4L0UA

Crystal structure of plasmodium vivax prx1a
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
PTYVGKEAPFFKAEAVFGDNSFGEVNLTQFIGKKYVLLYFYPLDFTFVCPSEIIALDKALDAFHERNVELLGCSVDSKYTHLAWKKTPLAKGGIGNIKHTLLSDITKSISKDYNVLFDDSVSLRAFVLIDMNGIVQHLLVNNLAIGRSVDEILRIIDAIQHHEKYGDV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Observed octameric assembly of a Plasmodium yoelii peroxiredoxin can be explained by the replacement of native "ball-and-socket" interacting residues by an affinity tag.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-Cys peroxiredoxin, putative
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium vivax sal-1
total genus 55
structure length 168
sequence length 168
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2013-06-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4l0uA00
2KP2A 3M9JA 2VL2A 1ZGNA 5B7CA 18GSA 5ELGA 5IIZA 1TU7A 2CZ2A 3Q19A 2F8FA 4DSRA 4L0UA 4ZB6A 3MNGA 1A24A 6GSWA 4MH2A 1Z6NA 2GSTA 1TKDB 1U3AA 1V2AA 3GRXA 2H1GA 3KMOA 3QCPA 4FO5A 2IIYA 1AQWA 1YY7A 2EIOA 4TXOA 4MA9A 4BWSA 2J9HA 2IPAA 3GN3A 1JZDA 2VD0A 2OACA 1KNGA 3GMFA 4WEYA 1ABAA 1F6MC 3GH9A 4I5QA 4MF5A 3CTFA 2CX3A 2HFDA 6GSYA 4GQCA 4TR4A 2JZSA 1QGVA 1ZL9A 2GDRA 3TKPA 5J9CA 3EINA 1PRXA 2CVKA 3J7Yk 4PNGA 2HYXA 2E0QA 3ZL5A 1SK2A 4HZ4A 3GTUB 5ECSA 2RM5A 2V1MA 4X0XA 4ZBBA 2AUVA 3HJPA 3Q74A 3TRQA 1O8WA 4OWYA 2ZUPA 1FOVA 4IS0A 2HNLA 2FA4A 4EO3A 3ZREA 4GTUA 4O32A 3VFIA 3S9FA 2I1UA 4LL4B 1GSSA 2L4QA 4BVXA 5D9VA 1XVWA 3L9UA 2VL2C 5F06A 3IBHA 4Q5QA 2DMMA 3FY7A 4TR1A 1DE2A 2ON7A 5G5EA 1OAZA 2YJ7A 2OJLA 5B8BA 2I4AA 3DWVA 3L9VA 1YEXA 4V2LA 2ON5A 1NSWA 2JZRA 4ZL7A 2X8HA 1MDKA 2IMDA 2NVLA 1S3AA 3HHVA 3KTLA 1XW6A 1K0OA 1T1VA 4EXJA 