2F51A

Structure of trichomonas vaginalis thioredoxin
Total Genus 29
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
29
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
SDPIVHFNGTHEALLNRIKEAPGLVLVDFFATWCGPCQRLGQILPSIAEANKDVTFIKVDVDKNGNAADAYGVSSIPALFFVKKEGNEIKTLDQFVGADVSRIKADIEKFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Electron transport
source organism Trichomonas vaginalis
publication title High-resolution structure of recombinant Trichomonas vaginalis thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords thioredoxin
total genus 29
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2005-11-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2f51A00
3BD2A 2J23A 3HKRA 3KZQA 4NHWA 2A2SA 1A0FA 4WXTA 5KN0A 2MMAA 3FR9A 1TU7A 4NXIA 3TJBA 3D21A 2CX3A 1BG5A 4BWSA 3EMXA 3A2VA 1NSWA 1S3DA 2PVQA 5J5NA 3CSHA 3TRXA 3IK9A 1S3AA 1ZGNA 2HYXA 1SK2A 4MZWA 1OKTA 1EGRA 3GKXA 1ACVA 1GLQA 1X9MB 4XIHA 5KN1A 1GUHA 5CAXA 4MPFA 2YV9A 2KOKA 3APSA 3M9JA 2A4VA 1SD8A 4KDUA 1Y6EA 3IAM2 5B7CA 3FRCA 4EDZA 1SL0B 3N5OA 2X8HA 5DDLA 3FY7A 2H01A 4OCEA 2H19A 4KDYA 5ECKB 1M2AA 4GQFA 1EOGA 4L5OA 3EC3A 3U5RE 2LRCA 5HFKA 1GUKA 2C3TA 3DVWA 4TW5A 1M0UA 2JACA 4MF7A 3H4KA 2K8VA 4Q5QA 1XWBA 4BA7A 5AIXA 3P8WA 2GZPA 2CT6A 3VFIA 1K3YA 2FWFA 4I6XA 4AJ8A 1B4PA 2HLSA 1A8LA 4AF2A 2L6CA 1JZWA 1FHEA 3UIWA 3ZMKA 2QGVA 1ON4A 1U87A 3A2WA 1GULA 5CRGA 2GSRA 5GZZB 4FH8A 3F0IA 3KH9A 2J9HA 5HFGA 1FB0A 5COHA 3QFBC 2YWOA 2YZUA 5ELGA 2BTOT 1JZRA 2LSTA 2K8SA 1WRYA 3MAKA 1UA5A 1GSYA 3F4RA 2HSHA 3GRXA 2KHPA 1ILOA 2VL3A 2RIIA 4ZBAA 1SK1A 5D9XA 4V2NA 1K0OA 1F6MC 2ALBA 2H70A 1F2EA 4N30A 2KLXA 3HZ8A 4K1FA 1E6BA 3EWLA 5JWOB 4LL1B 2VCWA 2VCVA 2OA7A 1XPVA 