1X0RA

Thioredoxin peroxidase from aeropyrum pernix k1
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
PGSIPLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVCTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLHAESATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRSLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYEEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thioredoxin peroxidase from aerobic hyperthermophilic archaeon Aeropyrum pernix K1
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable peroxiredoxin
molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
total genus 72
structure length 244
sequence length 244
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-03-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 1x0rA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1x0rA01
4BWSA 1WRYA 4LMWA 1GNWA 1A2JA 5D96A 3TDGA 3HJMA 1Z5YE 2X64A 2F8AA 1A24A 3LWAA 4IBPA 4MZWA 3QMXA 2WCIA 2EIQA 1ZMAA 2GS3A 4XS1A 1O73A 2WB9A 1AAZA 5G1LA 4KCAA 1SK1A 5AIVA 1OE8A 4GLTA 1M7TA 5J41A 4DSSB 2OBIA 1MD4A 2WFCA 3H1NA 3F8UA 1B48A 4MCUA 2QC7A 1SJZA 2LKUA 4Q5RA 2GSSA 3VURA 4I2UA 3WT1A 4AF2A 3CRUA 7GSSA 4IVFA 5EY6A 3EMXA 1JLVA 2C3NA 2HRFA 4HZ4A 4IQ1A 1K0BA 3ED3A 2VL2A 4KB3A 4WEYA 1YY7A 1C72A 2MMAA 2V2GA 5DQYA 3F4TA 3ZLPA 1QFNA 3GURA 1TP9A 3IE3A 4HS1A 1TDIA 1Y6EA 1SL0B 2R4VA 1TI3A 4BWQA 1EGOA 2CZ2A 5J9BA 3J7Yb 2HZEA 5HR0A 4YQVA 3QPMA 2JSZA 3EYTA 2H76A 3UOMA 1XVWA 2GSRA 1G7OA 2NVLA 3DGQA 1PN9A 3DWVA 1AW9A 4JEDA 1TRWA 2TRXA 2O89A 3J7Yk 2LS5A 5IOXA 3FY7A 5IMDA 5ECRB 4HJ2A 4KSOA 3RAZA 3LG6A 5JWOB 3L9VA 2L5OA 1Y25A 2YJHA 5FT3A 1ZZYA 3TOTA 3GTUB 1JLWA 1I9DA 4IP6A 2CQ9A 2IMIA 2RIIA 2N5AA 1BQ7A 1F6MC 2FLSA 4ILFA 1X0RA 2OKAA 4IJ3A 3VWVA 2NTOA 4K0NA 3ZRDA 1PD21 4GSTA 3P90A 3KTLA 3UJ1A 2PWJA 2HI7A 2G2QA 2OE0A 3M9JA 2XBQA 3QAGA 1F2EA 2ALBA 3IBHA 1XW5A 3ZYWA 3VI7A 1JZOA 4MDCA 4D73B 3D22A 3FZ9A 2GVPA 1M0UA 4BVXA 1PL1A 4GSSA 4V2MA 1XVQA 1FVKA 3LQ7A 5DVBA 6GSXA 2D2ZA 3KMOA 1V98A 4BVYA 5DAKB 4F9ZA 1GH2A 1TRVA 4HJMA 3TOUA 1YF0A 2C0DA 2IMEA 