5ABRA 3RHCA 2ES7A 4FYUA 2HT9A 2PMTA 1ZMAA 2ZCTA 1B9XC 1WWJA 4HQSA 4EE0A 2C0EA 2A4VA 1AW9A 4PX1A 1H75A 2FWHA 2VAFA 2VOCA 1XIYA 5COHA 1GSFA 2HLSA 1E2YA 4MDCA 2I9HA 1FVKA 5DALA 4N11A 4F0CA 4EC0A 4NV5A 4XRAA 1MTCA 5G31A 1YKCA 3KP9A 3EVIA 4NAXA 2P5QA 2FWEA 4PURA 4N30A 2O85A 4JE1A 5H5SA 1SJ6A 4GRFA 3KH9A 4QL9A 5JWOB 1B8XA 3VURA 3UBKA 3CRUA 1ZZYA 5JCUA 1ERWA 2WS2A 1KBNA 4IQAA 1KTEA 3VWVA 1WRYA 4MP4A 4MMMA 2FY6A 2H6XA 3ISOA 1A2LA 2GQMA 4IBPA 3ZTLA 4AGSA 1O81A 5AN1A 5HFIA 1O73A 2O89A 2PVOC 2DJ0A 3TB2A 2LJAA 1A2MA 2C0FA 2Z9SA 3LORA 1FB0A 2H19A 4K7OA 4X1UA 5HR1A 4KE3A 3PR8A 3LFLA 4XS4B 2B1KA 22GSA 4HEA2 3HZ8A 4MCUA 3VLNA 3KD0A 1LU4A 4EKZA 3A2VA 3DVWA 16GSA 4OO5A 5E4WA 5KN1A 1PKWA 4EUYA 2XC2A 4ZL8A 4F82A 3ED3A 3NOFA 4MZBA 1SU9A 5E59A 1XCCA 2HI7A 3HYPA 3G7IA 3MWHA 1N8JA 2QC7A 3TGZA 3IAS2 4H86A 2LRCA 3ME8A 5IPHA 1F3AA 3F6DA 3L4NA 4ECCA 1OC3A 1O6JA 3D6IA 4V1Ap 5DCGA 2VCVA 3BCIA 2YANA 1SD8A 4ZB8A 2VLUA 3FR9A 4Q5FA 3DEXA 3E9JB 2B3SA 3BBYA 1WJKA 3I9V2 4Q5NA 3F6FA 4QL7A 2RUEA 4O92A 4KH7A 5AISA 4IP6A 3F9UA 5FT3A 4WBJA 5F8BA 5IMVA 1ACVA 2GSQA 1GUHA 2LNTA 1TI3A 4MF7A 4JZQA 2AHEA 4NV2A 10GSA 4KNDA 5H5QA 1GLQA 3G7JA 1RW1A 5GAND 4AJ6A 1SKRB 4D73B 3OR5A 1PMTA 1C72A 4FH8A 1XWKA 2OKAA 1EP7A 3UBLA 3M3MA 2H0IA 2N5FA 1I9DA 3CYNA 1GTBA 1V9WA 2H1AA 2OE0A 3LXZA 1HNCA 4F2IA 4I6XA 1RQMA 2FWFA 2QSIA 2HSYA 1Q4JA 1TU8A 2H1DA 1XFLA 1PQNA 5B6NA 4JBBA 1TJDA 2ZNMA 3ZITA 5J41A 2J23A 1BEDA 1F3BA 1M2DA 1R26A 2VL9A 3EC3A 1SKSB 2YZUA 6GSSA 1TK0B 3UVHA 2CQ9A 1B48A 4KX4A 2DSAA 3C8EA 2IMIA 3GH6A 3K8NA 3RBTA 5F05A 2JZTA 5FWGA 2PN8A 3D0ZA 1G0TA 3BCKA 4KDUA 1O85A 3RDWA 2ALBA 5ID2B 2IMKA 4GSTA 1K0MA 4ZILA 1EEJA 2JSZA 5DAKA 4J56E 2CAQA 3PGTA 4K1FA 3KMNA 2GZPA 3EU3A 4K2DA 2P5RA 