1DBYA

Nmr structures of chloroplast thioredoxin m ch2 from the green alga chlamydomonas reinhardtii
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
MEAGAVNDDTFKNVVLESSVPVLVDFWAPWCGPCRIIAPVVDEIAGEYKDKLKCVKLNTDESPNVASEYGIRSIPTIMVFKGGKKCETIIGAVPKATIVQTVEKYLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords CHLOROPLAST THIOREDOXIN M CH2
publication title NMR structures of thioredoxin m from the green alga Chlamydomonas reinhardtii.
pubmed doi rcsb
source organism Chlamydomonas reinhardtii
molecule tags Oxidoreductase
total genus 36
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1dbyA00
4L0WA 5D9TA 3A2XA 3LYPA 1TP9A 5DQYA 4JRRA 1S3DA 3A2VA 1K3LA 4V1Ag 3VPQA 1GSDA 1X5EA 1ZMAA 4RI7A 5G1LA 2P5RA 3L78A 5LCZA 1TK8B 4IN0A 2FCHA 4D73B 4POLA 1M0UA 5ECKB 1GSQA 3DGQA 2H76A 4TR0A 1XCCA 4K0GA 4X0XA 3IK7A 1JZRA 3C7MA 1TRSA 2F51A 2LJRA 4K0NA 4F03A 2X8CA 1BAYA 4V2LA 3CSJA 7GSSA 4KAEA 4KDXA 4MA9A 2P31A 3F8UA 4BVYA 3D4TA 3EVIA 1S3CA 3VURA 1AQWA 2C0FA 3FR3A 1GLPA 5DJMA 5J9CA 2H0IA 1LBKA 1A23A 2FWFA 1M9BA 2H75A 2V6OA 4GQCA 4K6XA 3FKFA 3DYRA 3QAWA 1T1VA 1AQXA 3UARA 4ZILA 2C0EA 1DUGA 3V1WA 5DVBA 1W4VA 2IN3A 3QAGA 4ECCA 2EC4A 3TJBA 1GSSA 5KN2A 2HNLA 2C8UA 2H1BA 3LQ7A 4DSQA 1SJIA 3H79A 2I9HA 2N5BA 1GNEA 4L5OA 4G10A 1F9MA 3CSIA 3QD9A 2H19A 2DJJA 3LORA 2IFQB 1MD4A 2DJ2A 1R5AA 2XBQA 3GH9A 3ERWA 3IC4A 4GF0A 4GLTA 3D5JA 4D73A 1VF3A 2YWIA 4QL7A 1GTAA 2TRCP 4PNGA 4XTSA 4I8BA 2HSHA 4I5QA 4KNDA 2V6KA 12GSA 2LSTA 1I5GA 3TUEA 3WGDA 5J41A 2IJYA 1SK2A 4RI6A 5G31A 4LMVA 2HFDA 4KSMA 2B5EA 2V1MA 3EWLA 2JSYA 1O73A 1X5CA 2CAQA 1TOFA 2H72A 3MNGA 2L59A 1PKZA 1CQGA 4O5RA 1PN9A 2JSZA 3NZNA 5ENUA 1GUKA 1K0CA 2H1GA 3D4MA 3H93A 2YCDA 4WBJA 4I6XA 1PMTA 1EV4A 1K0BA 1Z6MA 3QPMA 4AJ6A 3ZYWA 3HCZA 3TOTA 1ERUA 3GH6A 3PR8A 2IMFA 2YZUA 1TI1A 5EY6A 2RM5A 2WGRA 3ZITA 2H71A 3TKSC 2IFQA 3L9UA 5CRGA 2YN1A 1AQVA 3GSTA 5L71A 3IE3A 3A5WA 3FR9A 4PQIA 1QXHA 1GRXA 5HFGA 3N9JA 3TB2A 3FEUA 2BTOT 2J23A 3E0UA 2LS5A 1G7OA 1XZOA 3RPNA 2EIQA 4J56E 2R4VA 3O6TA 