4JU5A

Crystal structure of the dimeric form of the bb' domains of human protein disulfide isomerase
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
212
structure length
200
Chain Sequence
AATTLPDGAAAESLVESSEVAVIGFFKDVESDSAKQFLQAAEAIDDIPFGITSNSDVFSKYQLDKDGVVLFKKFDEGRNNFEGEVTKENLLDFIKHNQLPLVIEFTEQTAPKIFGGEIKTHILLFLPKSVSDYDGKLSNFKTAAESFKGKILFIFIDSDHTDNQRILEFFGLKKEECPAVRLITLEETAERITEFCHRFL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Protein disulfide-isomerase
publication title Structural insight into the dimerization of human protein disulfide isomerase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 56
structure length 200
sequence length 212
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2013-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13848 Thioredoxin_6 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ju5A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ju5A01
3NZNA 2VUPA 1FO5A 2ON5A 3IE3A 1R26A 2L6CA 1FVJA 2H1BA 1J0FA 4QL9A 1B9YC 2C0FA 1I5GA 4IVFA 3K8NA 2IWTA 3M9KA 3JCML 5AGYA 2X8CA 1W4VA 3GSSA 5IPGA 1RW1A 4ECIA 4IELA 5CP1A 4NXIA 1QK8A 4MK3A 4HEA2 3GL3A 3APQA 4YQVA 4MJCA 3BCIA 5COHA 1LU4A 3UVTA 2GQKA 4CDOA 4QL7A 3VWWA 4K8MA 5DVBA 2DJKA 3KZQA 3I6AA 1XVWA 1EP8A 1NHYA 1SJZA 3UEMA 4ECCA 3RHCA 3HXSA 2R6KA 2H30A 9GSSA 2IMFA 4YQUA 2C4JA 5J9CA 1EEJA 3H8QA 3L9UA 4V2LA 3CXGA 4LL1B 3I69A 2HZEB 2CVDA 1B48A 2OE0A 2V6OA 2OKAA 2VD0A 3F4SA 4MZCA 4I5QA 3CMIA 3C7MA 5HFKA 1GWCA 2ZCTA 4HU7A 3F6DA 2IMDA 2PVOC 4GSSA 3D22A 3HDCA 1OC3A 2CVBA 2LTKA 3Q74A 1XZOA 4F2IA 3D5JA 4XTSA 5G31A 3D21A 5EVOA 4IHUA 1K3OA 1XW5A 4GF0A 2OACA 3UL3A 2PWJA 1AQVA 3ZZXA 3GYKA 4XCSA 1O6JA 1QUWA 3WT1A 1KNGA 5HR0A 4XHMA 5D73A 4JRRA 1EOHA 1OE8A 