1B9YC 1TRVA 3CSJA 4FYCA 3R2QA 1WMJA 1M7TA 5CRGA 3WT2A 3WGEA 1B4QA 3IPZA 2L5OA 3KH7A 3AY8A 4NMUA 3EMPA 2VCWA 2RUFA 1GTUA 4IJ3A 3LGCA 5G5FA 3I6AA 3DRNA 4K6XA 2VCXA 1X0RA 1EWXA 2DMLA 4KAEA 2WZ9A 4WBRD 2FHEA 1OE8A 5LNKe 1DBYA 1A23A 3GKNA 2FD3A 3W6GA 2L6DA 4YQVA 3CXGA 2H30A 1OE7A 1VF4A 2YJHA 3UIWA 4NWYA 3DXBA 3N5OA 3IRAA 2CX4A 3MSZA 1U88A 3A2WA 4RI6A 4POLA 5A4WA 4DVCA 1M99A 3KXOA 4LMVA 1TK8B 1PSQA 5CYYA 3F3QA 2KUCA 2BJXA 5FHIA 1GUKA 1YF0A 3C73A 3HKRA 3KP8A 4WETA 2KLXA 4ML1A 3ZRDA 3Q6OA 5G30A 4YQMA 1ON4A 3VK9A 3WGXA 3QAWA 4G19A 1OYJA 2FLSA 1XWCA 2XPEA 1VF1A 4HDEA 1CQHA 1EGRA 3HVVA 2H0HA 3FZ5A 1Z3EA 1ILOA 2A2RA 2B6MA 2HSHA 14GSA 2YNXA 3APQA 3GX0A 2NBSA 3DYRA 1G7EA 3WT1A 4BPYA 3F3RA 3F4TA 3APSA 3IAM2 1OKTA 4GSNA 4J57E 2JACA 3VPQA 3PINA 1T7PB 4XIHA 3JCML 3QFAC 2OBKA 5EVOA 1AIUA 3P8WA 5AIVA 1MEKA 3DIEA 4Q5RA 4RI7A 1GL8A 1OC8A 3UARA 4ZL9A 2A2SA 5A4UA 3NZNA 4K0NA 1VGLA 2EC4A 3TRXA 2CV4A 4JR4A 3DKSA 1V40A 4MZCA 3FZ4A 3N9JA 2B5YA 1AXDA 1QQ2A 3CSHA 3IK7A 4PQHA 4ECBA 1ZYQB 4IJIA 1E6BA 2M46A 1AAZA 1ZYEA 2IMEA 1ZOFA 2IJYA 19GSA 3TJJA 1ZCPA 4G10A 2V6KA 6GSVA 2LRTA 5INYA 2R37A 5HQPA 4ECIA 3EE2A 2PUKC 4CHSA 1Y25A 2LQOA 2YV9A 4TXOB 1FHEA 1F37A 4KCEA 1XW5A 2CZ3A 2TRCP 1F2EA 1XXUA 2K8SA 3I69A 2IN3A 1GUMA 2FA8A 3DD3A 3TKRA 1CQGA 2V41A 4OMVA 4MPFA 1SJIA 1IYIA 3RHBA 1TDIA 4K7NA 1U3IA 4MH3A 4POBA 2C0GA 3M1GA 3J7Yb 3TKSA 2IMFA 3ZZXA 2IFQA 2GZYA 5IMCA 3VWXA 3IA1A 4EDZA 1PX7A 5KN2A 1SL0B 5JWRB 3KZQA 2I81A 2MMZA 3ME7A 3ZLPA 5KEJA 2GSRA 5IMZA 1JZOA 1TP9A 1X5DA 1AC1A 4XS1A 3D4TA 5C00A 4HOJA 3FKFA 2OE1A 4OO4A 1YQ1A 3FW2A 4ZXGA 2PERA 2YP6A 5HFKA 5D73A 3ZIVA 3HJOA 1THXA 2OA7A 3ZYWA 1GULA 2B7KA 4IKHA 2GS3A 1Z7PA 3MDKA 3KIJA 4OFTA 1XW9A 1UVZA 1NHYA 4ILFA 5ECRB 