1X0RA

Thioredoxin peroxidase from aeropyrum pernix k1
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
PGSIPLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVCTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLHAESATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRSLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYEEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thioredoxin peroxidase from aerobic hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix K1
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
molecule keywords Probable peroxiredoxin
total genus 72
structure length 244
sequence length 244
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 1x0rA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1x0rA01
4IGJA 2MMNA 3FZAA 2VIMA 1OE7A 2QC7A 4XCSA 4Q5FA 1XVQA 5D96A 5EY6A 5JWOB 3RHCA 4N0ZA 5ECKB 4HUAA 2H0HA 2DJ2A 3GNJA 5ECIB 3UAPA 4KUNA 3ME7A 3UJ1A 3E0UA 2K6VA 2WGRA 1FVKA 2H71A 3RAZA 2KOKA 5IQYA 4O32A 4YQMA 3GKNA 3IBHA 3M9JA 5J4UA 4I6XA 1A8LA 4TR4A 6GSVA 1SD8A 3UL3A 3VFIA 4IKHA 5DJLA 4F0BA 5J41A 3D6IA 1YQ1A 2L5LA 1BYEA 3CSJA 5F06A 1J0FA 3SWLA 1WWJA 3LJRA 4IBPA 2ALBA 4PQIA 2V32A 3MWHA 3NOFA 4MLYA 4WBJA 1Z7PA 2ZCTA 3I69A 1SJZA 4N11A 1SL0B 2P5RA 4K7OA 2WULA 4JR4A 5D73A 1JZRA 3VI7A 3C1SA 1T4ZA 1OKDA 2LS5A 3GKMA 1YKAA 4KX4A 3A3TA 1ERVA 2FY6A 2O8VB 2YV9A 1XWKA 5KN0A 2LJAA 3LXTA 4K7NA 2YWMA 5ECPB 4L0WA 1B48A 1GNWA 4MJEA 4LA1A 4PQ1A 3C1RA 2A2RA 1PRXA 1TJDA 3G7IA 1GULA 4DSQA 2XBQA 1GUMA 5LNKe 2PVQA 1PSQA 4EDZA 5JCGA 1EV9A 5B6NA 8GSSA 1TU7A 2R2JA 2FLSA 2CZ3A 5ABRA 1R5PA 2H1AA 2K9FA 5B6MA 4LMWA 3J7Yb 3GL3A 1KTEA 3FR9A 3WT1A 3EINA 3C71A 5IMCA 4ZL7A 1Y25A 4GTUA 3R2QA 4FH8A 3CTFA 1A8YA 1WOUA 3KP9A 2F51A 2FA4A 3ZZXA 2LRTA 1CQGA 1O8XA 1TK0B 5KN2A 2YZHA 4F9ZA 3HCZA 3LXZA 1X9SB 5A4UA 2G0FA 1M9AA 3U5RE 2M72A 1X0RA 1KEBA 1B4QA 3IAM2 2BJXA 2RUEA 4GSTA 1M7TA 1OC9A 4IJIA 3RBTA 2J9HA 2FD3A 2NBSA 2WZ9A 1XWAA 1K3YA 3QMXA 2I1UA 2L59A 2IWTA 3IAS2 3ZMLA 3N5OA 4WXTA 4X1UA 2K8VA 1A2JA 1J9BA 4GLTA 1R5AA 3H1NA 2GVPA 2WS2A 