4BL7A 3TGZA 3UJ1A 1QQ2A 4MH2A 4EUYA 3ZFBA 2R6KA 4WR5A 2L4CA 4OO5A 5ECRB 1OKDA 3RPNA 5B6MA 3RPPA 1GRXA 4EDYA 3CRUA 3D5JA 4BPYA 2YWNA 4JU5A 1SKSB 2FUG2 3IDVA 4XS1A 3C8EA 4ZXGA 3TDGA 3TKSE 3I69A 2GQMA 1V40A 2H6YA 4MF6A 4YAPA 4KX4A 3GA4A 4ZBBA 1W4VA 6GSVA 2YANA 4KCEA 2DBCA 4QL9A 3E9JB 4FO5A 2DJ1A 2H1GA 5HFIA 3DWVA 5DJMA 3IAS2 4MA9A 2MZCA 4ZILA 3CBUA 4HQZA 3GKMA 3QMXA 4GF0A 2FWGA 1TRVA 5LD0A 1LU4A 1QK8A 3VPTA 1BQ7A 2FGXA 4AJ6A 1GSUA 4NWYA 3UBLA 2JL4A 1TRUA 4YQMA 1TK8B 3L4NA 3TKSA 1EOHA 4GLTA 5DQSA 1GH2A 6GSTA 1HQOA 3W8JA 4IP1A 1GTBA 2O8VB 2LEGA 2PUKC 1OAZA 4KUNA 2GSQA 2DC5A 3A5WA 4I8BA 3GH9A 1YZXA 5FHIA 1X5DA 1XWKA 4TOPA 6GSXA 4HOJA 4MDCA 5IMAA 5B8AA 1T3BA 4POMA 1NM3A 4PX1A 2I3YA 1YKCA 2OADA 3NOFA 1SENA 2C0FA 1K0CA 3TRQA 2FY6A 2VCTA 1H4OA 4KNDA 5AIVA 14GSA 4X1UA 6GSWA 4DEJA 4GTUA 1A2JA 1PX6A 3A2XA 1R26A 5DCHA 1GLPA 12GSA 1XIYA 1X9SB 5JCGA 4OCFA 4EO3A 3D0ZA 3KM6A 1Z7RA 1G7OA 4L5LA 2FWHA 2DMLA 2YWMA 1O73A 4OFNA 4EF0A 5D9VA 2R4VA 4O5RA 4RI6A 1Z5YE 2LQQA 3KMOA 3QD9A 1WE0A 1ZYQB 10GSA 3VWXA 4MZCA 3IRAA 1K3LA 1AXDA 3PINA 3F4TA 3FYGA 4JE1A 4HU9A 20GSA 2V1MA 5A4VA 2VLVA 3ZZXA 1MEKA 4F82A 1A2MA 3DKSA 2YN1A 3ZRDA 3TJGA 5IMZA 1YY7A 3TCOA 1JZOA 3Q6OA 5FT3A 2IMIA 2H71A 4GQCA 4EKZA 2JZRA 2PPTA 4QL7A 2CZ3A 3RDWA 5F8BA 3W8SA 4PNFA 1Z6MA 1SU9A 1F9MA 3ERGA 1V98A 1M99A 2VLUA 5ELAA 5L71A 4MMMA 5A4UA 1A24A 2X8CA 1T8EB 2AB6A 2R3XA 3QFAC 3HA9A 2RM6A 5G31A 2KP1A 1F3BA 1PMTA 1QUWA 4Q5FA 3WT2A 3WGXA 1U3IA 4BWQA 4TRXA 5KN2A 5IOXA 3VPQA 1GSFA 2IFQA 1PL2A 4V1Ag 5HR1A 3US3A 5G1KA 2VL9A 2N5AA 1OVNA 3GX8A 4JZQA 5LNKe 5GSTA 1OC9A 4F9ZA 2GDRA 2RUEA 1Z7PA 3IPZA 3BBYA 1YKAA 2C0EA 2AHEA 2YNXA 2FA4A 4MF5A 5D93A 2JZSA 1X9WB 2IN3A 5IQYA 1B4QA 2X8GA 2RUFA 1LBKA 