4F0BA 4KA0A 1YZXA 3VWUA 5AIXA 2FWGA 2E2MA 3L78A 4O5RA 8GSSA 4TR1B 3ZIJA 5G1KA 3TUEA 1A8YA 1FVJA 1XOAA 3CMIA 3HCZA 4KDXA 4KGIA 1MD3A 2P31A 5B8AA 1K0AA 4NHWA 4FIWA 1M2AA 3BD2A 3HY2A 4N0VA 3EURA 4K7IA 1VF3A 4EL1A 1PL2A 2YWNA 2GT5A 5CRWA 1PL1A 3TJBA 1Z9HA 4PNFA 2CAIA 1GNWA 1Q98A 5J3RA 2VLTA 5DALB 4RUVA 3CTGA 5CRDA 2VD1A 3F4RA 4KCAA 4JR6A 1FAAA 3C71A 4XRDA 1USBA 5ECHB 2H0GA 3ERFA 3UL3A 1PD21 1K0CA 3FZ9A 2DIZA 1XVQA 3TKSC 4Z7XA 4OD7A 3EMXA 5ECKB 3SWLA 3A5WA 3LQ7A 2L4CA 3GL3A 3D4MA 2CVBA 4ZBDA 1DSBA 3GV1A 2O7KA 2H1BA 1XBSA 2DJKA 3V1WA 4OFNA 3PH9A 4NPBA 1OVNA 2N5AA 3U6VA 4DSQA 4XCSA 1S3DA 3H79A 3FEUA 2IL3A 2C1YA 3TJKA 2N5BA 3H8QA 3IC4A 1HNAA 3M0FA 4CW9A 4AF2A 2MMOA 2AAWA 3IK9A 3VI5A 2RIIA 4TVEA 1PKZA 4JEDA 2TRXA 3GYKA 2AB6A 2B7JA 2DJ3A 5J5NA 3FHKA 4TN8A 17GSA 1OC9A 1BYEA 5CNWA 3HVXA 2FGXA 5F0GA 4KDYA 3HXSA 3GL5A 3LWAA 3GFKA 3VI7A 3A2XA 1PN9A 2VM2A 2CVDA 2GQKA 1FO5A 1VRSD 2B5XA 4RQRA 2JADA 3H4KA 2FCHA 5IM9A 4XHMA 3SBCA 2FNOA 4MZWA 4EF0A 1K0DA 3IR4A 2LNSA 3HZ4A 3WGDA 3GIXA 4N10A 1EOHA 2XBIA 1SL2B 3HD5A 1EV9A 1DUGA 2K6VA 2LKUA 2WJUA 2F3MA 1MDIA 4HI7A 4HJMA 1BG5A 5G1LA 2RM6A 1M2BA 1QXHA 5AGYA 1Z5YE 1RK4A 5KN0A 1GP1A 3GA4A 3BJ5A 4HS1A 1PX6A 1ERUA 7GSSA 3D5JA 1AQXA 4WKWA 3DMLA 5DJLA 1GH2A 4ID0A 1X5EA 1AUCA 3FR3A 1A8LA 4EVMA 1R5PA 4TXVA 5CREA 1WPIA 3TDGA 4G9HA 4IN0A 3EU4A 5DQSA 4DSSA 2D2ZA 3F8UA 3KTBA 2WFCA 2YV7A 2BTOT 3FR6A 2B5EA 1T8EB 3ERWA 4WR4A 3ZMKA 4NXIA 2LTKA 2LQQA 3ZMLA 3ERGA 1NHOA 3QAGA 1MDJA 2WRTA 2VIMA 4TW5A 5CO3A 5IMDA 1ML6A 3RAZA 1QK8A 3G7YA 1V57A 3TKSE 3HVSA 3TOTA 3GURA 5F07A 2HZEA 1GSQA 2X64A 3GKXA 1X9MB 1GNEA 5GSTA 1TRWA 4GF0A 2OE3A 1GWCA 3P2AA 4EDYA 2OADA 2O87A 1THOA 1R7HA 2EIRA 2JU5A 4GSSA 4BWQA 2GT6A 2VUPA 3D22A 2GTUA 