2IFQA 2TRXA 3D21A 1R4WA 1NW2A 1GSUA 4NHWA 1S3DA 5B7CA 5CRHA 4OO5A 5ECHB 2MYGA 2RIIA 2M46A 3L9VA 2CZ2A 3IRAA 1SKRB 1G0TA 1T1VA 2O89A 4IS0A 3HJOA 3ERFA 1GSDA 3LYKA 3IE3A 1QUWA 5F0GA 1G7EA 4ZL9A 5FT3A 3M1GA 3TRQA 4ID0A 5HR2A 4AJ8A 2AHEA 1EOGA 2YZUA 3P90A 5H5SA 4OFNA 6GSWA 2PERA 4G2EA 2H0GA 1GTBA 1PL2A 1A2LA 5C00A 3ZITA 2RUFA 5E4WA 1O85A 2DJ3A 18GSA 3RPPA 5H5QA 3WGEA 5A4VA 4P3YB 3EURA 1SKWB 1ERWA 3TOTA 1GSYA 3FZ9A 4XIHA 4ZB8A 5AIXA 1PN9A 1B8XA 1IYIA 1EP8A 3IDVA 3TKPA 3GTUA 5CNWA 4XS6A 5DALA 2M80A 3FW2A 3M9KA 3F63A 3I6AA 4LLRA 1VF4A 3KTLA 12GSA 4HJ2A 5HFGA 4V2LA 1LJRA 3F3QA 2EC4A 1U87A 3PH9A 2OE1A 5COHA 3Q18A 3LSZA 3MSZA 4FIWA 1K3OA 1JZDA 5HR1A 3ZL5A 2CVBA 1UVZA 4CW9A 2H8LA 3KH9A 3IR4A 1XXUA 2H76A 2REMA 3KMOA 4IP6A 3UVTA 3RHBA 5JCWA 3VURA 4BPYA 2H70A 4ZIJA 3WGXA 1GSEA 2V1MA 2DBCA 4HOJA 4WR4A 3TJGA 1O73A 4LL1B 2ZUPA 1GL8A 4RI7A 4OO4A 5GAND 2HLSA 1F37A 2PU9C 5B8AA 2GSQA 4YAPA 1XWBA 2GGTA 1FVJA 2WDUA 3IA1A 2YNXA 2IN3A 4AJ6A 5INYA 5IMVA 2XPDA 1Z5YE 4TR0A 4ZL8A 2DMLA 2CVKA 3TRXA 2GSSA 4DVCA 4WEYA 3D0ZA 2B5YA 1A2MA 5HR0A 1DBYA 3HZ4A 1HNAA 2OKAA 1F2EA 1J08A 2H75A 3F4TA 17GSA 3UBKA 4EC0A 2YANA 3KMNA 2PUKC 5ECMB 3FZ5A 3ERGA 3F3RA 4K6XA 4G19A 1QK8A 4FO5A 6GSSA 2XBIA 5KN1A 1VF2A 1TK8B 1JZOA 5G1LA 3QR6A 5B8BA 4NV5A 1FG4A 4TR3A 1PX7A 2VLTA 3GUSA 3GSTA 2GZZA 3UMAA 4DSSB 3CXGA 3QD9A 4RQXA 3ZVJD 2YJ7A 3G7YA 1SENA 3A2XA 2H19A 4POMA 3O3TA 2XC2A 2FGXA 1HD2A 3KGKA 1FOVA 1FAAA 1U6TA 1M2AA 1X5CA 2H01A 10GSA 1ERTA 4JE1A 1SD9A 3C7MA 2VCXA 2DIYA 2LJKA 2YWNA 2AUVA 1SL2B 5IMFA 2I3YA 1FW1A 3ED3A 4XRDA 1MD4A 1UA5A 2AAWA 4IHUA 3DIEA 1XW5A 4MF6A 4KH7A 3VLNA 4ML1A 4X0XA 5EVOA 2H6XA 3M3MA 4K0GA 3PR8A 2X64A 4Q5NA 4GF0A 2QSIA 3TDGA 3HDCA 3HHVA 5DQSA 2RLIA 5GSSA 1ABAA 3UBLA 5G5EA 4O7HA 3WGDA 4LMVA 4BL7A 3KZQA 4MH2A 3DKSA 1QFNA 4KAEA 2GLRA 1AQXA 4MJBA 5GSTA 2H6YA 4TXVA 3FYGA 5CP1A 4O92A 3L9UA 1PA3A 3KD0A 3CBUA 1JHBA 3GRXA 4MMMA 5IM9A 3DMLA 1B4PA 2GSTA 4K8MA 5ELGA 3HZ8A 4JU5A 4PX1A 4ZBAA 5D9VA 2GQKA 5IMZA 4FYUA 2GT6A 3BBYA 3DVXA 2VO4A 4H86A 3Q74A 4MZCA 4N10A 2BTOT 4EVMA 