3KP9A 2F8AA 4HUAA 2CX4A 1ON4A 4G10A 4OO4A 22GSA 1XWCA 4HOJA 1O7UA 1V9WA 3QAWA 1SU9A 3TKRA 4ID0A 4O7HA 5JWQB 3KCMA 4EE0A 2VOCA 2IFQA 2DJ0A 2REMA 4XS6A 3G7JA 1JFUA 2FA4A 3FY7A 4K6XA 2HE3A 1FB0A 5ECQB 4POKA 4HZ2A 5ID2B 2LS5A 2RLIA 3GMFA 4EKZA 1Y6EA 2GS3A 3V1WA 1TK8B 3VFIA 4E8HA 5ABRA 3ZMLA 4ACSA 4AJ6A 2EIOA 5J41A 4MDCA 2M72A 1WWJA 1M99A 3GX8A 4K7OA 2KUCA 1F37A 3ME7A 3LG6A 4XRDA 1PX6A 2YCDA 2I4AA 1O8XA 3S9FA 3RPNA 1ML6A 2FWFA 3ZIJA 1OC9A 4I2TA 4NPBA 3FR3A 4MLYA 3TOUA 3LWAA 17GSA 2MYGA 4IN0A 3FR9A 3TKQA 3GA4A 2X8GA 2NTOA 4TR0A 2DSAA 4F0CA 3IXRA 5JWOB 3L4NA 2R2JA 4KSOA 3ERWA 3VPQA 5J5NA 4KE3A 4WBJA 6GSYA 4BA7A 2AUVA 2DBCA 1YKAA 3NIVA 1GSDA 2FUG2 1OKDA 2HRFA 5DJLA 3VWUA 2VL9A 2QGVA 1XWAA 1TRSA 1U87A 5CYYA 1JZOA 1JZWA 3D4MA 5IO2A 4MJAA 2XPDA 3F0IA 1AAZA 2VD1A 3HZ8A 5H5RA 2L6DA 1Z3EA 1DBYA 2VCWA 2BTOT 1DE2A 4J56E 4TOPA 3DVXA 3IBHA 4TN8A 1I9DA 2YV9A 2FY6A 2H74A 2YANA 4WXTA 3ZFLA 2G2QA 2I1UA 2H19A 1U3IA 8GSSA 1T4YA 4JE1A 1C72A 1HNCA 2AB6A 5GSSA 2PN8A 3DEXA 5ECSA 4K9ZA 3GV1A 2PERA 1F9MA 6GSUA 2GSSA 4WETA 2JSZA 2OADA 5ECOB 1GSQA 1B9XC 2A2SA 3KH9A 3ZVJD 4BVXA 2VL2A 1PGTA 2WGRA 5D93A 5IOWA 4O32A 4PUFC 2N5AA 1A8YA 5LCZA 2YP6A 2TRXA 4OCFA 5DCHA 3HJOA 4EF0A 1G7EA 1SYXA 1X9MB 1OAZA 2JU5A 1O73A 1K0OA 2GGTA 5A4UA 2WDUA 1TK0B 2BJXA 2FA8A 1SJIA 3M9JA 2LNTA 3KM6A 1T1VA 1U3AA 1K0CA 2GSRA 1ZYEA 3AY8A 4QQ7A 4D73A 2MBTA 4YAPA 1BAYA 1THOA 4EDZA 13GSA 1OKTA 1PMTA 2E0QA 1HQOA 2MMNA 3KTBA 4HI7A 3CBUA 4G9HA 4MABA 2IMIA 3CRUA 3O76A 2A4VA 4Q5FA 3M1GA 5D9VA 4LLRA 4Q5NA 2VAFA 1O85A 1CQHA 4IQ1A 1J9BA 4WF5A 5F8BA 2VO4A 2L5OA 4O92A 3DWVA 3WGEA 2VM2A 2M46A 4V1Ag 2R3XA 2LJAA 2R37A 3I43A 4ZILA 2DIYA 4POLA 3M3MA 2HXKA 3KGKA 1YEPA 1JHBA 1R7HA 4J57E 4OMVA 3J7Yk 1YZXA 4OFTA 4KX4A 