4JU5A

Crystal structure of the dimeric form of the bb' domains of human protein disulfide isomerase
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
200
Chain Sequence
AATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSKYQLDKDGVVLFKKFDEGRNNFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYDGKLSNFKTAAESFKGKILFIFIDSDHTDNQRILEFFGLKKEECPAVRLITLEETAERITEFCHRFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Homo sapiens
publication title Structural insight into the dimerization of human protein disulfide isomerase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
total genus 56
structure length 200
sequence length 212
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ju5A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ju5A01
2DMMA 2MBSA 4ECJA 3F6DA 5FT3A 4POLA 3WT1A 1V40A 1SU9A 2H0IA 3ERFA 3H1NA 2PUKC 5GZZB 3CYNA 4JR6A 5G2ZA 2AYTA 2R37A 4EDYA 3IV4A 1NHYA 3FKFA 4XS4B 3CRUA 2IMDA 2REMA 4F0CA 2Z9SA 3BCIA 2WRTA 2WB9A 4RUVA 3BJ5A 3O76A 3QMXA 1GUMA 3DWVA 2GS3A 3C8EA 2HI7A 3IPZA 1V9WA 1OE7A 3CXGA 3DD3A 1DE1A 1X5DA 3N9JA 2ES7A 1PL2A 2V2GA 4EC0A 1BYEA 4LMWA 2QGVA 2YP6A 2I1UA 1SJ6A 1UC7A 3ZZXA 1XWBA 5CREA 4JBBA 1SK0A 1SD9A 1KEBA 1USBA 2GDRA 1T00A 1SKWB 3DYRA 4ZBBA 3EWLA 2MMAA 2VD0A 1QXHA 1AQVA 2YN1A 3LGCA 2CAQA 4AJ8A 4PQHA 1T7PB 4YQMA 5KN2A 4Z7XA 1K3YA 2FWFA 5F0GA 3DKSA 1LU4A 5KN1A 1F9MA 1F3BA 1X5EA 2PVOC 6GSYA 3G9BA 3ZFLA 3S9FA 2CX4A 3CRTA 5CRHA 2FHEA 2WDUA 2XPDA 4KX4A 5IOWA 2IWTA 3Q19A 5DQYA 5A4WA 4F0BA 2F51A 2IMKA 3TB2A 3IC4A 2GQKA 1JFUA 3GURA 4HUAA 4X0XA 4J57E 3M9JA 4AF2A 1TRSA 3F4SA 4PNFA 3TRXA 6GSVA 3UEMA 3HZ4A 5AIXA 1A8LA 3QAVA 5KN3A 5CNWA 4PXOA 3RAZA 3M8NA 1M2AA 4V1Ag 2G2QA 1M2BA 4TOPA 5ECKB 1FAAA 3G7IA 2E7PA 2CZ3A 2ZUPA 5IOXA 3VURA 2YJHA 2O87A 2YJ7A 3CSIA 5HQPA 1OC3A 4IJIA 1G0TA 3BD2A 2OACA 3L4NA 1HNBA 1OKDA 2H1DA 2X8GA 1AW9A 1PD21 2C0EA 5ECPB 3HKRA 1K0NA 1ERTA 5D96A 4BA7A 2GZYA 1FB0A 2GSSA 4KUNA 5ECMB 1GSSA 4K1FA 1S3AA 4G9HA 5G5EA 1RK4A 4WBRD 1YF0A 1PQNA 4OD7A 1TP9A 1Y6EA 1OE8A 2FLSA 2CVDA 1AXDA 4WR4A 4MPFA 