1M7TA 2JADA 3ED3A 3QCPA 3L0HA 2OE3A 3P7XA 1B9XC 1O85A 3KMNA 1QGVA 4HUAA 2IMIA 5IO2A 1GUMA 1PL1A 1TK0B 3FW2A 5A4UA 2QC7A 3KP9A 2FGXA 5LNKe 3GMFA 1BX9A 3A3TA 2DJ3A 4RQXA 3TGZA 5A4VA 1PX7A 4MF7A 4HQSA 1QFNA 1RQMA 4IP1A 1GNWA 2RM6A 4Q5RA 4WF4A 22GSA 4FYBA 2JZSA 3GNJA 3TKRA 4EDYA 1EWXA 4QQ7A 4ACSA 4OFTA 4AGSA 2AYTA 5GSTA 1EEMA 1SJZA 5HR0A 3ZVJD 3P8WA 3GYKA 4F0CA 1I9DA 5E4WA 2XPDA 2EIOA 3F3QA 1O6JA 1YF0A 2R6KA 1GUHA 3UBLA 2ON7A 3FR6A 5C04A 3TCOA 4F9ZA 3TJKA 2CVDA 2LQQA 2FD3A 5HR1A 2DBCA 2CVBA 5FWGA 4L5LA 5DAKB 2LV3A 2CZ2A 5J9BA 3VPTA 2PN8A 1T8EB 2F3MA 2LEGA 5JWOB 2KUCA 2WCIA 3BOAA 1JZDA 5G1KA 2QGVA 1TK5B 2OADA 3TJGA 2K18A 1OYJA 1A2MA 3LG6A 3HHVA 4KSOA 4O7HA 3MAKA 1MDJA 4Q5FA 3ZFLA 2GT5A 2JACA 5DQSA 3WGEA 2ALBA 2KOKA 3ZFBA 5H5RA 5IMCA 4GXZA 3G7IA 4IS0A 1FVKA 6GSVA 1EEJA 4HU7A 11GSA 4CW9A 3TDGA 4FYUA 2MMNA 3FZ5A 5EL8A 4BVXA 1MEKA 2VCTA 2IWTA 3MWHA 2RUEA 2VCWA 2PGTA 1HYUA 4MJEA 1XVWA 4WXTA 5IOWA 1ZGNA 5ELGA 3D22A 2LNTA 4OCEA 4OO5A 4MMMA 1EV9A 2N5FA 3I43A 4PURA 4WKWA 1WE0A 4EKZA 2FHEA 2O8VB 3H8QA 2ZUPA 3FRCA 3TKQA 2R2JA 2I1UA 3KJYA 5DAKA 3DVWA 5DCGA 5DJLA 4CDOA 1HNAA 2DC5A 1QQ2A 5IMFA 2NPBA 3DRNA 3HVXA 2JZRA 3I6AA 5D8IA 3ME7A 4I2TA 4KE3A 3TJJA 4YAVA 5ECLB 2VL2A 3F6DA 2LTKA 1GH2A 1SKWB 1HNCA 3ZMLA 2C0DA 3UAPA 1Z3EA 5F0GA 4F0BA 4K8MA 1RK4A 1JHBA 3L4NA 5AIVA 4ZIJA 2ZNMA 4K7IA 3GIXA 1HNBA 4BL7A 1E2YA 1PA3A 2Z9SA 4KUNA 5J3RA 4QL9A 2B6MA 3IOSA 4HEA2 2LNSA 1X9SB 1R4WA 1FW1A 5CNWA 1YZXA 3IDVA 1DE2A 5G30A 2CA8A 1O81A 1V2AA 2O85A 4XHMA 4K2DA 1T4YA 3KTBA 5C00A 4ZB8A 1T00A 3IA1A 2TRXA 3ZIJA 4K9ZA 2FWEA 5HFKA 3E9JB 2C3QA 2VCQA 1QK8A 3D6IA 3QR6A 3GFKA 4FO5A 1B4QA 4EVMA 3EU4A 1U3AA 5A5KA 4MZCA 1MD3A 3UVTA 1PSQA 3TRQA 2YV7A 4WEYA 2WULA 4ISDA 2L6DA 1Y6EA 2XHFA 3GKKA 5ECIB 4JEDA 3APQA 2B7KA 2DJKA 5HR2A 1VGLA 3KMOA 5J4UA 2L5OA 4MABA 5HFIA 4WR4A 2BMXA 2VCZA 4TR3A 1TJDA 3UEMA 3DEXA 4O92A 2VCXA 4ULXA 2L57A 3C8EA 3ZRDA 3HJPA 4GCIA 1PGTA 2MZCA 2VIMA 1SKRB 2N5AA 3CRUA 2H8LA 2MMZA 4KCAA 4YH2A 3KTLA 5AIXA 2VD1A 6GSXA 1H75A 2QSIA 1TI3A 3DXBA 