4MJEA 4MPFA 1TXXA 3Q6OA 1ZL9A 2H73A 2PVQA 2GQLA 2LEGA 1F3BA 1JLWA 4EXJA 1MEKA 5HR3A 1VF2A 5G1LA 2VL2C 3QD9A 3F3RA 5EPFA 1K0BA 3FZ4A 5CRHA 3QR6A 4GCIA 3N5OA 4KDUA 4KW6A 3ZRDA 1TRUA 2LJRA 2JSYA 2C8UA 4NWYA 2GTUA 3VURA 1XFLA 1TKDB 4YH2A 2N5FA 1OVNA 4PUAA 1XWKA 3BJ5A 4F03A 4FIWA 2P5RA 1PRXA 3UVHA 5J9BA 2MMOA 4NAXA 1LBKA 3GTUA 5CRDA 3HD5A 2XHFA 3LFLA 2H1AA 3GKNA 5CAXA 2GVPA 5C04A 3TRXA 3EINA 1GRXA 2AAWA 2VLVA 1GUKA 1T8EB 3ZITA 3A5WA 3A2VA 4NV5A 1XOBA 1ZOFA 2NBSA 1M2BA 4LL4B 2L5LA 4JBBA 3TKSE 5GAND 1UA5A 4IS0A 1R5PA 1EV9A 2IMEA 1RK4A 2CX3A 5GAPD 4TRXA 3C73A 2GSQA 1QGVA 3N9JA 3GKXA 2FD3A 4G2EA 1U6TA 1HYUA 3IPZA 5IM9A 1GSYA 18GSA 3SBCA 1SK1A 2HI7A 2K8SA 3C71A 5ECKB 5B8AA 2GZZA 2AHEA 1TP9A 4JU5A 3QMXA 3HVXA 3W6GA 4XS4A 5INYA 4CHSA 1X5DA 3CYNA 3ME8A 7GSSA 2CZ2A 4HJ2A 2H0GA 3LEFA 3ZLPA 2HZEA 4GSTA 2IPAA 4WR5A 3TJJA 2YV7A 3VLNA 2XBIA 1A2MA 1AQWA 1WOUA 2WB9A 4MPGA 2DMMA 3TKPA 1QXHA 4F0BA 3MNGA 2CZ3A 2X64A 1S3AA 3ZMKA 1O8WA 1OC8A 2XBQA 4K7NA 4YQMA 2H1DA 4F9ZA 4Q5RA 1BG5A 5CRGA 2ON7A 4KSMA 5DALB 5GSTA 1SL1B 1V57A 1U88A 20GSA 2JL4A 1VF4A 3D4TA 3ISOA 2VL3A 4K7IA 4L5LA 4IGJA 1YJ6A 5G5EA 1XW6A 2LKUA 5G1KA 1URMA 3TB2A 3KTLA 2ZUPA 1ERVA 2K8VA 2FNOA 1GSSA 6GSTA 2VLUA 1YQ1A 1G6YA 5DJMA 1R5AA 2YPMA 1GNWA 3RPPA 2HNLA 2LQOA 4IP6A 4TW5A 4ZBAA 1XIYA 2F3MA 5ELGA 2I9HA 3GL5A 3GNJA 4X43A 3LORA 4GWRA 1G0TA 2WS2A 1EEMA 2L59A 3LJRA 2F8FA 1A23A 2CQ9A 3QFBC 2JZTA 3IAM2 3PGTA 2QC7A 4OD7A 3M8NA 3E0UA 2DMLA 3FEUA 3FRCA 4TR4A 5FT3A 5HQPA 3DMLA 1XWGA 1MD4A 3HHVA 1PN9A 3HZ4A 2C0GA 2H0HA 4WBRD 3KD0A 2R5GA 3W8JA 4L0WA 5KEJA 2TIRA 4TXOB 1ZMAA 4N0VA 4AJ7A 4IW9A 2V32A 19GSA 3I9V2 3IR4A 3GRXA 2DJ3A 4EDYA 2O8VB 3DYRA 3TKSA 1YY7A 3ERGA 1GP1A 3VK9A 1Z6NA 3EYTA 1PKWA 1A0FA 2RIIA 5G2ZA 