3D4MA

Glutaredoxin 2 oxidized structure
Total Genus 37
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
37
sequence length
109
structure length
109
Chain Sequence
MVSQETVAHVKDLIGQKEVFVAAKTYCPYCKATLSTLFQELNVPKSKALVLELDEMSNGSEIQDALEEISGQKTVPNVYINGKHIGGNSDLETLKKNGKLAEILKPVFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural aspects of the distinct biochemical properties of glutaredoxin 1 and glutaredoxin 2 from Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-2, mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 37
structure length 109
sequence length 109
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3d4mA00
6GSUA 2AUVA 3VWUA 4EL1A 2F8FA 3C7MA 4KW6A 3BBYA 4JEDA 2J23A 1AUCA 5IMDA 4RI7A 2P0GA 5HR1A 1QFNA 5ELGA 3D21A 3FW2A 4QQ7A 4YAVA 2H1GA 2V6KA 4WBRD 1M7TA 3PINA 1SL1B 3EVIA 3K8NA 3F9UA 2K8VA 3DYRA 1FVKA 4ZILA 2YJ7A 2O89A 17GSA 2FHEA 4PQHA 5J41A 1JHBA 3IK9A 1J0FA 1O8XA 2FA8A 5G2ZA 1Z6NA 3TKSA 3GL3A 4HI7A 2V1MA 1A2JA 1EP7A 1PKZA 1XW9A 3ZVJD 5CREA 2WULA 4K1FA 1Z9HA 1MDKA 3Q6OA 3FR3A 4IN0A 2H71A 4KDXA 2N5AA 3GSTA 1HNAA 1XWGA 1K0AA 3I6AA 3SWLA 3ZYWA 4V2LA 1YDKA 4XHMA 3QAGA 4EC0A 1B48A 4KB3A 2RUFA 2WRTA 5D9TA 4AF2A 3WGDA 1M9AA 1Y6EA 4MJBA 3GUSA 4E8HA 3ZMLA 1F6MC 1SU9A 4JE1A 3NZNA 4NHZA 3IDVA 3FKFA 3HCZA 18GSA 4ECCA 4AJ6A 2P5RA 5DAKB 1AQVA 1ZGNA 4XS1A 16GSA 3FK8A 3LYKA 5DVBA 2B3SA 3QPMA 5A4UA 2H74A 3ERFA 2GT6A 2YWOA 3QMXA 1XW5A 4EO3A 2GT5A 2OKAA 3ERGA 3UARA 1K3LA 5G5FA 2VLTA 3DIEA 5IMZA 4WEYA 1ABAA 1SKRB 1XOAA 3UOMA 5B6NA 1EV4A 3CTGA 3GHAA 2YWNA 4PQ1A 1BEDA 3GFKA 3G9BA 3L78A 2VCWA 3A2WA 4NV2A 4ECJA 3MWHA 2F3MA 4TR4A 4OO5A 2E2GA 1QK8A 2YNXA 3ZMKA 4TR1B 5CRDA 3NIVA 1XVWA 2H0IA 4ISDA 4MJEA 4BVXA 5G30A 3MDKA 3QOUA 1UN2A 3LG6A 3KXOA 2EIOA 4JR6A 4MZBA 4GQFA 5ECRB 1THOA 4IVFA 2LS5A 1GSDA 5HFGA 2GQLA 3F8UA 1GUHA 2R37A 5HFKA 2ZUPA 4KX4A 2YZHA 1YY7A 2OA7A 2RLIA 1GSSA 1OC3A 3GTUB 1ZYQB 3PGTA 1WOUA 4ULXA 1MEKA 5DALA 4TOPA 4Z7XA 5IMVA 4PUFC 3NOFA 1T3BA 3ZTLA 1YF0A 2B7KA 2FWFA 4OO4A 3H4KA 1G7OA 2X64A 4N11A 