4JU5A

Crystal structure of the dimeric form of the bb' domains of human protein disulfide isomerase
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
200
Chain Sequence
AATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSKYQLDKDGVVLFKKFDEGRNNFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYDGKLSNFKTAAESFKGKILFIFIDSDHTDNQRILEFFGLKKEECPAVRLITLEETAERITEFCHRFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Protein disulfide-isomerase
publication title Structural insight into the dimerization of human protein disulfide isomerase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Isomerase
total genus 56
structure length 200
sequence length 212
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ju5A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ju5A01
1F3BA 1G7OA 4WKWA 4LA1A 1X5DA 4AJ8A 2K6VA 3GYKA 3KTBA 5CRWA 4H86A 1AC1A 5GSTA 1V40A 3V1WA 3BBYA 2DJ3A 6GSSA 1NHOA 2AB6A 3MAKA 1XW5A 5D9XA 1M2AA 3EMPA 1O8WA 3TJGA 4QL9A 2E0QA 3GTUB 2CAQA 3ERWA 1UVZA 1YQ1A 2EIQA 1SL0B 4GSSA 3HZ8A 5JCWA 2MMAA 3PR8A 4NXIA 4TOPA 3TUEA 18GSA 3GSTA 3FR9A 2H0HA 3VFIA 2DIZA 4LL1B 2B5YA 4TN8A 4XS4B 4LLRA 2IFQB 2VUPA 3DYRA 2DJJA 1GTBA 2BMXA 5LNKe 5ECHB 2X8CA 2GLRA 2VIMA 2M46A 1Z3EA 13GSA 5ELAA 1PD21 2YANA 1FVKA 3GKMA 4BPYA 4ECCA 4ECJA 3UVHA 5HQPA 1N2AA 2C0FA 4NV5A 2X64A 2MZCA 2G2QA 3APOA 4ZXGA 4I2TA 2AHEA 2J23A 5A4WA 5KEJA 3F4SA 5CYYA 2KP1A 5G1KA 4ZIJA 1OKTA 3C8EA 3LGCA 3UARA 3IHQA 1ZOFA 3W8JA 1M9BA 1GSFA 4L0WA 1BYEA 5D9VA 2FWGA 2DJ0A 3GH6A 1T3BA 2V2GA 2M72A 1X5CA 3UL3A 4I5QA 4JU5A 3MSZA 1B4QA 3UEMA 5GZZB 1XWBA 2LJRA 2LRTA 3HZ4A 3LEFA 2WCIA 5ECSA 4MPGA 5EPFA 2RUEA 2VCTA 1Z7RA 2GVPA 2HFDA 2V41A 4N10A 6GSWA 4N0ZA 5JWQB 2JZRA 8GSSA 1ZGNA 4G10A 4IHUA 1PGTA 1WPIA 1V58A 2FUG2 3QAGA 1ZL9A 5DJMA 2OE3A 3C1SA 4FYCA 4KNDA 2GT5A 2X99A 3I43A 4JZQA 3HVSA 3F0IA 4DSSA 1X9SB 5L71A 4YQMA 1XOBA 1X0RA 2ON5A 4KDXA 2CT6A 5G31A 5B6NA 2GSTA 3W6GA 2FGXA 2PVOC 1GSEA 4MF7A 4EKZA 1ILOA 1W89A 4Q5FA 2H19A 1K3LA 2C1YA 3TJKA 1A0FA 1A23A 2C0GA 4DEJA 4FO5A 4EVMA 2VO4A 2YJHA 2VAFA 