2X8GA

Oxidized thioredoxin glutathione reductase from schistosoma mansoni
Total Genus 193
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
193
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
publication title Mapping the Catalytic Cycle of Schistosoma Mansoni Thioredoxin Glutathione Reductase by X-Ray Crystallography
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN GLUTATHIONE REDUCTASE
total genus 193
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2010-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 2x8gA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2x8gA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 2x8gA03
3BCKA 2OALA 2CZ2A 1MO9A 4ZIJA 4FK1A 2VM2A 4ACSA 4H7UA 1RP0A 3RP7A 1XFLA 1V2AA 4DSGA 3V3OA 4AT2A 2DMMA 1V98A 2MMAA 4BWQA 3NGCX 3RPNA 4L5OA 1BQ7A 5AIXA 3L78A 2PUKC 3GX8A 4HJMA 3P4PA 1OJCA 3IOSA 1GT8A 3HVXA 4TOPA 1GUMA 3LEFA 1GPEA 2LSTA 1PXBA 1A0RP 1YQ3A 1YF1A 3LXDA 4GF7A 2H71A 1IUXA 3IHGA 1PKZA 1XVWA 1B8SA 3LJPA 5GRTA 2WDUA 4MZWA 2XVFA 1Q98A 4HU7A 4AGSA 5KN0A 3D8XA 4IKHA 3ATQA 4IP1A 2GQLA 3AE3A 3QPMA 4EIQA 4IV9A 3COXA 4J31A 2XFOA 1ZKQA 4K7ZA 2TMDA 1XHCA 3MAKA 2GT5A 2I3YA 2K9FA 4APNA 4GLTA 1OJDA 1ZMCA 3Q9TA 4CBQA 2R9ZA 3G7YA 5D73A 1GRHA 1V58A 3IC9A 4GR1A 2OJLA 1IUTA 1TTZA 1X5DA 3AEGA 2M80A 4POKA 1TK5B 3H79A 3SGLA 1KFYA 1L9CA 1AOGA 2F8FA 1H86A 2VQBA 3IAM2 1QQ2A 1KSSA 5EB4A 3VR8A 4GDEA 5ECPB 4XCSA 3VFIA 1A0FA 2XFPA 4NHWA 1T7PB 3AYJA 1EL7A 5ID2A 1XBSA 5KN3A 1RQMA 3NNEA 2EIOA 4XWRA 2CVJA 4JBBA 4TR1A 1Z6NA 4ICYA 4JRRA 1ZYEA 3DVWA 4PNGA 4WR4A 5A4UA 3CSJA 3S9FA 4RI6A 3Q74A 4IS0A 1XW6A 1YKAA 2V61A 3GDNA 3KH7A 4EDYA 4Y4LA 4XRAA 3K30A 3PS9A 6GSYA 4Y4MA 1GERA 4KGIA 3CGBA 4Q5FA 4G9HA 4KUNA 5E4WA 4V2LA 1R7HA 4CNJA 2OKAA 2JACA 2E7PA 2IN3A 2DJKA 3HA9A 1M2DA 5IOXA 2F3MA 3DD3A 3BHKA 4PNFA 2WU5A 2IL3A 2BK3A 3CN8A 3I43A 1J0FA 3NYFA 2Q0LA 2MZCA 1B4VA 3NLCA 2EQ6A 2VRMA 2C64A 4K7NA 3FRCA 5D9TA 4JQ9A 3ZITA 1F6MA 2KOKA 2N5BA 3CPHG 4N9XA 4X1UA 2BMXA 4ZB6A 3GH9A 3LGCA 1JLVA 3M8NA 