2CAQA 1XCCA 4EVMA 1MDKA 3GKKA 1HNAA 2LRTA 3KD0A 3TKPA 3GNJA 2F3MA 2CVBA 1FB6A 1ZYEA 2FWEA 1TU8A 1SKWB 3IA1A 1RK4A 2LNTA 4HU7A 3CRTA 3NZNA 3TOUA 3C73A 3DEXA 3DXBA 3ZIVA 3H8QA 2DJKA 4G10A 2JSYA 4GXZA 3WYWA 1ERVA 2H8LA 3W6GA 1VGLA 2VLTA 3GV1A 2B7JA 2HFDA 5H5RA 3BCIA 2OBKA 3HYPA 2C3QA 5GAND 2H75A 3G7JA 4L8EA 2R2JA 4PQHA 3KIJA 2VAFA 4CHSA 5JWRB 3HCZA 2LJRA 2YWIA 2V32A 3WT1A 5J9CA 1ERWA 2PU9C 2GQKA 4OMVA 1SD9A 2V6OA 2LTKA 4K8MA 3AY8A 3HZ4A 4LLRA 2AV4A 2C80A 1AQVA 4KCAA 2HZFA 4EXJA 3P90A 5LCZA 3VWWA 1A23A 4NV2A 1VF1A 2GZZA 3LEFA 6GSYA 1JHBA 2DLXA 2XPEA 5IOWA 1PA3A 3F3QA 3KTBA 4KH7A 5DQYA 1THOA 2OKAA 2K18A 4XS6A 1XFLA 1BEDA 4ECCA 1K0BA 2QC7A 4HUAA 4MCUA 5DALB 1URMA 3Q74A 3GUSA 2HE3A 1PSQA 3CSIA 3PH9A 2WGRA 3UBKA 2E2GA 3ME8A 5E4WA 2R5GA 1V58A 5FWGA 1YDKA 3F4SA 1YF0A 3UARA 3QAWA 5F0GA 1Z3EA 5JCWA 4TXVA 3GSSA 5ENUA 1AIUA 3KEBA 4PURA 1R5AA 1ZMAA 3ME7A 3UMAA 4XRDA 5D73A 2H74A 1ZZYA 3GHAA 2H6ZA 4F0CA 1YEXA 1YQ1A 2OE3A 4ZB9A 4MPGA 1FW1A 1Q98A 2LJKA 2F8FA 2P0GA 3GH6A 4ECJA 1R4WA 1PKWA 1WP0A 1X5EA 2LQOA 2IJYA 4YQUA 3ZTLA 5A5KA 2G0FA 4BVXA 4ECBA 4WBJA 3SWLA 5H5QA 3GURA 3QAGA 1GP1A 3TUEA 1C72A 2CZ2A 2H1BA 1T4YA 1S3CA 2HXKA 9GSSA 1DSBA 4IQ1A 4ZL7A 3QDNA 1M9BA 1TDIA 3MNGA 3GMFA 5EL8A 2NVLA 1CQHA 3VWVA 2AYTA 16GSA 2WB9A 4HQSA 1M7TA 3APQA 3EVIA 3LSZA 3WD6A 3GIXA 4Q5NA 4IQAA 4ML6A 3IOSA 2IWTA 2L4QA 2OE0A 3KP8A 1SL1B 4I97A 2B3SA 1GNWA 1EV9A 5EPFA 2HRNA 3RHBA 2L59A 2F8AA 2ON7A 2LS5A 2VD0A 3FK8A 2CA8A 2E7PA 5DVBA 1PKZA 4L0UA 1ABAA 5F07A 2AUVA 2MBTA 5G30A 1T4ZA 4G19A 3VI5A 1DE2A 2TRXA 3H79A 4J57E 4HI7A 1SYRA 1AQXA 1VF3A 3ZYWA 4PGTA 3I6AA 5AGYA 4G9HA 3MDKA 2HZEB 3FZ9A 4LL4B 1G6WA 3FZ4A 2DSAA 1QFNA 4GRFA 2NBSA 3LJRA 4RUVA 2CQ9A 2JADA 3I9V2 