2YWIA 3DMLA 3WGDA 3TJKA 2FUG2 4MZBA 2V1MA 5DBQA 4HU9A 1K3OA 5DCHA 2VL2C 2CZ3A 5DDLA 2YWMA 3ZZXA 5ECLB 1J0FA 1WJKA 2H1AA 1VF1A 4G2EA 3HKRA 4XIHA 2VL2A 4JBBA 3HVSA 5FT3A 3VWVA 3GYKA 1VGLA 5IOWA 5IMZA 1SD9A 2E2MA 1M2BA 4PNFA 3DKSA 5IM9A 2IMEA 4I2TA 2NDOA 4X0XA 4NV2A 2RM6A 1RW1A 3E3EA 2LJAA 4PX1A 1CQHA 1WPIA 5A4UA 1O85A 4MJAA 2E2GA 2LNTA 3EMPA 3CRUA 2E0QA 3V1WA 4RI6A 3UARA 5F0GA 1I5GA 3QCPA 3GKNA 1XWKA 9GSSA 1XW6A 5ECNB 3MWHA 2BJXA 2CVDA 3LYKA 4IGJA 3APSA 1NHYA 1Q4JA 5LCZA 3TB2A 3IK9A 1BYEA 1UA5A 4NAXA 3LWAA 3TRPA 11GSA 4MZCA 3GL3A 4K0NA 1YEPA 1QMVA 3WGEA 5CRDA 1G7EA 5L71A 2H75A 3NOFA 3IDVA 3DWVA 3GFKA 1DE2A 5DVBA 3CXGA 1TTZA 5INYA 4FH8A 5J4UA 2I81A 1MDJA 2RIIA 6GSVA 4X1UA 1Z6NA 1EEJA 2M46A 3RHCA 2GZYA 1SKRB 5AIVA 2YN1A 4KUNA 4TR4A 5G5EA 2PUKC 1IYIA 2JADA 1EGOA 4NHWA 2WS2A 4IELA 2PMTA 1HQOA 1T00A 1YDKA 3RHBA 2X8GA 2MMNA 2GS3A 2YV7A 4MF7A 4XCSA 4GRFA 4KSOA 5JCGA 1UVZA 1JLVA 2FHEA 4EDZA 2LUSA 2CVBA 1PD21 2G0FA 1HNCA 1F37A 4TXOA 3F63A 2GQMA 1X9WB 1EV9A 3KTBA 5C00A 1JLWA 4K2DA 3KGKA 2AJQB 1HYUA 4F03A 1GRXA 2L57A 3FZ9A 1M2AA 2OKAA 3S9FA 1Y25A 3TJFA 3ZVJD 3CBUA 2NBSA 1EGRA 2JSZA 4XS1A 4I97A 2FGXA 2FWHA 4O92A 5J5NA 1SYRA 2JL4A 3SWLA 4NV5A 1ERWA 1Z7RA 5ID2B 1T4ZA 4MDCA 3VK9A 5EY6A 4F0CA 1R5AA 1SL2B 2C1YA 4FO5A 3GRXA 4N0VA 5KN2A 3HDCA 4MABA 3DVWA 2CA8A 2PERA 4MJEA 4GQCA 2VD0A 4NHZA 4LLRA 1V9WA 4PNGA 2IN3A 2H6XA 4DSSB 2FLSA 2G2QA 4KX4A 4OD7A 3U5RE 4YQMA 3G7IA 1XZOA 2CX4A 3F4SA 3BOAA 2FWEA 1TOFA 4NMUA 3VFIA 1W89A 4TR1B 2YCDA 2VAFA 2TRCP 1Y6EA 2MZCA 2H8LA 3C1SA 5FWGA 1FAAA 2GSTA 2JU5A 5CYYA 4N11A 2VCWA 3HJMA 1CQGA 1H75A 3ZMKA 1MEKA 1MDKA 3PH9A 1O7UA 2FCHA 2LJKA 1S3AA 2HI7A 1FW1A 4P3YB 5H5SA 3VWUA 5FHIA 4IVFA 3ZIJA 1GSEA 5IIZA 1O73A 2H66A 