3FZ4A 3LZWA 4OPGA 3P2AA 2FJEA 2BJXA 4NTCA 4J57E 4WX1A 4LA1A 2LEGA 1W89A 3ALMA 6GSTA 2VCTA 2WP9A 4B67A 1JHBA 1H81A 6GSUA 2YR4A 4HA6A 3GHAA 2X8HA 1MDIA 1KNGA 2XLTA 11GSA 3ICSA 4REKA 2H1DA 4BV6A 2JSZA 4C3YA 4XTSA 2WDRA 3CTGA 5FT3A 5GSSA 1D4DA 2GMHA 5HY5A 1IUSA 4BK3A 1EP7A 1D5TA 4B69A 1TDNA 1LJRA 5IQ1A 1GSDA 3C96A 3E9JB 3MWHA 2R2JA 5DCHA 3US3A 3DIEA 3DKSA 4NV5A 1S3CA 3RNMA 1T3BA 4IHUA 4YTPA 2MMOA 4AOSA 3GYKA 4TRXA 5IMVA 2VCXA 2CAQA 3DMLA 2OBKA 4AJ6A 3CPIG 1DUGA 1GSSA 4ECJA 4AP3A 2H88A 2NPXA 1PJ6A 2VCQA 2FJBA 5IM9A 2EIQA 1TKDB 4XIHA 3KM6A 1HNCA 1PX7A 4OD7A 1GRFA 3DGZA 1GNEA 2OE0A 4D03A 2IMEA 2VAFA 2YWNA 2H0GA 2O87A 3HZ4A 4MF6A 1V9WA 4KPRA 3Q19A 1WE0A 3VWXA 5JCLA 4DGKA 3AB1A 2FWEA 2A2SA 1ZP0A 2C75A 1Z9HA 3IA1A 1FOVA 5D9VA 7GSSA 4EL1A 1GNWA 2H6YA 1D4CA 4GF0A 4MJEA 3ZRDA 4NAXA 3FZAA 4NHZA 3QSEA 2YZHA 5D9WA 4A6NA 6GSSA 2JB2A 1S3AA 1TK8B 5ECLB 4YQMA 1M99A 2GQFA 2H01A 3DEXA 5CYYA 3J7Yk 2RIIA 2XPDA 1F8SA 4ZBDA 4IA5A 3GNJA 2EQ9A 1ML6A 3F3QA 3E0UA 2X50A 4AJ7A 4NMUA 1H4OA 1XPVA 4KH7A 2YG5A 4PABA 4PXOA 4H2RA 3G5RA 3LYKA 2VVMA 1VG9A 2I1UA 2RUEA 2Y6QA 1H83A 4ZB9A 2OE3A 2B3SA 1SENA 14GSA 4ML6A 4X9NA 3LG6A 1F3BA 2E1MA 2R3XA 1GSEA 2YQUA 2EC4A 4X0XA 3UMAA 1ZMAA 3FBSA 4ISDA 3CGEA 1SYXA 1GH2A 5F0GA 4X4JA 3M1GA 5ECQB 4NWYA 1JRXA 4JR6A 5GSTA 3ZREA 3EPTA 2JL4A 1U3AA 5CREA 4MMMA 3BI5A 3KXOA 3UKQA 3KLJA 4D73A 4L0UA 2R0PA 5CP1A 1F37A 3CIRA 1S3DA 1EWXA 1EV4A 1NHSA 2AQJA 3CRUA 5F07A 3HVSA 5KN1A 2Q6UA 4A99A 3O76A 1X9WB 4IN0A 4EKZA 2X8GA 4OWYA 1DOEA 3KP9A 3M3MA 2GQKA 1AIUA 4IJ3A 1AUCA 4V1Ap 4XWZA 4F03A 3LYPA 2B1LA 1DOCA 1A8LA 1IJHA 1VF2A 1FB6A 3TB2A 5LNKe 2L6DA 1XOAA 3G7JA 3P4RA 4U2TA 4Y4NA 2F51A 3IDVA 1D7YA 4CY6A 1K0BA 3EAOA 4OFNA 2XLUA 1OVNA 2V2GA 4BA7A 2FA8A 2IFQB 2PMTA 3DK9A 2WZ9A 2IMDA 4BJYA 2R4EA 3NRNA 3H8LA 4H4TA 1OKTA 2BXRA 1B9YC 1DE2A 1O85A 2VOCA 2C3NA 2WESA 3GSSA 4H2PA 3W8JA 3GKNA 4Z2TA 4IBPA 1YJ6A 4OPCA 4OPLA 4H4YA 1DNCA 2GF3A 2C0FA 5IQ4A 3GUSA 1NPXA 3F6FA 2OA7A 1O73A 2ON5A 4H4UA 4IVOB 4ECCA 3UKPA 1WP0A 1Z5YE 1GNDA 1ON4A 1AC1A 