5GAND 2YWOA 3IXRA 4GRFA 3TOUA 3RBTA 3HVVA 3HDCA 1IYHA 2REMA 2VLVA 3EMPA 16GSA 2HLSA 2I81A 1NSWA 4MP4A 4TW5A 2M72A 4G2EA 4ZL9A 2E0QA 3IPZA 4BWQA 3TJFA 2C3TA 2GT6A 1SK1A 1TU8A 3Q74A 5IPHA 2IIYA 1M2DA 1VRSD 5JWQB 1ML6A 2VLTA 1DSBA 4WBRD 4IELA 4NAXA 1AW9A 4EC0A 5ECQB 2GZZA 2WB9A 4BA7A 3HZ4A 3QFBC 5ECOB 1XW6A 1W89A 1OVNA 4HZ2A 4EDZA 2LJKA 1OC8A 2KLXA 2H1AA 4PQ1A 3RPPA 4YQVA 2XBIA 4RQRA 3D0ZA 1GTIA 1CQHA 5CAXA 1YY7A 2ES7A 1FB6A 1XIYA 1U3IA 3S9FA 2VL3A 2DSAA 3M8NA 4TR4A 1T7PB 3M3MA 3H1NA 3AY8A 5F8BA 4ZBDA 4K7NA 1ZYEA 3RDWA 2GDRA 2O87A 2VLUA 1FG4A 4JU5A 2VO4A 3TRXA 3C1RA 1GTBA 4ILFA 1A0FA 4FIWA 5ECRB 1EP7A 4MZBA 2WJUA 1GTUA 5F07A 1Z6NA 6GSYA 2BJXA 4ZL8A 2H0HA 2GSQA 1BG5A 3BCKA 3GN3A 1Z5YE 2DMLA 1K0OA 3KXOA 2K6VA 3F9UA 2FLSA 2B1LA 1YEXA 2V41A 5IMDA 1AAZA 1JLVA 4OWYA 1JZOA 3ZREA 3GKMA 4KDYA 3FHKA 2LKUA 3MSZA 1ABAA 2YWNA 2ON5A 2JZTA 3LEFA 3NOFA 4I97A 1T3BA 4XIHA 1FVJA 4RUVA 3GHAA 5JWRB 2G0FA 19GSA 1R5PA 2RLIA 4ID0A 1YDKA 1X9MB 5B7CA 3F4SA 2PMTA 2OACA 2H30A 1V57A 2AUVA 5A4WA 3CBUA 5D73A 1X0RA 2V2GA 2RIIA 1B4PA 3KH9A 2GGTA 1B48A 3GKXA 3GX0A 2DIYA 1N8JA 3HD5A 3F6FA 3QOUA 1WMJA 1K3YA 3APOA 2OE1A 4MJBA 3M0FA 4JR4A 4FH8A 3FK8A 3I9V2 4LMWA 1XPVA 3DVXA 2YJHA 1OE8A 1PL2A 4HJ2A 4F2IA 2C3NA 2L5LA 4TN8A 3ERGA 3RHBA 2KP2A 3DMLA 2YOIA 1DE1A 3BD2A 4IHUA 1V58A 5G5FA 3GV1A 4K7OA 4Q5NA 2LUSA 2VUPA 1VF2A 4XS4B 5B6NA 3C1SA 3ZL5A 5EPFA 4FYCA 4POBA 3E3EA 5GZZB 1R7HA 4XRDA 2NTOA 3LGCA 5H5QA 1A0RP 1O8WA 3VWVA 4MZWA 1MDIA 3ISOA 3A2WA 4DVCA 4NMUA 2G2QA 3PH9A 5IMZA 4N30A 3WYWA 4E8HA 2GSSA 4ZBAA 5JCWA 4K1FA 2X8HA 4TXOB 4IJ3A 1A8LA 4IQAA 3LWAA 5KN1A 3GRXA 5EVOA 10GSA 3CRTA 4Q5QA 1F3BA 1J08A 3HY2A 1RW1A 3DKSA 5IM9A 1WRYA 1SU9A 1A2JA 4WETA 2K9FA 5HQPA 8GSSA 3J7Yb 2IMEA 3R2QA 5JCUA 4H86A 4ECIA 1M99A 1Z9HA 4KGIA 20GSA 3F3RA 5GSSA 1SL1B 1SKSB 4X1UA 5DALB 2HI7A 1WOUA 3K8NA 5CO3A 1H4OA 2QKEA 4NXIA 1GL8A 2YANA 2PERA 3KGKA 5KN3A 5J5NA 4MDCA 1XWCA 1USBA 4J57E 5INYA 4KB3A 2OA7A 3U5RE 2PPTA 1K0MA 1PX6A 1THOA 4N0ZA 1XOBA 4XS4A 2HE3A 1WP0A 14GSA 1N2AA 