4OWYA

Crystal structure of ahp1 from saccharomyces cerevisiae. investigating the electron transfers.
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
174
structure length
169
Chain Sequence
b'DLVNKKFPAGDYKFQYIAISQSDCKMPQTVEWSKLISENKKVIITGAPAAFSPTCTVSHIPGYINYLDELVKEKEVDQVIVVTVDNPFANQAWAKSLGVKDTTHIKFASDPGCAFTKSIGFELAVGDGVYWSGRWAMVVENGIVTYAAKETNPGTDVTVSSVESVLAHL'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Ahp1 from Saccharomyces cerevisiae. Investigating the electron transfers.
rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin type-2
source organism Saccharomyces cerevisiae
molecule tags Oxidoreductase
total genus 45
structure length 169
sequence length 174
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-02-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4owyA00
3D4TA 1FB0A 2H1DA 2RM5A 3I43A 4POLA 4BVYA 1SU9A 4JRRA 3A2VA 5HR1A 3QMXA 4F03A 5ECRB 2CA8A 1EOGA 3VK9A 5JWOB 3M9JA 1ST9A 1SJZA 2ES7A 6GSVA 2LTKA 4PQ1A 3D21A 2V41A 4Q5RA 1OYJA 6GSUA 2HZEA 2HYXA 2NPBA 5GAPD 5AISA 4KUNA 2P5RA 4QQ7A 3M9KA 2H70A 5G5EA 1ML6A 3LG6A 1T00A 5CRDA 3DKSA 4XS4B 4OCEA 2F8AA 3QPMA 4EKZA 4ZIJA 1IYHA 5EVOA 3WGDA 3UBLA 1Z3EA 3ISOA 4TR1A 2GSQA 1SKSB 3VI7A 3F4RA 2N5BA 1EEJA 3G7YA 5KN3A 2H6ZA 3GURA 1YJ6A 2VD1A 3F0IA 3Q74A 3IBHA 5JCWA 3G9BA 1ERWA 3N5OA 5IQYA 2F51A 4JE1A 2I3YA 4KNDA 1XWCA 1V9WA 2WB9A 4OFMA 3DXBA 5IMVA 3GA4A 3WD6A 4MJEA 1ZOFA 3ZTLA 2R2JA 4K8MA 4PUFC 3IE3A 1A0FA 1DE1A 1RK4A 2R4VA 3IAS2 4J2FA 2WS2A 3AY8A 1FO5A 1M2BA 1WOUA 1JZDA 1GUHA 5B8AA 2CQ9A 1F3BA 1NHYA 3LYKA 3APQA 19GSA 2R37A 2IMKA 4MDCA 3IOSA 4AJ6A 3ERFA 4ZBAA 2B1LA 3FKFA 1G0TA 1J08A 2XC2A 1SJIA 4E8EA 3F63A 1NW2A 3ERWA 1DE2A 3E3EA 4HUAA 4KDXA 2FLSA 