4GSSA 5IIZA 2EIOA 1MTCA 4I2UA 2GTUA 2VM1A 3F6DA 2R37A 4FIWA 3VURA 3C1RA 3FR6A 2EIRA 4JBBA 1PL1A 4ACSA 2PWJA 6GSUA 2IIYA 1YEPA 1DE1A 5J41A 2WZ9A 1AUCA 4EC0A 2GT6A 4NHZA 3KTLA 4IBPA 1GSDA 1QGVA 1IYHA 1PX7A 5G2ZA 3CTGA 5ECPB 2PERA 2YP6A 2L6DA 3WGEA 2GSSA 1GSSA 2NPBA 4ISDA 2L5OA 3KCMA 3DVXA 1K0NA 3UOMA 3HJPA 8GSSA 1KNGA 3FEUA 4JR4A 2TRCP 2YV7A 2IMFA 3S9FA 4TN8A 1ERUA 5E59A 3LXTA 3KJYA 3GFKA 4E8EA 2VM2A 5AISA 1FAAA 2YJ7A 3LFLA 4TR3A 2YJHA 1EEJA 1GWCA 3VK9A 5IPGA 5ECQB 3LORA 4PXOA 3D6IA 2FCHA 2N5BA 2O85A 2B5YA 2XBQA 5ECMB 2H76A 2OE1A 4JRRA 2C4JA 4J2FA 1AC1A 2BJXA 2KP2A 11GSA 5G5EA 3CXGA 4K7NA 1BX9A 3IK7A 2E2MA 2B1KA 3L9SA 3LYKA 1SJ6A 3ZMLA 1E2YA 4HDEA 1B8XA 1X5CA 4XCSA 4OO4A 1J0FA 3D4TA 1AAZA 3F8UA 3VLNA 4KB3A 5IO0A 1AW9A 2F9SA 2VIMA 2YOIA 2IMEA 3GTUB 1FVJA 3FZ5A 1KEBA 4LMWA 4J56E 3KXOA 3Q18A 3UL3A 1R5PA 4XRAA 3GSTA 3LG6A 4QQ7A 4TXOB 4ULXA 5HR3A 5CRHA 2LV3A 3JCML 4HS1A 4NAXA 2C1YA 1EWXA 5HR2A 2X64A 1PGTA 2QSIA 5JWQB 2WFCA 3L0HA 4MLYA 3EU3A 4IN0A 4NMUA 2HT9A 2FD3A 3NIVA 1J08A 3EINA 1V9WA 4IKHA 3EE2A 1NW2A 3GYKA 4MJAA 1XWGA 1I9DA 4HZ2A 2B5XA 4K6XA 4DSRA 2FA8A 1M9AA 1H75A 1WWJA 3RHCA 3FHKA 4XS4B 5ECNB 1TI3A 5F06A 1MDJA 1GNEA 4V1Ap 2PGTA 1B48A 5H5SA 1TOFA 4BVYA 3UAPA 2YPMA 3DRNA 3F9UA 1MD4A 1WMJA 3TJKA 1Z6NA 1O6JA 1Z9HA 3ERWA 2H0IA 4RI7A 2ES7A 2DMMA 3LYPA 1FVKA 4KDXA 3UEMA 3ZVJD 5CRDA 3CTFA 4KGIA 1O8WA 2GS3A 4H86A 4N0VA 3H1NA 2CAIA 2V2GA 3VWUA 3M0FA 2ZCTA 1DUGA 2QKEA 1IYIA 1I5GA 1NHYA 2GSTA 1PD21 3RBTA 4MJCA 1T7PB 4O92A 1K0AA 4WF4A 2H0GA 2OJLA 3G9BA 2WS2A 1M2DA 3WGDA 4JR6A 5D8IA 1ZCPA 3HHVA 3BCKA 4WF5A 2PN8A 5DALA 1ERTA 3TB2A 5D96A 1RW1A 5EY6A 2GQLA 3GL5A 3CMIA 5ABRA 2H1AA 2VL2A 3P7XA 4Q5RA 1A0RP 1PQNA 4WEYA 2AAWA 2MMOA 3FW2A 