1ACVA 4JZQA 2VCWA 3H8QA 1BEDA 2N5AA 3IXRA 4POLA 1V57A 3MDKA 2N5BA 2KUCA 1TI3A 2C3TA 4NAXA 3HXSA 2JU5A 4RI6A 11GSA 1C72A 4IP1A 2LQQA 4V2NA 3DEXA 3WT2A 2H74A 1M0UA 3QOUA 3UIWA 3CSHA 4E8HA 5CAXA 1T8EB 4TN8A 3ZREA 2IIYA 2CQ9A 3CYNA 2C0FA 2MBTA 2F8FA 2HSYA 1YF1A 4Q5RA 4TVEA 1EGOA 4MCUA 5IO0A 5FWGA 3KEBA 2V6OA 3A5WA 4GQFA 1TRWA 3O6TA 3UOMA 2MBSA 1O7UA 1ZGNA 1BX9A 4KA0A 4TW5A 2LUSA 5DBQA 4V2MA 1AW9A 5C04A 4OWYA 3SBCA 1V2AA 4N0VA 3DXBA 4HZ2A 3KCMA 3H93A 1HQOA 1B9XC 2H30A 4ZXGA 1IYHA 3EWLA 4HZ4A 1YEXA 2DJ0A 4EXJA 3VWWA 4MF5A 4OCEA 2JZRA 1XWCA 2L6CA 3ZVJA 1BG5A 2HXKA 3QAGA 1EOHA 5JWRB 1AC1A 1K0CA 22GSA 2O87A 3HJPA 1Z9HA 2LKUA 2V2GA 3H4KA 4E8EA 2GTUA 1QQ2A 3CSIA 3TKRA 3APSA 2VAFA 4HQSA 3IV4A 3UEMA 3KP8A 2C3NA 1QMVA 2P0GA 4IQ1A 1NHYA 1OC9B 2CX4A 4ECJA 1PQNA 6GSYA 2B7KA 5ECOB 4N30A 3TKSC 4YQUA 4ZBBA 2GSRA 1XFLA 1GRXA 5DCHA 1NM3A 1HYUA 3GH9A 3RPNA 2CV4A 1U88A 2IFQB 2PVOC 3MAKA 4J57E 5FHIA 1SK2A 3A2VA 4TOPA 1EV4A 2OE3A 4GXZA 4HQZA 1V9WA 5IMDA 3TJJA 1XOAA 2TIRA 1HNCA 4HI7A 5ECQB 2B7JA 1TU8A 2KHPA 3TJFA 1XPVA 4KGIA 3QAWA 1TDIA 1X5EA 2XPEA 5H5RA 4PGTA 3GN3A 2FNOA 3TKSA 1TRUA 1OC3A 3FR3A 2WJUA 1XBSA 2WCIA 2C1YA 5CO3A 2FUG2 4F82A 1YEPA 3IK7A 2E2GA 3ZFLA 2YCDA 2RM6A 4F0CA 2FCHA 3GTUB 2I9HA 5DALB 2HRFA 1EGRA 1THXA 2ZNMA 3N9JA 1AXDA 3IOSA 3KJYA 1T7PB 1MD3A 4K7IA 2VM1A 3IC4A 4BVXA 3IPZA 2AB6A 1X9WB 4I8BA 5HQPA 2ON5A 1VGLA 3HVSA 3BCKA 3KTBA 3JCML 2IL3A 5G30A 2A4VA 3GKXA 5ENUA 1LU4A 4TR1B 2N5FA 2CT6A 4L5LA 2IMEA 4PQHA 1SK0A 5LD0A 1DE1A 2YJHA 4XS4B 1GP1A 2LRNA 2VLVA 1XIYA 4MZBA 14GSA 5IIZA 1EP7A 1ML6A 1PX6A 1THOA 2WFCA 3QFBC 4XS1A 1ZL9A 2RM5A 1WPIA 1EWXA 1NSWA 2LSTA 5D9TA 2GS3A 3F6FA 4JR6A 2EIRA 1N2AA 4ML6A 1HNBA 4QL9A 2DJJA 3F4RA 4WF5A 3L78A 4JRRA 2HE3A 2VLUA 4NV2A 4TR1A 2WRTA 4HJMA 1ZOFA 1R7HA 2GQLA 1K0OA 5KEJA 4ECCA 5DAKA 4XS4A 3DRNA 4D73A 2HYXA 1TXXA 4MK3A 2B6MA 4F03A 2B5XA 4KDUA 1QXHA 2PN8A 2B1KA 1EZKA 1TRVA 5EPFA 5G1KA 3VWUA 4ZB9A 3GHAA 5ELAA 2E0QA 3HYPA 2MZCA 1FO5A 4FYCA 1RW1A 2DLXA 2L4CA 4YAVA 4NPBA 4KDXA 4MP4A 2VL9A 1JZWA 2B5EA 5DQYA 4MF7A 4OFMA 3ZYWA 