2B5XA 2CAIA 3KM6A 1F37A 1F6MC 1THXA 2LRCA 3CYNA 4ZL7A 4XS6A 3KD0A 2LRNA 1UA5A 2VL9A 5D93A 4XRAA 3GKNA 4GWRA 4V1Ap 4LLRA 2GTUA 2OBIA 2YV9A 4TKYA 5IIZA 4G19A 1OKDA 3KCMA 4Z7XA 4TXOA 2H1DA 2HT9A 3CMIA 3MDKA 2R37A 5F05A 3N5OA 2JU5A 3ZZXA 3UBKA 1GSUA 1XW5A 3KH7A 3DWVA 5CYYA 2B7JA 3IV4A 1EGOA 3UL3A 4AF2A 1SYRA 2H6ZA 5JCGA 3Q18A 1SD9A 4PUAA 5E59A 3SWLA 4MLYA 2IPAA 3DIEA 1V98A 3HA9A 5HR3A 3HZ8A 3HXSA 4HI7A 5G2ZA 4ZXGA 2OE0A 2EIRA 3D21A 5DALA 1OC9B 1SJ6A 3BBYA 4OO4A 1EP8A 2YNXA 2F8AA 2H0GA 3VLNA 1FOVA 3VWXA 2AAWA 3G9BA 5ELAA 1WPIA 3LSZA 5AISA 1M2BA 4ML1A 3VI7A 3W8SA 1ERVA 1YJ6A 2NVLA 2GQKA 3HKRA 4MH2A 2AB6A 2C80A 3IR4A 1A24A 2VM2A 5CRDA 2X64A 1PRXA 4L0UA 2H01A 3LFLA 4TR1B 3NIVA 1XWGA 1ZYQB 2GZYA 2KHPA 3LXZA 3UMAA 4YQUA 4HS1A 4IQ1A 1Y25A 4MH3A 3GL5A 2L4CA 2X8GA 2CVKA 1U88A 4GSNA 1NW2A 3KP8A 4TRXA 3TKPA 3CTFA 3UIWA 2P5QA 3CXGA 1WWJA 3US3A 1GSYA 1ON4A 4KW6A 3HVSA 4GTUA 1TRVA 5F06A 1SENA 2DJ0A 4IW9A 4MCUA 2HRNA 3FY7A 4PX1A 5ID2B 1G6WA 2LRTA 3Q6OA 1ERTA 4KH7A 1K0AA 3KEBA 3GX8A 1IYIA 3O3TA 1AXDA 1OC9A 1AC1A 3L9VA 1FHEA 2R5GA 4GSSA 2HXKA 1FAAA 1BYEA 3KZQA 1J0FA 1Q4JA 4PGTA 3APSA 3EYTA 3VWUA 4E8EA 1EOHA 1T4ZA 2PVOC 2IMDA 1GSEA 1GWCA 4V2NA 2CV4A 1XWKA 3BJ5A 1WIKA 4WR5A 2VCVA 5ECNB 4OFMA 4TR1A 4DEJA 2NBSA 4F82A 3F4RA 4PNFA 2FNOA 2MMOA 3HJMA 1R26A 3HYPA 1GLQA 3Q19A 3EURA 1SD8A 1TRUA 4MPFA 2FY6A 5IMAA 5B6MA 4IVFA 1OE7A 2CT6A 2O89A 1K0DA 1FB0A 2OKAA 1C72A 1MTCA 4MPGA 5D9VA 2CQ9A 3RAZA 2NDOA 4MF6A 2CX3A 1GP1A 1TW9A 2LQOA 4TOPA 3L9SA 3IRAA 1SL2B 2C0GA 3OR5A 4OD7A 3QAVA 3W6GA 5ID2A 2DLXA 1FO5A 3EU3A 1ST9A 3QDNA 1ZZYA 13GSA 1TRWA 1ZCPA 2WDUA 3WT1A 2K8VA 2GSRA 3FZ4A 1U6TA 1XW9A 6GSTA 4HOJA 2WRTA 4EUYA 1GULA 2KP1A 5IMVA 2D2ZA 3ZMKA 1G6YA 4AJ8A 4OCFA 2HZEB 1B9YC 4BPYA 3ZVJA 2AHEA 4ML6A 4EXJA 2F9SA 4MJAA 1M9AA 3GL3A 4OMVA 2M80A 2A4VA 1X9WB 2HYXA 5ECSA 4P3YB 1YKAA 4IBPA 2H70A 2C1YA 2HZFA 2OBKA 5ABRA 4GQFA 18GSA 3M9JA 3PINA 2H6YA 2GS3A 2DJ1A 4NV2A 3GTUB 1ILOA 5IPGA 2VD0A 3UJ1A 3WD6A 5G5EA 1SK0A 2OJLA 4N0VA 3C73A 3QFAC 4WF5A 2K8SA 1U87A 