1I5GA 2DJ2A 1ZCPA 1MDJA 5GAPD 2H72A 5DCHA 5KN1A 1ZYEA 1QUWA 2JZSA 3UVTA 5E4WA 2MBTA 1A2LA 3F8UA 1EEMA 2N5FA 4HZ2A 1OVNA 2F51A 4NHWA 5GAND 2YV9A 4OO5A 2HYXA 2LS5A 2WJUA 3MWHA 2NVLA 2NBSA 2PERA 4F03A 5H5RA 3EYTA 2CX3A 1LU4A 1YF1A 2WRTA 4MH2A 2WDUA 1PN9A 1QGVA 1V98A 2GSRA 1TP9A 3M3MA 4IGJA 3VPTA 2FA8A 2B6MA 1EP8A 3KTLA 2CX4A 1QXHA 2WGRA 1UN2A 5KN0A 3ME7A 3M9JA 2X8GA 3D5JA 1YZXA 3IPZA 4RQXA 1Z5YE 1ZZYA 4OCEA 1EOGA 3ZREA 1R26A 2YN1A 4ZB9A 1TU8A 3ZZXA 4OMVA 1XBSA 4JR4A 2JU5A 2R37A 3CSJA 2LSTA 2RIIA 1ON4A 9GSSA 2QKEA 3QMXA 5HR1A 3ZL5A 1XWKA 4OWYA 2VLVA 3GIXA 1XVQA 6GSVA 4JBBA 2IJYA 1LBKA 3FHKA 3KZQA 2H76A 1YKAA 3UBLA 1NW2A 4V2MA 3N9JA 2FLSA 2RM5A 2HZEA 3BCKA 3IK9A 4F2IA 2L6DA 4MZBA 3ZLPA 3RHBA 2EIOA 3DMLA 1VGLA 4RI6A 3F9UA 3TKPA 4PQIA 3D4TA 1GLQA 3KMNA 5CP1A 4N0VA 2O87A 4KW6A 3FK8A 4FH8A 10GSA 3FR6A 1EEJA 2Z9SA 1QMVA 5JCGA 1TI1A 4KUNA 1PRXA 3RAZA 4K0NA 3QFAC 2YWMA 3GN3A 2FHEA 3DRNA 2VD1A 4GRFA 2GDRA 4TR4A 1JLVA 3DXBA 3UOMA 4TXVA 2C3TA 3FY7A 4KGIA 4O7HA 4EL1A 1EV4A 1R4WA 4TXOB 1PSQA 4HU9A 5HFKA 2TIRA 3LXTA 3SWLA 3VWUA 1V9WA 2BJXA 4MMMA 4PNFA 1AQVA 1SK1A 2JACA 2B1KA 1Z6MA 4KDYA 1XVWA 4XS6A 1TXXA 4JEDA 2B7JA 4Q5RA 4OD7A 2O7KA 1NM3A 4EC0A 2OKAA 4NAXA 2O89A 3W8SA 3AY8A 2CZ3A 1AUCA 3F4TA 1I9DA 1OC9A 2H71A 3TRQA 2YPMA 2F9SA 2I3YA 3RBTA 2GS3A 2V6KA 1Y25A 5COHA 4KH7A 5A4VA 1QK8A 3TGZA 2OBKA 3DVWA 4ZILA 4HQZA 3CXGA 4ACSA 4XS1A 1GSSA 2HE3A 20GSA 3FZ9A 1SYRA 2HSYA 2AAWA 3MDKA 1WIKA 1H75A 2YZHA 16GSA 3ZITA 1SU9A 1GSUA 1YEPA 5DJLA 4NMUA 2CZ2A 3S9FA 1TOFA 3KIJA 4MLYA 4F0CA 2CVKA 5CAXA 2YJ7A 4WEYA 2KLXA 5G1LA 4IJIA 5DALB 1GSDA 4JRRA 4WR5A 4F0BA 2YZUA 3A3TA 4D73B 4ZBDA 4EUYA 3P90A 4K7IA 2DJKA 2JSYA 3D4MA 4HZ4A 2K18A 1THXA 4TRXA 2L5LA 1GLPA 3M1GA 2LKUA 1JZDA 4G9HA 1SK2A 4MF5A 1B8XA 5IO2A 1GUKA 1AW9A 2C0EA 2K8VA 1SJIA 1V57A 5FT3A 1TI3A 2IWTA 3CMIA 5DBQA 2H74A 1TDIA 3QAWA 1VF1A 5DQYA 3PINA 5ECLB 4K6XA 2L57A 1JZOA 1A2JA 2WS2A 3GKKA 4MJCA 2VL2C 2I81A 4K8MA 3WGEA 4NPBA 4J57E 1OAZA 3LXZA 5IMCA 5ECRB 1K0OA 3LQ7A 2R5GA 2HI7A 3WT2A 4L0UA 1Y6EA 3KP8A 2ZCTA 3NOFA 3O6TA 