2LV3A 1GLQA 1ST9A 2HI7A 5A5KA 5CYYA 4EO3A 3FEUA 2O85A 3HY2A 3I43A 1Z7RA 3EMXA 2VCQA 4KSMA 1XZOA 4PNFA 1YF0A 1LBKA 1YJ6A 4GWRA 1S3AA 4IJ3A 2LEGA 4V1Ap 1GNEA 1F3BA 2NVLA 2VCTA 5EL8A 3L4NA 1U3IA 2IMKA 1KBNA 1G6YA 5ECSA 1TI1A 2TRCP 4TRXA 1WP0A 5AISA 2YOIA 4X43A 4AF2A 2GZYA 4BVYA 2VL2C 1XW9A 5D8IA 2F9SA 1ZZYA 2JL4A 2Z9SA 4ULXA 2H6ZA 2FA8A 5IOWA 1O8WA 3P8WA 2PMTA 3Q19A 1DUGA 1SU9A 3HA9A 3KM6A 3APOA 2EIOA 3D4TA 2KLXA 1K0MA 3P2AA 1SYXA 4GCIA 4ZILA 1V58A 2B1LA 3TKSE 1TP9A 1M99A 3HD5A 1ON4A 2AV4A 5G5FA 2H73A 3AY8A 4GQCA 3F9UA 4MJAA 2PBJA 3GL5A 4DEJA 1NHOA 4L5OA 3ZIJA 1DE2A 1GH2A 2VL2A 4EF0A 2CAQA 1SYRA 1ILOA 1Q98A 3GH6A 3BD2A 3FY7A 1OVNA 2L6DA 3OR5A 2X8CA 1WJKA 2R6KA 3M8NA 2R4VA 4PUAA 1E2YA 4I2TA 3DYRA 3BOAA 4EKZA 1I9DA 1A0FA 1YZXA 3FZ4A 1GTAA 2X8GA 3LG6A 4I97A 3EC3A 1JLVA 5DCGA 4IELA 1GLPA 1RK4A 3EU4A 4ECIA 1F6MC 3EMPA 2ON7A 13GSA 3ZTLA 5HFIA 4HU9A 2I81A 1QGVA 4WETA 16GSA 3CMIA 3DGQA 1TRSA 4PXOA 4ZB6A 4EUYA 2QKEA 2VD0A 1ZYQB 2OBIA 4I5QA 4NXIA 3EE2A 1MDKA 3HVVA 2PGTA 3TCOA 4L0UA 3QFAC 2DSAA 2CA8A 2X8HA 1K0DA 1G6WA 3BCIA 5IO2A 1AQVA 4EL1A 2HZEB 3QDNA 2LNTA 4J2FA 3NZNA 1AIUA 5ID2B 1AUCA 1WRYA 4KSOA 1TK5B 4ZBDA 2HZFA 3GMFA 3RDWA 2YWIA 2HNLA 3Q6OA 4EDYA 2A2SA 1R26A 4POKA 1V40A 5DDLA 4PUFC 4K2DA 3GURA 4GSNA 5ECNB 5KN3A 2ES7A 2HSHA 5GZZB 5D9WA 3ERWA 2AJQB 4O5RA 2CAIA 3DWVA 4KDYA 1MDIA 1WMJA 2HT9A 2HZEA 2D2ZA 3CRTA 5JWQB 2CVDA 5ID2A 5A4WA 1K0BA 3GKKA 7GSSA 3VI5A 2H1BA 2OE0A 4MZWA 5CRWA 4ISDA 2H66A 3TJBA 4IN0A 3PGTA 5J5NA 6GSTA 3GSSA 3LWAA 1TTZA 3WYWA 5AN1A 2PPTA 1A23A 2C0DA 3GX8A 4K0NA 4TKYA 1T4YA 4OFTA 3ZRDA 5IPGA 1MDJA 1V98A 4K9ZA 1Y6EA 1GTUA 4KE3A 3CRUA 4AJ7A 1YDKA 2DJ1A 1GTIA 5IOXA 3TB2A 1EEMA 5G31A 2X99A 3GIXA 4KB3A 4OD7A 4JEDA 2HFDA 3F4SA 1TW9A 3W8SA 2NTOA 1G7OA 3PINA 4TXOB 3F8UA 2C0GA 2I4AA 2MMAA 4YQVA 4KCEA 2L5OA 1X5DA 1F9MA 3EYTA 3UARA 6GSUA 2YV7A 1AAZA 3K8NA 4WBRD 2YN1A 4GRFA 2NPBA 1WIKA 2WB9A 5CREA 3ME8A 2LNSA 2IPAA 1RQMA 3C8EA 1I5GA 3FK8A 2O7KA 2FWHA 3KH7A 2LTKA 3WD6A 5J9CA 5AIVA 2AYTA 4FYBA 1GWCA 3HKRA 4ACSA 4RQRA 1Z3EA 1T00A 3E9JB 1TKDB 