4ULXA 3F0IA 1UC7A 2H76A 4IW9A 5DAKB 2R2JA 4ACSA 3L0HA 1TRSA 3F4SA 5DQYA 3LSZA 2VL3A 3W8JA 4XS6A 1GSUA 4E8HA 1GSDA 3VPTA 4IP1A 2VLVA 2HRFA 2AV4A 1URMA 1OKDA 2C8UA 4K9ZA 2RLIA 5IPGA 2H8LA 3C1SA 3A3TA 1M0UA 3IDVA 3KCMA 1VF2A 4K0GA 3IE3A 5KN3A 3HDCA 4WF4A 5HR3A 2MMAA 3P7XA 2NDOA 4BA7A 1SYXA 1X9WB 5ECPB 1T4YA 3U5RE 2HXKA 3M8NA 4V2NA 1N2AA 2H70A 4MJEA 2VCZA 3HA9A 2NTOA 3ZVJD 2DBCA 3GKMA 2C3QA 1U6TA 1UA5A 1K3LA 1X5CA 2TIRA 3UJ1A 1EZKA 2F51A 2HE3A 5ECNB 2L5LA 2H74A 2V2GA 1A2JA 1K0NA 3W8SA 20GSA 4MJCA 2MZCA 5D9TA 4KUNA 3HJMA 1XWAA 1TI1A 2C80A 1M9BA 2DJ2A 4PUFC 4KB3A 4PXOA 2DC5A 5J9BA 1HQOA 3ZVJA 1BQ7A 2DIYA 1I5GA 4O7HA 5CAXA 5A5KA 4MABA 4MF6A 4F03A 1TOFA 1Z7RA 1SD9A 2R6KA 3P90A 4I2TA 2LRNA 4E8EA 3GTUA 1PGTA 2M80A 1V98A 3LJRA 2R4VA 1XOBA 5G2ZA 5DJMA 2O8VB 2FUG2 2LEGA 3LYKA 4HU7A 4LMWA 5DDLA 3CSIA 3QMXA 2YPMA 4IVFA 1J9BA 5B6MA 3RPNA 1LBKA 1PA3A 3IV4A 4YQUA 3TKQA 4JU5A 5IMAA 1BAYA 5IO2A 6GSUA 3ZFLA 3I43A 2GLRA 4TOPA 3E3EA 3VWWA 1K3OA 5EL8A 5GAPD 3DGQA 1SK1A 1XWBA 2YOIA 2K9FA 3QD9A 2H66A 3GNJA 4MJBA 1R5AA 1O7UA 1Z6MA 2X8CA 3DVXA 3IHQA 1FG4A 4DEJA 4L5LA 1GSYA 3WYWA 4V2MA 4HQZA 3UMAA 3WD6A 3TOUA 3US3A 1WOUA 3G9BA 5CRHA 2WGRA 2YWOA 1JLVA 5GSSA 4L8EA 1K0BA 3KEBA 5H5RA 2BMXA 4TR0A 1BX9A 1S3CA 9GSSA 4N0ZA 1ERTA 1YDKA 1V58A 2PWJA 1SYRA 3QPMA 4ZB9A 1BJXA 1KEBA 1UN2A 2OBIA 3KJYA 1F9MA 2NPBA 4LA1A 3LYPA 4MPGA 3CRTA 4PQIA 4RQXA 4ISDA 3IOSA 5IOXA 3TRPA 5C04A 2LSTA 1DE1A 1T00A 2HZFA 2F8AA 1WP0A 4ZIJA 1EP8A 1XWGA 2JSYA 1A0FA 1T4ZA 3GSTA 2PVQA 1FW1A 1X9SB 4HU9A 4CDOA 2EIQA 1QUWA 3KM6A 2H01A 4WXTA 1IYHA 1T3BA 2L57A 3EWLA 2YZHA 4KW6A 4MLYA 4I97A 2GZZA 4P3YB 11GSA 2IFQB 4MJAA 4IQ1A 5HR0A 2V32A 4XS4A 2AJQB 2YWIA 3UOMA 2H72A 1TXXA 2KHPA 1U87A 1SENA 2L59A 