1A8LA 6GSWA 5B7CA 1OYJA 3D6IA 3ZFLA 4IELA 1GTBA 4I97A 3VWXA 3KGKA 2JSZA 3ZFBA 1Q4JA 2L6DA 5CO3A 1OC8A 2NPBA 4JR4A 3HHVA 2H6YA 4N30A 4ECIA 3I43A 1ACVA 1XVQA 3KMOA 1AQWA 2KP1A 2RM5A 4MK3A 4Q5FA 2ZCTA 3ZRDA 3DGQA 4POLA 4IQ1A 1RK4A 3LJRA 1G6WA 1ZZYA 4MJAA 3GV1A 5B6MA 1JZWA 4L0UA 1J08A 3M1GA 1MD4A 2C8UA 4HJ2A 1F3BA 2MMZA 4MH2A 3W8SA 2BJXA 4XRDA 1M99A 4HS1A 1FOVA 3GKMA 3KCMA 2L4CA 2QC7A 5C00A 5CP1A 2N5BA 4WXTA 3LWAA 10GSA 2HRFA 4OFNA 1WIKA 2LNSA 4TRXA 1A24A 4WBJA 2VCXA 2FY6A 3HJPA 1B8XA 4IGJA 2RM6A 3S9FA 1G7EA 3IA1A 4AJ8A 1VF2A 4IJIA 3CRUA 5JWRB 4YQVA 2IMFA 1YKCA 5GSTA 1HNCA 1O8WA 1NM3A 2LTKA 3TKRA 4BPYA 2E7PA 5IMFA 3TRQA 1T4YA 3F4SA 4DSSA 1Y25A 3E9JB 3J7Yb 5HFIA 2HZFA 4D73A 3TRXA 1AXDA 1TKDB 1G6YA 3UVTA 3GYKA 3A2VA 22GSA 5DCHA 4WETA 3GMFA 1ERUA 5ECIB 3DVWA 1UC7A 1PSQA 3WYWA 4KH7A 1TI3A 4PGTA 1TK0B 5DDLA 13GSA 3D5JA 1TW9A 1X9MB 5ECNB 3GKKA 3BJ5A 3LFLA 2XBIA 4MF6A 1PKWA 3P8WA 1X5CA 3TKSE 3FZAA 4OMVA 1QMVA 3UAPA 2F51A 1CQGA 4OCFA 4FH8A 1TTZA 4PQIA 5G1KA 3AY8A 4ZL7A 2OBKA 1DSBA 4QL7A 2FNOA 1EWXA 5AIVA 2AJQB 2KUCA 4MPFA 1EV9A 3M8NA 1Z6MA 2CAIA 2HZEA 1N2AA 2HFDA 4GLTA 3ZZXA 1M9BA 3GURA 3QAVA 2ON5A 3F0IA 2C0GA 2AB6A 1T8EB 5ECHB 1ML6A 1B9YC 2H75A 2GSSA 3HZ8A 6GSTA 4JRRA 1SKWB 3ED3A 2H73A 2H8LA 1GWCA 5GAPD 5IMCA 4ZBAA 3KEBA 1PN9A 4K2DA 1BAYA 1K0MA 3FY7A 1K0NA 2C0EA 1ERVA 5ABRA 4LLRA 5CAXA 1K0OA 1AIUA 1K0CA 2GTUA 4MA9A 1V57A 3UIWA 1FVJA 3EMXA 5F8BA 4MZWA 3VLNA 3EWLA 4YQMA 3RBTA 4HZ2A 1WRYA 1JZOA 5D8IA 1SJZA 5J3RA 8GSSA 4PXOA 4OWYA 4K0GA 3HY2A 3PR8A 5J5NA 3GH6A 4KCAA 4LL4B 5DJMA 2DC5A 3Q18A 3VURA 5JCWA 4ACSA 4G10A 1SJIA 3A3TA 1Q98A 4KSOA 1SD8A 3QCPA 3GA4A 4FO5A 2I9HA 2WDUA 3RDWA 2L59A 4ECBA 1BYEA 1N8JA 2R2JA 2J9HA 5DALB 2L6CA 4YQUA 3GKNA 3FR9A 1BQ7A 3KIJA 4P3YB 3QR6A 1G0TA 2DBCA 1O7UA 4XIHA 4NMUA 4CDOA 5GSSA 1VF3A 1H4OA 2HRNA 2A2RA 2GGTA 1ST9A 4MPGA 2OACA 2PGTA 1OAZA 4OFTA 5ECKB 1B4QA 2OJLA 2KP2A 3C1RA 1WE0A 2NBSA 2PWJA 4ML6A 3P2AA 2X8HA 4CW9A 1LJRA 1M2BA 1GH2A 4IP6A 1K3OA 1ZYEA 2L5LA 3QDNA 1JLWA 3V1WA 2VO4A 5AN1A 3O6TA 3UBKA 