5H5RA 2H1AA 2X99A 2GZPA 2C3NA 5EPFA 2X64A 3LEFA 3BCKA 4FO5A 1K0DA 2WCIA 5KN1A 1F9MA 3L4NA 1O73A 4J57E 2VCXA 2O85A 3TRPA 5JWQB 1VF2A 4HS1A 4K9ZA 2LQQA 2I4AA 2CZ2A 5ECMB 3TJFA 2AJQB 3CXGA 1TKDB 5HR0A 4IELA 1T8EB 2G0FA 2DJ3A 1X9MB 4QL7A 3HZ8A 4ZL8A 3ZLPA 1EP7A 1GUKA 4AJ8A 4OO5A 2IFQA 2PU9C 4YQVA 2H73A 5J3RA 1TDIA 4V2LA 4X1UA 3E0UA 2DMMA 1TOFA 1NM3A 4XS4A 3A3TA 3GIXA 3CTFA 1CQHA 4AGSA 4V1Ag 4PNGA 2MYGA 3BD2A 1XW9A 3TRXA 4MF5A 2H72A 1XBSA 1K0NA 4ML6A 4PNFA 1ILOA 3W6GA 4EVMA 1PMTA 2L6CA 3I9V2 1ZL9A 3RDWA 4ECIA 4IP1A 2GZYA 4KW6A 3CSHA 2O7KA 2GQLA 4POBA 4YAPA 5HR2A 1GSQA 3RPNA 3TJKA 2F3MA 3I6AA 4ID0A 5CYYA 1SD8A 4KAEA 5A5KA 2YV9A 4XCSA 1EGRA 3GV1A 4NPBA 2AUVA 4LMVA 1MEKA 1T4ZA 2GSTA 1XWKA 2R6KA 5J41A 3J7Yb 1FVKA 1KTEA 2AHEA 2H66A 3DYRA 3ZVJD 2DBCA 2HRNA 3DMLA 3LXTA 1YDKA 2GSRA 2DLXA 3HJOA 3TJBA 5ECKB 3CRTA 2M72A 1VGLA 1ZYQB 3HYPA 2JZSA 1EOHA 4BA7A 4LA1A 4RI6A 4N10A 4EF0A 3DGQA 3FHKA 3D22A 3DRNA 2V1MA 3C1SA 2EIRA 1A23A 2VCVA 3GHAA 2B6MA 4XTSA 3F8UA 1W89A 3TUEA 5B6MA 1MD4A 1U3AA 2C3TA 4I97A 3WT2A 4HZ2A 1FW1A 2HRFA 5B6NA 3ZL5A 1LU4A 1YEXA 1NSWA 3VI5A 1QXHA 5J5NA 2JL4A 3GX0A 4GQCA 2VOCA 2B5YA 2HNLA 4XS6A 3HVVA 5HR3A 4MLYA 2OBIA 4F2IA 4GQFA 4X43A 4N0ZA 2XPEA 5IMCA 3KGKA 1WRYA 1TRUA 1OVNA 5ID2B 2GS3A 3NZNA 3F9UA 5HQPA 2TIRA 3QAVA 5D9VA 5KEJA 1K0OA 5G1KA 2FUG2 2D2ZA 4K7IA 1TU8A 2CVDA 5D8IA 5LCZA 1SK1A 2HT9A 3KM6A 5AIVA 3ZIJA 3F3QA 2NVLA 1V40A 3UL3A 2HSYA 2JZTA 1GH2A 2I1UA 2E2GA 4MF6A 1GTBA 4PXOA 1MDKA 3HJMA 1OE7A 4MK3A 1OKTA 3M8NA 1TU7A 2FHEA 4GCIA 1BEDA 2H0GA 11GSA 2DIYA 4IBPA 2H74A 4OO4A 4JR6A 2H1BA 3D4MA 2ZNMA 4OFTA 3H1NA 4TXOB 2H19A 1SL2B 4N30A 3RAZA 5JWRB 3HZ4A 1F37A 5ELAA 2FCHA 4V2MA 1DBYA 5A4UA 1FHEA 1XOBA 1TK5B 1SKRB 1XOAA 3FR3A 