3KM6A 4KCAA 2B5EA 1YQ1A 1A2LA 4F82A 4GTUA 3F6FA 3WT1A 4MP4A 5DJLA 3IV4A 4EE0A 5ABRA 1USBA 3O6TA 4FYBA 4K7OA 3QAWA 2C3QA 3APQA 2N5FA 1TW9A 1ABAA 3GL5A 3IHQA 3Q74A 3TJGA 4IHUA 4HJ2A 4TOPA 1URMA 3GKKA 4I5QA 2OE0A 3E9JB 3EWLA 5DALB 1EWXA 3UMAA 4LMVA 1WE0A 4GXZA 3IBHA 2NTOA 3C71A 4MCUA 1OAZA 5G30A 2CV4A 2WGRA 4ZL8A 1J08A 1NM3A 3GTUA 5ECMB 8GSSA 2DJ0A 2B1LA 2C80A 3C73A 2C8UA 5ECPB 2GQLA 3FHKA 2CQ9A 1XPVA 2GSQA 4OMVA 1OE7A 1PMTA 4WETA 3UVHA 4LL1B 2FWGA 3FW2A 1LU4A 3ME7A 4ZBDA 2L4QA 3QDNA 1EOGA 3LEFA 4FYCA 3LFLA 4AF2A 1A8LA 1F6MC 4BWQA 2X64A 4E8EA 3UAPA 2C0DA 5H5QA 2HNLA 1EP7A 1FOVA 4XRAA 4N10A 2VD1A 5JWOB 3MSZA 4RQXA 1PGTA 17GSA 4IP1A 1K0NA 2K6VA 3O76A 2K8SA 3QD9A 4I2UA 1UN2A 2F8FA 3BCIA 1V40A 1B8XA 2XBIA 2IJYA 4BVYA 2GT6A 2LTKA 4BWSA 3DVXA 4K7NA 2AB6A 1A23A 2GT5A 2OBKA 3ZFBA 1TDIA 1SENA 1F3AA 4KA0A 1M7TA 1KNGA 3UVTA 2X8HA 3IXRA 3D4MA 5CRHA 1B4PA 2XBQA 3VPQA 3L0HA 4QL9A 4ID0A 1LBKA 3ME8A 2YV9A 2HZEA 4TXVA 2GQKA 1A0RP 1TRUA 1BJXA 1Z9HA 4DSQA 4WKWA 1M9BA 2B6MA 3QPMA 2L6DA 2YPMA 5GSTA 1OVNA 3CTGA 4AJ7A 3DIEA 1FVKA 2A4VA 4WR5A 5E4WA 3CYNA 3RPPA 2OJLA 4WF4A 2X99A 3MDKA 4K7IA 1ACVA 3P8WA 2GGTA 2IIYA 3ZMLA 4HDEA 5DQSA 5A4WA 2C0FA 1U6TA 2H70A 2BTOT 2RLIA 3TKPA 1AUCA 3GMFA 3VI5A 5AIXA 3TRQA 2B7KA 4IP6A 3EINA 3IPZA 3FR6A 3HCZA 3D5JA 4I6XA 4XS6A 4OFNA 3IA1A 6GSXA 3R2QA 1GSSA 2VL9A 2A2SA 2H76A 4EDYA 3ZYWA 1JZDA 3BD2A 1PSQA 1SJZA 3FZAA 10GSA 2B7JA 2WJUA 1GUHA 2CVKA 2VO4A 4QQ7A 2P5RA 1GUMA 2WRTA 3O3TA 1KBNA 1OE8A 5B8BA 4BVXA 2HYXA 2WCIA 2ZUPA 4H86A 1X5CA 1TI3A 4PQHA 4Q5RA 2H30A 3I69A 4OFTA 3TUEA 4KE3A 4MJCA 4PGTA 6GSTA 1BQ7A 1Z3EA 2XPEA 3RDWA 1T8EB 2H6YA 5CAXA 1KEBA 2IFQA 5DQYA 3EYTA 3Q19A 3PINA 3C8EA 4JU5A 3GSSA 5IMAA 1ILOA 5IO2A 5H5RA 5CO3A 