1DBYA

Nmr structures of chloroplast thioredoxin m ch2 from the green alga chlamydomonas reinhardtii
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
107
structure length
107
Chain Sequence
MEAGAVNDDTFKNVVLESSVPVLVDFWAPWCGPCRIIAPVVDEIAGEYKDKLKCVKLNTDESPNVASEYGIRSIPTIMVFKGGKKCETIIGAVPKATIVQTVEKYLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Chlamydomonas reinhardtii
publication title NMR structures of thioredoxin m from the green alga Chlamydomonas reinhardtii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CHLOROPLAST THIOREDOXIN M CH2
total genus 36
structure length 107
sequence length 107
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-11-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1dbyA00
4TOPA 4J2FA 1U3AA 4RUVA 5D8IA 1JZOA 2CX4A 3LXTA 2CX3A 1PL2A 3FZ9A 4ILFA 2P0GA 1XW5A 4I97A 1OKDA 2YOIA 2IMEA 1V40A 3FZAA 1QQ2A 3ZLPA 2G0FA 1OE7A 1WE0A 4JEDA 3LQ7A 3QD9A 1TKDB 2FLSA 2AV4A 3P2AA 2WJUA 1AC1A 5ECMB 5G5EA 1GRXA 3PH9A 3O6TA 3K8NA 4MJAA 5C00A 1U88A 3ZITA 3IR4A 2O85A 1SJZA 2VCWA 4PNFA 2CAIA 3HJPA 2YWIA 3HJOA 2C4JA 4LMVA 2R4VA 4I5QA 1I5GA 5IMCA 4F2IA 2AUVA 3KGKA 2R3XA 4ZL8A 3RDWA 4L8EA 3KP9A 3ISOA 4QL9A 1IYHA 3N9JA 2ZCTA 2B7KA 2VM2A 3CMIA 3R2QA 2CV4A 2ON7A 3PINA 4K6XA 2IWTA 1NHYA 3H79A 1Z6MA 2LRCA 1RK4A 4BA7A 3CTFA 4EC0A 2E2MA 2MMOA 1MDIA 2JZTA 3D21A 1ABAA 2ALBA 2HE3A 1DE1A 4IN0A 4MF7A 4JRRA 3DWVA 2AJQB 3UAPA 3H93A 4POBA 2VLUA 2PUKC 3Q6OA 4L5LA 3GRXA 3D5JA 1PX7A 1SD9A 5DVBA 1QFNA 4BWSA 2I3YA 2B6MA 4N11A 5E59A 4FYUA 2OA7A 2YN1A 3UVHA 2I9HA 3ZIJA 5GAPD 2L6DA 1XWCA 1EOHA 3F0IA 1TK0B 1OVNA 1BJXA 2NDOA 1K0NA 4IW9A 1EV4A 1AQVA 1SL0B 2WDUA 3W8JA 3EU4A 3M3MA 4OFTA 1K0DA 2CZ2A 4GLTA 3HVXA 4PXOA 1OYJA 3D0ZA 3TRQA 1YF1A 1O7UA 4MF5A 1HD2A 3TKQA 3APSA 1XXUA 5HR1A 5FWGA 4F0BA 2LV3A 2H70A 1PN9A 4HJ2A 4KSOA 5E4WA 3IV4A 3S9FA 3QAWA 2QGVA 3IAS2 3GN3A 5ECLB 2IL3A 3GL5A 3FR3A 1BX9A 3P8WA 5FHIA 2RM5A 4BVXA 4TR3A 3WGXA 3VFIA 3I6AA 2P5RA 1M2DA 1ERVA 2KLXA 4DSSA 5H5SA 3FZ4A 5H5QA 2DJJA 1XVWA 4O92A 4XS4A 1IYIA 2LSTA 2FCHA 1YEXA 