1AUCA 4JBBA 3OR5A 4WR5A 3J7Yk 1EEMA 3KZQA 3RBTA 3FZ5A 5ECQB 4EO3A 1UVZA 3TKSE 2RLIA 3QR6A 1M9BA 3TDGA 1VF1A 4CDOA 1EWXA 2CVKA 3Q6OA 1SL0B 1A2MA 3CMIA 4GWRA 3N9JA 1NHOA 4GTUA 3VWWA 2YJ7A 1JLVA 2H0HA 1MDIA 1SJ6A 2VCQA 4TR0A 10GSA 5L71A 4KCEA 4PQHA 5ECLB 2IMDA 5C00A 1X0RA 3VWXA 1A24A 2PUKC 1WMJA 3IHQA 3A5WA 1B9YC 1EZKA 3IDVA 2CV4A 3ZITA 2HFDA 1KNGA 2O87A 3US3A 3TJGA 1GNEA 1PD21 1SKWB 3W8SA 3U5RE 1THOA 3F4SA 1PX7A 4NHWA 1ZCPA 1PA3A 3A2WA 1O6JA 3KMOA 1O85A 4V1Ap 2YWNA 3GSSA 1YY7A 3WGXA 4IGJA 4X0XA 4H86A 4HI7A 1BQ7A 3EINA 5J9CA 3TCOA 3FYGA 3KH9A 3HJPA 4YH2A 2QGVA 3KP9A 2MZCA 2ON7A 2WRTA 4ZL9A 5CP1A 3APSA 2IIYA 2JSYA 4IP6A 5AN1A 3IC4A 3LFLA 4RQRA 5CRGA 3GFKA 1U3IA 2MMAA 5A4VA 2L6DA 5F0GA 1XVWA 2V32A 1T3BA 2QC7A 3DVXA 1GULA 4WF4A 5ID2A 4WETA 3KTBA 3UOMA 3VLNA 1BAYA 2K8SA 2YWIA 4G2EA 5ECPB 1U6TA 3TOUA 1GSYA 3ME7A 5CRHA 4MMMA 4IW9A 2IWTA 2LS5A 4I2TA 5CAXA 5H5SA 1SYRA 6GSWA 1S3CA 1UC7A 4ULXA 2VD0A 2ZCTA 1WE0A 3IV4A 2K18A 2VLTA 2VM2A 4MCUA 5F8BA 3EU4A 3GKXA 4KSOA 3FR9A 1HYUA 1KBNA 5G2ZA 1GLPA 2A4VA 4Q5QA 2AB6A 2IMFA 3MAKA 2MBSA 1G7OA 4TXOA 3FRCA 2OE0A 4ZB9A 2YZHA 2FNOA 1PL1A 2LQOA 1B9XC 2HZFA 4ECCA 1ZYEA 3BJ5A 5AGYA 3VPQA 3LYPA 2HSHA 2L4CA 1O7UA 2WULA 1PKZA 4HZ4A 1YF1A 1X9SB 1SK2A 5J9BA 4WBJA 2VLUA 1H4OA 1R7HA 4EDZA 3Q18A 4AF2A 1S3DA 3GH9A 2JSZA 1AQXA 2E0QA 2VLVA 4I8BA 1Y25A 1YF0A 3C7MA 4TXVA 5ECOB 3Q19A 2C0GA 1GSEA 2OADA 1M2AA 5FT3A 5INYA 18GSA 1GNWA 1K3OA 4BL7A 1B4PA 3FEUA 2YV7A 5D93A 3ZVJA 1QFNA 3ZMKA 8GSSA 3EMXA 4LL4B 3VWUA 3ZIVA 3CRUA 4YQMA 2YP6A 1OC9B 1EGOA 2BTOT 1DUGA 4MPGA 4MPFA 20GSA 2LRTA 2E2MA 1K0AA 3H8QA 1V57A 5CO3A 2KP2A 1J0FA 4K7NA 3WT1A 3L9VA 3LORA 5G1LA 5HFIA 2YANA 4BWSA 2GQMA 5DQSA 1QUWA 4OWYA 2OE1A 2V2GA 5G31A 