4TN8A 3JCML 1BX9A 2OE1A 2LRCA 4L5LA 3GKXA 2PVOC 3U5RE 2DJJA 2C0DA 4F03A 2YWIA 2XC2A 1TI1A 2IFQA 1H75A 1LBKA 2VIMA 4V2NA 5JWOB 4FIWA 1AQXA 4MF5A 4EKZA 3P7XA 3P90A 1XFLA 3QFBC 2AAWA 3WT1A 5KN1A 4JZQA 1HYUA 2I81A 2V32A 2ON7A 4MLYA 3D4TA 2C3QA 3CYNA 2K6VA 4ILFA 1Z7PA 4RQXA 1XWKA 4X1UA 4DSQA 4KGIA 1XIYA 2VD1A 1DE1A 2RIIA 4KUNA 4DSSB 2O85A 4OD7A 4D73B 2K9FA 2H1DA 4MF7A 1PL1A 2VCQA 3M0FA 3FHKA 1GLPA 2L4QA 3LQ7A 3KP9A 4F82A 4Q5NA 2ZNMA 2AV4A 2VLVA 3LXZA 1DBYA 3M9JA 1V98A 5E59A 1A0RP 4N0ZA 4L8EA 2IMDA 3CRTA 1O81A 4DSRA 2B5XA 2PPTA 2R3XA 2GVPA 1HQOA 4OFMA 4MMMA 2HNLA 3GSSA 1XCCA 3DVXA 2B7JA 1OC9A 4V1Ag 5JCUA 5D93A 4XS4B 2VCVA 5ECOB 3MNGA 3F6FA 1EGRA 4NAXA 2HZEB 2H0GA 3KTLA 1YKAA 2V2GA 1R26A 3HZ4A 2E0QA 4MABA 3MAKA 2EC4A 1BJXA 2H66A 3F4TA 3VWWA 1QXHA 3F6DA 1Z7RA 2WS2A 3HA9A 2MMOA 3TKSC 2FLSA 3KZQA 1TRWA 1TRSA 3LORA 1ZMAA 4POBA 1KBNA 1EEMA 5L71A 4POMA 2YWMA 1U3AA 2TRXA 1K0BA 3TJKA 3GX8A 2MBTA 3KTBA 3EINA 3HVSA 4MP4A 1GSFA 2IN3A 3FYGA 4HUAA 5D9WA 1AC1A 3DXBA 1V9WA 1ILOA 2PUKC 5G1LA 3VWVA 3GX0A 2R6KA 5JWQB 6GSXA 3DD3A 1MDIA 4Q5QA 3BCIA 1TOFA 2B1LA 1F9MA 3UEMA 4MCUA 4WR4A 1ERTA 4F2IA 1M2DA 14GSA 3TOTA 1A2LA 3FZ4A 2XBQA 2H1BA 2HT9A 4V2MA 1MTCA 2DIZA 4RI6A 2D2ZA 5CRGA 2FCHA 4F9ZA 1TK5B 2LJRA 2H0HA 4TXVA 2VL2A 3RPPA 5G31A 4L5OA 5AIXA 5B8AA 3QD9A 5KN3A 2VUPA 3IR4A 1FHEA 3BCKA 3WD6A 2I3YA 1AAZA 4HJMA 1KEBA 3DWVA 3N9JA 3L4NA 3EU4A 3VFIA 2QKEA 3WGXA 2FWHA 4MH3A 1ON4A 1W4VA 5GAND 4CHSA 4GRFA 4GXZA 2GZZA 1GSQA 1B4PA 3ME8A 3UBLA 19GSA 1X5EA 4KE3A 5IQYA 2JU5A 3KD0A 4I6XA 2YCDA 2WCIA 3M9KA 5C04A 4J57E 4WF5A 5J4UA 2JL4A 1PRXA 1JLVA 1WMJA 4K6XA 1ZL9A 2C0FA 3KH7A 1TP9A 2LJKA 3UMAA 3CTFA 2DMLA 2IFQB 2LUSA 3H8QA 3IRAA 4J2FA 4LMVA 5DJLA 1GUMA 2FWGA 2X8GA 1V2AA 3F63A 3BOAA 3ZIJA 3O3TA 3TKPA 5G5EA 2C1YA 2YZUA 4ZBDA 1A8YA 4EF0A 5F07A 4V1Ap 4XRAA 4BWSA 1MDJA 1SYXA 1R7HA 4XS4A 2VL2C 3VI7A 3SBCA 4HQSA 2WB9A 4G19A 3M3MA 1JZRA 2BMXA 1MD3A 4PUAA 2LSTA 2Z9SA 2GZYA 1GSEA 4ML1A 1EP8A 1WJKA 3C73A 3HXSA 4PX1A 2HXKA 3EURA 3LYPA 1B9XC 3TRPA 2LKUA 4GSSA 