4RQRA 3IR4A 5IQYA 4ECIA 1A0RP 3KMOA 2H70A 3QD9A 3PGTA 4BPYA 5AGYA 1AAZA 1SL2B 1QMVA 4GQCA 1I5GA 4Q5FA 2H8LA 3QAWA 2V6OA 3ZFBA 3WD6A 4OO4A 3RBTA 4GSNA 4TR4A 4ECBA 1SK1A 4LA1A 4K6XA 2J9HA 3F3QA 2L6CA 1WOUA 3IE3A 4G10A 3KGKA 4BWSA 3G7JA 2YWMA 1ACVA 1GNEA 4HDEA 2FCHA 5JWQB 3IAM2 1UA5A 1JZDA 2GZZA 3F63A 1Q98A 3GSSA 5IM9A 1DE2A 5IMFA 2C3TA 2KHPA 3F9UA 1TK8B 2OE3A 2C0DA 2LQQA 3D4MA 4Q5QA 3I9V2 4GRFA 4PUFC 4WXTA 5IMVA 1FG4A 4K7IA 1TK5B 3W6GA 2LV3A 2EIRA 1BQ7A 3CTGA 4F03A 1XOBA 3NOFA 4GSTA 4J56E 2GLRA 1GSEA 4O32A 2E0QA 1J9BA 4KB3A 3EYTA 1ML6A 3HVSA 3KM6A 4IJ3A 4XS4A 2L5LA 4NHZA 1N2AA 2RLIA 3UVHA 4XS6A 1ON4A 5HR3A 1JZWA 1E2YA 3VWWA 2PPTA 8GSSA 1SD8A 2LRCA 5ECIB 5A5KA 5ELGA 1K0OA 2LNSA 2L4QA 3TGZA 1Z7PA 1R4WA 1TOFA 4KGIA 1GRXA 4HI7A 3KJYA 4BL7A 1RQMA 4N11A 3D4TA 3VK9A 3LXTA 4X1UA 2K8SA 3GTUB 3LEFA 1PA3A 1FHEA 1HNCA 6GSXA 3UL3A 3CSHA 3HZ8A 5G1KA 3EMXA 2F3MA 1VF2A 2K6VA 3EU4A 4NHWA 4Q5RA 1O6JA 4L0UA 4WF5A 3LORA 1GSYA 2BMXA 5D8IA 3MAKA 4ECCA 3M3MA 5JCWA 4GF0A 1XW5A 2QSIA 1V57A 4I2UA 2K9FA 1GP1A 1TU7A 5G5FA 1A0FA 2P5RA 4L5OA 5DQSA 5KEJA 3IRAA 4D73B 1PKZA 2PN8A 4HQSA 1JLVA 1LBKA 1XIYA 4MZCA 4JEDA 1GSDA 1ZMAA 1XXUA 2H1GA 2WCIA 4HZ4A 4PX1A 3QOUA 4I5QA 1QGVA 2GZPA 6GSUA 1XPVA 2HE3A 3LFLA 2NVLA 2BTOT 4RQXA 3MNGA 4LMVA 2DIZA 4AJ6A 3F8UA 2H0GA 2XBIA 3KH9A 2DIYA 3RDWA 1T1VA 1CQGA 1BG5A 3U5RE 4QQ7A 1X9WB 2OBIA 2VCWA 2F9SA 1AC1A 1XW9A 1GUHA 2QKEA 3ISOA 4WF4A 5JWRB 1XWCA 2LS5A 4XCSA 1MTCA 2FWEA 1Z6MA 4NXIA 2B7JA 3ZVJD 1XOAA 3UOMA 2K18A 1FVKA 1ZOFA 1VF1A 2JZSA 6GSWA 1TXXA 2H76A 3ZL5A 1H75A 4PGTA 4MMMA 1U6TA 2YV7A 2PGTA 4F9ZA 1YQ1A 3LYKA 3GX8A 5HR0A 4MF6A 2LJAA 4LL4B 2MYGA 1GWCA 2BJXA 3KEBA 4OFTA 2NPBA 2JU5A 1B9XC 3U6VA 1TI3A 4JE1A 1YF1A 4E8HA 4PURA 3KCMA 1AQXA 14GSA 3DEXA 4HQZA 3L78A 2L59A 1MEKA 2VUPA 2VO4A 2AUVA 3QFAC 1PL1A 3CMIA 3LJRA 1M0UA 4IQ1A 3GKKA 4MPGA 3EVIA 2OKAA 2O85A 3RHBA 5ECRB 1OC9A 1A2JA 3GX0A 2JZRA 4FYCA 3ZTLA 1XFLA 5ECHB 2B1KA 5D73A 3P90A 3M0FA 1X9MB 2OADA 2V1MA 4KA0A 1THXA 1GTBA 5DCHA 3Q6OA 2PVQA 1SENA 2VLTA 1YDKA 5EVOA 1GTUA 3J7Yk 3FW2A 