4HJMA 3GKNA 4PURA 2AJQB 4ZB8A 5ECNB 2C8UA 4KA0A 1SKWB 4NV2A 1AAZA 5B6MA 2I1UA 2IL3A 1TU7A 3NIVA 1HQOA 3QR6A 1ZYQB 2YWIA 3QCPA 4K1FA 1T7PB 2LJKA 4X0XA 4KB3A 2E2GA 5IIZA 2REMA 1GULA 2DJ1A 4KAEA 1PA3A 4YQUA 1XZOA 2ES7A 4GWRA 1YF0A 2WULA 5J41A 4MZWA 1JZWA 4YAVA 2VM2A 3ZFLA 2YNXA 1FG4A 2VCWA 5AIVA 1TRVA 5G2ZA 4POKA 2XPEA 3L9VA 4XCSA 1TK5B 2LRCA 3TJJA 4KDUA 4EDZA 1EV9A 3F3RA 4ML1A 2DIYA 1GRXA 2ALBA 3D6IA 2LTKA 2IMIA 1XOAA 4LMVA 1GL8A 2PBJA 3GX0A 2O85A 1MEKA 4OO4A 4PX1A 3DWVA 2FCHA 2B3SA 4BVYA 3G9BA 5HR3A 3TKRA 3HY2A 3OR5A 4V2NA 3LORA 1JHBA 3SBCA 5DAKB 4IS0A 2B7KA 3KP9A 1XIYA 1DE1A 4MCUA 1ERTA 2H70A 3IDVA 3EINA 1PX6A 3I6AA 2DMMA 2YP6A 3I69A 4MF6A 4TW5A 1EOHA 1TJDA 5DVBA 4J2FA 4PUFC 4IW9A 2HRNA 3PGTA 4PQ1A 5ID2B 2HXKA 1GNEA 3FRCA 4QQ7A 3FEUA 2DMLA 3FZ4A 3QOUA 4WF4A 4ZBAA 1K0NA 1G7EA 3EC3A 2MBSA 1USBA 1FAAA 2GSSA 1O6JA 1VF4A 4IJ3A 1J9BA 1WOUA 3DKSA 3M0FA 1JLWA 4HUAA 1YJ6A 4CDOA 3H4KA 5D96A 5H5QA 4DSRA 2A2SA 3VWWA 4RI7A 2F3MA 2LQQA 2L59A 3EU3A 1YY7A 3WGXA 2DSAA 4ID0A 2H73A 3U6VA 1SD8A 1J08A 2P31A 4MA9A 3US3A 1WJKA 1PX7A 3E9JB 3QAVA 3WD6A 1SJZA 3F3QA 2IMFA 1Q4JA 2GZZA 1T1VA 1XW6A 1WP0A 3GA4A 2GQLA 1HYUA 2V6OA 4XRDA 2KHPA 4N30A 2AUVA 5FHIA 1SL1B 2QSIA 2HLSA 3QFBC 4TR1A 4F9ZA 3ZIVA 1M2DA 1U3AA 2P5QA 3IK7A 1XPVA 1T00A 1X9MB 3LYKA 3TDGA 5IMVA 3CTFA 1E2YA 4YQVA 3CRTA 3RDWA 1A24A 4HI7A 1A8YA 3LYPA 3ZRDA 1GSYA 2PVQA 5D73A 5AIXA 3HYPA 4F82A 4XIHA 2H0GA 1GWCA 3UJ1A 2H30A 3IA1A 2JSZA 4PXOA 2PMTA 2O8VB 4TKYA 2GQMA 2H8LA 1OYJA 1M99A 1SKSB 5LD0A 3G7IA 3EURA 4FYUA 3KGKA 3ERFA 4GQFA 3F6DA 1SD9A 4FIWA 5DCGA 4GLTA 1IYIA 3GMFA 4WBJA 4IP6A 3HJMA 2PU9C 4WXTA 3FR3A 3GV1A 1OE8A 4BA7A 3A2XA 2DLXA 3GL5A 2FD3A 3J7Yk 1O81A 3GH9A 4GQCA 2LEGA 1U6TA 3HHVA 4KE3A 1U3IA 5ABRA 1YDKA 4ULXA 2FWEA 3UBKA 5EL8A 5CREA 1FB6A 1SJ6A 4GF0A 2H1BA 1TK0B 3BOAA 4DSSB 1MD4A 1LJRA 3Q18A 1O73A 1EZKA 5DQSA 2WFCA 1XXUA 2PN8A 3TKSE 2KOKA 2L6CA 3HCZA 2TRXA 3ZMLA 4K7OA 4WF5A 1UC7A 2GQKA 4PGTA 3ZVJD 1WWJA 2FY6A 1CQGA 1SK0A 3L9SA 2GSQA 1KEBA 2CVDA 3EVIA 3KH9A 4I2UA 3GHAA 5IMFA 3TB2A 3L78A 1F2EA 3PH9A 1PKWA 