1FOVA 3UBKA 3U6VA 3TOTA 1X9SB 1TI3A 2HYXA 4J2FA 1ST9A 3GUSA 2BMXA 1K0AA 3CTGA 4HJMA 1X5CA 3H79A 2VCTA 1H75A 4OFMA 2H8LA 1G7OA 1A8LA 1FW1A 3VWXA 5A5KA 2OJLA 3G7IA 5JCGA 1CQGA 2L4CA 4WEYA 4ZB6A 3WGXA 3FYGA 2NVLA 1XOAA 4ZXGA 4HQZA 3US3A 1S3CA 4TR1B 1BEDA 4Z7XA 5ECNB 4ZBDA 1TDIA 2P31A 3Q19A 4XS1A 2H76A 2HFDA 3MDKA 5LD0A 4EUYA 3APSA 2GLRA 5JWRB 2WJUA 3UAPA 5D8IA 4ZL9A 3D6IA 3FHKA 1K3YA 3GIXA 1KTEA 4FYUA 5JCUA 1GL8A 2GDRA 1Y25A 2LRNA 4K2DA 3E3EA 1EOGA 2H01A 3QFAC 1PX7A 2L4QA 1A2JA 1OC9B 4MF5A 4MJBA 5E4WA 12GSA 2NPBA 2LRTA 1MDKA 2CV4A 3TKSC 2C0EA 3E9JB 2HLSA 1T3BA 1TOFA 4IP1A 2PPTA 4KCEA 3KEBA 4RUVA 5FWGA 4KH7A 5F06A 1MDIA 3IK7A 4K0NA 5CRWA 1WP0A 2YZUA 3EE2A 3IV4A 5DQYA 2OBKA 4BL7A 1M0UA 2YN1A 4IBPA 5KN0A 3M0FA 1TK5B 4GSNA 3DIEA 1GTBA 3KJYA 1V40A 3UBLA 1EZKA 1HNBA 3LGCA 2CAIA 3H4KA 2PBJA 3FR6A 1JLVA 1Z6MA 1A0RP 1PL2A 2G0FA 3IRAA 4JR6A 4DSSA 1E2YA 1FHEA 4MCUA 3EWLA 5G5FA 4ZBBA 3F3QA 2TRCP 4IJ3A 1A24A 2KP1A 2AV4A 1XWBA 2V6KA 5B7CA 5KN1A 2DJ2A 4N0ZA 2QKEA 4OWYA 1TJDA 1K0NA 3G9BA 2A2RA 3IHQA 1M2DA 2B3SA 3O3TA 3DRNA 2WULA 1R4WA 3HA9A 4JZQA 1SKRB 2OA7A 4GQFA 2WRTA 2B1KA 4PURA 3GN3A 4HS1A 3P7XA 4MF6A 2I81A 4TVEA 3IA1A 2E2MA 2KP2A 2MBSA 2KOKA 1HNAA 3A3TA 1TW9A 2DLXA 4V2NA 4ISDA 3BOAA 2ALBA 5DAKA 1A2LA 2B7JA 3EC3A 3ZVJA 2XC2A 4NMUA 4D73B 2OE3A 5CNWA 4ML1A 3IAS2 4IJIA 2YWMA 1O81A 4X1UA 1PSQA 2K9FA 3BD2A 1Z5YE 3TJKA 2ZNMA 5HR2A 4OCEA 4RI6A 2LUSA 5DDLA 3P8WA 1VRSD 3ERFA 4G19A 1NSWA 2OE1A 2H6XA 3WT2A 1B4PA 2PU9C 4XRAA 4JEDA 3FZ9A 3H1NA 4N11A 2J23A 5AIVA 2VCQA 1SKWB 4ECJA 3ZYWA 4E8EA 1GTUA 4ILFA 3LXZA 5LNKe 4MZWA 3H93A 4Q5QA 3TJFA 3NOFA 2I3YA 4GXZA 1YEXA 2V41A 5DQSA 1TU8A 4K0GA 1UN2A 1NW2A 3F4RA 14GSA 4KNDA 5L71A 2CT6A 2DIZA 5IIZA 2AJQB 1EP7A 3L78A 5A4WA 2LQQA 