4X43A 1TXXA 2L6CA 5CRWA 3GURA 5ECPB 2VAFA 4HZ4A 4NPBA 4DSRA 3LXTA 3TKSE 5D9XA 3QMXA 2H6XA 3SBCA 1YEPA 1KBNA 2PVQA 2XC2A 1K3OA 2DMMA 5CREA 1QUWA 2RUFA 3EE2A 3EMXA 1HQOA 3F4TA 2VL2C 1ERWA 2IL3A 1G7EA 2LJAA 3U6VA 2AV4A 2TIRA 2B1KA 4NHZA 1Z7PA 2GZPA 2HZEA 4LL4B 2IMKA 1JZWA 3W8JA 4AJ7A 3GA4A 3PGTA 2FA4A 4HDEA 3H4KA 2XPEA 4PXOA 2WS2A 5CRHA 1WJKA 1LU4A 2GSTA 1A8YA 5FHIA 1UC7A 2AJQB 5IQYA 5IOXA 3VI5A 4IGJA 1QMVA 4HU9A 4V2MA 2HSYA 2JL4A 2HRFA 1KNGA 4HQZA 3GTUA 4BWSA 1Z7RA 3GUSA 4ZB9A 2B3SA 4IKHA 2CX4A 4JZQA 1XOAA 4JBBA 3HJOA 4GSTA 3VFIA 1PD21 3M9KA 1M2AA 2I3YA 1PQNA 2DIZA 2F8FA 3ZIVA 4XS1A 4POMA 1EOGA 1V9WA 1EZKA 4ZBBA 3DD3A 2E2MA 2A2RA 4IP6A 3IBHA 3F0IA 1BQ7A 6GSWA 1G0TA 4ZB6A 1ZOFA 1UVZA 1F3AA 4YAPA 1X5DA 3UOMA 2GQLA 1SYXA 5DDLA 2L4QA 3GSSA 4ECBA 2FWGA 3VK9A 3WT2A 1VF4A 3CTGA 3TRPA 3ERFA 4TVEA 1BJXA 4PQHA 4EE0A 4NV5A 4O32A 2X99A 3EC3A 2R3XA 3JCML 1A2LA 4DSSB 4N11A 4EO3A 1B8XA 2CZ3A 2YZHA 3UVHA 3IK9A 2O7KA 1NHYA 5KEJA 5ECHB 5LD0A 4CHSA 1LJRA 1ZL9A 1YKCA 4G9HA 4YQMA 1BEDA 3LYKA 4EF0A 2I4AA 1KEBA 1XVQA 4J2FA 2ZCTA 2H74A 4KX4A 2FWHA 5ECMB 1ACVA 5FT3A 4PUFC 5DCHA 1NM3A 4KDUA 2C4JA 2VOCA 1E6BA 2MBSA 3O76A 2PUKC 2E7PA 1J9BA 3KIJA 2YWMA 1VF1A 2MYGA 5IO0A 1YQ1A 2PU9C 1EGRA 1TKDB 1KTEA 1JFUA 4L8EA 17GSA 1TDIA 4LL1B 1TTZA 3P90A 1MDKA 2WFCA 4IJIA 2V32A 4NWYA 5B8AA 2FA8A 1JLWA 4NHWA 1V40A 3WGXA 2J9HA 2PBJA 1OKTA 3I69A 4MF5A 2YP6A 3BCIA 5GAPD 3ZLPA 4XCSA 2H66A 3FYGA 2GLRA 3G7YA 3F63A 3FZ9A 4N10A 1S3AA 1UN2A 2FUG2 4DSSA 1O7UA 4OFNA 3C71A 5H5SA 3TKSA 5DBQA 2E2GA 3RHCA 1XXUA 3EINA 2VM1A 4POKA 4JE1A 1GSFA 2PWJA 3VWWA 4TXVA 1SL0B 4EL1A 2GVPA 3J7Yk 3IAM2 3CSHA 2B5YA 2M46A 5AN1A 1K0NA 5D9WA 1YF1A 3G7JA 1XBSA 2A2SA 5COHA 1XFLA 3IAS2 2WZ9A 4KA0A 3P2AA 3M1GA 3LJRA 1NHOA 4I2UA 6GSUA 2YPMA 5D96A 3ME8A 3FZAA 4ECJA 1Q98A 6GSSA 4LA1A 3ZTLA 1DBYA 1HD2A 1AUCA 1O8XA 4HJMA 5CP1A 9GSSA 2H73A 2GQMA 1AIUA 1XWAA 1OAZA 5AGYA 2P0GA 2MMAA 1URMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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