2WHDA 4EM3A 4C77A 1DODA 4TR4A 1CJ3A 1USBA 3D4MA 3QSSA 3NYCA 2HNLA 5DDLA 5JCUA 3U6VA 2WDQA 3IV4A 3UAPA 3CTYA 2CZ3A 4CHSA 4DNAA 1TYPA 3QFBC 4MZCA 1A23A 3UL3A 2PVQA 2VO4A 4KB3A 2C66A 4B65A 2GGTA 3HHVA 2WULA 1LPFA 3FZ5A 4LL1B 1GSYA 1M6IA 2RM5A 5DQSA 2L6CA 4MJBA 4L8EA 1SJ6A 4IELA 3AEAA 5H5QA 2ES7A 1T4ZA 1ZOVA 3G5SA 2LUSA 3RP8A 5DCGA 4ZL8A 1OJAA 5DAKB 3NK2X 1PXCA 2V5ZA 4UDRA 4TM0A 4Z2UA 1EEJA 4JE1A 5FS8A 2IPAA 2M72A 1TXXA 2YWOA 2JKCA 5G30A 3QAVA 9GSSA 1ST9A 3KU9A 5D96A 2OACA 3A2WA 2YLXA 1PJ7A 3HY2A 2XVEA 2C67A 4P9SA 5IIZA 4EDZA 4YQUA 1G7OA 2DJ2A 1F8RA 3I6DA 2C70A 4H2NA 2Q0KA 4GWRA 1ELIA 3TCOA 4TXOA 2YJ7A 4F0CA 3GWFA 1EOGA 5J60A 3L1RA 3KA7A 5CRWA 3ZZXA 1N4VA 3TJKA 4U8PA 4OPIA 2VVLA 2V3BA 4BJZA 1ZK7A 1MD4A 4ZB8A 3TKSA 4MF5A 1TU7A 1V40A 3H1NA 3Q6JA 2GVPA 2X64A 4J33A 1PD21 4A7AA 2WOWA 2PN8A 2ZCTA 2BA9A 3ICRA 3SFEA 2BS2A 3D0ZA 3ZLPA 4YKGA 4K0GA 2R45A 3L0HA 3KH9A 1IUWA 2RLIA 3DK8A 2WEUA 2J23A 4AF2A 2F8AA 5JCWA 2CA8A 2BC1A 1FL2A 1J08A 3K7QX 3ZMKA 2I0ZA 5JCMA 2H89A 3II4A 3CNJA 1CC4A 2HYXA 3QFAA 1WMJA 2CX4A 3EF6A 1JZRA 1FEBA 4XS4A 2R0CA 1SU9A 1Y56B 2C3DA 2DIZA 2Z5XA 2H0IA 2WPEA 3BBYA 4YSHA 3GTUA 1X5EA 4PGTA 2L4QA 5GAPD 4YSXA 4H4WA 2A2RA 2VCZA 2AR8A 2CQ9A 3D21A 5G31A 3HJPA 3FIMB 2E2MA 2NVLA 2CX3A 2FBWA 2DLXA 3T37A 3RPPA 1SL0B 2NBSA 1FOHA 1ZL9A 4WXTA 4L5LA 2PHHA 4OFTA 4V1Ag 2XFUA 1EV9A 1T1VA 3EWLA 2X3NA 3UBLA 5A4WA 5D8IA 2V6OA 3UKKA 4NZHA 4J2WA 1XVQA 4YSZA 5KWFA 4FDCB 1SK1A 1TOFA 4USQA 4CCQA 3VI5A 2H66A 4HZ2A 4BURA 2OADA 5B8AA 1EP8A 3E1TA 2Q7VA 4NEWA 1FW1A 4C3XA 5TR3A 2KLXA 1GRTA 5CO3A 2CULA 2NDOA 2H76A 5ELAA 2CDUA 4I59A 1EGOA 4U8LA 3TJJA 1S3BA 5JCIA 2OLOA 1ZY8A 4U8NA 3ZDNA 2AUVA 4MJWA 4KW6A 3ME7A 3NTDA 3IK9A 4YAVA 2BS4A 3NN6X 5ECRB 3GWDA 5CAXA 4J57A 1THXA 4KNDA 1R26A 1JOAA 2LV3A 5DJLA 3AWIA 3JSKA 2B7KA 1SD9A 5F06A 2CVBA 4NV2A 2QCUA 1REOA 3TKQA 3CSHA 3KVEA 4H86A 1MOKA 5C00A 4DSQA 1GSNA 3GMBA 2V6KA 3MSZA 2Z9SA 2GSQA 3TKSE 4OMVA 1TK0B 3WGEA 5B8BA 4WBRD 1DBYA 1M2BA 4HUAA 1O5WA 1S2YA 3VURA 4EMIA 3Q6OA 3C4AA 3AYLA 3HZ8A 