5D9XA 2EC4A 4EO3A 5IPHA 4BWSA 3HKRA 4ZIJA 3RDWA 5IQYA 2HT9A 2H70A 3L0HA 1M2AA 3DGQA 4MZBA 4GLTA 1MTCA 1WMJA 3WYWA 3EVIA 2P0GA 1X9WB 3FW2A 3MAKA 4EVMA 3RBTA 4I8BA 4EC0A 3PH9A 4KDXA 4L8EA 5ENUA 2WZ9A 5EY6A 1PL1A 3VI5A 2MZCA 3CSHA 3F6FA 5HFIA 5D96A 1SK0A 3GTUB 11GSA 2EIRA 4FO5A 5AISA 2B1LA 3GX0A 4OO5A 4ULXA 2H72A 3QAGA 5F07A 5B6NA 3KMOA 4FYCA 5B8BA 3R2QA 2B7KA 2H0IA 3UMAA 1PA3A 5DALA 3L9VA 3TRPA 2MMAA 2FWGA 4I2UA 5ECPB 1USBA 1TU7A 4HDEA 2Z9SA 2D2ZA 4MH3A 3TUEA 2J9HA 3FZAA 3TJBA 1T7PB 2M80A 1X0RA 2FLSA 2HZFA 2WCIA 1YF1A 3EU3A 3DKSA 5CREA 5IO0A 2RM5A 3KXOA 2C0DA 2DJ1A 2DC5A 1K0DA 1V2AA 1YKCA 4PQ1A 2FWHA 3GH9A 4PNGA 3WD6A 3O6TA 4XS4B 2VCZA 5F05A 1YDKA 1AC1A 1XBSA 1F2EA 2F51A 3LYPA 2LSTA 3F4TA 1T4ZA 3LSZA 10GSA 3RAZA 4X0XA 1EGOA 2VCXA 5IMVA 4P3YB 4H86A 1OE7A 3SWLA 1YF0A 2NDOA 4WKWA 3CSJA 5AIXA 5AN1A 4DSRA 4KB3A 3WGDA 4FH8A 4N30A 4K1FA 2FCHA 3KMNA 2O85A 2H6YA 1VF3A 3F8UA 4PX1A 2LNSA 3VPTA 5D9TA 3D0ZA 4F82A 2VCVA 4GTUA 2DJJA 1RQMA 4TXOA 2LV3A 5DBQA 1SJ6A 1DSBA 2O87A 1IYHA 1KBNA 4TR3A 3UJ1A 5ECRB 4BVYA 3UOMA 1ZGNA 1Z7RA 1GTIA 2E7PA 1BQ7A 2H75A 4PNFA 5IMZA 1H4OA 2YWNA 5ID2A 1TRVA 3GURA 3MSZA 2PMTA 1VF1A 2WFCA 1BYEA 5IOXA 2VM1A 1KEBA 1SL0B 5J3RA 3EMPA 2JADA 2V1MA 1EGRA 5J4UA 1S3DA 2O89A 1XVQA 5HR1A 4FYBA 1HD2A 3GFKA 2FGXA 4KCAA 3W8SA 1N8JA 1V98A 2YJ7A 4MF7A 1NM3A 3EURA 1JZRA 5CO3A 3GKKA 2B5EA 1WPIA 4YAVA 2X99A 3A2WA 1LJRA 2H6ZA 3QAVA 4IKHA 3GSTA 2CAQA 2MMZA 3GH6A 3LXTA 4IQAA 3ZIVA 2B5YA 3IK9A 1M7TA 2E2GA 2FHEA 4TR1A 1GLQA 1GLPA 1E6BA 2C3QA 2QSIA 3CSIA 1FG4A 1GSFA 2K18A 2B6MA 2C3TA 1B4QA 2IFQB 4JR4A 4DSQA 3UIWA 4LMWA 4V1Ap 1K0MA 3DXBA 2ES7A 2AYTA 5DCGA 4BWQA 3ED3A 2KLXA 5D9WA 3VI7A 3QPMA 2R4VA 2VIMA 3C1SA 4MA9A 1EWXA 3RHBA 3C8EA 3DD3A 2YOIA 1FAAA 