2ES7A 5F8BA 4OO4A 1PKZA 2NTOA 4WR5A 1AXDA 2VCQA 5JWOB 3UJ1A 4FYBA 1JZRA 4ZBAA 3GIXA 5CRDA 5AIXA 3L9VA 2GSTA 3IDVA 4HU7A 2H0IA 5DBQA 4NHWA 5F0GA 4IP1A 2DBCA 2V32A 3IAM2 4PQ1A 1J9BA 3L9SA 3VWXA 2RUFA 4X0XA 1YQ1A 1TOFA 1FHEA 3DIEA 2OJLA 4QL7A 4K7IA 5EVOA 1AW9A 1TDIA 5DAKA 3VPQA 4TXOB 2IIYA 3I9V2 1F3AA 4FO5A 1XWBA 1WIKA 3MDKA 2YPMA 5KN3A 2R37A 1O6JA 4OMVA 3ERFA 1KEBA 1J0FA 3D6IA 4NPBA 3M8NA 1TJDA 2GS3A 3ZVJD 1YKCA 3F9UA 3DVWA 2M46A 1SL2B 4NV2A 1MD3A 4ZL9A 4F82A 4GQFA 2J9HA 1R4WA 2NPBA 3TUEA 3P7XA 4TN8A 2JADA 1F3BA 4MF6A 2YANA 4ML6A 1N2AA 1ZOFA 2LUSA 2KOKA 3UVTA 2AYTA 4KE3A 3H8QA 3LFLA 2ON5A 1E2YA 5D73A 4MZCA 4XTSA 2VCXA 1PRXA 4NMUA 3N5OA 1ZGNA 3O76A 3F6DA 2H19A 2N5AA 2VOCA 4P3YB 5J5NA 3ZMLA 2X99A 1TK8B 1GSDA 4MK3A 5B8AA 2XBQA 2C80A 2LJRA 2C0DA 1FVJA 2YCDA 4PQIA 1SENA 4KX4A 3EINA 4Z7XA 1GL8A 4OWYA 2GSRA 1T4ZA 1NW2A 5HR3A 5F05A 3MSZA 2A4VA 2X8HA 3BCIA 2XPEA 2B5EA 2EC4A 4PGTA 4XS1A 3SBCA 1MTCA 1M7TA 1SYXA 1A8LA 4RI7A 4N0VA 2GSSA 4AJ7A 3GKMA 4IHUA 1XWAA 3NOFA 3FR9A 3EVIA 1FW1A 1ZZYA 1PSQA 5FT3A 2CZ3A 3LXZA 4NWYA 3QFBC 1K0AA 1F9MA 2DMMA 5A4WA 3F3QA 3ED3A 4POMA 1FO5A 2FWFA 2GLRA 2B1LA 2K9FA 4G19A 1ML6A 4D73A 1T8EB 4NV5A 2H74A 4Q5QA 2IFQA 1KNGA 2JZRA 4GSTA 1R7HA 5ECKB 3IPZA 5ENUA 1BEDA 2RLIA 3QDNA 2O87A 2PPTA 5J41A 3ZIVA 5DJMA 5IO0A 3EYTA 5DALA 2B5YA 3G9BA 4V2LA 4L0UA 4ECBA 3HVVA 3H4KA 2RIIA 4TR0A 2TRXA 2OKAA 4ZBDA 5JCGA 2H6YA 3WT2A 1H4OA 3KJYA 1HNBA 5HR0A 3HDCA 3M1GA 2O7KA 2CA8A 1A24A 1VF3A 4MLYA 5LNKe 4DSQA 3KZQA 3GH6A 1ST9A 5CYYA 5F06A 1T00A 3MNGA 3KD0A 2L5LA 2REMA 4KGIA 5D9TA 2HZFA 3FK8A 2H71A 2X64A 2IN3A 2H72A 2VCVA 3EE2A 4MABA 2CT6A 1V2AA 13GSA 4IGJA 1GULA 1GWCA 4J57E 1HQOA 3ZTLA 1SU9A 4BPYA 1FB0A 4IQ1A 3HXSA 5G30A 3DD3A 4L5OA 1LU4A 3IK7A 3QFAC 3EURA 3DVXA 2N5FA 3IA1A 3VI7A 1S3AA 2VIMA 2IJYA 5ECPB 1URMA 3E0UA 3KTLA 2L4CA 3WT1A 1BQ7A 2K18A 2F51A 5EPFA 2XPDA 2HZEA 2FHEA 3CRUA 2WZ9A 1G7OA 5A5KA 5C04A 3IE3A 1OC8A 3TDGA 9GSSA 1SK0A 6GSXA 2BJXA 4YQVA 4KCAA 5KEJA 2FUG2 3OR5A 3IXRA 2VL2C 4MPGA 1TRUA 1FVKA 3UBLA 5GSTA 2C8UA 5IO2A 3W6GA 