1NHYA 2DKIA 2ZNMA 3ZL5A 1ONFA 3K7TA 4H4XA 1E7PA 5EPFA 1JRZA 2HZEB 13GSA 3V76A 4Q5RA 3NYEA 2UZZA 1GLQA 2VM1A 2X99A 4EQWA 2YVJA 1GRGA 3DK4A 2YP6A 3E3EA 2DJJA 1C72A 1PN0A 3GKXA 1GTHA 4KCAA 5DALA 4CCRA 3L8KA 1XWAA 2GZYA 3PR8A 5E59A 2H6ZA 3UOMA 2JB3A 4Z7XA 1NM3A 2R4VA 3CSIA 3CMIA 3ITJA 4ECHA 5G1KA 3AD9B 3VI7A 4DVCA 2B7RA 5DBQA 3H8QA 3FEUA 1B9XC 1SL2B 4BK1A 1XDIA 5L46A 3NOFA 2FLSA 1FVJA 3ZVJA 4XS1A 2BACA 1ZMDA 5G2ZA 3F8DA 4JY2A 2YANA 1Y25A 3UVHA 3SWLA 1GUKA 1A24A 1DE1A 2J9HA 3ISHA 4TLXA 1FO5A 4F0BA 3N9JA 2R46A 2WGRA 5BUKA 2NPBA 4RQXA 1UN2A 1UKVG 1A8YA 1DXLA 1PBBA 22GSA 2FWFA 2PERA 2Z5YA 1TDKA 4U2LA 4P3YB 5CRGA 4GXZA 1MD3A 3UOYA 3MNGA 1T00A 1CQGA 2C0EA 1K0MA 4YT0A 3HYPA 2VOUA 3VR9A 5ECIB 2C0DA 4CRTA 3A5WA 4I2UA 2GB0A 4J2FA 1U88A 2RM6A 2VCVA 2YCDA 3SBCA 2BK4A 2BCPA 2DC5A 2YJHA 4K7IA 4QQ7A 1PX6A 4BPYA 5JWRB 3TJFA 3QMXA 5IPYA 2TIRA 4JNQA 3PVCA 4H4SA 2K8VA 2YR6A 1Z6LA 2DBCA 2LRNA 2L5OA 3CTFA 5G1LA 2KUCA 3AEDA 1QXHA 5IMAA 3APOA 3HD5A 4K6XA 2H0HA 2GTUA 2XCGA 3P9UA 1TI3A 2LNTA 2R6KA 2GAHB 1GP1A 2IVEA 4EQXA 4GSSA 1TDIA 3AD8B 3VLNA 4KSMA 4UP3A 3GRSA 1ACVA 2P5RA 1HNBA 3TUEA 4ZXGA 3ADAB 2C73A 2IMIA 3LOVA 1PGTA 3Q18A 1MTCA 3GRTA 4LU6A 3CGCA 1EL9A 4WR5A 2JSYA 3EC3A 2WP6A 2GLRA 1XOBA 1HQOA 3ICTA 3NT6A 4MJAA 1TW9A 1XPQA 5ECSA 5EOWA 5J7XA 3H8IA 4MJCA 3PO7A 3UBKA 3ALJA 1K4QA 2V41A 2WOIA 3WD6A 3OR5A 3VQRA 3F8RA 4CNKA 2YG7A 3AECA 2VD0A 3D6IA 1CL0A 3RP6A 2PU9C 3IRAA 3ME8A 3F6DA 4H2QA 2OA1A 3C1RA 3EU3A 1G0TA 5CRDA 1O6JA 4AJ8A 4RG4A 4NPBA 1BGJA 2H1AA 1YQ4A 4ZBBA 3UP5A 3BHFA 1TRUA 1PSQA 3PGTA 3CNPA 3ISOA 4Z44A 3UTEA 1GALA 3TOTA 4EE0A 2YOIA 1N8JA 6GSVA 3IK7A 2ZZCA 1JU2A 3C73A 3P8WA 1A2JA 4KA0A 2WJUA 1N4WA 2WB9A 2YVGA 4N30A 1CJ2A 3GYJA 1SD8A 5DBJA 2H8LA 1DJNA 1EL8A 3ZTLA 1O8XA 2H30A 3LQ7A 4TM3A 1B37A 3FYGA 3HVVA 2PBJA 4HQZA 3MDKA 1S3EA 2LQOA 1Y0PA 3FKFA 2H73A 3GDPA 3KKJA 5HR2A 1URMA 3QOUA 1PBEA 1K0DA 4MZBA 1BJXA 1FCDA 2WP5A 1E6EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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