3UIWA 3TRPA 1GSSA 1F3BA 2BTOT 5CNWA 1R7HA 3P8WA 5CO3A 2GQMA 4TXOB 2V1MA 4ML1A 4KAEA 2IMDA 2O85A 2FCHA 1FB6A 2VL9A 4OCEA 6GSSA 1AIUA 1XWCA 4EE0A 1O85A 3DIEA 4MZCA 5ENUA 1XCCA 1YDKA 4XTSA 3F9UA 4TR4A 17GSA 1JFUA 2DC5A 1R26A 3LFLA 2YWIA 2RM5A 4L5OA 4WR5A 2EIRA 5D8IA 3ZMKA 4IS0A 2R3XA 3CXGA 4P3YB 3D5JA 3RHCA 4V2NA 3LORA 2LJAA 3E9JB 1BX9A 1ZOFA 4KCEA 3Q18A 4HZ2A 3HXSA 3GFKA 2CV4A 3TJGA 1ERUA 2MMNA 4ZL9A 1OC3A 3EC3A 2OJLA 4KX4A 3HJPA 1JZRA 2FWFA 4FYCA 1ZCPA 2C1YA 2VOCA 1UA5A 2H8LA 3GKXA 3KTBA 2M46A 2HLSA 2RUEA 3FEUA 1MDKA 1CQHA 2CX4A 4NV2A 4WBRD 1MD3A 2MZCA 3D0ZA 4MF5A 1PX7A 4XS6A 2GLRA 5F07A 4F03A 1RK4A 3ZVJD 5ECKB 3FR3A 2XBIA 1TTZA 4RI6A 3ZL5A 3HJOA 3HCZA 16GSA 2KP1A 4N10A 4TR3A 4LMVA 1EEMA 1GSQA 4DSQA 2GZYA 1Z9HA 3G7IA 2GDRA 2MMOA 3GTUA 5E59A 5D93A 2G0FA 1GTIA 1O6JA 5D9VA 2M80A 2DJKA 3ZFBA 4JR6A 1HYUA 4KSMA 5AGYA 3GNJA 4K8MA 1A0RP 6GSWA 5H5SA 3KMNA 5G1KA 3IK7A 3FRCA 2FHEA 2YNXA 4QL9A 3F0IA 4BL7A 1H75A 2L59A 2XPEA 4EF0A 5B6MA 2DJ0A 5F0GA 5INYA 3C73A 5F06A 4D73A 1OC8A 3GH6A 3UVTA 1TOFA 4RQXA 4OD7A 2VM1A 1JZDA 3KCMA 3D4TA 1N8JA 3HHVA 3S9FA 3A5WA 2V6OA 3MAKA 2O87A 1WIKA 2WZ9A 2IFQB 3QDNA 1OKDA 4YQUA 2K8SA 5IPHA 2WRTA 4KDUA 2VUPA 1OVNA 3IA1A 4L0UA 2YZUA 4GCIA 4EO3A 2WGRA 1QGVA 3CTFA 2VCVA 4ZBAA 3TGZA 2YCDA 4TXOA 4OFMA 2KP2A 4GF0A 2B5XA 1U88A 3QOUA 4TRXA 5L71A 1E2YA 3A3TA 3HYPA 3N9JA 4N0ZA 5DBQA 4RQRA 2OA7A 2H30A 1SENA 10GSA 1HD2A 4E8EA 1EOHA 1X5EA 3BCKA 4HUAA 3GX8A 4MJCA 3ZTLA 3C1SA 2DSAA 2VCQA 1XXUA 12GSA 1UC7A 1V9WA 2E7PA 3FK8A 5IO0A 2B5YA 1TU8A 5GZZB 5COHA 4EDZA 3RDWA 4YAPA 1YKCA 2HT9A 2K6VA 1A8YA 2CVDA 2AHEA 6GSYA 1F37A 1ERWA 5ECSA 2IMKA 4FH8A 2C0FA 3VPQA 4ZL8A 4H86A 3FHKA 4IJIA 3FZ4A 2VCTA 4QQ7A 1KNGA 3LYKA 3UBLA 1U87A 4XCSA 2H1DA 4J2FA 1GSEA 4JE1A 4F0CA 3K8NA 1BG5A 2FY6A 3RPPA 3DRNA 1TK0B 1GTUA 4XRDA 1PQNA 1WJKA 2C3TA 4ULXA 5IIZA 1MTCA 1QMVA 4X0XA 4Q5FA 2K8VA 4OCFA 3GSTA 3NZNA 5AIXA 5J4UA 5ELAA 3M3MA 2VAFA 1GNEA 3FR6A 4ZBBA 3TJKA 18GSA 3QFBC 1USBA 1EOGA 4F2IA 2WDUA 3EVIA 1O8WA 3LGCA 5ELGA 4PURA 3H79A 1OYJA 3N5OA 5HR3A 1Z3EA 2RM6A 5FWGA 2QGVA 4NWYA 