3QOUA 4ZB8A 5B8BA 1BYEA 4MP4A 5A4WA 2VOCA 1G6YA 1K0DA 5J3RA 2VD1A 1XVWA 3VI7A 2M72A 4IVFA 1B9YC 4NPBA 2LRNA 3N9JA 3QR6A 4N10A 2LJAA 3HVXA 1QMVA 1VF4A 1A2LA 1W89A 2N5FA 2P31A 4IHUA 4CW9A 4MH3A 1M2BA 4ZB6A 2IPAA 1SL2B 5DAKB 4WETA 2XPDA 5CP1A 1VF2A 2PBJA 17GSA 4PQ1A 2PVOC 2H72A 3L9VA 1TI1A 4O32A 4ML1A 4E8HA 2B7KA 3EYTA 4MABA 5ECOB 1G7EA 1BAYA 5INYA 4D73B 1VRSD 3P2AA 1QXHA 2DIZA 3QCPA 3MSZA 5ID2B 3FR3A 2FNOA 1XW6A 5GAPD 1MD3A 3BJ5A 3TKRA 5IM9A 5J9BA 3LQ7A 4OD7A 5IO2A 2BMXA 1K3OA 1EEMA 2O7KA 3M1GA 3O3TA 3BOAA 1GTUA 2C3NA 2L5LA 4KE3A 2MMZA 3RAZA 3DIEA 2P5RA 1OYJA 1O85A 3ED3A 3QPMA 5D9TA 5F05A 2CX4A 5ECHB 3D4MA 4GCIA 4IELA 4DVCA 3ZVJA 4AJ7A 4EL1A 3F3RA 3GX0A 2V6KA 4JEDA 1KTEA 3HJOA 5IMCA 4ZBDA 4DSSA 2GZYA 3TOTA 2HNLA 4OWYA 4OFMA 3UVHA 3IV4A 1XW5A 1GUMA 3TRPA 2HZEA 4LA1A 4MJBA 5IMFA 18GSA 2K6VA 1CQGA 3MWHA 1XBSA 2HRFA 3O76A 4POKA 22GSA 3HDCA 5EVOA 5C04A 2K9FA 3LGCA 1EZKA 2IL3A 1UN2A 4GWRA 2A2RA 3M9KA 5J4UA 1J9BA 1JZDA 3FZAA 1N8JA 2O89A 3PGTA 3J7Yk 1YJ6A 4K7IA 5DJLA 3GN3A 3D22A 5IMDA 3HJMA 3CYNA 3A3TA 3C1SA 4P3YB 2XC2A 3O6TA 3TJFA 5KEJA 1F37A 1UVZA 3KGKA 1HNCA 4K2DA 2H30A 4X43A 5CRWA 1XW9A 3DD3A 2C0DA 2P5QA 1USBA 2B1LA 1V2AA 2RM5A 1U3AA 1TJDA 2MYGA 3C7MA 13GSA 3E0UA 3PR8A 2I4AA 5CREA 3TKQA 1MDIA 4GSNA 4ZIJA 1GSQA 4YQVA 1JFUA 1NHOA 2VL2C 2VCXA 4DSSB 1O8XA 1T1VA 4KW6A 2GT5A 1JLVA 19GSA 3ZREA 2GLRA 3R2QA 3I43A 5AN1A 3HXSA 4V2MA 4K9ZA 3F63A 4MK3A 2M46A 1GL8A 2DJ3A 4IP6A 4KAEA 1GTIA 3CSJA 1TK0B 4KA0A 1F3AA 2RLIA 1TRWA 3GKNA 1TKDB 3ISOA 1OE8A 3M8NA 1LJRA 2H0HA 2E0QA 4ZL8A 2MBSA 4HJMA 4ECIA 2WDUA 2IMKA 5DCGA 2I1UA 5CNWA 5HR0A 4PUFC 2LUSA 5CYYA 1GTAA 3OR5A 1YF1A 4IJ3A 5IPHA 1ZOFA 2H1DA 1EP7A 2C8UA 3HY2A 5ECLB 3ZITA 4I5QA 2VCQA 