1EEMA 1XPVA 5DVBA 6GSTA 4BL7A 2PPTA 5JCWA 3UEMA 4GCIA 1QMVA 3Q18A 1TK5B 2LUSA 2WDUA 2VO4A 2C3TA 2E7PA 3L9SA 5D9WA 3GSSA 2GQLA 3GX8A 3QDNA 1G6YA 2P0GA 2CA8A 4MK3A 5HR2A 2VM1A 2XPDA 5D9XA 3FK8A 2I3YA 2YCDA 2V6OA 2B1LA 1GTAA 2F9SA 5ECQB 2QGVA 4G2EA 2KP1A 4GLTA 5D96A 2LS5A 2C0DA 4OFMA 2VCQA 3M9KA 4POKA 3IXRA 1YF1A 2MMNA 4YAPA 5GZZB 4K8MA 4ECJA 4I2UA 3TJFA 4WF5A 2H6ZA 1ERVA 5JWQB 6GSXA 1YJ6A 1GTIA 4JRRA 3QOUA 4HUAA 1K3YA 3TJGA 4TKYA 1YEPA 5EPFA 1ST9A 4D73A 2LJKA 4F9ZA 4HJ2A 3RPPA 2R5GA 4PUAA 5D93A 1HNBA 1WIKA 5LCZA 3LXTA 3C7MA 1EV4A 2H71A 1G6WA 1LJRA 4LL1B 2C4JA 2YWMA 2K8VA 4ML6A 5IOWA 4V1Ag 2X8GA 4PQ1A 5HFGA 3GUSA 3KGKA 3O76A 3GKKA 3O3TA 4NHZA 5JCGA 1FB6A 1HD2A 1WE0A 3QFBC 4GQFA 2MBTA 4I8BA 2HRNA 5IMFA 5ID2A 1JLWA 4ZBAA 4KSMA 4OCEA 1OC9B 3APOA 3CBUA 4L5OA 3GHAA 1A0RP 3LEFA 3C1RA 5IQYA 3H1NA 1J0FA 2DLXA 4AJ8A 4X43A 1XZOA 2WB9A 5EY6A 4OCFA 2L6CA 2G0FA 1GRXA 5DCHA 3NIVA 1B4PA 1TW9A 2LV3A 4AJ7A 2R3XA 3LG6A 2KOKA 1YKAA 2XBQA 2CT6A 4KSOA 4TRXA 3FYGA 3FZAA 12GSA 4XTSA 2M72A 3E0UA 1SJZA 4BVYA 4WR5A 1Y6EA 5ENUA 1JFUA 5ECIB 5LD0A 3QR6A 5ECLB 5DBQA 2PU9C 2MBSA 2IWTA 1TTZA 2PBJA 3QAVA 1SK0A 5IO0A 2H6YA 2REMA 1R4WA 2X99A 4PGTA 5ELAA 1QFNA 4LLRA 1J08A 1JZRA 4GXZA 1JHBA 1MD4A 4DSSB 2GSSA 2C3NA 2G2QA 1NW2A 1TRUA 4TR3A 1W89A 1H4OA 3FRCA 1HYUA 1GSEA 3H93A 3BOAA 3UVTA 4GWRA 4YAVA 2K18A 1SKWB 1EOGA 1NM3A 4POMA 1EGOA 1SL1B 2GVPA 1JZWA 2DJ1A 2H75A 3ZFBA 3TCOA 5ECOB 1GLPA 13GSA 1G7OA 2AYTA 2HZEB 4HZ2A 3D21A 4IGJA 2MYGA 5CP1A 2WULA 4L0WA 2JL4A 1M9AA 4J2FA 3UAPA 2LJRA 5L71A 2E2GA 3O6TA 3EYTA 2YN1A 1O8XA 4FYBA 2XHFA 1AQVA 3MAKA 5A4VA 2QKEA 2WCIA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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