5CYYA 3HJMA 3U6VA 1XWAA 1J9BA 1EGOA 3HVVA 5DBQA 1SK1A 5HQPA 2L57A 2CA8A 2JZRA 5J9BA 4E8EA 2GS3A 1OVNA 5F05A 4KDUA 1X9WB 5D9VA 2BTOT 2IMKA 1EOHA 4PURA 2R4VA 1XWCA 3E0UA 3APQA 4POKA 3L9SA 4G2EA 4TR0A 5GZZB 9GSSA 1R5PA 2C4JA 3L9UA 2A2SA 1OC9B 2PVQA 1YF1A 5HR0A 3BD2A 3N5OA 1DE2A 5LD0A 3CSIA 2JSYA 2F9SA 2DIYA 4I8BA 3FZ9A 1EZKA 1O73A 2CT6A 2DLXA 3IHQA 2GZPA 2H01A 3ZLPA 2B1KA 3H79A 2GQMA 2C80A 4TW5A 4BWQA 5E4WA 3W8JA 2VL9A 4ID0A 1PMTA 2YPMA 4ZL8A 5IMAA 1PX6A 2LEGA 5EPFA 2JADA 3MSZA 4IKHA 2OE3A 1T7PB 3TJJA 2IWTA 4NXIA 4I2UA 5ENUA 2NDOA 2AYTA 1GULA 1URMA 1F3AA 4N0VA 4IJ3A 2VAFA 2MBSA 2LRTA 5H5QA 4NWYA 1TXXA 2M46A 2EIQA 2LQOA 5CNWA 2NVLA 1X9SB 1NSWA 2MZCA 3EMPA 3GN3A 2YV9A 5INYA 2P5QA 3J7Yk 1X5DA 5AISA 3WT2A 2QSIA 1NHOA 1PQNA 1JFUA 3VK9A 3GIXA 4LA1A 1AW9A 2MMNA 5DQYA 3Q19A 1XW6A 4ZXGA 3RAZA 1V58A 1QQ2A 4IW9A 5CRHA 3D22A 4NPBA 3CBUA 4HEA2 1K3YA 1TU8A 1I9DA 5CRWA 1SKSB 4IHUA 5EVOA 2HYXA 3APSA 2B5YA 2G0FA 4K8MA 2CX3A 3HYPA 4RUVA 4HU9A 3APOA 2X8CA 4LL1B 5ID2A 5IPGA 4FYBA 1FG4A 2VCZA 1V40A 3A5WA 5H5RA 1SYRA 1S3AA 2L5OA 3GH9A 5FWGA 3LSZA 4F0CA 3L0HA 2C3TA 2CVKA 3TCOA 1S3CA 2C3NA 1VF4A 3IK7A 3C8EA 4FYCA 2G2QA 2GQKA 3EC3A 4JBBA 3QAWA 4GWRA 1LU4A 3LEFA 4IP1A 6GSYA 4X0XA 5ECLB 3G7YA 1FB6A 2I1UA 4K7IA 1GNEA 4KCEA 3ME7A 4RQRA 4TXOA 4DVCA 1A0FA 2N5FA 3UJ1A 2KOKA 4OCEA 2LQQA 3IC4A 3TJBA 1XPVA 5ECMB 4BA7A 12GSA 4K9ZA 3FZ5A 3H93A 1SJ6A 4EDZA 4HDEA 4GF0A 2K8SA 2TRCP 1YEPA 3RHBA 1T1VA 1PX7A 1TJDA 2WFCA 3TJGA 2YJHA 2GDRA 5KN2A 1GSYA 2H30A 2CVBA 4PNGA 1OKDA 2PU9C 4GSNA 4KAEA 3ZIVA 1SK2A 2GLRA 1WPIA 1U87A 4WF4A 1QUWA 3Q74A 5ECQB 1T4ZA 3IBHA 1TU7A 3PH9A 1Z5YE 3FR6A 3D4MA 2DMMA 1O85A 3E3EA 5H5SA 3I9V2 4EE0A 3DRNA 1SENA 5D96A 4KNDA 2FUG2 4G9HA 1GP1A 2HSYA 5D73A 6GSVA 2ES7A 4J56E 7GSSA 1VRSD 2YN1A 3RHCA 2GSTA 2YV7A 3TDGA 3C1SA 1S3DA 2XPDA 2DJ0A 20GSA 2MYGA 1TDIA 3KP8A 4TR3A 1K0DA 4YAPA 3EE2A 3W6GA 3HVXA 2H76A 3D0ZA 4WR5A 3HD5A 1E6BA 3A2XA 4NHWA 1SL0B 4XS6A 1WP0A 3TGZA 1BG5A 2A4VA 4HOJA 2IJYA 1UVZA 2FA4A 2KLXA 4MZCA 2WJUA 3TOUA 1PD21 4K7OA 3VPTA 