2OADA 5G1LA 2I1UA 1GUMA 1Z9HA 2E7PA 2PBJA 3DKSA 1R5PA 4E8EA 2LNTA 2XHFA 5B6NA 5B7CA 2FA4A 4EDZA 1B4QA 2Z9SA 3BOAA 2GSQA 1ZCPA 4XCSA 1OC9A 2AHEA 5HQPA 4V2MA 2VAFA 1DBYA 2C0GA 4LMWA 5ECRB 3L4NA 5DQYA 2AB6A 1OKTA 4MH2A 3DGQA 2MBTA 2M80A 3FEUA 1T3BA 3LEFA 4K2DA 1EP7A 3GHAA 1HNAA 4HS1A 4KDYA 2H6XA 3C7MA 1SKWB 1O8XA 1QMVA 2H66A 2EIRA 17GSA 5IMDA 5LD0A 3ERWA 2HXKA 2JACA 2YZUA 3H1NA 2J23A 3SWLA 3TJFA 1BG5A 1O8WA 2VO4A 1MEKA 1M99A 1VF1A 4ZB6A 2PU9C 2F8FA 3UARA 2GQKA 3D22A 2IMIA 2WGRA 3HVSA 22GSA 2M72A 1UC7A 3IOSA 1JLWA 2XC2A 3M9KA 1PL1A 3FKFA 4O32A 4MP4A 2YWNA 4RQXA 1GSUA 4JR6A 1B8XA 5ECOB 4ECIA 4GWRA 3BD2A 4IVFA 2LKUA 4HOJA 1USBA 3JCML 1B4PA 3GKKA 2O8VB 1MD4A 2YNXA 4WXTA 4GSNA 2DJ3A 5D96A 4WEYA 2H1DA 5JCUA 3C71A 4X43A 3M9JA 3P90A 2DJ0A 4G9HA 3CSJA 1YKAA 14GSA 3FW2A 1V9WA 4KDUA 2H6ZA 3HD5A 3ZRDA 3O3TA 4ML1A 2GQLA 3Q18A 1RW1A 1GLPA 2QSIA 2JL4A 3IHQA 3E3EA 20GSA 4GF0A 5D9WA 4K7OA 4GRFA 8GSSA 3GTUA 4AJ8A 3NIVA 1LBKA 4G2EA 1K3OA 4CHSA 1MDKA 3UL3A 3MWHA 3IBHA 2K8VA 3EMPA 3TGZA 1SD8A 2LNSA 4KNDA 2ZNMA 1M2AA 1Z3EA 1SL1B 4I8BA 4EDYA 1XOAA 1B9YC 2IMDA 4EL1A 4I6XA 3HYPA 3HHVA 4YAPA 2LJAA 3DXBA 3IC4A 2OE0A 2CVKA 4YH2A 2PN8A 3HKRA 1PMTA 1WOUA 2C0FA 5CRGA 1X5DA 2X8GA 4IELA 4L0WA 2H1GA 3GYKA 5IMAA 2VL2A 2H8LA 1H75A 1ZMAA 5HFIA 1SJ6A 2FNOA 2CVBA 2DLXA 1M0UA 3IK9A 4EO3A 2FWHA 2VLVA 2H1AA 1U6TA 3LYPA 4TXVA 5ECHB 1GTUA 1Z5YE 4O7HA 4EF0A 1N8JA 1AIUA 3BJ5A 3ZREA 5JWRB 1PX6A 4DVCA 3KMNA 5ID2A 1XW6A 4HZ2A 3BBYA 1NHOA 3KEBA 3QR6A 2HLSA 2YJHA 3GSTA 1G0TA 2K8SA 2IPAA 2YV7A 1YJ6A 3ZZXA 1GSQA 1K3LA 4JE1A 3LG6A 2OACA 3M0FA 4ECJA 3QMXA 1F37A 1JFUA 1TK5B 5IPHA 3KM6A 3A3TA 2L5OA 3CSHA 4TR1B 2HI7A 5DJLA 3CYNA 2LS5A 2OE3A 4FYCA 5GSSA 1AUCA 2VLTA 1V58A 4XIHA 2A2RA 3IRAA 4ISDA 4LL4B 4XS4B 3EWLA 3KH9A 3LGCA 5IQYA 5JCWA 1M9AA 1S3CA 3C73A 3D4TA 1Y6EA 3KIJA 2F9SA 1FOVA 1VF2A 2GQMA 10GSA 4Q5FA 1VRSD 2OBIA 4MA9A 5CRWA 4FH8A 3VURA 1GP1A 3QAGA 1K0BA 1JZDA 4IKHA 2H76A 2LRNA 2MBSA 2F8AA 4WETA 4F9ZA 1LJRA 4K9ZA 2YV9A 2FWGA 2H0GA 3ZFBA 2OBKA 3KXOA 5EL8A 4NAXA 1F2EA 2GZYA 4ZB9A 5CRHA 