2I1UA 1X5CA 3QD9A 3PINA 4PUFC 4HOJA 1GUHA 4NHZA 1XW6A 4GTUA 5C04A 1S3CA 3HVVA 4HQZA 1TRUA 1V2AA 4X43A 1UVZA 5JWRB 3CMIA 2YOIA 3U5RE 3WGDA 4V1Ap 4ECJA 1NM3A 2VCZA 2VIMA 2YANA 3Q74A 5CRDA 3TJBA 2OE3A 3TKSA 3QAWA 3M1GA 3Q6OA 1FHEA 3QAVA 1MDIA 2CVBA 5G31A 1PKWA 3U6VA 5HFKA 4OO5A 2B7KA 2LRCA 4WXTA 2IFQA 4CHSA 3I9V2 2FA4A 1XW9A 3G9BA 1R4WA 2PBJA 5DALB 4LL4B 4DVCA 1X9MB 3KIJA 2B1KA 1T00A 2JU5A 3G7YA 2N5BA 4I6XA 1K3YA 3FKFA 2ZNMA 2V41A 3QFAC 3GHAA 1BAYA 5ECMB 3TJJA 2CX3A 3EURA 2L6CA 4EDYA 3ISOA 1X9WB 2P31A 2A2SA 4IELA 2O7KA 2CA8A 4TVEA 4TW5A 3I43A 13GSA 4I5QA 4IQAA 4KDYA 2FWGA 1SL2B 1ERVA 2LNTA 2ES7A 2GZPA 1OC9B 2I3YA 1ACVA 4YAVA 1ZYQB 2RUFA 2H70A 5G5EA 4ZIJA 4K6XA 3MDKA 3VWXA 9GSSA 4MMMA 2NBSA 1EGRA 1TW9A 1O8XA 2H01A 1ON4A 4FYUA 5GAPD 4I2TA 1A0FA 4K7NA 2L6DA 3LYPA 2H1BA 1PL2A 3C1RA 5A5KA 2VL2C 4YH2A 4PXOA 2MYGA 1YEPA 2L5LA 2HXKA 1HNBA 3DVWA 3WGEA 1GULA 3L4NA 4L0WA 3WD6A 3LEFA 5CAXA 1Z7PA 3TKQA 3D21A 3Q19A 1M9BA 4PQIA 3FZ5A 1KBNA 4N0VA 2H0HA 2IMFA 3UAPA 3BOAA 4O7HA 4WBJA 5AISA 1QUWA 1THOA 4J56E 1EP8A 2LUSA 2HFDA 3C71A 2PMTA 3CSJA 3M0FA 1PKZA 2H73A 4XS4B 1B8XA 1F3AA 3A2WA 1WWJA 4YQMA 5GAND 2B5EA 3KH7A 2PVOC 1GTAA 3H8QA 5IQYA 1GSUA 5IMZA 5KN1A 4ZB8A 3VFIA 4DSSA 1U3IA 3GL3A 4PQ1A 1LU4A 4GQCA 1FB0A 3ZFLA 2L57A 1J08A 3IK9A 4I97A 2IPAA 3L78A 3P2AA 2KOKA 2L4QA 1XPVA 3GH9A 3BD2A 1TU7A 1XFLA 2DMMA 2YN1A 3DYRA 4HU9A 2EC4A 3CBUA 4FIWA 1TI1A 4OO4A 5H5RA 5ECLB 1LBKA 2HYXA 1DBYA 1NW2A 1W4VA 1EZKA 3GRXA 2GT6A 3BBYA 2HZFA 1XWKA 1U6TA 3FYGA 1UN2A 1WE0A 2L4CA 5DALA 2E2MA 1BJXA 1T7PB 2WJUA 4HU7A 1G7EA 4XHMA 3CSHA 3ME8A 4XIHA 3AY8A 5J9CA 5CRWA 1XOBA 1HNAA 2RLIA 3DEXA 4O32A 4K7IA 2AB6A 3ZREA 4NAXA 3ERFA 2E0QA 3O6TA 3KM6A 5ECIB 2F3MA 3IHQA 4KW6A 2GZZA 3F6FA 4EL1A 4G9HA 3HZ8A 1SK2A 1SU9A 1K0AA 2EIOA 1MDJA 3TKPA 2TIRA 3MNGA 2VM2A 4G19A 3A2XA 4GQFA 2X99A 1SKSB 3HD5A 4K2DA 2TRCP 2V6KA 1PSQA 4GXZA 3A2VA 3IXRA 1M99A 1N2AA 5A4UA 5LCZA 3GMFA 4NV5A 1WPIA 2YJ7A 1JZWA 2H66A 1NHYA 3KJYA 2LEGA 2DIZA 2JSYA 3HY2A 4L5LA 3ME7A 3IDVA 4ISDA 4POBA 1YF1A 4IP1A 2LTKA 6GSVA 4OFNA 3F3RA 2VD0A 3L0HA 2OBKA 