3P2AA 4N0VA 3MWHA 2LRNA 1GSUA 1GRXA 5LNKe 3M3MA 3GMFA 5B8BA 2OBKA 16GSA 4LMWA 3KEBA 2LJKA 4IQ1A 2K9FA 1O8XA 1A2JA 5ELGA 3EYTA 1JZWA 1B48A 3GL3A 1BG5A 2CX3A 4HQZA 1TXXA 5ECIB 3HA9A 4MABA 5A4WA 5H5QA 4CHSA 2B7KA 5ABRA 2XHFA 2YCDA 4KDYA 2KOKA 4FYCA 3GUSA 4L0WA 3FK8A 3FY7A 5JCGA 2F9SA 2VCTA 4HJ2A 2C0DA 5IMDA 4TR3A 4MZCA 2JU5A 1XWAA 2KHPA 1GUMA 2B7JA 2VCWA 4MP4A 1GWCA 1GTUA 5DVBA 1QK8A 3TKPA 1QMVA 2X8CA 2AYTA 4HU7A 1M0UA 1AXDA 3GSTA 4ZB6A 2A2RA 5KN2A 3GH6A 2OE3A 2PVOC 4EXJA 3IK9A 1BYEA 1UA5A 3LQ7A 2LSTA 3QAGA 4IQAA 2LRCA 2YPMA 3FR6A 2XBQA 3LSZA 3TKSC 4TR4A 1DSBA 4GSNA 1H75A 2H6XA 2FWFA 2H30A 4XRAA 2DJ0A 5IPHA 1QQ2A 3HY2A 4KX4A 13GSA 3L9SA 4DEJA 4KA0A 3QFBC 2RUEA 3PR8A 1FAAA 4HJMA 2L57A 2P31A 2YNXA 1ERTA 1Z7RA 3DWVA 3UEMA 1GTIA 4MH3A 2VL9A 3VWVA 2OKAA 2L5LA 2NDOA 2WZ9A 1U87A 1A0RP 1OE8A 3O3TA 4LL1B 4EC0A 3GNJA 1PQNA 3F4TA 4N11A 3CTGA 1B4QA 4MA9A 5IIZA 6GSYA 5DCGA 4IVFA 1FB6A 5ECHB 3JCML 2XBIA 2H01A 3LXZA 1E6BA 3F3RA 2FWGA 4OFNA 5FWGA 2HXKA 2H1GA 1VRSD 3TKRA 1CQGA 5IOXA 2HZEB 3HKRA 1TK8B 2JACA 5AIXA 2V6KA 1JZOA 3APOA 2MMZA 3ZRDA 2H76A 2PWJA 3I69A 4K2DA 2YWOA 1FG4A 3EC3A 2LJRA 5DAKB 4PX1A 4K0NA 2KLXA 1ERUA 4DSSB 3LWAA 1XXUA 2GGTA 1TJDA 5DALB 3FZ9A 2L4QA 3EU3A 4K0GA 2PGTA 1G6WA 3IA1A 4HDEA 2N5AA 2H8LA 2B5XA 2FD3A 1N8JA 5JCUA 4K6XA 2WDUA 1AIUA 2L59A 3HD5A 2VL2C 3BCIA 4O32A 3HVXA 2GTUA 4EE0A 2LJAA 1Z6MA 4HQSA 5GAND 2WFCA 2FGXA 5DJLA 3S9FA 1KEBA 5IM9A 1M7TA 2B5EA 2HE3A 1XZOA 3QCPA 4F0BA 2H6YA 4F82A 4FIWA 22GSA 4KH7A 4JEDA 4PURA 2CZ3A 1SYXA 1TW9A 2O89A 3TB2A 3TRQA 4NAXA 2TRXA 3HCZA 1HQOA 4HOJA 2M80A 5D9XA 3P8WA 3HHVA 3QOUA 1GL8A 1X9WB 1A8LA 1ACVA 4ML1A 4OCFA 1HNBA 1K0MA 1XWBA 1V58A 2VUPA 3DVWA 3V1WA 1GSDA 1WJKA 3ERGA 3E9JB 2PVQA 