1EWXA 4IS0A 1TRWA 1VF4A 2CVDA 3GKXA 3VK9A 1GTAA 3AY8A 1W89A 1R26A 5DQSA 2VL3A 1THOA 4FIWA 5INYA 4KAEA 1TRSA 1Y25A 4EKZA 4KDXA 1YEPA 2VCZA 4GTUA 3J7Yk 3GMFA 1EZKA 2KHPA 3F8UA 2C1YA 2V41A 5JWQB 1ZYQB 2JSYA 5HFGA 5A4VA 3ZYWA 1KTEA 3HA9A 2HSYA 4IBPA 2PVQA 2HT9A 1YDKA 1O81A 6GSYA 5KN0A 4HU9A 2WFCA 4J56E 1OC3A 1YZXA 2HYXA 2L57A 1K0MA 4WKWA 4GXZA 3QCPA 1WRYA 3VLNA 4N10A 4HEA2 1XVQA 3WGDA 1XOBA 4LA1A 1X9SB 1GTBA 5IIZA 2GGTA 4XRAA 5HR2A 4PUFC 1MDJA 3I69A 3QOUA 1ERWA 3APOA 3G7YA 2WCIA 5IOXA 5J9CA 1TU8A 4IQAA 2DJKA 3TJBA 1XZOA 2I4AA 1UN2A 4K8MA 1SKRB 2VL9A 1EV9A 4G10A 4HDEA 1A23A 1WWJA 2RUEA 3LWAA 2MZCA 1X9MB 1TXXA 4EE0A 2YWMA 6GSWA 2WS2A 3QPMA 3ME7A 3RHBA 1K0OA 1SKSB 4TR4A 4ULXA 4ZIJA 1AQWA 3VWUA 5LCZA 5IMVA 1PGTA 1GUKA 1I9DA 3CTGA 4BWQA 5ECQB 4HZ4A 5AIVA 1G6WA 5D9VA 4MZWA 3RPNA 2LQOA 1X0RA 1A2MA 2PGTA 3TJKA 1PKWA 2CQ9A 2DC5A 2C3NA 3TKSE 3DYRA 3W8SA 3KTBA 3D4MA 1SYRA 4KCEA 4V1Ap 5IM9A 3GNJA 3FZ5A 4OD7A 1O73A 4GCIA 5AISA 1GSFA 5A4UA 4F0CA 4WF5A 2LEGA 2R5GA 3HJMA 1DUGA 1GNEA 4D73B 2JU5A 1K0CA 2FWEA 2IFQB 3QAVA 1PD21 2HNLA 5L71A 3E9JB 5J3RA 1QXHA 1JZWA 1ZL9A 3TKSC 3WGEA 2QC7A 5DALB 4HI7A 2FA8A 2IMFA 4N30A 2TRCP 3LYKA 4TRXA 4MCUA 1ON4A 3G7IA 3WD6A 2YWOA 2B7JA 2KUCA 4V1Ag 1FAAA 3FY7A 1X9WB 2V2GA 1SK2A 2K6VA 2PVOC 1YY7A 4JZQA 11GSA 4EVMA 2A2SA 5ELGA 1JHBA 4EUYA 5AN1A 2DSAA 1HYUA 2PWJA 3RBTA 2VM1A 2GVPA 4KH7A 4YQMA 5G2ZA 4KW6A 4ZBBA 4IJIA 5J4UA 4N0ZA 3APQA 5D93A 4KA0A 6GSUA 2PERA 1K3YA 2ZUPA 4NHZA 5IPGA 1S3DA 3PR8A 1ZYEA 1HNCA 3C1SA 1Q4JA 3KMOA 3FRCA 1XBSA 5G5FA 4MPFA 5EY6A 4TVEA 4QQ7A 2L4QA 4XRDA 5COHA 3CRTA 1SK1A 3ZVJA 3CXGA 3TOUA 2VUPA 3HCZA 5B6MA 1TRVA 5KN2A 4ZXGA 2GZPA 1EGOA 3DMLA 2PMTA 5G31A 2EIOA 4TW5A 4YAVA 2JZSA 4ZL7A 3F63A 4TKYA 3GFKA 5GAND 2L6CA 1OE8A 2GDRA 3CBUA 1UVZA 3L78A 3ERGA 4KSMA 4OCEA 5ECSA 3UMAA 3GX8A 1VGLA 4LL1B 4OFNA 5ECIB 6GSVA 1XPVA 3F4RA 2HZEB 4E8HA 7GSSA 2EIQA 4PUAA 1CQGA 4JR4A 4IJ3A 1G7EA 1QGVA 4TXOA 1C72A 3C1RA 5J9BA 3EU3A 4I2TA 1M9BA 1GSSA 2V1MA 16GSA 3KP8A 5CO3A 2HRFA 2DJ1A 3ME8A 2GTUA 4GSSA 1GSYA 3TCOA 1T1VA 1B9XC 