1KEBA 4WETA 2V32A 5ECNB 4TN8A 2GQLA 1VGLA 3WGXA 5G2ZA 4WKWA 5AN1A 4MZBA 2I9HA 2YWOA 4MK3A 5DAKA 1YQ1A 5IMAA 4ZB9A 4MJAA 4JRRA 1A23A 3US3A 3D6IA 4XS4A 4ECIA 2GQKA 1GUMA 3M9KA 3QCPA 5ID2B 3DMLA 2X8GA 1TK8B 1PGTA 5DJMA 1GTBA 1K3OA 2JZTA 1J0FA 1YZXA 3TB2A 4EC0A 2YWMA 4XRAA 4MH2A 1SD8A 3ZIJA 3H93A 5DCGA 1TRSA 3E0UA 2C3QA 4JU5A 2B7JA 4PQHA 3UARA 3LSZA 4HQSA 3GL5A 4PUAA 1RQMA 1A2LA 3IAM2 3RBTA 3FW2A 5EVOA 4Z7XA 5KN3A 5ECOB 2A2RA 3F3QA 2I81A 3ZITA 3KP8A 4KUNA 3GKNA 1OKTA 3APQA 1T8EB 3ERWA 4TOPA 2AYTA 3KD0A 2ZCTA 4X1UA 1ML6A 1Q4JA 2FGXA 2E2GA 2HSHA 2OACA 3E3EA 2VLTA 1GWCA 4NHWA 3HVSA 1XBSA 4PX1A 5JWQB 5GSTA 2VO4A 3VLNA 4BA7A 2OE1A 3F63A 2IJYA 4GWRA 4MABA 5D73A 2KLXA 3HDCA 1OAZA 2F8FA 4LA1A 3DVXA 4F82A 2YZHA 1GRXA 2YV9A 4E8HA 3MSZA 4POLA 1M2AA 2F51A 4CW9A 2FNOA 3D4MA 1M9AA 2O8VB 1X9SB 3KXOA 4IGJA 4TR1B 5FHIA 1SK0A 1Z7RA 4I8BA 5HQPA 2KUCA 1B4PA 1XZOA 2N5FA 3V1WA 2IIYA 2MMZA 5HFIA 1TK5B 2AUVA 4MF7A 1AXDA 4HEA2 1BYEA 1BEDA 4GSNA 3TJFA 1GLQA 3CYNA 6GSTA 5DDLA 2H19A 3RHBA 5LNKe 3F4SA 2QKEA 2WULA 2C0EA 4MPFA 3GIXA 1A2MA 1THXA 2X8CA 5IMCA 4LL1B 1SL1B 3IR4A 2HNLA 3ZIVA 1ZYEA 4KA0A 4IHUA 2PPTA 4ECBA 4MA9A 2R5GA 4WF5A 8GSSA 2PUKC 3W8SA 5IOWA 2BMXA 3GN3A 5HR1A 2CAQA 4V1Ag 4N30A 1S3AA 1V40A 1FVJA 1XWAA 5ID2A 5A4WA 2HE3A 2H71A 3TKSE 3GSSA 1VF1A 1ERTA 4TKYA 2VD1A 5CYYA 5HFGA 4EXJA 3GV1A 2LJRA 2REMA 2HSYA 3O76A 4OFTA 2LRTA 1EEJA 4ECCA 4IKHA 2HRNA 1AQVA 3FR9A 3RPNA 2H72A 2K9FA 3JCML 1EV9A 5F05A 3ZMLA 1PX6A 2C0GA 1I5GA 1NHOA 1U3AA 1XIYA 1O7UA 5KN0A 4KH7A 2H6YA 1WMJA 3UEMA 2H74A 2DJ1A 4O92A 3UVHA 3F6DA 2X8HA 1K0MA 2JL4A 2VLUA 1QQ2A 4K0GA 3TKSC 4O5RA 2B1LA 1EP7A 3M8NA 1G6YA 5EPFA 1JHBA 4ZL7A 1DSBA 3TCOA 1DE1A 1G6WA 5DCHA 1RW1A 4KGIA 2CVKA 3I69A 3ZZXA 5IPGA 3UMAA 3PR8A 3PGTA 1CQGA 3DKSA 3TRXA 2PERA 1HNCA 1QXHA 1PRXA 3KH9A 1T4ZA 4J57E 2DJ3A 3W8JA 3GUSA 2JACA 5F8BA 1K0OA 2B6MA 3CRTA 1B9XC 14GSA 1S3DA 1SJIA 3W6GA 2H6ZA 1K0CA 3NIVA 2AJQB 5D9XA 4ZBDA 4IN0A 5A4VA 2QSIA 2J9HA 1YEXA 3APOA 4NXIA 1B4QA 1EWXA 2JADA 2YV7A 2LQOA 1WOUA 3KGKA 1T4YA 4JBBA 3IAS2 2Z9SA 5E4WA 2C4JA 3GA4A 5C00A 