1NHOA 3IDVA 2H1GA 2GZPA 1JZDA 3TCOA 1Q98A 2GSTA 3APOA 2C80A 4NHWA 3TDGA 2L57A 1SENA 4KA0A 1XW9A 3IOSA 2IMKA 2JZRA 1GULA 4PGTA 4L0UA 2GQMA 2YWOA 2GT5A 4PXOA 2LJKA 1ZZYA 4N10A 3L9SA 3GHAA 3BCKA 3A2XA 1BJXA 1XCCA 1UC7A 2EIQA 1TTZA 5IMDA 3DVWA 2K6VA 4KAEA 4ZB9A 3J7Yb 3KP8A 1ERTA 5C00A 4HQSA 1SKSB 1OYJA 1WRYA 2RUEA 5KN3A 5KN2A 4HU9A 4PQHA 3KIJA 1Q4JA 3FK8A 6GSSA 2OBIA 4O5RA 4OFNA 1AIUA 6GSWA 5E59A 2YZHA 3UARA 3EMXA 4WF4A 5F0GA 1GTAA 1T00A 1SD9A 3LYKA 1GUHA 3G7YA 1MDJA 1ERWA 4DVCA 3QCPA 5IMCA 1SD8A 1XXUA 3F63A 6GSXA 4MMMA 4KGIA 1G6WA 3FZ5A 1MD3A 2XPEA 2V2GA 4I97A 4POMA 1XPVA 4LMVA 3VWVA 3ZL5A 3HVVA 1TI1A 16GSA 4ZL7A 4GQCA 2P5QA 5ELAA 2YWIA 2PUKC 2YJHA 1ACVA 4NHZA 1IYIA 3HJMA 3TGZA 4AGSA 1AW9A 4MP4A 4BPYA 5JCWA 5IMAA 2JACA 1ZYQB 1PKZA 1THXA 1Z7PA 3P2AA 2HSHA 5B6MA 2X8HA 2CA8A 4AJ8A 5EL8A 1QQ2A 1AUCA 2HSYA 1QMVA 4DSSB 2O7KA 4RQRA 2GZYA 4LA1A 1ABAA 4ZL8A 2CVKA 2VLTA 2HRNA 3HJPA 3F9UA 3HYPA 5A4VA 4HZ4A 3CTFA 1F3AA 1ZCPA 3CRTA 3P90A 1N2AA 4KUNA 1WIKA 3ZFBA 2LRCA 5H5QA 1M9AA 4I6XA 1B8XA 4POBA 1SYRA 1M9BA 3FKFA 4GRFA 5ECIB 5ECMB 1J08A 1Z9HA 1WJKA 6GSVA 3IC4A 2YNXA 1TRWA 3BBYA 4L5OA 3QOUA 4ZB8A 4TKYA 5FHIA 3LQ7A 4PQIA 3KH7A 2H71A 1PQNA 5ECLB 1SK2A 2H66A 3HVSA 3Q18A 2F9SA 4TXVA 3EU4A 1GSEA 5G30A 2GT6A 3QDNA 5DAKB 1AQXA 1V58A 1QFNA 4CW9A 2N5BA 2IIYA 2FWEA 3PINA 1X5EA 3PR8A 5IMFA 2C1YA 3GKMA 5GZZB 1UVZA 3ZTLA 3ZREA 4WR4A 2JZSA 3OR5A 2RM6A 1WE0A 1F6MC 1W89A 4XIHA 3TJGA 3TRQA 4ECBA 1GSUA 4ML6A 1ERUA 3C1RA 2KHPA 1SL2B 2IL3A 2IJYA 4V2MA 1VGLA 2PGTA 1DE1A 1K3LA 5H5SA 1FVKA 2B5XA 1PD21 2RUFA 1GUMA 3HCZA 4AF2A 1AXDA 1DUGA 3HY2A 5HFGA 1FB6A 4RI7A 4DEJA 4RQXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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