1CQHA 3FZ4A 2NDOA 1SYRA 2GQMA 2LKUA 2LJRA 5GAND 1MDJA 4NMUA 4ULXA 2IIYA 4EUYA 3Q74A 3PR8A 2IMIA 3GRXA 3QCPA 3W8SA 3EC3A 1SJZA 5CO3A 1IYHA 2HT9A 2CQ9A 2DBCA 2R3XA 2MBTA 1XCCA 1W4VA 2I81A 2I3YA 3ZRDA 3DIEA 3G7YA 4TXOB 3LG6A 2VM2A 4MJBA 1G7EA 4HS1A 4KDYA 1IYIA 2HSYA 2NTOA 1R7HA 3FZAA 3IK9A 3VWUA 4MF7A 4OFNA 12GSA 3GFKA 4RI7A 3BBYA 5ECQB 2DJKA 5HFIA 1OAZA 1GULA 3GNJA 5LCZA 2FD3A 1TRUA 2LTKA 2H1BA 4WEYA 1EWXA 1XBSA 5J3RA 3HVVA 1S3CA 5L71A 3FK8A 5ID2B 1T3BA 4XRDA 3ZIVA 5CP1A 1VF4A 2I9HA 1YEPA 3VI5A 1XWKA 3KMNA 3VI7A 3FR6A 16GSA 2EIQA 4ILFA 5EY6A 1Z6NA 4Q5NA 4YAVA 4HU7A 2CVBA 4JR4A 4WKWA 2FY6A 3VWXA 3OR5A 2R6KA 2HYXA 2M72A 2WZ9A 2O8VB 3UARA 4JZQA 2QC7A 2PWJA 4OCEA 1JZOA 1A2MA 1YJ6A 2B5YA 3F0IA 2AHEA 4V1Ap 2RM6A 4F2IA 2OA7A 2YV9A 2DSAA 3TKSA 5C04A 5ABRA 2GT5A 5E59A 1EEJA 4TW5A 2AJQB 2YZUA 1EP7A 3CSJA 3W8JA 3DVXA 6GSSA 4XHMA 3GN3A 1F6MC 3DMLA 3WT2A 5F06A 2HZEB 1ZYEA 3F4TA 4N0VA 3IOSA 4POKA 5D9VA 1PN9A 2VAFA 4YQVA 3HHVA 4MJEA 4TXVA 4ZL7A 2IN3A 2C0FA 2VIMA 1K0DA 4KW6A 1GNWA 1YEXA 3SBCA 4XRAA 3PH9A 2DJ0A 3HCZA 5CRDA 3H8QA 2GSRA 4MZBA 5DAKA 1PX7A 2EIOA 1KNGA 1GSQA 4CW9A 3TOTA 1XWGA 3TJGA 1WPIA 4EO3A 2L5OA 3D5JA 2TRXA 2VOCA 1X5CA 1THOA 3F3RA 2C4JA 1VGLA 2EC4A 1EZKA 3TRQA 4AGSA 5CAXA 2MMOA 2YOIA 4IHUA 1TU8A 2GTUA 5INYA 3TUEA 1JZRA 1AUCA 3UMAA 2DJ1A 4MA9A 3EE2A 1JLWA 1OVNA 4POBA 3LQ7A 3Q18A 3EMPA 4OO5A 2LSTA 1G6WA 1OYJA 1A8YA 3IDVA 2HXKA 4OWYA 2CT6A 3ZYWA 1FB6A 5DALA 3DGQA 2KLXA 5G1LA 2L6DA 1EGRA 3WGEA 3ZMKA 1W89A 3FR9A 3US3A 4LL1B 4GWRA 3GL3A 4K9ZA 1GL8A 3ME7A 4IP1A 5B7CA 2VCXA 3HYPA 5COHA 5IPGA 1K3OA 2DJJA 3QPMA 5C00A 3A5WA 4XTSA 1ZCPA 1ST9A 2AV4A 1BJXA 4EE0A 5DDLA 2HZFA 5H5SA 1M9BA 3GMFA 5IO2A 1EGOA 3TOUA 1BEDA 1FW1A 3ZVJA 3D22A 2B6MA 2C80A 3CBUA 3D0ZA 2YWIA 1U3AA 4J2FA 3UBKA 1C72A 4K0NA 3TKPA 1PGTA 3HJPA 2C0GA 2IJYA 2LJKA 3GH6A 2V6KA 2RIIA 4OMVA 4XS1A 3E9JB 3HY2A 4K7NA 3WGDA 2R2JA 5ECOB 3FRCA 5HR2A 4DSSB 4EKZA 5JCUA 1WJKA 3C7MA 4O5RA 3HJOA 5D9WA 5HFGA 2B3SA 1YKAA 4X43A 1X9SB 4N30A 4WBJA 4I8BA 1NW2A 2B1LA 1R26A 1G7OA 1WRYA 11GSA 13GSA 1ABAA 1T8EB 