2LEGA 5AN1A 4DSRA 4IQAA 2D2ZA 5F07A 2XC2A 5JWRB 3HHVA 3DRNA 1A2JA 3FEUA 5KN1A 2MBTA 4EF0A 1MDIA 1JZRA 1G6YA 5HFIA 2EIRA 3QOUA 2YJ7A 1GTUA 3K8NA 2WZ9A 4ZBAA 2OADA 2HLSA 5CRWA 5JWQB 4POBA 2VIMA 1YZXA 5F8BA 4FIWA 3ZITA 5JCWA 3G7YA 3W8SA 1ZMAA 4OO4A 3PGTA 1DSBA 2DC5A 4PUAA 5J3RA 2PU9C 5ECOB 2L5OA 2EIOA 3GUSA 4ZB6A 3VLNA 2B3SA 1V57A 1TK8B 1A2MA 4Z7XA 5J9BA 5C04A 1AAZA 1X5EA 3CSHA 3EURA 2H6ZA 3FYGA 3BJ5A 1PN9A 5B7CA 1QK8A 2DIZA 2HZFA 1PX6A 1ZCPA 4BL7A 1GSUA 2IMIA 5IMFA 1OC9B 2B1KA 4HS1A 1GTAA 1PKWA 4EL1A 2E7PA 2VL3A 4TN8A 4ZIJA 5GZZB 2C0GA 2KOKA 1ERTA 3Q6OA 18GSA 4TR0A 2C0EA 2VLVA 3HZ4A 4BPYA 1O6JA 2LRCA 5DJMA 2AUVA 2J9HA 2F8AA 5G1LA 4WXTA 1B9YC 1AQWA 1GWCA 3LQ7A 3LSZA 3UL3A 3M9JA 5LNKe 3IK7A 2YNXA 5LD0A 3LORA 4Q5FA 1EV4A 1T3BA 4ULXA 1S3DA 1FB6A 3TKRA 3C1RA 2LJRA 2WFCA 2K8VA 5ENUA 3H8QA 3OR5A 2V6OA 3D21A 1IYHA 2TRXA 4ZB9A 1GNEA 2R3XA 5J9CA 4RQRA 3TJJA 5A5KA 1X9SB 3RAZA 2X8CA 5CREA 4WBRD 1YF1A 3CSIA 2P31A 1GH2A 3QFBC 1VF2A 3F6DA 3KD0A 4CW9A 2XPDA 1V58A 1OC3A 1TP9A 4IKHA 5COHA 4L5OA 4MMMA 1PL2A 3GH6A 1QUWA 4POKA 1J9BA 2QGVA 4Q5NA 3DEXA 4XS4A 2H71A 3UIWA 4WR4A 5B8AA 1OKTA 1R4WA 2V32A 1AQVA 2O85A 1TXXA 4L5LA 3ZFLA 2HZEB 5B6NA 1PA3A 3AY8A 2HRNA 2LNSA 1U87A 2VLUA 3I6AA 3L78A 3ZVJA 4RI7A 3LJRA 1VRSD 3Q18A 4PXOA 3ZTLA 4K8MA 1G6WA 1MD4A 1Z6MA 4PQIA 3IC4A 5HFKA 1M0UA 1PRXA 1K0DA 3EU4A 1EP8A 3GURA 2OA7A 2OE3A 1FO5A 4JE1A 4PURA 2L6CA 2HXKA 1T4YA 4E8HA 2O89A 2IPAA 4EXJA 4YAPA 2O8VB 5EPFA 4YAVA 1OC8A 2VM2A 4ISDA 1GLQA 2MBSA 1N2AA 2GTUA 2MMAA 13GSA 3A3TA 4WBJA 1GSDA 5GSSA 4F9ZA 2RM5A 1X9MB 3KH9A 2CAQA 1RQMA 3F8UA 4HQSA 3DXBA 2M72A 2FY6A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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