5HR3A 4TXOA 2MMOA 3ISOA 3P7XA 4AGSA 1Q4JA 4K1FA 1PKWA 3DD3A 1Z6NA 3TGZA 4IVFA 2OACA 2LQOA 4HEA2 1XCCA 2DIZA 4Z7XA 2JZSA 1K3LA 2XHFA 1OKTA 3GX0A 1DSBA 3O76A 3VK9A 3W6GA 4KW6A 2F8AA 2F3MA 3QPMA 1SL1B 2LRCA 2K18A 1URMA 9GSSA 4NHZA 1SK1A 3EVIA 1FB6A 2JSYA 3ZIVA 4HS1A 1GUHA 1BQ7A 4XRAA 1XWGA 2YWOA 3HVXA 1TOFA 2B3SA 1ZCPA 1ZYEA 4MPFA 1M2DA 2C8UA 1CQHA 2R5GA 1A24A 4HU7A 1E6BA 3QAVA 5DAKB 2E2MA 4D73B 1U3AA 2V41A 3TOUA 2FWGA 1WE0A 4BWQA 5ECRB 4WKWA 2GQMA 1AQWA 2IMFA 1GUKA 3GYKA 5F8BA 3LEFA 3LGCA 1XVWA 1ZMAA 2IJYA 1SJIA 1VRSD 5J3RA 2HRNA 4F2IA 2QGVA 3J7Yk 2DJKA 4QL7A 4G9HA 2OA7A 4MPGA 1SJ6A 2IMIA 3LQ7A 4MDCA 4Q5QA 1PL1A 19GSA 4PNGA 3VWVA 1S3CA 3BJ5A 1MTCA 3IHQA 1PD21 4ECBA 3A2WA 2G2QA 2P31A 3KXOA 1JFUA 4PURA 2LJRA 3TKQA 2H1DA 3TRPA 3LFLA 3C73A 1JLWA 2H72A 3FKFA 4DSRA 4MABA 1UN2A 5J9BA 4XHMA 2PWJA 5DVBA 3GV1A 4CHSA 3U6VA 5CRGA 3D5JA 5CRDA 2J23A 1XW6A 4IW9A 1O6JA 2R37A 2C3QA 3M0FA 3ZMKA 1YKCA 3GFKA 3W8JA 4KCAA 4CDOA 4WF4A 1GSSA 2VUPA 3I9V2 4J56E 1KNGA 2EIQA 2YP6A 2VM2A 5ECLB 1GSFA 4KNDA 4HDEA 3L0HA 4BWSA 5AGYA 4BA7A 5JCUA 2L57A 2P5QA 3FRCA 3FR6A 2K8SA 2VD1A 3F0IA 1VF1A 3H79A 2JZTA 3D4MA 3F6DA 1USBA 2DMMA 2OADA 3VPQA 4GSSA 3V1WA 3EU3A 4I2UA 5IPHA 5LCZA 1H75A 3TUEA 4ILFA 4LL4B 1T3BA 1FB0A 4MJCA 2VOCA 2YPMA 3NIVA 2L4QA 5L71A 4NWYA 3MNGA 3APQA 2JSZA 5F05A 1YY7A 5IMAA 3LYPA 1FHEA 1OAZA 1M9BA 2JACA 4MH3A 1N8JA 3S9FA 1PGTA 3KIJA 1A0RP 2FHEA 2GT5A 1W4VA 3VWXA 5F07A 4OMVA 5HFKA 3E3EA 1SKSB 2NDOA 4QQ7A 1W89A 6GSXA 2H0IA 1VF3A 2CX3A 3IK9A 1GSQA 4JBBA 5D93A 2IMDA 1B9YC 4WR5A 3US3A 2GDRA 3FHKA 2JADA 5GAPD 3CTGA 1ERUA 3LORA 4EE0A 3L9SA 5D9XA 4RUVA 1OYJA 3UVHA 4V1Ag 5E59A 2OJLA 3TJKA 2MMZA 3HJMA 4MA9A 1OC8A 4DSSA 2GZPA 2C80A 1K0NA 1M2BA 3VPTA 1X9MB 2VCZA 4XTSA 2E7PA 1OE8A 1UC7A 4YH2A 4IQAA 4POBA 3QCPA 1O81A 2OBKA 1PMTA 5G2ZA 2FWEA 1F3AA 5DJMA 4G10A 2DC5A 3ZLPA 2C0EA 2BMXA 1PKZA 2VCVA 2C4JA 1XOBA 3G9BA 2FWFA 1BJXA 2H1GA 1BAYA 4OCFA 3DVWA 1K0AA 1H4OA 1MEKA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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