2VCTA 3VLNA 3LYPA 1MDIA 3C1SA 1XWAA 2CX3A 1Z3EA 1G6YA 1OKTA 3A2XA 3E0UA 3PINA 3JCML 4EF0A 1GLPA 3MDKA 5IPHA 1QUWA 2LRNA 1A2LA 3A3TA 1MDKA 1BAYA 2TRCP 1QFNA 5F07A 5D9TA 2XC2A 2PMTA 1TDIA 1GLQA 1N8JA 2IFQB 3ZLPA 1MD3A 2H0HA 1H4OA 1HYUA 3GHAA 4EXJA 2VCZA 4CDOA 1J0FA 4HU9A 3ZREA 3HD5A 5HFKA 2HRNA 5AIVA 3TCOA 1RW1A 4TN8A 4FIWA 4LLRA 4ISDA 1YZXA 1ZZYA 3H79A 2PU9C 3DRNA 2RUFA 4I97A 3AY8A 20GSA 4ZL8A 4NAXA 1V2AA 3KTBA 2AAWA 1KTEA 1O8XA 1WIKA 1Q4JA 3P2AA 4ID0A 2R4VA 3A2VA 2M80A 3FHKA 4ML6A 2XHFA 2H72A 1V58A 5DBQA 2V41A 3UBLA 4BVYA 1XW6A 1A24A 1XZOA 2HFDA 1PRXA 2NBSA 3ME8A 4GXZA 3M9KA 1ZL9A 4GLTA 2IMEA 2O89A 2H6YA 4E8EA 5EPFA 1XVWA 2FA4A 2CAIA 2WS2A 3RHCA 2FA8A 3O3TA 4CHSA 2HZEA 4BWQA 3O6TA 4GTUA 2E2GA 3QFBC 1X0RA 3I43A 1SKRB 2G0FA 1F3AA 2H66A 3TKSC 2LQOA 2HLSA 4MDCA 4MH3A 2X8CA 2JL4A 1TTZA 2DJ2A 2VLUA 5J4UA 2OBKA 2ALBA 1JHBA 4WETA 2CZ2A 1I9DA 1YY7A 4K8MA 1B48A 2ON7A 3FZ5A 5IMAA 4MK3A 1T4YA 4FYUA 3P8WA 3VWVA 3BOAA 1EOHA 4OCFA 2C8UA 2N5FA 5F8BA 1SL1B 2WJUA 1SJIA 2B5XA 1TRVA 4TKYA 3GUSA 3C73A 4L8EA 3TJBA 3IBHA 3KP8A 2M46A 5J9CA 3VFIA 1TKDB 2I4AA 2P31A 18GSA 3ERGA 2DLXA 1AQWA 2X8HA 4FYBA 4IELA 5ECLB 3K8NA 4POMA 17GSA 3UIWA 4HEA2 3CTFA 2IMFA 2P0GA 2H73A 2PERA 4MJAA 1PX6A 1ZYQB 3WYWA 1Z7RA 5FWGA 2GSQA 5IO0A 4N0ZA 1T4ZA 5ELAA 1GSFA 4YH2A 2CV4A 4EVMA 3QR6A 2YWNA 1EOGA 2TIRA 3ERWA 3GIXA 1F37A 1YKCA 3LXZA 6GSTA 3P7XA 4H86A 5KN0A 4QL9A 4KNDA 2JZTA 3TKRA 1Z5YE 1TRWA 3D6IA 2MZCA 4V2LA 5DJMA 5GSSA 3IK7A 1GSUA 2OE0A 2N5BA 2YCDA 1M9AA 4MLYA 1EV9A 2KP1A 5AISA 2A2RA 4DSQA 1EP8A 4G2EA 5A4VA 1GUKA 3QDNA 1K3LA 3LSZA 2O7KA 4DSSA 2IL3A 3TRPA 2J23A 1NSWA 3J7Yb 4ZB6A 2B7KA 3KZQA 1ERUA 4IBPA 2V32A 3L9VA 1K0AA 2IPAA 3IA1A 1SL0B 4ML1A 2H1AA 2R5GA 4PUAA 5IMCA 5IMDA 3E3EA 3NZNA 5J5NA 4P3YB 3GTUA 4F82A 4EL1A 4JU5A 4GSSA 3KXOA 5B8BA 1FOVA 1V98A 2C3QA 3HXSA 1SKSB 1VF3A 2FGXA 2VL2C 4ZILA 2YANA 4MCUA 4IN0A 4DEJA 2GSTA 2ZNMA 3N5OA 3EU3A 2H71A 2OJLA 4PQ1A 1ZGNA 2H30A 1OC8A 2HRFA 1U3IA 2LNTA 4V2MA 4XIHA 3ZITA 5D93A 2IFQA 3FYGA 5J9BA 3C71A 1R5AA 3SWLA 1K0MA 1WE0A 4D73A 2VL3A 4O92A 