1XVQA 3TJJA 3SBCA 1TK5B 3GTUA 2JSZA 5JCUA 1FG4A 1OC3A 4N11A 1EP8A 1O7UA 3K8NA 3HD5A 1SK0A 4RQXA 2CVKA 4AGSA 2OACA 2WJUA 3QAVA 1A8YA 2DJJA 3IBHA 4TXOA 1EGOA 1O81A 4CDOA 1FOVA 4EE0A 5ECSA 3J7Yb 2Z9SA 2WULA 1FO5A 2WRTA 3L9UA 5GSSA 1G0TA 4RQRA 3ZLPA 3FKFA 5C00A 2CV4A 4PUAA 2JZTA 2H6XA 4FYUA 4MZBA 3M3MA 2C0GA 1HNBA 2H66A 2I81A 4YAVA 4MJEA 1XXUA 2EIQA 4ID0A 2HI7A 3EU4A 1UC7A 2DJ0A 4XS4A 4YH2A 4K7OA 2VUPA 3LXZA 1XOAA 3ZL5A 1XZOA 3F6FA 2GGTA 4V2LA 4FYCA 4NV5A 2LNSA 4TR4A 1SYXA 2LKUA 3L78A 2V41A 4K0NA 7GSSA 2YCDA 1Y25A 4F2IA 4TVEA 1THXA 5ECIB 3Q19A 4PQIA 2XBIA 3KH7A 4KSOA 5HQPA 2JU5A 2VCZA 4IGJA 1V57A 1TTZA 4K0GA 2DIYA 4I2TA 3IR4A 4F0BA 2D2ZA 1WPIA 6GSSA 3APOA 3LWAA 3GL3A 2H73A 3EURA 4LMVA 1TP9A 1TXXA 1ML6A 4O7HA 1BJXA 4FYBA 1AQWA 1RQMA 3DYRA 4TKYA 3H93A 1Q4JA 2REMA 1U6TA 3ZIJA 1SJZA 1K0MA 2L57A 1X0RA 1TRSA 1ZL9A 3U6VA 4DSQA 3IE3A 2NTOA 4GSTA 4ILFA 4ZL9A 2HSYA 2ON5A 2X99A 3HVSA 1N2AA 5G5FA 2G2QA 4X0XA 2YZHA 2I9HA 4IW9A 4WR4A 1KBNA 4N0ZA 4TR1A 5DAKA 2FHEA 2PMTA 2FLSA 4TR0A 1OE7A 1WOUA 3G7YA 1WJKA 2NDOA 4PNGA 1XWAA 4POLA 2KUCA 1DBYA 3C71A 1SKRB 1OC8A 1GSEA 5KN3A 4WBRD 4POBA 2IMDA 2VO4A 2MMNA 3G7IA 3IC4A 1XOBA 4D73A 2B6MA 3DMLA 1B9XC 1ST9A 2XHFA 5ID2A 3KMNA 2F51A 4WKWA 5IMVA 3TKSC 5DBQA 1PRXA 1EV4A 5G1LA 4HZ4A 4IS0A 2CVDA 4G2EA 3ERFA 2DJ2A 5CO3A 2EC4A 2B5EA 3IXRA 2O87A 1U88A 3EMPA 1HD2A 2ZUPA 4L0WA 1JLWA 3IHQA 1HYUA 3HVVA 4F03A 3UVTA 4KSMA 2M80A 3V1WA 4IJIA 1R7HA 4XHMA 5B6NA 3DGQA 5D9WA 4HJ2A 4Z7XA 3E3EA 1T00A 2IFQB 4HEA2 1TW9A 1SJIA 1XWCA 3KP9A 1WIKA 2OBIA 2AJQB 2TIRA 2GVPA 1PN9A 2WCIA 3ZFLA 2ZNMA 4OFTA 4TR1B 4XTSA 1OC9B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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