2KHPA 4TR1A 1K0DA 5G30A 2I4AA 3BJ5A 4MJEA 5JCUA 5B8BA 1ABAA 5CP1A 3NOFA 2GSTA 5EL8A 4NPBA 4ZXGA 3IC4A 1SKRB 4LLRA 1VF4A 1T1VA 11GSA 4FO5A 5GSSA 3KP9A 2PVQA 5D9WA 2DLXA 5B8AA 1SKWB 4TR0A 1AQWA 1FW1A 1ZL9A 3GYKA 5ECPB 1EV4A 3DXBA 5B7CA 2M72A 2DJJA 2VLVA 3LXTA 1DE2A 4EVMA 2IL3A 4N11A 1M2BA 22GSA 1K0NA 3GKKA 2H0IA 1XOAA 1AC1A 3VI5A 1DUGA 2CAIA 3MWHA 1FOVA 4MLYA 4GRFA 1ST9A 4KDXA 3KZQA 2LJKA 3O3TA 2AV4A 2P0GA 4EKZA 2GSQA 3HVXA 2VL3A 2JZSA 5B6NA 1HQOA 5DJLA 2LQQA 1B9YC 19GSA 3L9UA 1SYXA 1GL8A 4MP4A 5ECHB 4RUVA 4Q5NA 2FWEA 4ML6A 4AJ6A 3VK9A 3LXZA 1G0TA 1FAAA 5ECQB 3LJRA 3P7XA 3EWLA 5HR2A 3I6AA 3VPTA 2J23A 3PH9A 2VCXA 1GP1A 4K7OA 1IYHA 4DEJA 2H6XA 1Z6NA 2JZRA 5IM9A 4POMA 1R5PA 5KEJA 4PNFA 5DQSA 3ERGA 1OC9A 1O81A 2CZ3A 4ZB6A 3R2QA 1GUKA 2PGTA 1K3LA 2ON5A 2IWTA 3HKRA 2R6KA 3VWUA 2YPMA 2MBTA 4JZQA 2B3SA 4ZILA 2FD3A 1QK8A 2DIYA 4FYBA 3G7JA 4G10A 4K9ZA 3HA9A 2C80A 4MH3A 2P5QA 4QL7A 3GKMA 4EUYA 3DD3A 2FWHA 2P5RA 1E6BA 5H5QA 2C8UA 3GX0A 5CRGA 2DBCA 2ZUPA 5IO2A 1Z6MA 5G5FA 4OWYA 1J9BA 1V57A 3TKRA 3CSIA 4WR4A 2FA8A 3TUEA 2FUG2 4AJ7A 3CTGA 1YJ6A 2XHFA 3C7MA 2ON7A 1SD9A 2H0GA 2LRNA 3EU3A 2GTUA 1ZGNA 1GLPA 2K18A 1NSWA 3QR6A 3IOSA 1H4OA 2YWNA 3L9SA 3SWLA 2VCWA 3UL3A 1XWBA 4MF6A 5LD0A 3H4KA 3UBKA 2A4VA 2GT5A 1XWGA 5KN2A 4F0BA 2MBSA 3FZAA 1TJDA 1GSFA 4MPGA 3WT2A 3ZVJA 3C8EA 3EINA 5J5NA 2LV3A 2CT6A 5CREA 1GSYA 2YP6A 4HI7A 4L8EA 3SBCA 1PMTA 5JCWA 4NMUA 2HZEB 1TXXA 3APSA 2OADA 4ID0A 5IMFA 2PN8A 1T3BA 5J3RA 2WS2A 1FG4A 1GSDA 4HDEA 4JR4A 3F4RA 4KNDA 2BJXA 2PU9C 1LJRA 1AUCA 3VWWA 1Q98A 4AJ8A 4DSRA 1VF2A 1TKDB 1VF3A 4POKA 4WF4A 3HZ4A 3EMPA 2XC2A 4KE3A 3EU4A 4AGSA 4ACSA 5JCGA 3IPZA 2R2JA 4PNGA 1PA3A 1IYIA 2DJ2A 3BCIA 4G2EA 3IRAA 1URMA 1AQXA 1V58A 4Q5QA 1OE7A 1VRSD 4CDOA 3KEBA 2LSTA 2NDOA 1SJ6A 2GGTA 2H1GA 1A8LA 1ILOA 4PGTA 1MEKA 5IMVA 3OR5A 4K1FA 4TXVA 1R5AA 4BPYA 2H75A 2H1AA 4OMVA 3TRQA 2AAWA 2DMLA 1F9MA 1M2DA 3EE2A 6GSUA 2R37A 20GSA 4RI7A 1WP0A 1KTEA 1SYRA 4V2LA 4MJBA 1X5DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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