4ZBAA 3TJKA 5H5RA 3I6AA 1ILOA 5DVBA 4IVFA 3BCKA 3IXRA 1WMJA 1SK2A 3NIVA 2VD1A 4I6XA 3GV1A 1FVJA 3KTLA 3L9SA 3FR3A 4MP4A 2WGRA 5DCGA 4N10A 2CVKA 1S3DA 1XVQA 2VL9A 4AJ7A 5B6MA 4L0WA 3GH9A 2YPMA 1B4PA 2CA8A 1U88A 2N5AA 2HSHA 3TJFA 4V2NA 3F6FA 1U87A 3M1GA 4KAEA 2L4CA 1PMTA 4KSOA 1A23A 2LRTA 2H19A 3UAPA 3TDGA 3V1WA 1PSQA 2F8AA 2HNLA 3ZIJA 3GA4A 5B8AA 3A2WA 5GSTA 1O8WA 3D21A 4MH2A 2VCVA 5AN1A 3FZ9A 1O73A 2ZCTA 1OC9B 4ZBDA 3GYKA 4IS0A 5LD0A 2FWGA 1EV4A 2H01A 3WGXA 1GTAA 4TR1B 4KE3A 3LWAA 1Y25A 3EINA 2YWOA 4DSRA 3GKMA 5ENUA 2D2ZA 4EDZA 4FH8A 5FHIA 4HZ2A 1HNAA 1QK8A 4FO5A 4JRRA 2VLVA 1J08A 5DJLA 3IHQA 2VCQA 4KCEA 3RPNA 3MSZA 4IGJA 4KDXA 5B6NA 2MMNA 2JACA 3KIJA 1TW9A 2FWHA 3I69A 2YZHA 2GQLA 3EURA 4KSMA 4PQIA 3APSA 5F05A 4KCAA 4ZXGA 1PKWA 1R5PA 1EEMA 2JADA 1LJRA 4K7OA 1DUGA 2A2SA 5JCGA 4RI6A 1O81A 3H4KA 1URMA 2L57A 3ZMLA 4G19A 22GSA 4NV2A 4IP6A 3MWHA 5J41A 3HJMA 4TRXA 2WFCA 3TKQA 5IIZA 2KOKA 1VRSD 2VL2A 1DBYA 1MD4A 3C1RA 1HQOA 3TKSE 2H6XA 4KH7A 2YNXA 3HDCA 2VM1A 3KH7A 4ZB8A 4MABA 4TR0A 4GCIA 1NM3A 19GSA 1O85A 2H74A 1UN2A 4TXOA 3FEUA 3APOA 4IW9A 1UVZA 5D9XA 4IKHA 3TJJA 3UVTA 1E6BA 3H93A 3APQA 4NWYA 1F2EA 3L0HA 4IQAA 4HJMA 4KDUA 3VPQA 5GAPD 4MZWA 1B8XA 1K0CA 3R2QA 2A4VA 2ON5A 1BX9A 9GSSA 2RM5A 2FNOA 5LNKe 3HVXA 2DJ3A 2X99A 1WWJA 2F8FA 3HA9A 5ID2A 3GKNA 5ECNB 2GVPA 1KBNA 1FO5A 1Z9HA 4MF5A 4ACSA 4WR5A 4O7HA 1HD2A 2JSYA 3UJ1A 1M99A 5CYYA 4HJ2A 3ED3A 2MMZA 3L9UA 5CRGA 4GQFA 1AIUA 1SYXA 3GSTA 4NPBA 1TK0B 2C3NA 4ZB9A 2K8VA 5HR1A 2GGTA 2KP2A 2AB6A 1GH2A 5IMZA 3VPTA 1M7TA 5G30A 2H75A 4K0GA 3F4RA 4YQUA 5DAKB 4YAPA 4MJCA 3GL5A 2LUSA 1ERVA 1TJDA 1B4QA 2C1YA 3DXBA 4ZIJA 3KD0A 2X64A 4HOJA 2XPEA 7GSSA 5H5QA 2DMLA 2FUG2 10GSA 3IAS2 5E4WA 4NV5A 2GT6A 5CRWA 2E2MA 4QL7A 1WP0A 1K0BA 2DC5A 5DALB 1GTIA 1ERWA 3DVWA 2RUEA 4DVCA 2OE1A 4TVEA 4TR3A 1QQ2A 5A4UA 5JWOB 2JSZA 3FY7A 2KUCA 2P5QA 4ZL9A 3GKXA 2XBQA 5ECSA 5EL8A 4I2TA 1TI1A 2LEGA 2WULA 4PNGA 4BVXA 3QAGA 4L5LA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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