2C3QA 3VLNA 5CRDA 1EGRA 1GUHA 3TJFA 2N5AA 3IOSA 4J56E 1XW9A 4HOJA 4NWYA 3GTUA 11GSA 2VL2A 1FHEA 2GGTA 3A2WA 1F9MA 4NHZA 2R4VA 5ECKB 3GFKA 5HFIA 3WGDA 2LNTA 4IVFA 3LFLA 2LQOA 2L4QA 4RUVA 2CVBA 3VPQA 4FYBA 1UA5A 5F05A 7GSSA 1XWAA 4XS4A 2IFQA 1PKZA 2RM6A 4KCEA 3GSSA 1T4ZA 2EIRA 2E2MA 5LCZA 2VL3A 5D93A 5KN2A 3VURA 2PUKC 3GRXA 1XWGA 2H6ZA 19GSA 3D0ZA 5ELGA 1ERWA 2IMKA 4LMWA 1K0AA 1Z7PA 2VOCA 2WB9A 4I8BA 1U87A 2N5BA 2VCZA 3G7YA 1BQ7A 4EF0A 1EGOA 3GL3A 1X9WB 1DSBA 4X1UA 2HZFA 3ZIJA 5F07A 3IV4A 1Z6NA 3CBUA 1C72A 3GUSA 2YWNA 4EE0A 3BD2A 1RK4A 2R3XA 5IPHA 1B9XC 4BL7A 2HZEB 4V1Ap 3EMXA 3GKXA 3KXOA 1SKRB 4ZB6A 4L5OA 2M80A 1WMJA 1URMA 4GSNA 1DE2A 3L0HA 3IRAA 3LWAA 3TOUA 1FB0A 6GSXA 1ABAA 2H1DA 5F0GA 4KSOA 3K8NA 2HT9A 1J0FA 1O8XA 22GSA 2PGTA 2X8HA 3ISOA 4HS1A 1DUGA 3TRPA 3IBHA 2JZTA 4G19A 2MMOA 2K8SA 1MD3A 4POMA 12GSA 4BWSA 3L9UA 3GNJA 4L5LA 4I97A 1BAYA 5B8AA 4HQSA 2CQ9A 4LL4B 2LV3A 3O3TA 3APSA 2HNLA 2IMEA 3CSHA 2PPTA 2DBCA 3DD3A 4IQ1A 2R2JA 1OC3A 3C1RA 3QD9A 4GXZA 5FWGA 2FWHA 4BWQA 4IELA 1NHYA 4EXJA 3LSZA 2MMNA 2VM1A 1OKDA 4K7NA 5IMAA 3DGQA 5D9TA 3HKRA 4CW9A 4POBA 2H0IA 2ON7A 3U5RE 1Z9HA 3ZTLA 1BG5A 1GNWA 4Q5QA 3WT1A 3R2QA 1ERUA 2G0FA 5EVOA 1MDKA 5B7CA 1ZMAA 5J3RA 1OC9B 5ECQB 3EE2A 4GSTA 4N11A 1O85A 1IYHA 1TRUA 3ME8A 4L8EA 5C00A 1M7TA 1K0MA 5GSSA 17GSA 1BJXA 1FVJA 4IQAA 3VI7A 1M0UA 2KP2A 1B4PA 5EY6A 2WZ9A 4ZL8A 1GTAA 1K3OA 1Q98A 1K0CA 2V1MA 4TR0A 4WETA 1HNAA 5HR0A 2XPDA 1VF2A 4MP4A 3C71A 1X5EA 4MK3A 3M9KA 1A0RP 2B5EA 3HA9A 3TCOA 2PWJA 3VI5A 2H66A 5F06A 3L4NA 1B9YC 1TTZA 4ECIA 2ZUPA 5A4UA 4O32A 1M9AA 2F8AA 2H6YA 3ZYWA 3QDNA 1PL1A 1R7HA 3CYNA 3C73A 3HD5A 3H93A 2OE1A 1SYXA 4XHMA 3MNGA 4GTUA 1A8LA 1VRSD 4E8HA 1JFUA 4JE1A 4DVCA 3KM6A 3UMAA 3TKSC 3CRUA 3CSIA 5HFGA 2YCDA 5G30A 1V2AA 4HJ2A 1N8JA 5CRGA 4PUAA 1GTIA 4RQRA 3N5OA 3H1NA 2GTUA 4ILFA 4KX4A 5CO3A 5J4UA 1PQNA 4PQHA 2YV7A 3G7JA 3A5WA 1MTCA 3Q19A 5JCUA 1RQMA 4MDCA 3KD0A 5AISA 2V32A 1KNGA 1RW1A 4IP1A 3FZAA 4AJ6A 3M8NA 3E0UA 3DVXA 4MJEA 4MABA 1GUMA 2TRCP 1K0DA 5C04A 3ZMKA 2JADA 1GP1A 1TK8B 5F8BA 2IMDA 