2I4AA 2VD0A 3IAM2 2CZ2A 3WGEA 4WKWA 1GTIA 5DQSA 2K18A 3HDCA 3QFAC 4EDYA 4O92A 1X0RA 2RUEA 2B5EA 1FO5A 3TUEA 1OKTA 3ERWA 5FT3A 4GSTA 1YEXA 5ELAA 1W89A 4ZBBA 4Q5RA 1SL2B 2F8AA 2H1AA 2JACA 2FD3A 2VM2A 3HKRA 4BL7A 4FYUA 2TIRA 2JZSA 5LNKe 1GL8A 2NTOA 3CSJA 2R5GA 3IE3A 2DJ2A 2EIRA 2H72A 5COHA 3O76A 3IOSA 4ZB9A 2CQ9A 5HR2A 1FW1A 1SD9A 4ZB8A 5B8BA 2XPEA 1ZOFA 4K0NA 5A4VA 2GSRA 1DUGA 4GTUA 1A23A 1XBSA 5EY6A 1E2YA 5AGYA 1ERWA 3F4RA 4EUYA 2REMA 3RPNA 2H70A 2H6ZA 3UL3A 1OE7A 2WZ9A 3DMLA 4TVEA 3KJYA 2XHFA 1GTUA 4LMWA 5ECPB 11GSA 4EXJA 2HI7A 3H1NA 5IOWA 3UVHA 6GSSA 1F2EA 1EEJA 1VGLA 1NHYA 2JZTA 2PN8A 1U3IA 4HZ4A 4QL9A 1IYHA 1RW1A 5ID2B 2O8VB 1XXUA 2YANA 2VL3A 1USBA 1JZDA 3G7IA 1TRVA 3OR5A 1GSUA 4O7HA 3GNJA 2LRNA 1THXA 5DCGA 1KTEA 2O87A 2OBIA 4TKYA 1SK0A 5DAKA 1KNGA 4MJCA 4ZIJA 5IO0A 1M0UA 2P31A 1GUKA 4AJ7A 3F3QA 3ZITA 4BVYA 1IYIA 2CVDA 3KH9A 4K7NA 3VI5A 4NV5A 1PL2A 1Z3EA 1CQHA 1T00A 4KA0A 3I69A 5IM9A 2CAQA 4DEJA 5KEJA 1PGTA 2MMAA 4O32A 4TXOB 5IPHA 1FAAA 3KMNA 3HJOA 4ZL9A 5LCZA 5F06A 2HE3A 3DEXA 4KDYA 1U88A 3TJFA 2DJ3A 2LJAA 1HNBA 3GRXA 5HR3A 4HQZA 3TB2A 1NW2A 3FEUA 1ZCPA 1TK8B 2E2MA 4IS0A 4JU5A 2KHPA 3US3A 3ISOA 5KN0A 3F3RA 3KM6A 2CV4A 1WWJA 4I2TA 2VOCA 4TR1A 1R4WA 3CMIA 2OADA 2DJKA 3LXTA 4IBPA 1VF1A 2DSAA 3ZVJA 5IIZA 1OE8A 3EU3A 2HSHA 5IOXA 1I5GA 4ZB6A 2FWEA 3GTUA 5ECSA 3EYTA 2V6OA 1HD2A 2PBJA 1R5AA 2QGVA 2M80A 2VM1A 2IIYA 2H19A 1M2AA 5F0GA 5A5KA 2LV3A 4I5QA 2LNTA 4MDCA 4GQCA 2IMIA 3LGCA 1U6TA 5A4WA 5JCGA 3CXGA 2H6XA 2IPAA 2VCTA 1YQ1A 4O5RA 4GCIA 2AHEA 1YZXA 4XTSA 2CX4A 4X43A 1FB0A 4PNFA 2VLUA 1QGVA 3G7JA 3IAS2 1XWBA 3DKSA 3IV4A 2M72A 1XOBA 3L9VA 1EOGA 1PA3A 3GL5A 2IL3A 2O7KA 2WGRA 1GNWA 2PMTA 3ZL5A 1GLQA 2CZ3A 1C72A 5D9XA 2DJ1A 2HLSA 3CSHA 2GSQA 2X99A 4EVMA 2FGXA 1GTAA 1O6JA 4XCSA 4L0WA 5J9CA 4H86A 4F0BA 1A2MA 4IQAA 2ALBA 5FHIA 3TKQA 4KSMA 2B6MA 2YP6A 3FRCA 3C71A 2V41A 1F37A 5EL8A 3R2QA 4YH2A 3VPQA 4N10A 1UA5A 1XZOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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