3EWLA 2LNSA 1SD9A 2GZZA 2MMOA 5CNWA 4O92A 2DJ2A 5DDLA 4KSMA 1AW9A 4XIHA 4JU5A 4JZQA 2WJUA 2DJ1A 4D73B 9GSSA 2RUFA 2K8VA 4L0UA 6GSSA 2FWHA 1OC8A 2A2SA 4XS1A 2GLRA 1GLQA 1WPIA 4BVXA 4TRXA 2FA8A 4TOPA 1E2YA 3TKSA 4XHMA 4P3YB 2WGRA 5C04A 3WGEA 2JZRA 3TKQA 3GL5A 2H71A 1Z9HA 2C3QA 2CAQA 4POMA 2GDRA 1K3LA 1AQVA 3GRXA 3DIEA 1MDJA 4IHUA 4ZL7A 3UBKA 5IO0A 2ON5A 1I9DA 3G7IA 1PL2A 2LUSA 1M99A 5GSTA 1XIYA 2AAWA 4HEA2 3CSJA 1Z7PA 1K0CA 4Q5NA 1LJRA 7GSSA 1SENA 1BJXA 2IFQB 2N5FA 2E7PA 3IXRA 2BMXA 4F9ZA 2JADA 4FYBA 1A8YA 2CX4A 5DAKA 1XCCA 5GZZB 2GQKA 4DSSA 2XPDA 1F3AA 1TK0B 2Z9SA 5DALA 3L9UA 2IMEA 3PINA 1R4WA 2C80A 1RW1A 1GSSA 4IKHA 2CAIA 1JLWA 3QDNA 3D0ZA 4IJ3A 5G5FA 3O76A 5IO2A 2R3XA 1TP9A 3UARA 3D5JA 2O8VB 1VF4A 2R5GA 3ZFLA 3UVHA 2NBSA 2M46A 4PQIA 2REMA 3H4KA 1YKCA 4MZWA 4ZBDA 4I2UA 4V2NA 5F07A 1BX9A 4WKWA 3ZREA 3PGTA 5DJMA 1GP1A 3MSZA 2IMIA 3EMPA 3M1GA 4O7HA 1K3YA 2EIQA 2HI7A 2RIIA 3FZAA 4L5LA 3CSIA 4TVEA 4G19A 1PX6A 3FZ4A 4EUYA 2X8GA 2VL2A 1ABAA 3ZYWA 4XRDA 1AQWA 1OAZA 3RHCA 1HD2A 1GTAA 2BJXA 1X5DA 4ZXGA 2C0FA 4AJ7A 2HLSA 2LEGA 4J56E 3ZZXA 1YZXA 2YOIA 1TI3A 4OMVA 2NTOA 4HU9A 2PERA 1PKWA 1OKDA 4MH2A 1Z6NA 3A2XA 1RQMA 3C8EA 1XW6A 2IL3A 2IPAA 4G10A 5FHIA 3W8JA 1ON4A 4GSSA 3G7JA 2KP1A 1C72A 4D73A 4NHZA 3EURA 3M0FA 5IOWA 1PN9A 4IJIA 1WP0A 3BOAA 2CT6A 1MD3A 5CREA 3ZFBA 4KE3A 5ECSA 3FW2A 1YKAA 3MNGA 1PSQA 5F05A 2B1KA 5HFKA 5D96A 4BWQA 5B7CA 2L5OA 2EC4A 1TRWA 4L5OA 4WF5A 3LGCA 1Y6EA 4RUVA 4KDUA 1MTCA 1F6MC 4Z7XA 1TRVA 3U6VA 3HXSA 1T4YA 1ZMAA 3LJRA 3GKKA 3WYWA 4NXIA 4EL1A 3MDKA 1XWGA 4GSTA 1GSFA 2V6OA 4MZBA 3QAWA 3KTLA 3KIJA 2CVBA 4ZBBA 2YWMA 1R26A 3PH9A 2C4JA 3C73A 2DC5A 5J4UA 1IYIA 2QKEA 2EIOA 3L0HA 5E4WA 3SWLA 1V98A 4RI7A 4MJAA 3IR4A 