3ZVJA 4I6XA 2KUCA 1TKDB 2F8FA 2RUFA 4POLA 4HDEA 1HNCA 3IAS2 5J9BA 2J9HA 3FZ5A 4K0GA 4ECBA 3APQA 2MYGA 2VCVA 3QPMA 4IKHA 4Q5NA 3RPPA 2LUSA 1XWCA 1CQHA 4MPFA 5DDLA 5IPGA 2MMZA 3EWLA 4TXOA 1WRYA 2OADA 3WYWA 2IPAA 3IC4A 4OFTA 3Q74A 1MDIA 5J5NA 3F4RA 3KJYA 2C0DA 5ECPB 1S3DA 3E3EA 1AQWA 3FKFA 1YEXA 2FA4A 1E6BA 2OACA 1TW9A 2H1GA 1ML6A 5A5KA 4Z7XA 2IN3A 1AQXA 1HD2A 4PNGA 4GCIA 1JZRA 2JL4A 5IO0A 3O76A 5KN3A 3KH7A 2FNOA 5HR2A 4OFNA 2EC4A 3H79A 5IOWA 1EWXA 2HSHA 1NSWA 2E7PA 1G6WA 3TKQA 2VCQA 3DEXA 4IBPA 2YWOA 1KBNA 1SL2B 1XFLA 2HRFA 5IQYA 3TOTA 2NTOA 3Q6OA 5G5FA 3VWVA 3TJBA 2OE0A 2VLUA 4JR6A 4YH2A 3KEBA 4YAPA 3HVXA 2LNSA 4P3YB 2VCXA 4ISDA 1DBYA 2OJLA 1F3AA 1BX9A 3BCIA 3VK9A 4XTSA 4O5RA 1BEDA 5ECOB 1GH2A 4KCAA 4O92A 3CTGA 2OBIA 4EDYA 2QGVA 5DALA 4V2LA 1GTUA 5CNWA 3FYGA 3HDCA 4TR3A 14GSA 3H8QA 1A2MA 3P7XA 1XCCA 3HXSA 1OE7A 4D73A 1ERVA 4WBRD 4WR4A 4X43A 2ZNMA 4OFMA 3UIWA 1AXDA 1S3CA 2GT6A 3F6FA 2GZPA 1ACVA 4EO3A 5IMZA 5IM9A 5AGYA 1AIUA 5IMDA 1S3AA 2I9HA 2H6XA 3J7Yb 1H4OA 3P8WA 3GX8A 1F37A 4AF2A 2H01A 1THOA 2FWFA 1G0TA 1K0BA 1U88A 1O7UA 5D8IA 3RHCA 2P0GA 3KMOA 2RLIA 4ML6A 2GZYA 2L4CA 2A2RA 3EU4A 1EP7A 3D21A 5JWRB 4TR1B 1ST9A 1W4VA 2XBQA 1QQ2A 2YOIA 1VF3A 3IAM2 4QL7A 1PL2A 1B48A 5E59A 4ZL9A 2CAIA 3HJPA 3FW2A 3I9V2 6GSYA 2C3NA 4DSQA 1R5AA 5JWOB 3LJRA 4K9ZA 5IOXA 2A4VA 3TRXA 3ED3A 1SENA 2AYTA 3DIEA 4XRAA 2VD0A 2B1LA 2I4AA 2H1AA 4CHSA 5J9CA 3ZFBA 3IXRA 2AV4A 4MJAA 2LRNA 3P2AA 2OA7A 4HU7A 1YKCA 4G2EA 2BTOT 1QFNA 4BVXA 2C4JA 3UAPA 5H5SA 3KCMA 4ZL7A 3A2VA 4ZBBA 1FOVA 1WE0A 3VWXA 2XBIA 3D22A 2NDOA 5D9WA 1GSQA 5ENUA 2XC2A 5G5EA 3IR4A 1K3YA 2C80A 4OCFA 2LJAA 4MZCA 4IN0A 1T4YA 4TVEA 2P5RA 4HEA2 5B8BA 1M2BA 6GSTA 1T8EB 1FW1A 3HVVA 3GURA 1OC8A 3JCML 2DC5A 1TRWA 6GSUA 3BJ5A 3F63A 2D2ZA 2B5XA 2R6KA 4KSMA 5ECMB 1FO5A 5ECIB 2XHFA 1TRSA 5DAKA 2L5OA 3NZNA 2NPBA 4AGSA 4AJ7A 3IE3A 5INYA 3LG6A 1F6MC 3ERGA 1KTEA 1G6YA 2CA8A 4K2DA 4MJBA 5CRHA 2IIYA 1HNBA 2VLTA 5ID2A 2H75A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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