1XCCA 1WMJA 1TP9A 3WYWA 2VCTA 2H0HA 1NM3A 1XWGA 3V1WA 1T7PB 3GA4A 3LSZA 2NVLA 3MAKA 3ZL5A 2FGXA 4BL7A 3Q74A 1FG4A 1SJIA 2I81A 2VD1A 3F4TA 2MYGA 2R6KA 4MZBA 5CNWA 4OO5A 1OC9B 4WF4A 2B3SA 4H86A 2F3MA 3HZ4A 3TRPA 4TR1A 3VI5A 1EOGA 2E2GA 4GQCA 1DSBA 3EMXA 3F3RA 3GKNA 2DIZA 4V2NA 2H73A 1XFLA 2WULA 4POKA 4JBBA 4Q5NA 1B48A 4MJBA 2O89A 4WR4A 1TU7A 1ILOA 1TI3A 2LQQA 5CAXA 1F6MC 4AJ6A 5GZZB 3EC3A 3FR6A 1EEJA 1WPIA 1PA3A 3C8EA 5D9XA 1XW9A 2VD0A 3J7Yb 2BMXA 4JU5A 3L0HA 1U87A 4XHMA 3VPTA 2V6KA 3VWVA 2HSHA 2N5BA 4AGSA 4K7NA 3TKSA 2H01A 3A2VA 2R2JA 2DJ2A 1X5EA 4X1UA 3GSSA 3ZFLA 2OE1A 1A0RP 4DEJA 4K1FA 4OFMA 1GH2A 1W4VA 3ZMKA 4KUNA 3GUSA 2L59A 4Q5RA 1G6YA 1A2JA 1GSEA 1THXA 1BYEA 2C3TA 1KBNA 4PX1A 3GH9A 2B1KA 2H30A 1PQNA 2WRTA 1E6BA 2C0EA 1XIYA 2QKEA 3LORA 2DIYA 3KCMA 1V98A 1WJKA 1TTZA 5AGYA 1QUWA 4CDOA 2YJ7A 2V6OA 3U6VA 1AQXA 4ECCA 2GT5A 1R5AA 1GTIA 1CQHA 1EEMA 3GX0A 3RAZA 2YP6A 5IOWA 2KP1A 4MJEA 5DDLA 1EP8A 3TJJA 4DSSB 3GTUB 5B8BA 1O85A 4K0NA 3A2XA 3UBKA 1Z7PA 3UIWA 1Z6NA 2C3QA 12GSA 4RI6A 1U3IA 1FB6A 5KN1A 2D2ZA 5IMZA 3PGTA 3RHCA 4K0GA 4AF2A 1DE2A 2LTKA 1RQMA 1UA5A 5ECNB 3CSIA 3FYGA 4NXIA 2HFDA 4ID0A 1TI1A 4XS6A 3HY2A 4ACSA 1V57A 2WB9A 3GV1A 2JSZA 2LJKA 1EGRA 1JLVA 3KH7A 1A2LA 4HQSA 3GURA 5DAKB 1WP0A 4OCFA 4F03A 2FY6A 2RM6A 4KB3A 4WBJA 4HJMA 3TRXA 2B5XA 4MJCA 1ERTA 2BTOT 3TJGA 1J08A 4IP6A 2HRNA 19GSA 1BAYA 3G7JA 3RPPA 3F6FA 5G1KA 3TKPA 2G2QA 1GUHA 4DSRA 3GL3A 5CREA 3VWWA 1XWKA 3A5WA 3TB2A 1YF0A 1A0FA 1GNWA 2GZZA 4RQRA 5ID2B 2NBSA 2YZHA 4WBRD 1Z7RA 4PQHA 18GSA 4POLA 4PURA 2H75A 2H1BA 2MMZA 2XBIA 1GLQA 2CAQA 5F07A 3UOMA 4BVYA 2E0QA 4YQUA 2LRTA 4HUAA 3BCKA 6GSSA 3LJRA 3F4SA 2DMLA 3A2WA 3US3A 2P5QA 2AAWA 4MH3A 1Q98A 4EXJA 5ABRA 3NZNA 2FD3A 4LLRA 2IMKA 5IMFA 3FHKA 1QK8A 3DEXA 4CW9A 1T4YA 6GSTA 5ELAA 1M2BA 2X8CA 3U5RE 2MMAA 5CP1A 3L9UA 5DCGA 4I2UA 2GT6A 3UEMA 3I43A 1ACVA 1TW9A 5H5RA 1OAZA 4O5RA 1NSWA 5HFKA 3Q19A 3TOTA 4MDCA 4HQZA 3DRNA 2P31A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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