1Z5YE 2YN1A 14GSA 4GLTA 2J9HA 3F6FA 3HDCA 2MBTA 3KP8A 2VO4A 4ZB8A 1THXA 1Q98A 1WIKA 2G2QA 1JZRA 4NV5A 5D73A 5ENUA 5DCHA 2KUCA 1YEPA 5E59A 2PBJA 1LBKA 3UIWA 4L8EA 4ECBA 3C71A 1EV4A 3KH7A 3KXOA 1T1VA 1ERVA 2F8FA 2AV4A 1OC3A 4F0CA 1T7PB 3GX8A 1XVQA 1R5AA 2FY6A 2GT6A 4MJBA 3GTUB 1XW5A 4QL9A 5IMFA 2PMTA 3H79A 3KMNA 1N2AA 2PPTA 4TKYA 1TI1A 4ZILA 4YQUA 1M9AA 4PUAA 1PGTA 2LV3A 4YAVA 5IPGA 1JHBA 4WR4A 2DSAA 3TJJA 3SBCA 3EVIA 4LLRA 3L78A 4IS0A 1B8XA 5G30A 4ECJA 3VURA 3IRAA 1AC1A 12GSA 1UN2A 5EY6A 1O8WA 3R2QA 3GYKA 2FWEA 3KCMA 3ED3A 1J9BA 1FOVA 2OJLA 1HNAA 2VIMA 1O81A 2LNTA 4G9HA 5HFGA 1OC9A 1WWJA 1G6YA 2LKUA 5ECNB 4OD7A 2ZUPA 2VAFA 1EP8A 1R5PA 3DD3A 3KD0A 1SL1B 3UVTA 1X5EA 4GF0A 4FH8A 2OA7A 4NMUA 2DIZA 2J23A 6GSXA 2YZUA 2H0IA 2IJYA 1ZGNA 2YJHA 4NV2A 4CW9A 5COHA 5F06A 1TTZA 3BBYA 4ACSA 5LD0A 1Q4JA 2OACA 2DJKA 1ZZYA 2VL3A 5IMZA 5EL8A 5KN0A 4I6XA 3EE2A 3CBUA 3UAPA 3UMAA 5IMAA 3GKMA 4DVCA 5DQYA 3ZMLA 3F6DA 4PGTA 4O5RA 4TR1B 3IPZA 1K0BA 4ILFA 2I81A 1EV9A 2I9HA 3UJ1A 1X5CA 4MF7A 3RPPA 3KJYA 5D9TA 4ISDA 2P0GA 1V2AA 2P5QA 3NIVA 2ALBA 3RHBA 17GSA 4DSRA 3VPTA 2GT5A 2IN3A 1USBA 2C8UA 2B3SA 4KCAA 4TN8A 3D6IA 3GKNA 4BPYA 5CRWA 5DBQA 5D9WA 3TGZA 4KB3A 3TOTA 3O6TA 2PN8A 3K8NA 2TRCP 4WBRD 1A2LA 3ME8A 3GN3A 2FA4A 4WXTA 4TW5A 1G7EA 3VFIA 3QFAC 1VF3A 3DEXA 2C0EA 4EDYA 1HNCA 1PRXA 3P90A 4JR4A 1XPVA 1QGVA 4NWYA 1SK0A 2VM1A 3GTUA 3CYNA 1M2DA 4IN0A 4MJCA 4Q5FA 6GSTA 2X8HA 3IK7A 2VCZA 1FVJA 1YQ1A 1JFUA 1S3AA 4I5QA 1I5GA 4WEYA 2MMNA 1XFLA 3P7XA 4FYUA 4K7OA 5GSSA 3NOFA 4GXZA 3C1RA 1URMA 2K6VA 2GSSA 4DSQA 2H75A 1U88A 2QSIA 1AAZA 2C1YA 1F2EA 2DJJA 2DMLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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